3HKRA

Crystal structure of glutathione transferase pi y108v mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
PYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIVTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Influence of the H-site residue 108 on human glutathione transferase P1-1 ligand binding: structure-thermodynamic relationships and thermal stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutathione S-transferase P
total genus 79
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3hkrA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hkrA01
5KN2A 2LS5A 1GL8A 5IOWA 1X5EA 2RM6A 1QXHA 1URMA 4GWRA 5EPFA 1OAZA 2FCHA 5DVBA 4PTSA 1M7TA 4XIHA 3EC3A 4L5OA 1PRXA 3KM6A 1TW9A 4JZQA 1QUWA 3G7JA 2PN8A 1AW9A 1XWBA 3GKKA 3PH9A 3VWXA 1TU8A 1SD9A 3R3EA 2H76A 3KH7A 2CX3A 4XS4A 3ZIVA 5E4WA 4YH2A 3DIEA 1S3AA 2N5FA 3BCIA 3HKRA 5AGYA 4V2MA 5J5NA 4DSSA 2B1KA 1LU4A 3F3RA 4K7IA 3QD9A 1FVKA 4F0CA 4MK3A 3JCML 3F0IA 4DSRA 1WP0A 1OC9A 5CO3A 2EC4A 4JR6A 2XHFA 3L4NA 1LJRA 1UC7A 4LLRA 2B7JA 4MH3A 2L57A 5H5RA 4E8HA 5D73A 4LA1A 4HQSA 3LEFA 3BCKA 19GSA 4KCAA 17GSA 1ZYQB 1UN2A 3CBUA 2GLRA 4MF6A 20GSA 2B6MA 3D5JA 6GSUA 1QK8A 5ID2B 1SK0A 5ECRB 1JFUA 1XOBA 3US3A 1HYUA 4EXJA 1A0RP 4IS0A 3CXGA 2HRFA 2HZFA 5IM9A 1YKCA 2DBCA 3CSJA 2B7KA 2RIIA 5CREA 5G1LA 1GTIA 1RK4A 4ZL9A 3CYNA 2PBJA 5ABRA 1F9MA 2L6DA 1Z7PA 4HOJA 1R4WA 2YV7A 2DC5A 3IAS2 1GP1A 5HR2A 1AAZA 3I69A 1NSWA 1PX6A 4PQHA 2HXKA 6GSSA 3IK7A 1TK0B 6GSVA 4ZIJA 1OE7A 3M1GA 2R6KA 2A4VA 3HVXA 2DJ3A 1H75A 2FLSA 2IWTA 1GTUA 3VWUA 2B3SA 1YY7A 5DJMA 4MPFA 4OO5A 3LXTA 2YWOA 2HE3A 2GSTA 3KJYA 5IMVA 3FZ9A 2Z9SA 2V2GA 3FW2A 1XOAA 1A2LA 3TKQA 4X1UA 3E0UA 5ECLB 5A5KA 3FK8A 3CTFA 3CTGA 2J9HA 3F4RA 2H19A 3DMLA 4H86A 1ZZYA 1F3AA 5A4VA 3E9JB 1OE8A 2H0HA 4NWYA 1SL1B 5ECOB 1XWAA 5LNKe 2JZRA 3PR8A 2H6XA 1X0RA 4KAEA 4TR1A 4PURA 1GTAA 4HDEA 4D73B 2VLVA 2VCTA 1T4ZA 2C8UA 1U6TA 3NOFA 2CA8A 4HS1A 5A4UA 1SK2A 4O5RA 5F06A 2FA8A 3KP9A 4ZL7A 5JCWA 4NPBA 2AHEA 2O89A 1XW9A 2I1UA 1XFLA 