3UAPA

Crystal structure of glutathione transferase (target efi-501774) from methylococcus capsulatus str. bath
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
VMKLYYFPGACSLAPHIVLREAGLDFELENVDLGTKKTGSGADFLQVNPKGYVPALQLDDGQVLTEDQVILQYLADLKPESGLMPPSGTFERYRLLEWLAFISTEIHKTFGPFWNPESPEASKQIALGLLSRRLDYVEDRLEAGGPWLMGDRYSVADAYLSTVLGWCEYLKIDLSKWPRILAYLERNQARPAVQAAMKAEGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Methylococcus Capsulatus
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Methylococcus capsulatus
total genus 72
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3uapA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3uapA01
2C4JA 3ERGA 4IS0A 4ZXGA 3WGDA 4N30A 1SJ6A 2H1AA 2GSSA 4KE3A 1GRXA 4X0XA 3BOAA 2GGTA 2H1GA 4K7OA 2GQMA 2IMDA 3GSTA 2FA8A 4G10A 3C7MA 4WF5A 2FLSA 5IIZA 4N10A 4G0LA 4YQMA 2KP2A 1XWGA 2YV7A 5GZZB 4KSMA 4WF4A 2HZEA 1CQHA 3TDGA 3I6AA 4PQHA 4NWYA 2V1MA 4RQXA 3D0ZA 3IXRA 4DEJA 5JWQB 2HSNB 1Z3EA 1SU9A 1GUKA 3DRNA 3KMNA 1TW9A 3BJ5A 4MPFA 1PQNA 3QPMA 2OADA 2TRXA 1QK8A 4JE1A 3KH9A 3VURA 2ON5A 2PUKC 2VL9A 4E8HA 3UAPA 3F4RA 2QKEA 5FHIA 2FWGA 5HFGA 12GSA 4IJ3A 4MF7A 1OC8A 1G7EA 3HJOA 2OE0A 1SK2A 2PVOC 2X8GA 5G1LA 3UVHA 4L5OA 3EWLA 4K8MA 1A8LA 3MDKA 1FHEA 3GYKA 2V6OA 6GSWA 1BYEA 4MJCA 1WPIA 2QSIA 1R4WA 2DLXA 2GZZA 1TTZA 2JL4A 4LMWA 1KNGA 1VF2A 1OC9B 1USBA 3FW2A 1SL2B 4TR1A 2H70A 4XS4B 2GSRA 3GV1A 1X9SB 4PURA 4MH3A 5AIXA 3W6GA 1OVNA 1XIYA 1GNEA 3GKXA 2CVDA 4DVCA 3EYTA 2JZTA 1YEXA 1JZRA 3M1GA 4ML1A 4PUFC 3GHAA 4MP4A 4TXVA 4OWYA 4BWQA 4LL1B 5EY6A 1JLWA 2YWIA 3ZYWA 4D73A 2HSYA 4MF5A 4MJEA 2LQQA 2OE3A 2H0IA 1FG4A 3TB2A 1BJXA 1THXA 4IELA 4QL9A 4KA0A 2H74A 2YN1A 4J2FA 1ZMAA 4XIHA 2I1UA 3HVVA 4EE0A 3D4TA 3V1WA 3H79A 4GCIA 2VD1A 1PD21 1HNBA 4I5QA 2H76A 4ZBAA 1M2DA 2QGVA 2X99A 1JZOA 1SYXA 1BQ7A 1QXHA 3O6TA 1T00A 2XPDA 3D5JA 2VOCA 4O32A 1K0BA 2OE1A 1PX7A 4BVYA 3KTLA 1SKWB 4GXZA 2K9FA 1TDIA 1U88A 2GDRA 3DKSA 4ID0A 3SBCA 1PKWA 1MTCA 1X0RA 3LFLA 1A0RP 3CMIA 3HYPA 4Q5NA 5HR3A 1FAAA 1SL1B 5HR0A 1KTEA 