3UBLA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501770) from leptospira interrogans with gsh bound
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
214
structure length
212
Chain Sequence
VMIKLHGASISNYVNKVKLGILEKGLEYEQIRIAPSQEEDFLKISPMGKIPVLEMDGKFIFESGAILEFLDTIFPQTPKLIPEDPWEAARVREISTIIETYLDIPARRIYLAKVSPEIVEEVHSTLVKGIKALQRVVRFSPYIAGNVFTLADCSGFAHLSVLDEELRPFYPNNHPLDLLNGWKEYFVFMKTKAGPALVEKDKQILKKILARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Leptospira interrogans serovar lai
publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Leptospira Interrogans
rcsb
molecule keywords Glutathione transferase
total genus 80
structure length 212
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3ublA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ublA01
3GH6A 4ZXGA 1MD3A 3H4KA 2XPDA 4IKHA 1YF1A 4JE1A 1YDKA 4WR4A 1MDJA 4BVXB 3HDCA 3MNGA 3IBHA 1B9YC 2KLXA 2V6OA 3LSZA 2OE3A 4I97A 3HVVA 3F8UA 1SENA 3IHQA 2K18A 5CNWA 4MLYA 2JZRA 3ZITA 1AC1A 4WKWA 3QDNA 1X5EA 4PQ1A 1ZYEA 1AQXA 3QPMA 3FZ9A 4POMA 2LJKA 4PUFC 4GSTA 4K0GA 5AN1A 3TKQA 2KUCA 3RPNA 3RBTA 2YZUA 3HJOA 5G1KA 5IMFA 2QKEA 5ECOB 3ERGA 4KSMA 2IMEA 5ELAA 4MA9A 1MDKA 2IFQB 3OR5A 3QAGA 2FA8A 5LNKe 4KDXA 20GSA 2HFDA 1M9AA 5J9CA 3C8EA 2WS2A 4TR1A 1K0CA 4IS0A 3G9BA 2HSMB 3TKSC 3ZLPA 4YQMA 1LJRA 4YQUA 2M80A 1SKWB 4IJIA 2LRTA 2A2RA 1ZYQB 1F2EA 4TKYA 1UN2A 3LXTA 3HD5A 1K0DA 3WT2A 4XHMA 5JCWA 1A2MA 4F0CA 1FVKA 1QK8A 1ZOFA 2GSSA 3M1GA 5F05A 1BYEA 5GSSA 3ZREA 3UBKA 5HFGA 3C7MA 2M72A 4WETA 1SK0A 3HHVA 2HXKA 3ZZXA 4KNDA 5B6NA 3F4RA 5A4UA 4ID0A 3F6FA 2DMLA 2LNTA 4XS1A 4EXJA 4IJ3A 4HOJA 2OJLA 3ZL5A 1OKTA 3CXGA 5J3RA 3QR6A 3DYRA 2DJ3A 1ERWA 1M2DA 3KH9A 2HRKA 2MMAA 