4IKH | Genus

Total Genus 71

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	71
sequence length	227
structure length	227
Chain Sequence	SAFAVTQKWPAQFPEWIQLYSLPTPNGVKVSIMLEEIGLPYEAHRVSFETQDQMTPEFLSVSPNNKIPAILDPHGPGDQPLALFESGAILIYLADKSGQLLAQESAARYETIQWLMFQMGGIGPMFGQVGFFNKFAGREYEDKRPLERYVNEAKRLLGVLDKHLGGREWIMGERYTIADIATFPWIRNLIGFYEAGELVGIDNFPEVKRVLAKFVARPAVIRGLEIP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of a glutathione transferase family member from Pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900003, with two glutathione bound rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Pseudomonas protegens
molecule keywords	Glutathione S-transferase
total genus	71
structure length	227
sequence length	227
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	2012-12-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00043	GST_C	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4ikhA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4ikhA01

4JR6A 4I2UA 1XIYA 2CV4A 2FWFA 3TDGA 5J3RA 5DDLA 4TRXA 5J41A 4KDYA 3LEFA 3ME7A 5GAND 2JZSA 3Q19A 3C8EA 3TCOA 4N11A 1QK8A 4JU5A 2QGVA 2H1AA 4FYBA 3C7MA 3KP9A 2GSTA 4P3YB 3F4TA 2LJRA 2O87A 3HCZA 5CREA 1S3AA 5ID2B 1SJZA 3L9SA 1EOGA 2F9SA 2V41A 2H73A 1TJDA 1AXDA 4XHMA 1TKDB 3UBKA 1A23A 1VGLA 2DJ0A 2CZ3A 1GSUA 3R3EA 4HDEA 4MPFA 1O8XA 5CNWA 5INYA 2I81A 4GSNA 1OC3A 4TW5A 4V1Ap 3TJGA 4NPBA 1CQHA 2AAWA 4Z7XA 5DVBA 2CZ2A 1YDKA 4EDZA 2PU9C 5KN3A 2H72A 2HSYA 3W8JA 1SENA 18GSA 4X1UA 1WOUA 1O8WA 3W8SA 4KH7A 1SYRA 1AAZA 5EL8A 2V1MA 1PKZA 1EEJA 5FT3A 3GTUB 4GSTA 2HZEA 1UC7A 2IMDA 1BQ7A 2X8CA 3C73A 2WDUA 2PPTA 2H0IA 1TI1A 2OKAA 1JFUA 1K0NA 5COHA 3IHQA 2R5GA 3RDWA 2LV3A 1WWJA 2MMOA 1DE2A 1SK2A 3TJBA 4ACSA 