4ISDA

Crystal structure of glutathione transferase homolog from burkholderia gl bgr1, target efi-501803, with bound glutathione
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
211
structure length
187
Chain Sequence
SQKPITLYVGADYVSAFAMSAFVVLKEKGLDFEIRTVDLKSKQQEVSLTRRVPTLQHDRFTLSESSAIAEYLDEVYPAPHYAAVLPADRETRALARQLQAWIRSDFMPLGEAAQLACEKLLSAADRLIDDERYGVFGDWCIADTDFALMLNRLVACGDPVPPKVLRYVERQWARPSVQQWVKQKRDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of GLUTATHIONE TRANSFERASE homolog from BURKHOLDERIA GL BGR1, TARGET EFI-501803, with bound glutathione
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Burkholderia glumae
total genus 65
structure length 187
sequence length 211
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14834 GST_C_4 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4isdA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4isdA01
4TOPA 2X99A 2XBIA 2AJQB 1FVJA 2C0FA 4J2FA 4PQHA 2ON5A 1GWCA 5ECIB 2IFQB 3ZZXA 2MMAA 3P7XA 2DC5A 2OA7A 1R5AA 3K8NA 5CRHA 1YKCA 1WP0A 2M80A 4ZL7A 2JSYA 3HHVA 1THXA 2YANA 4KA0A 1FB6A 1HNCA 2HRKA 4OFTA 2LS5A 4H86A 4IP1A 3Q18A 2X8CA 3TRQA 2VLVA 4I97A 5CRGA 2G2QA 1Z5YE 2HRNA 1SU9A 5HR1A 2L6DA 4IS0A 2LQOA 2ZNMA 3H93A 1DE2A 2K9FA 2B7JA 3RHCA 1V40A 1EWXA 4ECIA 4V2NA 1YQ1A 4MA9A 4G19A 2H72A 5GAPD 1PSQA 4FQUA 3IK9A 2FUG2 4DSRA 5ECSA 2BMXA 2YZUA 3WGDA 4LL1B 1XWAA 2YJ7A 3EMPA 4OD7A 3M8NA 1BG5A 1WPIA 4PURA 1Q98A 4GQCA 4WEYA 2GZZA 3PGTA 4PQ1A 4DVCA 3UMAA 4NAXA 2FWFA 2NPBA 4AF2A 3RAZA 5IPHA 4KGIA 4PUAA 1BAYA 1EV4A 4V2LA 4MH2A 2V41A 4MPFA 2O7KA 3G9BA 1GSYA 3GNJA 3D21A 2EC4A 2FWHA 1T1VA 4KSOA 4MDCA 5ELAA 1K0MA 1YJ6A 1SJ6A 2YCDA 3ZIVA 1UVZA 1JZDA 3DWVA 2GSQA 3TB2A 2H74A 5F06A 2WDUA 3MDKA 2TRXA 2HI7A 2AAWA 1Z9HA 4IBPA 3ZMKA 1S3AA 4X0XA 3EINA 5DAKB 1O7UA 4WKWA 5IO0A 2HRFA 1G0TA 1Z7RA 2EIQA 1LBKA 1A0FA 1YF1A 3SWLA 2AHEA 1PRXA 1R26A 1EEMA 1TOFA 2PU9C 4IGJA 4GCIA 2HSHA 4F03A 5HR3A 3A2XA 1FAAA 4EDZA 3LYKA 4G9HA 4OMVA 1TTZA 1AIUA 3QMXA 4TKYA 3ED3A 3VPQA 1K3YA 4KW6A 5CRWA 1RK4A 3L78A 5FT3A 1M99A 1ILOA 10GSA 4JR4A 3EYTA 4OFMA 2LUSA 2CVDA 4GSNA 2KUCA 3US3A 1T8EB 3WGXA 2P5QA 2IMEA 2IWTA 5D9XA 2N5AA 4KCAA 5DJLA 2VLTA 2RUFA 2PGTA 1FB0A 4XCSA 5FHIA 5ECKB 1SL0B 3P90A 1MEKA 1YZXA 2CVKA 3F63A 2PPTA 4YQUA 1I9DA 4YH2A 1HD2A 1AC1A 2E7PA 4TR1B 3GMFA 1WOUA 1IYHA 3GH9A 1M0UA 5DVBA 1O6JA 3C8EA 3U6VA 2FA4A 5KN0A 1OE7A 1EZKA 3KEBA 4BVYA 5H5RA 3EU4A 1BJXA 2X64A 6GSSA 1SD9A 4XS4B 2HSYA 4K9ZA 3AY8A 4K1FA 2VCZA 1ZGNA 2LQQA 4EE0A 2H1AA 1XXUA 4WF4A 5BMUA 2H76A 6GSUA 1NM3A 3A2WA 3M0FA 2VUPA 3FZ5A 4MMMA 2I1UA 5G2ZA 2CA8A 2H1GA 2RM5A 4CW9A 3KTBA 4JR6A 1KEBA 4N10A 1F3AA 4NV5A 5CREA 4RUVA 3KP9A 5AIVA 4MJBA 2DIZA 1ERTA 1TK0B 3QR6A 3VK9A 4HS1A 2L59A 1H4OA 2LNTA 3TKSE 5GAND 3H79A 1B4QA 2CAIA 3TGZA 5G31A 2LJAA 1FO5A 2JZSA 5IMFA 2E2GA 4I2TA 5KN1A 7GSSA 3DVXA 2IMKA 3QDNA 1GLQA 2GLRA 3DD3A 2L4CA 2A4VA 3F0IA 3UAPA 1K0NA 2FWGA 11GSA 2GSSA 2YWMA 1C72A 4OWYA 3IXRA 4ZL9A 2V32A 3BBYA 5C00A 1XBSA 2FY6A 4O92A 5ECMB 2DJ3A 1NHOA 3RPPA 3LXZA 1X9MB 2FD3A 3EURA 3IPZA 2J9HA 1EGRA 4KAEA 2K6VA 1LU4A 1E2YA 2IPAA 4ZIJA 16GSA 4KF9A 1W89A 4ML1A 2LNSA 1T4YA 1K0AA 4EKZA 5JCGA 2LRCA 1O81A 4XHMA 5DALB 1HNBA 1PQNA 3OR5A 2H6XA 3GH6A 4HOJA 4AJ7A 5INYA 3APQA 1TI3A 4MCUA 1SK0A 1SENA 1OC9B 3ZTLA 5G30A 2H01A 4MZWA 4PNGA 2YWIA 3GX8A 1UC7A 5EPFA 2HRKB 1X5EA 3UOMA 1AQXA 1F6MC 1PN9A 1AQWA 1V58A 1ERVA 4GWRA 1TU8A 1OVNA 3FW2A 3PH9A 2JU5A 2L5LA 3D6IA 1B4PA 1TK5B 1FVKA 4QL7A 3GYKA 2KOKA 3DXBA 4IVFA 2GSTA 1AAZA 3GN3A 2C0GA 3GSSA 2E2MA 5J3RA 1Y6EA 5CNWA 1Z6NA 2CX4A 2HSNB 2P5RA 5A4WA 2ES7A 4NHZA 5D9VA 3F4TA 1GRXA 5EY6A 2O8VB 4KNDA 4BA7A 1J08A 3RHBA 3F4SA 3HKRA 4F82A 1USBA 4GXZA 3CMIA 3UIWA 2VO4A 2C80A 1NHYA 2VD0A 4GTUA 1NSWA 3F3RA 4PQIA 2B5YA 4BVXB 4ZB6A 1XWBA 3EE2A 3IK7A 1ON4A 2FCHA 4FH8A 4V1Ag 1F2EA 1HNAA 1O8WA 3ZLPA 2ZCTA 4JE1A 2EIRA 2B3SA 2ZUPA 4CHSA 3HXSA 1ABAA 4MP4A 3DGQA 2QC7A 2B1LA 4GSSA 2VL3A 3D4MA 2GT6A 4XTSA 1EEJA 1M2DA 4EC0A 3L0HA 4LL4B 2PVQA 4YQVA 1U3AA 2R5GA 4I2UA 4PUFC 2XBQA 1WE0A 3GTUA 4J57E 1FHEA 3ZITA 4ML6A 1FW1A 3C1SA 2MMOA 1DSBA 5ID2A 3DMLA 4N0VA 1RQMA 5H5SA 2AYTA 3NZNA 4N11A 4HZ4A 1B9XC 3TKPA 3IOSA 4V1Ap 2JADA 1DBYA 2QSIA 4MZBA 1GSEA 1JFUA 22GSA 1GUKA 2FGXA 1SL1B 3KP8A 1EP8A 3W6GA 2F3MA 4BWSA 4Q5NA 3GL3A 4EVMA 3V1WA 1H75A 5EL8A 2MBTA 2HSMA 1OC9A 2YWNA 1V9WA 3MWHA 1SYXA 1OKDA 4LLRA 3FHKA 4ILFA 2CZ2A 4MJEA 4ZILA 1TK8B 1G7EA 1O73A 4I5QA 2YN1A 4NPBA 5JCWA 2LTKA 2R37A 4EO3A 3KTLA 3W8JA 2OADA 5CAXA 2IMDA 3CTGA 3GSTA 4ZB9A 9GSSA 1J9BA 3KMOA 3TCOA 5HQPA 3KXOA 2KLXA 3CXGA 2JACA 1R7HA 4TN8A 3M1GA 3GL5A 3F3QA 2EIOA 1J0FA 1N8JA 3QFBC 1K3OA 5G5FA 1GTAA 4MK3A 2I81A 1ZOFA 5ECNB 4BVYB 1B9YC 1K0BA 2HYXA 3TOUA 4GLTA 3HCZA 6GSXA 3L4NA 3LJRA 1SKRB 3LSZA 1TI1A 3DEXA 1OC3A 2VCWA 1ZL9A 1HQOA 1WIKA 2IL3A 3GKNA 1XW5A 3LWAA 6GSVA 5G1LA 4WR5A 5DQSA 4ZL8A 4BVXA 3KD0A 4MABA 3QFAC 1MDJA 3GHAA 1ZCPA 3VWWA 1K3LA 2YNXA 2B5XA 5F0GA 1R5PA 1XVWA 4QL9A 5D8IA 1GTIA 4JEDA 1GSQA 4BPYA 3G7JA 4OFNA 4K7OA 1YEPA 3VWXA 3R2QA 3IRAA 3LXTA 3TRPA 1XW9A 4BWQA 2RIIA 2DJJA 3IBHA 3GUSA 2KHPA 3O76A 2FWEA 4KX4A 2VCQA 1ML6A 5AIXA 2L5OA 2A2SA 3VLNA 1VGLA 1EOHA 4MF7A 3VI5A 2Z9SA 2IIYA 3WT1A 3JCML 4HEA2 4XRAA 4IKHA 5DJMA 3WGEA 3N5OA 4NXIA 1PGTA 5KN3A 3TKRA 2V6KA 4TVEA 3J7Yb 1K0DA 2YPMA 2P31A 3GFKA 5ECQB 1MD4A 4TR0A 3A5WA 1TXXA 3GKXA 1SD8A 2DJKA 2IMIA 1XZOA 3VURA 2AUVA 3ZVJD 4K0NA 2E0QA 1TRUA 3S9FA 1GSDA 4PXOA 3APSA 3TJKA 3MAKA 4KCEA 4N0ZA 1A2LA 5IMZA 4WBJA 2VCTA 2OJLA 1SYRA 3H1NA 1VF3A 4K8MA 4GF0A 3J7Yk 2YJHA 2F51A 1WWJA 3UJ1A 1SKSB 2F9SA 4JRRA 1TDIA 5A4UA 1JLWA 3E3EA 5ABRA 3QAVA 4KB3A 2QKEA 3KCMA 4KE3A 1QK8A 3VPTA 4NV2A 5JWRB 2PERA 5IMVA 4OCFA 5HFIA 4YAPA 4L5OA 2A2RA 2VL2C 3KGKA 2HZFA 2AB6A 1UA5A 2CX3A 2LRTA 1XOAA 3W8SA 5IOXA 4NWYA 4I8BA 3VWUA 3ZREA 2WJUA 4L0WA 3CSHA 3UBLA 4EL1A 3O6TA 1XFLA 3KIJA 5IO2A 3QPMA 4QQ7A 2O87A 4F0CA 3GRXA 3IC8A 1A2MA 3ZVJA 2H6ZA 4NHWA 2I3YA 2HNLA 1EP7A 1FG4A 4V2MA 5JCUA 3HZ4A 4X1UA 1ZYQB 4KDYA 3CRUA 4F0BA 13GSA 3GV1A 5CYYA 2H0GA 2HQTA 2VL9A 3QAWA 4HQSA 3IAS2 3ISOA 1PL1A 3PINA 4TR4A 14GSA 5HR2A 2JZTA 4PNFA 2LSTA 1QUWA 3HJOA 4IJ3A 2H6YA 2FHEA 3TKSA 1DUGA 4P3YB 1SJIA 5IIZA 2L6CA 4O5RA 3ZFBA 4HUAA 4L5LA 1XVQA 3P8WA 1URMA 3LQ7A 2LJKA 2GVPA 2C8UA 3GTUB 4WBRD 4ZBBA 1S3CA 18GSA 1TP9A 2IN3A 3UL3A 2H0HA 4RQXA 4HJ2A 1XIYA 4ECCA 1GH2A 5DQYA 4YAVA 4HQZA 3SBCA 5ID2B 1GUHA 2GZPA 3TOTA 3QAGA 4ISDA 4XS6A 5F07A 3TUEA 3PR8A 3H8QA 1XWKA 4ID0A 2C0EA 2M72A 1TW9A 1EV9A 4OCEA 2XHFA 3KH9A 2HZEA 4BL7A 1GP1A 2GDRA 1U3IA 2HSMB 4KH7A 5EVOA 1QMVA 1MD3A 1VRSD 1I5GA 3ZRDA 2X8HA 3C7MA 4JU5A 1YF0A 1T3BA 1GULA 3N9JA 3LFLA 1OKTA 4USSA 3VI7A 2MZCA 2VM2A 2B1KA 1G6WA 2CV4A 2DJ2A 1OYJA 1A8LA 4D73A 3RBTA 3C1RA 5B6MA 5ECHB 1BQ7A 4ECBA 1T00A 4FIWA 3HVXA 5AGYA 2L57A 2H71A 3F6DA 1LJRA 5DCGA 2WULA 5B8AA 1T7PB 3CBUA 2B5EA 1TU7A 5IOWA 3M9KA 3MNGA 2C4JA 1V2AA 3I9V2 4F9ZA 1YEXA 3L9UA 4IQ1A 1GNEA 3F6FA 2QGVA 5JWOB 2JL4A 4KDXA 1B8XA 2TIRA 5DBQA 2I4AA 1JLVA 1GLPA 2NTOA 4PTSA 2L4QA 4AJ8A 2D2ZA 3LORA 1QXHA 5D93A 2VOCA 4IHUA 3F4RA 20GSA 4RQRA 4EUYA 1GSUA 4G0LA 2CQ9A 3KZQA 2DIYA 5B7CA 5L71A 1WMJA 1VF2A 4TR3A 4ACSA 3FYGA 3IR4A 1EOGA 2MYGA 3HDCA 2G0FA 3TKSC 2OBKA 4ZBDA 1SJZA 5KEJA 1O85A 4GQFA 1U6TA 3HJMA 1WJKA 2C1YA 5D9TA 3RDWA 5ECOB 1TRVA 3FKFA 1QQ2A 3A2VA 1JZWA 1V57A 3FK8A 2RM6A 4Q5QA 2K8SA 1XW6A 2C3QA 3FRCA 2DMLA 4K0GA 3IC4A 3L9SA 2R2JA 1M9AA 1QGVA 2WRTA 2NVLA 2J23A 2B7KA 1GSSA 4G0IA 4LMVA 4FYUA 2F8FA 2KP2A 3FZAA 3ZIJA 1TRSA 1X5DA 3TJJA 1GNWA 3FR3A 1OE8A 3U5RE 4ECJA 1W4VA 2VL2A 1JHBA 5IMCA 2BTOT 3H4KA 1AUCA 3PPUA 2FNOA 4KSMA 3MSZA 4O7HA 4PX1A 2V6OA 6GSYA 3ZYWA 2YZHA 3IAM2 3LG6A 2X8GA 1X0RA 3IHQA 5C04A 2VIMA 1QFNA 1GTUA 3FR6A 4HZ2A 2NBSA 5GSSA 5F8BA 3HA9A 4IJIA 1XWCA 1ERUA 2LJRA 3ERGA 3L9VA 1FOVA 5KN2A 3G7YA 4K6XA 2XC2A 3HZ8A 5CRDA 3M3MA 3BD2A 3CSJA 4L0UA 5DCHA 1OAZA 1XOBA 3Q19A 2VCXA 1XPVA 3I6AA 1XWGA 2MMNA 1UN2A 1F9MA 2VM1A 3ME8A 1S3DA 2BJXA 5GSTA 3CRTA 1U88A 2DLXA 4POBA 1A2JA 1F3BA 3LYPA 1F37A 4G2EA 3DKSA 4Q5RA 2OE0A 5B8BA 1RW1A 2K8VA 2H1BA 5COHA 3HVSA 2FA8A 3TKQA 1X9SB 5G1KA 3QD9A 3BJ5A 2GSRA 4I6XA 2GGTA 4MZCA 6GSTA 4EXJA 1AXDA 2IJYA 2PUKC 4E8EA 3RPNA 4DSSA 3E9JB 1E6BA 2H8LA 2C0DA 3E0UA 2VCVA 3UARA 3DIEA 4XRDA 1A24A 2WCIA 3FZ4A 1SKWB 3EC3A 12GSA 3GIXA 4TXVA 4J56E 4ZB8A 2OKAA 3I43A 3QCPA 3GKMA 2M46A 2JSZA 3TDGA 1X5CA 5ENUA 8GSSA 2N5FA 5IQYA 4K7NA 1THOA 2WFCA 3HYPA 3F8UA 3LGCA 2NDOA 3TJGA 19GSA 4HU9A 4POLA 3ERWA 4TXOA 2WZ9A 2I9HA 1PKWA 5IMDA 4G0KA 1M9BA 3HJPA 2YOIA 3GA4A 1MDKA 3FY7A 4MJCA 2HZEB 4BL7B 2OACA 2IMFA 2DSAA 2IFQA 1CQGA 4IELA 2C3TA 1GUMA 4LMWA 2RLIA 4WR4A 3GX0A 4X43A 3LEFA 5J4UA 4EF0A 4WF5A 3IA1A 4JZQA 2GS3A 2VLUA 4POMA 1N2AA 2REMA 5HFKA 5B6NA 1ZMAA 1Q4JA 4NMUA 3APOA 4Q5FA 4D73B 1JZRA 3I69A 4IP6A 4HDEA 4IN0A 4ZXGA 1HYUA 4GSTA 2MBSA 5LNKe 4WXTA 1JZOA 3QOUA 2R3XA 3DVWA 1M2AA 1A23A 2CVBA 1M7TA 5JWQB 2H70A 5GZZB 1XCCA 2GQMA 4MF6A 3BCIA 1G7OA 4RI7A 1ZYEA 2GT5A 2H75A 2HE3A 2CAQA 2B6MA 2N5BA 2FLSA 3NIVA 5D96A 4AJ6A 5D73A 2YWOA 2CZ3A 4G10A 2R4VA 2HXKA 1PD21 3EU3A 1YY7A 3C73A 1Z3EA 5CP1A 3D22A 1AW9A 3VWVA 1A8YA 3FZ9A 2O89A 4FYCA 1VF1A 1Y25A 4HJMA 3FEUA 2RUEA 4LA1A 2H30A 5ECLB 4POKA 1IYIA 3BCKA 5DDLA 3WD6A 1ZZYA 1YKAA 1PL2A 1NW2A 3HVVA 3ME7A 5ECPB 5J41A 5A5KA 2OE3A 3C71A 2PVOC 2TRCP 3TJFA 1PX6A 1PA3A 2H66A 5DAKA 5D9WA 1MDIA 4DEJA 3ZFLA 2PWJA 1T4ZA 5AISA 1GL8A 4HI7A 3R3EA 2CT6A 2O85A 5ELGA 3Q6OA 1K0OA 1PX7A 1KNGA 3DRNA 2LKUA 2ALBA 3HD5A 1ST9A 3UVTA 1CQHA 4MPGA 1BX9A 3IDVA 2JZRA 3BOAA 3ZL5A 4E8HA 2F8AA 3D4TA 1EGOA 2WS2A 4OO5A 2H19A 5ECRB 4L8EA 2GQKA 5AN1A 5J9CA 3KJYA 3CSIA 2R6KA 5J5NA 1ERWA 2OBIA 1KTEA 1SK2A 3Q74A 3NOFA 2YV7A 2DJ1A 4IW9A 1TKDB 3UEMA 2XPDA 3UVHA 5E4WA 3ZMLA 3TRXA 2YP6A 2C3NA 4GRFA 1YDKA 3EVIA 3VFIA 3G7IA 3CTFA 4CDOA 1VF4A 5FWGA 1GSFA 2LV3A 2HRAA 4TR1A 5LCZA 3FR9A 1PMTA 3WT2A 5HR0A 3O3TA 1GTBA 4IQAA 4K7IA 1SL2B 4K2DA 2VD1A 3KM6A 3IV4A 3D0ZA 4XS4A 2GQLA 2XPEA 2AV4A 4FO5A 2VAFA 1K0CA 5J9BA 4F2IA 5IPGA 4TW5A 1X9WB 5CO3A 3CYNA 2ON7A 1PKZA 4WETA 1MTCA 1G6YA 4HU7A 2OE1A 1OC8A 4EDYA 4N30A 4XIHA 3F9UA 1U87A 3TJBA 1ACVA 5IMAA 2DJ0A 2WB9A 2H0IA 1A0RP 4XS1A 3DYRA 4JBBA 3EMXA 3UBKA 3GKKA 1DE1A 3IE3A 2V1MA 1M2BA 2K18A 2DMMA 2GTUA 3GURA 1Z7PA 1BYEA 4OO4A 1V98A 3D5JA 2HFDA 2LEGA 5G5EA 4O32A 5A4VA 5E59A 5H5QA 2V2GA 1TRWA 2DBCA 2PMTA 2PN8A 4ULXA 4DSSB 3KMNA 2HLSA 3M9JA 4ZBAA 5IM9A 3EWLA 4PGTA 4MH3A 3WYWA 4AGSA 3A3TA 2PBJA 4KUNA 5HFGA 4MJAA 1AQVA 1WRYA 2P0GA 17GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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