4IKHA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900003, with two glutathione bound
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
227
structure length
227
Chain Sequence
SAFAVTQKWPAQFPEWIQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLPYEAHRVSFETQDQMTPEFLSVSPNNKIPAILDPHGPGDQPLALFESGAILIYLADKSGQLLAQESAARYETIQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFNKFAGREYEDKRPLERYVNEAKRLLGVLDKHLGGREWIMGERYTIADIATFPWIRNLIGFYEAGELVGIDNFPEVKRVLAKFVARPAVIRGLEIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900003, with two glutathione bound
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas protegens
total genus 71
structure length 227
sequence length 227
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ikhA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ikhA01
4G19A 5EY6A 3DRNA 1NHYA 3IAS2 1GUKA 1OKDA 4E8EA 1T3BA 4Q5NA 2AYTA 1GUHA 1GLPA 5ID2B 3RDWA 4ZBAA 4EE0A 2YZUA 3QD9A 1DE1A 2CZ2A 2HSYA 4D73A 1K0BA 4K0GA 3NIVA 5KN2A 4WBJA 2PVQA 2F51A 3UOMA 2RM6A 2PN8A 4KH7A 1R7HA 2F9SA 1B8XA 6GSSA 1ACVA 4G9HA 2VLTA 2QKEA 3HKRA 22GSA 4PX1A 4JR6A 3HZ8A 3TJFA 1I5GA 2YJHA 5HFIA 5F0GA 4I2TA 3UJ1A 4F9ZA 4QL9A 2GZZA 4WEYA 2DC5A 10GSA 1BJXA 4XS4A 4ZXGA 3GX8A 1IYHA 5EVOA 4AGSA 18GSA 3ZYWA 4TR0A 4LA1A 2HRKA 5ECNB 5CO3A 5HR3A 2H6YA 1R5PA 1EEMA 4IHUA 4XS4B 1DUGA 2DJ3A 1NSWA 3VWVA 1JLVA 3BOAA 1HD2A 4XCSA 1FOVA 4MZWA 4N0VA 1YDKA 2PWJA 2HSMB 3MWHA 4MPFA 4MCUA 5IOXA 2VCZA 1A2MA 1VF4A 4FIWA 5COHA 4KDYA 3UL3A 1DE2A 1O73A 3TKRA 1V9WA 3G7YA 4DSRA 3GN3A 5GAND 2H1BA 4I8BA 3D6IA 3EU4A 1YJ6A 3KTLA 4FQUA 2PVOC 1HNAA 1XXUA 5CRDA 4BVYA 1YY7A 1LJRA 4IP1A 2HQTA 3GYKA 5GAPD 2PMTA 2G2QA 2YJ7A 4IW9A 4TKYA 1FB0A 3EURA 3M9JA 1QGVA 2NVLA 1I9DA 4MH3A 1O8WA 4KGIA 2IPAA 2VD1A 2C4JA 3TCOA 1SKWB 1CQGA 1XBSA 1NW2A 1OC8A 4ULXA 4ZBBA 2FD3A 1KNGA 2C0DA 3C71A 5B7CA 3O6TA 4BL7A 2DJ1A 3ZITA 3KM6A 1AIUA 2GT5A 4Z7XA 4WF5A 4XIHA 1SD9A 5JWQB 4WKWA 4MZCA 3KIJA 3F6DA 2V2GA 3PGTA 2DJJA 4BL7B 4DVCA 1DSBA 1HNCA 1SL0B 2VAFA 2YWIA 4XRAA 2X99A 13GSA 3CRTA 1KTEA 4F03A 5J41A 4H86A 