3IE3A

Structural basis for the binding of the anti-cancer compound 6-(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-ylthio)hexanol (nbdhex) to human glutathione s-transferases
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
PPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYASLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the binding of the anticancer compound 6-(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-ylthio)hexanol to human glutathione s-transferases
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutathione S-transferase P
total genus 84
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3ie3A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ie3A01
1NM3A 5EPFA 2F9SA 1NW2A 2IIYA 2P5QA 3GKNA 3RPPA 1BG5A 2PU9C 3M3MA 1O8XA 3VWVA 1NSWA 1FVJA 2VCVA 1ZOFA 2E2GA 1ZYEA 1F3AA 1IYHA 3FZ4A 3CBUA 5G5EA 4PUFC 5B8BA 3LYKA 4OFTA 2L5LA 3CTGA 1G7OA 3G9BA 2FWEA 3O76A 1OC9B 3CXGA 4NAXA 3TCOA 1WWJA 3VPTA 4OFMA 2HZEA 1TDIA 4JR4A 3GL5A 4QQ7A 2PWJA 4ZB9A 3TB2A 1THOA 1JLVA 1XWCA 3FYGA 3L9SA 5CRHA 6GSTA 4ZB8A 4O32A 4FQUA 3TJGA 2CQ9A 1XXUA 1AAZA 2H1BA 1O7UA 4E8EA 4L5LA 1O6JA 2QKEA 2H0IA 3L4NA 1PMTA 5IO0A 2H72A 2JACA 1AQVA 2XPDA 5DJMA 2IMIA 1SKRB 2XBIA 4O5RA 3QD9A 5HFKA 1TI1A 1F3BA 1TU7A 5ABRA 2FCHA 4XS6A 1XW6A 3F3QA 3LWAA 5ECOB 4D73A 5HFIA 2EIQA 1KBNA 5F0GA 2WB9A 2AV4A 2JSYA 2YWOA 3PINA 4HJ2A 4EC0A 1Z3EA 5B6NA 2QC7A 3BCKA 3ZYWA 2E0QA 3GKXA 1THXA 5CRDA 2PMTA 1PA3A 1VF4A 4OCEA 2GT6A 4DSSB 1GLQA 1K0NA 5KN0A 4DVCA 4V1Ag 4O7HA 2X8HA 3HVXA 3IE3A 1Y6EA 1ERUA 2H76A 2DJ1A 5J9BA 3UBLA 4K0NA 3KH9A 3CSIA 1XWAA 1EP7A 3FHKA 2K9FA 4EL1A 4POBA 5GAND 3P8WA 1TKDB 4G0KA 1ERTA 5ECMB 3FRCA 4IVFA 4PTSA 3QCPA 1M9AA 3UJ1A 5KN3A 4HZ2A 3I9V2 4ZL8A 3R3EA 1UVZA 5LD0A 2GS3A 1CQHA 4MMMA 2MYGA 1B4PA 6GSYA 3FR3A 2FD3A 1K3OA 2WCIA 1ZYQB 5ELAA 3GTUA 2R37A 3IV4A 4JR6A 3UARA 1OYJA 5ECLB 3FZ5A 4MH3A 4LLRA 2XPEA 4YQVA 5J9CA 2HSHA 1KEBA 3UL3A 1M99A 3TGZA 4CDOA 4L8EA 4PQ1A 1MDJA 1TP9A 1M0UA 4FYBA 3DYRA 3FR9A 3LQ7A 1SKSB 1T8EB 2H1DA 2GZPA 