3MAKA

Crystal structure of glutathione transferase dmgstd1 from drosophila melanogaster, in complex with glutathione
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
VDFYYLPGSSPCRSVIMTAKAVGVELNKKLLNLQAGEHLKPEFLKINPQHTIPTLVDNGFALWESRAIQVYLVEKYGKTDSLYPKCPKKRAVINQRLYFDMGTLYQSFANYYYPQVFAKAPADPEAFKKIEAAFEFLNTFLEGQDYAAGDSLTVADIALVATVSTFEVAKFEISKYANVNRWYENAKKVTPGWEENWAGCLEFKKYFE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural evidence for conformational changes of Delta class glutathione transferases after ligand binding
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Glutathione S-transferase 1-1
total genus 78
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2010-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3makA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3makA01
2KP2A 2H73A 1YEPA 4AGSA 3TKRA 3TKPA 2N5BA 2RUFA 5AGYA 5D9XA 2O87A 4OO5A 1DUGA 2IWTA 2TRXA 3GKKA 2OA7A 3UVTA 1N8JA 1G7OA 3IV4A 2NVLA 4NAXA 5IOWA 4XS6A 2LRNA 1EV4A 2PVOC 1U87A 2L5OA 4KSMA 3PR8A 1BQ7A 2WCIA 1M2AA 3KIJA 5GAND 1M0UA 3VK9A 4TW5A 4V2MA 1QMVA 2LSTA 1THXA 6GSTA 2F8AA 4HJ2A 4EXJA 1OKTA 3L0HA 5CO3A 2JU5A 2KUCA 5FT3A 3FZ5A 4ULXA 1ST9A 1TRUA 4IKHA 2H6XA 6GSSA 2P5QA 5A4VA 5EL8A 1CQHA 3WD6A 5CRHA 1TI3A 3HVXA 2CVKA 4DSQA 3V1WA 2HSMA 1TRSA 1PQNA 3ERFA 5IMCA 2OBIA 1V40A 4L5LA 1QXHA 1GSUA 1ON4A 5DJLA 3GTUA 4OCEA 1H4OA 4HZ2A 4TRXA 2YZUA 4K7OA 4HDEA 4G0LA 2B5YA 4F0CA 4PQHA 1K0CA 4KDXA 3EWLA 5A4WA 5D73A 1J9BA 1OAZA 4LLRA 4D73B 2HNLA 1FAAA 1PL1A 3GH9A 2R4VA 4EL1A 3EU3A 2K8VA 1FOVA 2FCHA 3ZMKA 3KH9A 3D0ZA 1DE1A 2FUG2 2AHEA 5H5SA 3F6FA 4MPGA 1B9XC 4V1Ap 2DMLA 2HSNB 2PU9C 2LJKA 4RQRA 1OE8A 1VF3A 3UARA 3PH9A 1JZWA 1DE2A 4EDZA 3DIEA 