3WYWA

Structural characterization of catalytic site of a nilaparvata lugens delta-class glutathione transferase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
PIDLYYVPGSAPCRNVLLAAKAVGVDLNLKLTDLKSGQHLTPEFIKLNPQHNVPTLDDNGFVLNESRAIMTYLADQYGKDDSLYPKDPKKRAKVNQRLYFDMGTLYQSFGDAYYPHMFGGAPLDEDKKKKLGDALVFLDGFLEKSAFVAGEDLTLADLAIVASISTIEAVEYDLSPYKNINSWYSKVKAAAPGYKEANEEGAKGFGQMFKAMT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the catalytic site of a Nilaparvata lugens delta-class glutathione transferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
total genus 87
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3wywA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wywA01
1Q4JA 5ECQB 4IP6A 3RHBA 1SKRB 3GURA 5C00A 3ZTLA 3IA1A 1FB6A 4MABA 5F0GA 3HHVA 2OKAA 4ECIA 4V2LA 2WZ9A 2LRCA 2A2RA 4JBBA 2B3SA 3TGZA 4GSTA 1Z3EA 1KNGA 1K0AA 3ME7A 7GSSA 3L9VA 3GV1A 2R6KA 4HI7A 3KTLA 2F8AA 2H74A 2VCZA 1M9AA 5KEJA 1ST9A 2WJUA 1K0CA 3GSSA 1G6WA 4WBJA 2AUVA 3IOSA 3GUSA 1PGTA 1MTCA 1T4YA 1A2LA 2N5FA 1YEPA 2MBSA 8GSSA 2LTKA 2HSNB 3RPNA 2GZPA 4LMVA 1YQ1A 1EEJA 2J23A 3DKSA 2C0EA 16GSA 2LJAA 5HFIA 5FWGA 4YH2A 2JU5A 1ABAA 4WR4A 5LNKe 2KP2A 2AYTA 3F6DA 4IJIA 1GUMA 5JWQB 3R3EA 2FWEA 2H6YA 4QL7A 4LLRA 2G0FA 3EYTA 1UVZA 2XBIA 1VF4A 1YJ6A 4KW6A 4E8EA 5G2ZA 2HRKB 4TR0A 4I5QA 4AJ8A 4XTSA 3WGEA 4ZIJA 4Z7XA 3GX0A 2KUCA 2PWJA 3NOFA 4BL7B 5DDLA 4WEYA 5KN0A 4MCUA 1M0UA 2REMA 4RUVA 5F07A 3NIVA 5ELGA 6GSXA 2KOKA 4V1Ap 4MJCA 1V58A 2K8VA 3GTUB 4J57E 2PUKC 3TJKA 3TKPA 3QR6A 3U5RE 1GRXA 2BMXA 4XS6A 2ES7A 4MZBA 4H86A 4AGSA 4F0CA 4HQSA 1R5AA 1QGVA 3ZLPA 2E2MA 4HQZA 2NTOA 3GKXA 4LA1A 3F4RA 3PH9A 4GRFA 3Q19A 1TU8A 1TRWA 3E0UA 4JR6A 1WRYA 1NW2A 3N9JA 1XW9A 2AJQB 4HUAA 2C0GA 1M2DA 3QAVA 5HR3A 3TCOA 1FW1A 6GSWA 3DMLA 4QL9A 2H0HA 4J2FA 1ERTA 3MWHA 2LKUA 2MYGA 1GSEA 3M8NA 5H5QA 3TB2A 1UA5A 4O32A 1ON4A 2YV7A 1JZWA 4L5OA 3QPMA 2YANA 3APQA 4POKA 3GKNA 2L4CA 1OKTA 3DIEA 3G7JA 1T3BA 4NV5A 2PBJA 5DCGA 4Q5RA 3CSHA 2EIOA 1TTZA 3MAKA 3VURA 1FHEA 3JCML 5KN3A 4F82A 1DE1A 2VL9A 1A2MA 5B8AA 2H75A 1EGOA 1SL1B 1GWCA 2HRNA 4BWSA 3A5WA 4IN0A 5CYYA 1PL1A 4KGIA 5B8BA 2L4QA 5CRGA 3CRTA 1XXUA 1GSSA 3ME8A 4O7HA 4TXVA 2KLXA 2VL3A 4BWQA 5DALB 5EVOA 1F2EA 1N8JA 1O81A 5IMFA 1EV4A 4PTSA 1SL2B 1OC9A 5CO3A 2CX3A 5J3RA 4ZB6A 2YZHA 1SKSB 4RQXA 2HQTA 1R4WA 3APSA 3C7MA 1JZDA 5CRDA 1A2JA 2B1LA 3L4NA 4OCFA 3DWVA 4QQ7A 3LWAA 3GH9A 1H75A 2KP1A 3E9JB 2IN3A 2YNXA 2HNLA 4G0KA 4O92A 4OO4A 4MZCA 4KUNA 3GL5A 2FA4A 5B6MA 4K0GA 1XIYA 1YF0A 2FA8A 5JCUA 2GGTA 2IFQA 1FAAA 2H76A 3PPUA 4K2DA 1PKZA 2LRTA 5EY6A 3EINA 1TJDA 3LXZA 1WOUA 5ECPB 2K18A 1T8EB 4GLTA 3GFKA 3EMPA 1S3CA 2H01A 4NWYA 1KTEA 1AQVA 3D6IA 1VF1A 2FWGA 1VF3A 3ERGA 1GTIA 2H72A 4G19A 2LNSA 1XWCA 3DEXA 4IQ1A 3ZFBA 2NVLA 2N5BA 1TKDB 2P0GA 4LL1B 4YQVA 2X8GA 5D9VA 2R2JA 5H5SA 4PNGA 4JR4A 4NMUA 4ILFA 1V57A 2FNOA 3HJOA 5ECOB 2V41A 3VWUA 2M46A 5E4WA 2DMLA 1V9WA 3GKKA 2RUFA 3I43A 3KP8A 5IOXA 3FKFA 1TI3A 4KCAA 1LBKA 2LJKA 2C80A 1BX9A 3F8UA 1GP1A 3ZYWA 4AF2A 5ENUA 4MF6A 3ZVJD 4TR4A 1XVQA 3HVXA 4XS4A 1B4PA 4PQ1A 3KMNA 3HY2A 3KJYA 1GUHA 1HNCA 3GSTA 3FW2A 2YV9A 4NV2A 3D4MA 3ZL5A 3FZ9A 1RW1A 3A3TA 3H93A 1GNWA 1JFUA 5A5KA 1ZYEA 1R26A 4MH3A 2AV4A 4ISDA 2DC5A 5IMAA 2H19A 3LG6A 2R5GA 3TUEA 2VL2A 2VCXA 2IMFA 3N5OA 4G0LA 4NHZA 5A4UA 1B4QA 3EVIA 1ACVA 2OACA 4TXOB 5D9TA 3HA9A 3GA4A 2VLTA 2WULA 4I6XA 2LUSA 3EE2A 5AIXA 1LJRA 3VWXA 2VD1A 3VK9A 3M9JA 2DLXA 3TOUA 5DAKA 4IGJA 3UEMA 5ECLB 10GSA 4F9ZA 2AHEA 11GSA 3LORA 3ZZXA 3J7Yk 3VPTA 2V32A 4N11A 5ID2A 2L59A 5IMZA 1K0BA 5KN2A 1X9MB 1SD9A 2HSMB 4GWRA 1XPVA 2H66A 5JWRB 3LGCA 3F0IA 5ABRA 3VPQA 2OADA 1SJZA 4ID0A 2L5OA 1G0TA 1AAZA 2E2GA 4KCEA 1T00A 3CYNA 3CXGA 3PGTA 1FVKA 1OYJA 4IBPA 3GYKA 2OJLA 1C72A 4GCIA 3LEFA 5ECKB 4KX4A 2V1MA 2Z9SA 2C3QA 1A0FA 2HZEA 1GUKA 5B7CA 1X5DA 1WPIA 2DJ0A 3MDKA 2IJYA 5F8BA 2YWOA 1TK0B 2R4VA 4K1FA 1F6MC 3L9UA 3L78A 1NSWA 4D73A 3UBKA 2DIZA 1K3OA 2FLSA 3KIJA 14GSA 4MJBA 4O5RA 5IIZA 1S3AA 1MDJA 3WYWA 1U6TA 4ML1A 3CBUA 3TKRA 1X5CA 1BQ7A 1SU9A 1TI1A 3ZFLA 2H0IA 4IVFA 2H71A 2GDRA 1B9YC 4NHWA 4HEA2 1EEMA 1XOBA 3TJGA 3IXRA 3TRPA 5DCHA 4NXIA 4KDXA 3VWVA 4MZWA 4XCSA 4YAVA 1B48A 4OO5A 2VLVA 3P90A 4MH2A 4L8EA 3Q74A 3G9BA 3EC3A 1K3LA 3LYPA 4TR1B 3UVHA 2L57A 2VIMA 1I9DA 19GSA 1Z5YE 1DBYA 4V1Ag 3C1SA 5JCGA 1TRVA 3D22A 3BOAA 3TJBA 1SK1A 4JRRA 3HVVA 2H6ZA 2GQKA 3O3TA 5A4VA 3WGDA 1M2AA 5JCWA 2QSIA 1T4ZA 1S3DA 1PMTA 2CVDA 3KP9A 1SJIA 1WP0A 4X1UA 2NBSA 2ON5A 4K9ZA 4PGTA 2GSTA 2LS5A 5G1KA 2RLIA 4E8HA 3IK7A 3KMOA 5CRWA 1OE8A 4TN8A 5DJMA 3FZ4A 1IYHA 3HYPA 3F4TA 1F3AA 3DRNA 1X9WB 2CZ2A 1VRSD 4GTUA 2L5LA 4BPYA 4CHSA 3D4TA 3IE3A 1KBNA 2DIYA 2K6VA 3DGQA 3DXBA 1VGLA 2HYXA 2M80A 5IPGA 2AAWA 4WETA 4WKWA 4ML6A 3FEUA 3F63A 4MPFA 2NDOA 3HZ4A 4ZL9A 4K0NA 1TDIA 1U87A 4HOJA 4RI6A 4TR3A 1URMA 4KNDA 1V2AA 4IS0A 2JZSA 4ACSA 1HD2A 1MD4A 2FY6A 1XWBA 4Q5NA 1TP9A 2O87A 4BVXB 1U3IA 2MMNA 1QQ2A 2FWFA 4ECCA 5C04A 3KTBA 4KSMA 1QFNA 3TKSE 2GZYA 4DSSB 2H70A 1OKDA 2GZZA 4N0ZA 1K0DA 2L6CA 2VCVA 1HYUA 4IELA 3GKMA 4EXJA 3VLNA 4MP4A 4BVYB 2XPDA 2JL4A 1JLVA 1PSQA 5G30A 1ZL9A 4XHMA 3UJ1A 4GF0A 3S9FA 4GQCA 1DE2A 2VD0A 3QFAC 4PQHA 2C3TA 2RM5A 4TVEA 2V6KA 3DVWA 4YQMA 1AUCA 3IC8A 1XWAA 2BTOT 1SKWB 1YDKA 2A4VA 1U88A 3M1GA 1FG4A 4JE1A 2DJKA 3IHQA 4MJAA 3A2WA 3I69A 3C71A 5GZZB 1R7HA 4I97A 17GSA 2HRKA 22GSA 1XWGA 2MMOA 1HNBA 2C1YA 1RQMA 2AB6A 4N0VA 3K8NA 3HXSA 5HR2A 4BL7A 3D21A 2B1KA 4FH8A 5ELAA 1M99A 4L5LA 2YPMA 12GSA 3LQ7A 5G5EA 3ERWA 4HS1A 1O8XA 4JZQA 2B5EA 4WBRD 6GSYA 1OVNA 4ZBAA 3GTUA 3MSZA 4FYUA 3GRXA 2GSRA 4KE3A 1ZZYA 4PURA 1Q98A 1ZCPA 3FHKA 3FZAA 3IRAA 4I8BA 1WJKA 3EU4A 4EKZA 3FZ5A 3GH6A 5F05A 1XBSA 3PINA 3ZVJA 1ZOFA 5D8IA 4OMVA 1BAYA 2VCWA 2I9HA 1X9SB 2IIYA 2I3YA 4IP1A 2YJHA 1GSYA 2B5YA 1GSQA 5AGYA 3BJ5A 4OD7A 3RAZA 2PMTA 1JZRA 1GTBA 2CAIA 4PUAA 2UZ8A 3LXTA 1A23A 5D93A 5DVBA 5CAXA 1SJ6A 4OFTA 3WD6A 1ERWA 2WDUA 5J4UA 2H0GA 2XHFA 5DQYA 1SENA 1GULA 3ZREA 1Y6EA 2OE0A 4Q5QA 5HR1A 1DUGA 1EZKA 2R3XA 5D73A 3HJMA 1O85A 3M9KA 2IWTA 2X99A 3IDVA 4G10A 3F3RA 3VFIA 2G2QA 3FRCA 5D96A 2H1BA 1B9XC 2OE3A 5HFGA 3I6AA 2CX4A 2YCDA 2GT5A 4G9HA 2MBTA 5INYA 1O6JA 2QGVA 5J5NA 3OR5A 1A24A 1LU4A 4OFMA 3QOUA 2B7JA 4FQUA 3LFLA 4K7OA 2X8HA 3KH9A 3P7XA 1TXXA 5ID2B 2ZCTA 3DD3A 3L0HA 2PVOC 1F9MA 1M2BA 4YQUA 1EP8A 5LCZA 2WCIA 3FR6A 4BA7A 5ECIB 1A8LA 2H30A 4ZILA 2YOIA 2P5RA 2CA8A 4TOPA 1XVWA 2FUG2 2ALBA 2PERA 3F9UA 2WS2A 1PN9A 4KDYA 2N5AA 4ZB8A 5D9XA 4HU9A 4PUFC 3FY7A 4PNFA 2I4AA 1TRSA 1WIKA 4DSRA 3HD5A 3TKSC 20GSA 2CZ3A 9GSSA 2C3NA 2LSTA 4MPGA 4MA9A 2F9SA 3ZIJA 2PN8A 1GTAA 2JZTA 1XOAA 4FYBA 3TDGA 4KSOA 2WGRA 1BJXA 3U6VA 1MDKA 2WFCA 2CVBA 2H6XA 3IAM2 5AIVA 5IMDA 2HZFA 2JACA 3CTFA 1QK8A 3FR3A 5IMCA 2VUPA 2VLUA 4POMA 4IQAA 1G7OA 4AJ7A 13GSA 2KHPA 3M0FA 3KD0A 2F3MA 2P31A 1AQXA 4FIWA 1K0MA 3EURA 1K3YA 1PD21 4L0UA 4WXTA 4K7NA 4F0BA 2H1GA 1NHYA 1DSBA 2JADA 4NAXA 1WWJA 4PQIA 3Q18A 2PGTA 2FHEA 4MF7A 3US3A 1O7UA 1OE7A 5CREA 3IR4A 2H1DA 2VOCA 3ED3A 1SK2A 4WF5A 5G5FA 1O8WA 3HCZA 3IV4A 2C0FA 2I81A 2O8VB 3D5JA 3M3MA 3QCPA 1GTUA 5AISA 3QAGA 3EMXA 2B6MA 6GSUA 2PU9C 4ZL7A 3W6GA 2O89A 2B7KA 3ZIVA 1YF1A 1GSFA 1Z7PA 3C8EA 3J7Yb 1OC8A 1PA3A 3ERFA 3R2QA 3GIXA 5F06A 1CQHA 5FT3A 3TOTA 1M7TA 2LQQA 2YWIA 1OAZA 3KM6A 2QC7A 1K0NA 2C4JA 3UBLA 2OBKA 3H8QA 3CRUA 4CDOA 1HNAA 4TXOA 1OC3A 4WF4A 3HDCA 2TRXA 4JEDA 4TRXA 4EF0A 2HE3A 3GNJA 1YKCA 3C1RA 3QFBC 2LEGA 4V2MA 1MD3A 2DMMA 3BCIA 3UAPA 2FGXA 4XIHA 3GL3A 5CNWA 1T7PB 3BBYA 1E2YA 2ZUPA 2GTUA 3VI5A 2X8CA 4TW5A 2GT6A 1QUWA 5J9BA 4HDEA 2GQMA 2B5XA 2HSHA 3FR9A 4HU7A 1GLQA 5HQPA 2HSMA 3EWLA 4GXZA 4NPBA 2ON7A 1UN2A 1Z7RA 2ZNMA 4IHUA 5IM9A 3WGXA 4X0XA 5HFKA 1EOHA 5G1LA 1RK4A 3GMFA 1AXDA 1EGRA 1NM3A 4POBA 2VCTA 4XS1A 2L6DA 1XW6A 2GSQA 4MLYA 1ZMAA 1AIUA 3KGKA 5A4WA 3LYKA 3WT1A 4EVMA 4KA0A 2PVQA 5CRHA 2R37A 5IOWA 3BCKA 4HZ4A 2HI7A 2HRAA 5ECMB 2CQ9A 4PXOA 2I1UA 1J9BA 1VF2A 3HJPA 3IBHA 5EPFA 1I5GA 3IC4A 1SK0A 5J9CA 2HXKA 3TJJA 4K6XA 1JHBA 1YZXA 2H8LA 4K7IA 2WRTA 2CV4A 1GLPA 2HLSA 2E7PA 2RIIA 3QMXA 1SL0B 3ISOA 4HJMA 3P2AA 4TR1A 3G7IA 4OCEA 4DSQA 3A2XA 2MMZA 1Z6MA 1OC9B 2YWNA 3DVXA 5ECHB 5E59A 1TK5B 2H73A 2TRCP 3RHCA 1SYXA 3ZMKA 1PL2A 1HQOA 2J9HA 5H5RA 4LMWA 4L0WA 2CVKA 3O6TA 1BEDA 3CMIA 1TOFA 3GX8A 3IK9A 4MDCA 4X43A 1FO5A 2K9FA 1F3BA 2H1AA 4KH7A 1O73A 4ULXA 5JWOB 3QDNA 4K8MA 1FB0A 1ZGNA 4POLA 3TRXA 3RBTA 2HRFA 3P8WA 2LQOA 4N10A 4KAEA 5AN1A 5IPHA 3TKQA 2DJ2A 2M72A 4V2NA 3W8SA 1EV9A 5DBQA 6GSVA 4WR5A 3KEBA 3WT2A 2IFQB 2IMKA 5D9WA 1WMJA 2NPBA 4DVCA 1YY7A 3IAS2 3HVSA 3EU3A 4ZL8A 1GL8A 4ECBA 2X64A 1XFLA 1PRXA 1TU7A 3RDWA 1Y25A 1KEBA 1A8YA 2IMEA 4CW9A 4I2UA 3TRQA 4MMMA 2YN1A 4G2EA 1TRUA 3CTGA 3ZITA 2IMDA 5GAND 2GS3A 2MZCA 1FVJA 3MNGA 1QMVA 4GSSA 1ILOA 3O76A 1TK8B 1K0OA 3UVTA 1GSDA 2IMIA 2FWHA 3LSZA 2IPAA 4EO3A 3QD9A 4EDYA 2HSYA 2RM6A 4BVXA 18GSA 1XW5A 4ECJA 3DYRA 3SBCA 3BD2A 2LNTA 5IMVA 4KDUA 3UIWA 3H79A 2EC4A 5ECRB 2GLRA 3H1NA 1PQNA 4DEJA 5LD0A 4DSSA 1BYEA 4IJ3A 4ZXGA 1AW9A 5IO0A 4XS4B 3NZNA 1QXHA 1R5PA 1EOGA 5G31A 2VAFA 5IO2A 2XBQA 2XC2A 4BVYA 1JZOA 1EP7A 4Q5FA 1GSUA 3QAWA 1THOA 1G7EA 4I2TA 3CSJA 1E6BA 1W4VA 2PPTA 3F3QA 2CAQA 4IW9A 4OFNA 3HKRA 4MK3A 4RQRA 2A2SA 3L9SA 3I9V2 2CT6A 1PKWA 3KXOA 4EDZA 2OA7A 1NHOA 1SD8A 1USBA 5IQYA 4GQFA 4YAPA 2V2GA 1MDIA 2D2ZA 1IYIA 3AY8A 5GSTA 2YP6A 5FHIA 2VCQA 1U3AA 5ECNB 3UL3A 2O85A 1X5EA 3KH7A 3TJFA 3CSIA 1J0FA 4J56E 1V98A 2K8SA 4AJ6A 3IPZA 4XRDA 2OBIA 3VWWA 4F2IA 3APOA 5B6NA 5DALA 3D0ZA 4ZB9A 5DAKB 3FK8A 3RPPA 5COHA 1CQGA 1N2AA 4TKYA 1W89A 1XWKA 2O7KA 1F37A 2HT9A 3ZMLA 4IKHA 3GHAA 4LL4B 4EUYA 1BG5A 2VL2C 4G0IA 4HZ2A 2JZRA 6GSSA 1XZOA 1AC1A 4HJ2A 4USSA 2BJXA 1Z6NA 2DSAA 5ECSA 1G6YA 4F03A 4ZBBA 3C73A 4EL1A 1UC7A 3ZRDA 2HZEB 4XRAA 2VM2A 2DJJA 2FD3A 2GQLA 3VI7A 3PR8A 4GSNA 2OE1A 5GSSA 5BMUA 1B8XA 3F4SA 4KF9A 5EL8A 4FO5A 3UOMA 2V6OA 4D73B 3LJRA 2GVPA 5HR0A 4EC0A 2IL3A 5L71A 2WB9A 2VM1A 1PX7A 5DJLA 1EWXA 1SYRA 2MMAA 3V1WA 5KN1A 1MEKA 2DJ1A 3Q6OA 3HZ8A 2QKEA 1TW9A 1THXA 2E0QA 2VO4A 2LRNA 3W8JA 2DBCA 2C8UA 4JU5A 5CP1A 2YWMA 2RUEA 1X0RA 3H4KA 4EE0A 2XPEA 4MF5A 2TIRA 4N30A 3UARA 3TKSA 2C0DA 2LJRA 2YZUA 2GSSA 1PX6A 1ML6A 4OWYA 1M9BA 2HFDA 1T1VA 2P5QA 3KCMA 1GNEA 2EIQA 2LV3A 1YKAA 4PX1A 1XCCA 3E3EA 2F8FA 3FYGA 5J41A 2EIRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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