4RQXA 4MP4A 3H79A 3CSJA 2VCXA 2BJXA 3KH7A 1F9MA 2AAWA 2L6DA 5KN3A 2YN1A 1HQOA 2X8GA 2FCHA 1EGRA 5H5SA 2KP1A 3ZFLA 4O32A 3HJPA 3TB2A 3FZ9A 5IO0A 3ERFA 3D0ZA 2IFQB 4L0WA 1JLWA 1HNBA 1O6JA 3ZREA 4KSMA 2IMIA 2VCWA 4IVFA 6GSTA 5KEJA 2JU5A 4OFNA 4NHZA 3ZIJA 3TKSC 6GSXA 4KCAA 4F82A 3J7Yb 4MJAA 3KTBA 3RBTA 3ME8A 1RQMA 1WOUA 2PBJA 1Y6EA 3GKMA 2AHEA 5AISA 2VLUA 2V1MA 2O89A 5J9CA 1EOHA 4F0BA 5JCGA 1T7PB 2VD0A 1A24A 3F3RA 1ML6A 3KD0A 3GURA 3FKFA 1Z7PA 4PGTA 1R26A 1V57A 1JZDA 1TK8B 5D8IA 5F8BA 3TKSE 1M9BA 1XWAA 4CDOA 1H75A 2PGTA 2LRCA 2GS3A 2HT9A 2YOIA 2OA7A 2P31A 5J5NA 4MF5A 3A3TA 1XW5A 2H71A 3ZVJA 3GL3A 4PQ1A 3FEUA 4LL1B 4L0UA 2VCVA 1NHOA 3ZVJD 2OE0A 1QFNA 4BVXB 3IA1A 1XOAA 4V2LA 1GRXA 3G9BA 4L5OA 3RPNA 4HQZA 3QDNA 1ZCPA 1ZGNA 3KMNA 3QAWA 4GQFA 4ILFA 2L5OA 3VLNA 2P5QA 2L6CA 3GKNA 1O81A 1SK2A 4GQCA 3LSZA 4KX4A 2NPBA 2V6KA 5DJMA 3TKQA 2KLXA 1EGOA 5LNKe 4MJBA 4BA7A 3CSIA 3LGCA 5IMFA 4WR4A 2LSTA 3P8WA 5IPGA 4MF6A 2CAIA 3RHBA 3E0UA 3WGEA 3VK9A 4PNFA 2EIQA 3M0FA 2O85A 1JHBA 5HFGA 1B4PA 3HYPA 5CRWA 3I43A 3ZFBA 2AUVA 2B7KA 3HJOA 1QMVA 1Z7RA 3GKKA 2H30A 1PA3A 3N5OA 3FR6A 1TU8A 1B4QA 1TKDB 2HFDA 1K0AA 1OE8A 5D73A 4AJ8A 1S3AA 1XZOA 1GSQA 1YF0A 2YNXA 2FUG2 4XS1A 1X9WB 2N5FA 1JZWA 2WRTA 3UVHA 3RPPA 2V41A 2H72A 5IPHA 3CTFA 2H1AA 5IOWA 1A8LA 1PKWA 4BWQA 4DSSA 4NWYA 4FO5A 1UVZA 4HOJA 1N2AA 1GNWA 1GTUA 1EWXA 1F3BA 1Z9HA 5G2ZA 4JZQA 3C73A 2VL9A 1XVQA 1PRXA 2V32A 2LEGA 4ECJA 1SJIA 5IMDA 2LJKA 2YP6A 1V40A 2EIRA 3H93A 2YV7A 1K0NA 4IBPA 4LLRA 4DSSB 3LFLA 3IR4A 3L0HA 3HJMA 3UMAA 3QMXA 2GVPA 2R37A 3HY2A 3EE2A 4K7IA 3QAGA 2CA8A 4KE3A 2FHEA 2VUPA 3GHAA 1WRYA 2Z9SA 1U88A 4CHSA 3IBHA 1GSSA 1TRWA 2FWFA 3QPMA 1SL1B 1PX6A 3F63A 3UEMA 4WR5A 1TDIA 3EYTA 3IC8A 4ZB8A 4OMVA 2CV4A 1SJZA 2H0HA 1M2DA 5ECSA 5GSSA 3H1NA 5HR0A 3GH6A 4Q5QA 2MBTA 2K8SA 1EOGA 4HEA2 1AAZA 3GFKA 1GNEA 3M9KA 1A0RP 1WE0A 4ZILA 3UVTA 4J56E 1FG4A 1JFUA 1XWBA 5DALA 2ON7A 3GTUB 20GSA 4MJEA 5CP1A 2C0EA 1T4ZA 2LV3A 1F6MC 2DJ2A 4HI7A 1FO5A 3C8EA 2A2SA 4O7HA 5ABRA 2ES7A 2WULA 3APQA 4E8HA 1M99A 4OFMA 2IN3A 2GGTA 1AXDA 5IQYA 1BQ7A 5CREA 5AN1A 5IIZA 3BCIA 3LXTA 4TRXA 2CQ9A 5JWOB 5HR2A 2XBIA 3IE3A 3D4TA 5J9BA 1XIYA 1GP1A 3LYPA 2MZCA 1ILOA 1YEXA 16GSA 2DMMA 4EVMA 2YPMA 5ELGA 1Z5YE 3D22A 4ZBDA 3APOA 5ECOB 3GSSA 2J23A 3KMOA 1GTAA 4OWYA 3ME7A 2WGRA 2HLSA 2RM5A 3DIEA 5HFKA 4MZBA 14GSA 2A2RA 2AV4A 2JADA 1K0CA 3VFIA 4D73B 2H66A 4ZIJA 3A2XA 1TI3A 6GSWA 2MBSA 2TIRA 3I6AA 1GSYA 4N30A 1K0MA 4EO3A 3GUSA 11GSA 1GTBA 1E6BA 1AQWA 3KH9A 3G7JA 4EL1A 2GT6A 3TRXA 4EF0A 2MMNA 5GSTA 3ZMKA 1XWKA 4ML1A 2XPEA 5G5EA 1V98A 4G2EA 1S3CA 5BMUA 2AJQB 3ZMLA 1Z6MA 4OCFA 4YAVA 8GSSA 4MF7A 1ZZYA 2H75A 2B3SA 4OO4A 1PL1A 3TKPA 2IMKA 3TJBA 2HRKB 1YKCA 2VL2A 4GSSA 2B6MA 5KN1A 5E59A 1A2LA 2WDUA 2H0GA 2WFCA 2H1GA 5L71A 3BCKA 2H01A 1U87A 2YWOA 1N8JA 4XTSA 2PERA 3P2AA 5A4VA 2L4QA 4MK3A 2JACA 2P0GA 2HE3A 4V1Ap 3FR9A 1FHEA 1GSUA 1JZRA 2KOKA 1TRSA 5DAKA 3L9VA 2FLSA 4USSA 3S9FA 2FWEA 3FZAA 1LBKA 2RLIA 1ON4A 1TW9A 1G6WA 4BVYB 1THXA 2LNSA 2IMEA 1WWJA 1X0RA 2DJ0A 3VI5A 4XS6A 2PPTA 5E4WA 1USBA 1A8YA 1AQVA 2IWTA 3HA9A 2O8VB 1SK0A 1OC9A 3W8SA 5B6MA 2WS2A 1ZOFA 5INYA 1BAYA 4XRDA 2R6KA 1Z6NA 4G0LA 3IPZA 2EIOA 4ZL7A 3QFAC 1OC9B 4WF4A 4IGJA 3LORA 4ZL9A 1ZL9A 2IIYA 1YKAA 3HVVA 4I97A 2GSTA 3LWAA 2CAQA 5DCHA 1R5AA 4AJ7A 2B5XA 2LNTA 2E2MA 5GZZB 4TXOA 4I6XA 5DVBA 3IXRA 1GWCA 1ZYQB 3LJRA 4PNGA 1AUCA 1A2JA 5J3RA 1BYEA 4NV2A 1EV9A 4P3YB 4GLTA 1ERUA 1XPVA 4MPGA 3JCML 5C04A 3J7Yk 2FWHA 2N5AA 4PQIA 4K1FA 4MLYA 1O8XA 4YQVA 3C1RA 3FR3A 2XHFA 3I69A 3VPQA 1OVNA 2YZHA 2X64A 1LU4A 5D93A 2R4VA 2OBKA 5F07A 1M2BA 4F2IA 4K2DA 1B9XC 2H6ZA 3TRQA 2D2ZA 2GQMA 4KAEA 1TOFA 1PN9A 4MMMA 2X8HA 4DEJA 1C72A 1NM3A 1R4WA 2GTUA 4NMUA 2HRNA 2HNLA 3MNGA 1VF1A 2L4CA 5FWGA 5B8AA 5A4UA 1ERVA 3M3MA 4JU5A 4BPYA 1TU7A 2C0GA 2IMFA 3DXBA 4ACSA 2VM1A 1PD21 4HJMA 2N5BA 1AW9A 4ML6A 4HDEA 2M46A 2NBSA 1M2AA 1V2AA 4TW5A 1THOA 4MJCA 4J2FA 4HU9A 4IS0A 2CX3A 4ZB6A 2VO4A 2B5YA 4IQAA 2KHPA 2K18A 1X9SB 2C3NA 4RQRA 2JSYA 5IMVA 1SKSB 3EWLA 4XHMA 1T8EB 4ECBA 1BEDA 2ZCTA 3HCZA 4L8EA 2XPDA 3F6FA 4ID0A 2YWNA 9GSSA 1TJDA 4AF2A 3DEXA 3HDCA 4G10A 4LMWA 4TR1A 2K8VA 4J57E 3A2VA 2LTKA 3F9UA 2J9HA 3GKXA 4V1Ag 2FA4A 2HXKA 1VF2A 1Q98A 2VCTA 1U3IA 2DSAA 3FHKA 4NPBA 4OD7A 3UAPA 1GUMA 2DMLA 5A4WA 3D4MA 2BMXA 1YEPA 5J4UA 3WGXA 1MD4A 2M72A 2HZEA 1SENA 3KP8A 2B7JA 2CZ3A 5AIVA 3IDVA 1G6YA 4JE1A 2H74A 1TK5B 5C00A 4IP6A 2H76A 4PUFC 3UIWA 5A5KA 4TOPA 3NZNA 3V1WA 5AGYA 1QUWA 2F3MA 2GSRA 1GL8A 4OFTA 2P5RA 2CVDA 4YH2A 1MDIA 2H70A 2HZEB 4EKZA 5CAXA 6GSYA 1O7UA 1ERWA 2ON5A 3E3EA 2PUKC 4BWSA 2JZSA 2R5GA 4Q5FA 2VM2A 3R2QA 1YQ1A 3OR5A 4IKHA 1J9BA 2FY6A 3VPTA 1EEJA 4RUVA 4V2NA 5ECIB 1WPIA 4GSNA 5IMCA 5D9WA 4O5RA 5D9TA 1F37A 1IYIA 2K6VA 1FVJA 4N11A 5EPFA 1XOBA 3CMIA 1JZOA 3KZQA 3FRCA 1Z3EA 3IHQA 1BG5A 4HZ2A 1U6TA 3KXOA 1T00A 5B8BA 3EMXA 4RI6A 2MYGA 4GSTA 2NTOA 4IJIA 4F0CA 2GSQA 4NXIA 2HYXA 3EMPA 3UBKA 3GL5A 1GH2A 3W6GA 3QAVA 1TP9A 4G0KA 3APSA 3EVIA 3FZ5A 3RAZA 1VRSD 5ECPB 3F0IA 3HHVA 2C1YA 1TRVA 4ECIA 2O87A 2F8AA 5ENUA 3QFBC 4I2UA 2JZTA 5CYYA 1ZYEA 1XVWA 1WMJA 3VWXA 1MDJA 2LKUA 3TDGA 2WCIA 17GSA 4X1UA 2VOCA 1QXHA 1BX9A 4KDXA 1GTIA 1GSFA 5DALB 4HS1A 3VURA 1ABAA 3KP9A 1J0FA 3C7MA 1X9MB 3CTGA 2NDOA 4TR3A 1TRUA 5ID2A 3SWLA 4PTSA 3GV1A 3US3A 2HZFA 5ECMB 4WXTA 3O3TA 4IELA 1PMTA 3GH9A 4KB3A 3UARA 1T4YA 2XBQA 1AC1A 3CXGA 4KNDA 5DCGA 1S3DA 1KEBA 19GSA 3FZ4A 1X5DA 1VGLA 2H8LA 4PQHA 4FYUA 3TUEA 1WIKA 3H8QA 3FYGA 4JRRA 3UBLA 4ISDA 4K7NA 6GSVA 2MMZA 4V2MA 5IO2A 4IN0A 2CT6A 3NOFA 3F4RA 2FA8A 3TJGA 3WT1A 4I5QA 3C1SA 3TKSA 3ED3A 4QQ7A 3HZ4A 1QQ2A 1GLQA 1TI1A 2OE3A 1OKTA 2LUSA 3EC3A 1W89A 4KA0A 1EP7A 3D21A 2IJYA 4K9ZA 5ECHB 2ZNMA 2JSZA 3PINA 3L9SA 4LL4B 1PL2A 2K9FA 2HSMA 3DWVA 4PURA 2GDRA 3Q6OA 5FHIA 2CX4A 2GQKA 3IV4A 3L9UA 4DSQA 2DBCA 1W4VA 1CQHA 2R3XA 2MMAA 5HR1A 2HSHA 2HRAA 4GCIA 4N0ZA 2HI7A 2C3QA 3IRAA 2MMOA 3BD2A 5G30A 3GX0A 4MABA 2C3TA 1DBYA 1XFLA 2QGVA 4POMA 2H1DA 3P7XA 1WP0A 1YF1A 4TR4A 12GSA 1HYUA 3Q19A 3G7IA 2KP2A 3F3QA 3WGDA 4EC0A 3IK7A 3HD5A 2DIZA 4EUYA 4KW6A 1UA5A 4POLA 4X43A 5DAKB 4TVEA 2G0FA 2VL3A 2LJRA 1XWCA 5DQYA 2WB9A 2I3YA 1UN2A 4WBRD 4OO5A 3LYKA 2A4VA 3R3EA 3L4NA 3ZZXA 7GSSA 3N9JA 5G31A 5ECKB 4ECCA 3KCMA 5D9XA 1X5EA 5G1LA 3KJYA 5H5RA 2E7PA 1YZXA 2E0QA 1M0UA 4JEDA 1EV4A 3A5WA 1SYXA 4GRFA 3VWWA 3P90A 5DQSA 4O92A 1AQXA 4EXJA 5HQPA 1F3AA 2I9HA 1RK4A 3MSZA 4OCEA 3DGQA 2TRXA 2IL3A 3F4SA 4ZB9A 3EU3A 2IFQA 2OADA 4JR4A 1A23A 1FAAA 1SJ6A 2LRNA 3VWUA 4PXOA 1A0FA 1GSEA 3TRPA 3VI7A 4JBBA 3ZTLA 3PR8A 2C80A 4TXOB 4WETA 3DMLA 2LS5A 3FY7A 2RIIA 2C8UA 1EZKA 4POKA 3GIXA 4GTUA 4YAPA 5JCWA 4GWRA 4NHWA 2YV9A 3TGZA 3L78A 1MEKA 2LQOA 5JWRB 4GF0A 3W8JA 1OAZA 3D5JA 3TOUA 1SD8A 5B6NA 3GRXA 3GA4A 3PPUA 5DJLA 2H19A 3U5RE 5IMZA 5D96A 1XW9A 4POBA 1FB6A 2CVBA 1PQNA 1UC7A 5F06A 4NAXA 4HUAA 3BBYA 2O7KA 5D9VA 3GMFA 1KBNA 3DKSA 3IK9A 3GNJA 1B9YC 2VL2C 4MA9A 4N10A 3KEBA 1K0DA 2VCQA 1PGTA 4YQUA 3ZRDA 5LD0A 1TTZA 1SYRA 2EC4A 2VLVA 2B1KA 1PSQA 1T1VA 2L57A 1K3YA 3TJJA 4BVXA 4GXZA 2JZRA 3M8NA 1X5CA 4QL7A 5CRHA 3TJKA 2XC2A 1OC3A 2DLXA 4LMVA 5DBQA 3MDKA 3FK8A 2LQQA 2LJAA 2GLRA 1SU9A 1K0OA 2H0IA 1M9AA 1SKRB 2FWGA 4KSOA 4G0IA 1G0TA 3HXSA 3K8NA 4TXVA 1ERTA 3I9V2 3MAKA 3DVXA 1FW1A 2YCDA 6GSUA 2ZUPA 3SBCA 4K8MA 1GSDA 3DVWA 5CRGA 1FVKA 5JCUA 3QOUA 3Q74A 1G7OA 4MH2A 2IMDA 3IC4A 1E2YA 4TR1B 4HJ2A 3HVSA 2DIYA 2OKAA 3U6VA 4K7OA 1Y25A 2KUCA 4NV5A 3KGKA 2FNOA 3DD3A 4FH8A 2ALBA 1B48A 2HSNB 4MDCA 2GZYA 4TN8A 3WD6A 2QC7A 5DDLA 3ZLPA 5ECLB 4K6XA 3Q18A 2WJUA 2GZPA 1K3OA 1M7TA 4HU7A 1VF3A 4K0NA 2YANA 3TOTA 2TRCP 2OJLA 5CNWA 4KUNA 2R2JA 1PKZA 5EL8A 4KF9A 4IJ3A 3IAM2 3ZL5A 3QR6A 1QK8A 2JL4A 1V58A 3WT2A 1H4OA 3ISOA 2FGXA 3H4KA 2I4AA 1MDKA 4Q5RA 1OE7A 3LQ7A 4X0XA 3LG6A 2WZ9A 2I81A 3PH9A 3WYWA 2B1LA 2I1UA 3F8UA 1O85A 2OBIA 1F2EA 2PU9C 1SL2B 3DYRA 4AJ6A 1ZMAA 3O76A 4ZL8A 4EDZA 1U3AA 3GSTA 1OYJA 1PX7A 5ELAA 1G7EA 3M1GA 5AIXA 2RUEA 5H5QA 5G5FA 3E9JB 3HVXA 1SK1A 1Q4JA 2F8FA 2VIMA 2H6XA 4FYCA 1TK0B 2E2GA 5LCZA 5ECQB 2OE1A 2B5EA 4RI7A 1URMA 2DJKA 1ST9A 2LRTA 3EINA 2HRFA 3ERWA 2M80A 4FYBA 2C0FA 2L59A 4EDYA 1XWGA 2AB6A 1EP8A 3GTUA 2L5LA 2YWMA 3CYNA 1MD3A 4YQMA 1TXXA 4CW9A 2UZ8A 2GSSA 3LXZA 3QCPA 3BJ5A 1GULA 3F4TA 3IOSA 4HQSA 4KCEA 1RW1A 2H73A 4PUAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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