4DEJA

Crystal structure of glutathione transferase-like protein il0419 (target efi-501089) from idiomarina loihiensis l2tr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
202
structure length
202
Chain Sequence
KRSVMTLYSGKDDLKSHQVRLVLAEKGVGVEITYVTDESTPEDLLQLNPYPEAKPTLVDRELVLYNAQIIMEYLDERFPHPPLMPVYPVARGTSRLMMYRIERDWYSLAEKIQKNDAQARQELKEGILSLAPIFADTPYFMSEEFSLVDCYLAPLLWRLPAYGIDLEGQGAKEIKQYMVRLFERKTFQDSLTEEEKELARNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase related protein
publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase-Like Protein Il0419 from Idiomarina Loihiensis
rcsb
source organism Idiomarina loihiensis
total genus 62
structure length 202
sequence length 202
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4dejA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4dejA01
2C0DA 2R3XA 4JR4A 4TRXA 3F63A 5DQSA 1SKWB 4TR3A 5KN3A 3GIXA 2M80A 1JZRA 1GP1A 4KAEA 1U6TA 1WJKA 1R5AA 5IOWA 4ISDA 1TRSA 5H5RA 2X64A 2L59A 2BTOT 2GQLA 2WDUA 2L5OA 2MBSA 1DUGA 2V6OA 2R37A 3A2VA 2FNOA 2GGTA 4FYUA 2VCTA 4OCFA 2VCQA 4N10A 1ERTA 1F3BA 1R4WA 2DMLA 3GA4A 3LEFA 3O6TA 5ID2A 3TOUA 6GSVA 3QAGA 2LJRA 2TRXA 4YAPA 4N0ZA 1EP8A 3L9SA 5GSSA 2H1AA 1HNBA 1IYHA 4MABA 4NXIA 1JZDA 1SL0B 2GSTA 5D9WA 1SENA 2VM2A 4Z7XA 1LJRA 3W8SA 2NVLA 4Q5FA 5B8BA 1RW1A 1FO5A 3QAWA 5F06A 3W6GA 5J3RA 4PTSA 2Z9SA 4FH8A 4L5OA 2OE3A 3IA1A 5GAPD 4GSSA 3J7Yk 3GKKA 3TJJA 4F9ZA 3F0IA 3TKRA 3GN3A 4ECJA 2V2GA 5C04A 4ECCA 2YWIA 3OR5A 5CO3A 1FW1A 2R4VA 1V57A 4WF5A 1ON4A 4L5LA 3LYKA 1OVNA 3D4MA 3DXBA 2RM6A 3IE3A 3IRAA 3FR6A 3QR6A 1XCCA 3L78A 4PGTA 4TR1B 5HFGA 3IR4A 1YJ6A 2H76A 4G2EA 2GT6A 4V1Ap 4GXZA 4RUVA 1NHOA 3A2WA 3IC8A 3BJ5A 3LFLA 3A3TA 1XWKA 5ECHB 