3UAPA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501774) from methylococcus capsulatus str. bath
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
VMKLYYFPGACSLAPHIVLREAGLDFELENVDLGTKKTGSGADFLQVNPKGYVPALQLDDGQVLTEDQVILQYLADLKPESGLMPPSGTFERYRLLEWLAFISTEIHKTFGPFWNPESPEASKQIALGLLSRRLDYVEDRLEAGGPWLMGDRYSVADAYLSTVLGWCEYLKIDLSKWPRILAYLERNQARPAVQAAMKAEGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Methylococcus Capsulatus
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Methylococcus capsulatus
total genus 72
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3uapA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uapA01
2VL2A 4GLTA 2CZ3A 4IVFA 1ERVA 2I81A 3GN3A 4HEA2 3FRCA 1QXHA 3FZAA 4IW9A 1FVJA 2CAIA 4K1FA 1QMVA 3UL3A 4G0LA 1GSUA 3HVXA 4O5RA 2DMMA 4Q5QA 1OC9B 4PQIA 4L0UA 2VL9A 2WULA 1HQOA 5CNWA 18GSA 5ECOB 1CQHA 3F6DA 3HDCA 2C80A 4E8HA 4BL7B 4ID0A 1B48A 1TJDA 4ECIA 2O89A 6GSYA 1JFUA 3A2VA 1XFLA 2PVQA 1SENA 4JE1A 2GSTA 1PD21 1AIUA 2PUKC 3HA9A 4MJAA 3UVHA 1PKZA 5IMVA 2A4VA 3MAKA 4N0ZA 1R4WA 3GKMA 4TR1A 2H0IA 2HXKA 1M99A 3ZREA 2GQKA 3QR6A 3TDGA 2VCTA 1Y25A 2MBTA 2VL3A 1TXXA 5IO2A 2J23A 3G7JA 2X8GA 2CVKA 3L0HA 3TKRA 2LQOA 4N11A 4AJ7A 1TRUA 2O85A 1O8XA 2GZZA 1MTCA 1YZXA 3VI7A 1ML6A 5DQSA 4AJ8A 3GFKA 5ECRB 3SWLA 3WGDA 3R3EA 4JR6A 3GSSA 4I6XA 4NV5A 4JZQA 3AY8A 3F4TA 1A2LA 2H1AA 5CRWA 1QQ2A 2C3NA 1XVWA 1FO5A 4NHWA 3A2WA 1G6WA 2H72A 4V1Ag 5DJMA 2FY6A 2OE0A 4KAEA 3HJPA 3Q6OA 4GTUA 3LWAA 5HQPA 4ZL8A 2AB6A 3H4KA 1V2AA 6GSSA 2JZTA 3FKFA 3WGXA 16GSA 4D73B 6GSVA 2JSYA 5F07A 3KMOA 4NHZA 3TRPA 2HLSA 20GSA 3FW2A 1F9MA 4TW5A 2DIZA 3GL5A 4NV2A 3W6GA 1U88A 1RW1A 2RLIA 2L5OA 4DSSB 2C0GA 3HZ4A 3NZNA 5B8AA 4IN0A 1ZL9A 1BAYA 3ISOA 1JZRA 3R2QA 2HT9A 5EY6A 3IAS2 1ERWA 2FNOA 1XCCA 3PPUA 3WD6A 10GSA 2JACA 2LTKA 1EV9A 2L4QA 1PA3A 2HRFA 1SK1A 1CQGA 4HUAA 3MDKA 2R37A 3FZ4A 3IOSA 5DBQA 4LMWA 4F82A 1TI1A 1O7UA 1GSQA 1EGRA 1K3YA 1VRSD 1TI3A 2P0GA 4KSMA 4ZIJA 1QK8A 1EEJA 4MP4A 3GSTA 4YQVA 4X43A 4PQHA 4IP1A 5ECKB 3QAVA 1EP7A 