4ECBA

Chimeric gst containing inserts of kininogen peptides
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
225
structure length
202
Chain Sequence
SPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase, protein binding
molecule keywords chimeric protein between GSHKT10 and domain 5 of kininogen-1
publication title Chimeric glutathione S-transferases containing inserts of kininogen peptides: potential novel protein therapeutics.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 70
structure length 202
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ecbA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ecbA01
3GTUB 4NHZA 3RDWA 3IAM2 4MDCA 2R3XA 5COHA 3VI7A 2VCZA 4IBPA 2L59A 4RUVA 2HT9A 1XWCA 3KD0A 5ELGA 3LXZA 2FLSA 4V1Ap 2F8AA 3GN3A 1SK2A 4QQ7A 1THXA 5D9XA 1M0UA 1SD8A 3F6FA 3LYKA 2CT6A 2LSTA 4MPFA 3ZFLA 1NSWA 1Z5YE 4K1FA 5ECRB 2X8HA 1QGVA 1TXXA 3HXSA 4G19A 3EMPA 4HS1A 2LRNA 4N10A 3M3MA 3GH6A 1EWXA 4G0LA 5ECHB 4KSMA 5DALB 4I6XA 2YWIA 1X0RA 1BX9A 2VD1A 1M99A 4TW5A 2HSYA 1EOHA 4KUNA 3A3TA 3F3RA 2DJJA 3HJOA 1VF1A 3ME8A 3VWUA 5IQYA 5CAXA 1PKWA 1XWAA 3IA1A 4K8MA 2IN3A 4F9ZA 3QFBC 4WKWA 5EVOA 1DE2A 3FK8A 2CVKA 1QK8A 3GKXA 2GSQA 4YQUA 1K0OA 5HQPA 1OC9A 5ID2A 3APSA 1B4PA 3ERGA 4Q5NA 2X8GA 1QFNA 1GSQA 5DJLA 1M2BA 4USSA 5AN1A 4ECBA 5DVBA 4AJ8A 2Z9SA 3GSTA 3L9UA 3ZVJD 1A0FA 2RUFA 1SKWB 2F3MA 5L71A 3D22A 3LGCA 3FW2A 2J23A 4GRFA 13GSA 4OO4A 3HVVA 4NXIA 4MJAA 2RIIA 2V6OA 4OFNA 1K0CA 3MSZA 3N9JA 4POLA 4J56E 4KDXA 5DAKA 3F3QA 4HOJA 1JHBA 4XHMA 3VPTA 3UL3A 3KP8A 1A2JA 4ZB6A 1JLWA 3GL3A 1Z6NA 4ID0A 1TRWA 6GSSA 2PU9C 1GLQA 4NWYA 5DDLA 1O8WA 4X0XA 1I5GA 2K18A 4YH2A 1K0DA 3TKPA 1S3DA 1TK8B 2GQKA 2H71A 5KN0A 3IPZA 1G6WA 2GDRA 4GQFA 3HYPA 3ZIVA 1FB6A 3QFAC 2VL9A 2BJXA 4IS0A 1GRXA 2MMZA 1VF4A 1F2EA 3IBHA 3TKQA 2EC4A 4KAEA 2GQLA 5B6MA 1VRSD 4XRDA 4G10A 4F0BA 2OA7A 1PGTA 4POMA 4PQIA 5H5RA 1S3CA 1PD21 3QAVA 3BJ5A 2CVDA 1HNCA 1SD9A 3KZQA 1QQ2A 3GH9A 3ZZXA 3KP9A 4I97A 3R3EA 2X64A 2ZCTA 4EKZA 3LSZA 4TR0A 5AIVA 1VF2A 