3HZ8A 1B48A 2AUVA 1PX6A 1BYEA 4OO5A 4IKHA 3GFKA 1R5AA 1HNBA 1TJDA 5ECKB 2K18A 4POLA 1N8JA 1BAYA 2GT5A 3FKFA 1H75A 4RI7A 1A8LA 2YPMA 2YWIA 4HOJA 4JU5A 3W8SA 3IPZA 4V2NA 2I81A 5DAKB 5L71A 3F6DA 4NV5A 3BJ5A 4USSA 4L0WA 3E3EA 4I97A 2HSMB 1SU9A 3KD0A 3IBHA 4IJIA 2AB6A 3KMNA 3P2AA 3TKRA 5CRWA 2EC4A 2HXKA 1A2MA 3DRNA 2BTOT 5HQPA 1W4VA 1O85A 3L9VA 2L57A 3MNGA 2DJKA 5HFGA 1VF1A 3QAVA 4E8HA 3DVXA 4YAPA 5B6MA 1UN2A 4OMVA 3F3RA 3FK8A 5G31A 1K0BA 1V98A 4AJ7A 1ST9A 2LV3A 3ZIJA 3VLNA 1ERVA 1HNCA 2FA4A 3GX0A 1SD9A 1PL2A 2P0GA 6GSVA 3GHAA 4KB3A 3D4TA 3EINA 5FWGA 5H5RA 3QAWA 4PXOA 4MZWA 2LEGA 2O85A 3NOFA 3RAZA 5IMFA 1DE1A 4ZBDA 3DVWA 1ON4A 2H73A 1ZGNA 2VCZA 2YP6A 4ECBA 4TXVA 3IR4A 5AISA 3D4MA 3LEFA 2HRFA 4KDXA 3F4RA 3H4KA 2KP2A 1X9MB 3EMPA 4NMUA 3QOUA 2C0DA 16GSA 4Q5FA 1R4WA 2XHFA 4K2DA 2C4JA 1WOUA 3GNJA 5G2ZA 3A2VA 1M2DA 3EWLA 2L4QA 4V2LA 2C80A 4IBPA 1KTEA 2GQKA 5DAKA 5IOXA 5ENUA 4KSMA 3CSHA 4K7OA 1IYIA 9GSSA 2NDOA 2VD0A 2HSMA 3HD5A 4PURA 1ZMAA 1G6WA 1Z9HA 1GNEA 4BWSA 3J7Yk 2GLRA 3ZRDA 2HQTA 3RHBA 2VLUA 4LA1A 3UEMA 2F8AA 4AJ8A 2O89A 1A0RP 2IMFA 4HJMA 1R5PA 5E59A 1PKWA 4WBRD 1PQNA 3PH9A 3OR5A 4JRRA 1GLPA 1WRYA 3TKPA 1XOBA 3IK7A 1JHBA 4F9ZA 1TU8A 2OE1A 3U5RE 2GZYA 5AIVA 2C3QA 4MJAA 1XIYA 2CVBA 2FGXA 2LQOA 4TR0A 4IQ1A 3IDVA 3F6FA 3JCML 1OC3A 2KOKA 1DSBA 5CAXA 2XC2A 5AN1A 3KMOA 2BJXA 3UMAA 3F4TA 4X0XA 1JZOA 1X5EA 4ECJA 2TIRA 4TR1A 3C73A 3ME8A 5IMZA 2E7PA 5INYA 4GSNA 1LU4A 1GWCA 4NXIA 1TK8B 3IHQA 2GQMA 1E2YA 2VLVA 1GH2A 2YJHA 2K8VA 1MDIA 2WRTA 5CO3A 3DXBA 4ID0A 1GNWA 4G2EA 3CTFA 5JWQB 3KTLA 5JCWA 3TOUA 3BD2A 5DCGA 3GV1A 4PNGA 4I2UA 5ECQB 1EGOA 2GSQA 1GRXA 4KX4A 1S3AA 4BVXB 1LJRA 2DLXA 3WT1A 2H30A 1FG4A 2PUKC 2OE0A 2JADA 5G1LA 2HE3A 2YJ7A 4GCIA 1XWKA 1OC8A 4FIWA 4ZL7A 3LORA 4NHZA 5G1KA 3ZFBA 4ZILA 2JZTA 1GSQA 1MEKA 4RQRA 2HRAA 5B7CA 3M9KA 5ECNB 3DEXA 1GSYA 3HCZA 2LNTA 5GZZB 2FHEA 3GH6A 3CYNA 2J9HA 4V2MA 3KTBA 2YNXA 3L0HA 4MP4A 2H6YA 5F8BA 4G10A 4GQFA 2ES7A 3EURA 5CP1A 2R6KA 1YF0A 4WR4A 1BJXA 1OAZA 1ILOA 5DBQA 2B5YA 1T7PB 2X64A 4Z7XA 4DEJA 