3M8NA 4O7HA 1M9BA 2AAWA 2YOIA 2FGXA 1MD4A 4G2EA 4OCFA 4F9ZA 4JR4A 19GSA 1TDIA 3LEFA 2IMIA 5CYYA 1NHYA 2A2RA 4OMVA 2QSIA 1XBSA 4WBJA 2IWTA 5AIVA 3VWXA 4WR5A 2X8CA 3C71A 1A0FA 9GSSA 2IPAA 1GRXA 4OCEA 2VM2A 1SD8A 1XW9A 2LRNA 2YWMA 1A8LA 3US3A 2FCHA 4RQRA 1OAZA 3UEMA 1B4QA 2TRCP 4GSNA 5ECIB 5HR1A 2WDUA 1FAAA 4RQXA 3Q18A 2B7JA 5AN1A 3GKKA 3GX0A 4AF2A 4OD7A 2HSYA 2DJ2A 4F0CA 2CVDA 3BCKA 4I8BA 3RDWA 4POLA 1TU7A 3FR9A 4J2FA 4ZBAA 2MZCA 2TRXA 5DAKA 3RHCA 5HFGA 3HZ8A 3PGTA 1NW2A 1S3DA 5ECMB 3IE3A 4USSA 2EC4A 5KEJA 2H6YA 3IRAA 3F63A 1GSDA 5EPFA 5DCHA 1GP1A 2GT6A 5AISA 4Q5RA 1M2BA 4TR1B 5H5RA 2HI7A 1J9BA 2FWGA 4KDUA 4V1Ap 2B3SA 2H01A 5ECPB 4PGTA 5B8BA 4OO5A 5JWQB 2YJHA 1VF4A 4KA0A 2NPBA 4ZL9A 1BQ7A 2YZUA 2IMFA 1F3BA 5HFKA 2VIMA 12GSA 3OR5A 5DVBA 2L5LA 1YJ6A 3P7XA 3LG6A 4HU7A 1PKWA 5CRDA 3JCML 4WXTA 3UBKA 4BL7A 3TJFA 1WP0A 1M7TA 2XPEA 3G7IA 3QDNA 1PMTA 5CREA 1JHBA 4MZBA 2PWJA 4TOPA 2B5EA 2TIRA 1ERTA 1Q4JA 3VWVA 2FWHA 4XHMA 3TKSE 2JL4A 2KHPA 2HNLA 3KP8A 2R6KA 2WCIA 2LNSA 2OA7A 2CZ2A 1T8EB 1XW6A 1YY7A 2VCQA 1XXUA 1BJXA 3DXBA 3UOMA 4KF9A 1TW9A 1DSBA 2RIIA 1WMJA 1PX7A 1H4OA 1WWJA 1BG5A 3GTUA 5C04A 1T3BA 3GHAA 1SU9A 4PQ1A 2I9HA 5HR0A 4G19A 2IMKA 4GRFA 4FYBA 3RPPA 4EDYA 2DJ1A 3CBUA 4PX1A 2X99A 2HZFA 2YJ7A 1OKTA 1TK5B 4G9HA 4ZB9A 1BEDA 1FVKA 2B5XA 5HR2A 5EL8A 3APOA 1O85A 1ERUA 1YF1A 2RM5A 3TGZA 1ST9A 2NTOA 2VLUA 4N10A 4LLRA 1B9XC 2ZUPA 4OFMA 4MJEA 2PERA 4DVCA 1SKWB 4QL7A 4RI6A 3ZMLA 4JBBA 3UAPA 3HHVA 5ABRA 2F8FA 3O76A 1Z3EA 4EVMA 1YDKA 1OC8A 2C8UA 5F06A 1FB0A 5LNKe 1Z5YE 4AGSA 4I2UA 3ZVJD 1EP8A 2NDOA 2K6VA 4F2IA 2H75A 1ZGNA 3QFAC 4GSSA 5IMDA 2YV7A 1UN2A 4EKZA 3PH9A 4K9ZA 1VF1A 2H74A 4MH2A 4H86A 4RUVA 5JCWA 4PNGA 1DUGA 2H0GA 2VCWA 5DALA 3FR3A 4LMVA 2VCXA 1ZCPA 4KDYA 3F0IA 2OE1A 5A4WA 3TKPA 6GSTA 4PURA 5J5NA 2REMA 1SKSB 1TRWA 3BBYA 5B6MA 3ME8A 4WEYA 3KD0A 1GNEA 1J08A 1OKDA 1GSSA 4MA9A 5J3RA 3KCMA 3E0UA 1NM3A 1X0RA 1GTIA 4Z7XA 5GSSA 1O73A 2V2GA 5A5KA 5COHA 3H93A 5DAKB 3EURA 2FWFA 1SD9A 4N0VA 5D93A 1SKRB 1GSFA 1XWBA 3D6IA 4BWSA 3F6FA 1NHOA 3H1NA 1N2AA 5JWOB 5F8BA 4HJMA 1DE1A 2H70A 1WPIA 3L78A 4ML1A 1MDIA 4PUAA 4X0XA 1XWKA 3QCPA 4IP6A 4OFTA 3FHKA 3SBCA 2AUVA 1GL8A 2L6CA 3M1GA 2VAFA 3DVXA 3W8JA 3ZVJA 3CMIA 2H1BA 1S3AA 4XTSA 1ON4A 5IMCA 2C0EA 1K0OA 2VO4A 2VLTA 3TRXA 5CO3A 2DSAA 5JCUA 1PQNA 5DCGA 5FWGA 1M2DA 5E59A 1A24A 5DJLA 3LQ7A 2P5RA 4WKWA 2HQTA 3ERFA 1FB6A 2GT5A 3QPMA 1O6JA 1GNWA 1SYRA 5LCZA 3WT2A 1VF3A 5GZZB 1VGLA 1SL0B 3TCOA 5IMFA 3GTUB 2LSTA 1DBYA 1AQWA 3ZYWA 3ZIJA 5ID2B 6GSUA 4K0NA 3IK7A 1XOBA 2K18A 3P8WA 4G0KA 3TRQA 3VI5A 1PSQA 4YQUA 1F37A 2E2MA 3E3EA 1FG4A 3M9KA 3PR8A 4XS6A 4DSRA 2KLXA 3TUEA 2RUEA 2AHEA 3KIJA 2JZRA 3DKSA 3VURA 1TRSA 5KN3A 3VPTA 2I3YA 4HZ4A 5J4UA 1V57A 2DJKA 1EEMA 3L9VA 2UZ8A 2OKAA 2WJUA 1SL1B 1A2JA 1U87A 1YEPA 4EE0A 1SL2B 2LJKA 2BJXA 5GSTA 3E9JB 3TKQA 5C00A 5F05A 3V1WA 5A4UA 2LV3A 1GTBA 1UA5A 5FT3A 4MF7A 2FWEA 2GLRA 1USBA 1G6YA 3C7MA 2CT6A 2HSHA 2IN3A 5IOXA 2X64A 4XCSA 2IIYA 3LYPA 1Z6NA 1EGOA 1OC3A 2LNTA 2PN8A 1U3IA 2GTUA 5DALB 2XHFA 1R7HA 2YWOA 3RBTA 3ZLPA 2GVPA 2MBSA 2O87A 1O81A 4NAXA 3GX8A 1TRVA 4E8EA 1F2EA 2CAQA 3S9FA 2VCZA 3UIWA 1MD3A 4BVXA 3BOAA 5KN1A 2H30A 3VFIA 1G7OA 3A3TA 4TXVA 5J41A 4MCUA 2B5YA 3C1SA 2ON5A 3C1RA 5ECHB 1ZMAA 1EZKA 2DJJA 2VD0A 1AUCA 4EO3A 3RHBA 4TR3A 5D8IA 2M46A 1C72A 1TK8B 4IKHA 2C3QA 2H1DA 4YH2A 3VLNA 4ZBBA 4Q5FA 2FA4A 2N5BA 4IQAA 3L9UA 4ZXGA 3HVVA 4GXZA 3IDVA 1KBNA 2F9SA 2LQQA 3F3QA 3L4NA 3QMXA 3BCIA 3J7Yb 22GSA 2GGTA 4IS0A 2N5AA 1PRXA 2PGTA 1ZZYA 1HD2A 4GWRA 2VLVA 3ZRDA 3GL3A 4KGIA 2XC2A 3UMAA 3O6TA 4OFNA 3IBHA 1BX9A 5DDLA 4V2MA 2LRTA 3FZ9A 4IELA 3ZITA 3M0FA 2OJLA 1RK4A 5DQYA 3DIEA 1ZOFA 4K7IA 2WS2A 13GSA 3RPNA 2R3XA 3D0ZA 1V98A 3W8SA 1FOVA 4MPFA 4KNDA 2M80A 3M9JA 4JU5A 1T00A 2R5GA 4NXIA 4WBRD 3UJ1A 4ZL7A 3GH9A 1G7EA 11GSA 4F03A 4V2NA 3CRTA 5LD0A 4MABA 3U5RE 3GUSA 1X5CA 3IXRA 3EU3A 1GH2A 2DJ3A 4J56E 2GSSA 2ES7A 4N30A 3D4TA 5D9XA 4LA1A 2D2ZA 3WYWA 5AIXA 3UVTA 3Q74A 1Z9HA 1GTAA 2R2JA 3P2AA 5ECSA 4CW9A 3GURA 2KP1A 2IJYA 4HZ2A 2HRNA 3HYPA 1AQXA 3KGKA 1RQMA 3EMPA 3HJMA 3IC8A 3TJGA 1THOA 