4YQUA

Glutathione s-transferase omega 1 bound to covalent inhibitor c1-31
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
238
structure length
235
Chain Sequence
ESARSLGKGSAPPGPVPEGSIRIYSMRFCPFAERTRLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFKKNPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKKLLPDDPYEKACQKMILELFSKVPSLVGSFIRKEDYAGLKEEFRKEFTKLEEVLTNKKTTFFGGNSISMIDYLIWPWFERLEAMKLNECVDHTPKLKLWMAAMKEDPTVSALLTSEKDWQGFLELYLQNSPEACDYGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glutathione S-transferase omega-1
publication title Mechanistic evaluation and transcriptional signature of a glutathione S-transferase omega 1 inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 235
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.20.4.2: Methylarsonate reductase.
pdb deposition date 2015-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4yquA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4yquA01
2WRTA 1GLQA 3FW2A 2CZ2A 4G19A 4JRRA 3A2XA 2B1KA 1GSEA 4MCUA 4AGSA 1U88A 4GRFA 3KIJA 2MMZA 1DUGA 4PURA 4IELA 1TRSA 4LL1B 2QGVA 4QL7A 3HKRA 1ILOA 1XOAA 4HQSA 5F0GA 2HQTA 4EVMA 1K0NA 1E2YA 2K18A 4L5LA 3IR4A 2LRCA 2PBJA 2AB6A 2CAQA 3APOA 3BCIA 2VLVA 1BJXA 1FAAA 1BEDA 3CBUA 5ECRB 2MMAA 1XWCA 3TRQA 1V98A 1YDKA 5J5NA 2IFQA 5ID2B 4CHSA 3GTUB 3MNGA 2HSHA 4TR3A 3TJKA 5ECOB 2MYGA 4ZXGA 4G0LA 3LFLA 4FYUA 5D9VA 3IC4A 3APQA 2LJKA 3HVVA 3I43A 1Z9HA 3TRPA 4ZL7A 5DJLA 4ID0A 1LJRA 3O3TA 1KTEA 1YY7A 2F51A 3IA1A 5LCZA 4F82A 4HI7A 2TRCP 5ECLB 3TKPA 1OKDA 5IMVA 3KTBA 3P2AA 4JBBA 1OKTA 5F8BA 1G6WA 4IN0A 2CQ9A 2C1YA 1AXDA 3VLNA 2D2ZA 2LNSA 2CVKA 2I81A 1ERTA 6GSTA 2DIYA 4F9ZA 2H0HA 2XC2A 1EEJA 3GUSA 3Q19A 5AGYA 7GSSA 5ECKB 2LUSA 5J9BA 5KN3A 