5IQYA 3HY2A 3ZFLA 1YEXA 3QMXA 1V9WA 1JHBA 5INYA 4JEDA 1WMJA 3GUSA 3MAKA 1SK1A 3GX8A 5CREA 1F3BA 4BL7B 1OC8A 3O6TA 3A2WA 1LBKA 5CRGA 1K3LA 2VL3A 2ZCTA 2ON7A 4PXOA 2NTOA 2G2QA 2YPMA 1SJ6A 1ZGNA 4CHSA 1SKRB 4DSSA 3R2QA 3LWAA 5KN3A 2XC2A 1T7PB 3IDVA 4EDZA 1ABAA 5D96A 3CRUA 1QQ2A 3DVXA 3TJFA 2IJYA 1AAZA 1V58A 4WF4A 4MCUA 2J23A 3F3RA 5JCUA 5D9VA 5IMDA 3GYKA 5DAKB 1NM3A 2AAWA 1S3DA 1XFLA 3VLNA 6GSSA 2NBSA 1UVZA 2F8AA 3FKFA 3TOTA 1R5PA 4KDYA 1QFNA 3IK7A 1CQGA 3KMOA 1SU9A 3UARA 6GSTA 2KOKA 1X0RA 5B6MA 1AQWA 2HYXA 3F0IA 4TXOA 5ECNB 5IMCA 1X9MB 2B5XA 3UVHA 2O8VB 1SYRA 4ISDA 5B8BA 3HCZA 3EC3A 1B48A 5DJMA 2B5EA 2HZEB 5DALA 2PMTA 2OA7A 2H75A 1XWCA 4EVMA 3IR4A 4ZILA 2GSTA 5IM9A 2VL2A 5EVOA 2HE3A 5ID2B 2IMKA 2LJRA 1XPVA 3DRNA 3GV1A 2OE1A 3F63A 2C3QA 1TRSA 3QFAC 4LL1B 5KEJA 2HSMA 2X99A 1W4VA 3KEBA 5G2ZA 2KP1A 2NDOA 2RIIA 2CVBA 3DKSA 3M8NA 2DJJA 4RQRA 1SK2A 2B1KA 3JCML 4V2MA 1S3AA 4KB3A 3CSIA 5LD0A 1WIKA 3TJBA 2H8LA 3TJJA 3F4TA 1WWJA 3GKXA 3IPZA 4PQIA 4NHZA 1WJKA 4E8HA 3EVIA 4XS4B 3GKKA 4LA1A 3DEXA 4X0XA 4Q5NA 2I4AA 5E4WA 3ZTLA 2GT5A 1JLVA 4J56E 1BQ7A 1EOGA 3ZVJA 3HYPA 3LYPA 4K6XA 2OBKA 5IMAA 3L9VA 5HR0A 2HRAA 2GVPA 5IOXA 3VI7A 3TKRA 5CRWA 2CVKA 3WYWA 1ZMAA 1U3AA 2MBTA 4KCAA 5CRDA 5ABRA 2BJXA 1U87A 1GNWA 1Z7PA 1VF2A 3Q19A 1FVJA 4TR4A 3QFBC 3RDWA 1TJDA 4XCSA 2IIYA 3ZMLA 2R3XA 4GXZA 1VF4A 5ECPB 3IK9A 4BL7A 2IMDA 2O7KA 4ZL8A 3KH7A 2PERA 5CYYA 3IE3A 4MF6A 4JZQA 7GSSA 2H0HA 1TKDB 2LUSA 5IIZA 3N9JA 1EP7A 2R5GA 4OWYA 3M3MA 3F6DA 1YKCA 3NZNA 1EGRA 3ZYWA 2FWHA 2H73A 3QOUA 4FYCA 1GH2A 3DD3A 1AIUA 2GT6A 3ZIJA 1A23A 1WOUA 4Q5RA 3ZFBA 4POBA 4POKA 4PUAA 5J4UA 1HD2A 3KMNA 1GULA 4N30A 2V41A 5D9WA 1AQVA 5BMUA 4L0WA 3SBCA 3Q18A 3N5OA 2VO4A 1Z3EA 4TR1B 