3QAWA

Crystal structure of a glutathione-s-transferase from antarctic clam laternula elliptica in a complex with glutathione
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
SKPFVYWGSGSPPCWKVLLVLQEKKIDYDEKIISFSKKEHKSEEILELNPRGQVPTFTDGDVVVNESTAICMYLEEKYPKVPLFPSDTTIRAKVYQRMFETSNISTNVMEFVQYKMKNKDSIDQVLLKEKKDKAHVELGHWENYLKQTGGFVATKEFTMADVFFFPMVALIVRQGANLKDSYPNIFKYYNMMMDRPTIVKTMPPHWAESDSPGNLLDLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of a shellfish specific GST class glutathione S-transferase from antarctic bivalve Laternula elliptica reveals novel active site architecture.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Laternula elliptica
molecule keywords Rho-class glutathione S-transferase
total genus 81
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3qawA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qawA01
4TR4A 3EU3A 2WZ9A 1YY7A 3QCPA 1SENA 1DBYA 4K7OA 1IYHA 2C8UA 5HR0A 2HRKA 3FYGA 3GRXA 4ZL7A 4YQUA 1X9WB 5ECQB 3WT2A 1GSEA 2QKEA 3R3EA 1PMTA 3LSZA 1EV4A 2AAWA 1TK5B 3C8EA 3IHQA 4GF0A 2I1UA 2VIMA 1YEXA 2RUFA 3TJKA 2GVPA 5ECHB 4LL4B 1ABAA 1QQ2A 1XBSA 4FYUA 3W8SA 1F9MA 5E4WA 4K6XA 5A5KA 3UARA 2B3SA 3TOTA 5GSSA 1TI1A 1K3YA 5DBQA 3GMFA 4MH3A 1SYRA 3ZZXA 2OBKA 1G7EA 3Q19A 3F4SA 2LJRA 2CZ2A 1M2AA 2PBJA 1G7OA 4OCEA 4GTUA 4KNDA 1V9WA 1RW1A 4L0WA 2DBCA 4LMVA 4X1UA 3APOA 1A0RP 1W4VA 4JBBA 3GX8A 4NHWA 3GN3A 3H8QA 4NPBA 19GSA 4TR3A 1R7HA 1EOGA 3ERGA 2H1DA 2N5FA 3RHBA 2HZEB 2YZHA 1BAYA 4OFNA 4PQHA 3UAPA 1HNCA 3V1WA 3L78A 3N9JA 5KEJA 1NM3A 3VWXA 5CRDA 2F51A 2FUG2 2X8CA 1VF3A 3L4NA 4FYBA 1ZOFA 3EURA 3DVXA 2PGTA 4ZILA 2AUVA 3HA9A 3DD3A 1K3OA 2FNOA 4KAEA 2PN8A 4ECJA 2RLIA 1SKRB 3WGDA 3F3QA 5DALA 1WE0A 2DIYA 