1ACVA 3E0UA 3KH7A 5KEJA 1TOFA 5HQPA 2KUCA 5IO0A 5LNKe 1XBSA 4PQHA 1TU7A 3EMXA 6GSXA 2VCVA 1EP7A 1W4VA 3DVWA 3FR3A 5ID2A 4FH8A 4F2IA 3GTUA 1R7HA 5F06A 2YOIA 2H6YA 4KNDA 2IMDA 3VURA 2VCTA 1SKRB 4ML1A 2K8SA 3L4NA 2H1AA 1Z6NA 1AC1A 1ZGNA 2X64A 4EXJA 2ZCTA 1NHOA 2YN1A 1A2LA 1YJ6A 2CX3A 3CSHA 5CNWA 4TVEA 4BVYB 4KDUA 1PL1A 3EU4A 1FHEA 5G31A 1NM3A 2MMNA 4IBPA 1K3OA 4YAVA 3Q6OA 3KXOA 4JR6A 1JZRA 1JZWA 1EZKA 4O7HA 19GSA 1XVQA 4GSNA 2VAFA 3E9JB 3DWVA 1S3AA 2GSQA 1XWAA 3L9UA 2I1UA 2C3NA 4EDZA 1XWBA 4BPYA 3HVSA 5HFKA 2FGXA 5D73A 3WGDA 3DGQA 1VF2A 1ABAA 3WGXA 5AIVA 3D5JA 1XXUA 4Z7XA 3CSJA 4GXZA 2A2RA 2X99A 1DSBA 3TKSA 2PN8A 2GLRA 4KSOA 3KZQA 1V58A 3GKNA 4MZCA 3UVTA 4GTUA 5ECIB 4HS1A 1TTZA 5F07A 2DJ3A 2KHPA 2PUKC 3ED3A 1I5GA 2WDUA 13GSA 3UVHA 1GL8A 2PGTA 3KMNA 4KCEA 4NHWA 5ENUA 4MF6A 2RUFA 2KOKA 4ZIJA 4YQUA 4Q5QA 4BVYA 5DVBA 1Q98A 1A8LA 12GSA 2H0GA 1AUCA 3CMIA 4KW6A 1EP8A 3GL5A 2FWFA 4NPBA 4POBA 4HUAA 2H6ZA 3QD9A 4PX1A 4XRAA 5D8IA 3NIVA 1OE7A 1T4YA 2HZFA 2BMXA 3KH9A 3HJMA 2FLSA 1O7UA 4OO5A 1IYHA 1TU8A 2H30A 1PX7A 4KF9A 3ZZXA 4CDOA 5CAXA 2LRTA 3ZVJD 1O85A 1TKDB 3HY2A 3RPNA 3FR6A 2C3QA 1PX6A 5DCGA 2OBIA 5GSSA 1JZDA 2IMFA 1OVNA 3Q18A 1U3AA 14GSA 1OC9B 2GSSA 2BTOT 3LYKA 2VD1A 1A2MA 5A4UA 5J3RA 1TW9A 1NW2A 4Q5FA 2FWEA 2LNTA 3QMXA 3Q74A 2LQQA 2H1DA 4IJ3A 2LEGA 1HYUA 3IAS2 5HFIA 2RLIA 4I8BA 1I9DA 4GWRA 2IMEA 2VCQA 2H01A 2JZSA 1VF1A 3I9V2 3ISOA 4I2TA 2GZYA 5INYA 3IHQA 2ON7A 2UZ8A 3EE2A 4K6XA 3EU3A 1M99A 1F3BA 3FK8A 5LD0A 1QXHA 2FHEA 1Z7PA 3U6VA 1O6JA 3I69A 1B48A 1JFUA 3IOSA 3HJOA 2YWOA 1K3YA 3F6FA 3IK7A 2DLXA 1O8XA 3VI5A 3H93A 4ZBBA 4HEA2 2H1BA 3GHAA 3GV1A 4ECIA 1Z5YE 3D6IA 1X5DA 4IW9A 5DJMA 3GX8A 5AN1A 3GH6A 5HFGA 1OC3A 3LXTA 5DCHA 1U6TA 2R37A 3F4SA 1SJZA 4ZB9A 