4G9HA

Crystal structure of glutahtione s-transferase homolog from yersinia pestis, target efi-501894, with bound glutathione
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
202
structure length
202
Chain Sequence
VMMKLFYKPGACSLSPHIVLREAGLDFSIERVDLVTKKTETGADYLSINPKGQVPALVLDDGSLLTEGVAIVQYLADKVPDRHLIAPSGTLSRYHAIEWLNFIATELHKGFSPLFNPNTPDEYKTIVRERLDKQFSYVDSVLAEHDYLLGKKFSVADAYLFTVSRWANALNLQIKERSHLDQYMARVAERPAVKAALAAEDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutahtione s-transferase homolog from yersinia pestis, target efi-501894, with bound glutathione
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Yersinia pestis
total genus 75
structure length 202
sequence length 202
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4g9hA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4g9hA01
3FZ4A 1XWBA 2OBIA 3GKMA 4MP4A 1RW1A 2R5GA 5G5FA 3IAS2 2CT6A 2YP6A 3HCZA 1K0NA 5COHA 1WRYA 4ULXA 1AQVA 4QL9A 3VURA 4WEYA 2LQOA 1ZYEA 4PQIA 2LTKA 2LEGA 1PA3A 2E0QA 1M0UA 4BVYB 1AQXA 4HUAA 1ZGNA 2RUFA 4MLYA 2IMKA 4K6XA 1BQ7A 1R4WA 4L5LA 4BA7A 2MZCA 3GV1A 2PVQA 2HRKA 5HR0A 4GSNA 1WJKA 2H73A 1JZOA 3FRCA 4KDXA 5HR1A 5G5EA 1A8YA 5H5SA 2VLTA 2NBSA 2YV7A 2REMA 3CBUA 1GTUA 3L78A 3QFBC 5CO3A 4AF2A 1TK0B 8GSSA 4PGTA 3O3TA 4HJMA 3UBKA 1V40A 1PL2A 3F6DA 4EKZA 3IXRA 2CX4A 3G7IA 1NHYA 2XPEA 1FB0A 3UVTA 1F9MA 5CRHA 5IPHA 3D0ZA 3RHBA 1O73A 3KIJA 1X5DA 3D6IA 2HT9A 2O89A 4FYCA 4ECIA 4N0VA 1XOBA 4OD7A 5JWOB 2WRTA 3LQ7A 1XCCA 3UMAA 4IS0A 4O32A 4FYUA 1KNGA 2N5AA 5ELGA 5IPGA 1UA5A 1TXXA 4GRFA 5J9CA 2VL9A 4IP6A 3VWWA 2GZYA 4IN0A 3MAKA 2LNSA 3M9KA 3ZYWA 1QXHA 2X64A 5F05A 4TXOA 2HZFA 4I97A 5JCGA 2OADA 2L57A 4HI7A 2HXKA 2GSSA 3KGKA 3LWAA 3VLNA 1XPVA 4J57E 1FVJA 3DYRA 1T4ZA 2XBIA 4KH7A 3WYWA 2IMFA 1K0DA 3ZMKA 3ZIVA 4Q5QA 2H1BA 2HRKB 4XS4A 3VFIA 3F3QA 1GSDA 4XTSA 5B8AA 1QUWA 3GX0A 2FWGA 1VF2A 1ZYQB 2OKAA 4G0IA 5D9VA 2CZ3A 2AV4A 3LJRA 4K0GA 4FQUA 1O85A 13GSA 4OFTA 1TW9A 5H5QA 3DMLA 3CRTA 2HRNA 3PR8A 1RQMA 1PKZA 1F6MC 3FHKA 1U87A 2LKUA 3QOUA 1T00A 4I2TA 4ISDA 4ZILA 2IL3A 3Q18A 1SK2A 4V1Ag 1TJDA 3C71A 3APOA 2GDRA 2VO4A 1BYEA 4EDYA 4KE3A 4LL4B 1YKAA 3KTLA 1U88A 4MPFA 1TI1A 1ACVA 3DRNA 3HHVA 4NXIA 4F82A 1EV9A 3HVVA 2FCHA 2ZCTA 2GSRA 1H4OA 1K0AA 3F0IA 4ZB8A 5B6NA 3H1NA 3IA1A 1SKRB 1OE8A 4TXOB 1TTZA 3FKFA 5A5KA 2HNLA 4MJCA 1TK8B 3DIEA 2AB6A 2B1KA 1PN9A 4MZCA 5IMDA 2H70A 3A5WA 4EF0A 2F9SA 2BTOT 3NZNA 4K2DA 3EC3A 1FO5A 2I4AA 2PU9C 3ERGA 1AUCA 2KP1A 3UARA 2H6YA 3ERFA 3KEBA 4V2NA 1R7HA 2V2GA 2LUSA 1TOFA 3CRUA 1YF1A 1T8EB 2MBSA 3ZLPA 1E2YA 1LBKA 2L6DA 2C80A 2OACA 5HFKA 2F8AA 2XHFA 2VL3A 1X9SB 3IC8A 4EUYA 1ERWA 2R2JA 4LL1B 1OYJA 1XFLA 3DXBA 3N9JA 4MMMA 2L6CA 2P0GA 3UEMA 1WWJA 1EOHA 2A2SA 4XS6A 4PQHA 4USSA 3VK9A 3TJFA 1O81A 2HSHA 1X5CA 2K8VA 2G2QA 1XW9A 3US3A 2MMNA 1GRXA 4PURA 2EIRA 3DGQA 3PGTA 4LLRA 5DCHA 2LNTA 4KNDA 2HRAA 1M9BA 2C3TA 1ERTA 1S3DA 2G0FA 3G7JA 2VIMA 1BG5A 3KMOA 2ALBA 2M46A 3TKPA 3GKKA 1EOGA 2GQKA 4ML1A 2DMMA 2LSTA 2A2RA 2MMZA 1Q4JA 1SENA 1VF1A 1XVQA 1KBNA 1V9WA 2H1AA 2C3QA 3KM6A 3GYKA 5AIXA 4PUFC 4MJBA 5AISA 4XCSA 4CW9A 3TOTA 1MDIA 5BMUA 3UVHA 3KCMA 2ZNMA 1A8LA 2HFDA 2WGRA 4E8EA 1K3LA 1GTBA 1GLPA 2CAIA 2CA8A 3ISOA 1Y6EA 1Y25A 2F51A 4F0BA 4EE0A 4V2MA 3F4RA 4G19A 2PVOC 3F3RA 2JL4A 1PX6A 5EVOA 4DSSB 2FGXA 1J08A 4BL7B 1GNWA 1M99A 1ON4A 3PH9A 4EO3A 5DJMA 2VD1A 2RM5A 5J41A 2K8SA 2MBTA 2L5LA 1XOAA 3APSA 1QK8A 1GUKA 3EMXA 2CX3A 3KP9A 4LMWA 2DJ2A 3P2AA 4JR6A 1EP7A 1PQNA 4JE1A 3E0UA 3N5OA 1V58A 4DSQA 3FR3A 1YQ1A 1K0MA 1F37A 4H86A 2LJRA 3HYPA 3IK9A 3I6AA 1PGTA 2B7JA 1LJRA 3I9V2 1F3BA 4BVXA 3ZIJA 3WT1A 3M0FA 1T1VA 2VM1A 3IK7A 1B48A 3KMNA 4HU7A 4WKWA 3KH7A 2B5YA 1OC8A 2V1MA 3FW2A 12GSA 1MD3A 2R4VA 3FR6A 4FH8A 1G6YA 3DVXA 3KP8A 4ML6A 4IQ1A 1GH2A 3ZL5A 3WGDA 5FT3A 3H79A 2LRNA 1M2BA 1ABAA 1ML6A 3L9SA 5DAKB 1SL0B 1NHOA 5D9XA 4ZBBA 4KDYA 4BWQA 2CQ9A 3TKSE 4JRRA 2KUCA 3TUEA 5CP1A 1EGRA 2VCXA 6GSVA 1AC1A 1A0FA 3VI7A 4AJ8A 4O92A 2IMIA 2PUKC 3VPQA 1HNCA 3M1GA 1QGVA 2CVDA 3CSJA 2E7PA 1GUHA 3FYGA 2C0GA 4PQ1A 2VM2A 2DC5A 4ACSA 2B1LA 4I2UA 2H6ZA 2N5FA 4Z7XA 4MDCA 4MABA 1O8WA 2V32A 2HZEA 1GSQA 2FHEA 1I9DA 4K0NA 2DBCA 3GUSA 3LXZA 4ID0A 5IOWA 4GQFA 2CVKA 2XPDA 5DBQA 3QFAC 3O6TA 1K0CA 3P7XA 1IYIA 1ILOA 5DQYA 4N11A 4GTUA 3OR5A 1SJ6A 2C1YA 4RQRA 3BOAA 1JLVA 2JZTA 3LXTA 3TKRA 2JSYA 3R3EA 3EWLA 5HR2A 1XWGA 4K7NA 4K9ZA 2R6KA 1JZDA 2LRCA 2LJKA 2H74A 5IO2A 2K6VA 19GSA 4RQXA 3A2WA 1XBSA 1WIKA 2H66A 4MA9A 3C1RA 2PPTA 5HR3A 2AHEA 2WZ9A 2VD0A 1AW9A 4ILFA 2UZ8A 5D8IA 2VCWA 1ZOFA 2DJ3A 4XS1A 4JZQA 2EIQA 3QMXA 5DDLA 4KCAA 2JZRA 3BCKA 4TW5A 1FAAA 1YDKA 1WMJA 1AQWA 3VWXA 3HA9A 1OVNA 2L4CA 1OKTA 3I69A 4YQMA 4KA0A 1B9YC 1C72A 4KGIA 2YZUA 2HSNB 2HZEB 2X8GA 1SU9A 1Z7PA 4GWRA 3P8WA 3WGEA 1DE2A 2DJ1A 3DEXA 1EV4A 5ID2A 2JU5A 3DWVA 4ZBAA 2PBJA 3O76A 3W8JA 1AIUA 2KOKA 2E2MA 4L0UA 3CTGA 1BX9A 2RUEA 1XW5A 2X8HA 2GQLA 2I81A 2TRCP 1N8JA 1GUMA 4IJ3A 4V1Ap 4NHZA 4TKYA 4ZB6A 5GZZB 1YZXA 1SL2B 2RIIA 4Q5RA 3LGCA 1J9BA 2O8VB 3M3MA 11GSA 4PX1A 2RLIA 5D9WA 3GFKA 2GS3A 3J7Yk 6GSSA 4KW6A 4IQAA 2K18A 4QQ7A 4NWYA 2AYTA 1TDIA 2WJUA 1G7EA 2GQMA 4G2EA 4K1FA 1YY7A 1HNBA 5D9TA 4ECJA 3TOUA 2YNXA 2WS2A 3F6FA 2FA8A 5F8BA 1X9MB 1V98A 1MDJA 4ZXGA 1XWAA 4TR1A 5IMVA 1FVKA 2VOCA 1YKCA 2WFCA 3TJKA 5J5NA 3A3TA 5CAXA 2TIRA 3MSZA 3ZVJA 6GSXA 1BEDA 1X5EA 2VL2A 2QGVA 1PD21 3QD9A 2IFQA 1NW2A 4IHUA 1HD2A 2AUVA 4OO5A 4HZ2A 6GSYA 3TRQA 3FK8A 4AJ6A 1Z3EA 3UBLA 3GKXA 5J9BA 2P31A 5IOXA 3R2QA 3K8NA 1PSQA 3H8QA 3RPNA 5ID2B 4PTSA 3HZ8A 1SYXA 2NDOA 2VCQA 4WXTA 2OE1A 4XIHA 2DMLA 4JBBA 5F07A 1THXA 5CRWA 1GL8A 5AN1A 4MJAA 3ZTLA 3IDVA 5J3RA 4GSTA 4HZ4A 3FZ5A 3GH9A 4XS4B 2IMEA 2HYXA 5HFIA 2J23A 5C04A 1THOA 4WBRD 3IRAA 5GSTA 4EXJA 4WF4A 1ZZYA 5DVBA 1SD9A 4TOPA 4DSRA 3J7Yb 3UJ1A 2YJHA 5D93A 3TGZA 2HRFA 2VCTA 1TRSA 2GT5A 1K0BA 5IO0A 2Z9SA 3TCOA 3GMFA 3BJ5A 1ZL9A 1DE1A 2YCDA 3ZREA 1TU8A 4TR1B 3GN3A 4POLA 16GSA 1G7OA 1USBA 3HKRA 3SBCA 4Q5FA 3UIWA 3TDGA 5GAND 3HJOA 9GSSA 4KUNA 3A2VA 3QR6A 2H1GA 1SJZA 1SK1A 1GWCA 4WBJA 5CRGA 4TN8A 3GSSA 2IFQB 2AJQB 3H4KA 4F2IA 2DIYA 2DJKA 1VRSD 2JZSA 3L9VA 4NMUA 5LD0A 1EEMA 3RAZA 2YWIA 1TP9A 1ZMAA 3C73A 4E8HA 3CMIA 2YWOA 5B8BA 1TKDB 5ENUA 1LU4A 1OC9A 1B9XC 3D4MA 1WPIA 4CHSA 1OE7A 2QKEA 3RPPA 2HSYA 6GSTA 4IP1A 1WOUA 4MF5A 4NHWA 4ZL8A 3BCIA 2OA7A 1V2AA 3GKNA 1XIYA 5JWQB 4G9HA 2HE3A 4LA1A 4JEDA 5IMFA 2ES7A 5IMCA 3A2XA 2K9FA 4OWYA 2ON5A 1DSBA 3ERWA 4TXVA 3TJJA 3M8NA 5ECHB 2VAFA 2HSMA 4TRXA 2H76A 1K3OA 2H75A 1HNAA 3TJBA 3D5JA 2N5BA 4ECBA 1ERVA 4BWSA 3KXOA 3TKSC 5ECQB 2O87A 1PKWA 2FWHA 2NVLA 1GULA 4XRAA 2VLUA 2PN8A 1FB6A 3IE3A 2V6KA 1YF0A 1PMTA 4HDEA 2H0GA 2GZZA 3UL3A 4YAPA 3L0HA 4PNFA 1TRVA 4EL1A 4Q5NA 3IHQA 2CVBA 3RHCA 2PMTA 3EINA 3F63A 2FWEA 3PPUA 3TKSA 1W89A 2I3YA 5GAPD 3U5RE 3FR9A 2FA4A 2FNOA 3QPMA 3QAVA 2H19A 3ME8A 3Q19A 3ZFLA 1XWKA 1Q98A 1OC9B 5G1KA 1R5AA 1GSSA 1K0OA 2IJYA 3QCPA 2BJXA 1MEKA 1GP1A 1A2LA 5CREA 1URMA 3LG6A 2H0HA 3APQA 1EP8A 4D73A 4L5OA 2HI7A 5GSSA 3LFLA 1Z9HA 5AGYA 1EGOA 5DALA 2GT6A 1F3AA 2FY6A 2GZPA 3GRXA 3L4NA 4RUVA 4IGJA 3TJGA 5IIZA 2XC2A 1EEJA 5ECIB 1OKDA 1SKSB 1B4PA 3CSHA 2HLSA 1R5PA 2F3MA 3AY8A 3GTUA 5JWRB 5KN0A 2PWJA 3CXGA 4HEA2 4OO4A 2F8FA 4OFNA 4L0WA 14GSA 4MK3A 4I8BA 1SK0A 4PXOA 2LRTA 1DUGA 1CQHA 1BAYA 1BJXA 2ON7A 3EU3A 20GSA 5G1LA 2KHPA 1I5GA 4POBA 4TR0A 5LNKe 1SYRA 5G2ZA 5C00A 4YAVA 4IBPA 3QAWA 3TB2A 4LMVA 2O7KA 1O8XA 2C8UA 18GSA 5DQSA 2C0FA 4BVXB 2JSZA 5G30A 3BBYA 1H75A 4O7HA 4OCFA 2J9HA 1GSFA 3GURA 1B8XA 4POKA 1GSEA 5KEJA 4HQZA 5G31A 2XBQA 3WGXA 1M9AA 3ME7A 1Z6NA 2MMOA 2WCIA 3NOFA 2H71A 17GSA 4D73B 3EMPA 4KSOA 2CV4A 4KAEA 5CRDA 2IIYA 4N0ZA 1F2EA 3S9FA 3LYKA 5DALB 1M7TA 2MYGA 3LYPA 2TRXA 2CZ2A 4YH2A 4JR4A 1S3AA 1UC7A 4MF7A 1W4VA 2FUG2 2JADA 3QDNA 5B6MA 2DSAA 2YJ7A 2C0EA 1FOVA 3IR4A 3ZFBA 3KZQA 4G0LA 1J0FA 4GXZA 3FZ9A 4GF0A 1WP0A 5F06A 3FZAA 3GTUB 5B7CA 1YEXA 4ZL7A 5ECNB 2EC4A 1V57A 1JHBA 3TRXA 5F0GA 2M80A 2L5OA 3LORA 3ZITA 4KCEA 4X0XA 4KB3A 2X8CA 3ZZXA 1U3AA 3F8UA 4O5RA 2YWMA 5DCGA 3GX8A 5EPFA 4MCUA 3GH6A 3F4SA 2L59A 5J4UA 3Q74A 4MZBA 5CNWA 1IYHA 4MF6A 4F0CA 2H30A 3IC4A 1HQOA 5A4UA 4J56E 3GA4A 4N10A 3EURA 1U3IA 1PRXA 2B5XA 1MDKA 2P5QA 5E59A 1JZRA 4TR3A 5ECLB 2X99A 4OCEA 4KF9A 5A4VA 5FHIA 2GSQA 1FHEA 2I1UA 1T3BA 1M2DA 3C8EA 4V2LA 3E3EA 2GVPA 2QSIA 1A2MA 3C1SA 3IV4A 4WF5A 5FWGA 4F03A 2JACA 2VL2C 3CYNA 5IM9A 4P3YB 3W6GA 1TU7A 2OE3A 2O85A 1ZCPA 2LJAA 1M2AA 2GTUA 2FD3A 5HQPA 4GSSA 4XRDA 3DVWA 1XXUA 3U6VA 1S3CA 4K7IA 2B5EA 1DBYA 4TR4A 3IAM2 3MDKA 3KH9A 4GCIA 5KN3A 3IOSA 5ECOB 2KP2A 1T7PB 3FEUA 3WD6A 2PERA 3PINA 4K8MA 2VLVA 1UVZA 5EL8A 4G0KA 4GQCA 4IW9A 3M9JA 4NV2A 5ECSA 4N30A 3GNJA 1AAZA 4I5QA 3VWVA 2YWNA 1XZOA 2GGTA 2WDUA 2I9HA 1G0TA 3VPTA 3KJYA 3EVIA 1A24A 1SD8A 1ERUA 4MH3A 4KX4A 3GL5A 4HU9A 4KSMA 4L8EA 3KD0A 2ZUPA 1Z7RA 3C7MA 2GLRA 3F4TA 2LS5A 4PNGA 2P5RA 4QL7A 4KDUA 3H93A 2YN1A 3P90A 1OC3A 1GNEA 1RK4A 2WULA 3HVXA 1MTCA 1O6JA 2VCZA 1TRWA 1GSYA 1OAZA 3SWLA 3EU4A 1XW6A 4JU5A 1PX7A 5ECPB 4ZL9A 3D22A 2FWFA 2DIZA 2D2ZA 1WE0A 1VGLA 3JCML 4EVMA 7GSSA 2AAWA 5LCZA 2YANA 1TI3A 3NIVA 2MMAA 5AIVA 3LEFA 2OJLA 3GHAA 10GSA 4RI6A 2DJ0A 1A0RP 1KTEA 3RDWA 3TKQA 1NSWA 1QQ2A 2YPMA 4DSSA 1ST9A 5ABRA 2C4JA 2KLXA 4WR5A 4BL7A 3G9BA 2H8LA 3HJMA 2B3SA 3BD2A 3HXSA 3DKSA 3IBHA 5H5RA 2B6MA 1JLWA 1FW1A 4HS1A 4FIWA 2B7KA 2RM6A 5DJLA 5ECKB 5KN1A 3ZVJD 4FO5A 2QC7A 5IMZA 1JFUA 2H72A 3HJPA 2H01A 4K7OA 3EYTA 5JCUA 4MJEA 1R26A 4AJ7A 1HYUA 2LV3A 2NTOA 1XWCA 3KTBA 3EE2A 5ECRB 1GLQA 2CAQA 2DJJA 5E4WA 3LSZA 1GSUA 2PGTA 2H0IA 4NPBA 3TRPA 4MPGA 1YEPA 3HZ4A 3ZRDA 4WETA 2A4VA 4TVEA 1QFNA 5CYYA 4GLTA 4DVCA 1AXDA 1X9WB 3MNGA 2E2GA 1VF3A 5L71A 4J2FA 3I43A 2VUPA 1B4QA 4EDZA 1EWXA 4PUAA 5DAKA 2IMDA 2FLSA 2IPAA 1JZWA 1TRUA 3VWUA 1E6BA 1NM3A 5KN2A 1K3YA 1PL1A 5ELAA 1TK5B 4MZWA 2C3NA 1FG4A 2V41A 2R37A 3GSTA 5A4WA 4EC0A 6GSWA 1X0RA 5IMAA 4HJ2A 1MD4A 1VF4A 1A2JA 5HFGA 4WR4A 2IWTA 4OFMA 22GSA 5ECMB 4HOJA 4IKHA 3FY7A 3E9JB 5EY6A 2H6XA 3IPZA 4NAXA 3W8SA 1CQGA 4X1UA 3G7YA 4ZBDA 1Z5YE 1SKWB 3WT2A 4IELA 3CTFA 1SJIA 4YQVA 3F9UA 2YV9A 4BPYA 2WB9A 4RI7A 2OBKA 1Z6MA 1GTIA 4I6XA 1G6WA 3HD5A 1XVWA 3HVSA 2YOIA 4BVYA 3L9UA 5INYA 4ECCA 4F9ZA 3ZMLA 4POMA 3DD3A 5JCWA 2YZHA 3UOMA 1O7UA 3CSIA 2VCVA 3QAGA 4IVFA 3ED3A 1T4YA 3HDCA 2HSMB 5D96A 2EIOA 4IJIA 4MH2A 4ZIJA 2IN3A 3D4TA 4CDOA 3HY2A 1UN2A 4AGSA 1QMVA 1GTAA 3GL3A 2HQTA 5D73A 3GIXA 1SL1B 4OMVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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