1TK5B 4IGJA 2GZYA 4OCFA 2VLUA 4E8EA 1IYHA 1U87A 1X5DA 4K1FA 1G6YA 1BG5A 1K0OA 2H70A 3GTUA 1JZWA 2GGTA 3QR6A 3LXZA 2KP1A 1ZMAA 4DVCA 3TKSE 2WB9A 2C3QA 4O7HA 3D22A 4TXOA 3IK9A 3ERGA 4MZWA 3HDCA 4Q5FA 3N9JA 1SU9A 5CRGA 1ML6A 5DBQA 5FHIA 2FWEA 3WGEA 4IP1A 2NBSA 4HUAA 1GLPA 5AISA 4GLTA 4MZCA 2X8GA 4AF2A 3GYKA 4N10A 2LNTA 1RQMA 2H6YA 5JCGA 1JHBA 4AGSA 1FO5A 3GURA 3ZVJD 2AV4A 1R5AA 6GSWA 4KCEA 2LRTA 3QPMA 2IMEA 3F9UA 1V58A 1VRSD 1TI1A 2OE0A 3PPUA 1YDKA 1YZXA 3KMNA 4OFTA 5D8IA 2JL4A 2VM2A 4V1Ap 2JSYA 2JACA 3D4TA 2YPMA 1GLQA 2HNLA 1FB6A 2M72A 2H1AA 2R2JA 4YAPA 1U88A 5EY6A 5IO2A 4LMWA 3H93A 2GVPA 1MDIA 3EWLA 2AYTA 1RW1A 2WFCA 2VUPA 5D9XA 2IJYA 2DSAA 2AUVA 2GSRA 4G0KA 3IV4A 4PNGA 1BX9A 2BMXA 2LSTA 3DGQA 4NHWA 4OFMA 2LTKA 2YCDA 1GSSA 1YKAA 2YJHA 1XWCA 2O7KA 5DALA 2DMMA 3IA1A 1YF1A 1AQXA 3VI7A 3FY7A 4KF9A 5DDLA 3QMXA 4KA0A 1HNCA 4NAXA 5JWQB 4AJ8A 1EP7A 3ZREA 3GN3A 2OA7A 4TRXA 5JWRB 3NIVA 1TXXA 3NZNA 2EIQA 2GSQA 1SJIA 1JZOA 3D6IA 4V2LA 14GSA 3HJMA 4KGIA 3IOSA 2O87A 3LG6A 1GNEA 4MLYA 2H6ZA 2FWHA 2RUEA 1XZOA 2WULA 1C72A 2QKEA 1M0UA 2F51A 1EEJA 2PMTA 3EINA 5DQYA 3TB2A 4KB3A 1SYXA 3UVTA 4KE3A 2E0QA 1HQOA 2RLIA 2WDUA 3ZITA 1PL2A 4IN0A 2BTOT 4KUNA 1IYIA 1PL1A 4PXOA 1KTEA 4IW9A 1ERTA 1SJ6A 4NV2A 1MD3A 5ECSA 2MZCA 5DJLA 2AAWA 4F9ZA 2GQKA 3G9BA 3ME7A 2R37A 1MDJA 4XS6A 3PINA 2TRCP 4X0XA 3BOAA 4MJAA 2LRCA 4I2TA 4EE0A 1Z7RA 1O85A 5ELGA 3HZ8A 1NW2A 1YJ6A 1GRXA 4BVYB 1PQNA 1JLWA 1O8WA 4OO4A 4POBA 3CRUA 4ZBDA 1ON4A 2HSMB 1A23A 3W8JA 2F8FA 3K8NA 5J9BA 5HFKA 3WGDA 3TRQA 1TKDB 1V2AA 1V98A 18GSA 3QDNA 2B1LA 1V57A 2P0GA 3DKSA 1J08A 4MDCA 3QCPA 5CNWA 12GSA 2HRAA 2M46A 1JLVA 3F4TA 3TKRA 1K3OA 1OKDA 5B6MA 3I6AA 2XPDA 2J23A 4GQFA 3HHVA 3UJ1A 4X43A 3P8WA 2PVOC 2NDOA 4ECBA 5D93A 2MYGA 3GKMA 2PWJA 2GZZA 5B6NA 3MDKA 3RBTA 2H0IA 5HR3A 3GSTA 4RUVA 3QAWA 5J3RA 2I3YA 1ILOA 1DUGA 3ZMKA 1G7OA 4PUAA 1FVJA 2C4JA 3A2VA 4JRRA 3GFKA 4BWSA 3ME8A 1SJZA 1ERUA 2O85A 2CVDA 1Y6EA 3PGTA 2AB6A 3KCMA 2JZTA 1NHOA 5GSTA 1GSYA 3DYRA 3ZFBA 2H1GA 2L4QA 5ELAA 5BMUA 1YEPA 3FRCA 4MZBA 2OBIA 4MPGA 2GDRA 1A24A 2YNXA 2OJLA 1R26A 2VL2C 1SKRB 4BL7B 5INYA 2TIRA 4XS4B 2VLTA 4CDOA 2TRXA 5ECKB 2H8LA 5IO0A 1A2MA 1AQVA 4I2UA 4ZBAA 5D9VA 4GSSA 2KHPA 4K9ZA 4DSSB 3EU4A 3C1SA 1X5CA 2H1DA 1GSEA 5KEJA 1OC9B 3CMIA 3GL5A 5ID2A 2NVLA 2ZCTA 3P2AA 2F3MA 1NHYA 3GRXA 4ZILA 2LUSA 4WEYA 2K9FA 2ALBA 3KXOA 5DCGA 1PN9A 1I5GA 3FKFA 4USSA 3MNGA 2R4VA 3GKNA 1K0MA 3UL3A 2LEGA 1XVQA 1F6MC 5G2ZA 2LKUA 4N0ZA 3VK9A 3RDWA 2VD0A 2YP6A 1FAAA 13GSA 2VL9A 4JEDA 1XIYA 3DVXA 3L78A 1WE0A 3GH9A 4HZ2A 3UBKA 1B4PA 2IFQA 5GAND 3H4KA 1AXDA 1SKWB 1MDKA 2YOIA 4MJCA 2PVQA 1PMTA 3VWWA 1KEBA 3ERFA 1BEDA 1K0NA 2JADA 3GUSA 3UAPA 3KIJA 5G1KA 1ZL9A 4DSQA 3TJJA 6GSTA 2KLXA 4G10A 1OKTA 1M2DA 2GS3A 4IKHA 4GTUA 2C80A 2C0GA 3D21A 5IIZA 2PUKC 5J41A 1EGOA 3DWVA 1K0BA 4HI7A 3TKPA 5J9CA 5IQYA 5A4WA 4OWYA 5IOXA 1EV4A 5GZZB 3FR6A 2HRKA 1PKZA 2V32A 1K3LA 4GCIA 1DBYA 2MMNA 2REMA 1GSUA 3FEUA 1A8LA 3U6VA 1UA5A 1WMJA 2WCIA 2C3NA 3TJKA 2GT6A 1X9WB 1CQGA 1GUKA 4TN8A 3ZRDA 5ECQB 3HCZA 4BVXA 5LD0A 2N5BA 4HJMA 2MBSA 1T3BA 4XS1A 4IQ1A 4PQ1A 4MH2A 1ST9A 1V9WA 2NTOA 2VD1A 1DE2A 4TR1B 2KUCA 3IR4A 5D9TA 3BD2A 1YF0A 4ILFA 4V2NA 5G31A 2VOCA 4WF5A 1GSDA 3IXRA 2GQLA 1TJDA 4EVMA 3LYKA 1XW6A 3C71A 1X9SB 4WXTA 4EDZA 1N2AA 5COHA 3ZIJA 4MF5A 3IAM2 4EDYA 2F8AA 2RUFA 3F3QA 3LORA 1GSQA 2LJRA 1FB0A 1J0FA 3HVSA 1PSQA 3APQA 1F3BA 3GTUB 5DCHA 1G6WA 4OFNA 1G0TA 4KX4A 3G7IA 1W89A 2VCWA 2G2QA 2H73A 4TXOB 3HVVA 1TDIA 1WPIA 3C1RA 3F8UA 4TR3A 4BPYA 3S9FA 2LQOA 3LWAA 5D9WA 2HZEB 4IJIA 1WJKA 1O73A 3HY2A 3ZL5A 1AUCA 3M3MA 3HJOA 4I5QA 2PERA 3VURA 2OE3A 1BAYA 4ZB8A 4ZB9A 2H71A 1TK8B 5CYYA 4Q5NA 4WF4A 2YZHA 4BA7A 4JE1A 2FY6A 3ZYWA 4TKYA 5AIXA 5LCZA 1EWXA 1VF2A 1Y25A 1OC3A 5J4UA 3LSZA 4ZB6A 3IBHA 4OD7A 1XW5A 4LL1B 3HD5A 2VCXA 5GSSA 5HFGA 3WT1A 2G0FA 1ZOFA 5CRDA 2P5QA 2EIRA 1K0CA 1B9YC 2CQ9A 1GTBA 3IC4A 2GTUA 5F0GA 1F2EA 2XPEA 1ZCPA 3A3TA 1XCCA 4WKWA 3H1NA 4MMMA 2GT5A 1EGRA 4ACSA 2LV3A 2DIYA 1SD8A 2CAIA 1AC1A 4WBRD 3MSZA 1GH2A 5HR1A 3L9SA 4KNDA 2VAFA 3A2XA 1M2AA 3ZFLA 4IVFA 2WS2A 9GSSA 3TOTA 6GSXA 2B5EA 4HU7A 1NM3A 4N11A 2DJKA 2JU5A 3DRNA 5DALB 4MA9A 2HT9A 5L71A 5DAKA 1EV9A 1OVNA 3Q18A 4TVEA 1Q98A 4EF0A 1HNAA 3GMFA 4TOPA 4K7NA 1VF3A 2RM5A 4GRFA 2CX4A 4F0BA 2K8VA 1X9MB 4QQ7A 1O7UA 1GWCA 2MBTA 2LQQA 2P31A 1SK1A 2GSSA 3HA9A 3O76A 1I9DA 4Q5QA 2FWFA 4I6XA 1QFNA 2H30A 1FOVA 1Q4JA 5ECPB 4HEA2 2V1MA 4P3YB 5ECHB 4NXIA 3F63A 1TP9A 1QGVA 5G30A 4TR0A 4J57E 4K7OA 2VIMA 1BYEA 5CAXA 2C0EA 5IMAA 2AJQB 3RHBA 1B8XA 3QFBC 3TRPA 1M99A 1FG4A 4EL1A 4BVYA 5G5EA 3BJ5A 4JU5A 3HZ4A 1A2JA 1EOHA 1QMVA 2HSMA 1GUHA 2X99A 1M9BA 3EYTA 4DEJA 2CAQA 3ZLPA 3EMPA 4XRDA 3Q74A 2H1BA 2YWMA 5JCUA 5ECNB 4FYCA 1ERWA 1AQWA 2HYXA 3M0FA 3TKSC 3C8EA 1R5PA 3VWVA 1R7HA 3IRAA 11GSA 1XPVA 2LJKA 1T4YA 3KTBA 3IHQA 3GA4A 4FYBA 5AIVA 2VL2A 3SWLA 1JZRA 1S3CA 4NHZA 2C1YA 4LMVA 2ZNMA 3WD6A 1UVZA 3QAGA 2CVKA 4N30A 1K3YA 3GH6A 1TRVA 1GSFA 3KD0A 5G5FA 2HI7A 1FHEA 5AN1A 4FH8A 3R2QA 5IMDA 1PD21 3IC8A 3MAKA 2XBQA 1HNBA 4HZ4A 2V6KA 3AY8A 5IMCA 5FT3A 4F03A 3D0ZA 2JZSA 2C0DA 3WYWA 1ZGNA 2H72A 1BJXA 2IMIA 4ZBBA 4YQUA 4YQMA 2FA4A 5CP1A 3EURA 3GKXA 2MMOA 2M80A 1TRSA 2LJAA 1SYRA 2I4AA 2WJUA 2I81A 2UZ8A 5E59A 3GNJA 4BL7A 1THOA 4KW6A 1TTZA 3GHAA 1JZDA 1AIUA 5EL8A 3VFIA 1O81A 3W6GA 4JBBA 1M9AA 4XRAA 2IMKA 4F82A 4F2IA 3F6DA 4ML6A 4TXVA 2HSHA 4WETA 3A2WA 3RAZA 5DQSA 2VL3A 4KH7A 1CQHA 4K8MA 5B7CA 1N8JA 1TOFA 3FYGA 2K8SA 2A2RA 2ON5A 2ZUPA 5ECMB 1TRUA 4WBJA 2OADA 4XHMA 2C0FA 1M2BA 3F4SA 3QFAC 3HXSA 4ZL8A 4CHSA 4L8EA 2JSZA 4G0LA 4Q5RA 4WR5A 3UVHA 2L59A 3UARA 2I9HA 3KH9A 1EOGA 4RQRA 4ZXGA 4ML1A 3EMXA 1OC8A 1T7PB 3TOUA 3QOUA 5B8BA 2CZ2A 1G7EA 3ED3A 3FZ4A 1XBSA 3UIWA 2WZ9A 10GSA 2WGRA 4FO5A 4K2DA 1U3IA 2F9SA 2FWGA 3M9JA 5HQPA 16GSA 2ES7A 5D96A 2HRNA 5IPHA 3ERWA 2FUG2 1TI3A 3EVIA 3LYPA 4OMVA 3L9UA 5CRHA 4MABA 3TJFA 2DLXA 1VGLA 5IPGA 1B48A 4PUFC 2YWIA 4PGTA 3TJBA 3GX0A 4KDXA 2BJXA 2FD3A 4ECIA 2CT6A 1WWJA 1Z5YE 2IFQB 2YWNA 2QSIA 3TUEA 3LJRA 2X8CA 5H5QA 1MD4A 3G7YA 1K0AA 1V40A 4ECJA 5KN1A 3VPQA 4GSNA 2ON7A 4GF0A 2PGTA 2IPAA 2LRNA 5IMZA 4N0VA 1O8XA 