1T4YA 2I4AA 2BJXA 5KN0A 5KN1A 3KEBA 4X1UA 2IMDA 5HQPA 4BA7A 2DLXA 5A4UA 4O32A 4PXOA 3I9V2 3HVSA 1T3BA 5ECNB 2GT6A 2E2GA 5DCHA 2GGTA 3F9UA 4AJ8A 1OE7A 1OYJA 3IE3A 3LG6A 1JLVA 2ON7A 1PX7A 3KXOA 4USSA 2JADA 1EZKA 4YQMA 2HXKA 5IO2A 1HNBA 3F4RA 2KOKA 2FWGA 1E6BA 1AIUA 2VD0A 4ACSA 3I6AA 3ZLPA 5DQSA 3ISOA 3G7JA 5CRWA 3L4NA 2RLIA 3LEFA 1TU7A 2X8CA 2DSAA 2LNSA 16GSA 4PQ1A 5IM9A 2LV3A 1WJKA 1R5AA 5HFGA 2DMMA 3GRXA 4TXOB 3Q6OA 2R5GA 5CREA 4JE1A 4KSOA 3LORA 10GSA 2C0DA 4IP1A 1OVNA 3U5RE 4ZIJA 1GULA 3IC8A 3EYTA 3KD0A 4G19A 1W4VA 1A2JA 5CAXA 3A2VA 3TCOA 1K0MA 2MMAA 4ZB8A 1B4QA 1FB0A 5B6NA 1X9WB 3UEMA 4WBJA 2JZTA 4FYUA 4BVXB 1I5GA 2AV4A 3DGQA 3G7IA 1IYIA 3WT1A 2N5FA 2CAQA 2VCZA 4MP4A 2FD3A 4QQ7A 1FB6A 2MBSA 4GTUA 3GYKA 1QGVA 2GZPA 2XBIA 3E0UA 4I97A 1XFLA 1T00A 3KCMA 1YKCA 1QUWA 4J2FA 4LL1B 4DSRA 2AUVA 2CA8A 2HE3A 3L78A 1ERUA 2C0FA 5H5RA 2VOCA 1X9MB 2QGVA 1FVKA 1ZGNA 5ECPB 2GSSA 4TVEA 1G6YA 5BMUA 2B1LA 1LJRA 4KX4A 2H6YA 5JCUA 4AJ7A 5ENUA 1XCCA 2LRCA 2YWNA 2H01A 4KDYA 2GVPA 2GSQA 2GQKA 3RPPA 2HRKB 1GSSA 1GSEA 4MK3A 3C1SA 3FEUA 5IMDA 5FHIA 1J0FA 1J08A 1NM3A 1BAYA 1AQVA 2X8GA 3OR5A 2CVBA 1XW9A 3FZ9A 2M72A 1X0RA 5D9VA 3UBLA 1FW1A 5CNWA 1QQ2A 5HR1A 4JEDA 6GSYA 1YKAA 2H74A 1RQMA 1BYEA 5JWOB 3ZVJA 1A8LA 1K0BA 2B7KA 4OD7A 9GSSA 4OMVA 3CTGA 4F03A 1A0FA 1WMJA 3LGCA 3C71A 2B1KA 3GUSA 2X8HA 2EIOA 3F6DA 5DVBA 1NSWA 2IL3A 5ECIB 1A24A 1GP1A 4I2UA 2H70A 1F6MC 5DALB 3GMFA 1B9YC 3VPTA 2I81A 3GX8A 2H76A 3APQA 3QOUA 4KW6A 4IJ3A 5IPHA 4MJCA 1SKWB 3EINA 4WR4A 1XWAA 1XWKA 2AJQB 5KN3A 3GH6A 2GQLA 5ELGA 5HR2A 4KNDA 3QAVA 2D2ZA 2EIRA 3WGXA 2XHFA 1GSQA 1Z6MA 2HFDA 1MDKA 4BPYA 4CHSA 1QK8A 1JFUA 1AXDA 1O6JA 3FZ4A 3CRTA 2OADA 4LMWA 4Q5FA 3HJPA 3KP8A 4F2IA 1SK1A 2GSRA 1SU9A 3ERWA 2N5AA 6GSUA 2A2SA 4JU5A 4BL7B 2YN1A 4FO5A 2VLVA 4EDYA 3CSIA 5ECQB 1OC9B 4OCFA 1AC1A 14GSA 2LQOA 3ED3A 3HVVA 1QFNA 4XIHA 3TRXA 3D5JA 4PURA 1T1VA 2YWIA 1GTUA 1T8EB 4K8MA 3TDGA 1EEMA 2P0GA 2RIIA 1V58A 2IN3A 1MEKA 3IBHA 3UOMA 1GSYA 5IIZA 1U3AA 2V32A 1G0TA 2H8LA 5A5KA 3D22A 4CDOA 3ZITA 3LQ7A 4QL9A 22GSA 4GF0A 1T4ZA 4HI7A 4OWYA 1TI1A 4V1Ag 1SD8A 1GNWA 2VLUA 4O5RA 2L59A 6GSWA 2V6OA 4N10A 4ZL9A 2WFCA 4XS4B 2L4CA 2J23A 2HYXA 4IHUA 3F8UA 3BD2A 1XWBA 5CRGA 3TJFA 1O8WA 3IRAA 1HYUA 2JL4A 1HD2A 2LJAA 4E8EA 1A0RP 8GSSA 1SJZA 4PGTA 3QAWA 1F9MA 3ZL5A 1G6WA 2LKUA 1KTEA 3W8SA 4WETA 2A2RA 2ZUPA 3VURA 1XW6A 2C8UA 3GNJA 3MNGA 1T7PB 3N5OA 1MD4A 1SYXA 3BCIA 3ZYWA 5AIXA 3H1NA 2CX3A 2L4QA 2MZCA 1YDKA 3TKSC 2YV7A 3BJ5A 3LYKA 4L8EA 3TKSE 5L71A 4YAVA 1EGRA 4OO4A 5HFKA 1U3IA 4X43A 2WB9A 1MDJA 2B3SA 2H75A 4GWRA 2Z9SA 4KDUA 3M9KA 2YCDA 5AN1A 2FGXA 4Z7XA 2NBSA 1ERWA 1SKSB 2YWOA 12GSA 2HSYA 3D6IA 4KE3A 4MMMA 5DJMA 3ERGA 2L6CA 4OFNA 1SK0A 4MDCA 19GSA 2HZEB 3F0IA 4E8HA 2RUEA 1V98A 4GQFA 3NIVA 2R2JA 1F3BA 3DRNA 5CYYA 1XPVA 3R3EA 4F0BA 2CX4A 1GTAA 3GKXA 1FG4A 2GDRA 2FA8A 1MDIA 3MSZA 4XCSA 4V2NA 1WWJA 3LXTA 2PMTA 2CAIA 3H8QA 4LL4B 4YQVA 4ZILA 3KTLA 4L0WA 1ZL9A 2G2QA 4PQIA 2GLRA 3LFLA 2B5XA 2MMNA 4FIWA 4G2EA 2F3MA 4PUAA 3CXGA 1R4WA 1VRSD 3M9JA 1U88A 4P3YB 3KTBA 3GIXA 5EY6A 3S9FA 4TXVA 3HHVA 5G5EA 3GX0A 3HJOA 4MZCA 1BX9A 5J9CA 5ID2A 1RK4A 4NHZA 4WBRD 1ZYEA 4EKZA 4HS1A 5DQYA 3QDNA 2C80A 2GZZA 2PERA 5CP1A 5D93A 2J9HA 2HZFA 3N9JA 1XVWA 3U6VA 3KMNA 3DXBA 4IP6A 4K9ZA 3F4SA 2YV9A 5D9WA 3JCML 4XRAA 1DSBA 1S3AA 5ECHB 3ZMLA 4MH2A 4IBPA 4IJIA 2NPBA 1A23A 2ON5A 2C3QA 4IW9A 2LQQA 4HJMA 1USBA 1XXUA 3EC3A 1V9WA 3RAZA 4LA1A 4N30A 2BTOT 2HRFA 4HU7A 2FHEA 2NDOA 