4K0GA

Crystal structure of human clic1 c24s mutant
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
QPQVELFVKAGSDGAKIGNSPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure analysis of CLIC1 C24 mutants
rcsb
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
total genus 80
structure length 237
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4k0gA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k0gA01
4PX1A 2AV4A 5ID2B 4GSSA 4K0GA 4KE3A 2LJKA 3KMNA 2B5XA 3BD2A 1V40A 1G0TA 3DKSA 5H5QA 4JE1A 4BL7B 1ON4A 2GQKA 3G7IA 2WCIA 2A2RA 1ERTA 4G9HA 1Z7RA 2C3NA 5EL8A 5E4WA 2X99A 4I6XA 3HVVA 1O6JA 3HJMA 5GAPD 4JEDA 5C00A 1Z6MA 3E3EA 1E2YA 1F3BA 1Z3EA 4E8EA 3TOTA 1X5DA 1O8XA 5DBQA 2LRNA 5DALB 5HQPA 4IJIA 4K7NA 2VUPA 1VF2A 1T4ZA 3IAS2 2GSTA 3FYGA 1OE7A 3IA1A 1QQ2A 4K7OA 4TW5A 1H4OA 1THXA 1R7HA 3G7YA 4GSTA 2OBKA 1A2MA 1TI3A 4IP6A 4HS1A 3Q18A 1ML6A 3EWLA 2MMNA 1A0FA 3QAWA 4TRXA 3M0FA 1TP9A 1BG5A 2YNXA 3QOUA 4ILFA 1W89A 2YV7A 2YJHA 1QFNA 2PN8A 4HQZA 4RI6A 4L0UA 2H1AA 1M0UA 2GVPA 3F6DA 4ECCA 4EF0A 4HQSA 2GLRA 1HD2A 5HR2A 4MPFA 4POLA 4ZB9A 3A3TA 4N0ZA 2X8HA 1S3CA 3MAKA 5CRWA 4PXOA 4HJ2A 3H8QA 2CQ9A 1Z7PA 3UVHA 5HR0A 3I69A 2JL4A 2CV4A 3IDVA 3RBTA 2HSHA 5IO0A 4HOJA 4EXJA 2YV9A 1SD8A 3L78A 2VD0A 4BL7A 1MDKA 1XWGA 4ML1A 1K3YA 2K6VA 4BWSA 2HQTA 2JADA 3HXSA 3MSZA 4F82A 4ZILA 1EV4A 17GSA 2UZ8A 1UC7A 1O81A 4GLTA 4WEYA 2JSYA 1YY7A 2YZUA 2GS3A 2I3YA 1K0CA 5DJMA 2LUSA 3TKSE 4EDZA 2HRAA 5DQYA 4LMVA 4TN8A 5AIXA 4WETA 1WPIA 1NHYA 1TRVA 3EINA 2LTKA 2MZCA 1PMTA 3HY2A 3ZRDA 4CW9A 2QSIA 4AJ7A 4ZBAA 4MF5A 4OO5A 1AQVA 3E9JB 4GQFA 3H79A 4MDCA 1GH2A 2OA7A 4AF2A 2F8AA 4ID0A 1SK0A 4FQUA 1GSFA 2EIOA 2IIYA 1BYEA 1WE0A 2CAQA 4PGTA 3L0HA 1O8WA 3S9FA 3UVTA 5D9TA 1X5EA 4ZB6A 5KN3A 2OE3A 1EWXA 2IMFA 4XTSA 4X0XA 1M7TA 4IS0A 2O8VB 1M2BA 5A4UA 1AQWA 2DMLA 1OC9B 3PPUA 2CT6A 2GDRA 3LEFA 3FR9A 3V1WA 3HCZA 1HYUA 5ABRA 3GX8A 2JZTA 2VL9A 5ECMB 2D2ZA 4PTSA 3DXBA 4TR4A 4USSA 1Z5YE 3GIXA 1LBKA 1R5PA 5IMZA 2H74A 2LNSA 2FNOA 2B7JA 4TXOA 3SWLA 4IELA 4QQ7A 2AAWA 2FWHA 2LRCA 3QDNA 1GSDA 1URMA 1BAYA 4LA1A 1YF1A 2H6YA 3TRPA 1K0DA 1QUWA 3KM6A 2ALBA 5CO3A 5DDLA 2LSTA 2L5LA 3QR6A 1PL1A 3PR8A 3GH9A 3ZIJA 3LGCA 4XCSA 1X9SB 1K0MA 1USBA 2CX3A 2FA8A 2AHEA 3U5RE 3PH9A 1B9XC 2M46A 4TR1B 3W6GA 2E0QA 4WR5A 4RI7A 1J9BA 3CSIA 2HRKB 4GF0A 4NWYA 4XHMA 3KEBA 2GSRA 2FWGA 3GMFA 4X43A 5G5FA 3ERGA 2F3MA 2C0FA 3KH9A 1XOAA 3GSSA 2DC5A 2DIYA 3H1NA 4KSOA 2REMA 2FHEA 4GQCA 3TRXA 4IKHA 2OKAA 3C8EA 4LLRA 2CA8A 1B8XA 16GSA 1TRSA 4IQAA 22GSA 3ZIVA 3O6TA 4JU5A 4ECBA 4F2IA 4LMWA 1B48A 1AUCA 3TJJA 3R2QA 2NPBA 5CNWA 5F05A 5ELGA 2VCWA 2H30A 4YQMA 4KDUA 5CAXA 3Q19A 1K3LA 1VF1A 4FH8A 3APSA 2H70A 4G0LA 2FWFA 1FAAA 1NM3A 2B6MA 2H6XA 4ZB8A 5KN2A 2L59A 1E6BA 1LU4A 5G31A 2FD3A 5J9BA 2AJQB 4QL9A 2HZEB 5G1KA 2QC7A 2KLXA 2PVQA 1M9BA 4ZL8A 18GSA 1X9WB 4QL7A 2Z9SA 2DJ3A 2GZPA 2PERA 2H1DA 3UEMA 1EV9A 5KN1A 2MMZA 3TJFA 2IFQB 5IMDA 3UIWA 3QAVA 4BVXB 2N5AA 2HSYA 3L4NA 3HVXA 4MA9A 2WFCA 3VWWA 1FW1A 5IM9A 4WF5A 1C72A 2C80A 4HEA2 3AY8A 4IQ1A 3FEUA 2P5QA 3EMPA 4N30A 1XCCA 1YQ1A 5D73A 1ST9A 3APQA 3FK8A 1TK5B 2FY6A 3GN3A 4KB3A 4ECIA 3VWXA 2L4QA 4K2DA 2E7PA 2DLXA 2TIRA 2O85A 4DSRA 5JWOB 3IC4A 1J08A 1GULA 3CSJA 1I5GA 3W8SA 3F0IA 1SYXA 5HFKA 1V9WA 4ACSA 3LYKA 2YPMA 3WYWA 4IW9A 1M2DA 2B3SA 2ON7A 2DSAA 2LQQA 3LFLA 1XFLA 3TOUA 1ERWA 1Y6EA 4MLYA 3TGZA 1VGLA 2H01A 3A2WA 3C73A 1ERUA 2H0IA 4GRFA 4H86A 5CRDA 3MWHA 2R5GA 3IE3A 2WZ9A 4FO5A 3LSZA 4BA7A 4NV2A 2AB6A 2YJ7A 2ZCTA 1M9AA 3GKMA 3NOFA 4JR6A 1PL2A 1AAZA 5ECSA 3IK7A 2PUKC 3TJKA 4TR3A 4IN0A 1H75A 1JZOA 1A0RP 1OKDA 2RLIA 4K8MA 4ZIJA 1BJXA 2E2MA 2K9FA 4FYBA 1NSWA 1LJRA 2C4JA 3HD5A 3CRUA 3GL3A 3KTLA 4PUAA 2VM2A 1BX9A 4N10A 9GSSA 2OJLA 2HLSA 4XS6A 1GSYA 4MK3A 5EVOA 1CQGA 4MJBA 5H5RA 2F8FA 1XBSA 4NMUA 2P31A 1N8JA 3KP8A 2LEGA 3GRXA 1GTIA 3E0UA 4DEJA 5GSSA 1G6WA 5ECRB 4JRRA 1B9YC 2P5RA 5IOWA 3IRAA 4IBPA 5ECPB 2YCDA 3VPQA 14GSA 2EIRA 1JZWA 3GUSA 2I9HA 5IMVA 5IMFA 3M1GA 4Q5FA 2YZHA 3GFKA 1ERVA 2YP6A 3F8UA 4O5RA 1O85A 2HZFA 3QCPA 1ZYQB 2JU5A 3BJ5A 3ED3A 3FZAA 3L9SA 4J57E 1ZCPA 4NAXA 3QPMA 2PMTA 1AW9A 1WRYA 2PWJA 3WT2A 3ZTLA 1A24A 2H73A 1WMJA 3D6IA 2LJAA 3PINA 3DWVA 3WD6A 1V57A 2YWNA 5COHA 1B4PA 3IOSA 3KGKA 2CVBA 2C0DA 5E59A 3R3EA 2R3XA 4OFNA 1RW1A 2VO4A 6GSVA 1GUMA 5CRGA 1NW2A 4KDYA 4F0BA 3FR6A 5ID2A 4DSQA 4FYCA 2DJKA 2YWOA 4MZCA 3N9JA 1JHBA 3JCML 3MDKA 4PURA 1PRXA 2B7KA 4F0CA 1TU7A 5J9CA 1K0NA 2R6KA 3US3A 3ERWA 3VK9A 5DCGA 1XWAA 1SK1A 2IL3A 3EC3A 4IHUA 2HSMB 3N5OA 1HNAA 2VCTA 4DSSB 3IC8A 2VOCA 2VCQA 2A2SA 4WKWA 1XW5A 1YJ6A 5DALA 3K8NA 5G1LA 1FVJA 2DJJA 2J23A 5B7CA 4ZL7A 2YWIA 3ZL5A 3IPZA 13GSA 3KJYA 2VL3A 4V2LA 5IPGA 2JACA 5DJLA 5CRHA 4IJ3A 1GNWA 4WF4A 1J0FA 3IR4A 1QGVA 1AXDA 1OE8A 5JWRB 4OFMA 1GTUA 1Q4JA 3C1SA 4OFTA 2VCZA 3VLNA 3EU4A 1FB0A 2H19A 1U3AA 4KUNA 4J2FA 3ZMKA 1O73A 4HU7A 2E2GA 1SJZA 3HJOA 2LS5A 1PQNA 4P3YB 4YH2A 1XIYA 2I1UA 1AC1A 4K9ZA 1VF3A 1TW9A 3HYPA 4X1UA 2JSZA 1YKCA 2I4AA 1MDIA 4RQXA 5H5SA 2L57A 3KH7A 3BBYA 5B6NA 3Q6OA 5GSTA 4PQ1A 3QD9A 5AIVA 2X8GA 4OMVA 3UAPA 4I97A 2F9SA 3HZ4A 4XS4B 3IAM2 2DBCA 4YQVA 3TKSC 1F6MC 5KN0A 3QFBC 1U88A 3KTBA 1ZZYA 4OCEA 4GXZA 4IGJA 2OE1A 2HSNB 4F03A 1GSSA 4J56E 5ELAA 4YAPA 5JCUA 5J4UA 3VFIA 3NZNA 1GL8A 1M2AA 2H6ZA 2HSMA 5CREA 4BVYB 1PA3A 4HZ2A 1MDJA 2AUVA 1XPVA 4HUAA 1G7EA 2GSQA 1XWCA 4KDXA 3CXGA 2H71A 1DUGA 3FHKA 3G9BA 1R4WA 19GSA 1EEJA 1GTAA 1X0RA 2H0GA 3BCIA 4MF6A 4POKA 3EVIA 4ZL9A 4NV5A 4HU9A 1U3IA 5ECLB 3MNGA 5FT3A 4G2EA 1Q98A 4JZQA 5J41A 3GHAA 3CBUA 3TKPA 1K3OA 4KAEA 4O92A 4V2NA 3WGDA 2C8UA 4PQIA 5AISA 1ZMAA 2H72A 1GNEA 2JZRA 2I81A 4PQHA 4Q5RA 5F06A 1TDIA 2GGTA 2DMMA 3DGQA 1YEPA 3G7JA 1F37A 2KP1A 3A2VA 3D4TA 1EGOA 1O7UA 2IMKA 5HFIA 1MTCA 1GLPA 1ZGNA 2CZ3A 2C1YA 1A2JA 3KXOA 1XXUA 3C71A 5EY6A 5J5NA 2HXKA 1WJKA 1DE2A 6GSYA 4TVEA 4ISDA 1OC9A 3O76A 1GSQA 2WRTA 2F51A 3F4SA 4NHZA 3F63A 5D9VA 4KSMA 2R2JA 2OE0A 4GTUA 3UARA 4KA0A 4OWYA 4N11A 3HKRA 1XW6A 4YAVA 6GSWA 1OC8A 3GNJA 5F07A 1DSBA 2QKEA 1RK4A 4KX4A 5DCHA 4L0WA 2C0GA 4G0KA 5JCWA 2HE3A 2VLVA 4LL4B 7GSSA 2VLTA 2ES7A 3GURA 2ZUPA 2RM5A 3DD3A 3SBCA 5G30A 1OAZA 1WOUA 2CAIA 1ZL9A 1YF0A 3TKSA 2GQLA 2GQMA 2VCVA 4K6XA 3W8JA 11GSA 4TR1A 4E8HA 3WGEA 2GZZA 1Z9HA 4XRAA 4ZBDA 2HRKA 3UL3A 1YKAA 3ME7A 3CSHA 4EE0A 3HZ8A 3LORA 2R4VA 5A5KA 2NDOA 1PKZA 2B5YA 1N2AA 4WXTA 3EMXA 3ZVJD 2VLUA 1I9DA 6GSUA 2K8VA 8GSSA 4ML6A 3EURA 1W4VA 4GCIA 2N5BA 3TJGA 3GTUB 2QGVA 1K0AA 2LV3A 3DEXA 1K0BA 3VPTA 4G10A 3LXZA 4MZWA 2WDUA 3APOA 2VAFA 3F6FA 2DIZA 1EP8A 4EC0A 1JZRA 3ZVJA 4RQRA 1MD4A 4G0IA 1V58A 3IV4A 1BEDA 5CYYA 2RUFA 4TOPA 1NHOA 1SYRA 2GTUA 4XS1A 2CVDA 4KGIA 2NTOA 5J3RA 3QAGA 3M8NA 1XVWA 2V6KA 1FOVA 3TRQA 2FCHA 1A8LA 2YANA 3UMAA 4O7HA 5L71A 5D9WA 3O3TA 5IQYA 4TR0A 2HZEA 4NPBA 3VI5A 3HJPA 2XBIA 3UOMA 3GSTA 5C04A 1PX7A 1JZDA 2HI7A 3C1RA 2IFQA 3ZZXA 1V2AA 4AJ8A 4BVXA 2CVKA 3ZFBA 5ECIB 3U6VA 1AIUA 3WGXA 4YQUA 1SKWB 2IJYA 2B5EA 1SU9A 2X64A 4MP4A 3ZREA 1FG4A 3DYRA 3DMLA 3KIJA 1WP0A 3GKNA 3A2XA 1PX6A 1U87A 4NHWA 1XWKA 3RPPA 1TTZA 2CX4A 2H8LA 3FZ5A 1QMVA 3GTUA 1TRUA 4MJAA 1A23A 1DBYA 3TUEA 4ECJA 2R37A 4KCEA 1DE1A 3FR3A 1M99A 2RM6A 3RAZA 3ERFA 1T00A 4MJCA 1OKTA 2XBQA 1KEBA 3LG6A 1GP1A 1TXXA 2HT9A 1X9MB 3PGTA 1EZKA 4MMMA 2B1LA 4AJ6A 1A2LA 2XHFA 1SJ6A 2HYXA 2DJ0A 3HDCA 4MABA 5GAND 4AGSA 1PSQA 4CHSA 3FKFA 3TJBA 5ECNB 5DVBA 5HFGA 1TJDA 3ZLPA 1GSUA 3GA4A 4K1FA 5B8AA 1OVNA 1XWBA 1ABAA 4MH3A 2KOKA 4MCUA 3CRTA 3IK9A 5A4WA 1KBNA 1IYIA 5DQSA 2IPAA 3RHCA 1EOHA 3D21A 2O7KA 1SKSB 2H66A 4OCFA 4V1Ap 3HA9A 4HJMA 5ECQB 3LQ7A 1G7OA 1FO5A 3ZMLA 1FB6A 2YN1A 2KP2A 4FYUA 4L5LA 2XC2A 1SL0B 5HR3A 4D73B 3TB2A 3ZYWA 2XPDA 1ZOFA 1THOA 5AN1A 1CQHA 3RPNA 1TI1A 2KUCA 3L9UA 3FY7A 1TU8A 3J7Yb 3F9UA 5JWQB 2LRTA 2G0FA 2P0GA 2V1MA 1XVQA 2VM1A 5KEJA 5F0GA 1OC3A 3ZFLA 2WGRA 4V1Ag 1T4YA 3FZ4A 5D96A 2YWMA 3I43A 3GYKA 3F3RA 5JCGA 3D5JA 4PUFC 2RIIA 4DVCA 2DJ1A 5D9XA 1UVZA 3GX0A 3UJ1A 3FRCA 1KTEA 1TKDB 3D22A 2IMIA 1PD21 5DAKB 3P8WA 4TXOB 3F3QA 1SKRB 3HHVA 4KCAA 5IOXA 2BTOT 3P2AA 4K7IA 1MD3A 4WBRD 3UBKA 4POBA 1RQMA 1FHEA 3BOAA 2FA4A 1GUKA 3I6AA 4MJEA 3CTGA 1ACVA 2O89A 2WJUA 2OACA 2L4CA 5IMCA 4RUVA 1BQ7A 2LNTA 2MYGA 5FHIA 2IMEA 4L8EA 1GWCA 3FZ9A 4HDEA 4L5OA 3M3MA 1UN2A 20GSA 2O87A 2FWEA 3D0ZA 1XZOA 12GSA 1ZYEA 2H1BA 1U6TA 4IVFA 2C3QA 1GUHA 1EEMA 1PN9A 2OADA 1F3AA 4N0VA 3DVWA 2L5OA 2N5FA 3UBLA 2V2GA 5ECKB 2NVLA 1QXHA 1HNCA 1F2EA 2GZYA 1QK8A 5LCZA 4D73A 1GSEA 5IO2A 2FLSA 3VWVA 1YDKA 3GKXA 1MEKA 3HVSA 1T3BA 4DSSA 5ENUA 2XPEA 2OBIA 2LQOA 3H4KA 1T1VA 3LYPA 2H0HA 2IMDA 2C0EA 2PGTA 2KHPA 1HNBA 3KCMA 2RUEA 3GH6A 4JR4A 4WR4A 4EDYA 1TK8B 2HRFA 1T7PB 2HFDA 2V6OA 4BPYA 2PPTA 4KW6A 1WIKA 5DAKA 2MBSA 3FW2A 1R5AA 2WS2A 3LJRA 3P7XA 2WULA 5ECOB 3VI7A 3EU3A 1OYJA 2V41A 3IXRA 3VWUA 2VL2C 1XW9A 2L6CA 1TK0B 4ULXA 1TRWA 1SJIA 1SK2A 2H76A 2JZSA 3GV1A 5CP1A 3P90A 3TCOA 6GSTA 4GSNA 2L6DA 4XS4A 4POMA 1F9MA 3F4TA 2FUG2 3TKRA 5INYA 4MF7A 5A4VA 4V2MA 6GSXA 5F8BA 3DIEA 2H1GA 2VD1A 4I2UA 1IYHA 3CMIA 5AGYA 1X5CA 1V98A 5HR1A 4XIHA 1PGTA 5EPFA 2PBJA 4BVYA 1EOGA 2IN3A 1UA5A 2WB9A 2EC4A 4IP1A 3ZITA 2MMAA 1YEXA 3VURA 1YZXA 2V32A 3M9JA 4KH7A 1VRSD 4PNFA 1JLWA 4LL1B 1PKWA 1GRXA 2EIQA 5IPHA 5G5EA 3DRNA 4GWRA 4O32A 3KP9A 1HQOA 2TRXA 4HZ4A 1Y25A 2M72A 3EYTA 3IHQA 3QMXA 5B8BA 3D4MA 4JBBA 2K18A 1G6YA 4F9ZA 3NIVA 1K0OA 2B1KA 1ILOA 3EE2A 3KMOA 5GZZB 4ZBBA 2MBTA 3TDGA 1SD9A 5BMUA 3TKQA 2HRNA 1GLQA 2A4VA 2LKUA 3C7MA 2GSSA 4EVMA 3OR5A 2LJRA 2VIMA 1SENA 2AYTA 5IMAA 1FVKA 3DVXA 2CZ2A 1R26A 3I9V2 1Z6NA 4TXVA 3CYNA 4WBJA 2PU9C 1JLVA 4MPGA 2G2QA 4KF9A 5D8IA 2M80A 2ZNMA 3H93A 4I5QA 2J9HA 1VF4A 3IBHA 4XRDA 4BWQA 1EP7A 1S3DA 2H75A 2DJ2A 4I2TA 5B6MA 4TKYA 1GTBA 2X8CA 1S3AA 4ZXGA 3RDWA 3A5WA 1B4QA 2VCXA 2YOIA 4K0NA 4FIWA 4G19A 3LXTA 1A8YA 3F4RA 5LNKe 4OO4A 2BJXA 1WWJA 2GT5A 4HI7A 1KNGA 1XOBA 3J7Yk 2NBSA 3ME8A 5D93A 3CTFA 4CDOA 2VL2A 2ON5A 5FWGA 1JFUA 1SL1B 1EGRA 3Q74A 3LWAA 2TRCP 4EL1A 5G2ZA 4Q5QA 3QFAC 2FGXA 4PNGA 3KZQA 2MMOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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