2PGTA 3ZL5A 3HD5A 3BCKA 3TJBA 2O87A 3VLNA 3H4KA 1Z7RA 3ZMLA 1TK5B 4TXOA 4PX1A 4IW9A 2CX3A 5B6MA 2FA4A 3R2QA 4DSSA 4ECBA 3CXGA 3TKQA 1WP0A 9GSSA 3F8UA 5G5FA 1GULA 2CAIA 4V1Ap 4FYUA 1AAZA 5CP1A 8GSSA 1YEPA 4RI6A 4TRXA 1EV4A 1AW9A 1EP7A 2JU5A 4MCUA 4N11A 1GSEA 1GWCA 3PGTA 4IVFA 3C71A 4XS6A 1EOHA 4USSA 3KD0A 3HXSA 1GP1A 4OO5A 6GSTA 4OFMA 3TJFA 4O92A 1EGRA 2WS2A 4WBRD 2PWJA 2HRAA 2PU9C 4HU9A 3PINA 3HJMA 5FWGA 2LS5A 4XTSA 1ABAA 3RHBA 2BJXA 3QFBC 5CRHA 2R2JA 4TR1B 2NBSA 3DEXA 3G9BA 3GL5A 5IMDA 4NV2A 1TRSA 4MJBA 5INYA 2WGRA 4HU7A 2GT6A 2CVBA 4F0BA 1ML6A 4IP6A 3GTUB 5GSTA 2A4VA 1T4YA 1PX6A 3M9KA 3UOMA 4K0NA 1YY7A 1HYUA 2HE3A 1E6BA 4OMVA 4JR6A 3LEFA 3ZIVA 3O3TA 4EDYA 5DDLA 4D73B 3UBKA 2OA7A 4PTSA 2M72A 5DBQA 2LNTA 1XWBA 1XXUA 3VFIA 2OJLA 2H75A 1LU4A 3F0IA 5HR2A 4ISDA 3LWAA 1YDKA 2B5XA 3F9UA 4I2UA 1K3OA 2C3NA 1K0CA 1A2JA 4I97A 2YWNA 2M46A 2RUFA 2L57A 2YZUA 1A23A 1PN9A 4PNGA 5G5EA 3QAVA 4ILFA 1F2EA 11GSA 1FB6A 3FZ5A 3CYNA 3APQA 3VWUA 4BVYB 3A3TA 3TRQA 3IA1A 4XS1A 3C1SA 3CTFA 2CA8A 4BA7A 3AY8A 1FOVA 3D6IA 4GWRA 3EU4A 3GIXA 1RW1A 4X1UA 1NHYA 2K6VA 5D96A 3UIWA 1EEJA 3IC4A 1GSUA 5ECMB 1WIKA 2YWOA 2AHEA 5HFIA 3L4NA 3M0FA 2GTUA 4GSSA 1YF1A 1NSWA 3LYPA 1YQ1A 5IMZA 4KAEA 4CDOA 3TOTA 1TRVA 2LRCA 3N5OA 3G7YA 2EIRA 4FO5A 2N5BA 5JCWA 1V2AA 4I6XA 1S3CA 4O5RA 4JBBA 3GH9A 4J56E 2LV3A 2H1DA 4DSSB 5ECOB 3LXTA 3GKNA 3UBLA 4KW6A 4H86A 1TK8B 1X5CA 2GQLA 2IMKA 1MDJA 2CT6A 2LRTA 4NHWA 2O89A 1V57A 1EGOA 1XWKA 1O85A 4RI7A 2HYXA 3ZFBA 3F6DA 4CW9A 1R7HA 2NTOA 3GA4A 1VGLA 5CAXA 3HVSA 3GURA 5F8BA 2EC4A 6GSYA 4XRDA 3FYGA 3VI5A 2YNXA 4HS1A 5CNWA 3FRCA 3UMAA 5BMUA 5J4UA 3RAZA 3HKRA 3FZAA 2IMIA 3C8EA 4IJIA 5D73A 1F3BA 2H0HA 3HDCA 1QMVA 4XHMA 2F9SA 1K0AA 4ACSA 1V9WA 5DAKB 2P5RA 3GUSA 2QC7A 2HQTA 4Q5FA 2L6DA 2H73A 2MMZA 5ECLB 2CZ2A 1Z6MA 4KNDA 2PN8A 2H6ZA 5G30A 2L59A 4MZCA 5A4UA 2X8HA 5G31A 4KCAA 3WT1A 1Z6NA 4HOJA 2I81A 1B9YC 3W8SA 2L4QA 4GSNA 1J9BA 2OKAA 2E7PA 4AJ8A 2VCQA 1F3AA 4G19A 5DCGA 3WGEA 4K1FA 4HEA2 1V40A 2ES7A 3FHKA 3IE3A 4L8EA 4L0UA 1ZZYA 2HT9A 2C3QA 2B7KA 2B3SA 4HZ2A 2K18A 2OBIA 4OFTA 1DSBA 2AB6A 2LJRA 2F51A 1K0MA 4WR5A 5C04A 4ZILA 1WOUA 3ZRDA 2F8AA 2DIYA 1OC3A 4NPBA 2O7KA 4FYCA 3FR6A 13GSA 1ZCPA 3I43A 1SD8A 2JADA 2GZPA 3UARA 3KIJA 2H6XA 2L5LA 2ZUPA 2C1YA 3P2AA 1ZL9A 2KOKA 1HNAA 2XBIA 18GSA 4G0KA 3TKSC 4ZB8A 2HLSA 4K6XA 1QGVA 4ZBDA 2WULA 1TRWA 1XVQA 5AN1A 1BX9A 4GLTA 2ZNMA 1W89A 2GZYA 2YANA 5ECIB 4K9ZA 3DVXA 2XBQA 4V2NA 2VIMA 4YQUA 3LGCA 2H6YA 5B8BA 1GSDA 3GN3A 3DMLA 3ZFLA 3H93A 4POKA 3TJJA 4OFNA 5ELAA 2VCZA 4KCEA 1MD3A 3CSJA 5HFKA 1W4VA 2H72A 1O6JA 2TRCP 3VWXA 3WT2A 1TXXA 3WD6A 1QFNA 4QL7A 3P90A 1S3AA 4Q5QA 5A4VA 2IN3A 2REMA 1SD9A 4ML6A 2O8VB 4DSRA 2DJ1A 3LYKA 5D9VA 1PSQA 3QAGA 3GTUA 1AQXA 4IQ1A 17GSA 2IFQB 4YQVA 2CV4A 1AQWA 2WB9A 4IN0A 2L4CA 1XOBA 3GMFA 1B4QA 3IC8A 1AQVA 4POLA 1DBYA 1GUMA 4KDXA 1T8EB 4FIWA 1JHBA 4MZWA 1SK0A 2ALBA 3I69A 1N8JA 4TVEA 3ZTLA 2HRFA 4OO4A 4NXIA 3Q74A 2DBCA 4OCFA 3RBTA 1T4ZA 2HRKB 4ECJA 1GSYA 1VRSD 4NV5A 1V98A 3H1NA 3M3MA 4ECCA 1M0UA 3FEUA 1EWXA 3A2VA 1GTBA 2P31A 4TR3A 1M9AA 2V32A 1Y6EA 4MDCA 3BBYA 2YJ7A 1ERVA 1I9DA 19GSA 6GSUA 3IBHA 1O8WA 1GSQA 4RQRA 4X43A 2V6KA 2C0FA 5C00A 3QOUA 1K3YA 1ON4A 5CREA 1A8YA 2VCXA 1OAZA 4BL7A 2G2QA 1JLVA 2LTKA 2LEGA 1K3LA 2Z9SA 5ECKB 3TKRA 2GSQA 1S3DA 3TKSE 4NHZA 2VD0A 1OE8A 5ECPB 10GSA 2X64A 1PMTA 2YP6A 1AIUA 5E4WA 1Y25A 2VLUA 1ERWA 4TKYA 3EC3A 1YKCA 4PGTA 1J0FA 3N9JA 2CX4A 1M2BA 1Z5YE 3R3EA 3Q6OA 5DALB 3P7XA 5ENUA 3TRPA 1SKRB 3F6FA 3KTBA 3O76A 3KCMA 2AV4A 1OE7A 3EURA 3IK9A 3EINA 1TU8A 3L9UA 2EIOA 3HY2A 5JCUA 5D9TA 4WXTA 1B8XA 3OR5A 3TJKA 4ZIJA 4J57E 1BAYA 4MPGA 3VPTA 2M80A 4JR4A 2C0EA 1XW9A 2E2GA 3HA9A 2LJAA 4KDUA 2E2MA 2R4VA 5JCGA 2DSAA 2PVQA 3ZIJA 1Q98A 3IOSA 2KHPA 2K8VA 5DAKA 2HNLA 4KGIA 1BG5A 4EDZA 3F3RA 4N0ZA 4TR0A 2FWHA 3RPNA 1YJ6A 1YF0A 1DUGA 5H5RA 3ZREA 1AXDA 3DVWA 1GSFA 2R3XA 1Q4JA 5DVBA 3GRXA 2JZSA 1Z7PA 2DJ3A 5JWRB 2KUCA 5IOWA 6GSSA 2GVPA 3J7Yk 2FUG2 4L0WA 3GKKA 1M9BA 5F05A 1DE1A 2YJHA 4EVMA 1VF3A 2C3TA 1YZXA 4MK3A 3KM6A 3IV4A 3PPUA 2FCHA 4I8BA 4CHSA 3IR4A 1U87A 2B5EA 2H71A 3UEMA 2CVKA 2HSMB 1NM3A 4GSTA 3VPQA 1TI1A 1WMJA 3DIEA 20GSA 2JACA 2FY6A 3H8QA 4TW5A 2I4AA 1SK1A 5CRGA 2A2SA 5F07A 3A5WA 4WBJA 3U5RE 1ILOA 3S9FA 4LA1A 4EUYA 1RK4A 5G2ZA 2I3YA 1ERUA 2VL3A 1G6YA 4E8EA 3C73A 3QDNA 4V2LA 1X9MB 1UVZA 2VM1A 3MWHA 3DXBA 1JZWA 6GSXA 2XHFA 4MJAA 3LSZA 4F03A 1EZKA 2DIZA 3E0UA 4LLRA 4BL7B 3C1RA 4EL1A 5COHA 6GSVA 3GL3A 1OKTA 2NVLA 3LJRA 4OCEA 2P5QA 5H5SA 1PKZA 4PXOA 1JFUA 2KLXA 4BWSA 3FR9A 1XPVA 3GKMA 2PMTA 5ECRB 2LNSA 4JU5A 1NW2A 3QFAC 3NIVA 1R5PA 2JSZA 3FZ9A 1ZOFA 4K7IA 3L9VA 1PGTA 3ME8A 4PQIA 3IRAA 5JWOB 2IFQA 4OD7A 3TOUA 2UZ8A 3ME7A 3VI7A 2HXKA 1TU7A 1GL8A 1HNCA 1EP8A 5D93A 5IMFA 4TOPA 1H75A 3HJPA 1F9MA 2VAFA 5LNKe 3APSA 4EXJA 4XRAA 3LQ7A 5D9WA 2VUPA 4YH2A 1MD4A 1EOGA 4HQSA 5HQPA 4BPYA 2CZ3A 5D8IA 4F9ZA 5KN2A 4ZL9A 1OKDA 2HFDA 2HRKA 4YAPA 1XWCA 1T1VA 1XZOA 2FWEA 4GRFA 1A0FA 5B7CA 3WGXA 1MDIA 4N0VA 3U6VA 3US3A 2FNOA 1TI3A 5J5NA 1GLQA 3GX0A 4ZL7A 1ERTA 1R26A 4FH8A 3GH6A 5KEJA 3ZMKA 1M99A 2RIIA 3MAKA 2MYGA 2C80A 2IJYA 3E3EA 3M8NA 2GT5A 4V1Ag 3M9JA 3DYRA 4ZB6A 3FR3A 3PR8A 4GQCA 5B6NA 4F82A 3L9SA 4KB3A 4FYBA 4BVXA 4HZ4A 4AF2A 3HHVA 2J9HA 2H1BA 3BCIA 4YAVA 1M7TA 2CQ9A 1CQGA 2HI7A 1AUCA 2ON7A 4HQZA 1WE0A 1T3BA 1ZYQB 2AAWA 2YOIA 5KN3A 2J23A 2MBSA 2HZFA 2N5FA 2LUSA 4PUAA 1AC1A 1B9XC 5DALA 3KZQA 1ZGNA 3HZ4A 2VM2A 1MDKA 3DWVA 3VWVA 1A24A 3G7IA 2X8CA 1WWJA 1MEKA 4JEDA 5B8AA 4ECIA 4FQUA 3VWWA 3NOFA 5A5KA 1E2YA 2WFCA 1GLPA 3L0HA 4KUNA 2VO4A 1GTAA 2R37A 4NMUA 3FK8A 4IP1A 3TCOA 2OBKA 4ZB9A 1QQ2A 1H4OA 4V2MA 1IYIA 4MMMA 2AJQB 5AIVA 2DMMA 3JCML 1UC7A 3NZNA 3UVTA 3GNJA 1V58A 1UA5A 4Q5RA 3E9JB 2IMEA 4I2TA 2C8UA 3CTGA 2HSHA 4EO3A 5L71A 5KN0A 3QD9A 4KH7A 2VCWA 4LMVA 3KJYA 2AUVA 5DQSA 5IO2A 2XC2A 1R5AA 4KX4A 4WR4A 2MZCA 1KEBA 2YWMA 4GTUA 2R6KA 1LBKA 1THOA 3A2XA 1XVWA 2YZHA 3ED3A 4XCSA 2DMLA 14GSA 3QR6A 2KP1A 3UJ1A 4P3YB 2A2RA 3ERFA 2HRNA 1WJKA 2FGXA 3CBUA 5AISA 3ZVJA 3KH7A 4MZBA 5HR1A 4ZL8A 2IWTA 2N5AA 5CRWA 2WDUA 2HSMA 2GQKA 4HUAA 3W8JA 3ERWA 2YCDA 2H66A 3QAWA 2VLVA 2R5GA 5ID2A 4TN8A 3FZ4A 3LG6A 3J7Yb 4IQAA 1F37A 