2CV4A 5ELGA 3IC4A 2VCVA 2JADA 2A2SA 4EC0A 4I2TA 4IGJA 1JZWA 3VWWA 1ABAA 3TOUA 2LJAA 4MMMA 3MWHA 4RI7A 2E0QA 1AQVA 2MMZA 3MSZA 2DBCA 2OE3A 2IFQA 3LJRA 5ID2A 2GS3A 5ECLB 1UC7A 3EMXA 3KH7A 3ZFLA 3TJKA 1OE7A 2V1MA 4HI7A 5G5EA 1A2MA 4IJ3A 4YQMA 4ZILA 2V6OA 4KE3A 4PXOA 1QFNA 1K0BA 1T4YA 2YNXA 5E4WA 1AC1A 1Z7PA 1K3LA 1XVQA 3KH9A 4HDEA 2EIRA 4POKA 3F4RA 2RM6A 2K8SA 4BVXB 1V58A 5D96A 2WRTA 2EIQA 3ZFBA 2Z9SA 1A8YA 4L5OA 2FA8A 2O7KA 2EIOA 1ZYEA 2P5QA 2L4CA 2ZCTA 2V32A 3N9JA 3ZTLA 2IMEA 3IK9A 1VF2A 5D9TA 2YWNA 4KCAA 1H75A 2CVBA 3KJYA 2KUCA 3CRUA 1K0AA 5A4VA 3PINA 3DVWA 1B9YC 2LS5A 1U3AA 1XZOA 5CRGA 5HR3A 4HOJA 6GSWA 1B4PA 1LJRA 2B7KA 4WF5A 2YANA 2FLSA 5GAND 1Z6MA 3GKNA 3F4SA 2AV4A 3WGEA 2JSZA 3EYTA 3GYKA 2H71A 2WFCA 2OBKA 3I69A 3TKSC 1MEKA 2R4VA 3D5JA 4EF0A 1YQ1A 4EUYA 5F0GA 3TJJA 4XRAA 1M9AA 1GLQA 3I43A 1SJZA 3I6AA 5D9VA 3G7YA 1E2YA 5JCGA 2H19A 1R5PA 1AAZA 4DEJA 2MMOA 5G1LA 3Q19A 2YV9A 3HKRA 1HNAA 2VOCA 1A23A 2VD1A 3GMFA 1EWXA 5G31A 1BYEA 1GWCA 1Y6EA 3UARA 3C73A 3VK9A 1PX6A 5D9WA 3HCZA 2VM1A 2H8LA 2PMTA 3EVIA 2HFDA 1QGVA 1HNBA 3O3TA 1J0FA 3CSIA 1WRYA 3UBLA 2VL2C 2H76A 1V9WA 4FQUA 3EE2A 4G10A 3KMNA 4ECCA 1T4ZA 2L57A 1TTZA 4AJ6A 1B8XA 2GQMA 3CSJA 2QKEA 4XS4A 4POMA 1GSEA 2HRAA 5IPGA 3DYRA 3IPZA 5EVOA 4JRRA 2L6DA 4HQSA 1PGTA 1G0TA 4DSQA 2GZPA 5INYA 3ME7A 4KB3A 4GSTA 2H73A 1R26A 2GZYA 3CYNA 2C1YA 2HE3A 4FH8A 2HZEA 4EDZA 1PL2A 4TXOA 4F0BA 4L0WA 2PBJA 5IMAA 4BVYA 3GKXA 5AGYA 4K2DA 1HYUA 3QAWA 1TOFA 3KEBA 1UVZA 5L71A 2IFQB 2DJ0A 2F8AA 1S3CA 2XBQA 2J9HA 2PPTA 1XWGA 4MF6A 3DMLA 1IYHA 2IL3A 3KZQA 3FEUA 1JLVA 2DC5A 3LGCA 5IOWA 2C0FA 3LXZA 4WR4A 4HS1A 3M3MA 2K9FA 1LBKA 3C8EA 4K0GA 4KH7A 2B1KA 3GRXA 1XW5A 4TKYA 1I5GA 1WIKA 4YAPA 3A5WA 4K6XA 2P31A 3TOTA 3KXOA 2C4JA 3F3RA 4ZB8A 4IQ1A 2KOKA 2PU9C 3KTBA 4MF5A 4O92A 3WT1A 2XBIA 3TB2A 2OBIA 1QUWA 4BPYA 2QGVA 2LEGA 3VPQA 2LKUA 4K7NA 1ACVA 2MYGA 1TP9A 2HSMA 5G30A 2NBSA 1TK0B 2N5FA 1F6MC 4GQCA 2HSNB 4KX4A 3H8QA 1X9SB 1YF0A 1SJIA 3IAM2 4MK3A 1XOAA 1IYIA 2F51A 4PUFC 1T7PB 3EC3A 1M0UA 4IJIA 4MZCA 2H6XA 4FIWA 4TRXA 4TVEA 3APSA 5FHIA 4KW6A 4MZWA 1YEXA 2FD3A 1OYJA 1LU4A 3FZ5A 2HRKA 4GF0A 2AYTA 5KN2A 3DRNA 3FR6A 3LFLA 3VWUA 1SK2A 1FHEA 1JLWA 1YKAA 1EOGA 2WGRA 3D22A 1X9MB 4PTSA 4BWQA 3NIVA 1K0MA 5ELAA 2OACA 1ILOA 2LRCA 3EINA 2DMLA 4GCIA 4TN8A 4XIHA 1AXDA 4NMUA 1V40A 3IV4A 3F8UA 2ON7A 5G2ZA 3DWVA 3EU4A 4KSOA 1XPVA 4Q5NA 3L9SA 4ML6A 1URMA 3ZIVA 2MMAA 2YWIA 3P90A 4KCEA 3FY7A 5CAXA 3HVSA 4O32A 1NSWA 4CDOA 3APQA 5J9BA 1MDJA 3QOUA 2FUG2 3H79A 1O8WA 1E6BA 2X8HA 3D4MA 3CTGA 4FYCA 2DLXA 3TJBA 5G5FA 1MDKA 4LL4B 6GSXA 2C0DA 4OWYA 4XS4B 5CRHA 2QC7A 3FK8A 4CHSA 3LORA 2E2GA 3HJOA 3MNGA 5HFIA 1X5EA 4IBPA 4NPBA 4EL1A 1Q98A 2HZEB 4MH3A 3ZL5A 4BA7A 1GTUA 4TXOB 2V6KA 1K0NA 2GSRA 4G0IA 2CQ9A 1YKCA 1GLPA 4BVYB 1KEBA 2K8VA 3DGQA 3ERGA 3G9BA 3BD2A 3RAZA 5CP1A 1GUMA 2YZHA 2WB9A 2MMNA 2O8VB 1THXA 1GUHA 4L8EA 5D73A 2LUSA 1WE0A 1F3AA 2PVOC 1OC9A 2B1LA 1XWAA 2ZNMA 5IIZA 4MLYA 3CXGA 2IMDA 1GSYA 3IR4A 4ILFA 1SK0A 4GQFA 2L59A 1I9DA 4ECJA 1TU8A 1KTEA 4YAVA 5J9CA 3CTFA 3FYGA 1K0DA 3J7Yk 2E7PA 1EV4A 4LL1B 1HNCA 4K8MA 4TR0A 4HJ2A 3LSZA 4EXJA 3HXSA 5B6NA 3LXTA 1WJKA 3KM6A 5BMUA 5JWRB 2CA8A 2BTOT 3GA4A 3CSHA 1PL1A 2HSMB 1Z7RA 2CX4A 2KP2A 3A2XA 2RUFA 2OADA 5GAPD 4KUNA 2I1UA 4ECBA 2DIYA 2YP6A 1XIYA 4QQ7A 2GDRA 5B7CA 2WZ9A 3K8NA 5G1KA 5ECNB 17GSA 2LJRA 2JU5A 14GSA 2YN1A 2AJQB 2H66A 3N5OA 1GULA 3ERWA 3HD5A 1U6TA 4HU9A 1GUKA 2HRKB 1ZYQB 3EWLA 2F3MA 1EOHA 2H0HA 1M2AA 3ZZXA 1R5AA 2JZSA 4P3YB 1OE8A 2GQLA 3GV1A 1W4VA 4MJBA 2FHEA 5IMZA 5ECQB 5IQYA 1N8JA 4K7OA 3IA1A 2XPDA 2M72A 4I5QA 4MJCA 4WETA 4I97A 4TR4A 5ENUA 4FYUA 4ACSA 3NOFA 1SJ6A 4D73A 1A0RP 4QL9A 2YPMA 7GSSA 1X9WB 4ZBDA 2CX3A 3KP9A 4JEDA 5IPHA 4L5LA 2HYXA 2G0FA 4DSSA 1TKDB 3LYKA 4PNFA 4ZB6A 3KTLA 4V2LA 1K0CA 3QAGA 4XRDA 4OO4A 5KN0A 3IHQA 3GIXA 1JZOA 1WOUA 3TKSA 1T1VA 3QD9A 3DD3A 3BJ5A 3U6VA 1KNGA 1SYXA 5IM9A 2NVLA 3DEXA 3I9V2 4NWYA 1DE2A 4WF4A 2V41A 4IHUA 3F9UA 4HQZA 2B6MA 5H5SA 1X5DA 1AW9A 4MPGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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