3P8WA

Crystal structure analysis of r29m/e81m double mutant of human clic1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
PQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQMLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIMEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure Analysis of R29M/E81M double mutant of human CLIC1
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
total genus 76
structure length 236
sequence length 236
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3p8wA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p8wA01
3ME8A 5DJLA 3H79A 4K8MA 3EINA 1T8EB 3ZTLA 5H5SA 3I6AA 1XVQA 3ZREA 2VM1A 5IMFA 1X5CA 3BBYA 2C3QA 2IMFA 1SD8A 2GDRA 1TI1A 4GSNA 4MPGA 2L4CA 1BG5A 4MF7A 2F8FA 4IELA 1GLQA 4ML6A 2A2RA 2VCWA 2DJ2A 3ZRDA 2MMOA 5ELGA 2H0GA 5G2ZA 3M8NA 4H86A 4BVXB 1TK0B 1B4QA 3UEMA 2P5RA 4PQ1A 5DJMA 4BWSA 3APSA 3G7JA 3G7YA 1RK4A 5J5NA 1YQ1A 5EY6A 2DSAA 4O92A 3TKPA 4GRFA 4MMMA 1X5DA 2YPMA 4GCIA 4PTSA 2YNXA 2ALBA 1M2BA 5G5FA 3ERFA 1XFLA 2LKUA 3KM6A 5F06A 2L6DA 5H5RA 3BCIA 1R7HA 2CX3A 3HD5A 5FHIA 1XWGA 1TTZA 2I81A 3IK7A 3EE2A 3HVXA 1SJIA 1OE8A 4MF6A 7GSSA 3DEXA 4I8BA 2KLXA 5EL8A 1JLVA 1J08A 2YOIA 2CX4A 2HSMB 2C0DA 3EC3A 4KX4A 4CW9A 4ECIA 4I2UA 1OE7A 4RI6A 2QSIA 1T4YA 4BWQA 4KGIA 6GSVA 1VF4A 1V98A 2CAQA 3D4MA 5B6MA 5HFGA 2B5YA 3E3EA 4NV5A 2HSYA 3EURA 3VK9A 2RM5A 4FQUA 4TR1A 1GTIA 2B5XA 3HY2A 1KBNA 1M9BA 3LEFA 4TR0A 1BJXA 5G5EA 1X9WB 1BYEA 4DSSB 2KP2A 1FAAA 1T7PB 1OVNA 1OYJA 3GH6A 1WIKA 3HJPA 2REMA 2C3NA 3HYPA 3MSZA 4Q5QA 4V1Ap 1MD3A 5EVOA 1B9XC 2CZ3A 2HRFA 1A0RP 3L9SA 4IJ3A 2H19A 2NTOA 3H8QA 2FGXA 4JU5A 2WDUA 2CZ2A 3DVWA 3HVSA 5DALA 4GQCA 1ZMAA 2BTOT 4OO5A 5D96A 2QGVA 2HYXA 2VUPA 2N5AA 1O7UA 5CNWA 2XHFA 4MK3A 5AN1A 1TP9A 5ECKB 1XXUA 4J2FA 5CP1A 3RBTA 2X8GA 2QC7A 2VLUA 2NPBA 2OA7A 1TK5B 2VLTA 5F8BA 3KTBA 4NHWA 4F2IA 1XOBA 2JZTA 4N10A 2JSYA 5IOXA 3EMPA 4TXOB 3ZYWA 5JWRB 4FYUA 2TIRA 3DGQA 3G9BA 4L5LA 1GWCA 2FHEA 1EEMA 1GNWA 3LJRA 2EIRA 3C1RA 1M0UA 4JR6A 4Z7XA 3W8SA 1XVWA 3NIVA 4ML1A 4RI7A 4QL7A 1EP8A 4O5RA 1K3LA 3ZMKA 2PVOC 2YANA 3ZIVA 4PNFA 1GLPA 1M7TA 2ES7A 4K1FA 4X43A 1QQ2A 3VURA 3FZAA 4HOJA 3HXSA 3TKSE 1HQOA 4HDEA 1FB6A 4KNDA 22GSA 1PKZA 2JADA 2HFDA 3GMFA 1JZDA 1GSYA 5IQYA 1QXHA 1WPIA 3DYRA 3IHQA 2CVBA 3TCOA 1R5AA 4WR4A 3QD9A 4AJ6A 4EUYA 3CSHA 2G2QA 1YDKA 1Y25A 4K9ZA 4IP1A 5ABRA 5ECNB 2IFQA 4D73B 4J56E 3FZ9A 5CO3A 4USSA 2H74A 5J3RA 1EGOA 2AUVA 2VO4A 5D93A 2DJ3A 1SK0A 5CYYA 4HS1A 3LXZA 4POBA 4BVYA 4K7OA 1E6BA 1EEJA 4WBJA 4XS4A 1WJKA 1XOAA 3TDGA 4ID0A 3BOAA 4KB3A 2B7JA 4IN0A 3I43A 2VL2C 4E8HA 5COHA 3C73A 3VI5A 2TRCP 5E4WA 2R2JA 3SWLA 4EF0A 2I9HA 4G0KA 4BPYA 5A4UA 1M99A 2PGTA 5IOWA 6GSSA 1PRXA 2DIZA 4TR4A 3E0UA 5GAND 2B6MA 2V6OA 3FW2A 2HSHA 4O32A 1I9DA 1YKAA 1O8WA 2GZPA 3CTFA 2WS2A 3K8NA 2RM6A 4XRAA 2H66A 4TW5A 1F37A 2LNSA 4ZB8A 4MJEA 3PPUA 1OC8A 5G1KA 4PX1A 5B8AA 2XBIA 2CVDA 5IMZA 5E59A 2YWMA 4OO4A 4NAXA 2VM2A 4L0UA 2YZHA 4DVCA 3WT1A 3QCPA 5KN3A 3GHAA 5CRDA 3TJJA 3GNJA 2HXKA 2FD3A 3ZFBA 2XPEA 3ZZXA 3DD3A 3RPPA 2UZ8A 3PINA 2HZFA 4LMVA 1KEBA 2E2GA 1FVJA 3KJYA 16GSA 1EGRA 1NHOA 5CRWA 5HR2A 5J9CA 1J9BA 4L8EA 3L9UA 3F8UA 3PGTA 2K6VA 1ZL9A 2WZ9A 1TDIA 1YJ6A 2GLRA 2FWGA 4HJ2A 3FR6A 2K18A 2H1GA 1GUKA 2IMIA 1XW9A 2DJKA 1SKSB 1GUMA 4NHZA 4HUAA 4MZCA 4MJBA 5DQYA 3WGXA 2F3MA 4PUFC 2F9SA 3F63A 1Z6MA 3IC8A 1SYXA 2OACA 2LNTA 2HZEB 3M1GA 1PD21 3UVHA 4ECJA 1GSUA 5BMUA 2C0GA 1AW9A 4MP4A 3GX8A 2GSTA 3A2XA 3DIEA 3EMXA 3IRAA 3WT2A 3TB2A 2VIMA 1NSWA 6GSTA 2KHPA 4O7HA 3UAPA 4OD7A 1PN9A 3CBUA 5HR1A 5A4VA 4X0XA 1BAYA 3MNGA 2CV4A 2E2MA 1H4OA 1YF1A 4TOPA 2H70A 3QAGA 3M9KA 2FUG2 1A23A 3LWAA 2N5FA 2RUFA 4KDUA 2BMXA 2HQTA 3IA1A 4WF4A 4GSTA 3US3A 5JCUA 3ME7A 1GNEA 3J7Yb 1TJDA 1K0OA 4XHMA 2R3XA 1GRXA 1F9MA 1A2JA 1DBYA 5F05A 2H1DA 2I4AA 2IL3A 4MABA 4AF2A 3TRQA 5ECRB 1Z7PA 5DAKB 3TRPA 1OC3A 2JSZA 3LYPA 1E2YA 3RDWA 1OAZA 4WEYA 2VL3A 4N0VA 3TJBA 1MEKA 3GURA 1VRSD 1XWBA 2YWIA 3ZL5A 2M80A 1DE2A 3DKSA 2HRKB 3IR4A 2X8CA 4ZL9A 3F9UA 4POKA 3KEBA 1XWKA 1BQ7A 2JZRA 3D4TA 1YF0A 2AAWA 4JEDA 1XIYA 