2LNSA 4WR4A 1ZYEA 3M8NA 3DD3A 2VCZA 2VM1A 1DE1A 1T00A 4L5LA 4NMUA 1YQ1A 1PKWA 3H79A 2B5YA 4EO3A 3CSHA 4K0NA 4RI6A 4D73A 2FNOA 5FWGA 4PNFA 2HRKB 3HJPA 4MF7A 3DXBA 2YN1A 4I8BA 1YEXA 1J9BA 1ACVA 4FQUA 4TR4A 3VI5A 4ID0A 1PGTA 2A2SA 2VCQA 2MMAA 5EVOA 3L0HA 2L4CA 3RPNA 3V1WA 2HFDA 1T8EB 1A0FA 1HD2A 3LGCA 2PPTA 2PU9C 4BVXB 2OBKA 3O6TA 2X8HA 3GSSA 1WOUA 4FIWA 1XXUA 4HQZA 3IE3A 3RHCA 4ISDA 4KDUA 4NV5A 1F37A 3HYPA 4YAVA 3VLNA 1ERVA 1BQ7A 4K0GA 4HJ2A 4LL4B 4TW5A 4GQCA 4KSOA 1DSBA 3KGKA 3ZZXA 2EIOA 2DJJA 3C73A 3P7XA 4J2FA 2E7PA 1FW1A 4IQAA 1QQ2A 5KN3A 1U3AA 5ENUA 4ECCA 1WIKA 3Q19A 4YQVA 1Z6MA 5CRWA 2YANA 4O92A 1KBNA 4G2EA 4IELA 4IBPA 3GL3A 2HZEA 1GUMA 3APOA 3J7Yb 2FHEA 3WT2A 2VO4A 3ZMLA 2H66A 4MP4A 1PA3A 3FR9A 1S3DA 2N5AA 3KZQA 2IMFA 3J7Yk 1THXA 4KSMA 2IL3A 5F05A 3ISOA 4FYUA 2HSYA 2YZUA 1GULA 1TU7A 2QGVA 3TGZA 3APSA 3ZTLA 1VF4A 2L5LA 4G9HA 2NPBA 5C04A 1E6BA 2CV4A 2H74A 3CSIA 3UEMA 7GSSA 2R3XA 4MCUA 3IDVA 3CRTA 1SENA 2C3TA 3TRXA 1PX7A 4EC0A 2KP2A 2VCVA 2P5RA 3TJGA 3ZVJA 3OR5A 1SL2B 4CW9A 2X64A 4RQXA 3TDGA 1KNGA 3FZAA 3EU3A 4G0IA 3QAVA 2GZPA 1XVWA 3O3TA 1LBKA 3D4MA 4IJ3A 5KN0A 2K6VA 5JWOB 1OYJA 2L5OA 2GQMA 1B4QA 3N5OA 2L6CA 3TCOA 4QL7A 4K6XA 1MEKA 1Z6NA 3P90A 3GX8A 4IHUA 4EUYA 2IN3A 3F6FA 3FR3A 4Z7XA 3I43A 1T1VA 3RPPA 2DJ0A 3VPTA 1VF1A 2CVBA 2IIYA 2K18A 1E2YA 5F07A 4AJ7A 2R5GA 4L0UA 2DJ1A 4ULXA 2H0GA 1ABAA 2V6OA 5F8BA 3SBCA 5HR0A 4GXZA 1WRYA 2HLSA 2HSNB 5DAKB 2H75A 1TRWA 4MJEA 3FHKA 4AJ6A 3H8QA 4GSTA 1K0DA 3TKSA 3UOMA 2YJ7A 4V1Ag 3UMAA 4XCSA 2B5XA 4I97A 4L0WA 3WGXA 4PQIA 1EP8A 1GNWA 1SL0B 22GSA 3I9V2 3EE2A 3M9KA 3KTLA 1XWKA 1USBA 4IP6A 2MMZA 2HQTA 3Q6OA 6GSYA 3FZ5A 4BWQA 1W4VA 3DVWA 2KOKA 4RI7A 4MJBA 2E2MA 2OE1A 2E2GA 1XWGA 1MTCA 5H5SA 4KDYA 4JR4A 1EEMA 2FGXA 4O32A 2DMLA 4G19A 2OACA 5B8AA 2H01A 3IPZA 3W8SA 2DJ2A 2O8VB 1Z9HA 4OCEA 3GV1A 3UBLA 1SKSB 3LQ7A 3KEBA 2IMDA 2D2ZA 4J56E 2XBIA 4POLA 5ECIB 2XC2A 3C7MA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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