4DSQA 1VRSD 4TR4A 2EIOA 3IXRA 2A4VA 4BWQA 4EVMA 4YQMA 2DC5A 3N9JA 3ERFA 4PGTA 3VI5A 1AXDA 2X8CA 2VO4A 2WULA 2WFCA 2OADA 2VL2A 4K7IA 4FH8A 1TOFA 2OBKA 4LL1B 5H5QA 5FT3A 4L5OA 1QK8A 2MMOA 2WZ9A 2R5GA 2C0EA 2M46A 5G5FA 4V1Ap 5E4WA 2ZUPA 3KP8A 2KUCA 1R7HA 2UZ8A 5C04A 3ZMKA 1FHEA 2G2QA 2LNSA 2LSTA 2B7JA 2B3SA 4N10A 3GYKA 4GXZA 2Z9SA 1EOGA 1GUMA 3LJRA 3IK9A 3UIWA 4MZBA 4EF0A 1A8YA 1SL1B 5D9VA 5ECHB 2M80A 4GRFA 3KJYA 3QDNA 4X43A 3EU4A 4NWYA 4KCAA 3TJBA 3RBTA 2YZUA 2WDUA 3ERGA 3TUEA 4YQUA 1MD3A 1GSFA 2IFQB 1FB0A 2L6DA 1EOHA 2VCXA 1EV4A 3GL3A 1X9SB 2YV9A 3EVIA 4MH2A 2N5BA 1TI3A 3A2WA 3H79A 1PD21 3D22A 5D9WA 2H1AA 2HFDA 4J56E 1FW1A 1SL0B 1OC9A 3TRQA 2L59A 4EDZA 3HXSA 2HNLA 2GQLA 2LRTA 3QFAC 4IS0A 1QGVA 4JZQA 5G30A 3TRPA 3VPQA 3BOAA 1WIKA 3GX8A 3QMXA 5J4UA 1U6TA 1J9BA 1S3DA 1SKWB 5D73A 4KNDA 1SK2A 3GKKA 1MD4A 1TTZA 4TW5A 5AIXA 3HVSA 2JU5A 1PX7A 2QGVA 1GTIA 3DWVA 2V32A 2IMDA 2CAIA 2CA8A 4BVYB 1UC7A 3F8UA 4N11A 2VL3A 5HR2A 1Z5YE 5IOWA 2NVLA 8GSSA 4MJCA 4OD7A 4ECCA 3VWWA 5JCUA 1WE0A 2I3YA 1B8XA 3M8NA 3LFLA 1SK0A 3U6VA 5F06A 5GAPD 5GSTA 4L0UA 4NPBA 2YN1A 3UBKA 1QFNA 3GIXA 3ME7A 5HR0A 4ILFA 3H93A 5CRGA 1G6YA 3VWXA 4POMA 5EL8A 5JCGA 2DMMA 4PUAA 4DSSA 5LCZA 1TRWA 2VCTA 2BMXA 17GSA 5IQYA 3WYWA 2IFQA 2P31A 1NHYA 3ZL5A 1V40A 3MWHA 2VD1A 1DE2A 3PR8A 1EV9A 3HJOA 2GGTA 1AQXA 2FNOA 4ZB6A 4KSOA 3HVVA 1K0AA 4OFNA 3QAGA 3AY8A 3GN3A 2C1YA 2FWFA 2GZZA 4ULXA 4GSSA 4FO5A 1DBYA 2VM2A 1GUKA 3H1NA 3KGKA 1EP8A 3S9FA 3EMXA 1Q98A 1XPVA 1A23A 1M2BA 2XBQA 2LS5A 1VGLA 1K0MA 3A2XA 1BQ7A 1YQ1A 3WGDA 2HRNA 3LXTA 1WJKA 2PVQA 1DUGA 3F63A 1A2JA 4MPFA 3ED3A 1YKCA 19GSA 4K7NA 2HYXA 2MMZA 3Q74A 1YDKA 2B1KA 1XVQA 4F82A 1YF1A 2OACA 1SJZA 5IMVA 3I43A 5A4WA 3BCIA 1U3IA 4XCSA 3RDWA 3ZVJD 1Z6NA 3EU3A 2VL2C 5D96A 4BVYA 1V58A 4WEYA 4QL9A 3NZNA 4POKA 2N5AA 5DVBA 2OE3A 4K6XA 2V2GA 5CYYA 1Y25A 1JZRA 1M2AA 2VAFA 3HJPA 2H0GA 3TJFA 1SJ6A 4AGSA 4WKWA 2LRNA 3D5JA 2H6XA 2C0GA 3F4SA 1T4ZA 2DIYA 3TKSA 4IGJA 3SWLA 2LKUA 2LJRA 4HEA2 1CQGA 2F51A 4I5QA 2WGRA 1T3BA 2VOCA 3F0IA 2TRCP 2IWTA 5D9TA 