5D8IA 1TRSA 1N2AA 1VF1A 5BMUA 3QFBC 5GSSA 1PL2A 4GF0A 4EVMA 2GQMA 1GNEA 4L0UA 4HZ2A 2XBQA 3QDNA 4GWRA 1FO5A 4LLRA 1T7PB 3I9V2 1FB0A 2HRFA 1GTAA 4GXZA 2LJAA 2YCDA 1XWGA 2LSTA 3DVWA 1IYHA 5AIVA 1ON4A 2FWEA 3KCMA 3ED3A 4ECCA 1XW6A 3TOUA 4BVXA 2ZCTA 2RUEA 3O76A 1FAAA 4J57E 2IMIA 6GSYA 5DALA 3DIEA 4OFNA 3P90A 2L59A 3D0ZA 3M9KA 4BA7A 4EKZA 3HDCA 3NOFA 3RHCA 3IK9A 1B4QA 1WPIA 13GSA 2HZEB 5ECLB 2PGTA 3DXBA 1SU9A 2M72A 1G6YA 4FO5A 1XBSA 2X99A 4IELA 3CSJA 3HVXA 3LYKA 4WXTA 4F2IA 2G2QA 3EYTA 1ZZYA 4MJCA 4RQRA 2YZHA 4IP1A 3F6DA 1KNGA 4HUAA 3UL3A 4KF9A 1GSYA 4MK3A 1TDIA 2YANA 2ALBA 1O81A 2PVQA 5KEJA 5B6NA 3GURA 4RUVA 2IMEA 5H5QA 1EWXA 3HVVA 1ZOFA 2HLSA 2O7KA 2HSMA 4XS1A 4KA0A 1H4OA 3FEUA 2HSHA 5KN0A 3TRXA 4E8HA 3BOAA 2XC2A 3ZREA 1HNCA 5E59A 4IQAA 6GSTA 2CVDA 1H75A 2E7PA 3ERGA 5D73A 2CVBA 1F9MA 2N5BA 1U3AA 3ZMLA 2KUCA 2EIOA 3F0IA 5ECIB 3FW2A 3FHKA 1GUHA 1YKAA 2B6MA 3VWWA 4TXOA 4Q5NA 1X9WB 1X5CA 1B48A 3AY8A 2R4VA 3IAS2 3IC4A 1YQ1A 3E0UA 4KNDA 1EEMA 1F2EA 1PD21 2B5XA 1T4ZA 4MPGA 5DQYA 3GMFA 1BX9A 1OE8A 2M46A 2I4AA 4GQCA 4IN0A 19GSA 2OE3A 3FZ9A 2PN8A 2L4CA 1GTUA 2TRCP 4I6XA 2IN3A 3VPTA 3DGQA 1BEDA 2HSMB 4MF5A 4OFTA 4GCIA 4XTSA 4MLYA 1K0BA 3NIVA 4EDYA 3E9JB 3QD9A 4IJIA 4YAVA 2X64A 1K0OA 2K9FA 5G5EA 2OADA 4XS4A 5H5RA 3O3TA 4WR4A 3QAGA 1A8LA 3A5WA 3D21A 2IPAA 2H1GA 4EXJA 4ZILA 4DSRA 1HNBA 3KD0A 3L4NA 2VLTA 2NTOA 1RK4A 2VCXA 4PUFC 2L6DA 4TXOB 1A0FA 2HRNA 1EP8A 4NMUA 5CRHA 3H93A 1XW9A 22GSA 4K9ZA 3DYRA 4YAPA 2R2JA 2DMLA 1AQVA 4LMWA 3FK8A 2REMA 3EINA 3IC8A 1XOAA 4MABA 3HYPA 1GRXA 4TR4A 2VO4A 2XPDA 5GSTA 1A2MA 1VRSD 2DJKA 3IR4A 2GDRA 5J9BA 4HU7A 3ZVJD 5AGYA 1F6MC 2MYGA 1SL2B 2NPBA 4WBJA 4TR1A 1I5GA 4GRFA 4HOJA 2HXKA 3VWXA 5AN1A 5LCZA 4EC0A 4PNGA 3L9VA 4GQFA 3UARA 5F0GA 2E2GA 2YOIA 2X8GA 1SD9A 1SKRB 4WBRD 5DJLA 2H76A 2I9HA 1BAYA 1YKCA 4EL1A 3RBTA 2V2GA 2PVOC 5F06A 4XRDA 2IL3A 1ERTA 2FHEA 3QCPA 3M3MA 2MBTA 5CO3A 3ZIVA 3VLNA 2K8VA 4X43A 4AJ7A 4PX1A 2EIRA 3ISOA 2VL3A 1AQXA 5JWOB 4ZBAA 3DKSA 1PSQA 4L0WA 1PQNA 3H4KA 2OA7A 1OVNA 2H66A 3N5OA 4TR1B 1TK5B 4MDCA 1FB6A 1YY7A 2CT6A 2VUPA 4G0LA 4K7NA 2VAFA 2IIYA 1MDKA 4OMVA 6GSSA 1U87A 3V1WA 2LRTA 3FKFA 3D6IA 3HXSA 3F6FA 2HRKA 5LNKe 1V58A 2FLSA 4QL7A 4WETA 1X9MB 3MNGA 3DWVA 3TUEA 2PMTA 2VOCA 1EGRA 2X8HA 5A4UA 5DCGA 3TKPA 3P7XA 4BVYA 1U3IA 3HD5A 2P31A 5DBQA 1V57A 2V6OA 4DVCA 2RUFA 1XW5A 4YQVA 2C0FA 2FWGA 3A3TA 1BG5A 4JBBA 1JZRA 2MMAA 3VI7A 5KN1A 3LGCA 5IOXA 1GTBA 3MSZA 4G9HA 2GS3A 1SK0A 1MDIA 2B5EA 2OBIA 1TRWA 2VCVA 4KW6A 3EMXA 1Y25A 1K3YA 2H8LA 4WR5A 3EVIA 4PUAA 2GZYA 4MP4A 4CDOA 3LFLA 2YP6A 3EU3A 4EF0A 1TP9A 3PR8A 1M2DA 2HRKB 2C8UA 3DRNA 2RIIA 4XCSA 3UOMA 5ECQB 1AC1A 4NXIA 1R26A 3E3EA 1QQ2A 2K6VA 3CBUA 3DMLA 4XRAA 2H70A 1XWCA 3GH6A 4F0BA 1K3LA 4BVYB 2EIQA 3NZNA 5B6MA 3TKSE 4Q5QA 2QC7A 1PMTA 1LBKA 4WEYA 4OCFA 2VL9A 3RPPA 2CX4A 4OO4A 2JZRA 2YV9A 1K3OA 1E6BA 4HJ2A 3ZYWA 3UJ1A 2AYTA 4DSSA 2CA8A 5C04A 3G7JA 1OC9A 2DJ2A 1GULA 2GQKA 2LQQA 1T1VA 1J08A 2MMZA 2CX3A 3WYWA 5L71A 5D9VA 4F0CA 1TW9A 1XOBA 3QMXA 2VLVA 5ENUA 2MBSA 3TJFA 2YWOA 2P5QA 4GSSA 3KH9A 5HR0A 1TI3A 2AUVA 5HQPA 1WE0A 4MZCA 4HQSA 4L8EA 1X0RA 4HI7A 2E0QA 4X0XA 4K0NA 2YZUA 4YQMA 3FR3A 1S3CA 1BYEA 3FR9A 5CRDA 3WD6A 1PA3A 5G30A 1EOHA 5G5FA 4RI7A 3APSA 2V32A 5IMAA 4ILFA 2N5FA 3CSHA 1UN2A 1XCCA 4FIWA 1B4PA 3ZMKA 1URMA 1XFLA 3C1SA 3GKNA 3IV4A 2GT5A 4FH8A 5ECRB 2L5LA 5F05A 1YF0A 1NHOA 3ZFBA 2H01A 3TJJA 5EPFA 10GSA 2FUG2 1FHEA 3HKRA 6GSUA 4IP6A 4AF2A 2B7JA 2IWTA 2H6YA 1ZCPA 5G1KA 1M2AA 3H1NA 1K0MA 1GSSA 2ON7A 2F51A 4G2EA 4ZL7A 1EV4A 3PH9A 2TIRA 1MEKA 4NWYA 2O8VB 1XPVA 3KXOA 2FD3A 2MMNA 1WP0A 1J9BA 1MDJA 3IRAA 1SD8A 5J9CA 1ACVA 4V1Ag 4LMVA 5ABRA 4J2FA 1TK8B 2C0EA 1WRYA 2JL4A 1U6TA 8GSSA 4KDUA 4L5LA 1R4WA 1QFNA 3I69A 1FVJA 1TOFA 2FCHA 4BVXB 3VWUA 5B8BA 4OO5A 2YN1A 4PQHA 3F8UA 4Q5FA 5DALB 3KM6A 2UZ8A 3W6GA 2YWMA 1TU8A 4K1FA 4F03A 1PL1A 3L0HA 1KTEA 2LKUA 2VM1A 4QL9A 3GL5A 3G7IA 2JU5A 2ZUPA 2H6ZA 5FHIA 2YPMA 2NVLA 4WF5A 1E2YA 2BTOT 3IE3A 3FRCA 3EURA 2GZPA 2B5YA 1IYIA 3GSTA 2YJ7A 3KP8A 1FW1A 2LQOA 2H74A 4D73A 1A2LA 4PTSA 3A2WA 4POKA 3Q6OA 4TOPA 5D9WA 2G0FA 1T8EB 2AV4A 3BCIA 1SYXA 2F3MA 1V98A 1OYJA 2B3SA 4PQIA 2H71A 5D93A 4O7HA 5ELAA 3GX8A 5ECNB 1YF1A 2I3YA 1ERWA 1OKDA 3UEMA 3BJ5A 1KEBA 1A2JA 2HZFA 3ZRDA 1M99A 4KDXA 3KMNA 1X9SB 1Z6NA 2PERA 5F07A 12GSA 4ZL9A 2C3NA 4RI6A 4O5RA 4WF4A 2C0GA 4TR0A 3TRPA 2GTUA 3IOSA 4K7OA 5CAXA 5IPGA 1Z5YE 4K8MA 3KIJA 5IMZA 4ZBDA 2BJXA 4KCAA 3UMAA 4BL7A 2XBIA 1QMVA 3KTBA 4DEJA 16GSA 4MZBA 1HD2A 4KE3A 2H1DA 3GIXA 1GNWA 1GH2A 3FYGA 4H86A 2YJHA 5HFGA 4D73B 2B7KA 2H0GA 4MJBA 1DE1A 3JCML 3GL3A 2FGXA 5D9XA 1HYUA 4LL4B 3WGEA 3IPZA 3QAWA 3GNJA 1T00A 1NW2A 2DLXA 2LRCA 3GYKA 2VIMA 1PKWA 1EV9A 5H5SA 2LNTA 3M8NA 4N0VA 2VLUA 1OE7A 4F82A 2QKEA 1ZMAA 1GUMA 2WB9A 3ZTLA 3WGXA 4I97A 2B1KA 3U6VA 3FZAA 4POLA 2H19A 4XS4B 3BCKA 1YZXA 4BL7B 3LORA 1O7UA 2YWIA 5KN2A 2DC5A 2P5RA 5ECKB 3TRQA 4N0ZA 1LJRA 4IW9A 1YJ6A 1PX6A 3LQ7A 3GUSA 2C0DA 5DQSA 4HS1A 2BMXA 3CRTA 3UVHA 2PWJA 3FZ4A 3OR5A 3F63A 2YNXA 2KOKA 1NSWA 3KMOA 3WGDA 4ZB9A 1ZL9A 2NDOA 3ZFLA 1I9DA 2ON5A 4OFMA 1MTCA 1O6JA 3TGZA 1V2AA 4KGIA 3SWLA 2DJ3A 2IJYA 1F37A 1TU7A 4IGJA 4ZIJA 1SL1B 2OJLA 2Z9SA 4TKYA 5JWRB 4HZ4A 2C3QA 1XWKA 3KGKA 1F3BA 1GLQA 4O32A 5EY6A 1THXA 2FA4A 3VK9A 2OE1A 4V2LA 5CRWA 4MF7A 4G19A 1AQWA 4K0GA 3TKSA 3UIWA 2CQ9A 3F3RA 1SL0B 4G0KA 4RQXA 5IO0A 4MH2A 1OC8A 4K7IA 3H8QA 2H1BA 2A4VA 5IM9A 1B9YC 1EZKA 4OD7A 3ZZXA 1AUCA 2VM2A 3HVSA 4N10A 2JSZA 1AW9A 3HJPA 1MD4A 3MAKA 1V40A 4L5OA 2DJJA 4IHUA 4TN8A 1VF3A 4IJ3A 1YEXA 2CAQA 1JHBA 3WT1A 2WJUA 2VD0A 3N9JA 1JLWA 2EC4A 2GGTA 4TR3A 4MH3A 4ULXA 2O89A 1GSEA 14GSA 3VFIA 4NV2A 4GTUA 1T4YA 2N5AA 1ERVA 1K0AA 3GFKA 1TK0B 5ECHB 1J0FA 2R6KA 2DIZA 2WZ9A 4ECJA 5IQYA 3HJMA 3UBLA 1Y6EA 1GP1A 4EUYA 4TVEA 3FR6A 1JZOA 1CQGA 5HR2A 3HA9A 3HZ8A 1SK1A 3GTUA 4PURA 2FNOA 1Z6MA 3M9JA 1UA5A 4OCEA 3QAVA 3F4SA 4HU9A 3UVTA 5LD0A 4ECIA 4HJMA 4G0IA 4GLTA 20GSA 4MMMA 1GL8A 5ECMB 1VF2A 2JACA 1W89A 1RQMA 4V2NA 1GSQA 1JLVA 2FWHA 3LSZA 2J9HA 1AIUA 2J23A 1G7OA 3KEBA 2GSSA 2DJ1A 4TXVA 5AIXA 5DAKA 3BD2A 2DSAA 1ZYQB 2C3TA 4XS6A 4ZB8A 3L9UA 4PNFA 3VI5A 4I8BA 4LL1B 3TKSC 2GQLA 5A4VA 5DJMA 1DUGA 2ES7A 5G31A 4AGSA 1Z3EA 4DSQA 2M80A 5JCWA 5J5NA 3LXTA 1NHYA 2JADA 4JR4A 1ERUA 3KJYA 3K8NA 1S3DA 3TKQA 4JEDA 5GAPD 3IDVA 4FYUA 3Q74A 5D9TA 4EO3A 1G7EA 3GKKA 5GZZB 4K2DA 4I5QA 4K6XA 5CYYA 3GV1A 1ZGNA 4MJEA 4NV5A 3CTFA 5DCHA 1GTIA 2KP2A 4HQZA 1K0CA 1TTZA 4O92A 3GH9A 3EWLA 2DIYA 5A5KA 3DEXA 2IFQA 3IAM2 3PGTA 3QOUA 4CW9A 2VCWA 2VL2C 4EE0A 4J56E 17GSA 2AB6A 5IOWA 1DBYA 2XHFA 2HQTA 2JZTA 2L5OA 5DAKB 3FY7A 5B7CA 4MJAA 2OACA 2OBKA 3TJKA 3RHBA 4V2MA 4JE1A 4DSSB 1EP7A 2GSQA 3C1RA 1U88A 2CAIA 4KCEA 2C80A 4YQUA 3GKXA 2P0GA 4IQ1A 1OAZA 3ZLPA 1OC9B 1A0RP 3ZL5A 4WKWA 2D2ZA 7GSSA 2O85A 1UVZA 1ABAA 1X5EA 6GSWA 3P8WA 3LWAA 1GSDA 1M9AA 3QFAC 3LG6A 4AJ8A 5CRGA 4ZBBA 2F8FA 1QGVA 1XWBA 1JZWA 5EVOA 4POMA 3GX0A 1ILOA 2CVKA 4OWYA 1B8XA 1Q4JA 4ML6A 2IFQB 3M0FA 3EE2A 5IMCA 3IK7A 3IA1A 2F8AA 2HRAA 1TRUA 2LJKA 5G1LA 1WIKA 1GUKA 3O6TA 2HFDA 3PINA 3RAZA 4N30A 1PN9A 1WMJA 1YEPA 2LUSA 1HQOA 3D22A 5FWGA 1GWCA 3I6AA 4I2TA 1K0DA 5JWQB 1LU4A 4NAXA 3ZVJA 2L4QA 1M7TA 2WCIA 3TB2A 1SJIA 4ML1A 2YWNA 5ECOB 2H30A 4ISDA 4CHSA 1ST9A 4PGTA 3VWVA 1TRVA 4FYCA 3A2VA 3KH7A 3KTLA 4E8EA 1XZOA 1X5DA 1SKSB 1FVKA 1V9WA 5CP1A 4KB3A 5D96A 2WGRA 3CYNA 1C72A 3CRUA 2DMMA 5IMDA 2LTKA 2L57A 5HFIA 2HI7A 1M0UA 2VCQA 2AJQB 1MD3A 3TKRA 5HR1A 1N8JA 3P2AA 2ZNMA 1QUWA 5HFKA 3IBHA 3GSSA 3R2QA 4BWQA 2HSNB 2LNSA 2GVPA 3ME8A 2GSRA 2WS2A 3ERFA 2MZCA 4MA9A 2PBJA 1Z7PA 4KAEA 3HHVA 3G9BA 3F3QA 3WT2A 2L6CA 3D4TA 1KBNA 4IKHA 2WULA 1VF4A 3DVXA 4IS0A 4MZWA 1EGOA 1XVQA 4KSOA 4MF6A 1Z9HA 2HT9A 3LXZA 2XPEA 4HEA2 1THOA 3J7Yb 1BJXA 1FG4A 5HR3A 1NM3A 2I1UA 2LRNA 3PPUA 4QQ7A 2TRXA 3MWHA 3CSIA 1A8YA 5J4UA 3GN3A 4KUNA 5G2ZA 4ZB6A 3G7YA 2HYXA 4ZL8A 1G0TA 2KLXA 3D4MA 3ZIJA 1JZDA 3D5JA 1XVWA 2V6KA 5IIZA 4USSA 1XXUA 2LS5A 3SBCA 11GSA 3FZ5A 1TXXA 2H0HA 3EC3A 1Z7RA 2R3XA 3GRXA 5ELGA 3RPNA 2RLIA 1ZYEA 2PUKC 3LYPA 1DSBA 1O85A 2C4JA 2IMKA 3S9FA 4MCUA 1R5AA 3Q18A 5IMVA 2JSYA 5JCGA 3EMPA 3VURA 4ID0A 4PQ1A 2C1YA 1PX7A 5JCUA 1WJKA 1SJ6A 1ML6A 2RM6A 3VPQA 2HNLA 2RM5A 3HJOA 3KZQA 2R37A 3ERWA 2WFCA 3HY2A 4G10A 2DBCA 4BPYA 2VCTA 4ECBA 3GKMA 3A2XA 3APOA 1PRXA 1B9XC 5A4WA 3GHAA 3LJRA 2VD1A 1M2BA 2OE0A 3M1GA 5E4WA 2IMFA 5ECPB 3IXRA 2GLRA 4NHZA 3QR6A 3HZ4A 2E2MA 1M9BA 1R5PA 2A2SA 3GA4A 3J7Yk 5AISA 9GSSA 1Q98A 4IBPA 4IVFA 2H6XA 3ZITA 3DD3A 2HE3A 4NHWA 2FA8A 3CXGA 2FY6A 1G6WA 2YV7A 5IPHA 3H79A 2K18A 4ZXGA 4POBA 4PXOA 2LEGA 2NBSA 1A24A 1SKWB 4AJ6A 3APQA 1FOVA 1QXHA 2QSIA 3F9UA 3QPMA 2KHPA 1GSFA 2B1LA 6GSVA 3EU4A 3I43A 5ID2A 1T3BA 3US3A 3U5RE 3CTGA 4FQUA 1O73A 1F3AA 1GLPA 4JZQA 1OKTA 1XWAA 5F8BA 2WRTA 5ECSA 4Q5RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4IKHA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations