4BL7A

Crystal structure of the aimp3-mrs n-terminal domain complex in different space group
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
MRLFVSDGVPGCLPVLAAAGRARGRAEVLISTVGPEDCVVPFLTRPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEATELQPALSAALYYLVVQGKKGEDVLGSVRRALTHIDHSLSRQNCPFLAGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELSALHSWFQTLSTQEPCQRAAETVLKQQGVLALRPYLQKQPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Aimp3-Mrs N-Terminal Domain Complex in Different Space Group
rcsb
molecule keywords METHIONINE--TRNA LIGASE, CYTOPLASMIC
molecule tags Translation
source organism Homo sapiens
total genus 57
structure length 208
sequence length 208
ec nomenclature ec 6.1.1.10: Methionine--tRNA ligase.
pdb deposition date 2013-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF18485 GST_N_5 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4bl7A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bl7A01
2ZNMA 2DJ2A 4TR1B 3M9JA 3KGKA 2LEGA 1XWCA 2H8LA 3IE3A 1AUCA 1N8JA 1GUKA 1EZKA 3D21A 5E59A 4ZBDA 4G10A 5DVBA 5CRGA 4KSMA 1SJIA 4MK3A 1SK0A 5CREA 3DVWA 4IP1A 1SJZA 2IPAA 1EEJA 3L78A 4QL9A 3GL3A 2VD0A 2DC5A 2FA8A 1ON4A 3F63A 4ZL9A 4DSSB 4TOPA 3KP9A 2WB9A 2CZ3A 4F0BA 3NOFA 2A2RA 3C8EA 1KNGA 2V6KA 2F8AA 1FG4A 3KMOA 4D73A 4IVFA 3QAWA 2AJQB 1CQGA 1WOUA 3LEFA 2I81A 2HE3A 1Z5YE 3BOAA 3A2VA 1FVJA 2R2JA 1U88A 2LSTA 1C72A 4EE0A 2C0EA 3L9VA 5H5SA 5J3RA 2YWMA 4V2LA 4O7HA 1PX7A 3ZFLA 5B8AA 2GLRA 2B7JA 2HRKB 4KNDA 3KMNA 4EL1A 1WP0A 3TRPA 4NAXA 1E2YA 3APQA 1TU8A 1T7PB 1XFLA 1SKSB 3TOUA 2N5FA 1HNBA 1WJKA 4BVXB 2YWOA 4I2TA 3BBYA 2R6KA 5ELGA 4J56E 3GH9A 3UEMA 1A0FA 1AAZA 5HFGA 3HJMA 2OBKA 2MYGA 5DJLA 4AJ6A 2OJLA 5JCUA 4TR3A 2FCHA 4K0GA 1AC1A 3VI5A 1SL2B 2PUKC 3UBLA 5A4WA 1M9AA 2LRNA 4MLYA 2PU9C 3ZFBA 5IQYA 3KEBA 3HXSA 3ZL5A 2GQKA 3IA1A 1AQXA 4MF5A 4BL7A 2A4VA 4PTSA 1G7OA 4WR4A 2E0QA 2H74A 2X64A 2MMZA 4JR6A 2FWHA 1F37A 2EIRA 2IMKA 2PWJA 4LL1B 1PRXA 2J23A 1JZOA 3BCKA 1R7HA 5DQYA 2HSMB 3O3TA 3FR6A 3TJKA 1F3BA 1V58A 2LNTA 4AGSA 6GSWA 19GSA 2CVKA 4PNGA 1BYEA 2HZEB 3P8WA 2H75A 4TR0A 2V6OA 5F05A 2FHEA 5D9TA 5CO3A 2VD1A 2M80A 1GSYA 2HRAA 3UL3A 3IOSA 1JZDA 1O8XA 1H4OA 5EY6A 5EVOA 1B4PA 2DJ1A 1B9YC 2L4CA 3VPQA 3C7MA 2HXKA 2C3TA 3F3RA 4USSA 1GRXA 1XWAA 1XW6A 4MJEA 4EDZA 4MCUA 5IMCA 2GSTA 3FW2A 3HKRA 4LL4B 4YAPA 3GSSA 1ERVA 4MJAA 3CYNA 4K7NA 3KM6A 3G7IA 1PX6A 4HU9A 5E4WA 2IFQA 4NPBA 5D9VA 2YZHA 4MZWA 4PURA 3IPZA 1Q4JA 1XIYA 1ST9A 2OACA 4N0VA 4J57E 1PSQA 3PGTA 5FWGA 3CSIA 2GSSA 5CYYA 2CT6A 5G5EA 5GAPD 5ENUA 4V1Ag 5KEJA 4FYBA 1GTAA 3H1NA 1A24A 4TKYA 4EVMA 4I5QA 1GSFA 5IOXA 3TCOA 2MMNA 4ULXA 1XWKA 3J7Yb 3LYKA 1G6WA 3R2QA 2JADA 2GZZA 3VWUA 5HR3A 2OADA 2VCZA 3QAGA 1GSUA 3GKXA 4MZBA 5CRHA 4RUVA 4FYCA 1B4QA 4LLRA 3DXBA 3FHKA 2C0GA 1T1VA 3IK9A 4PQ1A 3TJFA 5KN3A 3F8UA 4XHMA 1PN9A 4ECIA 1PKZA 3DGQA 1HD2A 4LA1A 2IFQB 3E0UA 1YEPA 4HI7A 4IHUA 4XIHA 2C0FA 11GSA 2L6DA 5IIZA 2I4AA 4TXOA 1MTCA 2J9HA 4EKZA 3GHAA 1MDJA 1UC7A 3Q6OA 5JCWA 1LBKA 4TXVA 1YKAA 2YWNA 2CX3A 5IO0A 3TKRA 2XBQA 3HZ8A 3IRAA 1SD9A 3IK7A 1J9BA 4Q5FA 4X1UA 1XXUA 2HRFA 5A4UA 4L8EA 3O76A 1SK2A 2NVLA 4G0LA 4G9HA 4KH7A 2RM6A 2E7PA 1THOA 3KJYA 1K3OA 2DMMA 1GNEA 1BG5A 3F6DA 4RI6A 2DJ0A 2PBJA 4ECJA 5AISA 3ZTLA 1TW9A 1GSQA 3GMFA 3FZ9A 5ID2B 5D93A 1HNAA 1YEXA 3O6TA 5IMFA 2JZRA 2HYXA 3EINA 2CX4A 1ERWA 3GTUA 4GQFA 2HSYA 1O7UA 3HVXA 2M46A 4RQXA 1GNWA 2V2GA 1XW9A 2C3NA 4MJCA 2VLUA 1EEMA 4RI7A 4F03A 2LQOA 3LFLA 1PL1A 1WRYA 1U3AA 1K0BA 5D9WA 4ZB8A 4EDYA 5JCGA 4MA9A 5CNWA 2HNLA 3GFKA 2CZ2A 4BWSA 1QFNA 4GF0A 2ES7A 4HUAA 5DCHA 4Q5QA 2DIZA 4PQIA 2YJHA 5CRDA 1YKCA 2MBTA 4KAEA 3TDGA 1A8YA 1XVQA 1MD4A 1R5AA 1EP8A 1IYIA 2LRCA 4AJ8A 3M1GA 2RLIA 5DALA 3UBKA 3CBUA 5D8IA 3ZVJD 3IXRA 4HJ2A 2YNXA 4ECCA 2KOKA 1M2BA 2BTOT 2NPBA 2KP2A 3GX8A 3E3EA 4IGJA 1K0CA 5JWRB 3GTUB 4TR1A 2ON5A 2H70A 3VWXA 2IMDA 3QFBC 4HS1A 1XW5A 1KEBA 2YOIA 2LRTA 4NMUA 2GSQA 2DLXA 5AIXA 4AF2A 3FK8A 3MNGA 3HJPA 2LJKA 1PL2A 5B7CA 3HZ4A 5KN1A 1JLWA 4BWQA 1FB6A 2FD3A 3M3MA 4F0CA 3IAS2 3KD0A 3DIEA 3QOUA 3QD9A 2H6XA 1Z6MA 3MAKA 1TRUA 3LXZA 4DSSA 2X8HA 4NWYA 1A2MA 1O85A 2YANA 2KUCA 1SL0B 4K6XA 1HNCA 3WD6A 1F2EA 4AJ7A 5ECHB 3P7XA 3Q19A 2X8GA 2ON7A 1H75A 2IL3A 5HR1A 2ALBA 6GSYA 3W8SA 3HJOA 4IKHA 2XHFA 4GLTA 2F8FA 3D0ZA 1AIUA 1BAYA 1PA3A 2VUPA 1UN2A 4CHSA 1A0RP 2HRKA 1SD8A 5L71A 1SL1B 4WKWA 3ZMLA 1EP7A 3ZIJA 2O89A 4HZ2A 4BVXA 4HEA2 4L5OA 1FAAA 3DEXA 4POLA 2LJAA 3OR5A 1JLVA 4G2EA 2R4VA 4FYUA 1OE7A 3GN3A 2OE0A 5CAXA 2VM2A 1YQ1A 1ZGNA 1EV4A 5IOWA 3N9JA 4POKA 5H5QA 5DJMA 1GULA 5AIVA 3APSA 4XCSA 1USBA 5ELAA 2YP6A 4KCAA 4OFTA 3H8QA 3UOMA 3GNJA 2GVPA 2H19A 3QAVA 1IYHA 1XOBA 1AXDA 1X0RA 1J08A 2H01A 2V1MA 2YPMA 1GSSA 5ECMB 2IMEA 2CVDA 1W89A 2L6CA 2DBCA 2WS2A 5ECSA 1K3YA 3GA4A 2HSMA 1V57A 1E6BA 2M72A 3TRQA 1RW1A 3IV4A 5ECKB 2H76A 4MF7A 4WR5A 3DRNA 2HZEA 3QMXA 2L59A 3UMAA 1V98A 4FIWA 1TJDA 1RK4A 2H72A 2E2GA 4IBPA 2PVOC 5DDLA 1TP9A 4KX4A 4XRDA 1GL8A 1EOHA 2B1LA 3APOA 2IMFA 3PH9A 3KH7A 2FLSA 3TKSE 2LJRA 5F06A 3L4NA 3LSZA 4F82A 2B1KA 4K8MA 4Q5RA 2AUVA 3CXGA 2PPTA 3VPTA 4MJBA 1MDIA 5IMZA 1M7TA 1F9MA 1WIKA 4N0ZA 2GZYA 3DVXA 1UA5A 3FY7A 4NXIA 2FY6A 2RUFA 1ZOFA 1NHOA 2KLXA 4Z7XA 2MBSA 2B5YA 2HT9A 4ECBA 4WF5A 1QUWA 3GURA 1TI1A 1A23A 4QQ7A 4PUAA 4N11A 2VIMA 1QQ2A 2GT6A 3Q74A 3C1SA 3F3QA 5ECPB 1Y6EA 1EGRA 4ZL7A 4MDCA 4G19A 3FRCA 2IMIA 4DEJA 4QL7A 4IJIA 1VF2A 5C04A 5HQPA 2O7KA 5JWQB 4NV2A 3Q18A 2GSRA 4YQVA 2KHPA 3DYRA 4YAVA 3FEUA 4PUFC 1EWXA 1SENA 1B48A 3D6IA 3EURA 5KN0A 2WGRA 2MMAA 4MP4A 1U87A 3E9JB 1KTEA 1TK8B 4MH2A 1KBNA 4MPFA 3GV1A 2GQLA 4ZB6A 3ISOA 3F4TA 5C00A 4GRFA 18GSA 3LORA 1SKRB 2K18A 4GTUA 3KIJA 1YJ6A 1G7EA 3EE2A 2VO4A 2I9HA 3A2XA 2B3SA 1OKTA 4KF9A 2FA4A 5ECLB 1FO5A 4BPYA 2HFDA 3U5RE 4G0KA 4H86A 2O85A 1ILOA 5D9XA 1X5DA 1BEDA 2RM5A 4O5RA 2RIIA 5ECNB 2EC4A 3ME7A 2HSNB 3US3A 1O6JA 2VL2C 3HDCA 1V40A 1T4YA 2JL4A 5IMVA 5G31A 1N2AA 1K0MA 1DSBA 2CV4A 5ID2A 2JZSA 4CW9A 4KA0A 17GSA 4TRXA 5IO2A 1ZMAA 1QGVA 2H71A 2WZ9A 1TK5B 3G7JA 1O73A 3I6AA 4ISDA 1OC9B 2QGVA 3N5OA 1TRWA 2TRXA 1MD3A 3GYKA 2HQTA 4ZBAA 1A8LA 3WT2A 1ZL9A 2JSYA 5IPGA 5GSSA 3GL5A 1SU9A 5F8BA 4ID0A 1R5PA 2FWFA 1TXXA 4NHZA 3HVVA 3UVTA 1QXHA 4JU5A 4Q5NA 1WWJA 5HR2A 1X5CA 3IR4A 2GT5A 7GSSA 4FH8A 1GWCA 3LGCA 1URMA 2I1UA 3ERGA 3BJ5A 2F3MA 1EOGA 4YQUA 2VCQA 1JZRA 4N30A 1Z7PA 3ZREA 5EL8A 1W4VA 1ERTA 4RQRA 4L0WA 1SYRA 3D22A 3HVSA 4K7OA 3TOTA 1ACVA 4OCEA 1X9WB 3CSHA 1AW9A 3I9V2 1PKWA 3WGXA 2H1BA 1A2LA 2NBSA 5B6NA 2B5EA 3C73A 3RHBA 20GSA 2QC7A 3W6GA 6GSTA 1NSWA 1XWBA 1OYJA 4DVCA 3FKFA 1GUMA 4G0IA 3K8NA 4MMMA 2Z9SA 2IN3A 3QPMA 1M99A 4GCIA 1FHEA 1VF1A 4OO5A 4JZQA 4K2DA 2H1DA 1T4ZA 3GH6A 3D5JA 2O8VB 3NIVA 3CRTA 3EMXA 4HU7A 1X9SB 4IS0A 3LJRA 1MDKA 3RDWA 1DE1A 4IJ3A 2CQ9A 2O87A 4HOJA 3S9FA 2PMTA 3VURA 3C1RA 4KB3A 2AYTA 3DWVA 1LJRA 1YDKA 1S3AA 2FUG2 6GSVA 3GKNA 3M9KA 2HZFA 2OA7A 2XPDA 4WXTA 3KP8A 1AQVA 2DJKA 1SKWB 1PGTA 4OD7A 1ZYQB 5EPFA 1WE0A 3H93A 4GWRA 5G2ZA 1R4WA 4XS4B 5J9BA 4K0NA 2VCXA 3EU3A 2G2QA 2CVBA 1S3CA 1ZCPA 3ME8A 5FT3A 3F6FA 2LV3A 4L5LA 1EGOA 3GIXA 2XBIA 4JR4A 2R5GA 2JU5A 4KE3A 3IAM2 3TJBA 3ZVJA 4L0UA 3RPNA 5D96A 2IWTA 5H5RA 2P0GA 1QK8A 2OE1A 1X9MB 2C80A 1OAZA 4PNFA 1OC3A 3ZRDA 3KTLA 1DE2A 3D4MA 4HQSA 3TJGA 4KDXA 1B9XC 2P5QA 3TKSC 2VCWA 3UARA 3U6VA 3WGDA 4JRRA 1TRSA 1WMJA 3UVHA 2LS5A 1HQOA 1JZWA 2H0HA 2YCDA 5LCZA 1V2AA 3KCMA 4PX1A 3ZLPA 3PPUA 2YJ7A 4GSTA 4WBJA 2I3YA 3MSZA 2DIYA 1M9BA 1TRVA 4OMVA 4OWYA 4I8BA 5AGYA 1BX9A 2WULA 2VL9A 2K6VA 2DJ3A 1F3AA 5DAKB 1NM3A 2H1AA 1SJ6A 2WDUA 1JHBA 2HSHA 4I6XA 2CAIA 3GKMA 2OBIA 1WPIA 1TDIA 4POBA 4DSQA 2E2MA 2H73A 2OKAA 3QDNA 5J9CA 1FOVA 3CSJA 2H66A 4I2UA 2L57A 4POMA 2C1YA 1XZOA 2LKUA 2MZCA 3F4RA 3W8JA 3VK9A 2F9SA 3AY8A 1ERUA 2H30A 3LYPA 4GSNA 3CTFA 2ZUPA 2RUEA 4ZXGA 4LMVA 2AAWA 1U6TA 3BD2A 2N5BA 5F07A 2L5OA 3GUSA 2C3QA 4ZB9A 2V32A 4HZ4A 2UZ8A 4ILFA 3A5WA 1AQWA 5G1LA 3LQ7A 4BA7A 3DKSA 3TB2A 1GTIA 1GUHA 1M0UA 4KW6A 2C8UA 2GTUA 4J2FA 4IN0A 3WT1A 1TTZA 5CP1A 5HR0A 3IDVA 3J7Yk 1FB0A 1VF3A 10GSA 4JEDA 2VM1A 5J5NA 3G7YA 2IJYA 1Z7RA 1JFUA 3M8NA 4MZCA 3EYTA 3RBTA 13GSA 14GSA 4ML6A 3FZ5A 1U3IA 4D73B 16GSA 1VGLA 3A2WA 4HDEA 4YQMA 2WFCA 3I69A 1SK1A 2IIYA 5LD0A 5IPHA 4ACSA 3F0IA 1OE8A 1TK0B 2MMOA 8GSSA 4WETA 6GSSA 3H4KA 3HY2A 2BJXA 2EIQA 2VAFA 1G6YA 4V1Ap 1BJXA 4OFNA 4O32A 2JZTA 5ECIB 1Q98A 1NW2A 2QKEA 3PINA 2VLTA 2VOCA 4XS1A 2GDRA 3I43A 1K0OA 2BMXA 4K1FA 1B8XA 1XCCA 3H79A 3JCML 5HFKA 4KSOA 1ZZYA 1M2AA 4IW9A 12GSA 4JBBA 2GS3A 4WEYA 4KDUA 2AV4A 3GX0A 1T3BA 2A2SA 1YF1A 3L0HA 4ZILA 2G0FA 4E8HA 1XVWA 5J4UA 3LWAA 1R26A 3HYPA 4EC0A 5D73A 4JE1A 6GSXA 1VF4A 5DBQA 4IELA 3RAZA 2VCTA 4NV5A 3EMPA 2LNSA 5COHA 5HFIA 4ZL8A 5AN1A 2VL2A 2DSAA 2WCIA 2XC2A 2H6YA 4BL7B 5F0GA 3ZIVA 1ML6A 2JACA 3DMLA 1GH2A 4EF0A 4X0XA 3FYGA 2YZUA 3F9UA 3EC3A 3TKPA 4KGIA 1OC9A 4FQUA 2GGTA 