3CRU | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	214
structure length	214
Chain Sequence	MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGCEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Using affinity chromatography to engineer and characterize pH-dependent protein switches. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Schistosoma japonicum
molecule keywords	Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme
total genus	68
structure length	214
sequence length	214
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	2008-04-07

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A	PF14497	GST_C_3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	3cruA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3cruA01

1M0UA 1N8JA 2H8LA 4EO3A 5FHIA 1T7PB 5ECNB 1WRYA 4KUNA 3DVXA 1K3YA 1M99A 3C71A 4MP4A 4PUAA 5F0GA 2VOCA 2ES7A 3LORA 4KW6A 3NOFA 5F06A 2VCVA 2GZZA 1ZYEA 4DVCA 1YZXA 1U3IA 2QKEA 2CA8A 1GTIA 5IPGA 2VD1A 2CAQA 3TJFA 1XWBA 4NWYA 3M9KA 5DQYA 1HD2A 2C8UA 4TXOA 4CDOA 1O8XA 1S3CA 2V41A 5JWQB 3TKSC 2GSQA 1O6JA 3KMNA 2FNOA 2HSMB 3BCKA 4RQRA 1XW9A 2GQMA 3ME8A 1BJXA 4MABA 3IV4A 1F9MA 2H75A 3RBTA 4V2MA 1QFNA 4PGTA 4WETA 8GSSA 4XIHA 1GSFA 2L6CA 1R4WA 5DCGA 2H0GA 3Q6OA 5LD0A 1YF0A 1TRUA 2IMFA 4BWSA 5IMVA 5JCWA 3ZITA 4ZIJA 4FYCA 4I2TA 4KX4A 14GSA 1X9WB 1Y6EA 1J0FA 4AF2A 4I5QA 5LCZA 5HR3A 19GSA 2X8CA 3GTUA 5H5QA 2KP2A 3KGKA 2BTOT 2K8VA 2GZPA 2YV7A 4ZBBA 1SL0B 3IOSA 2VAFA 3H4KA 3ZL5A 3BOAA 4IGJA 2R5GA 4G0IA 5AN1A 4RQXA 4YQUA 1NHOA 4PX1A 3VWUA 3CSJA 1V9WA 5J9CA 3GV1A 3VWVA 3Q19A 2LRCA 2NDOA 3CYNA 1DE2A 1V57A 4DSSB 5ECPB 5HFIA 10GSA 3RHCA 1TI3A 1FB6A 1E2YA 3FY7A 1Z6NA 2DIZA 2OBKA 1SKWB 6GSSA 2X64A 1WPIA 4KCAA 1T00A 4WEYA 2WS2A 2H30A 4TXVA 3M1GA 3KP8A 4IP1A 3TKRA 1GWCA 4PURA 2F51A 1GNEA 1SENA 2VCXA 4ML6A 4AJ6A 4MF5A 3VWXA 3W6GA 2LQQA 3FK8A 2HI7A 2L5OA 2J23A 4TR4A 1A23A 4EE0A 3EWLA 6GSTA 2PGTA 2YV9A 2XPEA 3F9UA 2H74A 4F0BA 2EIOA 4ZL8A 1T8EB 2FA4A 1MTCA 2LNSA 1GSSA 4OFNA 4XS4B 4BVYB 1M9AA 4X0XA 2WGRA 2H19A 2B1LA 1OC9B 2G2QA 1YEPA 2H76A 1AAZA 1KEBA 3L9UA 4IQAA 3FR9A 2HZEA 3FZAA 1B4PA 4JR6A 1DE1A 2WZ9A 2KUCA 1B4QA 1GSEA 5D9VA 18GSA 4MDCA 4I97A 1F6MC 3HKRA 2YWNA 3KIJA 4K0NA 3ZIVA 2N5BA 4YQVA 3DEXA 3HVSA 3VI7A 2KOKA 2QGVA 1ERWA 11GSA 2M80A 5HQPA 1HYUA 1XWAA 2LJRA 4GCIA 2YCDA 3TKPA 1Q4JA 3KJYA 2HSHA 4H86A 3HCZA 2H70A 1LBKA 1WOUA 4TVEA 4FH8A 2LNTA 2RIIA 3DKSA 4BA7A 4EF0A 3H79A 1G7OA 2P5RA 1M2BA 4ZILA 1FB0A 3UARA 5DVBA 5JWRB 1K0DA 3IR4A 2HFDA 4GF0A 3VFIA 2H6XA 1A8LA 4O92A 4MLYA 5KN1A 1TTZA 2PPTA 22GSA 2AB6A 4LMWA 4PQHA 5IMDA 1M7TA 2IWTA 3DMLA 4GQCA 4HZ2A 4MH3A 5D8IA 3H1NA 1F2EA 2X8HA 2DJ0A 4TXOB 2CVDA 1UA5A 4F9ZA 3ISOA 3PR8A 1IYIA 3A2XA 2H01A 3ZVJA 4MPFA 3GSSA 1PQNA 1A24A 1ZYQB 1NHYA 4MZBA 2YN1A 4EL1A 1ZZYA 2NVLA 2WB9A 2KP1A 2GZYA 2KLXA 2H66A 5EVOA 2QSIA 1HNAA 4E8HA 2CX4A 3UEMA 3P2AA 3KZQA 3TUEA 3UVHA 4MF6A 3TKQA 5LNKe 4P3YB 13GSA 2GSSA 4IP6A 2K9FA 3GKNA 2M72A 4G0KA 1OKTA 3EYTA 1EWXA 2ZNMA 3GTUB 2QC7A 2GS3A 2P0GA 1TU8A 1EGRA 5F07A 1SD9A 3IC8A 3JCML 3V1WA 5CO3A 1K0AA 2X99A 2VLTA 5GZZB 3HY2A 2TRCP 5ECSA 1ERUA 2LJAA 3E9JB 2MZCA 2CQ9A 4MJAA 3WGXA 4PXOA 3O3TA 1EV9A 1XOBA 4NV5A 1M2DA 4K7OA 3MAKA 2L57A 3D5JA 3CSIA 3L9SA 17GSA 5ECRB 2YWOA 2N5AA 1ERVA 1PL2A 3GYKA 5BMUA 1VF3A 5H5RA 1PN9A 1Z5YE 2O85A 2PU9C 5EPFA 3FEUA 4PTSA 3KTBA 3ZYWA 5JWOB 3HVXA 4ZB8A 3H93A 2R37A 1ZGNA 2B7KA 4OCEA 3HJMA 5CRGA 3RDWA 4XCSA 4NAXA 1WP0A 3WYWA 2YP6A 3TCOA 3IRAA 4WXTA 5B8BA 4YAPA 6GSWA 4FIWA 3PINA 1K3LA 2LKUA 5CRWA 3IA1A 2R6KA 3ERWA 1ON4A 5IMFA 1XXUA 3QR6A 1MDKA 3GL5A 1LJRA 1FOVA 3BBYA 1SYRA 3VURA 2I81A 5ECIB 3KXOA 3D4MA 1I9DA 4G10A 4X1UA 2YPMA 1YY7A 4ZB9A 1LU4A 2HZEB 4ULXA 1SL2B 4D73A 5HR2A 2FWFA 3QAVA 2XBQA 2L59A 3GH9A 3EU4A 2C4JA 2JSYA 2XPDA 3A2WA 3TB2A 3O6TA 3F0IA 4EXJA 3D21A 5COHA 3VLNA 2BJXA 2YJ7A 4MMMA 3KMOA 2HNLA 4ZBAA 5G1LA 3WGDA 4KF9A 1XVWA 1Q98A 5JCGA 3KP9A 2JL4A 3TJGA 5HR0A 3FKFA 2WFCA 1AQXA 2V32A 2DBCA 1TK5B 2RUFA 3G7YA 3O76A 2V1MA 2BMXA 5F05A 1K0OA 4L5LA 2HT9A 4HUAA 4MPGA 5IO2A 2AJQB 3BCIA 1WIKA 2L4QA 3MSZA 2NPBA 4N11A 4IKHA 2DMMA 1N2AA 5G30A 3RPPA 2LRTA 3F6FA 5KEJA 