3LYKA

Structure of stringent starvation protein a homolog from haemophilus influenzae
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
192
structure length
192
Chain Sequence
VMTLFSNKDDIYCHQVKIVLAEKGVLYENAEVDLQALPEDLMELNPYGTVPTLVDRDLVLFNSRIIMEYLDERFPHPPLMQVYPVSRAKDRLLMLRIEQDWYPTLAKAENGTEKEKTSALKQLKEELLGIAPIFQQMPYFMNEEFGLVDCYVAPLLWKLKHLGVEFTGTGSKAIKAYMERVFTRDSFLQSVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of stringent starvation protein A homolog from Haemophilus influenzae
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Stringent starvation protein A homolog
total genus 60
structure length 192
sequence length 192
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lykA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lykA01
4HU9A 2X64A 3GL5A 3F3QA 4X1UA 2HZFA 4L8EA 5IOXA 2DIYA 4KX4A 1SJZA 1M9AA 3LGCA 3IRAA 2GZYA 2VIMA 1N8JA 5LCZA 2WCIA 1JZDA 3CRTA 5IPGA 4N10A 3JCML 4GXZA 2O87A 3TKSC 3IC4A 2LJKA 3F6DA 3ISOA 3EWLA 1E2YA 4GSSA 5HFGA 5EVOA 5HQPA 2QGVA 1GSYA 4BVXA 3GSTA 5F8BA 2H8LA 5D9XA 1K3LA 2M46A 4JR4A 22GSA 3ZFLA 3G7YA 1XZOA 2H73A 2XBIA 4MABA 2WB9A 1PKZA 2IFQA 3WD6A 2LRTA 1M0UA 1M9BA 3M1GA 2C3NA 3I9V2 4TOPA 2DSAA 1PQNA 2EC4A 2QC7A 2R6KA 4EVMA 5BMUA 3D4MA 1TW9A 5H5QA 4POLA 3M9JA 4GCIA 3KZQA 1SK1A 3N9JA 1X9SB 4EUYA 5J4UA 1X5CA 1H75A 1GH2A 2N5AA 2FWFA 2WDUA 5KN2A 3UARA 1SKWB 1K0DA 1M2BA 4EKZA 1AAZA 3HXSA 2DIZA 3LFLA 1I5GA 1OVNA 4JRRA 4K6XA 4OFTA 3QDNA 5IMCA 1GNEA 3QAGA 1UVZA 5GAPD 2H30A 4MZCA 2MMZA 2VCXA 3VFIA 3EMXA 1TRSA 1V9WA 4WBRD 1R5AA 3DMLA 2X8CA 3HJMA 4OWYA 3L9UA 2NDOA 2XHFA 4MP4A 2N5FA 4GQCA 3KTLA 3ZMLA 4J56E 1WP0A 3APSA 3MSZA 2HZEA 4ILFA 1JFUA 4TR4A 4N30A 4KDXA 3WGEA 4KGIA 2YV7A 