3RPPA 3FZ5A 2OJLA 4O32A 1WRYA 2B7JA 3LJRA 2C0EA 4FO5A 2VL2A 4NV2A 5IIZA 2ALBA 1LU4A 5D93A 16GSA 2VCWA 2V32A 2L4QA 1FOVA 1EWXA 5D9WA 4XS6A 1OC9A 3SBCA 3IE3A 2P5RA 1OE8A 3C7MA 3A3TA 2MBSA 2CZ3A 4TN8A 2DJ2A 2REMA 2L5LA 1O8WA 4V1Ap 3HYPA 2NPBA 3VWVA 3ERWA 5HR2A 1DE1A 3WT2A 2YV7A 4IJIA 5IM9A 2FUG2 1T1VA 2H71A 2O89A 4LMVA 1O73A 1TXXA 5GAND 2YV9A 4MH3A 1N8JA 3KGKA 3EURA 3F9UA 2C3TA 4PQ1A 2B5YA 1M7TA 3EINA 3G9BA 1HQOA 2RM6A 4OD7A 2JZRA 4OCEA 2PMTA 4HU9A 2LS5A 2H76A 1K0MA 2MZCA 4V1Ag 1XWGA 4NMUA 3DVXA 1VGLA 3FZ9A 1BAYA 3GRXA 1B4QA 2I3YA 1GLPA 2HZEB 4ISDA 3FYGA 2RUEA 4YAPA 3EVIA 3UBKA 4MA9A 4H86A 4MF7A 4KGIA 2GZPA 3C1SA 1YZXA 4MJCA 2VUPA 4GQFA 2VOCA 1G7OA 5B6NA 2L4CA 1K3LA 3BCKA 5L71A 1PKZA 4MJEA 3EYTA 4K8MA 2GS3A 2NBSA 4DEJA 4K0GA 3H4KA 4KX4A 4ZILA 3V1WA 1MTCA 3CTGA 1BYEA 4EC0A 1HNAA 4RUVA 2H70A 1SD9A 3M9JA 3FRCA 3P8WA 3GA4A 4L0UA 4KSMA 2M46A 2VLUA 3UL3A 2QSIA 1YEXA 1V40A 3WD6A 3TDGA 3K8NA 1XW6A 3P7XA 2E2MA 3GNJA 4KAEA 3A2VA 5DQSA 1Y25A 3N5OA 3KJYA 3GX0A 3D21A 4XHMA 1GRXA 3PGTA 5DALA 4MZWA 1FVJA 4P3YB 4FQUA 2QC7A 5AISA 3IRAA 2WFCA 1TRUA 1GSYA 5CREA 5CRHA 2YWNA 4I5QA 3F63A 4K0NA 5ECQB 2HZEA 2JZTA 1GSFA 4DVCA 1BQ7A 3D0ZA 5IOXA 3WYWA 2NVLA 1SK2A 5IMCA 3UOMA 2YPMA 1A24A 4JE1A 2H66A 17GSA 2K9FA 4EO3A 4J2FA 1J08A 1Y6EA 5ELAA 3QR6A 3GFKA 5ECNB 4POLA 5B8BA 1TDIA 2QKEA 4CW9A 1GNWA 1XOBA 2ES7A 3QFBC 2MBTA 2CAIA 2HSYA 1WIKA 3LSZA 1WOUA 3LG6A 4MDCA 3ME8A 2GQMA 1CQHA 4KA0A 4XTSA 3ZFLA 3F0IA 2I4AA 3TUEA 4PNFA 2P31A 4N11A 5G30A 1SYRA 1YF0A 2HRNA 4V2LA 3QAVA 2G0FA 2YZHA 2PERA 1EOHA 1GTUA 6GSVA 4LLRA 1TI3A 4JEDA 4N30A 3TJBA 2DJKA 4MPFA 2F8FA 3CRUA 2B3SA 1PN9A 3QFAC 2HYXA 1AIUA 5GZZB 3TGZA 2M72A 3ERGA 2FWHA 2OKAA 3KEBA 2HI7A 2GDRA 1HD2A 2NDOA 5EL8A 1OAZA 2O7KA 1YEPA 3R2QA 1XIYA 5CRGA 3C71A 1U3IA 4NAXA 3S9FA 2H0IA 1EV4A 6GSWA 1HNCA 1SYXA 1ZMAA 22GSA 2GVPA 3W8SA 3D4MA 4KE3A 1FB6A 5FHIA 3G7JA 3CYNA 3LGCA 5JWOB 2WJUA 2X8HA 3EC3A 2XBIA 2V2GA 1OC8A 1QQ2A 2C0GA 4IVFA 1FO5A 4USSA 3GH9A 3QAGA 3DRNA 1PRXA 2A4VA 3WGEA 2VD0A 3VWXA 2F9SA 4N0ZA 2LRNA 1UN2A 3UJ1A 3N9JA 5IMAA 1GTAA 3C1RA 4IKHA 3IK9A 2HE3A 3M9KA 5H5SA 1NHYA 3TKQA 20GSA 4KB3A 3RBTA 3TB2A 4ML6A 3UIWA 2E0QA 1KBNA 2B5XA 1M2BA 2FA4A 4BVXB 2VL9A 5A5KA 2GZZA 1WPIA 2C0DA 3KMOA 4EUYA 1TRWA 1X9SB 2N5BA 5J41A 2MMOA 3HJPA 3BD2A 2H75A 3ZITA 2GSTA 5CYYA 2YNXA 1GUMA 4K9ZA 4HJMA 4QL9A 8GSSA 2R6KA 2FY6A 2VM2A 1BX9A 4KDYA 1GH2A 3SWLA 4V2MA 2B7KA 1XCCA 2ZNMA 1THOA 3CRTA 3L0HA 5JCWA 3IC8A 2V41A 5JWQB 4HU7A 2CVDA 1GP1A 1GSUA 4BA7A 1R4WA 4I97A 3IBHA 4TR4A 4TW5A 5B6MA 3HHVA 3IAM2 5G1KA 5IMZA 3A5WA 5CRDA 3HD5A 4OFNA 1M2DA 2OE0A 1K0OA 1V57A 4I2UA 3R3EA 4K7NA 4WR5A 4HOJA 3LWAA 2KP2A 4IQAA 2V6OA 2YWIA 3ZMLA 1M9BA 3L9VA 4GCIA 1YQ1A 4HZ2A 1T7PB 4KDXA 4QQ7A 3CXGA 3VPQA 3GKKA 4BVXA 2VL3A 1TK5B 4TOPA 3KP8A 4WBRD 4TR1B 2IJYA 4RQXA 2XBQA 2VCZA 1CQGA 1G6YA 2C0FA 2VCXA 3LEFA 5J4UA 2CVBA 1ZYQB 1TI1A 5IOWA 4L8EA 2LJAA 1URMA 2YCDA 2JU5A 4ZL8A 1UC7A 3ME7A 3IPZA 3KTLA 1GSSA 3LORA 2HSMB 1F9MA 3FZAA 1XW5A 1X9MB 1ON4A 2H73A 2GT5A 4RI7A 1F37A 3DMLA 4KUNA 1DE2A 4OCFA 1TJDA 2WGRA 2C4JA 3KP9A 3NOFA 5DBQA 3HDCA 1PD21 1TK0B 1PL2A 3PH9A 1GSDA 1ERVA 2P5QA 1H75A 3F6DA 4BWQA 1QMVA 4RI6A 1S3DA 5HR0A 1WWJA 2DSAA 1GTIA 2P0GA 2R5GA 3TKSE 3F3RA 1XVWA 4XRDA 4POKA 2VIMA 3TOUA 1R26A 3ZVJA 1XFLA 5B8AA 1MEKA 3GSTA 1A2JA 4POMA 5KN1A 2AJQB 1YKAA 3DIEA 4IS0A 4GF0A 4PGTA 5GAPD 1K0CA 4HJ2A 1SJ6A 3GKMA 2I9HA 2J23A 3IV4A 2GTUA 1JLWA 4V2NA 1QGVA 2K8VA 1K0BA 2IIYA 3ERFA 1VRSD 1M2AA 4TR1A 2KLXA 4OMVA 1T00A 2IMIA 4K1FA 2PVOC 2FD3A 2CA8A 3NZNA 2X8CA 2HXKA 1TP9A 1X5CA 5EPFA 5G5FA 2B1LA 3D22A 4I6XA 1JLVA 2HSMA 3TKRA 2LTKA 1GUKA 2BJXA 4ACSA 5D9TA 1RQMA 1EV9A 1SENA 4MZBA 2B5EA 1TRVA 1EOGA 3RAZA 4DSQA 3DXBA 5DALB 2TRXA 5CP1A 1A23A 5IMFA 4TXOB 1M0UA 3E3EA 2FCHA 1V2AA 3MDKA 4WF4A 5IO2A 2GQKA 1J9BA 1XW9A 4OFMA 3ZL5A 2IWTA 4IQ1A 4HDEA 2O8VB 1QUWA 2PPTA 2EIQA 4MP4A 1IYIA 5JCGA 1ZYEA 3A2WA 5F05A 1B9YC 3FEUA 4WKWA 1SL1B 3HXSA 4AJ6A 1Z6MA 2VLTA 2YJ7A 4YH2A 5J9CA 4PUAA 3HCZA 2GT6A 3UBLA 3ZYWA 1SK1A 1ST9A 3VFIA 1WP0A 3G7IA 5A4VA 3BJ5A 4NHZA 1G7EA 1EEMA 1QK8A 4EDYA 3GKXA 3EMPA 2M80A 3F8UA 1KNGA 5EVOA 1USBA 4PNGA 2R4VA 4ECBA 1F2EA 2HFDA 3PR8A 3BBYA 3ZTLA 2K6VA 1ERUA 5ECPB 3QAWA 3HVXA 1TK8B 1T4ZA 10GSA 4LA1A 3MAKA 3VK9A 3DYRA 2YANA 1A0FA 2O85A 1U87A 1WJKA 3GSSA 2YWMA 4JZQA 2LV3A 3W8JA 4FYCA 2XPDA 1J0FA 1GWCA 1SL2B 1WMJA 2EIOA 4L0WA 1T3BA 4X43A 4MH2A 3UMAA 1AQXA 4LL4B 1R5PA 3U5RE 3DKSA 4TXOA 3H79A 3TJGA 5DQYA 4ECJA 4NXIA 4PXOA 4PTSA 2LKUA 5CRWA 3O6TA 3TCOA 2V1MA 3RHCA 2FWGA 6GSUA 1B9XC 1EGRA 1B8XA 4JU5A 2VM1A 1Q4JA 5DAKB 5H5QA 1XPVA 3HA9A 2AAWA 5G1LA 4OO4A 1AAZA 2CX4A 3TRXA 5G5EA 4F0CA 5HR1A 4D73B 2HNLA 5AIXA 3LYPA 3GURA 3FZ4A 4ZBAA 1FVKA 4X1UA 4ECCA 3F4RA 2WS2A 3RDWA 3J7Yb 1S3CA 3AY8A 4HQZA 2F8AA 1SU9A 4GSSA 3US3A 4AJ7A 4KH7A 2DMMA 1SL0B 1O81A 4IP1A 2C80A 4XS1A 3RHBA 5FT3A 3GYKA 4XCSA 3TKSC 4AF2A 3PINA 3ZREA 5FWGA 4MJAA 1K0DA 1RK4A 2N5FA 5ECSA 3ZMKA 1ML6A 5ECMB 3VPTA 1XZOA 4J56E 2L57A 3FR9A 3APSA 5KN0A 1NSWA 2L5OA 5ECHB 4JR4A 1THXA 4WBJA 3M0FA 2VO4A 4WEYA 3BOAA 4F03A 1A8YA 2FA8A 4LMWA 2JL4A 3KCMA 4MABA 3QOUA 2H8LA 4MF5A 1GULA 2DJ0A 1M9AA 2N5AA 3H1NA 3C73A 4ULXA 2HRAA 1C72A 1PKWA 5IPGA 2YJHA 3JCML 11GSA 3HZ8A 2AUVA 2DIZA 1ZL9A 1SD8A 2RM5A 2E7PA 4Q5NA 3ZIJA 1BG5A 3C8EA 2JADA 5C00A 