1W89A 4MCUA 3FYGA 4O5RA 1SJIA 1ZMAA 2B5XA 4K1FA 4USSA 1FVKA 3HD5A 4KDYA 1QXHA 3GNJA 4MF7A 1OC8A 3ERGA 4MK3A 7GSSA 2L4CA 4L0UA 1TRWA 3IHQA 2N5FA 1SKRB 3HA9A 3CXGA 5ECMB 9GSSA 4TR1A 1VF2A 2GSRA 3CRUA 3GL3A 1MDJA 3IXRA 1GH2A 1GSDA 1U3AA 4TKYA 2A4VA 3TRQA 4Q5NA 3ZLPA 1T4YA 4E8EA 4N0VA 3I43A 3G7IA 1VGLA 3APOA 1DSBA 4ZXGA 2JU5A 5GAPD 4Q5FA 4BL7A 4PUFC 1E6BA 2IIYA 5IMAA 4IN0A 4ECCA 1ML6A 2PUKC 3C7MA 4EDZA 1B48A 1EP7A 1SJZA 1TK8B 2OE0A 2V6OA 4JBBA 2PWJA 4RI6A 4ZL9A 3HZ8A 2GT6A 5E4WA 2K6VA 4J56E 1GTUA 5AIXA 2IFQA 3RPNA 1DUGA 1EEMA 2VL9A 3QDNA 5AISA 3P8WA 2YWIA 3SBCA 1OC3A 2JSZA 4NXIA 3PPUA 4GTUA 3M0FA 1IYHA 2VLVA 5ECLB 3IDVA 1QUWA 5CNWA 1B8XA 1GSUA 2F9SA 3C73A 2UZ8A 1PSQA 3ZMLA 1TOFA 1XOAA 5IM9A 2MBSA 3W8SA 1XWCA 1THXA 5GSSA 1WWJA 2LRNA 3EMPA 5J3RA 2ON5A 3ZVJD 3ZIJA 1A2LA 1A0RP 2VL2A 3GFKA 4FYBA 4D73B 4JEDA 3VPTA 1K3OA 4OO4A 4Z7XA 4ECJA 6GSVA 3F6DA 1Z7RA 1TK0B 4F2IA 1GLPA 4GSSA 3KD0A 4RUVA 2IMDA 5C04A 1T1VA 2D2ZA 3IAM2 1SYXA 1A8YA 4HDEA 1YF1A 4ECIA 2AYTA 3QOUA 3FR6A 2B5YA 3HYPA 5L71A 4K9ZA 1SK0A 1X9SB 3K8NA 3D22A 3VWWA 4IHUA 2CZ2A 3HHVA 1JZOA 4NHWA 4GWRA 2VO4A 3TKSA 4ILFA 2MYGA 3GKMA 3EU3A 3EVIA 3LFLA 4ACSA 1JFUA 4K7NA 2B5EA 4J2FA 1J08A 4OD7A 2XBIA 4IELA 2B3SA 2GVPA 4KSOA 3TJKA 3FZ5A 4MA9A 1U6TA 1YDKA 4JZQA 4KDUA 3I9V2 1X5EA 2I1UA 4ID0A 5DBQA 1QQ2A 1BX9A 4HU9A 1F3AA 3APQA 2AV4A 1X5DA 3IAS2 4J57E 3KCMA 3P7XA 1WMJA 3LYPA 3KH9A 3TRPA 1EOGA 2HRKA 2RLIA 4V2NA 4YQMA 1G6YA 3LJRA 1K0MA 2YJHA 1JZDA 1AUCA 4XRDA 1PMTA 2B1KA 1USBA 2IL3A 4V1Ap 3Q74A 4HEA2 3UVTA 1FAAA 4FYUA 2PMTA 5AIVA 4LLRA 1AC1A 3M9JA 4TOPA 5D73A 1U87A 3F4SA 1A0FA 5IOWA 4EC0A 2HE3A 2VUPA 4MZWA 3I69A 5DJMA 4TR1B 5ELAA 3APSA 4G9HA 4V2LA 1ST9A 4GXZA 1O7UA 5C00A 1RW1A 2VD0A 3KH7A 4QL7A 4HOJA 2DJJA 4I6XA 2FWEA 3W8JA 2CZ3A 1GRXA 2NBSA 5HR1A 1GULA 2CX3A 1AXDA 2WULA 1SJ6A 1PD21 1FHEA 4WF5A 3LSZA 3ZREA 2OBIA 1VF4A 1KNGA 2FCHA 2TRXA 3FZ9A 1A2JA 2LUSA 4ISDA 1BEDA 6GSUA 1G0TA 3TJJA 3S9FA 5IPHA 3HJOA 2AAWA 2C0FA 3GKKA 4TRXA 4IJ3A 4GLTA 4HJ2A 3IBHA 2A2RA 2GDRA 4KDXA 3HDCA 2GT5A 4HS1A 2AUVA 3N5OA 2VLUA 2DJ3A 4O7HA 1MEKA 2IFQB 5DQSA 3G7JA 4IQ1A 1JHBA 5J41A 16GSA 2PVOC 5CREA 2VIMA 1SU9A 2WJUA 4MJCA 5A4UA 4HU7A 3IC4A 3A5WA 5ECQB 3UAPA 3C8EA 3UOMA 1XZOA 3LEFA 2HRFA 1MD4A 4G0LA 3Q18A 1TKDB 1GL8A 5J5NA 2DC5A 2YZHA 4HZ4A 1XBSA 2C3QA 2P31A 3J7Yb 5G5FA 4MZCA 4L5OA 1H75A 1AQVA 2LS5A 3GA4A 3DVWA 4I2UA 3F4TA 2XC2A 2V2GA 1XWKA 2DLXA 1H4OA 1ZL9A 1O81A 3FHKA 5G2ZA 1VF1A 1F37A 3LYKA 4XS4A 2HQTA 5J9BA 3KM6A 3DD3A 3QMXA 3HZ4A 4POBA 3EE2A 4WBRD 4TR3A 5B6NA 4GRFA 5IOXA 2GQKA 4GSTA 5CAXA 5G1KA 1I5GA 2FY6A 20GSA 3UBLA 3QFBC 2VL3A 2OE1A 2RUEA 2IMEA 1GLQA 1TDIA 3TOTA 2DIYA 1OYJA 1MD3A 5ECOB 2HZFA 1PRXA 5A5KA 5KN0A 3ZFLA 2R2JA 3F63A 2FLSA 4IBPA 3US3A 1FVJA 1C72A 3HVVA 1EZKA 1O85A 5D9WA 1V2AA 2ZUPA 4ZB6A 2IN3A 4OWYA 3WT1A 5IMCA 1GUHA 3L4NA 1O73A 5IIZA 3UIWA 1YEXA 4EKZA 2VCZA 1QMVA 3GX0A 5DAKA 3DIEA 2HSNB 2R3XA 2YNXA 1K0NA 4WF4A 2IMKA 2DJ1A 5ID2A 4OCFA 1HNCA 1OKDA 2H0HA 3LGCA 1M2AA 3WT2A 3WGEA 2HXKA 1V40A 3ZRDA 2GSTA 2CAIA 4IVFA 4IW9A 2DJKA 1GP1A 2P5QA 1TRVA 1M9BA 1EOHA 2HRKB 5FT3A 3EURA 4MH2A 1PGTA 1JLWA 4FQUA 2M46A 2IPAA 4XTSA 2MBTA 4NV2A 1X9MB 1GTBA 2ZCTA 2MMAA 3BD2A 1PA3A 5J4UA 4N30A 4OMVA 4LMVA 3FZ4A 2XHFA 4KA0A 4CW9A 1SL1B 3VPQA 3QAGA 3G9BA 2EIQA 5B7CA 1K0CA 2YZUA 2FHEA 1T3BA 3TRXA 1OVNA 4HI7A 3TOUA 5H5SA 5DALA 4NPBA 5HFGA 1EV4A 3DGQA 5B6MA 1GSQA 1JZWA 4F82A 2WRTA 3TJBA 5B8AA 3C1RA 5F8BA 1OAZA 2HLSA 1TXXA 3ME7A 5EL8A 1SK2A 3AY8A 3I6AA 5ABRA 4POKA 1XIYA 2NTOA 1XVQA 4IJIA 4N0ZA 2MMNA 4WKWA 1PX7A 1RQMA 2CT6A 2YANA 1R5AA 3EC3A 3MWHA 5CP1A 3ZTLA 3KTLA 3GMFA 5DCHA 2OA7A 4YH2A 1B9XC 1Z6MA 1R5PA 5D9XA 2E2MA 3LG6A 1XW6A 1BAYA 3N9JA 5IO0A 3IK9A 2O89A 1Y25A 4JRRA 4KE3A 4Q5RA 3F4RA 2RM6A 3GSTA 2PERA 4OO5A 2RM5A 2H1GA 2JZSA 4ZBDA 1ZOFA 1G6WA 2C3TA 3ZMKA 2FUG2 4CHSA 1WE0A 4GSNA 1OE7A 2O7KA 2FD3A 3ZFBA 3C1SA 3ED3A 1XWGA 1GUMA 2K18A 2F8AA 3CMIA 3PGTA 3UMAA 3R3EA 5GSTA 3TGZA 2CVBA 1XW5A 1J9BA 2EIRA 5D9TA 1ACVA 4ECBA 4PQ1A 3GKXA 1JLVA 1BYEA 2V6KA 1Z7PA 1S3DA 2R4VA 3NIVA 2H71A 3DRNA 2H0IA 1TI1A 1XFLA 2EC4A 1BG5A 4HQZA 2I4AA 1SKSB 4KAEA 4POLA 1OE8A 1NM3A 4NHZA 2FGXA 2HYXA 2C3NA 4K8MA 2DMLA 5CYYA 4IS0A 2G0FA 3HJPA 4XHMA 2OACA 1W4VA 3OR5A 3FW2A 2VM2A 4L8EA 4XS6A 3M3MA 2I9HA 4DSQA 2JZRA 2VCWA 4KNDA 2L6DA 1UC7A 4KSMA 4EVMA 1PX6A 2FWGA 1ERTA 2YWMA 1XPVA 1GTAA 3CTFA 5KN2A 2HRAA 2JADA 1GUKA 1FG4A 3RHBA 3A3TA 1V98A 4MJEA 4WBJA 1TRSA 4K6XA 3GURA 2L5LA 1UVZA 2O87A 3VI5A 2C1YA 4KCEA 1EGOA 5KN3A 4BPYA 3IK7A 1Z3EA 4AJ7A 2LSTA 3P90A 4BVXA 4EDYA 2IMIA 1TJDA 5D93A 3HXSA 1PKZA 1SD8A 1X0RA 4NMUA 2CV4A 2E7PA 1U88A 2KHPA 1RK4A 2LJKA 1G7EA 3CSHA 5DAKB 2LTKA 3IPZA 1Z9HA 5A4WA 1CQHA 1R26A 2GTUA 2IJYA 2AHEA 3QD9A 5ID2B 2VCQA 5FWGA 5G5EA 3IE3A 4Q5QA 4WR5A 2X8GA 4EUYA 3DYRA 3FRCA 3E0UA 4V1Ag 3EMXA 2H72A 4K2DA 2I3YA 3F3RA 3QAWA 4QL9A 1ILOA 4POMA 2OKAA 2MMZA 2B7JA 4ML1A 2MMOA 4I8BA 2DJ2A 4DEJA 2OJLA 1EP8A 4YAVA 3SWLA 1K0BA 3L9VA 2HSMA 1KTEA 2H1BA 4HJMA 2VM1A 1PKWA 2OADA 2GLRA 3U6VA 3ZZXA 1YKCA 3GH6A 5D96A 5ELGA 1BQ7A 1KBNA 2A2SA 1JZRA 2ON7A 4PNFA 1V58A 3UBKA 2YOIA 1GNWA 5ECHB 1TW9A 3MDKA 1YKAA 5DALB 4L0WA 3TDGA 2LEGA 2GQLA 4KGIA 1A2MA 1NW2A 1T4ZA 2ALBA 3CBUA 1R7HA 3F8UA 4JR4A 4PQIA 1URMA 2H6ZA 5CRDA 6GSXA 5AGYA 2VCTA 3DWVA 2K8SA 3CTGA 6GSYA 3U5RE 4JU5A 4LL1B 2DSAA 4BL7B 1YJ6A 1HQOA 1B9YC 2WDUA 2OE3A 4F03A 4O32A 1AQWA 1QK8A 3L0HA 4XRAA 2E2GA 4HQSA 2JZTA 3EINA 1TU7A 4F0CA 5G31A 3UJ1A 3D6IA 3LXZA 1VRSD 2HSYA 4DSRA 3QFAC 1HNBA 4MJBA 2J9HA 3QCPA 4WR4A 12GSA 2LV3A 4DSSA 4KB3A 1EEJA 4FO5A 1O8WA 1AW9A 5DDLA 3F3QA 2PVQA 1ZCPA 1S3AA 4N10A 1TP9A 2HRNA 2H1DA 2CVKA 2C0DA 2F8FA 3WD6A 3GHAA 2FA8A 1CQGA 4X43A 1GSYA 1F3BA 4KH7A 5INYA 3FR3A 5JCUA 5GAND 2LQOA 3PH9A 4AGSA 2C0GA 3E3EA 3MNGA 2JACA 1SK1A 4RI7A 2C0EA 2O8VB 1THOA 5CRHA 3LQ7A 2WCIA 1ABAA 2PN8A 4OFTA 1DBYA 4LL4B 1MDIA 1FO5A 5EY6A 3M8NA 2Z9SA 2C80A 5A4VA 4BVYA 3CRTA 3R2QA 3KEBA 2H6YA 4TN8A 4TW5A 1OC9A 2F3MA 3LWAA 3J7Yk 4OFMA 4G2EA 1X5CA 3D4TA 3TKSE 4QQ7A 3LXTA 4K0GA 5HFKA 2FWHA 4XS1A 3H8QA 4PNGA 4AJ8A 1UN2A 1PL1A 2H1AA 3VK9A 4G19A 5IQYA 2TIRA 3ERFA 3RAZA 3UL3A 3L78A 2E0QA 3GX8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3CRUA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations