3WD6A

Crystal structure of bombyx mori omega-class glutathione transferase in complex with gsh
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
NINFNTKHLRKGDPLPPFNGKLRVYNMRYCPYAQRTILALNAKQIDYEVVNIDLIDKPEWLTTKSAFAKVPAIEIAEDVTIYESLVTVEYLDEVYPKRPLLPQDPLKKALDKIIVEASAPIQSLFIKILKFSDTVNEEHVAAYHKALDFIQEQLKNRGTVFLDGSEPGYADYMIWPWFERLRAFAHDERVRLEPSKYSLLLEYIDNMLKDSAVSQYLIPLEILAKFHEAYTKKERPNYELLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Omega-class glutathione S-transferase
publication title Three-dimensional structure of a Bombyx mori Omega-class glutathione transferase.
pubmed doi rcsb
source organism Bombyx mori
total genus 94
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3wd6A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wd6A01
3I69A 3AY8A 3BOAA 2H8LA 4WF4A 5A4VA 1R5PA 3F3RA 3F6DA 1XW5A 1X9MB 2YNXA 2E7PA 3LG6A 2MMZA 3DEXA 4MCUA 4KAEA 4IS0A 3GKNA 5EPFA 2CV4A 2P5QA 3SBCA 2BJXA 2DIYA 3L9UA 4BL7B 4HU7A 2ALBA 3IR4A 3DGQA 1XIYA 3WT2A 4X43A 2UZ8A 2KLXA 5ECSA 1Y25A 1PSQA 5G30A 4I8BA 1Z9HA 2IN3A 2PVQA 5JCGA 3HJPA 1QGVA 2VD0A 4OCEA 1OKDA 3HXSA 4IQ1A 4G10A 1WWJA 1N2AA 4K6XA 5COHA 3WGXA 1LBKA 4EE0A 4TVEA 1SKWB 2CX4A 1GL8A 3G7IA 1PX7A 1YDKA 4YH2A 3ZZXA 3QMXA 1JHBA 1XPVA 1JZRA 2CZ3A 4GQCA 4ZB9A 3L4NA 5INYA 1TU8A 1ZOFA 5B8AA 1ZCPA 1Z6NA 2N5AA 3IC4A 4EO3A 4ZL8A 2GTUA 1W89A 5IO2A 4KCEA 1ML6A 2C0EA 3F0IA 4KH7A 3EE2A 2QKEA 2JADA 3F4RA 6GSYA 1LJRA 4HI7A 1YZXA 4HUAA 1K0CA 2G0FA 3TKQA 4POLA 1O81A 1EWXA 4NPBA 1VRSD 3UVTA 2B5EA 2L6DA 1ZYEA 4ZIJA 3HJOA 1BJXA 2HYXA 3FY7A 2B3SA 2G2QA 3M9KA 5J3RA 2R3XA 1OAZA 4GF0A 2HRKA 1M2DA 1R4WA 1PQNA 2GT5A 3P7XA 3ZVJA 2H01A 1J0FA 4XS4A 4JR4A 5F07A 3D22A 5FT3A 4EUYA 1H75A 3KM6A 1FB0A 1FO5A 1ERUA 5F0GA 1T7PB 2CX3A 1GNWA 4ECIA 2FD3A 3F3QA 2LKUA 5J41A 5J9BA 4ML1A 1A8LA 4PUFC 3IE3A 1S3CA 1G0TA 2A4VA 3TRPA 4QL9A 3C71A 1XW9A 1URMA 2AHEA 2LS5A 2YP6A 1A2JA 1EZKA 4V1Ag 4F03A 4GQFA 2C80A 4MZBA 2RUEA 1TTZA 4WBJA 4KX4A 4MJAA 4GRFA 3QFBC 1MEKA 3ZITA 3DVXA 1S3DA 1K3OA 4HZ4A 2OBKA 3KD0A 1EV4A 2B7KA 2NBSA 3GFKA 1JFUA 3GHAA 3NIVA 5HFIA 3F8UA 2KOKA 2HZEB 2OE1A 3FZ4A 1VF1A 3GX8A 3E3EA 3IK7A 2KP1A 3ED3A 1ZZYA 4WBRD 3HKRA 3VWXA 1XWKA 3M0FA 2V6OA 1TKDB 2YWIA 3HVXA 2K8SA 2IFQA 2I4AA 1XVWA 4BPYA 2HSYA 2RIIA 3GTUB 2IMDA 2RLIA 2GS3A 1EP8A 3FZ5A 2HNLA 4F2IA 1FB6A 1ZMAA 3GX0A 1OVNA 2B1KA 4CHSA 2IJYA 5G1LA 4JZQA 2WJUA 3GKKA 3UEMA 1ST9A 2I3YA 3TKSE 4YQMA 4KDXA 1SJ6A 2LJRA 2OE3A 2YWMA 3QD9A 4F82A 4TRXA 1HQOA 2OJLA 5HR2A 3O76A 4F0BA 4GXZA 1V40A 1PKWA 5IM9A 2L5LA 1I9DA 2P0GA 4MJEA 4WKWA 1F6MC 3UBKA 4KNDA 2HRNA 1KEBA 2N5BA 3O6TA 3FRCA 2WFCA 2YN1A 5CYYA 2H74A 2PPTA 3TOTA 2F3MA 5IMZA 5DALA 4MJCA 2HXKA 2PGTA 5AN1A 4E8EA 3RAZA 3IBHA 3R2QA 5ECOB 1U3IA 1A2LA 4KUNA 3ME8A 2XBQA 5G2ZA 5HR0A 3P90A 3E9JB 5F8BA 4ISDA 3GH6A 4ZB6A 2ON5A 2DLXA 2VLUA 3EYTA 1NSWA 4DVCA 1FVJA 4HQSA 4X0XA 2HRAA 3ZYWA 2PBJA 4K8MA 5CAXA 1OE7A 1AQWA 2F9SA 1ACVA 5ELGA 3M1GA 4ZB8A 1AW9A 1MDIA 3EC3A 1SENA 2O7KA 4BVXA 3RPNA 2CT6A 4JE1A 1B8XA 4PURA 1SK0A 1XOBA 3IAS2 1R5AA 2DJ1A 2C0GA 4J56E 3F9UA 2GZZA 3Q19A 3LXZA 2HZFA 2PUKC 2CA8A 2E0QA 1USBA 3QAWA 4WR4A 1SK1A 1U3AA 4PX1A 3GH9A 3TRXA 3N9JA 1TK0B 1QUWA 1FG4A 2AAWA 2LQQA 5D96A 3RHBA 3HD5A 4IN0A 3NOFA 2I1UA 1A23A 2GQLA 1GRXA 3GURA 1AUCA 1NHYA 5IOWA 1ABAA 4AJ8A 3TKPA 1Q4JA 2GSQA 1BG5A 4NHWA 3HVSA 2K18A 1SKSB 5A5KA 5B8BA 2L4QA 2XPDA 4F9ZA 2C3TA 3GV1A 3BCIA 3WYWA 5IPHA 2HSMB 1F3BA 2REMA 3GSTA 4TXOB 1G6WA 1YKAA 2EIRA 3G7JA 4HDEA 4LL4B 3APQA 1A24A 1OE8A 2FLSA 2LSTA 4K1FA 3PGTA 1WOUA 5JCWA 1YQ1A 3HA9A 3S9FA 1JLVA 2H71A 3QFAC 4V2LA 3CTGA 1AXDA 2LJKA 2C3NA 1G7OA 2C0FA 3I9V2 3UARA 3DD3A 4LMVA 2MBSA 1A0RP 1GH2A 5KN0A 1DE1A 1X0RA 1X5CA 2JZRA 3ZMKA 3HZ8A 2A2SA 4TN8A 3H93A 1ERTA 3MDKA 1OC9B 2F51A 2R6KA 3ZFBA 1XBSA 4DEJA 4V1Ap 2DJ0A 4IHUA 5CP1A 2R4VA 4GSTA 2VLVA 4OWYA 1GSSA 4MF7A 1U87A 1EEMA 5DJLA 2KP2A 3HVVA 1JZOA 1WE0A 2HI7A 1FAAA 4MF5A 1I5GA 4I6XA 2CQ9A 3D0ZA 3KCMA 1PL1A 2LQOA 1THXA 3TUEA 1GNEA 1YEXA 4BWSA 2TIRA 4ILFA 1MDKA 2AUVA 4FIWA 11GSA 1GTUA 3DIEA 1K0NA 2H73A 2IMFA 2IFQB 1XWCA 4MLYA 2V2GA 2GVPA 2GZYA 3D21A 4LLRA 3Q74A 1CQHA 3A3TA 3LQ7A 3KEBA 3C7MA 2DMLA 5B6NA 4L5OA 3Q18A 4JBBA 4EL1A 1EGOA 4OD7A 5ELAA 3GL3A 4JU5A 4HJMA 1PGTA 2GSRA 2HQTA 3MNGA 3DMLA 2ZNMA 4MJBA 5DAKB 3C1RA 2WB9A 3OR5A 1TRSA 2QSIA 4V2MA 4LA1A 2O89A 2TRCP 5JWOB 2JL4A 3MAKA 4G0LA 3A2XA 3TCOA 2PWJA 1IYIA 1PL2A 2FA4A 4EVMA 4MPGA 2WZ9A 5CRWA 2NVLA 1K3LA 1YEPA 5ID2A 4PUAA 5CRDA 3H79A 1SU9A 1GSUA 3MWHA 4DSSA 4MDCA 1XVQA 1O6JA 4MMMA 5F06A 2LRTA 1YY7A 2IMKA 3E0UA 3APSA 4O92A 2LNTA 2WDUA 2XHFA 3EVIA 4Q5NA 3ZVJD 2FY6A 1NHOA 2VAFA 2OA7A 5DJMA 5E4WA 2M46A 2GSTA 4G0KA 1WJKA 2A2RA 2XPEA 3VLNA 5FWGA 4IJIA 5CREA 1MD4A 3F4TA 4K7OA 4GSSA 4ZL7A 3P8WA 1F37A 3L78A 1GP1A 1SJZA 4JEDA 3TJBA 3A2VA 12GSA 4XHMA 4TR3A 5CRGA 4IELA 3C8EA 1EEJA 1WRYA 4TR1A 4BVXB 3ME7A 4FYUA 2JZTA 3CSJA 2CZ2A 4MABA 3K8NA 16GSA 4OMVA 2ES7A 1TI3A 2CVKA 2AJQB 3GN3A 5BMUA 4YQVA 2PU9C 4KW6A 3CYNA 4L0UA 3UOMA 3GUSA 4NAXA 4DSRA 1T4YA 2YWOA 2LNSA 7GSSA 3TJFA 4E8HA 5J9CA 3ZIJA 2R37A 2FWGA 1EV9A 4N0ZA 4ZXGA 2YWNA 1NW2A 2GQMA 4N11A 4K0NA 1BX9A 4MP4A 1THOA 2FCHA 2HSHA 2ON7A 2FWHA 3HHVA 5AIXA 3BJ5A 1RK4A 3ERGA 3APOA 2VCWA 4WF5A 1Z3EA 2FGXA 3ZREA 4G9HA 1ILOA 1GULA 4ZBAA 1V58A 2P5RA 3Q6OA 2VO4A 5IO0A 1K3YA 5DVBA 2GZPA 1O8WA 1GUKA 3H8QA 2XBIA 4PNGA 2VM1A 2K8VA 2X99A 2H1DA 4AJ7A 2F8FA 3CRUA 2VIMA 3FZ9A 2X8CA 2ZUPA 2IWTA 1M7TA 2OE0A 1T4ZA 5IMDA 1E2YA 4KCAA 4KB3A 1Z7PA 1QXHA 3ZL5A 3UMAA 1K0OA 4BVYA 1EP7A 5G5FA 4GWRA 5JWQB 3R3EA 4N0VA 2FWFA 4G19A 1AQVA 3LSZA 2B5XA 3D5JA 5KN1A 5ENUA 3GKMA 1YKCA 1VGLA 3LYKA 4K7IA 5ECQB 2YOIA 2QGVA 4EF0A 2AYTA 3M9JA 5IOXA 3TB2A 3KP8A 5AIVA 1EOGA 1IYHA 3M3MA 2L6CA 3EURA 5LCZA 4Q5QA 4BL7A 1XZOA 3WD6A 3L9VA 2VCXA 2LUSA 1T1VA 3UVHA 1WP0A 4K2DA 4PNFA 6GSVA 3WGDA 4NV2A 2C3QA 1M99A 5ECRB 10GSA 1AIUA 2OADA 2MMAA 3FYGA 5HQPA 1B9XC 1UA5A 2WGRA 4MZWA 2B7JA 3DVWA 1GTIA 1TK5B 2PVOC 2YJHA 2CAIA 3QAVA 3UAPA 3JCML 4USSA 6GSSA 4WXTA 3VURA 4I97A 3QDNA 4CW9A 1TOFA 2K9FA 3LEFA 3FHKA 1X9SB 1SYRA 2VL2A 4HEA2 4EC0A 3H4KA 4PGTA 3QOUA 6GSXA 2JZSA 1B4QA 5ECPB 2H30A 2LRCA 1XWBA 4NHZA 1DSBA 3CBUA 3ISOA 2YV9A 2VUPA 5ECNB 1YF0A 3GYKA 1X5DA 3TKSA 3QR6A 3GIXA 4NV5A 3D4MA 1DE2A 2F8AA 4KDYA 2J23A 2YZHA 3HYPA 3ZFLA 2EIQA 2HSNB 2PMTA 1GLPA 1TJDA 2VD1A 5HFKA 2VL2C 1B9YC 4MH2A 1GWCA 4IGJA 2AV4A 2R5GA 3KJYA 1H4OA 3FK8A 1GLQA 1UN2A 1VF3A 4MPFA 3KH9A 2MMNA 5B6MA 4TXVA 4K7NA 1T8EB 5GAPD 2V32A 3GA4A 3TKSC 3LORA 2IMIA 5H5SA 1K0MA 4EKZA 4G0IA 3EMXA 2EC4A 4IQAA 1SL0B 1FHEA 4ECBA 4D73A 2LEGA 1TU7A 3GNJA 4XIHA 2VCTA 4GTUA 5EL8A 3CMIA 1GSFA 3VI5A 1SK2A 2H6ZA 4TR4A 2AB6A 1GUMA 3VWVA 2HRKB 2VL3A 1PD21 1M2BA 4J57E 3DXBA 1Q98A 3U5RE 2VCQA 4XS4B 4IVFA 3KZQA 4RQXA 5JWRB 2NTOA 2HZEA 5HR3A 2VCVA 5IMAA 3FR9A 3LXTA 1OC8A 4EXJA 3LFLA 5JCUA 5B7CA 1QMVA 2HLSA 3WT1A 4Q5RA 1GSQA 4OCFA 2VM2A 5A4WA 2DIZA 1WMJA 1T00A 2YZUA 1OYJA 3ERFA 2P31A 5ABRA 4IBPA 3PINA 5D9VA 3GTUA 3HZ4A 2O8VB 5CNWA 1T3BA 5C04A 2HFDA 4XRDA 3TGZA 2DJJA 1AQXA 2OACA 3RBTA 1PX6A 3U6VA 1OKTA 5G5EA 2WRTA 5CRHA 3DYRA 4O5RA 1WPIA 3IK9A 5GSTA 3QPMA 4KA0A 3MSZA 4ZL9A 4KGIA 1QFNA 4HJ2A 3ERWA 1KBNA 2H1GA 3LWAA 4MF6A 3TJJA 1ERWA 5IMCA 5ECIB 2L59A 3M8NA 3C73A 2TRXA 3ZMLA 5IIZA 2H0IA 1VF4A 22GSA 4LL1B 1F2EA 1R7HA 5J4UA 2E2MA 3TKRA 1Z5YE 1AC1A 2H6YA 5H5RA 1UVZA 2KUCA 1F3AA 1TW9A 1CQGA 1BYEA 3HCZA 2PERA 3FZAA 3VI7A 1MTCA 2LJAA 4ECJA 3EINA 2DMMA 2FNOA 5AGYA 5J5NA 1C72A 1N8JA 2JU5A 1PN9A 3EMPA 5IMVA 3LYPA 2B5YA 4MZCA 2V41A 4FH8A 2GT6A 1UC7A 2XC2A 3FR3A 5KN3A 3KTLA 3LGCA 19GSA 1YF1A 1BAYA 2H72A 3UL3A 4POBA 4ML6A 1NM3A 3DWVA 1TRVA 5ECLB 3IV4A 2LTKA 1BQ7A 2MYGA 3N5OA 5LD0A 1MDJA 5DALB 5D8IA 2MBTA 4ID0A 2LV3A 2H1AA 2M80A 1GUHA 3KMOA 3VFIA 4PXOA 5ECHB 3CTFA 1GTBA 2L5OA 2CAQA 8GSSA 1M2AA 3CSIA 2X8GA 2YJ7A 5DDLA 3A5WA 2WS2A 4O32A 3GKXA 5IQYA 3BD2A 1B4PA 3GSSA 1XOAA 2HT9A 3V1WA 4RI7A 14GSA 3GL5A 2C8UA 3UJ1A 4MK3A 2Z9SA 4XS6A 2WCIA 2MMOA 4IJ3A 1OC3A 4NMUA 17GSA 1AAZA 1A8YA 2O85A 3NZNA 4HOJA 5DCHA 5A4UA 1GSEA 4IKHA 4P3YB 4L5LA 1U6TA 1G6YA 1VF2A 2DJKA 2FWEA 3TDGA 4DSQA 1PKZA 3W8JA 2X8HA 4BA7A 4Q5FA 4ECCA 2YCDA 4H86A 4I5QA 1V2AA 1MD3A 3RDWA 4EDYA 3KP9A 3IOSA 2HE3A 1DBYA 4FYBA 2HSMA 4TXOA 4XRAA 1TP9A 1TK8B 1XWAA 5FHIA 4POMA 3IC8A 3L0HA 4XS1A 2GQKA 2DBCA 4KSOA 1M9AA 4V2NA 4QQ7A 3GRXA 3I43A 3HJMA 4MA9A 2YANA 1YJ6A 1JZWA 2OBIA 2CVDA 2VCZA 2H19A 3UBLA 2JACA 1K0DA 1R26A 3KMNA 2YV7A 2H66A 4CDOA 4EDZA 2H70A 4TR0A 9GSSA 1RQMA 4D73B 1M0UA 1XW6A 1ERVA 1OC9A 13GSA 3QAGA 4I2TA 4JR6A 3I6AA 1O73A 4AF2A 3F63A 1J9BA 3KH7A 4PTSA 3TOUA 4L0WA 3CSHA 4KSMA 1EOHA 4TKYA 3ZIVA 3PPUA 1SD8A 3TRQA 4L8EA 1SJIA 1PA3A 5HR1A 4K0GA 4RI6A 2FA8A 2PN8A 3ZRDA 4HU9A 2EIOA 2CVBA 4BWQA 2V1MA 3J7Yk 5DBQA 1E6BA 1A2MA 3W8SA 5GAND 5D9WA 5KEJA 2DC5A 3CXGA 2BTOT 1XFLA 2LRNA 3DKSA 1TRWA 4KDUA 4K9ZA 4F0CA 1GTAA 2FUG2 3H1NA 1SL1B 1O8XA 5L71A 2V6KA 4YAVA 2L57A 1HNAA 2VLTA 1FW1A 4ZBBA 1HNBA 3IXRA 3IAM2 3J7Yb 1V57A 2DSAA 1JZDA 1SL2B 1ON4A 5CO3A 4GCIA 4I2UA 5DAKA 5DCGA 4QL7A 2IMEA 2MZCA 3F4SA 3C1SA 4PQHA 1A0FA 3O3TA 1HYUA 5EY6A 4HQZA 3KIJA 2H0GA 4XCSA 3IHQA 1DUGA 6GSTA 2RM5A 3W6GA 2DJ3A 1O7UA 1XCCA 4N30A 1M9BA 2H6XA 4OO5A 1WIKA 5D73A 3L9SA 3EU3A 5KN2A 18GSA 3UIWA 1FOVA 2IIYA 1TDIA 4JRRA 3IDVA 3KGKA 4NXIA 4FO5A 1RW1A 3DRNA 4IP1A 5HFGA 5D9TA 5AISA 5F05A 3WGEA 1SKRB 1ZL9A 1TRUA 4PQ1A 4ZILA 1J08A 1GSYA 2JSYA 2QC7A 1LU4A 3KTBA 2M72A 2DJ2A 2IL3A 2I81A 5G1KA 2JSZA 4NWYA 5H5QA 3VK9A 4RQRA 3EU4A 2WULA 3IRAA 4WETA 5G31A 5ID2B 2H1BA 2YPMA 5C00A 4FQUA 4ACSA 4DSSB 4YQUA 3EWLA 1GSDA 3US3A 4XTSA 3QCPA 3FR6A 2O87A 4PQIA 2BMXA 1S3AA 2HRFA 4OFTA 4HZ2A 5D9XA 3D4TA 3RHCA 5IMFA 3VWUA 3A2WA 3HDCA 2IPAA 1B48A 1K0BA 1KNGA 2H76A 1U88A 1PRXA 4X1UA 3KXOA 5ECMB 4IP6A 1SYXA 6GSUA 5GZZB 4MH3A 1EGRA 3D6IA 3G9BA 1Y6EA 1QQ2A 1F9MA 2C1YA 1SD9A 5LNKe 4GSNA 1X5EA 3P2AA 3FKFA 4AJ6A 4TR1B 5DQSA 2FHEA 2GSSA 3SWLA 3ZTLA 1Z7RA 4HS1A 4TOPA 3PH9A 4IW9A 4FYCA 4KE3A 3FW2A 3IPZA 2C4JA 4ULXA 4AGSA 3VPTA 2D2ZA 1O85A 4OO4A 2N5FA 1TI1A 3BCKA 2RM6A 2NPBA 2VOCA 3GMFA 4Z7XA 1HNCA 2I9HA 1K0AA 3TJKA 4O7HA 1XWGA 4G2EA 4WEYA 1PMTA 20GSA 5EVOA 3IA1A 2B6MA 6GSWA 3HY2A 5DQYA 2L4CA 1XXUA 2X64A 2C0DA 2E2GA 2ZCTA 2B1LA 3BBYA 3PR8A 2GLRA 5IPGA 4LMWA 4KF9A 4ZBDA 3VWWA 3F6FA 4J2FA 1FVKA 2R2JA 1JLWA 2RUFA 1Z6MA 1TXXA 4N10A 5D93A 3RPPA 1ZGNA 2VL9A 1W4VA 2NDOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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