1SJIA 1RK4A 2OE3A 2XBQA 5ECKB 3I69A 3ZVJA 3BCIA 1M2AA 3HD5A 3UBKA 2VO4A 1M7TA 3UMAA 1SU9A 4RI7A 1GP1A 4WBJA 1F3AA 5ECQB 3CYNA 3UARA 1QXHA 2HNLA 2AUVA 5G5EA 2HQTA 4MF6A 3G9BA 3P8WA 2VL3A 2YZHA 1WP0A 3KJYA 2HRKA 4HZ4A 5ELAA 2BTOT 1AXDA 4PX1A 1AW9A 3F4TA 1NHOA 1W4VA 2CAQA 1OKTA 2C3NA 5F8BA 1B9XC 3IRAA 1GH2A 2HZFA 4OCEA 1FAAA 4Q5RA 1NHYA 3EMXA 4KGIA 2M72A 2E0QA 4LMVA 2VCTA 2UZ8A 5IIZA 4WF5A 5G2ZA 1UN2A 1YQ1A 3DMLA 1BQ7A 4IGJA 3LORA 3EWLA 5KEJA 4IJIA 14GSA 1USBA 4N0ZA 4OFTA 3W8SA 4K2DA 3IK7A 3BBYA 1OC9B 1EOGA 3ZMLA 5ID2B 2C4JA 1J0FA 2A2SA 3UOMA 2H76A 2PBJA 4BA7A 4F0CA 1WWJA 1TP9A 1G7EA 2YWOA 2H6XA 4ZBDA 1ABAA 3C7MA 2L5OA 5DCGA 1U88A 5JCWA 5KN2A 2IWTA 3CSIA 3M1GA 2B5XA 1BEDA 1HNBA 1GSEA 4K0GA 1PL1A 2H72A 3E0UA 4J57E 2VLTA 3CTGA 1BAYA 3Q18A 4ZB9A 4TVEA 5C00A 5DAKB 5AIXA 1QMVA 4GSNA 1ERUA 1TW9A 22GSA 1O7UA 1MEKA 4XS1A 2RM6A 2HRFA 2WRTA 4MLYA 2R4VA 3F4SA 1F6MC 4DSQA 5D8IA 3DVWA 3GRXA 1TK0B 3WYWA 4JEDA 2LV3A 2B7JA 2VCXA 2DMLA 3QR6A 3KTBA 2WZ9A 5ECSA 1FHEA 1R7HA 1U3IA 5GSTA 3G7YA 2HSHA 2C8UA 3HCZA 3DWVA 2L5LA 4JZQA 3R2QA 1T4ZA 1YEPA 1M9BA 5ECIB 4LL1B 1HD2A 1GTAA 2GSRA 4BVXA 1T4YA 1SKRB 4YAVA 3LYPA 2H0HA 3IE3A 3ZIJA 1WOUA 3KGKA 5IOXA 2I4AA 3IXRA 3NZNA 4H86A 1YDKA 2JZSA 3BCKA 2QC7A 3GNJA 3E9JB 1FB0A 2GZYA 1MD4A 6GSXA 4N0VA 1EGOA 4HJ2A 1E6BA 3FZ4A 3H79A 4RQRA 1XW9A 3HY2A 3TJGA 4YAPA 4PGTA 3M9JA 3FR6A 2B1LA 4IP6A 2KP2A 3DEXA 2B5YA 1K0MA 4I8BA 1SJZA 4OWYA 3DIEA 2YN1A 5E59A 1BJXA 3PH9A 3FZ9A 3ME7A 2GT6A 2P5QA 2RLIA 4KW6A 5H5QA 1TI3A 4IKHA 1FOVA 8GSSA 4I5QA 1JFUA 4TR1A 1EEJA 4BWQA 2H75A 1PMTA 4KH7A 4KDUA 5JWOB 2H1DA 4MJCA 4AGSA 1XBSA 3QD9A 2JADA 4XS4A 2FWFA 3DRNA 4J2FA 2H6YA 1GTBA 4FQUA 3TOUA 4K6XA 2IMDA 1M9AA 4EVMA 5CRDA 5CRHA 1V40A 3TOTA 5HR1A 4L5OA 3VLNA 1TK5B 4IHUA 4FYCA 1KBNA 2L4QA 1CQGA 4KE3A 2KLXA 5FHIA 3FR9A 3RHBA 3JCML 1TRVA 2WDUA 2YV9A 1FVJA 2TIRA 3TKSE 5HFGA 2A2RA 3GMFA 3BD2A 3G7IA 1S3AA 2F51A 4ZBBA 4FO5A 1G6YA 3ZTLA 3LWAA 4I2UA 5GAPD 1TTZA 2GTUA 4DSSA 4TN8A 19GSA 1A8YA 1UA5A 2JSYA 3KM6A 2C3TA 3FZ5A 3EU3A 3GHAA 4CHSA 3CBUA 1ZYQB 3DXBA 4G2EA 5HR2A 5B8AA 1OE7A 5ECMB 4TOPA 1EV4A 4P3YB 3UVHA 2WB9A 3VK9A 3HZ8A 2GLRA 1MDJA 5CYYA 2FA4A 2DJKA 2HZEA 1TI1A 1EV9A 5GAND 4EO3A 2J9HA 2NDOA 4PUAA 1HQOA 4ZL7A 2REMA 2VM1A 2C80A 2V41A 1H75A 4NV5A 1GWCA 1XFLA 2P0GA 5IMCA 3CSHA 1X9MB 4JBBA 4BVXB 2V2GA 5ABRA 2MMNA 2VL2A 4OD7A 4JR4A 1OC8A 2JU5A 2WULA 2E7PA 5J4UA 2MMAA 2VOCA 4DVCA 2G0FA 1HNAA 2C0DA 1R26A 1MDKA 1Z3EA 3TDGA 1ZMAA 2PMTA 3FEUA 4WETA 2IMKA 4D73A 2QKEA 4K9ZA 2GVPA 3GKMA 5E4WA 1T7PB 1A2LA 2H74A 1V57A 2H01A 2H0IA 2KP1A 4IQAA 1F37A 4ECCA 2VM2A 1R5AA 4O5RA 1V9WA 2IMIA 4E8HA 3HVSA 2K8SA 3GX0A 3FR3A 3GL5A 2VCWA 2VUPA 2B3SA 1XOAA 3CTFA 3P7XA 1MD3A 5G5FA 2RM5A 1TJDA 1DSBA 3GA4A 1U3AA 4QL7A 6GSTA 3KH9A 5G30A 2VL2C 3KXOA 2L4CA 2MMOA 4Q5QA 1Z7RA 2LJAA 3D6IA 1AQWA 1V98A 2KOKA 5A4UA 4RI6A 1G7OA 1XVWA 3I43A 1YJ6A 3ISOA 3VPQA 1JZWA 1XXUA 3AY8A 3KCMA 3D5JA 4HEA2 1PSQA 1R4WA 2PGTA 2H1BA 1BG5A 3U5RE 2XPDA 2HRAA 4V2NA 5EPFA 5IMZA 3RPPA 1QUWA 5IPHA 3C8EA 3A2XA 3ZL5A 2MBTA 5D96A 1VGLA 3L4NA 3TRPA 2O87A 4L8EA 3D21A 3LQ7A 3EURA 1T1VA 2JSZA 2DJ1A 4NV2A 2ALBA 2G2QA 1YF1A 4WR5A 1DUGA 1LJRA 4MP4A 2C1YA 4BL7A 2CZ2A 2ZUPA 4I2TA 4IQ1A 1GNWA 4Q5FA 4MMMA 2GS3A 1SL2B 1PN9A 4TXOA 5JWRB 4Z7XA 3GKNA 3H8QA 2L6DA 1KTEA 2CQ9A 4JR6A 1O8XA 2C0EA 1PA3A 2ON5A 2V1MA 3HKRA 3TJKA 9GSSA 2KUCA 5ECPB 2HI7A 1OKDA 4KA0A 1OC3A 4G0KA 5J9CA 5DJMA 4HI7A 3ZREA 2D2ZA 1OAZA 4FYUA 3VWXA 5JCGA 1ZZYA 1TU8A 1NM3A 2HFDA 3LJRA 3QCPA 1E2YA 4EUYA 5EL8A 1UC7A 2FCHA 3IHQA 1XWBA 4IELA 3CXGA 2AHEA 3L9VA 2M46A 3KMOA 1B48A 3KIJA 1URMA 2LJRA 2H66A 1DBYA 4MZWA 2FY6A 4NPBA 4JU5A 2GGTA 2NTOA 2E2MA 1WE0A 2DJ2A 1A8LA 5J5NA 2XPEA 2B7KA 3TRQA 2AB6A 12GSA 3DVXA 3IAS2 1J08A 2GZZA 1FVKA 4GTUA 1VF3A 1K0NA 3VFIA 4F82A 1DE1A 2WGRA 1YEXA 5HFKA 2HYXA 2GQMA 3TKRA 4O92A 1PL2A 3KEBA 2EIOA 2LNTA 2NVLA 5F06A 4EDZA 5IPGA 1Y25A 3J7Yb 5HR3A 5FT3A 2R6KA 3I6AA 4IW9A 1MTCA 3FKFA 1XVQA 1JZOA 2IJYA 1PRXA 1FO5A 1YF0A 1YKAA 2DLXA 1EP8A 4HQSA 2A4VA 2YANA 2IIYA 3ERWA 3LG6A 6GSWA 3P2AA 3S9FA 2H30A 3QDNA 3EU4A 1AC1A 2M80A 2VD0A 3EC3A 4V2LA 2P31A 3VWWA 1ON4A 2YNXA 3FHKA 1R5PA 3KTLA 2RUEA 2H73A 1GSFA 2O85A 1O81A 2LNSA 2HXKA 1N2AA 4KNDA 2CZ3A 2K6VA 1TKDB 2ZNMA 1GULA 2VIMA 4PTSA 3GFKA 1PX6A 2N5FA 4KB3A 2FWGA 4L0WA 1LBKA 1GLPA 2OJLA 1ZYEA 1XIYA 2I3YA 1ZCPA 2N5BA 4ZL9A 3FYGA 2V32A 3ZFBA 3O76A 4EXJA 4X1UA 3PR8A 4GCIA 1HYUA 2LQOA 5HFIA 2NPBA 1TOFA 5ECLB 3TUEA 4HJMA 4BL7B 2ON7A 1X5CA 2YWMA 4IJ3A 3CRUA 4IN0A 2FNOA 4XRAA 2VCVA 2XC2A 2FD3A 1ILOA 4GXZA 2X99A 3CMIA 3E3EA 1GSDA 3GKKA 3F6DA 2H8LA 4L0UA 5G1KA 4V1Ag 3C71A 4TXOB 5C04A 3TKSC 3G7JA 4PNGA 5JWQB 4OMVA 2X8CA 4TKYA 2IL3A 3VWVA 1M2DA 1PX7A 2H1AA 2HRKB 2FUG2 1T3BA 4BVYA 3TB2A 1SYRA 2DC5A 2HE3A 5IMDA 1XCCA 1GL8A 1GUKA 1GUMA 5G1LA 4F2IA 3MNGA 2IMEA 1YY7A 2YP6A 4QL9A 3RHCA 1EEMA 4X43A 4MF7A 3P90A 1XZOA 5B7CA 3H93A 4EC0A 2CX3A 3D0ZA 1B9YC 4ZIJA 1ML6A 4HU9A 3HVXA 4HZ2A 4AF2A 3KMNA 4XCSA 3Q19A 4BPYA 4IP1A 4WF4A 3M0FA 4ZILA 3C1SA 5IOWA 3DGQA 4GLTA 2P5RA 3W6GA 3SBCA 1GSYA 3EE2A 1V2AA 1AAZA 20GSA 4GWRA 1GTUA 1ERWA 1CQHA 7GSSA 4KX4A 5KN3A 4HU7A 4PNFA 3EYTA 2CVBA 3IC4A 2C0FA 1NW2A 4RQXA 4YQVA 4TRXA 4LLRA 3TJJA 4IVFA 4MZCA 2FWEA 3IOSA 2PERA 3CSJA 1EZKA 5B6NA 2O8VB 5LD0A 4F03A 1U87A 2OBIA 1XWKA 4KSOA 2K8VA 2PPTA 5IO2A 1PKZA 2VLVA 4WR4A 2R2JA 3L78A 3WT1A 2JZRA 4ACSA 1OYJA 2VLUA 3MDKA 2ES7A 1Z9HA 2IFQA 4POBA 3APOA 5ENUA 3EVIA 5H5SA 4G9HA 4O7HA 4AJ6A 3IC8A 5IMFA 4ECIA 2PN8A 5IMVA 3WT2A 2YJ7A 1JZDA 2YCDA 1V58A 3IR4A 3ZITA 3SWLA 2HSMA 1AQXA 4ULXA 3HHVA 2B1KA 3DD3A 3GSSA 3TCOA 4MA9A 1SL1B 2OE1A 2FA8A 1TDIA 2E2GA 4MPGA 1K3OA 3PINA 1K3LA 5AGYA 2AAWA 4BWSA 4ZXGA 3APQA 1WJKA 1EGRA 2FGXA 4OCFA 2VAFA 1AQVA 3N5OA 3PPUA 4XS6A 5D93A 3UAPA 5KN1A 2XHFA 3MWHA 1XW6A 1Z6MA 1GNEA 2CX4A 2JACA 4K7OA 2QSIA 3US3A 2CV4A 1AIUA 1FW1A 2YZUA 2GSTA 5D9TA 2LJKA 4PURA 4GSSA 2LTKA 2QGVA 4KF9A 3IDVA 2DMMA 1A2MA 5EY6A 3W8JA 2MZCA 3IK9A 3O6TA 3LFLA 2JZTA 1U6TA 4BVYB 2MYGA 1SKSB 3NOFA 1XPVA 4KCEA 4TR1B 2O7KA 3VURA 3U6VA 2DJ0A 5INYA 3QAGA 1WMJA 1X9WB 4K7IA 2CA8A 3UVTA 4ZL8A 4XS4B 2VCQA 1J9BA 1OE8A 1PQNA 3K8NA 4GF0A 5DCHA 2PWJA 1IYIA 2R5GA 2EIQA 2F9SA 1JZRA 3F9UA 3BOAA 5CREA 3ZLPA 1TRSA 2OADA 6GSVA 4HUAA 5GSSA 1A0RP 3M9KA 2H19A 4MH2A 3HJPA 1ST9A 2HLSA 2PUKC 4NAXA 1X5DA 1KEBA 5CO3A 3L9SA 1I9DA 4FIWA 1T8EB 3FY7A 3O3TA 3GYKA 5A4VA 1C72A 3GUSA 1ZL9A 4DSSB 1X9SB 2DJ3A 4ZBAA 5DBQA 1K3YA 1W89A 4JE1A 2LRCA 2YPMA 4PXOA 4ISDA 5G31A 2L6CA 1TU7A 5BMUA 1AUCA 3LEFA 4AJ7A 3D4MA 5F0GA 4WEYA 3V1WA 3ERFA 5JCUA 4PQHA 2GZPA 3UIWA 1XWGA 3TGZA 5D9WA 3UJ1A 3QAWA 3D4TA 4PUFC 1K0AA 2IFQB 3Q74A 1ACVA 2CAIA 1SL0B 3VI5A 2KHPA 2MBSA 3LXTA 4GSTA 1YZXA 3C73A 2HZEB 3F63A 2LRTA 4XIHA 4KDYA 2L57A 2HSMB 2WJUA 3A2VA 2IPAA 4DEJA 4NMUA 1IYHA 2PVQA 1F3BA 1X5EA 4NHWA 4DSRA 2O89A 1GSSA 2DIZA 3L0HA 1THOA 3EINA 1B8XA 4ZB8A 1FG4A 3HA9A 3GIXA 4LL4B 1GSUA 2I1UA 3CRTA 3A2WA 3PGTA 2YJHA 3IV4A 1GUHA 3ZRDA 1OVNA 4N30A 4MABA 4XTSA 4MZBA 2AV4A 3Q6OA 3QOUA 4D73B 4MCUA 1ZGNA 10GSA 3HJMA 1T00A 2OBKA 5J3RA 4K7NA 2AYTA 3A5WA 1N8JA 5F07A 3UBLA 2HRNA 3DKSA 1ERTA 2YV7A 3F0IA 4CDOA 3GURA 2I81A 3GTUA 3UEMA 2DIYA 5DQYA 1EP7A 1F9MA 5AISA 4PQ1A 2EIRA 3QPMA 5LCZA 2WCIA 2TRXA 2TRCP 4HQZA 2PVOC 5LNKe 2JL4A 3RBTA 4OO5A 4WXTA 1SYXA 1KNGA 1XOBA 4POKA 1WIKA 3HZ4A 4JRRA 3QMXA 1XW5A 4G0IA 2C0GA 1K0BA 3DYRA 2I9HA 2LS5A 4ML6A 4MJEA 2B6MA 2IMFA 3F8UA 1BYEA 1Q4JA 2OKAA 1B4QA 3WD6A 5DQSA 1O85A 1JLVA 3TKSA 3WGDA 4MH3A 5DALA 1LU4A 4TXVA 4OFMA 2OACA 3M8NA 3GX8A 18GSA 1Q98A 4WBRD 5GZZB 17GSA 6GSUA 1A24A 1SK0A 2H1GA 3FRCA 5A5KA 4TR4A 1Y6EA 2AJQB 4YQMA 5CRGA 1ERVA 4FYBA 5HR0A 1WRYA 2B5EA 1RQMA 2FHEA 1WPIA 5B8BA 2FWHA 3MAKA 5D9VA 1A23A 2H70A 2GT5A 4KCAA 2XBIA 1TRUA 1G0TA 1O6JA 5D73A 2V6KA 2DSAA 2LKUA 5ECNB 4ECJA 1SENA 5ECOB 2F8FA 2K9FA 2LQQA 2DBCA 11GSA 4LA1A 4O32A 3TRXA 5CP1A 5CNWA 2HSNB 16GSA 3OR5A 1SK1A 4EL1A 4FH8A 2YWNA 2H6ZA 4EDYA 3I9V2 2NBSA 4LMWA 2N5AA 4N11A 4ML1A 5CRWA 3FZAA 5A4WA 3C1RA 3TJFA 1RW1A 3F4RA 3GV1A 5J41A 4K0NA 3J7Yk 1SJ6A 3ZMKA 1YKCA 4L5LA 2WFCA 4MF5A 3RAZA 2H0GA 4CW9A 1ZOFA 3WGEA 2WS2A 4E8EA 3ZYWA 2LUSA 4EE0A 5IO0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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