2EC4A 1MDIA 3PPUA 2HRFA 5DAKA 4G9HA 5BMUA 2HSNB 4EL1A 4TR0A 1EGOA 4MJBA 4D73A 4E8HA 1GTBA 2OA7A 3L9SA 1V9WA 1R5AA 3P90A 2HRKB 2C8UA 1YKCA 5IMDA 1GSQA 1PMTA 3M8NA 1RW1A 2HLSA 3F4TA 1KEBA 3VI7A 1SKWB 1MDKA 1H4OA 4GQCA 1K0AA 3GN3A 2JSZA 3TOTA 1AQWA 1PSQA 2ZUPA 3VWWA 2OACA 4BL7B 9GSSA 2ON5A 3W6GA 1ZCPA 1UVZA 3TJJA 3D4TA 3GMFA 2DJ1A 3VWUA 3LQ7A 5A4WA 4BWSA 5ABRA 1HNBA 4EF0A 5IQYA 2AYTA 4FIWA 4J57E 4Q5RA 1AQVA 4TKYA 18GSA 1N2AA 2A2SA 5G2ZA 1X9WB 1QFNA 3UAPA 4K7IA 2H6XA 3DD3A 4IHUA 2GSRA 4X0XA 2OE1A 3FKFA 2E2GA 4OWYA 1FG4A 2JACA 2FNOA 2IN3A 2L6DA 3DEXA 4K2DA 6GSSA 5KN2A 2Z9SA 5C04A 3GIXA 2TIRA 2O87A 2HRKA 4DSSB 4L5OA 5COHA 2AV4A 3KD0A 5CO3A 2WB9A 3ZIVA 2VL2C 4TRXA 1B4PA 1PGTA 5E59A 1GNEA 5DDLA 4FYBA 4XIHA 4NWYA 3FHKA 3MWHA 4E8EA 1X0RA 4WR4A 4BL7A 3KM6A 2LSTA 4DSRA 2WULA 3G7YA 5JWRB 2OBKA 2PWJA 4IGJA 1WE0A 1UA5A 4WXTA 1ZZYA 4MLYA 1YF1A 3IXRA 2EIRA 2F3MA 1FB0A 4GSTA 5JCUA 4F0BA 5HR3A 3H8QA 3QPMA 3GL3A 1T8EB 1JZOA 1PQNA 2WZ9A 1XWKA 1W89A 3UARA 5IPHA 2HT9A 4GLTA 4TXVA 3ZFBA 2LQOA 2JSYA 2CT6A 4MK3A 4MPGA 4ZBDA 4YQVA 2YZUA 1SKSB 1ZOFA 4N10A 6GSYA 5ELGA 2PVQA 1GUHA 2H72A 3TJFA 1LBKA 4NV5A 4HZ4A 3MSZA 1F6MC 3M1GA 1OYJA 2B6MA 4OFTA 2XHFA 4XS4B 4EKZA 5H5RA 2AHEA 2RIIA 3F3QA 4WETA 1Z7RA 2H74A 4EE0A 1F3AA 1JHBA 4G2EA 3IDVA 3QDNA 2GQLA 3WT1A 1FW1A 4DSSA 4ZL9A 5EY6A 2NTOA 5E4WA 2DMLA 4PUFC 4G10A 3ZLPA 4N0VA 1E6BA 3ZRDA 1A0RP 3FY7A 1ERWA 4WF5A 4KCAA 2IL3A 2OADA 1PA3A 3HZ4A 2IPAA 2L59A 2X8GA 4ZB6A 4MMMA 1MD3A 2DJJA 3QCPA 4IP6A 2PU9C 3M3MA 1MDJA 2H1GA 2R3XA 2WCIA 2R2JA 2G2QA 1MD4A 2L6CA 3LXZA 4PQIA 2DBCA 2IFQB 2KP1A 2J9HA 4AJ8A 1Z3EA 5B7CA 2IMKA 2GGTA 1VF3A 3L78A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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