3E0UA 4HOJA 2CV4A 2D2ZA 2WJUA 2LQQA 5E59A 1SK0A 4HUAA 4TR3A 2VCQA 3UIWA 4WXTA 3UOMA 5ECHB 4MH2A 1LJRA 4BA7A 5ECOB 2QKEA 3TJBA 4FIWA 1XIYA 1EZKA 2VL9A 3TGZA 2VM1A 4HI7A 4MJEA 3TB2A 3FR6A 3O3TA 4KDUA 1AW9A 5F06A 3GFKA 2C0FA 2HLSA 2X99A 2ON5A 4I97A 3HZ8A 4HEA2 4ECIA 4GRFA 1TI1A 2KP2A 1K0CA 1WWJA 1DE2A 2L6DA 3FZ4A 11GSA 1XOAA 2KHPA 3O6TA 2PWJA 2H1BA 3IAS2 1M2DA 1SU9A 1VRSD 3UMAA 3F4RA 5ELGA 2B7JA 1GSFA 1VF3A 6GSWA 3DXBA 1SENA 1YJ6A 2C1YA 1MD3A 2R4VA 3CMIA 4TXVA 1WMJA 2H6ZA 4MF6A 2YWOA 2V32A 5D9WA 4PXOA 1VF2A 4RQXA 3GH9A 3V1WA 2E2GA 1OC9A 1TKDB 1O73A 3C1RA 2I3YA 3CRUA 3FZ9A 3GX8A 1W4VA 4X0XA 1R4WA 3GL3A 2H74A 3GRXA 4NMUA 3N5OA 1YDKA 2HNLA 5ECIB 2C0EA 1X0RA 3I69A 1F3BA 4PUAA 3DWVA 3NZNA 4IHUA 3GN3A 4AJ8A 3F63A 3KP9A 1WOUA 2RM6A 3GH6A 2FHEA 3FR9A 4KW6A 1Q98A 2KUCA 5DCGA 3TJFA 5CREA 5DJMA 2R2JA 9GSSA 1BX9A 4POKA 1TK0B 3PGTA 4GSNA 5IO0A 3D4TA 3A5WA 4IJIA 3Q18A 3P2AA 3U6VA 2C8UA 1B8XA 4ULXA 2JZRA 3GNJA 5FT3A 4FH8A 5ECKB 3DD3A 1SJIA 3D0ZA 5IMAA 3TKRA 4XS1A 2PBJA 2YV9A 1TI3A 3H79A 3H1NA 5F05A 4ACSA 4ZILA 3HVXA 1U3AA 4Q5QA 2ES7A 3G7IA 1XW9A 2R3XA 2K8VA 3IV4A 2NTOA 4IVFA 3EINA 4LLRA 4Z7XA 2K6VA 4BL7B 4IS0A 1T7PB 4LMWA 1T1VA 3M0FA 2VUPA 5IOWA 1EV9A 3LXZA 5CRDA 2JSZA 1EP8A 3DEXA 2IN3A 1TDIA 1B4PA 1TJDA 3WGXA 1ERWA 4HQZA 1G7EA 3EURA 1XWBA 4KE3A 5LNKe 2L5OA 2DJ1A 1PKWA 1UA5A 3RPPA 2FWHA 2V1MA 2AV4A 4K7NA 2WFCA 1S3CA 1G6YA 4K7IA 2XBQA 5CYYA 1KNGA 5B6NA 5D8IA 3UVHA 5CO3A 2FCHA 1XWGA 2EIQA 1FVJA 1TU8A 1GTUA 3VURA 1THOA 2HXKA 3CSJA 2FGXA 1IYIA 1U3IA 3Q6OA 4F0BA 3GMFA 3TUEA 13GSA 1EOHA 4DVCA 4K0GA 2VCTA 2MMNA 1X5EA 1SL2B 2WULA 3BCKA 2L6CA 3ZMKA 3FY7A 1YKCA 2OJLA 3H4KA 4L5LA 3FZAA 1WIKA 1ZCPA 1DBYA 4KCAA 4G10A 2HT9A 2GVPA 2P5QA 5D9VA 