4CDOA 2H73A 1M9AA 1DE2A 2NTOA 1G6WA 3VLNA 2XPDA 5CP1A 5ENUA 3GFKA 1YQ1A 4DSQA 3KM6A 2C3NA 2B5EA 1LU4A 2VCQA 2HRFA 1OYJA 3TKSA 4TOPA 3F6FA 2XBQA 3O6TA 4NV5A 4IKHA 1I9DA 3VWUA 6GSYA 2HRKB 1BYEA 4WR4A 3RBTA 2LJKA 1S3DA 2H70A 3WGXA 3Q18A 4CW9A 3TKSC 3HCZA 3OR5A 2FGXA 10GSA 1ZMAA 4ZB9A 3TB2A 3CSHA 3O76A 1U87A 1B9XC 4ACSA 2V41A 5D9XA 3TJGA 1K0MA 3EE2A 1N8JA 1JZOA 1SU9A 1OAZA 3W6GA 5AIVA 4BA7A 1THOA 1TRWA 3L9UA 4ILFA 1EOHA 1GSQA 4GSSA 1GTBA 1A8YA 2CX4A 2MMOA 3D4MA 6GSXA 3ZIVA 4O32A 2F8FA 1PKZA 5HR1A 4YAPA 5FT3A 3VK9A 1QK8A 2LQQA 4DSSA 5E59A 2C0GA 3RHCA 5ECPB 2DIZA 1AQWA 3P8WA 3IA1A 7GSSA 4WEYA 1JLVA 2O85A 3KMNA 4ZL8A 4LL1B 5CNWA 1NHYA 4PTSA 3DIEA 3DGQA 4KSOA 2WB9A 4TW5A 5J4UA 1OKDA 3IPZA 2M72A 4DSRA 1TTZA 1ZCPA 4MABA 4Q5NA 3WGEA 1XWCA 4JE1A 3EWLA 4MJEA 2JSYA 2B7JA 1GWCA 2JZTA 1UC7A 2LNTA 1JLWA 1XWBA 4F0CA 3KH7A 5AIXA 4IJ3A 4XS1A 4OCFA 3ZL5A 1N2AA 1SJIA 4EVMA 1KTEA 5DALB 2YWIA 3CBUA 3C71A 3TCOA 4NXIA 4L8EA 22GSA 3UL3A 4F9ZA 14GSA 3ME8A 3ERWA 4BVYB 4KH7A 2IFQB 4GSTA 2M46A 2KHPA 2MZCA 2IMKA 2MMAA 3HHVA 1TKDB 2B6MA 2BTOT 5B8AA 1GLQA 2IMIA 3JCML 3HD5A 2YANA 3SBCA 3BD2A 4FO5A 4TVEA 1H4OA 3TRPA 4MZBA 1PKWA 3UVTA 2LRCA 4G0IA 4PQIA 3CRUA 4ZBBA 2VM1A 5FHIA 2K9FA 3KH9A 5JWRB 2H8LA 2H0IA 5DAKA 3KTBA 1FW1A 3VPTA 2MBTA 4DSSB 1B4QA 3QPMA 4ZB6A 4AF2A 3LQ7A 4IN0A 1WMJA 3QAGA 2CVKA 5EY6A 4KE3A 2MMZA 2GLRA 5D96A 2YZUA 3D0ZA 1FB0A 3CTGA 1SK0A 4LLRA 2XC2A 1GULA 3UJ1A 1O81A 4I8BA 3GSTA 4ML1A 1K0AA 2R4VA 2VLVA 4GXZA 2V6KA 2V1MA 1B8XA 4K0GA 1GTAA 4OFMA 1A2MA 2OA7A 2OADA 3VPQA 2I3YA 3GKNA 1O85A 5KN1A 1O6JA 4AGSA 2L57A 5ELAA 3QFBC 1TP9A 5IMFA 4I6XA 3KXOA 5ECNB 3WT1A 5GZZB 2FWHA 2VLTA 3BJ5A 4GCIA 4KF9A 2L6DA 1ERVA 2QC7A 3TUEA 3TKQA 4NV2A 3A5WA 2H19A 5KN3A 2GDRA 3ZIJA 2DJ1A 1B48A 5GSTA 2J9HA 3GHAA 3NZNA 1X9SB 3DRNA 3M9JA 1F3BA 4WKWA 5ECLB 2X8GA 3CMIA 5JCGA 3VWVA 1TJDA 2B7KA 1GUMA 4ECIA 4PUFC 2OJLA 4MMMA 2AJQB 2O7KA 4K2DA 4F0BA 5GAPD 2GQKA 5A4UA 1PX6A 4WF5A 5DAKB 2ZUPA 3A2VA 2IPAA 3PPUA 1S3AA 3DXBA 3L9SA 3PR8A 3FR6A 2JL4A 1WPIA 4I2TA 4IP1A 4RQXA 1OC9B 4EKZA 5IMZA 3HXSA 1HNBA 2V32A 1SL1B 1GSYA 2R37A 2D2ZA 5AISA 1A8LA 5KN2A 1PN9A 2AYTA 2MMNA 1G6YA 2REMA 2C4JA 1J08A 5EL8A 2K6VA 3H4KA 1O8XA 3ZMKA 2TIRA 6GSVA 3VI7A 2RIIA 2IWTA 2CX3A 4TR1B 1OVNA 1VF2A 2VLUA 4EL1A 1RQMA 4FIWA 1WIKA 4POLA 3US3A 2VL3A 1K3LA 2B5YA 2DJJA 2H1AA 2NDOA 4PNFA 4IGJA 2WDUA 2EC4A 5HR2A 1SL2B 1YKCA 1K0DA 1E2YA 3UVHA 2H1BA 1MDIA 2L5OA 2YV9A 4EUYA 5CRHA 3G9BA 3KEBA 4YQMA 2EIOA 2HSHA 3P2AA 1FAAA 2VM2A 1XOBA 5CO3A 1Y6EA 3DKSA 2K8SA 1F2EA 3I43A 3TRXA 4IP6A 3E9JB 1PD21 1VF1A 4IQ1A 2CAQA 1VF4A 3ZITA 4I97A 2MBSA 1TU8A 5G2ZA 1SYXA 3WD6A 2J23A 5ECMB 1OE8A 2DJ0A 2WULA 1ST9A 4IBPA 2GS3A 1Z3EA 1V58A 4MF6A 3IDVA 2DSAA 2ON7A 2WFCA 2NBSA 2A2RA 3LORA 3F4RA 3ZMLA 5F05A 1K0CA 1ZZYA 1XIYA 3BBYA 3H1NA 2PWJA 5J9CA 2CVDA 4PX1A 2H30A 3QMXA 2GT5A 1PX7A 3LGCA 4QQ7A 3C1SA 1V2AA 5IO2A 2VCVA 1T1VA 1Z6NA 2YWNA 5B6MA 4MDCA 2KUCA 2H72A 2LS5A 2JSZA 1CQHA 3UIWA 4PNGA 1XZOA 1THXA 2LV3A 3D21A 1SK2A 4JR4A 1WP0A 2VAFA 3MAKA 3LG6A 1UN2A 4XS4A 4POBA 2I9HA 3HY2A 3LEFA 1JFUA 4N0VA 1SK1A 4N30A 1Z7PA 5B6NA 2DC5A 1TW9A 4RI7A 5G5EA 4OWYA 4HUAA 1AC1A 2VD0A 1F37A 4ZXGA 4IW9A 2P0GA 5A4WA 5LCZA 5CREA 4BVXB 2DJKA 4TKYA 3ISOA 2H71A 3QAVA 4XRAA 2C3QA 2HFDA 1KNGA 3K8NA 4F03A 1OKTA 3EMPA 2VOCA 4GSNA 2M80A 3UOMA 2DJ3A 1SL0B 2IMEA 3KGKA 3CRTA 3WYWA 2E7PA 2Z9SA 3ME7A 4EE0A 3KP9A 5B7CA 5A4VA 4KB3A 2VL9A 4HJMA 4XRDA 6GSUA 4MP4A 1V98A 6GSSA 1MDJA 1ERTA 16GSA 1FB6A 3IRAA 2GSSA 4OD7A 4ZBDA 3QFAC 1AAZA 2LKUA 2LRTA 1URMA 4V2LA 1ERUA 1O73A 2GGTA 3TDGA 2C0DA 4EDZA 4Q5RA 2VO4A 2LTKA 1FOVA 3DYRA 1AXDA 1VGLA 1YKAA 1JHBA 3P7XA 5HQPA 1FO5A 2LJAA 2B1LA 3IOSA 4WBJA 4G2EA 2P31A 3GX0A 1M99A 3A2WA 4N0ZA 2WCIA 2FA4A 1PA3A 3PGTA 1BJXA 2OE1A 4XS4B 4HQZA 1BG5A 4V1Ap 5ECOB 2FHEA 1XW9A 2NPBA 2DMMA 2P5RA 4TXOA 3TRQA 4GWRA 5G1LA 3ZLPA 3G7IA 1FG4A 4HOJA 3VURA 3KIJA 4GQCA 4MJCA 1ACVA 4RUVA 3EMXA 2OKAA 1Q4JA 4POMA 1ML6A 4HZ2A 1AIUA 2KLXA 2HT9A 1K0BA 1T00A 4EO3A 4X43A 4G19A 1TRUA 2ALBA 5ABRA 1U3IA 1ZYQB 3S9FA 1Q98A 4BL7A 3KD0A 1MEKA 3M9KA 4TR0A 1B9YC 1U88A 5C04A 1MD4A 1XVWA 3F0IA 1ILOA 4WR5A 3UBLA 1SJZA 1LBKA 2GQMA 1PGTA 3L0HA 1ZYEA 3QR6A 2CQ9A 1GSFA 1GSSA 4MF7A 2B5XA 5J3RA 2P5QA 4FH8A 3TKPA 5LNKe 4MZCA 3IK9A 5INYA 4ZB8A 5COHA 4KCAA 1O7UA 1GUKA 1EEMA 1AUCA 5CRWA 5DDLA 2C1YA 4N11A 5G5FA 3KMOA 2H6YA 1M0UA 2FWEA 5JWQB 5C00A 4G9HA 2HRNA 2I81A 4F2IA 3HJMA 1XFLA 3LXTA 2OE3A 3A3TA 5J41A 2WJUA 1Z5YE 3FR9A 1A2LA 2V6OA 3RPNA 1EV9A 3N5OA 1GSUA 4EDYA 4PGTA 4RI6A 2YJ7A 5DCGA 4MLYA 4K0NA 3BCIA 2YPMA 4V2MA 1GLPA 1TU7A 1PSQA 4G0KA 3LYPA 4MPFA 2F9SA 2LSTA 1F3AA 2H75A 2YNXA 2VL2A 1B4PA 5J9BA 4NMUA 1EZKA 2K18A 4NWYA 1X5CA 3GIXA 2VL2C 2R5GA 4TXOB 1Z7RA 2FCHA 2HLSA 3D22A 5HR3A 3D4TA 2HYXA 1PRXA 1Z6MA 4L5LA 2CA8A 4HZ4A 4G0LA 3KCMA 2DLXA 3C73A 3G7YA 2LEGA 2O87A 1ERWA 4EXJA 2IJYA 4H86A 4GRFA 3GH9A 1YDKA 4KW6A 1C72A 2L6CA 2H76A 2H1GA 1JZDA 3TJBA 8GSSA 2GT6A 11GSA 2EIQA 2LRNA 2F8AA 3G7JA 2BJXA 4BL7B 5IMVA 3FHKA 2HSMA 3HKRA 3CXGA 2IN3A 3DVWA 3GA4A 4KUNA 1U3AA 2GTUA 1QUWA 4CHSA 1WWJA 4I2UA 3F6DA 5CAXA 4KCEA 5IIZA 3GKMA 5ELGA 3HVVA 2L4CA 3ZFBA 3I6AA 5L71A 1M2BA 4IHUA 2JACA 4NHZA 5IOWA 4HI7A 4K7IA 4IS0A 4KDUA 1X9MB 4PUAA 3C1RA 1NHOA 1I5GA 2HSNB 3L9VA 1J9BA 1AW9A 3LFLA 3QOUA 5IM9A 1CQGA 1R5AA 3M1GA 2OBIA 1HQOA 2ON5A 1FVKA 3HJPA 1TRVA 1M9BA 2R2JA 3FY7A 2LNSA 3ZFLA 5D9WA 1BEDA 3M3MA 1ZGNA 2LUSA 4LMWA 3Q74A 1T3BA 3FEUA 3GTUA 5D93A 2H66A 3CTFA 1E6BA 3GL3A 1UA5A 2JZRA 1SD8A 2GSRA 3HVSA 4J2FA 4MZWA 4KDXA 4N10A 2DJ2A 1MDKA 2MYGA 3FR3A 2WS2A 2B1KA 1YEPA 2VUPA 2XBIA 2DMLA 4JU5A 2PU9C 4GLTA 4OFTA 2FA8A 4ULXA 5DQSA 3MWHA 2IMDA 2GZZA 3J7Yb 1KBNA 1UVZA 1T4ZA 4KGIA 2KP1A 4KDYA 4MJAA 2AB6A 2YJHA 1EGRA 1NW2A 3U5RE 4MF5A 1H75A 1XWGA 2YCDA 5HFKA 2C0FA 2IIYA 4MK3A 1W89A 4G10A 1A2JA 2YOIA 1RK4A 3SWLA 4HDEA 3LJRA 1QXHA 1JZWA 2N5AA 3PH9A 2BMXA 4ZBAA 2HSMB 6GSWA 3LWAA 3KTLA 1FVJA 1T8EB 5EPFA 1ON4A 1TOFA 4O7HA 4HU9A 1EGOA 4DVCA 2E0QA 2VCXA 2E2MA 2FLSA 2CVBA 1O8WA 3HDCA 1XXUA 3IC4A 4EC0A 1GSDA 5ECSA 3D5JA 3RAZA 2TRCP 4TN8A 4LA1A 2QGVA 4K9ZA 3M0FA 4XIHA 2JADA 3F4TA 4HU7A 4D73A 4MPGA 1VRSD 2RM6A 5IO0A 3TGZA 1XOAA 4E8EA 1AQVA 1FHEA 1DSBA 2FWGA 4FQUA 1TK0B 2LQOA 3KJYA 2CT6A 4IVFA 3BCKA 5GAND 5DJMA 4OO4A 2H01A 3DEXA 3LYKA 2JZSA 4HS1A 4YH2A 3GTUB 3F8UA 2H0GA 3MSZA 2C80A 1U6TA 18GSA 4EF0A 2RM5A 3ZREA 5D9TA 2UZ8A 5D73A 3ERFA 4POKA 4WXTA 1XWAA 5DJLA 1GH2A 3QDNA 1XPVA 2TRXA 3O3TA 2PVQA 3QAWA 2HQTA 4J56E 4PURA 3TKSE 4WF4A 2VCWA 2H0HA 4ECCA 5F0GA 4FYCA 2YV7A 3IE3A 5G1KA 5H5RA 1HNAA 3GV1A 1XW5A 2HNLA 1GNEA 4BVYA 2F3MA 2A4VA 2I4AA 2IFQA 3PINA 1A0FA 5F06A 2EIRA 3HYPA 3GKXA 3APSA 2PVOC 3GYKA 5IMCA 4JRRA 4V1Ag 4ID0A 3F3RA 1JZRA 5EVOA 4AJ8A 1SKWB 1USBA 4MCUA 2FD3A 1OC8A 1YF0A 1GTUA 2PPTA 5ECKB 2XHFA 5IMAA 3VFIA 2VCZA 3FZAA 4JZQA 4BWSA 2FWFA 4HEA2 1TK8B 1ZL9A 4ML6A 4WETA 4USSA 4O5RA 1WJKA 2FY6A 2WGRA 1V40A 5FWGA 4RQRA 3GSSA 5D9VA 1EP8A 2AV4A 3IAM2 3U6VA 2KP2A 1YZXA 5BMUA 1M7TA 4Q5QA 4ZL9A 13GSA 3IK7A 5J5NA 4YQVA 4JEDA 5D8IA 5ID2A 2YP6A 4D73B 4WBRD 4L5OA 3GNJA 2O8VB 4HJ2A 2C3TA 5ECRB 1K0NA 2X64A 5JCUA 3TOUA 1J0FA 1DE1A 1X0RA 3KP8A 2H74A 3TJFA 4K8MA 3HZ4A 3R2QA 4GQFA 1OC3A 3IR4A 5AN1A 2JU5A 4I5QA 5JCWA 4J57E 2H6ZA 3NIVA 2GSTA 2HRAA 2YWMA 1AQXA 3Q6OA 3MNGA 1F6MC 1PL1A 1T7PB 2CAIA 3RDWA 2IMFA 4XCSA 4PXOA 4V2NA 4AJ7A 1GTIA 2HXKA 2AHEA 2RUEA 1S3CA 4DEJA 3GH6A 2OE0A 2VCTA 1Y25A 3D6IA 2ZNMA 3GL5A 1BQ7A 2GZYA 5HFGA 1HD2A 3APQA 4QL7A 20GSA 1IYIA 1XWKA 3A2XA 3KZQA 5H5SA 5G31A 3IBHA 1SJ6A 1TDIA 3W8JA 1HYUA 4P3YB 3BOAA 1TRSA 3RPPA 3ZRDA 3EC3A 5HFIA 2L5LA 3HZ8A 5H5QA 4KX4A 4IJIA 3ZTLA 5CYYA 1PQNA 1GNWA 3FZ9A 1PL2A 3HJOA 1KEBA 4Q5FA 1V57A 3F63A 3I69A 2GZPA 2PMTA 4NAXA 5LD0A 2A2SA 2NVLA 4XTSA 5ID2B 4L0UA 3UBKA 6GSTA 2GQLA 5F8BA 1QMVA 3UMAA 2H6XA 1OC9A 2CZ3A 1MD3A 1R26A 3FRCA 3CYNA 3MDKA 2E2GA 4KSMA 4F82A 3FKFA 2HE3A 3E0UA 3EYTA 3DMLA 2HZFA 4XHMA 3TJJA 1OE7A 3ZVJD 2IL3A 1A24A 2PUKC 4ZIJA 3M8NA 3CSIA 4YAVA 5IPGA 3IXRA 5ECIB 3QD9A 2N5BA 3FZ5A 5IQYA 3ED3A 1K0OA 2QSIA 4TR1A 3FZ4A 2G0FA 3CSJA 3UEMA 3GKKA 4ISDA 4HQSA 4QL9A 4MA9A 3I9V2 3EU4A 1LJRA 4MJBA 1XCCA 1EEJA 4AJ6A 3DWVA 5DCHA 4JR6A 4IELA 2WRTA 3TKRA 4TXVA 4XS6A 1R4WA 2XPEA 2HI7A 1XW6A 1NSWA 3FW2A 4BWQA 5DQYA 1Z9HA 3GURA 2ZCTA 3H93A 5DVBA 3F9UA 3IAS2 1M2DA 2X8HA 3EVIA 3HVXA 2KOKA 9GSSA 4OMVA 2L4QA 2YWOA 1SD9A 3FK8A 2R6KA 1A23A 3VWWA 4E8HA 1XVQA 1GUHA 2L59A 1YJ6A 17GSA 2HSYA 3ZYWA 5B8BA 1X5DA 2YN1A 4K1FA 3IV4A 5IMDA 1BX9A 1YF1A 1QFNA 1EWXA 12GSA 2R3XA 3IC8A 4PQ1A 3NOFA 3VI5A 3C7MA 1SKSB 4BPYA 2G2QA 2CV4A 4Z7XA 2C0EA 3AY8A 5IPHA 2V2GA 5IOXA 2HZEA 1G0TA 1T4YA 1X5EA 5AGYA 3EINA 1EP7A 3E3EA 4KA0A 5F07A 2ES7A 5KN0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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