1GULA 4EXJA 4QL9A 3IOSA 2A2RA 3CSHA 3M3MA 3PH9A 1TU7A 1S3CA 5B8AA 3TKPA 3ZTLA 3FR9A 3ZL5A 4XTSA 2XBIA 1TJDA 2I3YA 2QKEA 3DVXA 1A23A 2H70A 1GSEA 3RDWA 3F4RA 9GSSA 2VLTA 4XRAA 3ZIVA 18GSA 5D93A 3LQ7A 4IW9A 1HNAA 3FZ5A 2HSHA 5JWRB 1ILOA 3CTGA 1Y6EA 1THOA 3QDNA 3APQA 1TK8B 5J9BA 2H1BA 5AIVA 2YZHA 3RHBA 3LXTA 5DCHA 2C0EA 2E2MA 3CBUA 3TB2A 1ZYQB 5DJMA 1XWGA 3E0UA 4TVEA 4ECBA 4XHMA 2E7PA 1YEPA 2TRCP 1SK2A 1Z5YE 4TR1A 5B6NA 2X8CA 4OFTA 1MTCA 1SKRB 1O8WA 5DALA 3EMXA 4MF5A 3WYWA 4KW6A 4GF0A 4JRRA 1K0CA 5LD0A 1EEJA 4BVXB 4K7IA 1TKDB 6GSYA 3HZ8A 17GSA 5JCUA 3UBKA 2VO4A 4KCEA 4KDXA 2LQOA 1ACVA 1CQHA 1EGOA 2I4AA 1XW9A 5H5SA 5AGYA 5ECOB 1M2AA 2HE3A 1MDKA 3R2QA 3EU3A 2ZNMA 4O92A 4ZB9A 2B6MA 2B1LA 1JHBA 3QD9A 3H8QA 5ECKB 4F03A 4HJ2A 2HZFA 4WBJA 1B9YC 4MZWA 2YN1A 4FYCA 2IMKA 1PGTA 1SL1B 2HI7A 3CSJA 2IWTA 1GSFA 3FY7A 1PKZA 3BCKA 3GSSA 4I8BA 1K0BA 1U3AA 3M8NA 5JCWA 3PPUA 1O85A 4MF7A 3RAZA 1ZGNA 3UMAA 5CREA 1GWCA 5G30A 2G0FA 4BL7A 2B1KA 5INYA 4Q5RA 3HZ4A 1JLVA 2GZPA 3RPPA 2CA8A 4BVYA 5ECPB 2I81A 2VL3A 4GSNA 3ME8A 4YQUA 3M1GA 1ZYEA 1ML6A 2OJLA 3HVVA 3F6DA 4D73A 5CRDA 2CAQA 4OCEA 1WIKA 3I9V2 4K0NA 1OKDA 5DVBA 1ZOFA 2LRNA 1R5PA 3NOFA 4IVFA 1T00A 4L0WA 3ZREA 2FWGA 2RUEA 5KN0A 3GTUB 1QK8A 3CYNA 4XS4B 3GUSA 4GTUA 4QQ7A 1BYEA 3GL5A 4ECIA 4EKZA 2IJYA 1X9SB 2FWEA 3ERFA 4DSSB 4V2NA 5FWGA 1TW9A 3TJBA 2P5RA 2YJHA 4PNGA 4NWYA 1T4ZA 4RI7A 3ED3A 3SWLA 2WFCA 2LS5A 2H6ZA 2M72A 1MD3A 1XWBA 2C0FA 2ON5A 2LJAA 11GSA 1LBKA 1T8EB 1ZCPA 4ZL8A 4MJCA 2HRKA 2HYXA 2L5LA 2YCDA 2VIMA 1XWAA 2CV4A 1ZL9A 3D5JA 1K0DA 1MEKA 16GSA 2AAWA 3P7XA 1V58A 4MMMA 2XC2A 4EF0A 1T7PB 1OC9B 2LSTA 5CRGA 4I97A 3GV1A 1VF4A 3VWWA 3KIJA 4K7OA 2OBKA 2JU5A 3KCMA 4ULXA 3UOMA 1EP7A 3M0FA 4NMUA 2WGRA 4XIHA 2RLIA 3TRPA 4PXOA 1BJXA 1R26A 1EEMA 4KGIA 4G0IA 2A4VA 3UARA 3TJFA 3TRXA 1A24A 4WKWA 3GL3A 4JU5A 1ERWA 5ABRA 3V1WA 1J9BA 3P8WA 2C8UA 1UC7A 1M99A 4HU7A 1WE0A 1WPIA 5DAKB 4PX1A 1YF1A 2H66A 3KTBA 3M9JA 4V2LA 1SK1A 2B5YA 3ZMLA 2C4JA 5GZZB 1H4OA 3CXGA 3IC4A 1TRVA 4RQRA 5DBQA 4KDUA 4GRFA 1GUMA 3DWVA 2H71A 3PGTA 5EY6A 3FW2A 3O76A 1Z7RA 5E4WA 1TI3A 5F8BA 1NHYA 1XW5A 1KTEA 3FYGA 4NHZA 3MSZA 3ZFLA 4OMVA 4ZBDA 1M7TA 4MP4A 4WXTA 2HLSA 1QQ2A 1SYXA 1TK0B 4KA0A 2MMAA 4LA1A 4TXVA 5D96A 2JZRA 2NPBA 4IELA 4KCAA 5BMUA 1DSBA 2GS3A 1GSYA 2WULA 2V32A 4BA7A 3HA9A 2B5XA 3D6IA 4NV2A 2XHFA 3LYPA 4TKYA 1YKAA 4XS1A 2IN3A 5IIZA 5ECIB 2H1DA 2LUSA 2OBIA 3GKMA 3EMPA 3K8NA 3HHVA 2FGXA 3EU4A 5A4WA 4P3YB 2A2SA 3L0HA 2YJ7A 2DSAA 4ID0A 3GNJA 2B7JA 1THXA 4PUFC 4IP6A 4AJ8A 1TK5B 5FT3A 4HU9A 3QAVA 5C00A 2H6XA 3GYKA 3US3A 1MD4A 6GSWA 2LRCA 4POKA 4TXOB 2F8AA 1YKCA 2H1GA 1JLWA 1GUHA 2VD1A 3IV4A 5JWOB 2HNLA 3VPTA 2B5EA 2RM5A 3LGCA 2CT6A 1K3LA 4MPGA 1X5EA 1FG4A 5HFIA 4V2MA 3MDKA 2O87A 1B4QA 4WETA 4JEDA 3QPMA 2H75A 2E0QA 1PX7A 1XFLA 4KF9A 2GVPA 3BOAA 5CRWA 1SL2B 4N0VA 3VWUA 1TP9A 1ST9A 4AJ6A 3U5RE 4ZL9A 1ERUA 1OE8A 4I5QA 1JZOA 2DJJA 1F37A 3KEBA 2N5FA 3BD2A 3DYRA 19GSA 3FEUA 2F3MA 3ZVJD 7GSSA 4OD7A 5IO2A 2R6KA 2KHPA 6GSSA 1TRUA 4PURA 4MZCA 3EYTA 3HDCA 1I9DA 3TDGA 1QXHA 5D9VA 1K0MA 1EZKA 2H6YA 4V1Ag 12GSA 2HRAA 3EURA 4K7NA 3ZRDA 4N11A 3N9JA 3KH9A 1FB6A 3I43A 1GNWA 2H8LA 2P31A 2HQTA 1J0FA 4J57E 5A4VA 2H0IA 5KEJA 5KN1A 1EV4A 3VFIA 2ZCTA 1GTIA 2CVBA 4HQZA 3G7IA 4KX4A 1PRXA 4TXOA 1BX9A 2LJKA 3IK9A 3R3EA 3ZIJA 4POBA 3I69A 1AQWA 2CZ2A 4L0UA 4FIWA 5IMZA 2VL2C 2HZEB 3L9UA 2NDOA 2L4QA 2VUPA 2CX3A 2EIOA 4K1FA 1VF2A 3ZFBA 2IMIA 4YAVA 3P90A 4NHWA 2YANA 1O6JA 3J7Yb 3TRQA 3EC3A 1XWCA 2CQ9A 1V9WA 3CSIA 2PGTA 1PL1A 5HFKA 1V98A 1TU8A 2LNTA 1TTZA 3KTLA 4DSQA 5B6MA 3LXZA 2DJ0A 1S3DA 4KH7A 2MMZA 4MZBA 2QC7A 3M9KA 2OE0A 4G0LA 2DJKA 2AJQB 1F2EA 3Q74A 8GSSA 2DJ2A 2IMDA 4KUNA 5G1KA 1YDKA 2DJ3A 4GCIA 2GT5A 1TXXA 1KBNA 2G2QA 5IQYA 1FVKA 1T4YA 1K3YA 1NSWA 2IFQB 1C72A 1SD8A 3C1RA 5F0GA 5ECNB 1W4VA 3TKSC 2BJXA 3WGDA 4I2TA 2O7KA 3TJKA 2AV4A 3EINA 2VLUA 3LJRA 5HR1A 1OAZA 1VF1A 2L6CA 3KD0A 1SK0A 4LL4B 1WOUA 5J4UA 3DVWA 1ABAA 4TR4A 2PMTA 4MPFA 3SBCA 2V41A 4H86A 1ERVA 2VCXA 4F0BA 1J08A 1XVWA 3Q6OA 1XOAA 3ISOA 2FY6A 1A2JA 4AJ7A 2HSNB 4OO4A 4X1UA 2HZEA 3DGQA 2J23A 2JACA 5EVOA 3G9BA 2REMA 1XIYA 2R2JA 3DD3A 4O7HA 1XW6A 4PUAA 2OADA 2VL2A 3DKSA 6GSUA 4POLA 2XPDA 3S9FA 4NV5A 4G0KA 1G7EA 3APSA 3ZYWA 3HY2A 2YWNA 4Q5QA 1PD21 5IMDA 1GLPA 1ZMAA 1N8JA 2K8VA 1HNCA 1AQVA 2DIYA 4EDZA 4LMVA 4HS1A 4BVXA 1RQMA 4PQHA 3WT2A 2DLXA 4MCUA 3F3RA 1FHEA 1QFNA 2EIQA 4J56E 1AAZA 1YF0A 3A2XA 3F4TA 3GH9A 4EDYA 4X0XA 1GSDA 2HRFA 1E2YA 3TKSA 3UAPA 1WWJA 3TUEA 4MH2A 2GDRA 4FYBA 4XS6A 2BMXA 3C8EA 4BPYA 3VPQA 2GQMA 1X5CA 1BG5A 3IHQA 4F0CA 5F07A 5J41A 3KZQA 3HJMA 1AC1A 2E2GA 3QMXA 2ALBA 2PWJA 4KNDA 2C80A 3KMOA 4MDCA 4LLRA 2KP1A 3CRTA 2PUKC 2F8FA 2L4CA 3IK7A 1A8YA 4E8EA 1LU4A 2PPTA 4LL1B 3G7JA 4I2UA 1V2AA 1O7UA 1AUCA 3LG6A 5CAXA 2VAFA 3D21A 1A2LA 4XRDA 3UIWA 4BWQA 5EPFA 2H72A 5F05A 3GRXA 1FB0A 1VGLA 4F2IA 2UZ8A 1Z9HA 3F4SA 1HYUA 3CTFA 4N30A 5ELGA 5AISA 2C1YA 1TRWA 1DE2A 3PR8A 4YQVA 4IQAA 3LSZA 2MBTA 1KNGA 4ILFA 2GQKA 2ON7A 3GTUA 4XS4A 3A5WA 5ECLB 4GQCA 2FWHA 5ECSA 4CW9A 1SKSB 3P2AA 4GLTA 2GLRA 1GLQA 3ERGA 2IIYA 2P0GA 3FZ9A 4HJMA 4WF4A 4IQ1A 4DSSA 2PBJA 1SJZA 3FKFA 4ACSA 3BCIA 1SD9A 2IL3A 1AXDA 3PINA 2X8GA 1GSUA 2N5AA 2RUFA 1XVQA 5ID2B 2JL4A 1JZWA 3C7MA 3FZ4A 1BAYA 2PU9C 4J2FA 2X99A 1XBSA 1MDIA 4IJ3A 1GH2A 1U3IA 3VI5A 3FK8A 5DCGA 1BEDA 5HQPA 3APOA 4PNFA 2DBCA 3GH6A 1PMTA 1USBA 1A0FA 3D0ZA 1PSQA 2GSRA 4I6XA 1K3OA 5G1LA 1T1VA 1OC9A 2N5BA 1M9BA 4ZBBA 4HQSA 4YH2A 4LMWA 2OA7A 3ZZXA 1G7OA 3UEMA 4DSRA 3CMIA 1FAAA 3N5OA 3QFBC 2D2ZA 1E6BA 2L6DA 2VD0A 3JCML 2AHEA 3UVHA 5D9TA 4IP1A 2C3NA 2V6KA 1Z6NA 3EWLA 3AY8A 2HRNA 4TOPA 5GAND 1Q98A 4GSTA 2GZYA 2EC4A 5IO0A 2MYGA 10GSA 5IM9A 5CYYA 1TDIA 2IMEA 3IAS2 2JSZA 5D9XA 4ZIJA 3F9UA 2GZZA 1EGRA 4TR0A 2WJUA 2EIRA 2FA4A 4O5RA 5DAKA 2KUCA 1GNEA 1CQGA 2YP6A 4TN8A 1A2MA 4F82A 4GQFA 5A5KA 2CX4A 4EO3A 1O81A 2M46A 1QGVA 4G19A 3UL3A 4K9ZA 2O8VB 3TKQA 4KDYA 2WB9A 3Q18A 4OWYA 3UJ1A 1IYIA 4E8HA 1Z7PA 2RIIA 5D8IA 2YNXA 3L4NA 5D73A 3IXRA 5G5FA 1VRSD 4PQIA 2WRTA 2ES7A 3H1NA 1O8XA 1PL2A 4L8EA 4FQUA 3KJYA 3EVIA 2H73A 4MK3A 2B3SA 4MH3A 4TW5A 3HCZA 4MJBA 2IPAA 5ECQB 2KLXA 5IMCA 2KOKA 4IBPA 4KE3A 2FLSA 5DALB 1M2BA 4WEYA 3KP8A 1Y25A 5FHIA 1PN9A 1EOHA 4AGSA 1YZXA 4HI7A 2O85A 3Q19A 1HQOA 3KM6A 1OE7A 1OC3A 1RK4A 4EVMA 4QL7A 5IOXA 1EV9A 3GSTA 5COHA 2I9HA 2F9SA 4NPBA 3KMNA 3DRNA 2AB6A 5A4UA 5E59A 5CNWA 1GSSA 1M9AA 2JZSA 1F3AA 2YV9A 2WCIA 4CDOA 3I6AA 1PKWA 3WGXA 1JFUA 5H5QA 2NBSA 1MDJA 2C3QA 3WT1A 1XPVA 1GTBA 1EOGA 3H93A 6GSXA 3ZITA 3DIEA 1GTAA 3ZVJA 3GX0A 4EL1A 3KH7A 5DQYA 1X9MB 3GHAA 3VLNA 4HDEA 3W8JA 2QGVA 1Z6MA 3TJGA 2FHEA 4ML6A 3ERWA 3KP9A 4O32A 3TGZA 1AQXA 2MMNA 1O73A 3MWHA 3GKNA 4BL7B 2H74A 3KGKA 2LEGA 5IPGA 1N2AA 3F8UA 2OE1A 2GSSA 3ZMKA 1WRYA 3ZLPA 1I5GA 5ECMB 2VCWA 4BVYB 1B48A 1F9MA 3LWAA 5G2ZA 5LNKe 5ECRB 2XBQA 2VCVA 2YOIA 4Q5NA 2YZUA 2I1UA 2LRTA 1ZZYA 2C3TA 4HZ2A 4PQ1A 1AIUA 3E9JB 2IMFA 1GSQA 1F6MC 3UVTA 2LQQA 4D73B 2CAIA 4OFMA 2LTKA 3NZNA 4WBRD 2VM1A 