4BVXA

Crystal structure of the aimp3-mrs n-terminal domain complex with i3c
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
MRLFVSDGVPGCLPVLAAAGRARGRAEVLISTVGPQDCVVPFLTRPKVPVLQLDSGNYLFSTSAICRYFFLLSGWEQDDLTNQWLEWEATELQPALSAALYYLVVQGKKGEDVLGSVRRALTHIDHSLSRQNCPFLAGETESLADIVLWGALYPLLQDPAYLPEELSALHSWFQTLSTQEPCQRAAQTVLKQQGVLALRPYLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Assembly of Multi-tRNA Synthetase Complex Via Heterotetrameric Glutathione Transferase-Homology Domains.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ligase
source organism Homo sapiens
molecule keywords METHIONINE--TRNA LIGASE, CYTOPLASMIC
total genus 58
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 6.1.1.10: Methionine--tRNA ligase.
pdb deposition date 2013-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF18485 GST_N_5 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4bvxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4bvxA01
3TJFA 3K8NA 1XPVA 1FB0A 1H75A 3KMOA 2PU9C 2L57A 1Q98A 4H86A 3A2WA 4OD7A 4GSSA 1DE1A 3RPNA 4BVXB 3MAKA 3ZIJA 2IPAA 1A2LA 3QDNA 3UARA 1MD4A 2ALBA 5J3RA 2VM1A 2L59A 4AJ7A 3L4NA 4PNFA 4ZBBA 2H19A 4V1Ag 1XCCA 3ZIVA 5IQYA 1FB6A 1XZOA 1BQ7A 1E2YA 2OE1A 3TKSE 5DVBA 4HQZA 2PVOC 5IMDA 1JLWA 3I9V2 2IFQB 2PN8A 2OBKA 4PURA 4BWSA 2CVDA 3KH9A 3IC4A 2C80A 3IV4A 3E9JB 3WD6A 3R3EA 3G7JA 2E2GA 4PUFC 3GUSA 2X8GA 4BVYA 3LXTA 2R2JA 4HU9A 2LJRA 3FR6A 1XWAA 4WEYA 6GSYA 4ZXGA 4IVFA 3GL5A 2JSZA 4TR1A 1DE2A 1ZYEA 3CTGA 12GSA 1XW5A 3IAM2 2O87A 1DUGA 4WBRD 5HQPA 5IOXA 2WB9A 2VL2A 4POKA 3M3MA 3TDGA 3UVHA 4YQUA 5IO2A 4WETA 5AIXA 3IC8A 5ECNB 4NHWA 2GTUA 1ERVA 4RQRA 3LFLA 2B3SA 4DSSA 1TKDB 2JZRA 4K9ZA 1IYHA 4OWYA 3A3TA 1GSYA 3H79A 2HRKA 1PX7A 