5DAKB

Crystal structure of human glutathione transferase pi complexed with a metalloid in the absence of glutathione
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
209
structure length
192
Chain Sequence
PPYTVVYFPVRGRAALRMLLADQGQSWKEEVVTQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Visualisation of Organoarsenic Human Glutathione Transferase P1-1 Complexes: Metabolism of Arsenic-based Therapeutics
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 192
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5dakB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dakB01
5IMZA 2GS3A 1QFNA 2YNXA 1TU7A 1ZL9A 5LD0A 2VM1A 4FH8A 2YV9A 3RPNA 3QAWA 4PXOA 1J9BA 1KBNA 4KX4A 2K18A 3FEUA 1SL2B 4KF9A 3QFAC 2EC4A 4TRXA 2YCDA 3F4SA 4G2EA 3EURA 4IELA 5EPFA 1Y25A 3ZIJA 1YEPA 1AQXA 4N30A 2YOIA 1F2EA 4FYCA 2H1AA 4CW9A 2VL9A 1XFLA 1TW9A 3W8JA 2HSNB 2H6ZA 2OACA 22GSA 5IMFA 2LS5A 4I97A 2O87A 1G6YA 4YQUA 1SL0B 3FK8A 1U88A 4EXJA 2FY6A 3FZAA 5COHA 4BL7A 1W89A 2FA8A 3P8WA 3APOA 2RM5A 2YZHA 5HR3A 1A24A 3ERWA 2AUVA 2WFCA 4V1Ap 4V1Ag 6GSUA 3DMLA 4MJEA 5J3RA 4ZL9A 4FYBA 5IPHA 1QXHA 2H0IA 2B5XA 1URMA 3FY7A 1EV4A 3KD0A 4MA9A 2I3YA 1JZRA 2C3NA 4IVFA 1V98A 1UA5A 2FWEA 3FR3A 1YF1A 1GSYA 2VCZA 1WP0A 3D4MA 4EVMA 2ZCTA 3ZIVA 2VCTA 5CREA 2LEGA 3KTBA 2DJJA 1MDJA 3PH9A 3LGCA 1MTCA 1T00A 2H74A 2HLSA 2OE1A 1TI3A 1FW1A 2IMDA 3FHKA 4G9HA 1K0CA 5G1LA 3TOUA 1XVQA 3QDNA 4MH2A 5D9WA 3ZVJA 2HXKA 5ECKB 5IOXA 3CSJA 4X0XA 4ECCA 5A4UA 1R5PA 4K1FA 5LCZA 4HQZA 2AHEA 2PUKC 3UIWA 2OKAA 2DBCA 2OJLA 2HT9A 2HRKB 4YQMA 3IAM2 1VF1A 1VGLA 2H1DA 1FAAA 2VD1A 3DVWA 1WWJA 4EKZA 2VO4A 4I2TA 3VURA 3IK9A 1Z3EA 1YJ6A 1Z7RA 3F63A 1JHBA 3JCML 2H70A 4TXOA 3GA4A 1TK5B 2WZ9A 4H86A 3MDKA 4MCUA 1RQMA 2NPBA 4OMVA 4ACSA 1YY7A 2H6XA 2EIOA 2PVQA 3G7YA 3BCKA 2VD0A 1M9BA 4K8MA 1T8EB 4OCFA 4MF7A 5ECPB 4F0BA 4G19A 2H0HA 2I1UA 1X9WB 2A4VA 2RLIA 3BOAA 2R2JA 4XS4B 3F4TA 2DSAA 3EU3A 1YDKA 2CVDA 5IMAA 2DJ2A 2YN1A 2PWJA 3A5WA 1A23A 4BVYA 1Q98A 1NM3A 4O7HA 3RPPA 2H73A 2K9FA 3L9UA 5INYA 4KE3A 4ZBBA 6GSYA 3HA9A 1THOA 2C0GA 5JCUA 4F9ZA 1PRXA 2LUSA 2R3XA 1OC9A 4EC0A 2JL4A 4GXZA 5IMCA 2PBJA 1XW6A 1WMJA 1A2LA 4I8BA 3O3TA 1BAYA 4PTSA 2GSQA 2C4JA 5A4VA 1ERVA 1AXDA 4IP6A 7GSSA 4KH7A 2Z9SA 4OD7A 3QOUA 4QQ7A 3M1GA 3IK7A 2V1MA 1MDIA 3GL3A 3UJ1A 4YQVA 1GUMA 1Z9HA 3HVXA 1K0NA 1HD2A 2HRAA 1GUHA 2CAIA 1OC3A 3HZ8A 3VWWA 1UVZA 5JWOB 2F51A 2X8HA 3Q6OA 2GQKA 2GSSA 4HZ2A 5G5EA 4WEYA 2IWTA 3GTUB 1FVKA 2H1BA 4OFNA 3A2VA 3G9BA 2H30A 5GAND 2CQ9A 5FHIA 1BJXA 6GSVA 1X9SB 1AQVA 1WE0A 1I5GA 4ZL7A 3TKSE 4ULXA 4OFMA 2F3MA 2LRTA 2VLUA 2KUCA 2CT6A 12GSA 1XIYA 2VUPA 1NHOA 1V9WA 4GF0A 2JZSA 2H8LA 2C3QA 1TP9A 1XBSA 3VFIA 3A3TA 1K0AA 3MAKA 3F6FA 1EGRA 1HNBA 4X43A 4ECJA 4MJCA 1IYIA 2JZTA 5DAKB 5IMDA 1O8WA 4GSNA 2CVKA 2GVPA 2O85A 3QD9A 4JU5A 2GGTA 2LJRA 4K0GA 4MPGA 5D93A 4FQUA 2NBSA 2H66A 2DMLA 5CO3A 1K0MA 1EP8A 5F8BA 4N0VA 1XVWA 4IW9A 4XIHA 2G0FA 3IHQA 4LL4B 2E0QA 5A5KA 1ABAA 1DUGA 2VCWA 4BPYA 5CRWA 4K7NA 1RK4A 4BA7A 5ECNB 1XWAA 1SK0A 4IN0A 2LNSA 4MJBA 4N0ZA 2YANA 3VWUA 3RAZA 2IFQB 2C0DA 1SD8A 4KNDA 4K7IA 2GSRA 3MNGA 4J57E 3KGKA 2HE3A 4O5RA 2NVLA 5ECMB 1TRWA 1OKTA 3ERGA 1A2MA 4I5QA 2B7JA 3M9KA 2FLSA 1FHEA 1UC7A 4HDEA 2N5FA 1XWCA 1ZYEA 3ERFA 3TGZA 5FWGA 1PX7A 1AW9A 5D73A 1RW1A 3KM6A 4HOJA 2TRCP 1GTUA 3GKXA 1M9AA 3NOFA 4GLTA 1BG5A 1ILOA 4V2MA 4YAVA 3W8SA 2EIRA 3FW2A 4LMWA 1ZYQB 1M7TA 3CMIA 2PN8A 4TN8A 3C71A 3QPMA 4WXTA 4JE1A 6GSSA 4HJMA 5AN1A 2LJAA 3BJ5A 1ML6A 2HZEB 4KCAA 2IPAA 2HYXA 5ECRB 2AV4A 2QKEA 3D4TA 4EO3A 2MMZA 1GUKA 1GSUA 1M0UA 4ML1A 2HSHA 4K9ZA 1WJKA 5GAPD 1PMTA 5DJLA 1DE2A 5DCGA 1YF0A 4TR0A 2DC5A 5G31A 5CRGA 4XTSA 4MLYA 4K6XA 4HU9A 2LV3A 3I6AA 3FZ9A 4DSRA 4AGSA 1PL2A 4IJ3A 4KUNA 2KOKA 2YWIA 5J4UA 1GSEA 5DQYA 2HZFA 1WPIA 4MZWA 3EMXA 3P7XA 1X5DA 2V6OA 3HJMA 2HNLA 4TR1B 3TJJA 4G0KA 1NW2A 3FZ5A 2R5GA 3EINA 3HKRA 1EGOA 4JZQA 2WS2A 5IQYA 2RUFA 3LWAA 3A2WA 3HYPA 1B4PA 3TCOA 2HRKA 3GV1A 4JR4A 1TTZA 5E59A 5DCHA 5C00A 5D9VA 4KA0A 5ECOB 2V32A 4KSOA 4N11A 2YV7A 2HFDA 3CYNA 1M2BA 5J5NA 4FYUA 1V2AA 1F3AA 5G5FA 3UBLA 4WETA 3GX0A 3ZFBA 4HJ2A 2PVOC 3OR5A 1PSQA 3EMPA 2VL3A 3GKMA 3PINA 5AGYA 3LSZA 2IMIA 1QK8A 2MYGA 3IDVA 4RUVA 1TJDA 2XBIA 5AIVA 2P0GA 1WRYA 5JCGA 3C1SA 2O89A 2CX3A 4GWRA 1FOVA 2C1YA 3F4RA 3ZYWA 3CSIA 5EY6A 3KTLA 3DEXA 4AJ7A 1ZMAA 2QGVA 2GQMA 3KH7A 2B7KA 3LQ7A 3DVXA 2RM6A 4POLA 5G30A 1U3AA 4XS4A 14GSA 1S3CA 2BMXA 4RI6A 2YWOA 2HSMB 3GSTA 3KP8A 5J9BA 4Q5QA 3H79A 3IRAA 1SKRB 1GP1A 2PGTA 1AUCA 3D6IA 5CP1A 1XWGA 2K6VA 4LLRA 4OO5A 5B6MA 1JLVA 2WGRA 1QUWA 1ERUA 1BEDA 1G6WA 1FB6A 2EIQA 4XS1A 2M46A 2BTOT 3H93A 3WD6A 3VI5A 1EP7A 3E9JB 3TJBA 4ZB6A 5HFKA 4MJAA 5DVBA 4BVXB 5KEJA 5AIXA 4LMVA 3VWXA 3VWVA 1TRSA 1CQGA 2YPMA 3ZRDA 3GSSA 1DE1A 4MK3A 5HFGA 2CZ2A 2XPEA 3HJOA 2X64A 5KN0A 3L4NA 1XOBA 5CYYA 2OA7A 4KDUA 4K0NA 4ZL8A 1CQHA 3KCMA 4WBJA 1IYHA 1M99A 3KJYA 1EV9A 4NV5A 2UZ8A 1GNEA 6GSXA 3GTUA 2VLVA 3DYRA 4K7OA 3ZFLA 1G7EA 4TVEA 2O7KA 5JWQB 4WF5A 5EL8A 3IXRA 2L57A 4O32A 4HEA2 1ACVA 2AYTA 3D0ZA 5JCWA 4POBA 1A8YA 1TXXA 4IJIA 2VOCA 1EOHA 3MWHA 2ON7A 1U87A 2GLRA 5HQPA 4CDOA 3IAS2 4EF0A 4GTUA 2H0GA 3CTFA 4ECBA 2GZPA 1A0FA 4V2LA 3RDWA 4Q5FA 3PGTA 3HVVA 5DAKA 2H19A 1H75A 1AAZA 1M2AA 3H8QA 4MF6A 3ZMLA 1SU9A 1B9YC 2PU9C 4ID0A 3NIVA 1SYRA 2GZYA 1U6TA 1SK1A 4EUYA 1N2AA 4V2NA 4WR4A 3PPUA 4GQFA 3QMXA 2DJKA 2H6YA 5F07A 3IPZA 3GHAA 4NXIA 3D21A 3FR9A 5DBQA 4O92A 4G0LA 6GSWA 1XXUA 2IIYA 1XW9A 1USBA 2J23A 1ERWA 2CX4A 2IMKA 1OKDA 3DRNA 5H5QA 4MMMA 2XC2A 1H4OA 2L59A 4WR5A 3M9JA 1VF2A 4XS6A 3KZQA 1R4WA 3U6VA 3L9SA 4NHZA 1F3BA 2IFQA 2F8AA 1G7OA 4JEDA 1O6JA 2ALBA 3CBUA 4KSMA 1YKAA 1GULA 3F3RA 1MD4A 4MF5A 4PNGA 1GNWA 2BJXA 4JBBA 6GSTA 4MABA 4TKYA 3WGXA 3GUSA 3ISOA 3DXBA 3C8EA 2FWFA 4TR4A 4YH2A 5ID2B 2JACA 1GTBA 3G7JA 4RQRA 1EEMA 4PNFA 1WOUA 2C8UA 4I2UA 3IOSA 3D5JA 4WBRD 2CZ3A 2LRNA 2ZUPA 3ME8A 4IQAA 5IPGA 1TU8A 3TKQA 2DIYA 4QL7A 1DBYA 4HUAA 2CA8A 3BBYA 3IA1A 4Z7XA 5DDLA 2DJ1A 4Q5NA 4ZB9A 3GX8A 2FCHA 4HZ4A 1YZXA 20GSA 3R3EA 1MEKA 2B1KA 2HZEA 1THXA 2B5EA 1GSSA 4KAEA 4E8EA 2C3TA 3DIEA 3SBCA 2DJ0A 2TRXA 1B48A 3BCIA 4HQSA 2LKUA 1SK2A 1B9XC 2GT6A 5KN3A 3H4KA 3FRCA 3ZZXA 3AY8A 3GNJA 4XRAA 1TDIA 1DSBA 1BYEA 16GSA 5HR1A 3F6DA 3CTGA 4PQ1A 4DSSB 2WRTA 4HS1A 4TR1A 4PUAA 1GH2A 2OBIA 1GSDA 1G0TA 3ZLPA 5HR0A 2NDOA 1YKCA 3HD5A 3GIXA 5F06A 2OADA 3KP9A 1HNAA 1T4YA 5G2ZA 3KXOA 11GSA 3I9V2 1O73A 3GYKA 4NPBA 5D9XA 3D22A 2CAQA 4KGIA 3MSZA 2CV4A 4DVCA 4L0WA 13GSA 19GSA 4OFTA 2ZNMA 3KH9A 4TXVA 3M8NA 4NHWA 3HXSA 1V58A 1QGVA 2VLTA 1SJ6A 3P90A 1FB0A 1VF3A 4L5OA 1Z6MA 1F9MA 4XHMA 2I9HA 2L4QA 3HHVA 3F9UA 2REMA 2WB9A 1XZOA 2HQTA 4MPFA 4PQHA 1A2JA 1UN2A 2GQLA 1OC8A 2DJ3A 1VRSD 3EVIA 1O85A 3GKKA 3HY2A 4TW5A 5J9CA 1A0RP 3ZVJD 5B7CA 3APSA 2A2SA 2HI7A 2L6CA 3WT1A 2LQQA 4G0IA 3FYGA 3Q19A 5D9TA 3IR4A 2KP1A 5ECQB 3M0FA 2V6KA 3FR6A 1ERTA 3TRPA 3S9FA 4F0CA 2YZUA 4GSSA 5J41A 2B1LA 2XPDA 4DSQA 2GDRA 2L4CA 3LXTA 2HSMA 5ECIB 2C80A 3DGQA 4IGJA 5ELAA 2QC7A 4ILFA 5HR2A 1BX9A 2LRCA 4ZBAA 4IQ1A 2RUEA 3LYPA 2XBQA 1KTEA 1E2YA 2OE0A 1JLWA 2KLXA 3IBHA 5D96A 2R37A 2H71A 4GRFA 4J56E 1TRVA 1JFUA 1XOAA 3RHCA 1GTIA 1SJIA 3ZTLA 3GMFA 3RBTA 10GSA 4BVXA 3C1RA 2D2ZA 3O6TA 3SWLA 3HDCA 4G10A 3TOTA 1FVJA 4RQXA 1KNGA 4D73B 5DQSA 1V57A 2VM2A 2OE3A 3WT2A 2P5RA 3L0HA 2KHPA 5IIZA 2FWHA 1TK8B 4LA1A 1GLQA 5AISA 2LSTA 2MBTA 1KEBA 2I81A 3EE2A 3UAPA 3W6GA 2K8SA 2P31A 4IHUA 3QCPA 3DKSA 3GKNA 4F2IA 1O8XA 3UVTA 2IMEA 1FO5A 3TKSA 3GFKA 2OBKA 2FHEA 4KCEA 4GQCA 2MBSA 2V2GA 1K3OA 2VL2A 2WCIA 1T4ZA 2B6MA 2O8VB 4USSA 3HCZA 3FZ4A 5DALB 1BQ7A 1X5EA 1TOFA 4NAXA 2MMAA 4AF2A 5BMUA 1EEJA 2GZZA 4PQIA 4MDCA 1XW5A 4EDYA 1N8JA 3EYTA 3RHBA 3UOMA 3APQA 1XWKA 5E4WA 1HQOA 4F03A 17GSA 4N10A 1ST9A 1R26A 4L0UA 1ZZYA 4QL9A 2AAWA 4E8HA 3G7IA 3TKSC 3NZNA 3DD3A 1SKWB 1E6BA 3GH6A 3N9JA 4TR3A 4HI7A 4PGTA 5D8IA 5C04A 2NTOA 1X5CA 1B4QA 1A8LA 3K8NA 2HRFA 3E3EA 2VL2C 1QMVA 3P2AA 2VCQA 3F0IA 5GSTA 1FG4A 3LYKA 2C0FA 4ZXGA 4MZCA 1ZOFA 1R7HA 3TRQA 1HNCA 4YAPA 5KN2A 1EOGA 2JU5A 2H76A 1EWXA 2JSZA 1Y6EA 2GSTA 2GT5A 2VAFA 5CAXA 1M2DA 2R6KA 2XHFA 3LORA 1PQNA 1W4VA 2LJKA 1EZKA 2PMTA 4KB3A 1SKSB 4POMA 3KMNA 4XRDA 2YP6A 4X1UA 1X0RA 2RIIA 3EU4A 4NMUA 