1NHYA 2YWNA 4YH2A 4MMMA 1Z9HA 5AGYA 1URMA 2N5FA 4YQVA 4FQUA 3H1NA 4ECBA 3GN3A 4PURA 4GSSA 3L4NA 4CDOA 1XWAA 3TKSE 5ECSA 2L5LA 3J7Yb 3NIVA 2I81A 3GNJA 2K9FA 2P31A 2LTKA 4KAEA 1Z6NA 2DIYA 4GRFA 6GSUA 1EEMA 1G7OA 3H93A 5HFIA 2ZNMA 1XXUA 4OCFA 5ECRB 4DVCA 3EU4A 1M2BA 4PTSA 4G0IA 4PX1A 4YAVA 4HU7A 3G7JA 3HVSA 4PQHA 2RM5A 3BCKA 3D4MA 2PVOC 2QGVA 3PH9A 14GSA 4CW9A 2YANA 5H5SA 4HJMA 2YP6A 4ZL9A 3IC8A 3KM6A 4EUYA 5KN2A 3KIJA 4KX4A 1KTEA 1M7TA 3GA4A 3A5WA 3J7Yk 5JWRB 2VL2C 2WZ9A 2HRKB 4FH8A 1ZZYA 3Q74A 2PUKC 4I2TA 5CRHA 3VK9A 1BX9A 1ML6A 4ML1A 4HQSA 1GUKA 1Z7RA 5ECQB 2H1BA 4X43A 4GCIA 5FT3A 4MZBA 2TRXA 4DSSB 3VWVA 1I9DA 6GSYA 2B1LA 3LGCA 3RHBA 3E3EA 1Z5YE 1M0UA 1Q4JA 2C0FA 5JWQB 1TRVA 2F51A 2VL9A 1K0MA 4Z7XA 2QC7A 2LNSA 2IPAA 2B7KA 3F3QA 1OE8A 2V32A 4F0BA 2RM6A 5JWOB 1G7EA 2K6VA 1YJ6A 5AISA 5A5KA 3GL3A 3IC4A 3TCOA 3TKPA 1PMTA 1PX7A 1SJIA 3CYNA 3CTGA 1GLQA 2YNXA 3HA9A 1MTCA 3FR6A 4DSRA 1HNAA 4TXOB 3ZMKA 1U6TA 4KDUA 3DXBA 2H6XA 5H5QA 2FD3A 1SD8A 2IWTA 2WGRA 5DALB 4XIHA 2H6YA 4MABA 5FWGA 3W6GA 2H19A 3IAM2 4HZ2A 2C3TA 1MDIA 3UBLA 1ZCPA 2O87A 3GHAA 3KP9A 3BD2A 1U3IA 2GSRA 1DUGA 3GFKA 2B5YA 2Z9SA 4ULXA 3HVXA 5C00A 3V1WA 2OBIA 1BEDA 1M99A 2IMIA 5ECLB 2B3SA 4HZ4A 3U6VA 2LS5A 2HT9A 3VFIA 1Y6EA 2VCTA 1GSEA 3P7XA 2L4CA 1TU8A 1G6YA 3KGKA 4K7NA 2HSNB 3G7IA 2L57A 1Z6MA 2CVDA 3H79A 2AJQB 18GSA 4KUNA 1K3YA 1GL8A 1TK8B 2YJHA 2DC5A 2HNLA 5D9XA 4MF5A 1T8EB 4IVFA 2HQTA 4HU9A 3FW2A 1N8JA 3EMPA 4ZIJA 1GTIA 1HNCA 3GSSA 19GSA 3TRXA 1UA5A 4ECJA 3WD6A 2LRNA 2FHEA 1R26A 3RHCA 1B4QA 3FY7A 3D4TA 2VM1A 1TDIA 3WGDA 2L5OA 3ME8A 5DVBA 2HZFA 2CZ3A 2JZTA 4JBBA 3VWUA 2YZHA 2DJ2A 4NWYA 2HI7A 3HJPA 1GSFA 4IW9A 2WRTA 4MF7A 2I9HA 2AB6A 3TOUA 1EEJA 2HSHA 1PQNA 2H72A 2TRCP 4FYBA 2O89A 4L5LA 2WULA 1JZDA 4AJ6A 1TTZA 3BOAA 2OACA 2R6KA 1E6BA 3FR9A 3FZ4A 1N2AA 4D73A 2IL3A 4ECCA 1R5AA 2YWOA 1OE7A 5C04A 3GX0A 4WBJA 3ZRDA 1F9MA 2CZ2A 1TOFA 2XBQA 4K1FA 4OO4A 3CMIA 3DVWA 5F8BA 5DQSA 3GTUA 5EPFA 4ZB6A 1TW9A 1XBSA 3EURA 3VPQA 1B9XC 3BJ5A 5B7CA 1DBYA 2E0QA 5CO3A 3TUEA 3QCPA 1TK0B 3QD9A 1GSYA 3GMFA 1FB0A 2O85A 1SKSB 2GSQA 3LYKA 3K8NA 4GF0A 4K7OA 4GQCA 4HJ2A 3I43A 1YKAA 2VM2A 3E0UA 5F0GA 4QL9A 1SL1B 3E9JB 4NV2A 2ZUPA 4TR3A 2DJKA 1F6MC 1TP9A 4BA7A 3VWXA 5ECIB 4ZL7A 2YOIA 4ZBBA 1PD21 3TGZA 2WDUA 1BG5A 5CAXA 3UEMA 4O32A 2C0DA 4WXTA 3I9V2 4HDEA 4IQAA 4OCEA 4ILFA 2H6ZA 2VD0A 4MJCA 1PGTA 2AV4A 4O7HA 3BBYA 5ECKB 3EMXA 2K8SA 2LRCA 5J9BA 3Q6OA 3GIXA 1QGVA 2HSYA 3TJGA 2DIZA 2FA4A 2B7JA 4EF0A 3APSA 2K8VA 4N0ZA 4H86A 1VF1A 5B8AA 4ZB9A 4I5QA 3VPTA 4OD7A 4L0UA 1G6WA 3DMLA 2LJAA 4MJAA 4ECIA 3O76A 4NMUA 3MDKA 5IO2A 1OC3A 4LMVA 4HI7A 4TN8A 1X9WB 2GQKA 3L0HA 3UMAA 4TRXA 13GSA 2PVQA 5G30A 2GTUA 4WF5A 5D93A 1TXXA 4AJ7A 2KP2A 1O81A 4RI6A 4V2LA 4RI7A 1BJXA 1PKWA 5ELGA 3VWWA 2I3YA 3MSZA 1JFUA 2DJ0A 3FYGA 4NAXA 2E7PA 2L6DA 3F4SA 2L4QA 4POLA 5IOWA 4KA0A 4V2NA 2X64A 2IMFA 5ECMB 3LFLA 2D2ZA 3KJYA 4MPFA 3I69A 1USBA 2X8GA 4V1Ap 2LSTA 1GP1A 1VGLA 1GNEA 2WFCA 1I5GA 5A4WA 1OYJA 4XRDA 2DJ1A 3TKSA 1SJZA 16GSA 3L9SA 3EU3A 3PPUA 1XVWA 4WBRD 4X1UA 22GSA 1O8XA 1V57A 3GSTA 5DJLA 3P2AA 2JACA 1T3BA 1V2AA 4N11A 4KGIA 2OADA 3US3A 1JZOA 1T1VA 1AXDA 2VCVA 2FWFA 4AF2A 3D0ZA 2YCDA 3O3TA 1V40A 4MPGA 11GSA 2VUPA 1ILOA 2M46A 4IQ1A 2TIRA 4MJBA 3D22A 3H8QA 4TW5A 1PX6A 3FHKA 2G0FA 3ERWA 2V6KA 3D6IA 2X8CA 4KH7A 4N0VA 4MJEA 4J2FA 1XWKA 3FZ5A 3CBUA 3TRPA 2P0GA 2AYTA 2F9SA 1OAZA 3P90A 3M0FA 4EL1A 4G9HA 3IV4A 1ON4A 4HS1A 5L71A 1A2JA 3W8JA 1AUCA 3APQA 2CX4A 5HR1A 2MBSA 4OFMA 5EY6A 2ES7A 2H76A 2MZCA 1A2LA 3M9KA 2H1DA 1GSSA 1T00A 4MP4A 2FCHA 1IYIA 2YWIA 1F3AA 1EOHA 2LQQA 4NXIA 4F9ZA 1OC9A 1YZXA 1O8WA 4LLRA 1G0TA 1NHOA 3UJ1A 4KCEA 2VCZA 2KHPA 5HQPA 2L6CA 1K0BA 4IGJA 1EV4A 2VIMA 1GUHA 3LXZA 2JADA 4D73B 5ENUA 3UL3A 2C4JA 3IOSA 4J57E 4XS6A 3SWLA 1AW9A 1SL0B 1C72A 5GAND 4Q5FA 3ZVJD 4JU5A 1K0OA 2IN3A 1XVQA 1ZL9A 17GSA 1ERVA 4MZWA 4QL7A 2MMNA 1MD4A 1GSDA 2R37A 3GTUB 3GRXA 1WRYA 4YAPA 6GSXA 4XRAA 1DSBA 2NVLA 3UIWA 1J0FA 4EO3A 1O73A 4FIWA 5KN1A 1NW2A 4WR5A 1J9BA 2PBJA 5F06A 3ISOA 2H66A 4FO5A 1A24A 4BPYA 3CSHA 3GURA 1R7HA 1OKDA 4O92A 1PKZA 3KZQA 3KP8A 4G2EA 2PU9C 2H1GA 2H1AA 4L8EA 2VCQA 2GDRA 1KNGA 4G0LA 4I2UA 2RUFA 3KTBA 3DWVA 1NSWA 1SL2B 1QXHA 3C71A 1FOVA 4ML6A 4BWQA 4K2DA 1GUMA 2I1UA 3RAZA 4IBPA 1B8XA 1QUWA 2CV4A 1ST9A 2HRFA 2FGXA 4IN0A 6GSVA 3IAS2 3LORA 1EV9A 2BTOT 2C8UA 3LEFA 5HR2A 1TU7A 1TI1A 4WEYA 4PNGA 5DDLA 1HYUA 1JZRA 3EE2A 2EIOA 2XPEA 2GZYA 3WT1A 3EYTA 2VCWA 4Q5QA 4TR0A 2R4VA 4HUAA 3UOMA 1Y25A 3QAVA 1KBNA 4TOPA 1A0FA 1YEPA 3UVTA 3PR8A 2VCXA 2H70A 4EE0A 1F37A 1W89A 2LV3A 4F2IA 2YJ7A 9GSSA 2HLSA 5COHA 1PN9A 4K9ZA 2JSZA 3TB2A 4G10A 4G0KA 3KXOA 3GH9A 2C80A 3GKNA 2OE0A 2PGTA 3EWLA 3KD0A 5IO0A 1CQHA 1M9BA 4I6XA 4P3YB 4TXVA 1O6JA 1T4ZA 2A2SA 1XCCA 1K0NA 1KEBA 1JLWA 3M9JA 2GQMA 3CRTA 2WCIA 2R2JA 4MZCA 2VLVA 4IHUA 2H0GA 4I8BA 2LKUA 4BVYA 1PL1A 4AGSA 4IP6A 1EWXA 4ZB8A 3VI5A 1GWCA 4NV5A 2JSYA 5FHIA 1O7UA 4AJ8A 2CAQA 4FYUA 1UC7A 5EL8A 2JZSA 4XTSA 1EZKA 1XWGA 1THXA 2E2MA 1ACVA 3TRQA 1VF3A 4GQFA 1O85A 1VRSD 5CP1A 3C1RA 3HJMA 3C1SA 2L59A 4MH3A 1J08A 1XW5A 4GSNA 4USSA 1XWBA 4ACSA 4HEA2 1A8LA 5DBQA 2VLTA 3DGQA 5ECHB 1XZOA 1XOBA 4RUVA 5D8IA 1FG4A 1GTUA 2FUG2 4JRRA 1GTBA 2FY6A 