1SYRA 4DSSB 3HVSA 2MBSA 1YF1A 2ZCTA 7GSSA 1NW2A 1XCCA 3DVXA 3UJ1A 2VCVA 2R5GA 1GSSA 2JSYA 2VL3A 3IBHA 1RQMA 3VI5A 4PNGA 2YANA 3KH7A 2GQMA 3EYTA 4J2FA 3CTGA 2B1LA 3APQA 3E3EA 4V2NA 4NHZA 1N2AA 4TR0A 5ECPB 2NBSA 1TTZA 4HZ2A 1BEDA 1PRXA 1K0NA 4ZL9A 3TKSE 5CRWA 1XVWA 4ZB8A 2LRCA 3A2VA 4I5QA 1F37A 4NWYA 1GTAA 3PH9A 5G5FA 2IMKA 1TU7A 2FA8A 1XW6A 1EEMA 1WPIA 2F3MA 2G2QA 4F03A 3VPQA 1ERVA 3DKSA 2M80A 3C7MA 3ZL5A 2YZHA 1K3YA 3A2WA 1G0TA 2RIIA 2AHEA 1NHYA 3EVIA 2WRTA 4USSA 1Y25A 3QPMA 3ZZXA 1Y6EA 5B8BA 8GSSA 1H4OA 4JR6A 1PL1A 3W8JA 2AAWA 4XRAA 3S9FA 2IL3A 1T00A 3M3MA 2Z9SA 3QR6A 4MZBA 2TIRA 3VWWA 1HYUA 1MEKA 4BVYB 1YKAA 2YWNA 4KA0A 3VWVA 1FOVA 2ALBA 1ERTA 5CRHA 4FQUA 5B6MA 4JEDA 3D6IA 4BVYA 4ID0A 3TKPA 2JZTA 4CW9A 3J7Yb 3QOUA 3HJPA 1GTIA 4G0LA 3L0HA 5IMVA 4HDEA 1VGLA 4MK3A 4KNDA 1FO5A 3VI7A 3DRNA 5ID2B 1A8LA 3DIEA 4V1Ag 2O7KA 3TJJA 4IJ3A 4WR5A 3KCMA 4KH7A 1U87A 1VF1A 5J41A 4OCFA 4H86A 4FYBA 3W6GA 5ENUA 3AY8A 3QFBC 3LYKA 2LNTA 1GUMA 2YPMA 3RPNA 1QXHA 1MDJA 1AQWA 5ID2A 4TXOB 12GSA 1YZXA 1SD9A 3H8QA 5GZZB 4N0ZA 3SBCA 3KIJA 2VL2A 4MDCA 2HYXA 5B8AA 2JADA 4WBJA 4L5OA 1THXA 2BJXA 2OBIA 4XS6A 3BBYA 3KJYA 4XS4B 2GZZA 4NHWA 2AYTA 4TXOA 2LJRA 2FUG2 3IHQA 5D96A 2VCZA 3ERFA 1HQOA 5JCUA 2GLRA 5FHIA 1F6MC 5C00A 4PQIA 1V2AA 4OFMA 4RI7A 2IMIA 3F4SA 5ABRA 1A2MA 4PTSA 5JWOB 3LEFA 3FKFA 3ZVJA 4PNFA 2A2RA 2HFDA 5AN1A 1T4YA 3LG6A 1JZWA 2B5XA 3US3A 1XWKA 1EWXA 2X8GA 2RLIA 3ZRDA 1PX6A 3GKNA 3FEUA 1LBKA 2X8HA 4ZBAA 5DDLA 1PMTA 1JLWA 3DYRA 5JCGA 1QK8A 2HRNA 2I4AA 1A2JA 3W8SA 5ECRB 3J7Yk 4OMVA 1GP1A 2R37A 4QL7A 4IW9A 2MMAA 3P90A 1ILOA 4MLYA 1GLQA 4K8MA 2CZ2A 1SL1B 1QQ2A 2PU9C 1LU4A 2VLVA 2ON7A 1M7TA 3GIXA 1B9YC 4Q5FA 3R3EA 5HFIA 1HNAA 3ZVJD 2QSIA 1AQXA 2OACA 3MNGA 1QFNA 4P3YB 2VLTA 1U6TA 3HDCA 1Z7PA 3I6AA 5J5NA 2V2GA 3TJKA 3MAKA 4OO5A 4MMMA 1J08A 2HSNB 3CXGA 3ME8A 1F2EA 2VM2A 2KLXA 4EXJA 3ZFBA 1K0BA 1ZYQB 4OCEA 2UZ8A 2PGTA 3UVTA 4GF0A 1XWAA 4ZB6A 4ZXGA 3QCPA 1UC7A 2C80A 4PQ1A 2DJ3A 2K8SA 2F9SA 2REMA 2JL4A 4ZB9A 2VO4A 2B7KA 3IA1A 2AJQB 1XXUA 5A5KA 1TK8B 1GUKA 2PN8A 2LV3A 20GSA 4YQMA 2DMMA 4FYCA 1GTBA 3QD9A 2EIOA 2TRXA 4NV2A 2B5EA 2FWEA 1O6JA 4O32A 4BPYA 5GSTA 5E4WA 2DJJA 2GSQA 3L78A 4J57E 3DGQA 1OE8A 4QL9A 5HR3A 2G0FA 1HD2A 2LQOA 4KF9A 2CZ3A 1WRYA 2H19A 1SD8A 2OADA 2ZUPA 2WGRA 5KEJA 5IMFA 2P31A 1C72A 3F0IA 2HRFA 2GSSA 4HU7A 3VWXA 1A24A 3IOSA 1PD21 3MDKA 2H01A 2FA4A 4WETA 2B5YA 1ZL9A 4TKYA 3BD2A 4MF7A 2LKUA 4NAXA 1XVQA 5CAXA 1GWCA 1DE1A 4IQAA 1K0MA 4L0WA 4F0CA 1WE0A 2H76A 4ECCA 3WT1A 3WGDA 4X43A 4EDZA 1MDIA 4HJ2A 2IPAA 2V6KA 4NPBA 3DVWA 4DEJA 4EL1A 3GSSA 5LD0A 1K0AA 2L5LA 3EC3A 1TRUA 4JU5A 2E7PA 4BL7A 2H6XA 2CX3A 4POBA 4ZBDA 1U88A 4HZ4A 1TP9A 3APOA 5DQSA 1SL0B 3CSIA 1E6BA 2K9FA 4LL4B 1T8EB 3D21A 1O8XA 2HSMB 4YQUA 4POMA 3TCOA 1FW1A 2O8VB 1DUGA 1GSQA 2O89A 4GWRA 1AXDA 3QAVA 3L4NA 2CAIA 1ON4A 1IYHA 1OC3A 5KN1A 2HRAA 4JE1A 4E8EA 4O92A 2HRKB 2HQTA 4IN0A 5H5SA 5J3RA 1B48A 4ML1A 5GSSA 3TKQA 3G9BA 2GSRA 5ECNB 2N5BA 3KM6A 2PERA 3KTBA 3KMOA 3IC8A 2JZSA 2HRKA 1SJ6A 1TK5B 1HNBA 2H75A 1JLVA 2B6MA 4GQFA 2WS2A 1TRWA 2LEGA 5G2ZA 4IKHA 3KMNA 3TOTA 2DMLA 2DLXA 4ZL7A 3KP8A 2B3SA 2C0DA 1BQ7A 5KN0A 2GTUA 5C04A 1X9MB 1YF0A 4ZBBA 4G0KA 2H0GA 3A3TA 4MJAA 5D9TA 4LMVA 2E2MA 2DJKA 4XRDA 3HY2A 4MZWA 3IE3A 2LS5A 4DSSA 2V41A 1FVKA 3BOAA 5G30A 2YNXA 2H71A 3Q74A 2TRCP 5IO2A 5JWQB 2P5RA 2H1GA 5DALB 3RBTA 3L9SA 2KOKA 5DVBA 3CBUA 1W89A 2VLUA 1M2AA 4G0IA 4I8BA 3HVVA 3ZITA 1Z3EA 3GKMA 3PR8A 