3TJJA 4K9ZA 2HRNA 4V2NA 4MH3A 1NHYA 3IC8A 3KXOA 1XBSA 3CMIA 2X8CA 1T8EB 2R37A 2H6ZA 3HHVA 2N5AA 4PXOA 4ZBBA 4WF4A 1LU4A 4EXJA 2HI7A 3G9BA 3TUEA 4KDYA 4KCEA 2L5LA 4YH2A 3QFAC 5B6MA 3M0FA 5G1KA 4TR4A 3CRUA 1VRSD 2K8VA 1O8WA 1DUGA 4N10A 1K0NA 5ECRB 3WGEA 1THXA 5JWOB 3FR3A 1PQNA 4IQAA 1V9WA 3L9SA 1YY7A 4BVYA 2TRCP 2H0IA 22GSA 1PD21 2XPEA 2LTKA 2YN1A 2P31A 5DQSA 3RPPA 1J0FA 2FGXA 2FWGA 3HA9A 1YF0A 3TGZA 2FWEA 3ERWA 5B8BA 3HCZA 1GP1A 3CTGA 1TKDB 5ECQB 4IQ1A 3A3TA 1I9DA 4ZIJA 1GTUA 2B7KA 2D2ZA 3VI7A 3WYWA 1RQMA 4NHWA 1OKDA 1TOFA 3KZQA 4HQZA 3MDKA 5G5FA 2AHEA 1GTBA 4HJMA 5BMUA 2R3XA 2YV7A 2CAQA 3BCIA 2DJJA 3ZYWA 5FHIA 2PGTA 3F4SA 4WBRD 1YZXA 3FR9A 4GSSA 5GSTA 3KH9A 4XRAA 3ZMKA 2VCVA 1TI3A 4TW5A 1FVKA 2LUSA 4X43A 4OCFA 2PN8A 4KUNA 4LMWA 4MABA 1K3LA 3R3EA 4XS6A 1MEKA 3EU4A 4BVYB 3UAPA 3V1WA 3VLNA 1GLPA 2JSZA 2PVQA 1ABAA 2P5RA 1X5EA 1OC8A 2EIOA 5LNKe 5GZZB 2H0GA 2QSIA 3UJ1A 1XPVA 4TXOB 4TVEA 5DCGA 2L4QA 4EO3A 3RHCA 1PMTA 1FW1A 3GSTA 4CDOA 4XTSA 1T00A 5G30A 4MF6A 4XS4A 5IMDA 3FZAA 2C4JA 3GRXA 2NDOA 1XWGA 4ML1A 4FO5A 5GAND 1QMVA 4F9ZA 5INYA 9GSSA 1Z9HA 3SBCA 3ERFA 2AB6A 3NZNA 2F51A 1S3DA 3KTBA 1GLQA 3L9UA 2X99A 2WJUA 1HYUA 5KN2A 5J41A 2V41A 3UIWA 1Y25A 3ZZXA 5CRWA 2B5XA 5IM9A 2GQMA 4DSRA 2C0DA 4O92A 2WRTA 2K9FA 1GSEA 1O81A 3HD5A 2VL3A 3EWLA 1A2JA 6GSUA 2CA8A 2YWIA 4I97A 2PERA 3DD3A 3SWLA 3ZITA 3LG6A 2GZPA 4MPGA 5IMAA 2DMLA 3IBHA 3IHQA 2LQQA 3FZ4A 4V2MA 3IC4A 3EVIA 1CQHA 3D4TA 3P90A 3QCPA 1UVZA 5ECOB 2YV9A 2TIRA 4GXZA 4GQCA 3LXTA 1Z3EA 3VFIA 2NTOA 2FNOA 1BQ7A 1TU7A 5A5KA 3GKKA 3TKSA 4EUYA 4E8EA 5ABRA 3TRXA 1OVNA 5A4VA 2H1GA 4PGTA 4IP6A 2OE3A 3VWWA 2REMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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