2DJJA 1WP0A 1FOVA 4HUAA 3VK9A 4LMWA 1J0FA 1FB6A 2F8FA 4TOPA 1QXHA 1MDKA 5IMDA 4IJ3A 2MBTA 3APQA 1GSEA 2A2RA 2GSTA 3ZIVA 3US3A 2WS2A 1YKAA 1GTAA 4EDYA 4OO4A 4MF7A 2RLIA 3QR6A 5BMUA 1A24A 1BX9A 1YY7A 2P5RA 3WGEA 4TR3A 3ZREA 1V9WA 3FZ9A 5IM9A 4XS4B 2NPBA 1Z6MA 4GQCA 4ZXGA 1F9MA 4TN8A 2DJ2A 1N2AA 5ECPB 1I5GA 5DDLA 3ERWA 2L5OA 4CHSA 4KF9A 2IMEA 5AGYA 4X1UA 3ZFLA 3D21A 4MZCA 4WXTA 2DBCA 3CSJA 5LNKe 1HYUA 3VI7A 2YZHA 1AC1A 2OBIA 5A5KA 3KXOA 1ZL9A 5DALB 2HSYA 5EVOA 10GSA 3VURA 5CREA 1TK0B 3E9JB 4BL7B 4LMVA 2H75A 5EY6A 4I2TA 5F07A 3HY2A 4AF2A 3W6GA 3CRTA 1A0FA 1RQMA 1V57A 3EYTA 1EZKA 2G0FA 2GSRA 3E0UA 2H74A 2C0FA 4XS1A 2PBJA 5A4UA 2GSSA 2OA7A 1YEPA 2JSZA 4K9ZA 1GSSA 4DSRA 5DQYA 4AJ6A 3HDCA 4N0ZA 4HZ4A 1F6MC 12GSA 4PX1A 4IN0A 2H71A 4KGIA 4EUYA 1XFLA 3LGCA 3PGTA 3GUSA 1KNGA 4BA7A 2GDRA 4IW9A 1PN9A 4D73B 4KDYA 2GVPA 1XWGA 1S3CA 4F0CA 5D93A 1O8WA 4ML1A 3GSSA 1C72A 3IA1A 1TRVA 1HQOA 2FLSA 1GSUA 4XS4A 4G9HA 3KEBA 1TXXA 2I9HA 2E2MA 2HI7A 2JZRA 1K0DA 3ZZXA 1GUHA 1M9BA 4HS1A 1OKDA 3UVTA 1JLWA 2PN8A 5ELGA 3FEUA 2VM1A 1AUCA 1W89A 3KZQA 2F3MA 4TXOB 2K8SA 3Q18A 3K8NA 1VF3A 2CV4A 2DMLA 4HQSA 3GA4A 2V6OA 3VFIA 3TKQA 3HZ4A 1XVWA 2B5EA 2C8UA 4N30A 5D9XA 4IP1A 7GSSA 2A2SA 5HR3A 4ZBAA 1G7EA 6GSUA 2VCWA 5DALA 3WD6A 3I6AA 1T1VA 1QUWA 2CX3A 1PGTA 1WPIA 3TDGA 4BL7A 2GTUA 3EC3A 3ISOA 4XTSA 3LSZA 3HKRA 2CVDA 4BVXA 1QMVA 4TKYA 3GTUB 3A5WA 3RPNA 4Q5QA 2YCDA 1SYXA 1SD8A 5DJLA 2L4CA 3RHCA 18GSA 1U88A 5ECRB 3IRAA 1TRSA 3LG6A 2VLTA 2DIZA 4KDUA 1OKTA 3TKSC 2DJ0A 1SK1A 2FWGA 2LQQA 3LXZA 3DKSA 4FYCA 2VL9A 2I1UA 2PVOC 1K3LA 1H4OA 5JWOB 4J57E 3TKSE 4FYUA 14GSA 4JEDA 4MABA 4Q5NA 5IIZA 4MF5A 2V6KA 5ID2B 6GSSA 3MDKA 4HI7A 2HLSA 5D8IA 2YWNA 1B4QA 3P7XA 4ACSA 1XWBA 4GLTA 1K0OA 1K3YA 2IPAA 5J41A 1K0CA 1EEJA 1HD2A 3DMLA 2N5FA 1Q4JA 1T00A 2LUSA 4IQAA 1AIUA 1FVKA 4TXOA 3O6TA 3WGXA 4KE3A 5COHA 2LRCA 3IAM2 4G0LA 1GULA 1F2EA 4K1FA 4K0GA 4PQIA 3M0FA 3P90A 2MMNA 1E6BA 3CMIA 3FZAA 1AW9A 4IELA 3GH9A 2QSIA 1ABAA 4ECIA 5DQSA 3I69A 4G19A 1YZXA 3FY7A 5DCHA 1GSDA 3QFBC 3Q19A 1EEMA 3TRXA 5ECIB 2RUEA 2KLXA 1GTUA 5J5NA 1URMA 5B8AA 2MZCA 4XIHA 2X99A 1O73A 1GP1A 3W8JA 4MPGA 4CW9A 1RK4A 1YEXA 4KA0A 4YH2A 1TRUA 2H6ZA 5IMCA 1PSQA 4OWYA 3EE2A 2C3NA 2H1GA 1EWXA 3UAPA 1A2LA 2DSAA 4ZL9A 2YWMA 3PPUA 2HT9A 5IO2A 11GSA 1B9YC 2R3XA 4ZBBA 3O3TA 2WJUA 6GSWA 3GMFA 4MF6A 4MCUA 2FY6A 3D6IA 1XW9A 1XW5A 3TOTA 4EXJA 4WR5A 3UVHA 2NBSA 4G0IA 2IL3A 2L6CA 3HHVA 2JL4A 1TK5B 1SYRA 5ID2A 3DIEA 1GTBA 4H86A 1EGRA 2LTKA 1NHOA 4JBBA 3C1SA 2OKAA 4I6XA 1U3AA 5HR1A 4MK3A 3G7YA 1R26A 3A3TA 2ON7A 2AYTA 3N5OA 3IC4A 2HRKB 2H66A 3APSA 5JWRB 4IHUA 4I8BA 4RQXA 1PRXA 4TVEA 4GWRA 1OVNA 3KCMA 3HA9A 1I9DA 5IPGA 2VIMA 1USBA 1Z7RA 3TJJA 4WBJA 4F2IA 2FUG2 3HJMA 2B7KA 5A4VA 2REMA 2YOIA 3KIJA 3NIVA 2J23A 4XRAA 4MLYA 3HYPA 5ECSA 1X9WB 2B1LA 4IP6A 2H0HA 2IJYA 3L78A 3KM6A 4WF5A 1M7TA 3M1GA 2O87A 4MA9A 2I4AA 3IOSA 4HU7A 3MAKA 1V2AA 3ZMLA 2KHPA 3FW2A 5CNWA 4P3YB 1YJ6A 3FR6A 3LYPA 2K6VA 2R4VA 4TR1B 2FWHA 2ZNMA 2AJQB 1RW1A 3C1RA 1SL2B 3GRXA 2RUFA 5FHIA 1O81A 1FAAA 4EO3A 1FO5A 13GSA 3GSTA 4JE1A 3ZTLA 3J7Yb 5H5SA 2HSNB 3C7MA 1BEDA 2RIIA 4GF0A 3WT2A 2H01A 4ML6A 1ZZYA 3APOA 1X5CA 1XOAA 4GTUA 2CVKA 2H70A 4RI6A 2D2ZA 3M9JA 4HU9A 3GKMA 4HDEA 3L9UA 2HZFA 1UA5A 3TJKA 4BPYA 1J08A 2CX4A 3ZVJA 4EE0A 1AQWA 2AHEA 1ML6A 4NHWA 4MJBA 3C71A 2HRKA 4J2FA 2H8LA 1SENA 3VWUA 2TRXA 2VCQA 2V41A 1B9XC 4KAEA 1PL1A 1JZDA 2ZCTA 2ALBA 1JFUA 2X8GA 4PQHA 2CZ2A 1Z7PA 1OE7A 4MDCA 5F05A 2FA8A 2ON5A 6GSXA 4LL4B 2PPTA 2B5XA 2JZSA 1ZCPA 3V1WA 1XZOA 1LBKA 2PERA 4RUVA 4N0VA 2B6MA 1ACVA 2CZ3A 1X0RA 5C00A 4PNFA 4F0BA 3QPMA 3F9UA 2PGTA 4EKZA 1SJIA 2MMAA 3DD3A 2VUPA 1HNAA 3BBYA 4QL7A 4TRXA 1XBSA 3SBCA 2CT6A 1GL8A 2YV7A 5KEJA 1MTCA 3UOMA 2EIRA 3GURA 2LJKA 3IAS2 2DJ3A 4XRDA 2M72A 3D0ZA 4K8MA 2YANA 1XCCA 4HQZA 2HZEB 2KP1A 3Q6OA 4YAVA 1JZWA 4WETA 20GSA 4KH7A 3G7JA 2C3TA 1X5DA 4KCEA 2R2JA 4GSTA 2OJLA 4OCFA 5IPHA 2IMKA 1ERWA 5KN2A 2RM6A 4XHMA 1F37A 2MBSA 2AAWA 3ZITA 2NTOA 3IC8A 2LJAA 5J3RA 3MSZA 1PKZA 4O92A 22GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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