4BVXA 2REMA 3FRCA 5IPHA 4BWSA 3MWHA 4K0NA 2A4VA 1X5DA 3IXRA 5AIVA 1TK5B 1H75A 2MMOA 2WB9A 4JR6A 1H4OA 1SD9A 2ON5A 3HZ8A 2VOCA 3GKMA 3FEUA 1GLPA 10GSA 3RPPA 2YV9A 4E8EA 5LCZA 3S9FA 4ZBDA 2VLUA 5D9TA 4IP1A 4K7IA 2E2GA 2YWMA 1XOAA 5KN0A 1PA3A 1XW6A 4LMWA 4OFNA 2IFQA 2EIQA 2H71A 3KCMA 5JCGA 5IPGA 5D73A 2DSAA 1A0RP 1RW1A 1HNBA 5J5NA 5G5EA 2GZPA 1QMVA 1OC9B 3GL5A 2C0GA 4PNFA 4LL4B 2N5BA 2WJUA 1WPIA 4MDCA 5GSTA 5F07A 3P8WA 3G7YA 2MMZA 5HR3A 1S3CA 4KW6A 2FLSA 3APOA 5DCGA 3PGTA 3CTFA 3QAWA 2CT6A 1GSQA 2F3MA 2X8HA 3AY8A 4GLTA 4TVEA 3TDGA 4GWRA 2XBIA 1X5CA 1U88A 3DIEA 1M2AA 2YV7A 3ERFA 1FW1A 1R4WA 2XHFA 5HFKA 3LJRA 3ED3A 4NPBA 1FB6A 4MH2A 1GRXA 1T4YA 3L78A 1V98A 2CAIA 1FHEA 3UAPA 3LG6A 4V1Ag 5AIXA 2LQOA 2EC4A 2C1YA 5H5RA 4KSOA 2GZZA 3WGXA 3FK8A 4F03A 2PN8A 1YF0A 2AUVA 5IMZA 6GSWA 2GGTA 2FNOA 3A2VA 3IRAA 3WGEA 1TRWA 2FWEA 4O5RA 2CX3A 2CQ9A 3FR3A 8GSSA 5G31A 2EIRA 2YN1A 4K8MA 4ZBAA 1THOA 2B6MA 2PWJA 5IMVA 2AHEA 5J41A 3D21A 1A8YA 5DAKA 2UZ8A 2VAFA 4KF9A 3HZ4A 1K3OA 2P5QA 5A4VA 1GTAA 1PL2A 3HXSA 3ZIVA 2RUEA 2H74A 4QQ7A 1E2YA 2P5RA 2PPTA 4F82A 1BAYA 2C3NA 1JZWA 3A3TA 1TI3A 5E59A 4RQXA 12GSA 4NHWA 2LEGA 1SYXA 3L9UA 2GQLA 3LQ7A 3A2XA 1YY7A 3KTLA 2H0IA 1OVNA 5G5FA 1EP8A 2HZEA 2FWGA 5GZZB 3EINA 4PGTA 1LU4A 1RQMA 2GS3A 1ERUA 3D5JA 3C73A 3VURA 2H01A 3U5RE 1B4PA 2H30A 2RLIA 2DMMA 1RK4A 1YQ1A 4HQZA 4IELA 5DQYA 5ID2A 2C0EA 1WP0A 1FO5A 1EGOA 1PRXA 2V2GA 2OKAA 2GLRA 1DE2A 2N5AA 4OMVA 2DLXA 4KE3A 4DSQA 1TRUA 2DBCA 4EC0A 1Q98A 3CSJA 1HQOA 4OFTA 2QSIA 2V1MA 1XW9A 2NPBA 4JR4A 4DEJA 3W8SA 1ERTA 4BVYB 1K0AA 3BCIA 1X9SB 1FAAA 3F9UA 2J9HA 4G19A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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