2GLRA 2O8VB 2V6OA 4V2NA 2HZEA 4Q5FA 2F3MA 5ECHB 1CQHA 4JE1A 1B4QA 1FVKA 3ERWA 4NHZA 4KSMA 3GTUA 3LYKA 5FT3A 4JBBA 3ERFA 4MABA 1T7PB 3ZL5A 2TIRA 1UN2A 4RI7A 3DKSA 5C00A 1B8XA 5IMAA 3VWXA 3O3TA 4G0LA 5DALA 2KP2A 4TKYA 3TB2A 1E6BA 2CV4A 3GSSA 4DEJA 2A4VA 2WFCA 2GSTA 1GTUA 4NPBA 3CSHA 1M9BA 4K1FA 4LL4B 4Q5RA 2H75A 2PUKC 4I8BA 1TRVA 3UOMA 4GWRA 3KIJA 3L9UA 2G0FA 2DJ1A 3FKFA 3KGKA 3TGZA 3KP8A 4HZ2A 1TDIA 3FY7A 2M80A 3EYTA 1SL2B 2HYXA 1O81A 4G0IA 1GSFA 4MLYA 5G5EA 3QMXA 4HEA2 13GSA 3F63A 3C1SA 4MZBA 1HNBA 2C3NA 2IMFA 2KLXA 1JHBA 3CMIA 4GLTA 2YWMA 3N9JA 1GSQA 3D22A 4IELA 4POMA 1GTIA 5G30A 4WR4A 4MP4A 1V57A 2C0EA 1YEXA 3D0ZA 2MBTA 1SD8A 6GSSA 1W89A 2ZCTA 1TJDA 2V2GA 1HNAA 2GT5A 2GZZA 2B7KA 1MTCA 4KSOA 3TKSC 2H1BA 2L5OA 3EINA 2WJUA 3GHAA 1HQOA 1O6JA 5GAPD 1V58A 3GX0A 4EO3A 3RHCA 4TN8A 19GSA 2H72A 3HJOA 3DGQA 3FHKA 4MF6A 2FNOA 2FLSA 3HXSA 3ERGA 4K8MA 1XWKA 1VF2A 2YANA 4GQFA 5ECIB 1K0NA 2VL3A 4IP1A 3D21A 4AJ8A 2PERA 1ML6A 1JZDA 2FGXA 3WT1A 1ST9A 2XBQA 4MH2A 5JWRB 5IO0A 3DRNA 4EC0A 3ZITA 4F9ZA 1JFUA 1BX9A 3CRTA 1WE0A 4AJ6A 2L4QA 4HQSA 3KJYA 3IHQA 4WF5A 1ZGNA 2LQOA 3FYGA 3F4SA 5HFGA 4F0BA 5GSTA 2H0GA 3CSJA 3FR9A 3VWVA 3ZRDA 1WRYA 4TVEA 2XPDA 1FW1A 1QXHA 5KN3A 3KTLA 3GKNA 3A5WA 5CO3A 2FWGA 3APOA 2PBJA 3IR4A 2MZCA 5HR0A 1U87A 4ZB6A 2XC2A 2H0IA 1FG4A 1EOHA 2DMMA 2VCXA 1GUKA 4NWYA 4ML1A 2IN3A 4MMMA 4MH3A 4KAEA 2HT9A 2HRAA 4ECIA 3MDKA 1XFLA 2YOIA 3L9SA 3P90A 4OMVA 3D5JA 1YJ6A 1USBA 4G9HA 1GRXA 2N5BA 3IDVA 2IMIA 1F37A 1ZMAA 1B4PA 1SYXA 4PTSA 1PRXA 1Z5YE 3DVXA 1GUMA 2B7JA 4MJEA 4K7IA 2HSNB 1SENA 3FK8A 3PH9A 1AC1A 4FIWA 1XVQA 2V32A 4E8EA 3ZFLA 2H70A 2L4CA 1GSEA 1N8JA 4KNDA 2LNTA 2F51A 1NW2A 4KF9A 4ULXA 5F0GA 1ZOFA 4FQUA 3F0IA 3QAVA 3C7MA 3GKXA 5D9VA 4KB3A 5A4WA 3TOUA 2FWHA 1PA3A 2LRCA 3D4MA 4ID0A 3HJPA 2YV9A 4XRDA 5G1LA 3WGXA 1HNCA 3SWLA 1UA5A 1F3AA 5DBQA 2EIQA 2AHEA 3VK9A 3EMPA 4G2EA 3ZMLA 3L0HA 1OC9A 1Y25A 2GSQA 2H6YA 2C0DA 5DAKA 2HE3A 3TJKA 4D73A 3GV1A 3S9FA 1NM3A 1NHYA 5LCZA 3UBLA 1GP1A 2DJ2A 3BD2A 2P5RA 1WJKA 3RDWA 5ECMB 4Q5NA 2FA4A 6GSTA 3W8JA 5GAND 1Z6NA 4KCAA 2GS3A 4JRRA 2VD0A 1SL0B 3RHBA 2H66A 5JCUA 5CAXA 5DJLA 2GQMA 2JU5A 5D9TA 2YP6A 1WIKA 3IA1A 2GDRA 4NAXA 5A4VA 2LV3A 3AY8A 2FUG2 4IW9A 3O6TA 2NPBA 5CRDA 1M0UA 2IJYA 4EDYA 4MJAA 1H4OA 3M1GA 3WGDA 5DCHA 4XS4B 1N2AA 2H0HA 4BWQA 4MPGA 3D6IA 3J7Yk 2GZYA 2AB6A 2REMA 3FR3A 5F07A 2ZUPA 5DJMA 5IIZA 5F06A 3IOSA 5J9BA 3U5RE 4PGTA 2B6MA 3I69A 1B9YC 1FO5A 1ERWA 3Q19A 5G2ZA 1PX6A 1GL8A 3HA9A 1KTEA 5DCGA 2GSRA 4XHMA 2KHPA 3EC3A 5ABRA 4K7OA 2EIRA 1AQXA 4GXZA 4RI6A 2PPTA 3QFBC 1SJIA 2GQLA 1M99A 1ON4A 1PGTA 2E0QA 2VM2A 3IXRA 5D93A 3VI7A 3F9UA 1OC3A 2WULA 4KE3A 2HXKA 3P2AA 2RM6A 3KMNA 1K0BA 3LG6A 2B1KA 1W4VA 2HQTA 2YWIA 5JWOB 3VPTA 1X9WB 2CZ2A 4TR0A 2C0GA 2RM5A 1A2JA 3F8UA 3GYKA 1PL1A 1TU7A 3BCIA 1BAYA 5IPGA 2VAFA 3GH6A 1AXDA 1TK8B 5ECKB 4BVXA 2V1MA 2GQKA 4RQXA 2I4AA 5EVOA 3IPZA 1XIYA 2KUCA 1GSUA 1X5CA 3EURA 5INYA 2MYGA 3VURA 1TW9A 1TK0B 2WS2A 2LNSA 4XCSA 1M9AA 4ECJA 2YWOA 2OA7A 1EEJA 2IFQA 5IMZA 5J4UA 1DSBA 2NVLA 1XOBA 2O85A 2H01A 3LQ7A 4JEDA 1DBYA 17GSA 1VF3A 4KCEA 4HOJA 1G0TA 1R26A 3GX8A 4V2MA 1BJXA 4J2FA 2H30A 5ECRB 1T4ZA 3TRQA 1HD2A 4ZBDA 2QSIA 1GTBA 4LMVA 1XOAA 1PKWA 2IL3A 2PGTA 5IOWA 4ZB8A 2V6KA 3GFKA 1SJZA 2LJKA 5CNWA 2E7PA 3KZQA 2NTOA 1X9MB 1OC8A 1SL1B 2BMXA 5DQSA 2DLXA 4F0CA 1UC7A 3ED3A 2PMTA 3ME7A 1B9XC 2OADA 4WBJA 5DQYA 2JZTA 2I1UA 1SKRB 3TRXA 3KTBA 6GSXA 3TUEA 4HDEA 2P0GA 2YWNA 2FCHA 4LL1B 2F9SA 1MD3A 4GSTA 4YAVA 1SU9A 20GSA 3PGTA 3M0FA 2L5LA 1WPIA 2WZ9A 1R4WA 4CW9A 1HYUA 1GH2A 1TU8A 4IBPA 4PX1A 2HRFA 5ECSA 2VCVA 2CX4A 2GT6A 3HD5A 5B8BA 2ON5A 5LD0A 4BL7B 1S3DA 1ERUA 5CP1A 4KDXA 2M72A 3GH9A 3FEUA 3VWWA 5G5FA 2HI7A 2K6VA 4TR3A 1GULA 4YAPA 2X8HA 2LRNA 4EDZA 4MZWA 4V2LA 5IMVA 1GUHA 2N5AA 2FD3A 1O7UA 2P31A 1TI1A 2G2QA 2JZSA 1QFNA 3RPPA 2H73A 4POLA 2DBCA 4L0WA 2VO4A 5ENUA 1WMJA 2K8SA 4G19A 3EU4A 1PKZA 2FHEA 4KDYA 1YEPA 2LRTA 1SKWB 3I43A 3GURA 5FWGA 5HR3A 2RIIA 3W8SA 2MMOA 1B48A 1F9MA 5AIVA 5COHA 1WOUA 4IQAA 1SD9A 1V9WA 3GKMA 1TK5B 1WP0A 4JU5A 3VI5A 1XVWA 1SK1A 3WGEA 1XW9A 2N5FA 5H5RA 3HJMA 1AIUA 2WDUA 5IMFA 1K0AA 4X43A 2B5EA 1AW9A 2H8LA 4PXOA 2A2RA 2CAIA 3IE3A 4PNGA 4LLRA 4N30A 2K9FA 4KDUA 3DYRA 6GSVA 3LWAA 1EV4A 4OCFA 2GZPA 3TKSA 5D73A 4WF4A 1MDIA 1U3IA 4MJBA 1JZRA 4GSNA 5HR2A 1U3AA 4X0XA 2E2MA 1R5PA 4IN0A 4FH8A 2YNXA 1MDJA 3FZ9A 4J56E 1TI3A 4MZCA 3H4KA 4ZBAA 1M7TA 1KBNA 5CRWA 3QPMA 1LBKA 2IIYA 1TXXA 1M2DA 1QK8A 3HDCA 4ECCA 2XHFA 2FWFA 1AQVA 4I6XA 5D8IA 1XW6A 3ZFBA 1FVJA 3RBTA 4KH7A 3KH7A 1RQMA 2VLTA 1R7HA 3LGCA 3Q6OA 5AISA 1I9DA 1ILOA 2DJ3A 3EMXA 4HUAA 4I2UA 3P7XA 1WWJA 4IJ3A 4N10A 5JWQB 2VCQA 3BBYA 1V2AA 1ACVA 1SK0A 1TRUA 3LXZA 5D9XA 4L0UA 4IKHA 1J08A 5KN2A 22GSA 1TTZA 3NIVA 1NHOA 1A0FA 1SK2A 4G10A 1GTAA 4PQHA 2H76A 3KP9A 2RLIA 2YJHA 3DD3A 2CX3A 4O32A 2DMLA 3TRPA 2QGVA 4ISDA 1Z6MA 1TOFA 2IMDA 1VGLA 3DXBA 1KEBA 1YZXA 4ZL9A 3QD9A 5AN1A 2VLUA 5ECLB 4TXOB 5JCGA 2DJKA 1K3LA 4IQ1A 1T1VA 2JSYA 5KN0A 3EE2A 2HRNA 2H6ZA 4MA9A 2AYTA 2C1YA 3KCMA 2GSSA 5ID2B 2FWEA 2ON7A 4ILFA 4E8HA 4QL9A 3US3A 5L71A 2C0FA 3E0UA 5FHIA 3QAWA 3QOUA 4XIHA 2VCZA 3ZTLA 1F2EA 2CVKA 2L6CA 2RUEA 3BOAA 3G9BA 3CYNA 4ACSA 3CSIA 2YN1A 2CT6A 5H5SA 1PL2A 3MWHA 5J5NA 3GIXA 3QFAC 1Z9HA 3WYWA 1C72A 10GSA 3ZLPA 2QC7A 3H1NA 1SYRA 1BEDA 5G31A 2M46A 2LKUA 3M9KA 5IM9A 1FOVA 1YF1A 3I6AA 4OCEA 1X9SB 3DMLA 1Z7RA 2UZ8A 3PPUA 3J7Yb 3R2QA 2C4JA 4JR6A 4CHSA 3VWUA 2LUSA 2DSAA 1PSQA 1O8WA 1F6MC 1T00A 1RK4A 1EGOA 1FAAA 1J9BA 1UVZA 4HS1A 3C8EA 1M2AA 4G0KA 2C8UA 1EGRA 4EF0A 2X64A 3ZVJD 1Q4JA 3F4RA 3UEMA 2HSMB 1X0RA 1G6WA 2CAQA 3GSTA 4EE0A 1G7EA 3IK9A 2H71A 4XS4A 3TJGA 5KN1A 14GSA 3FZAA 3CXGA 1ZZYA 4PQIA 1K0CA 5BMUA 1KNGA 2JACA 5JCWA 2OJLA 2VL9A 1IYIA 4MPFA 4NV5A 2O89A 4GF0A 1R5AA 4IGJA 2HLSA 1K0DA 4YQMA 2PVQA 2OE0A 1CQGA 2AV4A 4O92A 1ZCPA 3VPQA 1NSWA 4BVYB 4L5OA 4OFTA 3FW2A 3NZNA 3A2XA 2HSYA 3DVWA 3V1WA 3IRAA 2VL2C 2CZ3A 3C73A 3ME8A 3L78A 3H8QA 1EOGA 4XRAA 2HSMA 4TR1B 3HVVA 1VF1A 4XS6A 2KP1A 2J23A 4DSRA 3O76A 2F8AA 1YY7A 1PD21 5HFIA 4CDOA 1F3BA 1AQWA 4NMUA 4NV2A 3L9VA 2H6XA 1JZWA 3A2VA 3RAZA 3QR6A 4DVCA 5ECQB 4GRFA 1ERTA 5CRHA 2BTOT 4DSSB 3UMAA 2OBIA 3M9JA 6GSWA 3ZREA 3H93A 4KUNA 2HRKB 2B5YA 3LORA 3MSZA 3APQA 3FZ4A 1FHEA 1XWGA 4HZ4A 3PR8A 2HZEB 4ZL7A 4TXVA 3D4TA 2LEGA 3TJJA 1OYJA 3CBUA 3GTUB 5GSSA 4XTSA 4HI7A 3P8WA 4EVMA 4WXTA 1YKAA 1ZYQB 1A24A 1Y6EA 1X5EA 3ZYWA 5ELGA 2VCTA 4K0GA 2DIYA 3QCPA 2IWTA 5H5QA 2NDOA 5DALB 1BYEA 3HCZA 5IPHA 3HVSA 4P3YB 2L6DA 4BA7A 4MF5A 4XS1A 2F8FA 3LJRA 4L5LA 3C71A 4K6XA 2BJXA 1ZL9A 3F3QA 4NXIA 1BG5A 2GGTA 2VUPA 2XBIA 3LYPA 4HJ2A 3HY2A 4TR4A 3BJ5A 2B5XA 1QUWA 4OFMA 4ML6A 1Z7PA 2ES7A 4TOPA 3TOTA 2R37A 2K18A 3GNJA 1TRWA 3BCKA 1PN9A 5D96A 4OO5A 4WR5A 2J9HA 3CTFA 4ZIJA 2OE3A 1LJRA 1K3YA 2I81A 5C04A 2PWJA 2ZNMA 4EUYA 2XPEA 3WT2A 4AGSA 4AF2A 2HFDA 3UL3A 4K2DA 1EP8A 2DIZA 3HKRA 1A8YA 4LA1A 2HZFA 2VIMA 1M2BA 1V98A 2FA8A 3KEBA 1EV9A 3TKPA 2OACA 1U88A 2C3QA 3HYPA 1T8EB 3GA4A 4MCUA 2CA8A 1A2MA 1K0OA 2MMNA 2X99A 4F82A 4FO5A 1GNWA 4EKZA 3KM6A 2YCDA 4JZQA 2LTKA 1YF0A 2VCWA 5B8AA 1AAZA 2I9HA 3G7IA 4GTUA 1I5GA 4GCIA 2WCIA 3UAPA 3PINA 2VLVA 1S3AA 3DEXA 1THOA 5DDLA 3UJ1A 4BL7A 1JLVA 1OVNA 2R6KA 5B6NA 2DC5A 1O8XA 2DJJA 2EIOA 4LMWA 1GNEA 2A2SA 1SKSB 5ECPB 9GSSA 2EC4A 3U6VA 3GRXA 5LNKe 3LSZA 1EWXA 1ABAA 5HFKA 4FYBA 3TKRA 11GSA 2JL4A 1MEKA 2IMEA 1QMVA 3EVIA 1T4YA 1A8LA 2YZUA 3MNGA 3IBHA 2LS5A 5J9CA 4YH2A 4OO4A 1XWCA 2K8VA 4TW5A 4HU7A 3FRCA 5G1KA 1EEMA 2DJ0A 4I2TA 5IMCA 2HSHA 5F8BA 5D9WA 3G7YA 3HVXA 3HHVA 4PUAA 4KX4A 4ZILA 4N0VA 1G7OA 4MDCA 1OE8A 5J41A 4MF7A 4MJCA 1YQ1A 4QQ7A 6GSUA 2IMKA 2AJQB 1K0MA 5EPFA 1Z3EA 4X1UA 1PMTA 4IS0A 2O7KA 4JR4A 4OFNA 2R4VA 1URMA 1QQ2A 4O7HA 3EU3A 4USSA 2MMAA 5A4UA 7GSSA 1SJ6A 3GL3A 3CRUA 2YV7A 2R3XA 4L8EA 2YJ7A 2YPMA 3IAS2 5EY6A 1EZKA 1GLQA 1S3CA 2AUVA 3TKQA 1PQNA 1GWCA 1YDKA 1GSSA 1A23A 1O73A 3Q18A 2Z9SA 4POBA 4TRXA 4V1Ap 2LJAA 2QKEA 3NOFA 2LSTA 3F4TA 3Q74A 5GZZB 2LQQA 4I5QA 1GLPA 4EXJA 4MK3A 3C1RA 2H1AA 2TRCP 1U6TA 3TCOA 4I97A 4RUVA 3ZVJA 5B6MA 3F6DA 4N11A 3QAGA 3OR5A 3VLNA 4WKWA 1MDKA 4IP6A 4GQCA 5B7CA 2P5QA 2X8CA 5E4WA 4FYUA 1OKDA 1YKCA 3GKKA 1OAZA 3FZ5A 1OKTA 1VF4A 3UBKA 4BPYA 3HZ8A 5ELAA 2H1DA 2D2ZA 1O85A 1OC9B 3M8NA 3TJBA 2VOCA 3W6GA 3F6FA 16GSA 5DAKB 1XWBA 4D73B 3VFIA 4O5RA 1OE7A 1J0FA 2FY6A 3JCML 2B1LA 2H1GA 4N0ZA 3ISOA 3GN3A 1THXA 2NBSA 4IJIA 4QL7A 2YZHA 1QGVA 3UIWA 3EWLA 1XBSA 4Z7XA 3E3EA 3UVTA 4EL1A 2WRTA 3DIEA 2V41A 4KW6A 2AAWA 2RUFA 1TP9A 5A5KA 3ZZXA 1JZOA 1TRSA 4FYCA 1RW1A 3IK7A 4DSQA 3KD0A 2MBSA 1VRSD 3GMFA 4TXOA 2GVPA 3N5OA 5E59A 1V40A 2KOKA 3ZMKA 5CREA 2I3YA 1GSDA 2JADA 2CQ9A 3KXOA 1K3OA 5ID2A 4KGIA 4ZL8A 1T3BA 2R5GA 5KEJA 4K7NA 2HNLA 4K0NA 1LU4A 5F05A 4KA0A 2CVBA 3LEFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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