4JZQA

Crystal structure of human clic1 c24d mutant
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
QPQVELFVKAGSDGAKIGNDPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure analysis of CLIC1 C24 mutants
rcsb
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4jzqA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jzqA01
2L6DA 4WR5A 1O6JA 4WETA 2VL3A 5DALA 3UARA 1Q4JA 3TDGA 2DJ3A 4MMMA 4L0UA 4POBA 5H5SA 3IRAA 3RBTA 1U3IA 4OCFA 5BMUA 3S9FA 2ON5A 2O85A 1TI1A 3NZNA 3FR6A 3WGDA 5J4UA 2VLVA 2H1BA 4TXVA 4HU9A 3ZIJA 1MTCA 3GKNA 3VI5A 2GSQA 2XPEA 5IM9A 4LMVA 1A23A 5C04A 1F2EA 1TK5B 4KF9A 3A2XA 1OKTA 2CAIA 2UZ8A 3SBCA 3TB2A 22GSA 1K0BA 2O8VB 2NVLA 3HVSA 4OWYA 1VF1A 4O92A 3D4TA 5LNKe 1ST9A 3DMLA 1A24A 4KDYA 4MZWA 2NPBA 4Q5NA 4POLA 1Y6EA 2H70A 2CVKA 2E2MA 4FQUA 3TJKA 1AQXA 3FZAA 4HU7A 4P3YB 5HR1A 2H0GA 1GTAA 3GHAA 4N10A 3ZTLA 2F51A 4I2TA 1OYJA 2YPMA 1NHYA 4F82A 5J41A 1GWCA 3VWXA 4O32A 1T00A 2HSNB 3IC4A 3HKRA 3ME8A 4IQAA 4NHZA 5B7CA 2B6MA 2OE0A 3GV1A 3H79A 4Q5QA 2TRCP 2OKAA 1HNBA 2C1YA 1JFUA 2MMNA 2V1MA 4G2EA 1K0CA 4HQZA 1TP9A 5D73A 3ERGA 2XPDA 1TU7A 4JZQA 1V40A 1A2LA 1R26A 4XS4A 2V2GA 4PGTA 3WT1A 3EWLA 2LEGA 3HVXA 1B8XA 2GDRA 3VLNA 1UVZA 1XW6A 1YQ1A 2EIOA 3G7IA 1SK2A 3Q74A 2IWTA 3TJFA 3GL3A 3ZL5A 1HD2A 1SJZA 3F8UA 3EU4A 2XBIA 2L57A 3HZ8A 4HI7A 4G19A 2WGRA 5IMCA 1WJKA 1E6BA 3W6GA 4MA9A 4ZB9A 1M9AA 2L5OA 2FA8A 3GL5A 4ML1A 1B9XC 3ISOA 2LJKA 1XWAA 1MD3A 4ID0A 1EGRA 3ZIVA 4OO5A 1X9SB 1CQGA 4IW9A 1HYUA 5INYA 1BYEA 2C80A 2MYGA 1QFNA 2C0FA 2KOKA 5DJLA 2FA4A 3FR3A 2GZYA 5B8BA 3IR4A 3ERFA 1Z5YE 4IS0A 3CRTA 2YN1A 1KTEA 4MPFA 3ZITA 2OBIA 3L9UA 4MH3A 4IP6A 3HVVA 4AF2A 4IGJA 2VLTA 1UN2A 2XC2A 1RW1A 1XBSA 3TOTA 4BPYA 4TR1B 3PH9A 2IIYA 3F4SA 4L0WA 4WKWA 3DIEA 2JSZA 3IK7A 3RHBA 1ZYQB 2V6KA 1SENA 5G31A 3D0ZA 2GZPA 1U87A 2IPAA 4E8HA 1O7UA 2JL4A 1NSWA 1SU9A 2KLXA 2AYTA 4KE3A 4F0BA 10GSA 3WYWA 4K1FA 5DCHA 2K8VA 3GFKA 1GNWA 3LQ7A 4ACSA 4WF4A 2G0FA 5GSTA 3MAKA 4TR4A 5A4WA 1XWKA 4K9ZA 2NTOA 1F3BA 4BL7B 1FO5A 1M9BA 2HRKA 1Z6NA 3PINA 5IPGA 5LD0A 2DMMA 2GQLA 4TR0A 1B9YC 1A0FA 3LG6A 3GKKA 3C71A 5G2ZA 4GSTA 1PGTA 1WIKA 4V1Ap 4HOJA 6GSWA 5GSSA 4V1Ag 2GGTA 2P5QA 3L0HA 2YP6A 2OBKA 4BWSA 3G7YA 3ME7A 1N8JA 2E0QA 3A2VA 4HJMA 2KHPA 2H71A 3UEMA 5DBQA 2VM2A 2IMFA 1H4OA 3LORA 2TRXA 1GLPA 1YJ6A 2K8SA 3GA4A 3QCPA 5ID2B 1W89A 1ERWA 2L59A 4XHMA 4QL7A 3ZFLA 3F63A 5G30A 1RQMA 3I43A 4K7OA 2LSTA 3KZQA 4POMA 1I5GA 4EO3A 4ZB8A 1ERTA 2HNLA 3F3RA 6GSTA 3GH6A 2B1LA 2I4AA 3APQA 5IO2A 4D73A 3W8SA 5A4VA 4ZB6A 1FOVA 2HQTA 3RPPA 2CZ2A 1QQ2A 3TKSC 4WR4A 3GKMA 1GNEA 1U6TA 3P90A 1ZYEA 1EZKA 1T4ZA 1GTUA 3M1GA 3M9KA 2H01A 4NHWA 2O89A 1HNAA 4N30A 3IE3A 1PMTA 5ECNB 1AUCA 3TRQA 1YF1A 3L78A 2JZRA 5GZZB 4OFNA 4MJAA 4JEDA 3TJBA 1K3LA 4BVYA 2VL2A 2YZHA 4TXOA 1X0RA 1XW5A 1SD8A 2B5XA 5B6MA 3EINA 1M2BA 2LKUA 1EP8A 2A4VA 5HFGA 4K7IA 1HQOA 5F06A 1ZCPA 2L4CA 3ED3A 1GL8A 2FNOA 1GSSA 1ABAA 1F6MC 1G7EA 4EE0A 1S3CA 4G0KA 1A2MA 5G1LA 5KN0A 4KDXA 4ISDA 1OKDA 5HQPA 5ECRB 1LU4A 1GP1A 3FZ4A 4EF0A 3G9BA 2C0EA 2WB9A 2JU5A 3LEFA 5IQYA 3KP9A 3BOAA 4L5LA 1C72A 1XOBA 6GSVA 4KDUA 3GKXA 2FCHA 3QAWA 3PGTA 3CXGA 2YWIA 1WE0A 2X64A 5GAPD 2R2JA 4GQFA 3ZVJD 3EE2A 2PGTA 4KGIA 1OC9A 3C8EA 1ACVA 4FIWA 4FYBA 3UMAA 5JWRB 2FWFA 3KH7A 1Z7RA 3E0UA 3TJJA 2X99A 3M9JA 5IMZA 2A2RA 1BX9A 2F8FA 4G10A 2HZFA 1GH2A 1PA3A 4GSSA 3CMIA 2FLSA 4ZILA 1GULA 2HZEA 1DUGA 1JZWA 5J5NA 1Q98A 3HCZA 2A2SA 4RI6A 2PN8A 1TK8B 1J0FA 3TOUA 1GSQA 4K7NA 20GSA 11GSA 3D22A 2LQOA 1AW9A 2Z9SA 3DD3A 4XCSA 3H93A 3LGCA 3D5JA 3QD9A 4TRXA 2YOIA 1K3YA 2VO4A 4XRAA 3WT2A 2H1DA 5IMVA 1A8YA 2B3SA 3FKFA 2H72A 4ZBAA 1TOFA 4IELA 2HFDA 2HSMB 4KCAA 2VLUA 4DSQA 3GSTA 1O73A 5D96A 3CSJA 4AJ6A 4ECBA 1GSEA 2HE3A 3TKSE 5H5QA 5IO0A 3A3TA 1PKZA 4KUNA 1ZMAA 1EV4A 3L9SA 3HDCA 6GSXA 1YKAA 2LV3A 2YZUA 2CQ9A 4ZBBA 3NIVA 4IKHA 4O7HA 2C3NA 3KMNA 2LRTA 2VCQA 1SK1A 1ZL9A 5ABRA 4PNGA 1YEXA 5B6NA 4MLYA 4JE1A 3OR5A 3QAVA 5JWQB 4FH8A 3UJ1A 4KW6A 1DE2A 2FHEA 5HR0A 6GSYA 1GSDA 4J56E 1U88A 1Z3EA 5AN1A 2M72A 2ES7A 2F3MA 1GSUA 3HYPA 2MBSA 8GSSA 5G5EA 4KA0A 2DLXA 4MPGA 3ERWA 5HR3A 3P7XA 4V2MA 1TI3A 3VFIA 5KEJA 3EMPA 4WBJA 2J23A 1SK0A 1O81A 3F4TA 1V98A 4EDZA 2YV9A 1TTZA 1X9WB 4KB3A 3D21A 2V6OA 2B1KA 1W4VA 1ML6A 4IVFA 4ZL7A 3PR8A 3F6DA 4WF5A 4BA7A 3GTUB 5CAXA 1A8LA 2OJLA 4PNFA 1Z7PA 5FT3A 3KD0A 1RK4A 4YAVA 1ZZYA 2H73A 3LYKA 1SYXA 4GCIA 3DKSA 5HR2A 1HNCA 5HFKA 3HJOA 4YAPA 4MJEA 2X8CA 3EMXA 4IJIA 2CX3A 4MH2A 5CRDA 3CBUA 1VF2A 3KTLA 1NM3A 2YV7A 3H4KA 1TRVA 1GUMA 1B48A 1X9MB 2GSSA 4GXZA 1VF4A 3W8JA 5CYYA 2YJ7A 4OD7A 4XIHA 4GLTA 2LQQA 2X8HA 2CVBA 5EPFA 4BWQA 1ERUA 2V32A 2K18A 1A0RP 1OE8A 5ELAA 1YDKA 7GSSA 2H6ZA 4GSNA 1V2AA 4YQUA 3VWUA 1GUHA 2H8LA 2VOCA 1CQHA 3DVXA 5DAKB 2GTUA 3LXZA 2N5BA 2LRNA 2CX4A 1VRSD 2H6YA 1WOUA 4PUFC 1PSQA 4KX4A 2IMIA 1THXA 3FHKA 13GSA 2C8UA 1TRSA 2P31A 1BEDA 17GSA 4MP4A 1ILOA 4IBPA 4G0LA 2QGVA 3U6VA 2L6CA 4K6XA 4X43A 1T3BA 3O6TA 4ECIA 2DJ0A 5EY6A 2R5GA 2LTKA 3ZLPA 4TR3A 2GT5A 2ZCTA 1R4WA 4N0VA 5ECIB 1EEMA 3UVHA 4BVXB 3WGEA 4QQ7A 5CO3A 3P8WA 1OC8A 4I5QA 2IFQB 3BCIA 2LUSA 4K2DA 4HDEA 3F9UA 2VL9A 1FVKA 4IJ3A 4PXOA 1XWCA 2VCVA 2VL2C 2B7JA 1SJ6A 3CTFA 2LJAA 4HEA2 1TRUA 3DEXA 2PUKC 3JCML 1PD21 4O5RA 1M2AA 2LNTA 2JADA 4JR6A 1GUKA 2YWOA 3TKRA 2BTOT 4HUAA 3IDVA 4POKA 1GSFA 2OACA 4MF7A 3GURA 2BJXA 1N2AA 2N5FA 2WDUA 2YWMA 5ECSA 2O7KA 2CAQA 5EVOA 4K0NA 1PN9A 5A5KA 1GRXA 3GSSA 2GS3A 5JCGA 3H1NA 4TW5A 2H76A 5J3RA 4ILFA 4HS1A 1KNGA 3GH9A 9GSSA 1KBNA 4MCUA 4J2FA 2YJHA 1V9WA 4ZL9A 3HZ4A 1V58A 2RUFA 3KJYA 4DSSB 4YQMA 1WMJA 4NWYA 5IPHA 3ZMKA 3D4MA 3LJRA 1MD4A 1K0MA 3KEBA 3KH9A 6GSUA 1I9DA 4G9HA 2IN3A 2CV4A 1WP0A 1KEBA 3GRXA 4ECJA 4WBRD 2CA8A 1U3AA 4FO5A 1B4QA 3EVIA 3LWAA 1BAYA 5B8AA 1DSBA 2DJ1A 4K0GA 1YY7A 2PU9C 1J9BA 5EL8A 3APSA 3WGXA 5HFIA 2VCXA 5IIZA 3TKQA 3APOA 3R2QA 5DALB 3MSZA 1XXUA 1X5EA 2GQKA 1PL2A 2D2ZA 3GMFA 3BBYA 4KNDA 5DVBA 2PVQA 2C0GA 4KCEA 4GF0A 4MDCA 2I81A 18GSA 3KIJA 5G5FA 2LRCA 2DJJA 4JRRA 2P0GA 4MABA 4MK3A 3ZMLA 3KP8A 1USBA 1QMVA 3UBLA 1EOHA 3M0FA 4V2NA 3IC8A 1QK8A 16GSA 5KN1A 4TR1A 1FB0A 1GLQA 3L9VA 2JZSA 1F37A 1XIYA 3DYRA 12GSA 1UC7A 2OE3A 2IMKA 2DC5A 3FR9A 3G7JA 3SWLA 3CSHA 2H30A 3IAM2 4OFMA 2I1UA 1F3AA 4F0CA 1NHOA 3QAGA 2PVOC 1LJRA 4L8EA 3VWVA 2K9FA 1YZXA 2VCWA 5D9TA 3F4RA 4KAEA 1JZRA 4CHSA 3WD6A 1EGOA 4MZCA 2VCZA 1PRXA 3K8NA 5AGYA 3V1WA 2VM1A 1O85A 2DSAA 3QFAC 4BL7A 4J57E 1XVQA 4EC0A 2HSYA 5ECMB 4XTSA 3R3EA 2GZZA 1K0OA 3FY7A 1XFLA 3CSIA 3GYKA 4KSMA 2WS2A 1T1VA 2VD0A 4AJ8A 2PBJA 5G1KA 3BJ5A 3VURA 3C1SA 1EEJA 4ZL8A 2PMTA 2RUEA 4TOPA 1XZOA 4EKZA 2L4QA 2OA7A 1MDKA 1GTBA 2C3TA 4HZ4A 5FWGA 4JR4A 1GTIA 2F8AA 3FZ9A 1VGLA 2G2QA 3FW2A 4XS1A 3TGZA 3ZZXA 1BG5A 3CYNA 3RAZA 2XHFA 4Q5RA 3HXSA 4ZIJA 3CTGA 4XS4B 1E2YA 5ID2A 1QUWA 5DQSA 3I69A 2DIYA 4MJCA 2DBCA 5COHA 1SKRB 2E7PA 1PQNA 4QL9A 5AIXA 2KP2A 3UVTA 4G0IA 1FB6A 14GSA 3BD2A 1M2DA 1OE7A 1IYIA 2PPTA 1AQVA 1YEPA 4Z7XA 2TIRA 3N5OA 1MEKA 4N11A 4MF6A 2WRTA 5L71A 1QGVA 4LL4B 2MMZA 3RDWA 1TW9A 19GSA 2JZTA 4H86A 5LCZA 1EOGA 3FK8A 2I9HA 2QKEA 2HT9A 2VD1A 3KCMA 5F0GA 1AAZA 5ELGA 5D93A 1M0UA 2LJRA 1SYRA 5ECOB 3QDNA 4ULXA 4WXTA 4EDYA 1ON4A 1K0AA 2FWEA 5CNWA 2L5LA 4HZ2A 1QXHA 3HJMA 3MWHA 3DGQA 3VPTA 4PQIA 2XBQA 2H6XA 4PX1A 3UAPA 1FHEA 4X1UA 2HRAA 5JCWA 4FYCA 1XCCA 3HD5A 5JWOB 5GAND 2H74A 2B5YA 1JHBA 1BJXA 3DRNA 3GN3A 4V2LA 5ECQB 4ECCA 3FYGA 5IMAA 3UBKA 2J9HA 1SL2B 1WWJA 5AISA 5KN2A 2FY6A 2M46A 3IV4A 3GX8A 2FWHA 2CVDA 1THOA 3IHQA 2DJ2A 4GQCA 3DXBA 4L5OA 5F05A 3US3A 4TKYA 3QR6A 3L4NA 5DQYA 4Q5FA 2DIZA 2DMLA 2HRKB 2FWGA 2VIMA 1K0NA 1MDJA 5AIVA 2F9SA 2GT6A 2YANA 4I6XA 3RPNA 2RM5A 3IK9A 1URMA 3GNJA 2WCIA 4NXIA 2OADA 1X5DA 2LS5A 1SKWB 1V57A 4TVEA 3KMOA 4LL1B 3KGKA 1Z6MA 4NV5A 1TK0B 2R4VA 4OCEA 4YQVA 1XWBA 5J9BA 4LLRA 1PX7A 3EU3A 5IOWA 2GSRA 1WRYA 2MBTA 4PQHA 1PKWA 2PWJA 3IPZA 5E59A 2YCDA 3O76A 5ECLB 1AIUA 2GQMA 2RM6A 5CRWA 3EURA 1OC3A 2MZCA 3QOUA 5F07A 3UL3A 1XVWA 4IP1A 1G7OA 1G6YA 4X0XA 5D9WA 2HSMA 2PERA 4N0ZA 2ON7A 2N5AA 3Q6OA 5JCUA 2FD3A 1TXXA 1O8XA 1ZGNA 4RQRA 4IHUA 1TRWA 3CRUA 1XWGA 1OAZA 1R5AA 1K3OA 3TCOA 4D73B 2KUCA 4KH7A 3LSZA 4F03A 1TJDA 3Q19A 6GSSA 1NW2A 1VF3A 2IJYA 4OFTA 1XOAA 2M80A 4AJ7A 2GLRA 4EVMA 2BMXA 2C4JA 2DJKA 1XPVA 3IAS2 4LA1A 3O3TA 5ECHB 1DE1A 2ZNMA 3QMXA 2C3QA 2IL3A 1TKDB 2IMEA 5CREA 1AQWA 1LBKA 4K8MA 1M7TA 5IOXA 4BVYB 4DVCA 1EWXA 3A5WA 2GSTA 4TXOB 4KSOA 4ZXGA 2R3XA 2CZ3A 3C7MA 3UOMA 2YWNA 2WJUA 3KM6A 3C1RA 3EC3A 2MMAA 4DEJA 3ZREA 3I6AA 2H75A 3VPQA 3AY8A 2HYXA 4NPBA 1GSYA 3LFLA 2K6VA 4NAXA 4GWRA 4NMUA 5ECKB 1XW9A 4I97A 1EP7A 1FW1A 1BQ7A 2WULA 1PX6A 3GTUA 5A4UA 4EXJA 5CRGA 3PPUA 1T7PB 2AUVA 4XS6A 3N9JA 2REMA 5IMFA 4HQSA 5DJMA 2VUPA 1S3DA 1OC9B 2JACA 4TN8A 2VAFA 2E2GA 1S3AA 1AXDA 3H8QA 3DVWA 4PTSA 2NDOA 4F2IA 2P5RA 3MNGA 2HI7A 4XRDA 2LNSA 2HZEB 1UA5A 3F6FA 2AAWA 2OE1A 5FHIA 1AC1A 2H0HA 2H1AA 3D6IA 2EIQA 4PUAA 1DBYA 1X5CA 3F0IA 3VI7A 1Y25A 4WEYA 1JZOA 4F9ZA 4IQ1A 4NV2A 3HA9A 2HSHA 2C0DA 5E4WA 2FUG2 2MMOA 3LYPA 3GIXA 2AV4A 3HY2A 1FVJA 5IMDA 3M8NA 2EIRA 1WPIA 5DAKA 4IN0A 2RIIA 4FYUA 3I9V2 4HJ2A 1YF0A 5DCGA 1ERVA 3J7Yb 3IXRA 3NOFA 1SKSB 3KXOA 3IBHA 4EL1A 2IMDA 5KN3A 4CDOA 4RUVA 1R5PA 1A2JA 3GUSA 3QPMA 1JLVA 1MDIA 1ZOFA 1R7HA 3C73A 2H0IA 3FRCA 3IOSA 3IA1A 3ZVJA 2RLIA 5ENUA 1IYHA 1T4YA 4MJBA 5CRHA 2EC4A 1SL1B 2AJQB 2ZUPA 3QFBC 2HRFA 3J7Yk 4MF5A 4OO4A 2QSIA 2QC7A 2I3YA 1K0DA 4BVXA 3TKPA 2H1GA 4PQ1A 3ZYWA 3DWVA 4I2UA 2V41A 3TJGA 2WFCA 5D8IA 2IFQA 2HXKA 2R6KA 4E8EA 2VCTA 1SJIA 4ZBDA 1F9MA 3BCKA 5CP1A 4JBBA 3M3MA 4EUYA 2B7KA 2AHEA 3TRXA 3Q18A 2JSYA 3MDKA 1TDIA 4DSRA 3EYTA 3F3QA 2WZ9A 4ML6A 1H75A 1PL1A 3RHCA 5D9VA 1EV9A 5C00A 3TRPA 1OVNA 3VWWA 3U5RE 4OMVA 5D9XA 1M99A 3E9JB 3FZ5A 2AB6A 4CW9A 1O8WA 2ALBA 3UIWA 4I8BA 5F8BA 4AGSA 5ECPB 1JLWA 3GX0A 3FEUA 4RQXA 4RI7A 1SL0B 4PURA 4MZBA 2YNXA 1FAAA 2GVPA 1TU8A 2HRNA 1B4PA 4YH2A 3TUEA 2H66A 3VK9A 1T8EB 3HJPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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