4V2LA 4IBPA 3FHKA 4RUVA 14GSA 4EC0A 1CQGA 4D73B 4XCSA 4WR4A 4TN8A 1ZMAA 2FNOA 5HR2A 3RHBA 1OYJA 1A2LA 3UBKA 4PUFC 5DJLA 4JBBA 2KP1A 5AISA 3OR5A 2VL2C 1GL8A 2GS3A 3TRQA 2IIYA 2DBCA 3KD0A 1FB6A 1EV4A 3F6FA 1ST9A 3ED3A 1XWCA 5J9CA 1FHEA 5A4VA 3TDGA 4OD7A 1GRXA 1WJKA 4K0NA 4WKWA 2C3QA 6GSYA 2DC5A 3FZ5A 4DSQA 4GTUA 2YCDA 5EPFA 3UL3A 2VCWA 4HS1A 5ELAA 4PURA 4K1FA 1PGTA 5AGYA 3GKKA 1EEJA 4F82A 1URMA 3A2XA 4BVXB 3MWHA 2BTOT 3LSZA 2IMFA 4MF5A 19GSA 4WEYA 3TJGA 3IK9A 3F8UA 4F2IA 4GSTA 3FK8A 2IFQB 1NM3A 1M99A 4BWSA 2MMOA 4G9HA 4AJ6A 2WZ9A 5INYA 1YQ1A 4G2EA 2XPDA 1V40A 1KTEA 2FWGA 2CAQA 2JACA 1J9BA 3C8EA 2I81A 1KEBA 1PX7A 5CRGA 1R26A 2F8FA 1FG4A 2YJ7A 1O81A 3IXRA 2B1KA 2CT6A 3HD5A 1ZZYA 4MJBA 3ZTLA 1EGOA 1A0FA 3L9VA 5J9BA 2HSYA 1G6WA 3R2QA 1RK4A 4KUNA 1ML6A 2LUSA 5IIZA 4KSOA 4TRXA 3FRCA 4ML6A 4IQ1A 2C0GA 1USBA 1ERUA 1ABAA 5G31A 1PSQA 3C73A 1GSEA 5HFKA 2IMEA 2P0GA 3VLNA 3GV1A 2H66A 1O8WA 4HQSA 5IPHA 5IQYA 2IMDA 2HE3A 1OKTA 3HA9A 1B9XC 3C1SA 2I1UA 4XS4A 3GUSA 4FYUA 1O7UA 2HZEB 4O5RA 2PVQA 3ZYWA 3EU4A 3LWAA 2YZUA 4NV5A 2FLSA 4HJMA 4EO3A 3U5RE 3M8NA 1MTCA 1SK2A 1JHBA 1F9MA 5CNWA 3EMPA 2O85A 18GSA 2YWIA 5G5EA 5KN3A 4LL1B 4MA9A 10GSA 2GT5A 1GSDA 3TKSA 1PL2A 5DAKB 1AUCA 5HR1A 2LTKA 1F3AA 1GULA 4IELA 2LSTA 3Q19A 3F4TA 4KAEA 4O7HA 4YQVA 2F51A 5GAND 1SKSB 1FB0A 2L4QA 4Q5NA 3UEMA 4F9ZA 4ECBA 1K0OA 3HCZA 2GT6A 2J9HA 5AIXA 3EU3A 5DAKA 2CX4A 3PINA 4CDOA 1YY7A 3FW2A 1V98A 1SKRB 1TOFA 3IK7A 6GSVA 1OC9B 5DCHA 1OC8A 1T3BA 1A8YA 4IP1A 1GNWA 6GSSA 3RAZA 5IMDA 4G19A 1T4ZA 2PUKC 5H5RA 3NOFA 1V57A 3LXTA 3RHCA 1BAYA 3BJ5A 2YWMA 4V2MA 1I9DA 3GA4A 4ZIJA 3WYWA 3ERWA 3M9KA 3KH9A 4XTSA 2H6YA 2HI7A 3HKRA 6GSTA 1BJXA 2XPEA 1G7OA 2E0QA 2YOIA 2CVDA 1AIUA 