4Q5FA

Crystal structure of the glutathione s-transferase from ascaris lumbricoides
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
PQYKLTYFDIRGLGEGARLIFHQAGVKFEDNRLKREDWPALKPKTPFGQLPLLEVDGEVLAQSAAIYRYLGRQFGLAGKTPMEEAQVDSIFDQFKDFMAELRPCFRVLAGFEEGDKEKVLKEVAVPARDKHLPLLEKFLAKSGSEYMVGKSVTWADLVITDSLASWESLIPDFLSGHLQLKKYIEHVRELPNIKKWIAERPKTPY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Glutathione S-transferase from Ascaris lumbricoides
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase 1
molecule tags Transferase
source organism Ascaris suum
total genus 70
structure length 205
sequence length 205
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2014-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4q5fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4q5fA01
2JACA 4EKZA 4JR6A 3GMFA 5LNKe 1NW2A 4G0LA 1ERUA 4K2DA 6GSYA 3IOSA 2XPEA 4FYBA 3WT2A 1NHOA 2OBKA 3IPZA 1TU7A 1XW6A 2YWNA 4Q5NA 1TK0B 4ZIJA 4I5QA 1R7HA 1R5PA 3LFLA 2PU9C 6GSXA 5FHIA 2CQ9A 4KA0A 5A4UA 4TR0A 1X9WB 3ZMKA 1X9MB 5AIXA 3LGCA 3IV4A 3EE2A 1TTZA 1WIKA 2K6VA 1A23A 3PINA 4IP6A 1B4QA 3CTGA 1ZYQB 3TDGA 2EIRA 4XHMA 1UA5A 4HEA2 1FVKA 2E0QA 4RQRA 2VLTA 4KB3A 1K3LA 9GSSA 1WWJA 3RHBA 3IHQA 1EEMA 4ISDA 2VD1A 2BJXA 4J2FA 4V1Ag 4K9ZA 3GA4A 3F4TA 2VCZA 4BPYA 5F05A 2HNLA 2BTOT 4GWRA 3A2XA 5IO0A 2HRAA 2FA4A 4TVEA 3QCPA 2M72A 2CVKA 5IMDA 3HVSA 2DSAA 1JFUA 1AQVA 3WGEA 2B7JA 1OYJA 3HHVA 2H19A 3FZ4A 3IAM2 5IMAA 3LORA 3DVXA 3GYKA 4L0WA 2H1DA 2HRKA 1K0NA 1TK8B 5GAND 1EP7A 2J9HA 2R3XA 1S3AA 3QOUA 5IOWA 4ML6A 4HUAA 5ENUA 3LG6A 4N10A 5J3RA 1E6BA 3PGTA 3ZYWA 2JSYA 4RI7A 1V58A 1Z6NA 4EDZA 4ECIA 2V32A 3VI5A 2DIYA 3KEBA 2CZ2A 3HD5A 2C1YA 3UVHA 2IMFA 1TOFA 1YJ6A 