2JU5A 5DVBA 2HI7A 4OWYA 1N2AA 1B4PA 4CDOA 1T1VA 3HZ4A 4NWYA 2VLVA 1GULA 3ZFLA 1M2AA 3F4SA 4KUNA 2IN3A 4GXZA 4TR3A 3HJMA 4YQVA 1OC9B 4EE0A 3NOFA 4HJMA 4TXOA 11GSA 5IO0A 1ZOFA 3QDNA 3TJFA 4ZB9A 1DE1A 2PUKC 1K0MA 2IMEA 4HZ2A 1GP1A 2OBIA 2R4VA 4NMUA 3HDCA 2LTKA 4AJ7A 1WP0A 1LBKA 5B8BA 5G31A 2HSNB 1F3BA 4YQUA 1U88A 3M3MA 2YJ7A 5DBQA 3F3RA 1U87A 1SKRB 2OE0A 4K0NA 3FRCA 4F82A 3N9JA 2G0FA 5GSSA 3EVIA 5CRHA 2WB9A 1UC7A 2C3TA 1Z9HA 3UJ1A 1IYIA 14GSA 3UOMA 5IM9A 1CQHA 3D22A 1SL2B 4D73A 2MMAA 3L78A 1TU8A 3GKXA 2HRAA 4TKYA 6GSXA 1Q98A 3HJOA 4MPFA 1PL1A 1B8XA 3NZNA 2O7KA 5ECIB 1CQGA 2GQMA 1G0TA 2X8HA 3C8EA 1FG4A 4MLYA 5IPGA 2C4JA 3QAWA 4K6XA 1ZYEA 2M72A 4CHSA 2LRTA 1HNAA 2F51A 1AIUA 1J0FA 3FYGA 2FA8A 4PNGA 1S3CA 2AB6A 3S9FA 1Z7RA 1TRUA 3GH9A 4GWRA 4TN8A 10GSA 3GKNA 3ERWA 2YN1A 3ERGA 5JCWA 4YAPA 1TI3A 3Q19A 5F0GA 2FLSA 1TK8B 2GZYA 4IBPA 3VPQA 3M9JA 2DLXA 2NBSA 4PXOA 1SL1B 2V6KA 1KNGA 1Z3EA 4ZBDA 1T00A 4WKWA 1GSQA 5FT3A 3LORA 1PL2A 1A2MA 1U3IA 1WOUA 4MF5A 1EZKA 3OR5A 2DIYA 3I9V2 3BCKA 4MA9A 1OKTA 5ECMB 2H73A 3EU3A 2JACA 2H1AA 2MBSA 2MBTA 1O81A 2H6XA 1ON4A 2YP6A 1XW6A 3R2QA 5ELAA 3P7XA 1IYHA 4YH2A 3QPMA 2GVPA 2HNLA 3F6FA 2DJ0A 1VGLA 2RUEA 2AYTA 1GTAA 2ZNMA 3IPZA 2C80A 3P90A 4ZBAA 3FR9A 2WCIA 2O87A 4NXIA 3DWVA 5C00A 4JR4A 3DMLA 2FWFA 3FR3A 4MJAA 3AY8A 4WXTA 3ZVJA 4PQIA 2GQKA 1S3DA 2OADA 1PQNA 2FA4A 3U6VA 3D0ZA 1YKCA 3G7IA 4N30A 1USBA 4XRDA 2A2SA 1HD2A 5CRGA 2OE3A 2I1UA 1QFNA 1JHBA 1OKDA 4Q5RA 1V57A 2HT9A 2VL2A 1O8XA 1K0NA 2BJXA 5IO2A 5ECSA 2AV4A 3IK9A 1A2LA 4G0IA 2GT5A 1GSSA 4F0BA 2YV7A 4PURA 3UBKA 4ECBA 2OE1A 2CVKA 2H30A 4HU9A 5J4UA 1MDIA 2LJAA 2RLIA 3V1WA 2DMMA 3GTUB 2CQ9A 2IWTA 3E9JB 5C04A 2GT6A 1K3YA 2AJQB 2OKAA 3BJ5A 5EPFA 1MTCA 4AJ8A 1THXA 4V2LA 5L71A 1O73A 4LL4B 3F4TA 3Q6OA 1RW1A 5D9WA 3WGDA 3N5OA 5DAKA 2K9FA 3GA4A 5IMAA 2IMDA 2K8VA 5IIZA 4MJCA 4MZWA 3LXTA 2IMKA 2GZZA 2HRKA 2H6YA 3CXGA 2PMTA 4KW6A 1AQWA 1KTEA 4IQ1A 4L5OA 4I5QA 3QFAC 2DC5A 2X64A 2C0EA 2DMLA 1SL0B 1WMJA 3F6DA 1Y6EA 3KMOA 4HEA2 4OMVA 3WGEA 5LNKe 5AISA 1EWXA 4EVMA 4ACSA 1QUWA 4XS1A 5ECPB 3TJGA 2GS3A 5HR0A 4J57E 3SBCA 5AIVA 2VCZA 2LSTA 4BVXA 1URMA 4ZIJA 1OC9A 1X5EA 4HQSA 4GF0A 2H1BA 3IOSA 3L0HA 2CT6A 4ZL8A 1DSBA 3CRTA 3I69A 4OCFA 4IVFA 4IW9A 2O85A 4EDZA 4BA7A 3VLNA 4EDYA 3HA9A 3HHVA 3H93A 1SYRA 3IE3A 3Q18A 17GSA 1TKDB 3KXOA 3LFLA 2O8VB 4GLTA 2HRNA 3TJKA 2NDOA 2IJYA 2C8UA 3A5WA 1B9YC 3APOA 2B5EA 4ISDA 2KP1A 3APQA 3A2VA 2VOCA 3W8JA 2H01A 4KCAA 2B3SA 2WULA 1S3AA 3Q74A 2X99A 3UVTA 2J23A 2H71A 1A8YA 3KD0A 2HSMA 2N5BA 4POLA 5KN2A 1VF1A 3KCMA 1Z6NA 5DDLA 4TXVA 1ZYQB 1LU4A 5B7CA 2VCXA 6GSYA 4X1UA 4OFTA 1TRWA 4N0ZA 2L5LA 2C1YA 4EKZA 4WETA 19GSA 5IMCA 4KDYA 5HR3A 4BVYB 2E7PA 3A2WA 4DSSA 3TKSA 2TRXA 1ZGNA 1A0FA 2MZCA 3DRNA 4IKHA 2GSRA 4V2NA 1AUCA 4G2EA 4G0LA 3KZQA 4FYCA 3QOUA 4XS6A 4YQMA 1ABAA 1AAZA 18GSA 2RIIA 1F2EA 3GIXA 3O3TA 2YZUA 1NW2A 2PWJA 4IS0A 2J9HA 3TKSC 1X9SB 2H0IA 4XIHA 1Z5YE 1XCCA 3F3QA 2YWNA 1K0CA 2JZSA 4KH7A 5LCZA 4Q5NA 1ACVA 1GSDA 3F4RA 5FWGA 4KE3A 3WYWA 3EWLA 3GL5A 3ZITA 2LV3A 1C72A 4IGJA 5ECQB 3KTLA 4GQFA 1MD4A 3FZ5A 3GL3A 3FEUA 3TKQA 2P5QA 4ZXGA 3IXRA 1XBSA 3ZMLA 1B48A 3UL3A 1GSFA 4F0CA 1WRYA 4BL7B 3TKRA 1FOVA 2VCTA 1I5GA 3UBLA 3IV4A 1MDJA 4AGSA 2YWOA 3ZIJA 3FY7A 4FO5A 4DEJA 2L59A 2I3YA 2OJLA 3HZ8A 4FH8A 1ZCPA 1QMVA 1F6MC 3L9VA 4QQ7A 3O76A 3KH9A 5IMDA 3LSZA 4V2MA 1LJRA 1G6YA 1T4ZA 3D21A 3KP8A 1R5PA 2R37A 4JE1A 1RQMA 4EXJA 4WR5A 4IQAA 3KMNA 1ERTA 1GH2A 5H5QA 4E8EA 3LGCA 4N11A 2LQQA 2ON5A 1AQVA 3GFKA 1XWAA 4KSMA 2H72A 3RPNA 4KAEA 3A3TA 1O6JA 3VFIA 5HFKA 3MAKA 3UMAA 2VD0A 4KF9A 5GZZB 1GSEA 4GTUA 1Q4JA 1PA3A 5JWOB 3IAS2 3H1NA 3O6TA 1QK8A 1TOFA 2H0HA 1HNBA 1HYUA 1TRVA 4NV2A 1YZXA 4WF5A 1TU7A 2WRTA 4TRXA 1VF3A 5A5KA 4JBBA 2HLSA 4XCSA 3U5RE 3W6GA 1YEXA 1EOHA 5J41A 5DQSA 2WJUA 2PPTA 1SD9A 4DSRA 3GTUA 1ERWA 5HFIA 3GRXA 2P0GA 4MZBA 3TOTA 5D9TA 4MDCA 2KUCA 3RHBA 1V2AA 1FVKA 4GSSA 3UIWA 3ED3A 1EOGA 1SU9A 2EIOA 2YV9A 2V1MA 5GSTA 4PGTA 2FCHA 4ZILA 3TUEA 1FO5A 5IPHA 2O89A 5ID2B 1JFUA 4V1Ag 2LJRA 2KOKA 3FK8A 1FW1A 3UARA 2K8SA 2FWEA 1FHEA 2VCQA 4LL1B 1JLWA 3C7MA 1W89A 2DJ1A 1WE0A 1MDKA 2EIQA 1GL8A 5JWQB 3HKRA 2A4VA 3ISOA 6GSUA 2PBJA 2WGRA 5INYA 2VD1A 2GQLA 3EU4A 4FIWA 1HNCA 2R5GA 5AIXA 1BX9A 3GX0A 3RAZA 2GTUA 2VCVA 3KH7A 1EV9A 5ENUA 12GSA 4L0WA 1K0DA 2M46A 3DVXA 3LYKA 2LJKA 2V2GA 2MYGA 2QKEA 2YJHA 1G6WA 4HI7A 2VL9A 3TOUA 1PKWA 3GSTA 1PSQA 2L6CA 4I6XA 4I2TA 3FKFA 5D73A 5ECLB 2H6ZA 2H76A 5GAPD 2DJJA 1V58A 1X0RA 4ECCA 3CSIA 1XPVA 1U3AA 3M0FA 4YAVA 3MWHA 1UN2A 1SK2A 2AHEA 4G9HA 4ZB6A 4I97A 5D9VA 3JCML 2HZEA 1GUHA 2ON7A 4JRRA 4HU7A 1TW9A 1AC1A 1YY7A 3IAM2 1PX7A 3IC4A 3J7Yk 3GYKA 1XZOA 4RUVA 5A4WA 3F0IA 1ML6A 2GSQA 4G10A 3VWXA 3H4KA 6GSWA 3P8WA 2E0QA 2C0FA 5CAXA 8GSSA 3FZ4A 5KN1A 4LLRA 2XC2A 2IPAA 4Q5FA 2FNOA 3IBHA 4OFMA 1WWJA 4P3YB 4POMA 3VWVA 4LA1A 2XBQA 1ERUA 4TR1B 4F03A 4MCUA 1FB0A 3VI7A 2H8LA 5DCHA 4TVEA 4ULXA 3PR8A 1SK1A 3CYNA 1GTBA 3R3EA 3DXBA 3GKMA 2L5OA 4IHUA 3EYTA 1ZZYA 5JCGA 3C1SA 5ECOB 2LEGA 2NVLA 3D6IA 1ST9A 1G7OA 4IJIA 2MMNA 4OCEA 3QFBC 4PQHA 9GSSA 2GSSA 2IIYA 2LQOA 1O85A 2PVQA 4MH2A 4RQRA 4HQZA 2LRNA 1EV4A 1R4WA 5DALB 3VWUA 2DBCA 1JZWA 1AXDA 5CREA 4G19A 1PGTA 4HZ4A 2JL4A 2L4QA 2PERA 1A24A 3WD6A 5LD0A 2LRCA 1NHYA 2VAFA 2WFCA 4LMWA 1SJ6A 3KP9A 4K2DA 1JZRA 4EO3A 20GSA 1XW5A 4K0GA 5IMVA 2B1KA 1G7EA 3P2AA 4EC0A 1UA5A 4KCEA 4IP6A 1W4VA 4PUAA 4BL7A 3FHKA 1TRSA 2R6KA 4DSQA 2P31A 1K0BA 3GSSA 3LG6A 4EL1A 4XTSA 4KDXA 2PU9C 2Z9SA 5DCGA 2FY6A 5KEJA 2H75A 1U6TA 5B6NA 1M9AA 3CTGA 4FYBA 3CMIA 3GN3A 1M2DA 4KA0A 3HVVA 1XWCA 1ILOA 4JZQA 2D2ZA 1TXXA 1UVZA 3C71A 2ZUPA 5AGYA 3GV1A 2YCDA 5ECHB 4OFNA 1EP7A 1H75A 4QL9A 2CAIA 4WBRD 2LUSA 3VWWA 3GUSA 4K7IA 3KIJA 3QMXA 1A8LA 1K3OA 3D5JA 2V41A 1GTUA 13GSA 4F9ZA 1NM3A 2B1LA 5J9BA 1YEPA 2V32A 5D8IA 3HCZA 3RHCA 1JZOA 2IFQB 1SKWB 4MH3A 3ZLPA 5G1LA 2L57A 1SENA 1R26A 5G30A 2PN8A 3L4NA 4ILFA 2GGTA 2HE3A 1QGVA 4K7NA 1AQXA 5F07A 1PX6A 4ZBBA 2MMZA 2LS5A 3TGZA 2XPDA 3PH9A 3QR6A 4XS4B 1X9MB 2CA8A 1SJZA 3IDVA 1VF2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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