1NHOA 2GQLA 1PA3A 3BCIA 2XC2A 4JZQA 4CHSA 4BWQA 5DBQA 3KGKA 4I6XA 2HSHA 2GSTA 5F0GA 3WT2A 2H70A 2I9HA 3C71A 4N11A 5CP1A 4TR1B 3GURA 1MD4A 1XBSA 1HNCA 4ECJA 2VD0A 4MJCA 3D5JA 2C4JA 1XOBA 3GHAA 2CA8A 2DJ0A 1XPVA 5HR0A 4DSRA 1S3AA 5JWRB 5ECSA 4K9ZA 2PPTA 2OE3A 1AC1A 4RQRA 4AGSA 4TR1A 3EE2A 2AB6A 2OKAA 5JCWA 4AF2A 2FY6A 3KEBA 4TVEA 5G1KA 1Z7RA 3LORA 2A2SA 3GYKA 2FD3A 3D22A 4RI6A 3H93A 3QFAC 1R5PA 3G7JA 3UBLA 2YN1A 2RUEA 1RW1A 2CVKA 2GQKA 1ZOFA 1FAAA 3F3RA 3IR4A 2LJAA 2YP6A 2VAFA 1YEXA 3P8WA 1ZYEA 1TXXA 1R7HA 1CQHA 2OE0A 6GSXA 2J23A 4WF4A 2H1AA 3PPUA 4NXIA 2YJHA 2BMXA 3IDVA 1EGRA 4IGJA 1KBNA 2L59A 5DQYA 3IPZA 5FWGA 4TW5A 3QAWA 4E8HA 4V1Ap 3FR3A 1OKDA 4EE0A 3VWUA 4OFNA 5COHA 3GX0A 1B4QA 5D93A 4OO4A 3I43A 2HSMA 1MDKA 1GSUA 3QMXA 2OBKA 6GSUA 3HHVA 1A0RP 3ERGA 2A4VA 4KCEA 2V6OA 5EY6A 4EF0A 3CTFA 4K7OA 1JZRA 2MYGA 2MZCA 1Z6NA 3VK9A 5A4WA 1Z9HA 3K8NA 3RDWA 5IM9A 4I2TA 3TOUA 1TRVA 1BYEA 3GKXA 5EL8A 2L4CA 2RUFA 3FYGA 1QUWA 2EIRA 2VD1A 5F07A 1XFLA 2H1DA 1V58A 4YH2A 1ACVA 3UAPA 2GDRA 1X5DA 2GGTA 4XHMA 5B7CA 5A4UA 1SYXA 3TRXA 5ECMB 2AUVA 2NVLA 1OAZA 3P7XA 3ZIVA 3LJRA 4YAVA 3LQ7A 1UN2A 4YAPA 3E9JB 1Z6MA 4L0UA 2ZNMA 1O85A 2IJYA 2H72A 1GUHA 2CQ9A 3GTUB 3VPTA 1QGVA 1OE7A 4ZL8A 4AJ7A 1S3DA 4QQ7A 1BG5A 4LA1A 4PQHA 3SWLA 1XW5A 3ZIJA 4Q5RA 1Q4JA 3HZ4A 2JU5A 3GTUA 4K2DA 3CYNA 2H0IA 1Z5YE 2IWTA 1PN9A 2LNSA 16GSA 1EOGA 1X9WB 4I2UA 4GLTA 4IP6A 4MCUA 2C3TA 5DALA 3HYPA 5G1LA 4EDYA 3ZLPA 2L57A 1QMVA 1JZOA 3LYPA 2GZPA 1VF4A 2F8AA 4WF5A 4XIHA 3ME7A 3IAM2 2OE1A 2RM5A 1DSBA 4MH3A 4PGTA 2M72A 4KSMA 2DJ2A 4D73A 2K18A 5AIVA 3HJOA 4PX1A 4KDYA 1A23A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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