3QFAC 4HOJA 1V40A 1G6YA 3F6FA 1X5DA 2OACA 2LKUA 3VI7A 4IKHA 4DVCA 1PX6A 5EL8A 1EWXA 4IHUA 1XOBA 4ML1A 1Q4JA 3BBYA 3IPZA 3HJPA 2K6VA 4IJIA 3WGEA 4GWRA 3HJOA 2K9FA 3F3QA 2NTOA 4IN0A 4USSA 1UN2A 2OKAA 2H19A 4JBBA 4ZXGA 4MJEA 1UA5A 3VURA 1SJ6A 2HSMB 1NM3A 5ELAA 1GL8A 1GTUA 3D4TA 1A0RP 5G31A 2F51A 2V1MA 3E3EA 2XPEA 4POMA 1WP0A 3L9VA 2HRKB 3GMFA 1SYRA 4DEJA 2O89A 4G10A 1PA3A 4XCSA 3C1SA 5HR2A 4MJAA 3HVXA 1WMJA 2WS2A 4OFNA 5AIXA 1AW9A 5GSTA 2CZ3A 3O3TA 1OC8A 4WR5A 3RPNA 2K18A 5JCGA 2IFQA 2H01A 2PVOC 3VWVA 2MZCA 5DJLA 1URMA 6GSTA 4HEA2 3EE2A 1XZOA 3H79A 3UBLA 5LCZA 2VLVA 5G5EA 4BWSA 2YWMA 2DJ1A 22GSA 4KSOA 3IDVA 1H75A 5HR0A 1G0TA 4EE0A 1DE1A 1SJIA 4ZILA 1TOFA 2TIRA 4MF6A 2HT9A 3FHKA 4FO5A 4G9HA 2FWFA 2GTUA 1BQ7A 1PQNA 3IBHA 2H0HA 1FVJA 2CVDA 3G7YA 3HVSA 3GKXA 3FR3A 1HD2A 4ZB6A 4HUAA 2HSMA 2HXKA 4JZQA 3GFKA 1M0UA 1OYJA 5IMVA 2VCZA 1GUKA 1W89A 1SU9A 2FUG2 1R7HA 2CVKA 3HYPA 4EC0A 5HR3A 4MA9A 1K0NA 4AF2A 2DIZA 3TCOA 3GX8A 2JADA 4K2DA 1GRXA 3TOTA 4RI6A 20GSA 3HKRA 1X0RA 3HD5A 4NAXA 4K6XA 1K0OA 2MMOA 1DBYA 2K8SA 5IPHA 3DEXA 1S3AA 2JZTA 3MNGA 1KEBA 2PVQA 4JE1A 1A8LA 2FD3A 5J5NA 2X8HA 1NW2A 2AUVA 2L57A 2AYTA 3D22A 3C73A 3FRCA 4X43A 2P5QA 3QCPA 3IAM2 5J9CA 2HFDA 5ENUA 3RBTA 2H30A 1U87A 1T3BA 13GSA 1OKTA 1X9WB 2HSYA 4ZBAA 4K0GA 1K0AA 2R5GA 2KP2A 3VK9A 14GSA 5IMFA 3GURA 5DDLA 4WR4A 3RHCA 1QMVA 5CP1A 1Z3EA 3LORA 3H4KA 2J9HA 3WD6A 5CRHA 5B7CA 5KN2A 4OO5A 4RQXA 1G6WA 3KXOA 4K8MA 5AN1A 3FZAA 2QSIA 1U88A 2YPMA 3U6VA 2JSYA 3TKSE 2PN8A 4JR6A 2LV3A 1YQ1A 2B7KA 4ZL7A 3NIVA 2C0GA 2FCHA 4EUYA 3VWXA 2FA8A 4IS0A 2VL9A 1YEXA 3C71A 1B4PA 2VOCA 2DC5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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