4NAXA

Crystal structure of glutathione transferase pput_1760 from pseudomonas putida, target efi-507288, with one glutathione disulfide bound per one protein subunit
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
ELSAFPITRKWPAKHPERLQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLAYEAHKVSFDNDDQLSPEFISLSANNKIPAILDPNGPGGQPLPLFESGAILQYLAEKSGQLLSQDPAQRYQTLQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFHFFAGKEYEDKRPRDRYVNESKRLLGVLDRHLKGRQWMAEEYSIADIAIFPWVRNLVERYNARDLVGFDQFKEVQRVLANFLERPAVQHGLKIPGAENLYFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutathione transferase Pput_1760 from Pseudomonas putida, target EFI-507288
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase, N-terminal domain protein
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas putida
total genus 86
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4naxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4naxA01
3VWVA 4TRXA 4F03A 4WKWA 4DVCA 4WBRD 2FD3A 2A2SA 4HU9A 3A2WA 1XXUA 3I43A 4PUAA 3FYGA 1UA5A 4ZBBA 3UVHA 2ZCTA 3BCIA 1KNGA 5G1KA 3TKQA 2LKUA 4G10A 3F6FA 3TJBA 3C8EA 2AV4A 3KD0A 3HZ8A 1YF0A 1FO5A 5CNWA 3IAS2 1SK0A 3IXRA 2VCWA 1K0CA 3F6DA 3VPTA 1V58A 3O3TA 1LBKA 5D73A 2C3QA 3QAWA 3TJFA 1YF1A 3S9FA 3FHKA 2HRKA 1PD21 1GTIA 1EP8A 1DBYA 4IQ1A 4D73A 3L9UA 1THOA 2RM6A 5CREA 5DCHA 2OJLA 2H6YA 1QXHA 1JZOA 4ECBA 2HSMA 1SL1B 4TW5A 2LRTA 1Q4JA 4LMWA 2B7JA 1O8XA 5AISA 2HZEA 5ECSA 3J7Yk 1O6JA 4NXIA 5CO3A 1ST9A 4E8EA 2OBIA 4NWYA 1FW1A 3GA4A 4O32A 1CQGA 2FY6A 5ID2A 4ZBAA 3CYNA 2KUCA 1GSUA 3C71A 2PUKC 2YNXA 2VCQA 1THXA 4PNGA 2HE3A 4BVYA 4V2NA 2QSIA 1ON4A 1J0FA 4BA7A 3CTGA 4EE0A 4NHWA 1X5EA 5HR3A 3MAKA 3DVWA 4J2FA 1TRUA 4ECIA 2L59A 3RPPA 4ZB9A 4ML6A 4ACSA 3GHAA 4MZWA 5G1LA 2CV4A 2KHPA 1OC3A 4KUNA 4BVXA 1TXXA 3UARA 4KDUA 3EWLA 1YZXA 2OE1A 3UBKA 1O85A 5G2ZA 1UC7A 3HVVA 5ECRB 2CT6A 4F82A 2UZ8A 4EKZA 1YKCA 3WT1A 4DSSB 4DEJA 1YEXA 4JBBA 2L5OA 3G7JA 2HFDA 5D93A 4HZ2A 2NTOA 5HFKA 1HD2A 2ZNMA 4O92A 3APSA 1A2LA 5J5NA 3TRPA 4L0UA 2XHFA 5HR2A 4KCAA 3CBUA 2HI7A 2FCHA 2F3MA 2YV9A 3LJRA 3DRNA 4ID0A 1QMVA 2L57A 2HRFA 3ZFBA 3I69A 1UN2A 4POBA 4MF7A 1WIKA 4GF0A 3ZMLA 2DJ1A 1CQHA 4ML1A 4XHMA 2ON7A 4TR0A 2L6CA 5JCGA 1U88A 3DVXA 4XIHA 2CX4A 2X8GA 2HNLA 1A2MA 1PX7A 5IMZA 2CVBA 1SKRB 2I3YA 2C0DA 3WGDA 3HY2A 3TKRA 3EMPA 4FIWA 3IV4A 3EYTA 3JCML 3LGCA 2LTKA 1OVNA 1OC9A 4OCEA 1EEJA 2HLSA 2R2JA 1AQXA 1F3AA 4PX1A 3L4NA 3F3QA 6GSSA 4TN8A 3RAZA 4YAPA 2FNOA 1TK8B 3BBYA 3D4MA 3ZIJA 4ILFA 5G5EA 3EE2A 2XC2A 2QC7A 3IPZA 3KMNA 5ECIB 4QQ7A 2IJYA 3W8JA 2V2GA 4XRDA 2DMLA 2H66A 4XS4B 2DJ3A 4PTSA 2X64A 6GSXA 4TXOA 3W6GA 2H70A 1B48A 3MDKA 2WDUA 4TR1B 4OO4A 4EVMA 2I4AA 1ERWA 3WGEA 11GSA 5ELAA 3HHVA 4KSOA 3LG6A 1K3LA 1K0DA 4K7OA 1VGLA 2LRCA 4FYUA 3F63A 3FKFA 1RQMA 4I2UA 1A0FA 2DIZA 2WS2A 1PMTA 2LNTA 1B9XC 3TJKA 5B6NA 3KTLA 3GN3A 4HEA2 19GSA 3GNJA 3NIVA 2VD0A 1A0RP 3HJMA 2MMZA 4FYCA 2PWJA 3GIXA 1HYUA 5JWQB 3VURA 3IE3A 2OA7A 5G30A 1EV4A 3F4SA 3DIEA 4DSRA 1ERTA 1IYHA 2CQ9A 1HNBA 2P5RA 3DKSA 2VM1A 4N30A 5D96A 1S3CA 2R3XA 2MMOA 1M9BA 5ECPB 3VLNA 2X8CA 2GVPA 1GSQA 2VUPA 1O8WA 5HFIA 1MD3A 1I5GA 4MH3A 3R3EA 3GKNA 3HXSA 1GLQA 5IMCA 1VF3A 2DBCA 2JZRA 2JU5A 2DSAA 3HYPA 3EMXA 3HDCA 4ZB6A 1M7TA 5IPHA 1HNAA 1OE7A 2YZHA 4RI7A 3EINA 3LSZA 5ABRA 3ERGA 1IYIA 2R5GA 5COHA 3IAM2 4HU7A 2GDRA 3IDVA 4MK3A 4CHSA 5IO0A 2V32A 3KH7A 4JR6A 3WT2A 4K0GA 4NV2A 2MZCA 1GNWA 4KF9A 5F05A 1AW9A 2HRKB 2OE0A 3HA9A 2JSZA 3CTFA 4D73B 3VI7A 3UOMA 2CVKA 5HR1A 3RBTA 1KTEA 2O87A 3HJPA 3KIJA 3I9V2 3LWAA 3L78A 3D0ZA 4AJ7A 3EU3A 2HSMB 4GXZA 5IO2A 3WYWA 1T4ZA 4OCFA 1PGTA 3GSSA 1XIYA 1U3IA 2IMIA 2ALBA 4I8BA 4KH7A 5HFGA 4MDCA 3ERFA 2FWHA 5CP1A 4QL7A 1Z6MA 3ZMKA 3HZ4A 1ZYEA 1RK4A 2V6KA 4OMVA 1KEBA 1VRSD 2R37A 4MA9A 3VFIA 1XW5A 4IP1A 3ZTLA 1I9DA 4MF6A 3ZYWA 4K6XA 4BVYB 5L71A 1A24A 2VAFA 1GULA 1H75A 3GRXA 5GAPD 2O89A 3QAVA 1R7HA 4TVEA 3FK8A 1FG4A 4EL1A 3ZL5A 2PU9C 4Z7XA 2GS3A 2CZ2A 2YCDA 5DDLA 4KDYA 6GSWA 1F6MC 3QAGA 1EGRA 4HZ4A 1HNCA 2C0GA 2PN8A 1V40A 5IMAA 4BVXB 2OACA 5KN1A 4K7NA 5AIVA 1XW6A 3J7Yb 5DQYA 1ZMAA 3QMXA 3D5JA 1JZRA 1G0TA 4JE1A 1BJXA 4WF5A 3HCZA 1EGOA 3U5RE 1YEPA 5CAXA 3ZVJD 1ZL9A 4GCIA 2MMAA 3H79A 5C00A 1S3DA 2NBSA 3O76A 1Z3EA 3UIWA 2OADA 3A2VA 1Q98A 2RIIA 1SJIA 2PERA 2ZUPA 3Q18A 1SL2B 2C80A 2VLVA 4WF4A 4TKYA 3VWXA 2VL2C 2YN1A 1MTCA 2LV3A 2EIRA 8GSSA 3TRXA 2WZ9A 5AN1A 2DJ2A 3TGZA 2FLSA 5IPGA 5JWOB 2VCXA 4ZBDA 2VLUA 3FEUA 1PKZA 2GTUA 2QGVA 2IL3A 2CVDA 1FVJA 4XRAA 5B8BA 4X1UA 2H8LA 1BAYA 4BWQA 4GSNA 4K1FA 3A3TA 4ZILA 4KDXA 1YDKA 3FR9A 1N2AA 5EVOA 4PGTA 2GZZA 1E2YA 5ECHB 5F8BA 4LL4B 1SYXA 3LXTA 1MDKA 4CDOA 4NHZA 3FZ4A 5D8IA 5IOXA 2RUFA 2MBTA 3TJJA 1JZWA 2OBKA 1XW9A 4ZB8A 5D9TA 1GWCA 2YANA 1KBNA 2C0FA 2MBSA 4IGJA 4XS6A 4PNFA 5CRDA 3L9SA 4MZBA 3QPMA 2KP2A 3UJ1A 2H0IA 3IC4A 4ZL7A 3M8NA 2H0GA 4MABA 1X9SB 4ECJA 2VL9A 1SD9A 1WP0A 1B9YC 2PMTA 3GTUA 4RQXA 1EV9A 4X0XA 1GTBA 4TXOB 2GSRA 5J9CA 2H30A 1GL8A 1JZDA 1AXDA 4F0BA 1R26A 3M9JA 2HXKA 3PH9A 1ML6A 3UBLA 1GSEA 1G6WA 5CRWA 16GSA 2P0GA 4FYBA 3CRTA 4PURA 4IJIA 2BJXA 5INYA 3GYKA 4BL7A 1VF2A 2ES7A 4ZL8A 2B5XA 22GSA 1K0NA 2TRCP 1S3AA 2PPTA 3ERWA 2FWGA 1AQWA 2WGRA 5G31A 3QOUA 3MSZA 3VWWA 4ZXGA 3KJYA 4GQFA 1AIUA 1XCCA 3KEBA 2LRNA 4G19A 3ED3A 1ERVA 2WJUA 3UEMA 1T8EB 1SK2A 4ULXA 1MD4A 2GSQA 1EZKA 5ECMB 3IK9A 2B1LA 1MEKA 4GWRA 1A23A 2K9FA 4RUVA 5F0GA 4ISDA 3NZNA 2G2QA 1GRXA 4NAXA 4HJMA 2FA4A 3Q6OA 4IVFA 4MJAA 1ACVA 5A5KA 2J9HA 3FW2A 4KA0A 4MJCA 4WXTA 3GH9A 2VCVA 2V1MA 3GX0A 4KX4A 2F8AA 2H6XA 1GSFA 2OE3A 3KP9A 5A4WA 1PL1A 5DJMA 12GSA 1SJZA 1ERUA 2H19A 1WMJA 2O8VB 3FZ5A 3HVXA 3CMIA 2GQMA 3KTBA 1X0RA 3KH9A 2WB9A 4MP4A 5EPFA 3N9JA 2Z9SA 3QFBC 2V41A 2VL3A 1F9MA 1TRVA 5F06A 3R2QA 2N5BA 3EVIA 4JR4A 2XBQA 2HSHA 3CXGA 2LNSA 2IMKA 1X5CA 2KLXA 1OYJA 20GSA 5ECLB 1M2DA 3N5OA 3F3RA 4E8HA 1SD8A 2HSNB 3F9UA 3AY8A 3A5WA 1J08A 1GNEA 3FZ9A 3TKSE 1F37A 1FVKA 5DALB 3FRCA 3GX8A 1OKTA 5ECNB 2GGTA 1SKSB 5B8AA 3TJGA 4X43A 4KW6A 4WR5A 1DUGA 4Q5NA 1JFUA 1E6BA 2RLIA 2MYGA 2IFQA 2DJJA 3US3A 1MDJA 4IW9A 5DVBA 2GSTA 3EU4A 3QFAC 2DC5A 1PQNA 5EY6A 1NSWA 3D22A 3TKSA 1A8LA 3RDWA 4XS1A 3G7YA 1DSBA 4IBPA 4Q5RA 1R5PA 4L5OA 3BJ5A 5J9BA 5C04A 3UVTA 3IC8A 4WR4A 4EDYA 3ZREA 2F8FA 4EXJA 3GL5A 1YY7A 1K3OA 1LU4A 4EDZA 4V2LA 2PVQA 2VO4A 2WRTA 3QCPA 2X8HA 2C8UA 5LD0A 3C7MA 2A2RA 4DSSA 1FOVA 2FGXA 4OO5A 5GAND 5BMUA 2ON5A 3M0FA 4DSQA 3IRAA 4AJ6A 2M46A 4PUFC 2JACA 3UAPA 1SKWB 4EUYA 4F9ZA 4YQMA 3P2AA 2H01A 1O7UA 1TU7A 1O81A 4F0CA 2RUEA 1SENA 3KCMA 1DE2A 3CSHA 1NW2A 2B7KA 5KN0A 4IHUA 2XBIA 2WFCA 3M1GA 4IJ3A 2H75A 1TP9A 1BYEA 2C1YA 1GUHA 2L5LA 1UVZA 3E3EA 1TK5B 6GSVA 2I1UA 3LQ7A 3G9BA 1N8JA 4YQVA 2AAWA 2O7KA 3DGQA 2DLXA 3KGKA 2V6OA 4HUAA 5KN2A 3HKRA 2B1KA 5DCGA 5J41A 3EC3A 2YJHA 1SL0B 4MMMA 4H86A 4FH8A 5ECKB 1LJRA 4HOJA 5F07A 3W8SA 3VI5A 1XVWA 4GRFA 4WBJA 2HZEB 2HYXA 4TR3A 2GT5A 3GURA 2L6DA 4I97A 1XBSA 3A2XA 3GTUB 1AAZA 3TCOA 1GTAA 4IN0A 4K8MA 2LJKA 5ID2B 2H1DA 5G5FA 13GSA 1HQOA 5IM9A 4LLRA 1XVQA 2DJKA 2FHEA 4IELA 2VOCA 3ZIVA 5DAKA 3C73A 4GQCA 2FWFA 2LJAA 2GZPA 3APOA 3GFKA 3KM6A 4EF0A 3BOAA 4MZCA 4K9ZA 1QFNA 2H0HA 2YP6A 1MDIA 2DMMA 2WCIA 2WULA 4HQZA 4PXOA 3FR3A 4BL7B 2IMDA 3GH6A 4GSSA 5A4VA 2H73A 4TXVA 2JSYA 3Q74A 3P8WA 4G0KA 4V1Ag 5H5QA 1PL2A 1Z9HA 1A8YA 2E2GA 2NDOA 3D4TA 18GSA 5AIXA 3GKXA 1T7PB 3FY7A 3GSTA 5IOWA 1K0AA 2F9SA 5JCWA 3HD5A 5KN3A 1VF4A 1V9WA 1JLVA 4G0LA 3OR5A 1Z5YE 2IN3A 4OFNA 2H6ZA 1F2EA 5IMFA 1XWGA 5DBQA 1USBA 5GSSA 5EL8A 3DD3A 4PQHA 2E2MA 3V1WA 4P3YB 1ZCPA 4POMA 4L5LA 2REMA 3VK9A 3BCKA 3M3MA 3F4RA 1B4PA 4G9HA 6GSUA 4AJ8A 3RPNA 2AJQB 1V98A 1J9BA 3DXBA 2HRNA 3PR8A 5HR0A 1AUCA 2LEGA 3H1NA 1A2JA 1XFLA 1Y6EA 2H71A 3LYKA 1OC9B 3VWUA 4L8EA 4XCSA 2GQLA 2JL4A 1FB0A 4GTUA 4JEDA 4I6XA 2BMXA 1GTUA 1TI3A 4FO5A 5ECQB 1M2BA 1K0OA 2M80A 3MWHA 4USSA 2K8VA 4QL9A 1GP1A 1QGVA 4MJEA 2N5AA 4J56E 3E0UA 3LORA 4ECCA 4IP6A 3WGXA 4XTSA 3TKSC 4Q5QA 2RM5A 6GSYA 1R4WA 2VD1A 2JADA 3SBCA 1WOUA 1OKDA 3TRQA 3LEFA 4F2IA 2YPMA 2P31A 1SU9A 3FZAA 2M72A 3TUEA 2G0FA 4HS1A 2FWEA 2HZFA 5HQPA 3HVSA 4GSTA 5ELGA 10GSA 2CAIA 1PRXA 2H74A 2MMNA 5D9XA 2IFQB 3IHQA 1WPIA 1TDIA 2LQOA 4MLYA 4KE3A 1T4YA 3GKMA 1M99A 4KCEA 2IWTA 4TOPA 3E9JB 4ZIJA 5D9VA 2CX3A 2VCZA 4MJBA 3KP8A 5ECOB 4J57E 4K0NA 3GV1A 1ZZYA 1WWJA 4LA1A 2VIMA 2O85A 2C0EA 5FWGA 5H5RA 4PQIA 3CRUA 3IR4A 3ME8A 2GQKA 1TJDA 1X9MB 3ZLPA 1GSYA 1K3YA 4MH2A 4MCUA 3WD6A 1TW9A 4ZL9A 5JCUA 4O7HA 3U6VA 3H8QA 3IBHA 1JHBA 2KP1A 3IK7A 1TOFA 2H76A 1V57A 1Z7RA 1W4VA 1TTZA 2FUG2 2HT9A 4O5RA 2C4JA 5GSTA 1NM3A 4BPYA 3ZITA 5GZZB 2LUSA 2J23A 1SYRA 2A4VA 1FAAA 5J3RA 7GSSA 3CSJA 2X99A 3HJOA 1TKDB 2IIYA 1WE0A 4RI6A 3KXOA 1FHEA 1EP7A 4EO3A 2K8SA 1QUWA 2K6VA 3LYPA 1M2AA 2JZTA 2YZUA 4MPGA 5B6MA 3UMAA 4MPFA 3DYRA 1SJ6A 3PINA 3IA1A 1C72A 2KOKA 4EC0A 1M9AA 5DQSA 5FHIA 1NHYA 5E59A 2DJ0A 2H72A 4TR4A 2YJ7A 1Y25A 2C3NA 2HQTA 3D6IA 1BG5A 3UL3A 1PA3A 2VL2A 4L0WA 1XOBA 2AUVA 14GSA 2I9HA 1V2AA 4OFTA 4HI7A 3Q19A 4G2EA 1ABAA 6GSTA 1FB6A 2K18A 2B5YA 1WJKA 3ZZXA 1JLWA 2IPAA 3TDGA 2HSYA 1EWXA 4V2MA 4JRRA 2GLRA 1U3AA 1AC1A 2AB6A 1GLPA 2GT6A 1F3BA 2VLTA 4IS0A 5DAKB 1XWKA 2EIOA 2YWOA 3ZFLA 3GL3A 5FT3A 3F8UA 4NMUA 4KSMA 2LJRA 3TB2A 1PX6A 1OAZA 4BWSA 2VCTA 2L4CA 3TKPA 2N5FA 3PGTA 1OE8A 3TOUA 3C1SA 2LQQA 3KZQA 1G7OA 2F51A 2IMFA 1RW1A 4AF2A 1H4OA 1X5DA 3RHCA 2I81A 3P7XA 4WETA 1T00A 2PBJA 3LXZA 1X9WB 1TRSA 3L0HA 4HQSA 3VPQA 3MNGA 1OC8A 4RQRA 5JWRB 2YWNA 3QDNA 4GLTA 4KGIA 2IMEA 4OWYA 3FR6A 1XZOA 5A4UA 2NPBA 4I5QA 2PGTA 2B3SA 2EC4A 3APQA 5J4UA 2GZYA 2AYTA 3ZRDA 1XWAA 2YWIA 4NPBA 1U87A 3BD2A 5DJLA 4N10A 5KEJA 5B7CA 1URMA 1Z7PA 2OKAA 3K8NA 1K0BA 3GKKA 4IKHA 1QQ2A 4PQ1A 1B4QA 3DEXA 2TRXA 1PN9A 3PPUA 3CSIA 2PVOC 4IQAA 4AGSA 4KB3A 2R6KA 1ZYQB 3M9KA 1XWBA 5IIZA 2L4QA 3F4TA 4N0ZA 4KNDA 3O6TA 2JZSA 1YJ6A 4LMVA 4LL1B 3C1RA 2TIRA 1ILOA 1BEDA 4POLA 1GSSA 2CAQA 4YH2A 5E4WA 1EEMA 5H5SA 1TRWA 4K7IA 1EOGA 3ISOA 4YAVA 1NHOA 3KMOA 2XPEA 5ENUA 1AQVA 2GSSA 3H93A 3G7IA 3GMFA 3RHBA 3QD9A 3DWVA 2YWMA 1ZOFA 1G7EA 1GH2A 2AHEA 4WEYA 4N0VA 4Q5FA 1DE1A 2HRAA 1XOAA 3F0IA 1ZGNA 5IQYA 4OD7A 4N11A 2LSTA 1K0MA 1GSDA 4CW9A 4OFMA 4HDEA 4V1Ap 5CRHA 2YOIA 5CYYA 2BTOT 1EOHA 3I6AA 2B6MA 5IMDA 4XS4A 3DMLA 2VM2A 1VF1A 1GUMA 1BQ7A 1TI1A 3QR6A 4G0IA 5LNKe 3SWLA 1Z6NA 4MF5A 2R4VA 5DALA 1G6YA 2CA8A 1TK0B 2E0QA 1PSQA 4FQUA 1XPVA 4TR1A 3TOTA 2EIQA 2E7PA 4HJ2A 3ZVJA 3L9VA 3D21A 3P90A 1W89A 4I2TA 5LCZA 4JU5A 3GUSA 1T1VA 3H4KA 2CZ3A 2LS5A 1YKAA 4KAEA 5AGYA 2NVLA 4NV5A 1GUKA 1B8XA 3LFLA 5IMVA 1O73A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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