1GRXA 2JSYA 4ZB9A 1TKDB 3PGTA 1Y25A 4WKWA 4JR4A 1Y6EA 2AB6A 5ECMB 3UAPA 3HDCA 4DSSA 1FO5A 2EC4A 4NHWA 1BG5A 1MTCA 3F4TA 1TJDA 4MCUA 2WDUA 2IPAA 2TRCP 4TR1A 1PL2A 4BVYB 4IVFA 4K2DA 4NV2A 2H19A 4KCEA 2GSTA 5KEJA 5DAKA 1GLQA 2IFQB 4ML1A 1GNEA 2VL3A 17GSA 3M1GA 2K18A 2UZ8A 2C4JA 3VI5A 2H72A 3IR4A 4AF2A 4ZXGA 1B4PA 2YJ7A 5KN2A 5LCZA 3GURA 1EOHA 2H1BA 5ECSA 3FHKA 1RW1A 2H66A 3TRQA 5IMZA 3CRUA 5F8BA 3ZVJD 4PUFC 5JCWA 3APSA 4IN0A 3HJMA 4POKA 4PTSA 1EEJA 3MAKA 2DIYA 4G0IA 1GUHA 3QD9A 2KHPA 2VCTA 1EWXA 3EURA 4TR0A 1ACVA 4FQUA 4EF0A 2JSZA 1ZOFA 3TRPA 1OC3A 3IHQA 3GSTA 2GT5A 2HT9A 2L6DA 2QSIA 2I9HA 4K6XA 3TKQA 4TKYA 4NXIA 5COHA 1SJ6A 1BJXA 3HYPA 5AIVA 4IS0A 1XOAA 1K3YA 2HSHA 3VWUA 3A3TA 4X0XA 4ML6A 5G31A 1M9BA 1AQXA 3FKFA 4ZL7A 3KMOA 2HSMB 2IIYA 5C00A 1XZOA 1TP9A 4XTSA 2H0GA 3C1RA 5IMAA 4OFMA 3LWAA 1GSFA 4F9ZA 1TK0B 2LUSA 3GTUB 3QAGA 1R5PA 1WP0A 4WF5A 5G1LA 4NWYA 3US3A 3IAM2 3HZ8A 3GL5A 1PMTA 4ZBDA 1NHYA 1KNGA 1X9SB 2CT6A 2H1GA 2IMEA 3LSZA 4WR5A 1XOBA 1JZOA 4GSTA 2H0IA 3L9UA 3GKMA 2VL9A 3LXZA 3D4TA 4I6XA 3E9JB 2YJHA 1N2AA 3M0FA 5GAPD 4KH7A 3EMPA 1YF0A 1ML6A 3H79A 2MMOA 1UC7A 2V6KA 4EVMA 4KCAA 5LNKe 3CMIA 1SKRB 3FR3A 2YZHA 5D96A 3MWHA 2H1AA 1FVJA 2F9SA 4K7NA 4D73A 4BWQA 3GSSA 3J7Yk 1E2YA 3CBUA 2HRAA 1ERTA 2DJJA 1PKZA 2ZCTA 5D8IA 1TOFA 2R6KA 4MPFA 3Q18A 4MJEA 4RI6A 3R2QA 2DJ0A 2YNXA 2V1MA 3WGEA 2LRTA 1YEXA 3QFAC 2JZRA 1Z5YE 5AISA 3D4MA 2LNTA 2E2MA 4JZQA 1WE0A 3C73A 2O7KA 3RBTA 2LTKA 2DJ2A 3HA9A 5CRDA 3EVIA 3RDWA 4KA0A 3FR6A 4ECCA 1M2BA 3O6TA 1Z6NA 4MF5A 5B6MA 4GRFA 2ALBA 4JBBA 4GQCA 2VM1A 2OKAA 4XRDA 2FY6A 2H71A 2ZNMA 3GL3A 2IMIA 1Q4JA 3P7XA 1YJ6A 2VCVA 1TW9A 6GSVA 3F3QA 1KBNA 3E3EA 2YWMA 3KH7A 1TK8B 4TR3A 3IAS2 1PD21 5DCGA 4MA9A 4NPBA 4WF4A 1PN9A 1A8YA 2GQMA 2HI7A 4GCIA 11GSA 2DIZA 2X64A 2OE3A 5HFIA 4PX1A 1GUKA 3BOAA 3Q74A 2RM5A 4JR6A 5IPGA 5IMVA 3GN3A 4J57E 2JACA 4FYBA 1DBYA 3G9BA 5ECKB 4BVYA 2CZ2A 3CTFA 4V2LA 4TXOA 2VLTA 2H0HA 2YANA 3QPMA 4POLA 5HR3A 18GSA 3MDKA 4GXZA 1NHOA 5LD0A 1GUMA 1EV9A 2MMZA 3VLNA 2OACA 3ZZXA 1Z7PA 2DJ3A 3DD3A 3O3TA 1JLWA 1TRVA 1JZDA 1G7EA 1C72A 2P5RA 5C04A 3TB2A 3L9SA 4YQUA 2C0EA 2VL2A 1EP8A 4J56E 3CYNA 3A2WA 3CSHA 2MBTA 3DVWA 1TK5B 4WXTA 2OJLA 5GZZB 1A2LA 4KF9A 2M46A 4BVXA 4POBA 2PN8A 1WIKA 1X5EA 1YF1A 1Q98A 2PWJA 3DKSA 3VI7A 4O7HA 1URMA 2WS2A 5EVOA 1M99A 2CZ3A 4CW9A 3QR6A 1ERVA 2B7JA 4K7IA 4IELA 2HRNA 1Z9HA 2H30A 3W8JA 3TJJA 3NZNA 3TJGA 3BCKA 1M2DA 2PVQA 2AAWA 1PRXA 1S3CA 13GSA 2K6VA 3C7MA 4K0NA 4ZL8A 3ME8A 4RI7A 4IGJA 7GSSA 2BMXA 4IQAA 4ZBBA 3IXRA 4TN8A 4EC0A 2GS3A 3DEXA 5ECOB 4ECBA 4HEA2 4G0KA 4HU9A 2O89A 3TOTA 3A2XA 5B7CA 2HRKA 4Q5RA 2KLXA 2XPEA 1AQWA 4RQXA 3ZFLA 2IMFA 1YZXA 5J4UA 3HKRA 3K8NA 1UVZA 2RM6A 5EPFA 3GA4A 3EE2A 4Q5QA 2QC7A 1PSQA 1XWCA 1M9AA 2OBKA 3AY8A 1PKWA 4MLYA 3VFIA 2R37A 3TOUA 2C1YA 3KZQA 2NTOA 5G1KA 3FY7A 2CVDA 1LBKA 3L9VA 2LEGA 3DYRA 3HCZA 2K8SA 1GTIA 1K3OA 4HOJA 3SWLA 1HQOA 1XWGA 1AW9A 5DALA 4TR4A 3H4KA 2OE0A 5IMFA 3QFBC 4H86A 2EIQA 2CQ9A 1GSDA 3P2AA 2B5EA 4OFTA 4MF7A 3PPUA 2QKEA 4XS1A 2P31A 3QCPA 5H5QA 2O8VB 2LS5A 3Q19A 3KM6A 3LJRA 4PNGA 1F37A 1ZYQB 3F3RA 5J41A 4MABA 2WRTA 2REMA 1KEBA 4RUVA 1FHEA 4G9HA 2YP6A 4EUYA 3UBKA 3A5WA 4DEJA 3M3MA 2HLSA 2DC5A 3FR9A 1S3DA 1Z7RA 2F51A 4I2TA 4EO3A 4BL7A 4ECIA 20GSA 1OC9A 4FYCA 2VL2C 4GSSA 3KP9A 3IPZA 2K9FA 4NV5A 1PA3A 3GHAA 5JCGA 3QMXA 5IO0A 1AAZA 5IQYA 4NMUA 2O85A 3DWVA 1EOGA 3ZIVA 1PGTA 3FZAA 4JRRA 1BEDA 5ECRB 4MZWA 2YPMA 1VF2A 4HUAA 3FK8A 1K0NA 3I69A 2HQTA 3IA1A 2XC2A 2FWHA 1O81A 4L0UA 2LJRA 3TJKA 5IOXA 5J9BA 2XBQA 5G30A 1XIYA 4GLTA 3O76A 1R26A 1B8XA 1TU8A 4N11A 4XS4A 2V41A 3H93A 3I43A 3FYGA 1AUCA 5G5FA 3RHCA 1CQGA 2PUKC 5F06A 1W89A 4G10A 1Z3EA 4MH3A 5GSSA 1XBSA 3HXSA 4MZBA 1MD3A 5B8AA 1TXXA 1OKDA 2I3YA 2ES7A 3WT2A 3IOSA 5G2ZA 3ZIJA 3DVXA 3RPNA 5E4WA 1A2MA 2XPDA 1TDIA 2WGRA 5ECLB 1ILOA 3BBYA 5B8BA 2IJYA 3EMXA 4HQSA 1VGLA 1R7HA 3CSJA 1TRWA 4ISDA 2VCQA 3TJBA 1K0AA 2YOIA 1O85A 4K0GA 4YAPA 3D21A 3HD5A 4KGIA 3IDVA 5GSTA 1ZCPA 2DBCA 3HZ4A 3WGDA 2DJ1A 1LU4A 4IQ1A 1WRYA 2F8FA 2VM2A 4HZ4A 1PX6A 1HNAA 4ZB6A 5JWQB 1O7UA 1YY7A 4WEYA 1HNCA 1F2EA 2I1UA 2L5LA 2E0QA 5DBQA 4BWSA 2A4VA 2IMKA 4KAEA 2VCXA 1K0OA 4MJBA 1X5CA 2C0GA 5INYA 1ZMAA 2PGTA 3G7YA 5E59A 5FWGA 3GKNA 3FW2A 3TKSA 2X99A 4I8BA 2HZEA 3VWVA 2DJKA 3P8WA 5ID2B 2L57A 3TUEA 5DDLA 2GTUA 4MJAA 1SYRA 4FH8A 1OC8A 1XW5A 4MF6A 2V2GA 3ZREA 3ME7A 3NOFA 4F82A 2CV4A 3ZRDA 5J3RA 1GLPA 3UMAA 2WJUA 1V57A 4O92A 4N0VA 3F63A 4POMA 1WPIA 4ILFA 6GSXA 1GTBA 5F0GA 3KJYA 2FWFA 2E7PA 1K3LA 2WULA 3ZTLA 4EE0A 4Q5NA 2FLSA 4GSNA 3VPQA 4L5OA 3IK7A 4HQZA 4K1FA 1V2AA 1SENA 4AJ6A 3VWWA 4KUNA 1SD9A 1GWCA 2AYTA 4LMVA 2G0FA 4YH2A 2TIRA 1O8XA 3WYWA 3IC4A 3P90A 2OE1A 4DVCA 1GL8A 4ZBAA 1ABAA 4DSSB 2H1DA 3VWXA 5JWRB 2WZ9A 2VUPA 1ZZYA 2PPTA 4I5QA 1JHBA 5ELAA 4XHMA 4TR1B 3APOA 3M8NA 3GV1A 1B48A 4TOPA 2JZSA 1UN2A 3J7Yb 2C3NA 1O73A 1VF4A 1JZRA 2VCWA 5F05A 5F07A 3HY2A 5ABRA 2VIMA 4ID0A 1F3AA 3EU4A 1THOA 2R3XA 5DAKB 1SL2B 4ECJA 4PNFA 2VAFA 1XVQA 4QL7A 1YQ1A 3TGZA 1SJIA 2FA4A 3UJ1A 2FNOA 2KP1A 1IYHA 3C8EA 1TTZA 3UL3A 3PINA 2C3TA 1U6TA 1EP7A 1K0DA 1SL0B 3IK9A 1H75A 1M7TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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