4IKHA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900003, with two glutathione bound
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
227
structure length
227
Chain Sequence
SAFAVTQKWPAQFPEWIQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLPYEAHRVSFETQDQMTPEFLSVSPNNKIPAILDPHGPGDQPLALFESGAILIYLADKSGQLLAQESAARYETIQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFNKFAGREYEDKRPLERYVNEAKRLLGVLDKHLGGREWIMGERYTIADIATFPWIRNLIGFYEAGELVGIDNFPEVKRVLAKFVARPAVIRGLEIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas protegens
publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900003, with two glutathione bound
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
total genus 71
structure length 227
sequence length 227
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ikhA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ikhA01
1BQ7A 2C3QA 4ID0A 2MMOA 4PUAA 2OE3A 3ZIJA 1OKDA 1TRVA 4JE1A 3QAGA 5A4WA 2P0GA 4MK3A 2DLXA 3GHAA 1K0BA 3L9SA 2VO4A 2FWHA 1M2DA 4K2DA 3KXOA 2H0IA 5IIZA 2VL9A 1JHBA 3A2WA 3IV4A 4FO5A 1AW9A 4K1FA 3TJJA 5IO2A 4V2MA 3GV1A 1LJRA 5IOWA 1AAZA 3HYPA 2LV3A 4MDCA 1R5AA 2I81A 2B7JA 3UOMA 1GSQA 1O81A 4K9ZA 4X0XA 2I4AA 3DXBA 4XRDA 3HA9A 1DSBA 5GSSA 1XZOA 4EC0A 1E2YA 3I69A 3IBHA 5CRGA 4KH7A 2PBJA 3LFLA 1T00A 4LMWA 5DJLA 2YWOA 1KTEA 4MZCA 2IMKA 3BCIA 1VRSD 4CW9A 1OKTA 3PH9A 5ID2A 2J9HA 1YEXA 2L57A 4JR6A 2MBSA 4ECBA 1V2AA 1QXHA 4LLRA 3IDVA 22GSA 1GTIA 1QGVA 3ME8A 3TRXA 4OFTA 1EOGA 1TOFA 2VCXA 3EINA 4O32A 2C8UA 3RBTA 2O87A 1M2AA 1YKCA 3KZQA 2IMDA 1TRSA 4RUVA 2HNLA 4N0ZA 1XIYA 3GSTA 1A2JA 3HVXA 1Q4JA 2M80A 3H79A 1KNGA 1BX9A 2NTOA 4F03A 1TU8A 2YWMA 2F8AA 3G7YA 5ID2B 11GSA 4QQ7A 5J9BA 3P8WA 3KM6A 1RQMA 4KX4A 4ECJA 4WETA 3KCMA 1WPIA 5J4UA 2C0EA 2X64A 3ZTLA 4OCFA 1K0CA 4GQCA 2DMLA 1AQXA 3QCPA 5G1LA 1EP7A 3I43A 3KH9A 4RI6A 1A2MA 1ZZYA 1FHEA 5D9XA 4XHMA 1XCCA 1XOBA 4YQUA 3BCKA 5C00A 4JRRA 3UBLA 4FYBA 3BBYA 3GKNA 3GNJA 1I9DA 4PUFC 4EVMA 3ZMLA 2YV7A 1PRXA 3TKSE 4HDEA 1THXA 5HR1A 4TR4A 1R7HA 2FA4A 5DVBA 2YZHA 3KEBA 2OA7A 1TXXA 4KB3A 4IS0A 2WB9A 4WKWA 2FD3A 2GZPA 1WOUA 1QFNA 5DCGA 2F51A 1MDJA 3EMXA 1XXUA 3IR4A 4ECCA 1F6MC 4KUNA 4ZB6A 2QKEA 1GLPA 1PKWA 1TK0B 1MEKA 3GH9A 4MMMA 3C8EA 2B1KA 5CNWA 3F0IA 5IQYA 1PL2A 4IP1A 4TR1B 3UL3A 1YJ6A 5IMDA 1Z7PA 1GNEA 1XWCA 5C04A 4I6XA 1FG4A 1B48A 5G30A 1TI3A 2HFDA 2HRNA 2L6CA 5JWQB 1PSQA 2MZCA 1OE8A 2IWTA 2GSRA 2DIZA 1ZGNA 2Z9SA 2D2ZA 4KSMA 1GSDA 4K6XA 3A3TA 5ECMB 3NIVA 4DSQA 4TR0A 5DAKA 1GSSA 3LXTA 2LRNA 2WS2A 1ON4A 1QK8A 2H1AA 2H71A 4MH2A 5ECKB 1KEBA 4PX1A 3AY8A 4PQHA 4IJIA 2AJQB 1SK1A 1XVWA 1J0FA 4ZIJA 1K3YA 4RQXA 2EIQA 2RIIA 3KMNA 3IA1A 1BAYA 5E4WA 2R5GA 3F3RA 2KUCA 4AJ7A 4IP6A 2A4VA 2E0QA 2VCZA 4EDYA 2LQOA 2GS3A 2E2MA 2H1BA 2RLIA 2XPDA 5DAKB 3BJ5A 4MJCA 1YKAA 2CAIA 4ML1A 4E8HA 2ZUPA 5J41A 3WYWA 5B6MA 3VURA 2H73A 3M9JA 5EL8A 3ERWA 5L71A 2L4CA 2WULA 1ERTA 6GSSA 5CREA 3TJKA 5KN0A 3IC8A 4IN0A 4KDUA 4EL1A 2HI7A 3O3TA 4XS4A 2PMTA 5ECQB 5AGYA 2VLTA 2R2JA 2H6XA 4POBA 3TKSA 3KP9A 3IXRA 3DRNA 2G0FA 4L5OA 1SL0B 1MTCA 3KD0A 2DJ2A 1T4ZA 1XBSA 4K0GA 5HFKA 3EC3A 1Z7RA 2JZTA 3HXSA 3EVIA 5ECRB 2H66A 2GVPA 1F9MA 5A5KA 4L0WA 4K7OA 4WBJA 4POLA 4ZXGA 1Q98A 4L8EA 2HSMA 1JZOA 2YWIA 4K0NA 4XS4B 4P3YB 3K8NA 3TKPA 1KBNA 6GSUA 4J57E 5HFGA 3LJRA 3R3EA 1FO5A 4BVXA 2B7KA 5IMZA 1MD3A 1H4OA 5D9VA 2VL2A 1VF1A 1ERUA 1M9BA 1G7OA 2HZEA 5J9CA 4DSSB 3WGDA 3Q6OA 3GA4A 1GSYA 5G5FA 1YEPA 5LCZA 1LBKA 1Z6NA 3CSIA 3TRPA 2HSMB 4IBPA 16GSA 2IMFA 2HSHA 3EWLA 3FY7A 2DIYA 2KHPA 6GSTA 1B9XC 1CQHA 3ZITA 4BVYA 2JACA 1MDIA 2MMAA 3DKSA 2LEGA 4OWYA 2V6KA 4KGIA 4OD7A 1A0FA 4USSA 4YQVA 2M46A 2X99A 1GRXA 2LUSA 3UMAA 1WJKA 3HCZA 4PTSA 1XVQA 4KW6A 2V1MA 1X5EA 4MJEA 4ULXA 1AQVA 4WXTA 4ISDA 3L78A 1ST9A 2H72A 1ZOFA 5H5QA 5DALA 3G9BA 3DIEA 3WGEA 3ZFBA 2K8SA 4BA7A 2XHFA 2NBSA 2X8CA 1VF4A 1PX6A 5ECSA 5FWGA 6GSVA 3UJ1A 2CAQA 1K0OA 2LJRA 1Z6MA 2AB6A 4ML6A 4AJ6A 5B6NA 1SYXA 3M8NA 4NWYA 2FWGA 1FB0A 5F8BA 2GQLA 2F9SA 1ZYEA 2CZ2A 2FCHA 2REMA 9GSSA 4Q5QA 2XC2A 1SJZA 3Q18A 3VPQA 2IPAA 1B8XA 1F37A 1JFUA 3WT1A 2KP2A 3GX0A 2H0GA 2H30A 1NHYA 4YQMA 4GXZA 1T8EB 1YDKA 2HSYA 4DVCA 1MD4A 4KNDA 4HJ2A 2GQMA 3IK9A 1HQOA 5J5NA 2GSQA 5HR0A 3ISOA 3CXGA 4MCUA 2XPEA 4FIWA 2FLSA 5IPHA 1TW9A 5GSTA 2HT9A 4GSNA 4WF4A 3L9VA 4WR4A 1ERVA 1GULA 3UBKA 3C1RA 4TVEA 1X9WB 5GAND 3FR3A 2H0HA 2H75A 1XW5A 2KOKA 3CRTA 4IKHA 2VAFA 4HOJA 3EU4A 3PR8A 4ACSA 4Z7XA 4XS1A 2IFQA 4OFMA 4HJMA 2CT6A 2VM2A 2YPMA 2JU5A 4IJ3A 1UC7A 4CDOA 4GF0A 4NXIA 1ABAA 1OC9B 1GH2A 2QSIA 1SD9A 3W8JA 4YH2A 2FY6A 2EIOA 3J7Yk 1J9BA 1JZRA 3ZMKA 3RHBA 1A23A 3VWWA 2GSSA 4NAXA 3HJMA 2MMZA 2IIYA 5LNKe 1V57A 4H86A 3FKFA 4PQIA 3GMFA 2AAWA 2KLXA 4JR4A 2LNTA 3M3MA 2CA8A 3A2VA 2DJJA 2GSTA 3U6VA 2RUFA 2OACA 5DBQA 2H1DA 3GRXA 2TRXA 1YQ1A 2V41A 3FZ4A 5E59A 3N9JA 3FYGA 1WP0A 1TRWA 4EUYA 4WR5A 1A0RP 1T3BA 1EZKA 4EKZA 4F0CA 3UAPA 4K7IA 3ZLPA 4WEYA 2E7PA 1X9SB 2XBQA 2YJ7A 1XWAA 5JCUA 1PKZA 2XBIA 1JLWA 1GSFA 1B4PA 3FZAA 1K3OA 2H6ZA 2K6VA 4K7NA 1TP9A 3TRQA 1ZL9A 2VCQA 1XWBA 2GT6A 1OYJA 4MH3A 2WDUA 3VK9A 3ZFLA 3ME7A 1FVJA 1AIUA 3PPUA 1S3CA 3C71A 5ENUA 3TCOA 2CZ3A 4Q5FA 4RQRA 5G5EA 1ILOA 2YNXA 1IYHA 3ZIVA 2B5YA 3C73A 3WGXA 1PD21 1A8LA 4I5QA 3TKSC 3H93A 4HU9A 4OO5A 4AGSA 1M2BA 1TJDA 1EOHA 4BL7A 2WZ9A 2VL3A 2LNSA 1JZWA 3F4TA 2HRKA 3M1GA 3DVXA 4AJ8A 5D96A 3IE3A 2GLRA 2YCDA 3R2QA 3FEUA 3IC4A 1GNWA 3O76A 3GX8A 1K0AA 4WBRD 2YP6A 2O89A 4HU7A 2K9FA 2OBIA 4I2UA 1K0NA 3A5WA 3P90A 3LYPA 2DMMA 4V2NA 5D9TA 3F63A 4EXJA 4PNFA 2C1YA 3RAZA 2JZSA 2P5RA 2HRKB 3DMLA 4KA0A 4MZWA 1EWXA 2VL2C 3BD2A 5JCGA 1EV4A 5IPGA 5D73A 2N5BA 1GLQA 3VPTA 1GTUA 4KF9A 4HI7A 1PMTA 3O6TA 4XRAA 2C80A 1NW2A 3P7XA 3CBUA 3GH6A 3KP8A 1YF0A 5CRWA 4EO3A 4G19A 3UARA 4XS6A 3F6DA 4ZL7A 4NV5A 2IMIA 3VI7A 4GSSA 1Z3EA 3H8QA 2PUKC 2VD1A 1G0TA 5F06A 2R37A 5EPFA 5IMVA 1O85A 2HRAA 4GQFA 2O7KA 4DSRA 4IQ1A 4NMUA 1FB6A 1O8XA 4F9ZA 4POKA 1Y6EA 3ZVJA 1PX7A 5ECNB 2BTOT 4LMVA 4BWQA 3QAVA 1FW1A 1WMJA 4TXVA 3MAKA 3VLNA 3E3EA 4KE3A 2YN1A 4J56E 3HHVA 5HQPA 4N0VA 4G9HA 2NDOA 3BOAA 1M99A 1JZDA 4GRFA 5F05A 4Q5NA 1HD2A 1SL2B 1K0DA 4F2IA 1G7EA 1VGLA 5CRHA 1W4VA 2JZRA 2M72A 4ILFA 3HVVA 5EVOA 2VD0A 5H5SA 2RM5A 4IGJA 2CVDA 1EGOA 3GTUA 3WD6A 1UVZA 3HKRA 4JU5A 1GUHA 4MPFA 2JADA 4OO4A 2TIRA 2FUG2 2OKAA 4L5LA 1LU4A 3SWLA 3UVTA 4GSTA 1TRUA 3FZ9A 1WRYA 2E2GA 1TK5B 2DC5A 4MF6A 3SBCA 5FHIA 1M7TA 2OADA 2ALBA 3L9UA 1GTAA 1B9YC 3LWAA 3HY2A 4KSOA 3KMOA 4MJBA 1RW1A 2A2RA 1QUWA 2ZCTA 3GTUB 2LRCA 4LA1A 4N11A 5ELGA 2LRTA 3DVWA 3D6IA 4IHUA 1T7PB 1FOVA 4PNGA 3LYKA 3CTFA 2HQTA 4G10A 3M0FA 2DJ1A 2HYXA 3IOSA 2B6MA 6GSYA 2N5AA 1R5PA 3LORA 3D5JA 2HE3A 5HR3A 3UVHA 2PPTA 3GL5A 2VLUA 1ZMAA 5CAXA 3HJPA 4NPBA 4ZILA 1M9AA 1Z5YE 1GUMA 1SL1B 2R4VA 3F9UA 1AC1A 4OCEA 5G1KA 1DUGA 3QDNA 2AV4A 4J2FA 4O7HA 4DEJA 3NZNA 1VF3A 4N10A 3GKXA 3APQA 2LKUA 4BVXB 1FVKA 2CX4A 1E6BA 19GSA 2C3TA 2VCVA 2HZEB 3CMIA 4G0LA 1EV9A 2IN3A 5IMFA 3KIJA 2PN8A 2O8VB 2GZYA 2B1LA 2NPBA 1EGRA 1PQNA 2YJHA 2R3XA 2ON7A 4BVYB 2QC7A 2WRTA 1GTBA 1Z9HA 4TR3A 3F8UA 1PGTA 1OAZA 4TW5A 2YOIA 1I5GA 3HVSA 4G2EA 2LJKA 3GFKA 1GWCA 1DBYA 1URMA 1X0RA 1USBA 3ED3A 4POMA 3U5RE 1AUCA 1TI1A 1V9WA 1XWGA 2O85A 2FA8A 3GIXA 2V2GA 4K8MA 1AXDA 5DALB 5KN2A 1F3BA 2GT5A 3FW2A 13GSA 4YAPA 2WCIA 3TB2A 1YY7A 2I3YA 1PA3A 4KCAA 4EE0A 1R4WA 2P5QA 4PXOA 2YWNA 3LSZA 2WJUA 1UA5A 5A4UA 5INYA 2JSZA 2L6DA 2H01A 2VOCA 1EP8A 5DCHA 2L4QA 4JBBA 1S3DA 4IVFA 2I9HA 5EY6A 5AIVA 3CTGA 3KJYA 5ABRA 2FNOA 3E9JB 2IL3A 3EMPA 5D9WA 1TKDB 2V6OA 1X5DA 3TKQA 3GL3A 3FK8A 5IMCA 1XPVA 3WT2A 1HNCA 4XTSA 1MDKA 5GAPD 4FYUA 3G7JA 1V98A 3LEFA 2MYGA 3IAM2 5DJMA 3RHCA 2MBTA 1IYIA 1T1VA 1TK8B 3VI5A 2IFQB 1XWKA 1H75A 3H1NA 4ZBBA 2K18A 4MLYA 4CHSA 3FHKA 2LTKA 3FRCA 5IM9A 2BMXA 4HQZA 4LL1B 3OR5A 4ECIA 7GSSA 2OBKA 5AN1A 1N2AA 1FAAA 5ECOB 1BEDA 1Y25A 2LSTA 3TJBA 12GSA 2LJAA 5HFIA 1HYUA 1VF2A 5KEJA 2VCTA 3KH7A 5ECLB 1HNBA 1GSUA 5IMAA 2A2SA 5DQSA 1OVNA 4V2LA 3VWUA 1GL8A 3QD9A 2HXKA 1SK2A 3D4TA 2C0DA 3GUSA 5CP1A 5F0GA 3ZL5A 2H1GA 3P2AA 17GSA 4TOPA 2VM1A 5G31A 1V58A 2H74A 3TOTA 2IMEA 1THOA 1SD8A 3IPZA 2H76A 1WE0A 2H6YA 2MMNA 4OMVA 2DJKA 3H4KA 1TU7A 1A2LA 2AHEA 2VUPA 4GCIA 3F4SA 2H70A 2KP1A 2PWJA 1ZYQB 1SKSB 3TGZA 4Q5RA 3C7MA 3TDGA 2VIMA 3HZ4A 4MP4A 5ELAA 4TKYA 5ECHB 2G2QA 2PERA 4I8BA 3F6FA 3QAWA 3CSJA 1AQWA 2LS5A 2J23A 5BMUA 3VWXA 3Q19A 4ZBDA 3TOUA 1G6WA 3MWHA 4ZB9A 4BL7B 3ZRDA 4TR1A 5COHA 3IHQA 4PQ1A 2P31A 1TTZA 2C0GA 4TXOA 1A24A 2YV9A 4D73A 1SJIA 1BJXA 5AIXA 4ZBAA 2EIRA 6GSXA 3N5OA 2GDRA 1BG5A 2L59A 2H8LA 1N8JA 3MDKA 5D93A 1SKWB 4BPYA 1OE7A 1PN9A 2FWFA 4JZQA 2GQKA 3ERGA 4QL9A 4E8EA 1DE1A 1SK0A 5DDLA 1HNAA 4MJAA 4IELA 2PVQA 4FYCA 3LGCA 10GSA 4KDYA 3APOA 2UZ8A 2HSNB 1YZXA 4TXOB 3MSZA 4D73B 2L5OA 4QL7A 3I9V2 3EE2A 3DGQA 1V40A 1SJ6A 4EF0A 4HZ2A 3V1WA 4IW9A 4PGTA 1OC3A 5IO0A 1TDIA 2PGTA 3D21A 3HZ8A 2X8HA 2OE0A 2YZUA 1XOAA 4HUAA 1QMVA 3KTLA 4KCEA 3GURA 2X8GA 5DQYA 2C4JA 6GSWA 4X1UA 3GN3A 1JLVA 2LQQA 3HDCA 3I6AA 4X43A 3F4RA 4TRXA 5CO3A 3LQ7A 2TRCP 5CYYA 2DJ3A 3IRAA 3F3QA 4FH8A 4EDZA 4XCSA 1ZCPA 5G2ZA 2B3SA 3EURA 2DSAA 4BWSA 1YF1A 2IJYA 2HZFA 4KDXA 1U3AA 3QPMA 18GSA 1T4YA 4HQSA 1DE2A 3EYTA 1SYRA 20GSA 1U6TA 3ZYWA 4MABA 2GTUA 3TUEA 1SU9A 5IOXA 4NHZA 3J7Yb 4FQUA 5GZZB 4GTUA 4O5RA 1K3LA 3GYKA 1GP1A 2RUEA 2ZNMA 1U3IA 5F07A 5ECIB 4HZ4A 2HLSA 5CRDA 3TKRA 4LL4B 4PURA 2B5XA 1WIKA 2C0FA 4HS1A 2BJXA 2AYTA 3W8SA 5FT3A 2DJ0A 3RDWA 4I2TA 3LG6A 1U87A 3DD3A 3D22A 5ECPB 3GKKA 4YAVA 4RI7A 4F82A 2OE1A 2CVBA 3D4MA 1C72A 2WGRA 3A2XA 1ML6A 3UIWA 3LXZA 1OC8A 3ZREA 4DSSA 5JWOB 3QMXA 1EEMA 3D0ZA 4HEA2 1RK4A 3L0HA 5KN1A 14GSA 1K0MA 3JCML 3QOUA 4ZL8A 3S9FA 5D8IA 3W6GA 4GLTA 1SKRB 4G0KA 3NOFA 4F0BA 3FZ5A 1U88A 2EC4A 1F2EA 3Q74A 5B7CA 1EEJA 3PINA 2PVOC 1B4QA 3RPPA 1ERWA 2CX3A 4ZL9A 1J08A 1NSWA 1F3AA 3E0UA 1O73A 1PL1A 3HJOA 2JSYA 2CV4A 4OFNA 1ACVA 3G7IA 4NV2A 2RM6A 2CQ9A 4O92A 2R6KA 3M9KA 1NHOA 2DBCA 1QQ2A 2WFCA 3ZZXA 4V1Ap 3ERFA 1O6JA 3IAS2 4N30A 3UEMA 2L5LA 3GKMA 3C1SA 4V1Ag 5AISA 3VWVA 1SENA 3TJGA 3L4NA 4XIHA 1G6YA 2I1UA 4GWRA 4AF2A 5KN3A 1UN2A 2VCWA 3PGTA 3QFBC 3RPNA 3DEXA 2FHEA 4MPGA 2YANA 2F3MA 5A4VA 4IQAA 2QGVA 3CYNA 3CSHA 2B5EA 3DWVA 5JWRB 1XFLA 2NVLA 1M0UA 1GSEA 4MF5A 2N5FA 3FR9A 4G0IA 2V32A 3APSA 1CQGA 5B8BA 1X9MB 2FGXA 2VLVA 4NHWA 2H19A 5J3RA 1XW6A 5LD0A 2JL4A 1WWJA 4MZBA 2F8FA 2CVKA 3MNGA 1XW9A 3HD5A 3TJFA 3QFAC 1GUKA 1NM3A 5HR2A 1O8WA 2K8VA 3GSSA 4JEDA 1S3AA 1O7UA 4L0UA 4ZB8A 3KTBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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