1KBNA 2O85A 5GSSA 1GTUA 5ECNB 2ZCTA 3EMPA 1EV9A 1SYRA 4GQFA 1PL1A 3BD2A 4G0IA 5IO0A 3FY7A 3IPZA 4HJ2A 4IKHA 4EC0A 2WCIA 2MBTA 2FD3A 5IOXA 1U3AA 3LXZA 5J3RA 4DSQA 1ZYEA 1UN2A 4EF0A 5ECHB 3P8WA 3APOA 1WRYA 2E0QA 5G1KA 4BVXB 1O81A 2F3MA 3KMOA 4KSOA 5D9XA 1PRXA 1GTIA 4G9HA 2GLRA 1BEDA 3ZLPA 2NPBA 3HVXA 2B5YA 5CRDA 4ZBBA 1FVJA 1XFLA 1A2LA 4JZQA 1GSSA 1N2AA 3D22A 2VCVA 4RUVA 1LJRA 4POMA 3D21A 1PA3A 2DJJA 5DCHA 2HZEB 2GS3A 4F2IA 2B7JA 1SJIA 5DJMA 4AJ6A 3VK9A 2MMOA 2H30A 2WRTA 3IAM2 2L5OA 3GFKA 1URMA 4L5LA 3HZ8A 3CRUA 2PBJA 5ABRA 2H0GA 5F0GA 2LQOA 1FO5A 2VL2A 3RPPA 3UL3A 5EPFA 3SWLA 5IMAA 2DJ2A 3TUEA 2PERA 2BTOT 3I9V2 4IHUA 1XW6A 4K7NA 2PPTA 4POBA 4HDEA 4MLYA 1SL0B 2WJUA 1SKSB 2H8LA 1A2MA 3LORA 3TRXA 3MNGA 3EU3A 3CRTA 1J08A 2LKUA 4LL4B 4K2DA 2V2GA 5CYYA 1PL2A 3TKPA 5J9CA 1IYHA 1QUWA 4EKZA 3CSHA 3KGKA 4KDYA 3IK7A 3QCPA 3CSIA 3TGZA 5ECQB 4WETA 3F4SA 1U3IA 2I9HA 5F06A 2BMXA 2DJKA 1X5EA 3TKSA 1TK0B 1FW1A 1GUHA 4O7HA 5EL8A 4ULXA 2TIRA 2K8SA 3DGQA 1B48A 5IPHA 22GSA 2RM6A 3HCZA 16GSA 3KXOA 5ID2B 2C0DA 2B6MA 1TOFA 4JRRA 4MA9A 1NHOA 5ELGA 5J41A 1XOAA 1SENA 4MF6A 5FT3A 4Z7XA 1JZDA 2DJ0A 5IM9A 4HJMA 2MMAA 1XCCA 1XWAA 1TJDA 4IGJA 2FHEA 5DJLA 2DC5A 4WEYA 5IPGA 1G6WA 5CO3A 2D2ZA 2P0GA 3D4MA 1TKDB 2WZ9A 1K0DA 5IMVA 5LCZA 2G0FA 5GAPD 3F63A 1O73A 1DE2A 3TJGA 1TP9A 2RUEA 1TRUA 4IBPA 2AYTA 3ZITA 2YPMA 2C0GA 3ZZXA 1VF4A 2RLIA 1C72A 1X9WB 2NDOA 1G7OA 3WYWA 4PQ1A 2B1KA 1VF1A 4QQ7A 5J9BA 2JZRA 2V41A 1GH2A 1ACVA 3EVIA 2LRNA 1O8XA 3QMXA 1U6TA 1Z9HA 2IIYA 1HD2A 1OC9A 2L6CA 2MMNA 2JSYA 3EMXA 1B4PA 1T7PB 4MH2A 2OACA 4TXOB 4XS4A 1K0NA 4GF0A 1XW5A 4HI7A 3IAS2 5E59A 2LJKA 4WKWA 2VLTA 2YV9A 2EIQA 5IQYA 1M2AA 3K8NA 1X5DA 2VCTA 3KEBA 2RM5A 5GAND 1I5GA 5H5QA 1EEMA 3IHQA 2IL3A 5AGYA 1YKAA 4PNFA 1HQOA 1G0TA 4MABA 1FVKA 3GSSA 4K0GA 3Q19A 2H01A 2FWFA 3EE2A 2LSTA 3RDWA 4AJ7A 3L78A 1SJZA 2IPAA 4F0CA 1FB0A 1XBSA 3A2WA 5DQYA 3F4TA 1ST9A 3DD3A 3Q18A 3MSZA 2XPEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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