3UEMA 5ID2A 1XWBA 3M3MA 1VF4A 2PPTA 2E2GA 3WGEA 4BL7B 2F9SA 1F6MC 4F82A 2FA4A 1TKDB 4IKHA 2DMMA 2X8GA 4BWSA 2JADA 2MMOA 2TIRA 2YWNA 3F8UA 3VK9A 1JZDA 3IV4A 4ML6A 3EC3A 1SJZA 2WJUA 3KIJA 3HVSA 4LL1B 2MMNA 3UARA 5CRDA 4NWYA 2AJQB 2FWGA 5ECSA 5KN1A 4WKWA 4PUFC 3DWVA 1YEXA 4KDXA 2QSIA 1OE7A 2B5YA 3QAGA 1SD9A 1I9DA 3US3A 1Z5YE 4P3YB 1GTAA 5IM9A 1Q4JA 5L71A 3V1WA 1X9MB 1LU4A 4POKA 2B3SA 2L6DA 4HU7A 3ZREA 3GRXA 4L8EA 4TOPA 4FIWA 3E0UA 5H5SA 4Q5RA 2H1GA 5GZZB 4OO4A 1SL1B 2FGXA 2AB6A 4RI7A 1T3BA 4DSSA 1O81A 3LG6A 2X8CA 3Q18A 1PN9A 2M72A 3HJPA 2YJHA 3EWLA 1S3DA 4FO5A 1O7UA 5IO2A 1K3LA 3ZL5A 1PX6A 4PX1A 1NSWA 2YWMA 4EL1A 4IBPA 1J08A 1GLPA 4TXOB 1R5AA 3A2XA 5A4WA 4KW6A 1Z7PA 1OYJA 3VPTA 3WYWA 2X99A 3U5RE 2CVBA 2J9HA 1QQ2A 2KP2A 1K0BA 3IE3A 1T1VA 1GSQA 4OCEA 1PKWA 5F05A 4DEJA 5H5RA 4ZB8A 5CNWA 3TDGA 5ENUA 2IL3A 3GURA 4MP4A 2VCVA 2P5QA 2R4VA 5IO0A 5EVOA 2E7PA 1K0OA 2GTUA 3LJRA 1WIKA 4EDZA 4L5LA 3ZITA 2PERA 3LEFA 1JZOA 1ZGNA 5B6NA 3CSHA 3IC4A 4GSTA 2IJYA 5F0GA 2H72A 3ME7A 2E2MA 1J0FA 2C0EA 3KMOA 5G1KA 3N5OA 1F37A 4ZIJA 4BVYB 5ELGA 1GWCA 4ISDA 1OVNA 2IN3A 3GL5A 1U3IA 3TUEA 1PL1A 2LQOA 4ZBDA 2HSYA 2ES7A 3UMAA 1OC9B 1SENA 1NHYA 3TRXA 5DJMA 2JZRA 1AQWA 5B8BA 3GN3A 1XPVA 2V41A 2DLXA 3C73A 5LNKe 5ECLB 5B8AA 2FNOA 2FUG2 1TK0B 1K3YA 1TRUA 1PD21 3VPQA 2F8FA 2VIMA 1K0DA 1XCCA 1Z6NA 4KDYA 1GSFA 2L5LA 3C7MA 2MZCA 4D73A 4AJ6A 4GCIA 5FT3A 4MH3A 4K2DA 4IS0A 3I69A 3FKFA 1LBKA 4OWYA 4XCSA 3UL3A 4NV2A 2I4AA 8GSSA 1JZWA 5HFIA 4J2FA 1GL8A 4AJ8A 3VLNA 2VCXA 1S3AA 5IMVA 3TJKA 3QR6A 1T7PB 2N5BA 3CXGA 2LNTA 3R2QA 2DIZA 1AC1A 3I43A 2K8VA 3F3QA 1GRXA 1ON4A 2L5OA 2JSYA 5IOWA 4EE0A 3VI7A 3HZ4A 2M80A 1PGTA 5GSSA 4WF4A 1B8XA 4ECIA 3O76A 3TB2A 3Q74A 2HRNA 1PKZA 3TJFA 4ZILA 3TJGA 2G2QA 5CRHA 1TI1A 3BD2A 2N5AA 1MDKA 2IMFA 1PA3A 3IC8A 1LJRA 3TKRA 3LXZA 1ZCPA 9GSSA 5DALA 3CRUA 3CRTA 3GH9A 3H1NA 4JRRA 5ABRA 5ECHB 3L78A 3ZMKA 3J7Yb 3J7Yk 2H75A 1YQ1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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