5ECMB 1A2JA 2LUSA 2VLUA 3TKPA 5AGYA 2HI7A 3WT1A 1OKDA 2OA7A 3D6IA 3L4NA 2FCHA 3F6FA 5GZZB 2IMIA 4KDYA 4ZL8A 3TJGA 1J08A 1WPIA 3C7MA 4TR1A 2LJKA 1UVZA 4G2EA 1QK8A 1ERTA 2DBCA 3N9JA 5CO3A 4RQXA 1A2MA 1SK1A 3F3RA 4X1UA 4F0CA 1EV9A 2DIZA 2NPBA 5D9VA 4G10A 5G1KA 3ZIJA 1MDIA 2MMOA 1SD9A 3CSJA 1PRXA 4K0GA 2JU5A 2ALBA 2AB6A 3UVTA 2HZEA 1GWCA 4D73B 3DD3A 2YV9A 4L8EA 3GKNA 1FB6A 1X0RA 3FW2A 4DSSA 1XW9A 1R4WA 3MNGA 1F2EA 3ZMLA 3FRCA 1PKWA 2LTKA 1KTEA 1V57A 2CV4A 8GSSA 3QR6A 1Z5YE 3DXBA 2X99A 3HDCA 3F63A 3L0HA 4I2UA 3DRNA 2YZUA 4IKHA 2H6ZA 5F8BA 3TCOA 5F07A 2GTUA 1K0BA 4TXOB 5G2ZA 1THOA 3MAKA 2YWOA 2PN8A 1G6YA 1KEBA 2OE3A 4XRAA 5H5QA 2X64A 3H8QA 3JCML 1H4OA 1ERVA 3C73A 1VF3A 2Z9SA 2C0DA 2ON7A 2B1KA 4ZB9A 4POBA 1NHYA 3IC8A 3KM6A 5EY6A 2C8UA 4G19A 2H1AA 4DSQA 5HR0A 2GLRA 4GQFA 2H01A 3E3EA 5IMVA 1PL2A 2DJJA 3TUEA 4YAPA 2JL4A 1YDKA 2DMMA 5IM9A 1EEJA 3VFIA 4OCFA 1TW9A 2L59A 3I69A 1F3AA 1FHEA 1PX6A 3GL5A 4XTSA 4POKA 5D9WA 3HY2A 4GXZA 2FHEA 5D9XA 3F4SA 2M46A 3LXZA 2GVPA 3M1GA 1YF1A 2O7KA 1BEDA 4IELA 2WZ9A 3GKMA 4WETA 2P0GA 2I81A 5ELGA 3VI7A 2PVOC 4IQAA 1F3BA 1OC9B 5EPFA 1DE1A 3ZVJA 4USSA 4ZBAA 2M80A 4V1Ap 3O6TA 1J0FA 2HSMB 2A2SA 5DAKB 5ECSA 5J41A 3BCIA 3APQA 1SJ6A 4N0VA 4LL4B 1QFNA 1FG4A 4G0IA 4ID0A 2C0GA 3EURA 2PMTA 5KN0A 3UMAA 3Q6OA 1KBNA 4TR4A 3GUSA 1Z7RA 2CAQA 3GKKA 2HXKA 3F4RA 4TRXA 4GRFA 1BQ7A 4K7IA 2I4AA 3L9SA 3D4MA 5DCGA 4KCEA 4LL1B 4IW9A 4JU5A 1GSFA 16GSA 2JADA 2L6DA 3CTFA 3LJRA 3A2VA 1U87A 2PPTA 3QFAC 2LNSA 3QAWA 4EXJA 5EVOA 1SL2B 3QPMA 3O3TA 3CXGA 4ZILA 4BL7B 5D73A 22GSA 4JBBA 4CHSA 3ZVJD 1I5GA 4K7NA 5KN3A 2JZTA 4PUFC 4YQUA 4WBRD 1EZKA 2LRNA 5GSTA 3A2WA 2CZ3A 1DUGA 2GT6A 3VK9A 5KN2A 1T00A 1SKRB 2LQOA 4LMVA 2HRNA 1M2AA 2IN3A 3Q19A 2X8GA 2NDOA 1FAAA 3U5RE 1K0OA 2KP1A 3TJKA 1YEPA 1A24A 2WJUA 4NXIA 1SK2A 2XPDA 3L9UA 4FYUA 2RM6A 3EMXA 4TW5A 5B7CA 6GSWA 5D96A 3HA9A 1ABAA 1XWCA 5J5NA 4LMWA 4ZBDA 4IJIA 2HSNB 2N5FA 4HDEA 2KHPA 4V2LA 3GHAA 4DSRA 3P7XA 1R5AA 5DDLA 3TRPA 1F9MA 2C3NA 2VUPA 2GSRA 1LU4A 3TRXA 2G0FA 1EWXA 3ZIVA 2DJ2A 1GTIA 2RM5A 2WCIA 5ELAA 3DMLA 5CYYA 5B8AA 5ECLB 3ZL5A 2HSMA 5GSSA 3LYKA 4L5LA 3IRAA 5INYA 1ZYEA 1O7UA 2L5OA 4MZCA 4WXTA 3GV1A 2YPMA 5AN1A 3TOUA 4NWYA 13GSA 3IK7A 2PBJA 1TRUA 4WF4A 2F51A 2QGVA 4TKYA 2GZYA 1QMVA 4FH8A 5J9BA 4ZBBA 2G2QA 2CA8A 3HXSA 18GSA 2GSSA 2HYXA 3BJ5A 5JCUA 3RAZA 4E8HA 3FR3A 3LQ7A 2VL2C 2MYGA 2VCVA 4HQSA 4PXOA 1V2AA 3H79A 5C04A 3VWXA 5G5EA 2XBIA 1PN9A 5F06A 2MMAA 4Q5QA 2V41A 2R4VA 3SBCA 3APOA 4LA1A 1W4VA 4HZ2A 3J7Yk 2L4CA 3GSSA 2YJHA 1J9BA 1TKDB 4BWSA 3C1SA 5L71A 3G7YA 1VRSD 3UBKA 4TOPA 2RLIA 5JWQB 2ON5A 5G31A 5IOXA 4KX4A 1M9AA 4MCUA 4CDOA 4IQ1A 2TIRA 4WEYA 1F6MC 1G0TA 4Z7XA 1FOVA 4OFNA 2O87A 4O32A 3G7JA 2B5YA 2JZRA 2P5RA 4XS4A 6GSTA 4MJCA 3TKSC 4ZB6A 1CQGA 3GX8A 3EU4A 1EV4A 3U6VA 2YNXA 2GSQA 1GSEA 3GH6A 5HR3A 1AIUA 3P8WA 3DIEA 2AUVA 3LWAA 2C80A 4K7OA 3HZ4A 4YQMA 2WGRA 4ZL9A 14GSA 6GSVA 3ZITA 2H0GA 1Y6EA 3C71A 1FB0A 1THXA 3CSHA 1BYEA 2LRCA 3I9V2 1QXHA 2ZNMA 2WB9A 2RUFA 5IPGA 2I1UA 1K3YA 6GSUA 5COHA 1MDJA 5ECQB 2B1LA 3A5WA 2C0EA 3FK8A 1OE8A 1GLPA 1GLQA 4WR5A 1JZOA 3GFKA 2PVQA 1KNGA 1GSDA 5ECRB 4I2TA 4MDCA 4HI7A 4NV2A 4GF0A 2H30A 1XOBA 1Q4JA 2OJLA 1PD21 3D4TA 4F82A 3GL3A 3VPTA 1OKTA 3J7Yb 3RDWA 2D2ZA 1VGLA 3FYGA 3WD6A 1Z9HA 5IMZA 1AW9A 4MK3A 3HJMA 4O5RA 2VCQA 2OACA 3FR9A 4NHWA 3RBTA 3RPNA 4IHUA 2IPAA 3HVXA 4F03A 1WMJA 2MBSA 2OBIA 5CREA 2FWEA 3H1NA 3ERFA 5DBQA 2DLXA 3KD0A 2BMXA 1C72A 4JZQA 3WGXA 1GTBA 1UC7A 2H1BA 2IFQB 3BOAA 1XBSA 4O7HA 3FHKA 4EO3A 2PGTA 2LNTA 2FWFA 1XVWA 1HD2A 3ZTLA 4OWYA 4KF9A 1YKAA 3UL3A 5LCZA 2VM2A 3QAGA 2CVBA 1VF4A 1TXXA 2DMLA 3TJFA 2FNOA 1Z3EA 4QL7A 3P2AA 2L4QA 3E0UA 5B6NA 1XWKA 3BD2A 2FUG2 3M3MA 5F0GA 5CRDA 3ISOA 3ED3A 2TRCP 3L78A 2O8VB 2DJ1A 2O89A 1O81A 10GSA 3ZFLA 3TJJA 1H75A 3DYRA 4BVXB 1S3CA 5DJLA 5DALB 1O85A 4N0ZA 3O76A 4OFMA 4BVYB 3WYWA 1ZZYA 1T4YA 2IJYA 3TOTA 5ECPB 2HQTA 1WE0A 1S3DA 1GUKA 1M9BA 4BA7A 4H86A 1TRSA 2LKUA 1SL1B 2GQMA 5ID2B 3KH9A 3F0IA 2GSTA 1N2AA 3IR4A 4JR4A 3W8SA 1GSQA 4MPFA 4MZWA 19GSA 2VAFA 2YZHA 4EDYA 5FWGA 1RQMA 5AIVA 4PX1A 1YY7A 1TI1A 5GAPD 4WF5A 4AJ8A 4XCSA 1T4ZA 5C00A 2AHEA 2DJ3A 1U3IA 2XHFA 1PX7A 4PUAA 2NBSA 1EOHA 2VL3A 4RI6A 4MF7A 1DBYA 2WRTA 1JLWA 1HYUA 1M7TA 2JZSA 3VWWA 4MH2A 2IFQA 2LS5A 1PSQA 2REMA 1JLVA 2R5GA 3D0ZA 4FYCA 1RK4A 3GX0A 3TKRA 4KSMA 4ZXGA 3EU3A 2HT9A 4D73A 2ZUPA 3GKXA 4OO4A 2MMZA 1OC8A 5H5SA 1B9XC 1R26A 4MPGA 2N5BA 4KGIA 3GTUB 5ECIB 2AV4A 3RHCA 4KCAA 2LQQA 2A2RA 2YANA 3UIWA 2B6MA 3UEMA 3W8JA 3CSIA 3A3TA 1PA3A 5A4WA 4EUYA 4Q5FA 3EC3A 4NMUA 2MZCA 2HSHA 2V6OA 4TXOA 1ZOFA 3TKSA 2OE1A 1K0CA 5E59A 2VD0A 3KJYA 3UOMA 3R3EA 1GSSA 2VCTA 2LJRA 1MEKA 5ABRA 1Q98A 1QUWA 1PMTA 2WS2A 4WKWA 5G30A 3TKQA 5ID2A 4HQZA 5EL8A 4EE0A 3GIXA 3PPUA 2F9SA 2L5LA 4MLYA 1K3OA 5ECOB 4JE1A 2LEGA 4CW9A 1M0UA 2YV7A 4MA9A 5E4WA 4K8MA 3KTLA 2H0IA 3IBHA 5HFIA 1NSWA 2VL9A 1U3AA 2YWIA 20GSA 6GSSA 2I3YA 2F8AA 5HR2A 3WGDA 4DVCA 3ZLPA 3S9FA 5J9CA 2IMKA 1GNEA 2OADA 2H66A 3HJOA 2KLXA 4KDXA 3H4KA 1UN2A 2GGTA 1ERWA 2MBTA 3VWUA 3C1RA 4ZB8A 3M9KA 4FO5A 3I43A 1B8XA 3I6AA 3PH9A 4N30A 4JEDA 2CX3A 3FKFA 1GRXA 1F37A 2E7PA 4AF2A 2B3SA 1ZMAA 5IQYA 4WR4A 2VCWA 3PR8A 3QMXA 1OC9A 2HLSA 1EGOA 4PGTA 5HR1A 4MABA 1YEXA 4TR3A 3KXOA 4FIWA 5DAKA 2YJ7A 3TRQA 3MDKA 3KZQA 2F3MA 4AJ7A 2MMNA 2EC4A 3TKSE 2NTOA 3DGQA 3MSZA 1TU8A 1U6TA 3KCMA 2L6CA 2H1GA 5CRHA 1A0RP 1OVNA 4AGSA 4HOJA 1ST9A 1GUMA 2H71A 1A8YA 2FLSA 4XS1A 5JCWA 1TI3A 3NOFA 4OD7A 2C0FA 1XIYA 1BX9A 2JSZA 2K8VA 1EGRA 1X5CA 3IAS2 1WP0A 2ES7A 1M2BA 2HRKB 2DJ0A 3ME8A 4MJBA 2HZFA 2KOKA 1VF2A 4KE3A 1AUCA 1RW1A 5CAXA 5ECKB 3VPQA 1GL8A 1T3BA 4I97A 4BL7A 3ZRDA 4X43A 3M9JA 3Q74A 3GNJA 3N5OA 3F9UA 3K8NA 2FD3A 3HYPA 1ON4A 2CT6A 4V2MA 3IDVA 2VO4A 1B9YC 1TJDA 4OFTA 1BJXA 5G5FA 1DE2A 4QQ7A 1GSYA 5ECNB 3CRUA 1YZXA 2GQLA 2GZPA 4XS6A 4JRRA 5IIZA 3LSZA 2YP6A 3GSTA 4KH7A 3FEUA 1SJIA 2PERA 1GUHA 1X5DA 5HFGA 3GURA 3OR5A 4IBPA 5DVBA 4V2NA 1SKWB 2E2MA 4TR1B 3V1WA 1JZDA 1XWGA 2WFCA 1IYIA 1K0DA 4IGJA 3TJBA 4NPBA 2H70A 1XCCA 4EC0A 4TXVA 4Q5RA 2IMDA 3FZ5A 2EIOA 3P90A 5HQPA 4GSSA 4L0UA 2GQKA 3FY7A 2IMEA 4HS1A 1M2DA 2R2JA 4F0BA 1JZRA 4GQCA 4GCIA 1T1VA 1A2LA 2HZEB 2VIMA 4TN8A 4DSSB 3D21A 3DVWA 1AQWA 3EYTA 5IPHA 2DJKA 2VOCA 4DEJA 1XWAA 17GSA 4XIHA 3IXRA 1GTAA 2HFDA 3UAPA 4ILFA 2N5AA 1WRYA 3KIJA 1I9DA 1V9WA 2A4VA 2QC7A 4L5OA 3D5JA 3AY8A 2IIYA 1TP9A 3VLNA 4IS0A 1VF1A 1OAZA 4OO5A 2H72A 5CNWA 1XW5A 1K0AA 4KDUA 2FY6A 3KTBA 1YQ1A 2RIIA 1EOGA 3KMOA 1BG5A 3KH7A 1FVJA 1A8LA 1ZCPA 2LRTA 1JHBA 4EVMA 3IC4A 5JWRB 2TRXA 3KMNA 2NVLA 4YH2A 2GT5A 1SKSB 1GULA 2H6YA 1GP1A 3ERWA 3HZ8A 1LJRA 2H75A 1SYXA 2YOIA 4MF6A 5ECHB 4K1FA 4PQHA 1FW1A 2LV3A 7GSSA 1XWBA 2RUEA 4F9ZA 4I6XA 5BMUA 4ULXA 2L57A 3TB2A 1IYHA 4MJAA 4KUNA 1HQOA 5D8IA 1T7PB 1TRVA 3VWVA 4KSOA 1O73A 1XFLA 4POLA 1PGTA 2AAWA 3G9BA 1GSUA 4OMVA 2PWJA 4GSNA 2YWMA 2B5XA 4K0NA 5D9TA 4PQ1A 3R2QA 5H5RA 1SYRA 3M0FA 2H76A 4LLRA 1URMA 3E9JB 3VURA 1CQHA 2J23A 2XC2A 2WDUA 2O85A 4P3YB 5B6MA 2C4JA 2V2GA 2CVDA 3LXTA 2FGXA 1G7OA 1PL1A 4N11A 2B5EA 4HU7A 1B48A 2V1MA 4ECJA 1SD8A 5JCGA 2QSIA 5G1LA 1XOAA 4IN0A 4PNFA 1ACVA 2LSTA 2EIQA 1G6WA 4PNGA 3GRXA 2GZZA 3UJ1A 2FA8A 2R6KA 2K18A 1EP8A 2KP2A 1W89A 1E2YA 2HRFA 1O6JA 2K8SA 5IO2A 4XRDA 4MJEA 3HCZA 4POMA 3QFBC 3QAVA 5HFKA 1ILOA 1Y25A 1ML6A 3FR6A 1AAZA 3ME7A 1SENA 2H73A 2F8FA 1ZGNA 5B8BA 2ZCTA 1Z6MA 1SL0B 1M99A 5J4UA 1TDIA 1T8EB 3CRTA 3LYPA 2VL2A 1BAYA 1TRWA 5CRGA 2IL3A 3BBYA 3HVVA 1B4PA 1FO5A 1QGVA 1OE7A 4K6XA 4MP4A 2YCDA 5DCHA 1WJKA 2QKEA 3SWLA 2DC5A 1GNWA 2LJAA 4NAXA 2XBQA 3EMPA 4ACSA 3F6DA 4ZL7A 5D93A 3TGZA 2FWHA 4X0XA 4HJ2A 3APSA 2KUCA 2AYTA 3H93A 2H8LA 4GSTA 5LD0A 2X8HA 4FQUA 2CX4A 5FT3A 4ECCA 1MDKA 4E8EA 3F8UA 2AJQB 2I9HA 3CYNA 4KW6A 4YQVA 3RPPA 1WOUA 4BVXA 5DQSA 2WULA 5DALA 2UZ8A 4EF0A 4BVYA 3ERGA 3ZFBA 4HZ4A 4J56E 4NHZA 4GLTA 1O8WA 3BCKA 3L9VA 1MTCA 2GS3A 2H0HA 4HU9A 4RUVA 1Z7PA 2CAIA 4YAVA 4NV5A 1V40A 1YF0A 4ML1A 4IVFA 1QQ2A 3FZAA 2P31A 3GH9A 1SJZA 1G7EA 4OCEA 3CBUA 5A5KA 1SK0A 3FZ9A 5DJMA 5AISA 4ECBA 2K9FA 5DQYA 3UBLA 1PKZA 1U88A 2B7KA 2HSYA 1N8JA 1AXDA 1XVQA 3MWHA 4HJMA 3F3QA 4O92A 2V6KA 3DKSA 5IMCA 3EVIA 3EINA 2HE3A 2E2GA 3IK9A 1YKCA 3Q18A 3EWLA 3US3A 4QL9A 2P5QA 3D22A 2H6XA 12GSA 1OC3A 5CRWA 4F2IA 3C8EA 4AJ6A 4GTUA 1LBKA 1XPVA 5A4VA 3DEXA 1GH2A 1HNBA 3IE3A 4EL1A 1USBA 1AC1A 3GN3A 4PQIA 4G9HA 1A0FA 1XZOA 2OE0A 1JZWA 2OKAA 1X5EA 5CP1A 3QD9A 3IA1A 4BWQA 3NZNA 1DSBA 1NM3A 2YN1A 4XS4B 5KN1A 1SU9A 1V98A 3HJPA 3CMIA 11GSA 5JWOB 1XXUA 4IJ3A 3KP8A 3GTUA 2C3TA 4MMMA 1K0MA 4I8BA 3QDNA 3ZZXA 2IWTA 1X9SB 1MD4A 1ZL9A 3KGKA 2X8CA 1AQXA 4IP1A 3ZREA 3DWVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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