5ECKB

Crystal structure of fin219-fip1 complex with ja, ile and atp
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
LPILLDYWPSMFGMRARVALREKGVEFEYREEDFSNKSPLLLQSNPIHKKIPVLVHNGKPVCESLNVVQYVDEAWPEKNPFFPSDPYGRAQARFWADFVDKKFTDAQFKVWGKKGEEQEAGKKEFIEAVKILESELGDKPYFGGDSFGYVDISLITFSSWFQAYEKFGNFSIESESPKLIAWAKRCMEKESVSKSLPDSEKIVAYAAEYRKNNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of jasmonate-amido synthetase FIN219 in complex with glutathione S-transferase FIP1 during the JA signal regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Jasmonic acid-amido synthetase JAR1
molecule tags Ligase/transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 61
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence C, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5eckB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5eckB01
2YJHA 4POLA 2FNOA 1WWJA 4F9ZA 3WGEA 3TUEA 5DVBA 2ZNMA 2VD0A 4WKWA 1F2EA 3EC3A 4IGJA 3L9VA 4F0BA 2R37A 1DSBA 5G30A 3RPPA 3M9KA 1EWXA 4NHWA 3UEMA 1GRXA 1EOHA 1SKSB 3GSTA 2IMKA 1T7PB 1J08A 4TKYA 1ABAA 1OKTA 2HXKA 3ZYWA 4JRRA 2MMZA 4K1FA 3QOUA 4ACSA 1VGLA 3DVWA 3D22A 3FHKA 2FWFA 1B8XA 4XS4A 2IMDA 5J9CA 3MAKA 2C0GA 2LSTA 1TRUA 1J0FA 2C3QA 3MNGA 4ZILA 2CQ9A 2FUG2 4FYUA 2DSAA 3GTUA 5J9BA 2PBJA 1V98A 3EVIA 4TR3A 4IQAA 3QAGA 4FIWA 4WR4A 10GSA 4PUAA 2L59A 2FGXA 4PQIA 2X8HA 4K7IA 1V40A 2VOCA 2FWHA 4MABA 3KXOA 4CDOA 4X43A 2HT9A 1EOGA 4IQ1A 1S3AA 2O89A 4OCEA 4ZB6A 2CV4A 2DJ3A 4NMUA 19GSA 4ZBBA 4ECIA 3ZITA 4BVYB 1Z9HA 1XVQA 1N2AA 4GCIA 1GWCA 2H6YA 2TIRA 4EO3A 2B7KA 2VCTA 1O81A 3IDVA 1SL0B 2E2GA 3KEBA 5IOWA 3N9JA 2V6OA 1VF4A 4KF9A 3IV4A 4BVXB 1TXXA 4OWYA 1YF1A 4JZQA 1PGTA 4OFNA 6GSUA 4CW9A 5D8IA 1SENA 1PKWA 1R26A 1GUKA 4ISDA 1IYHA 5C00A 2B5EA 3CMIA 1I5GA 3KH7A 3ZRDA 1YF0A 1UC7A 9GSSA 2H6ZA 2YOIA 3F6FA 4RQXA 2C80A 3GSSA 2YWMA 1A0FA 3TOTA 2CVKA 3H79A 4KDYA 2EIQA 4N10A 4EXJA 1A23A 3GFKA 5G31A 3I6AA 1T3BA 5A4WA 4TOPA 2R5GA 3OR5A 2RUFA 2R2JA 3MDKA 3E3EA 3GKKA 2YP6A 2CX4A 2OJLA 2FA4A 3ZIJA 2J9HA 1GNWA 2O85A 3QAWA 3D5JA 2HZFA 3CXGA 3ZLPA 3C7MA 4OO5A 2K9FA 3VI5A 4IW9A 4G19A 2MMAA 1JLWA 1EV4A 6GSTA 1M9BA 3W8JA 1HNAA 3GTUB 2YWOA 3DRNA 3FEUA 4D73B 1OE7A 4HQSA 5IMFA 2ZUPA 4MF7A 5B8BA 2GVPA 2LV3A 1V9WA 1PL2A 2LNTA 3IC4A 5IMCA 4X1UA 4HI7A 1ACVA 2VLTA 3TKQA 4BL7A 2H71A 2X64A 2N5AA 1O8XA 3LYKA 1YKAA 4IBPA 1TK5B 3HCZA 2RUEA 2WJUA 5IPHA 2I9HA 1LBKA 2FY6A 3IAM2 5IIZA 1T1VA 4K7OA 4F2IA 1XIYA 4EF0A 2CX3A 1R7HA 4N11A 2KP1A 2P31A 3HJOA 1TK0B 2PVOC 1X9MB 1F9MA 4QQ7A 4YH2A 5EL8A 3FY7A 2E2MA 2PVQA 2L4CA 1GSYA 4FYBA 2F8FA 1TI3A 1OE8A 1GTAA 4XRDA 17GSA 1JZRA 1OYJA 1A2JA 4HJMA 2GTUA 1SU9A 1GSDA 2IMFA 5GAPD 1R4WA 2LJAA 1YZXA 2WCIA 3LORA 1WPIA 2L5OA 4K8MA 5ECRB 2L4QA 1ML6A 2X8GA 5KEJA 3GV1A 4V1Ap 5J3RA 3ED3A 5EPFA 1VF2A 2HE3A 3KIJA 4MPFA 4MA9A 2NDOA 2DJ0A 2OE3A 4MF6A 1M7TA 1MEKA 5H5RA 1GSSA 5ELGA 2BTOT 3CSHA 3RBTA 3GH9A 3GMFA 3KTLA 4GTUA 2FCHA 2HRNA 3I9V2 1OC8A 1NHYA 3TDGA 3ZL5A 3F63A 2H1GA 3TKSC 2LJKA 22GSA 2OACA 1SJ6A 1AC1A 3GX0A 3QCPA 1E2YA 4KDXA 4RI6A 4HU9A 2F8AA 2C3TA 2YNXA 3CSIA 2IFQB 4TXOA 3VWXA 4YQMA 4YAVA 4LL1B 3D6IA 3F8UA 3QFBC 3IPZA 4XCSA 1CQHA 3FRCA 2HRFA 12GSA 2IIYA 1ERWA 4KGIA 2DJ1A 1KTEA 2MMOA 1Y6EA 1EZKA 4ZL9A 3EE2A 4ZIJA 1QGVA 4HS1A 3QAVA 3IBHA 1GSEA 1THXA 4QL9A 3F4RA 2YWIA 1Z7RA 2EIOA 4G0KA 5JCWA 3BCKA 3E9JB 5H5SA 1XOAA 1WIKA 5A4UA 3C1RA 3LXTA 4GF0A 3GL5A 2OADA 3IK9A 1YY7A 2CZ2A 1Z6NA 5DALA 3DGQA 2XPEA 5CRHA 1OKDA 3M0FA 1G6WA 3Q6OA 1FO5A 4GWRA 1XWBA 2AAWA 3GNJA 4ID0A 2FWGA 4USSA 5AIVA 4BA7A 4HU7A 1G0TA 4MH2A 5HFKA 5CP1A 4MDCA 2CA8A 2H73A 5ENUA 3G7IA 2B3SA 4F03A 1U3IA 1USBA 4MZCA 3D0ZA 4POMA 3MWHA 4WF5A 1Z5YE 1B4QA 1TU7A 4EVMA 5ECLB 1TK8B 3HZ8A 2HYXA 1SD9A 5CO3A 3TCOA 4MP4A 2M72A 4KSOA 3APSA 2HRKB 3IC8A 1K3OA 2VL9A 3A2XA 5CAXA 1ZYEA 4ZB8A 4ZXGA 3EU4A 4OFMA 2CVDA 3QR6A 4YQUA 2YV7A 3O6TA 1YQ1A 4GQCA 3DIEA 4Q5NA 4KA0A 4DSRA 3L78A 1B4PA 1SK2A 1YKCA 1JHBA 2JZRA 5CYYA 1B9YC 2HQTA 2JL4A 3G9BA 1BX9A 2VL2C 1TDIA 1W89A 4AJ6A 1B9XC 3GYKA 3EYTA 4IELA 2HFDA 1THOA 3GKXA 1HNBA 3RDWA 4KNDA 4RI7A 2K8SA 3ZZXA 3F3QA 18GSA 1R5PA 4JE1A 2P0GA 2H0HA 4PXOA 3DD3A 2K6VA 4K0GA 2GS3A 2XBQA 2OBIA 1BQ7A 3HHVA 3TJBA 2DLXA 1GUHA 4G2EA 3APQA 1XVWA 1QXHA 2H19A 3E0UA 3KCMA 4WBJA 1I9DA 2MBSA 5FWGA 4O92A 1PL1A 3P7XA 3IRAA 4HZ2A 3LGCA 2WB9A 3GN3A 1MDIA 4JBBA 3LG6A 2CT6A 1SKRB 2H1BA 1EP8A 3BCIA 3KP8A 4AF2A 3IK7A 2I81A 3EURA 1PN9A 1TOFA 5DAKA 4FQUA 1OAZA 2GQLA 3P2AA 1JZDA 1OC9B 1VRSD 2H01A 2FHEA 3KM6A 2LEGA 2VLVA 2OE1A 2O7KA 1GTUA 3ZTLA 5AGYA 6GSVA 1ZZYA 5ECIB 4E8EA 2XBIA 3CSJA 2FLSA 5HFIA 5JWQB 1V2AA 3A2VA 5CRWA 3UVHA 2B7JA 1S3CA 2HSHA 4IP1A 1U3AA 1O8WA 2GDRA 3PINA 3CRTA 1AXDA 1H4OA 1YEXA 3A5WA 3VURA 5JWOB 3IOSA 2MYGA 3KTBA 1Z7PA 4HEA2 1ZMAA 3TOUA 3WGXA 3VWVA 3NOFA 2B5XA 3EMPA 4MJAA 1GTBA 1XZOA 1KNGA 6GSXA 2HZEA 14GSA 3QPMA 1YDKA 3W8SA 4WBRD 3IAS2 4PUFC 2P5RA 1HNCA 5F05A 3WD6A 2EIRA 3KJYA 1O6JA 4TR4A 4XS6A 1SD8A 3PR8A 4K9ZA 4DSSB 4TRXA 4Z7XA 3M9JA 1T8EB 3KMNA 3M1GA 2HSMA 2WRTA 1X0RA 2A4VA 2AHEA 2ON7A 4EDYA 3VI7A 4I6XA 2ES7A 2H1DA 4ZBAA 2LKUA 5JCUA 2DBCA 5D73A 3HKRA 5D9VA 3LXZA 1G7EA 2V32A 2MBTA 4ML6A 3AY8A 5GSTA 3DKSA 5DQSA 3LSZA 4O7HA 4WR5A 3VK9A 2WS2A 3DMLA 2M80A 2C0EA 4V2MA 2IWTA 1GL8A 1FOVA 1FW1A 2ZCTA 4OO4A 2F9SA 2PMTA 2N5FA 3TKRA 1XWAA 4CHSA 1XWKA 3R2QA 1TI1A 5IMDA 1GH2A 3UMAA 4POBA 1UN2A 1FG4A 4GSSA 2K8VA 1PX6A 3FZAA 4KCAA 2K18A 3JCML 3ERFA 5D96A 3Q18A 2MMNA 2G2QA 2PPTA 1WP0A 5ECKB 3BJ5A 5DAKB 5IQYA 3HVSA 3HJPA 2MZCA 2OKAA 2H8LA 2FD3A 3QD9A 4XS4B 1S3DA 2JSYA 1EGOA 2NVLA 3F3RA 2KHPA 4KH7A 1ZYQB 2V6KA 4KAEA 4BWSA 2XHFA 4WF4A 1T00A 2PUKC 1J9BA 4TR1A 2GQMA 5KN0A 2WFCA 5G1LA 3KH9A 1ILOA 3FYGA 1TRWA 5IOXA 3BD2A 2LRNA 5GAND 1Z3EA 3K8NA 5G1KA 6GSSA 2GT5A 4MK3A 4GQFA 1F3BA 3D4MA 3UARA 4RQRA 1NHOA 1GUMA 1E6BA 5EVOA 2DJJA 3A2WA 3TRQA 4WXTA 3RHBA 3F4SA 5ECNB 1AAZA 3H1NA 3P90A 3IHQA 5DBQA 4FYCA 4MJEA 1HYUA 1X5DA 1SJZA 4Q5RA 4V2NA 3TB2A 1GSFA 2YV9A 1AW9A 2HSMB 1EP7A 4YQVA 1VF3A 2YZHA 2NTOA 4ECJA 2R6KA 3ZMLA 4ECBA 3FR9A 3IA1A 4LA1A 2RIIA 2M46A 3VFIA 2B5YA 4DEJA 2DIYA 2G0FA 2VCQA 4L8EA 2HSYA 1FVJA 4NXIA 2LNSA 3ERWA 3EINA 1ZOFA 4I97A 5DDLA 1PMTA 3D4TA 3Q74A 3DXBA 3H93A 5JCGA 1SJIA 1K3LA 5F0GA 4TW5A 1U6TA 4MJBA 5F8BA 1A2LA 1U88A 1GLPA 4N0ZA 2R3XA 1M9AA 3ZFBA 2WULA 1U87A 2VO4A 1GP1A 4NV2A 2X99A 1M99A 4HQZA 3U5RE 3QFAC 5B8AA 2IN3A 3SBCA 5IMVA 2L5LA 5D93A 4EKZA 4HOJA 5J4UA 1A0RP 1K0OA 1G6YA 3TJJA 2YCDA 2H0IA 4ZBDA 3LYPA 5J41A 3IR4A 1K3YA 2PWJA 1XW5A 1EGRA 13GSA 1GULA 2YWNA 1PSQA 4NWYA 4MJCA 4XIHA 1TRSA 3DYRA 1MDJA 2HSNB 3EMXA 1RQMA 4X0XA 11GSA 2NBSA 1BJXA 2XC2A 3FZ5A 3EU3A 5LCZA 1X5EA 2VAFA 1O7UA 3ZREA 4I2TA 1DBYA 2I1UA 3BBYA 1XOBA 4IKHA 4LMWA 5D9WA 3HZ4A 4PQ1A 4BL7B 1QK8A 4NAXA 2H76A 2OE0A 3ISOA 4KX4A 1HQOA 2RM5A 2DJKA 2X8CA 4GXZA 2LQQA 3ZFLA 2DIZA 2WZ9A 3TKPA 5AIXA 5ECMB 3DVXA 3RHCA 3A3TA 2V41A 4PNGA 2TRCP 4G9HA 4WEYA 4MCUA 4OCFA 1MTCA 2E7PA 4H86A 5ECPB 2B1KA 3UJ1A 2QGVA 2JADA 3CBUA 1EEMA 2CZ3A 5ABRA 1M2AA 4EE0A 4G0IA 1AQVA 2VL2A 1ZCPA 5F07A 4QL7A 3HDCA 4I8BA 4J56E 1SK0A 1NSWA 3VWUA 1EV9A 3TRPA 4EDZA 2JZTA 2ON5A 3HJMA 3IE3A 3WGDA 4JU5A 3US3A 2H66A 1MDKA 5B6NA 4IN0A 3F6DA 3UBLA 4V2LA 1SL1B 3GIXA 2IMIA 3R3EA 2H1AA 3P8WA 4FO5A 4N0VA 2KUCA 1A24A 4ECCA 1BAYA 2C0FA 4KB3A 1FB6A 1QFNA 5G2ZA 4L5LA 3DEXA 4ML1A 1TW9A 1XPVA 4BVXA 3PH9A 2LUSA 2GSQA 3G7JA 5HQPA 4TXOB 1MD3A 4Q5QA 4MF5A 2JSZA 2B1LA 3KGKA 1Q4JA 5EY6A 4K2DA 5CREA 1XXUA 1X9SB 5GZZB 3TJGA 1XWCA 4NPBA 1DUGA 3TJFA 3GL3A 3UL3A 2E0QA 1B48A 1XW9A 4KW6A 4PX1A 5IPGA 2KOKA 3D21A 3QMXA 4GRFA 5GSSA 4HUAA 1KEBA 5DALB 3LWAA 1SYXA 3WYWA 2IPAA 3ZVJA 5B6MA 2J23A 2CAQA 4NHZA 2PU9C 1M0UA 2B6MA 3BOAA 3IXRA 4PTSA 3HXSA 3GHAA 1UVZA 3GURA 2LRCA 3HVVA 4PGTA 3L9UA 4POKA 3LQ7A 4MH3A 5IMAA 2CVBA 2A2RA 4EC0A 3W6GA 3FW2A 1A2MA 1URMA 3LEFA 3FZ4A 4KSMA 4D73A 5DCGA 4HZ4A 5FHIA 5ECSA 3VWWA 3UIWA 4AJ8A 3HVXA 1F6MC 2OBKA 2R4VA 1DE2A 3C1SA 4PQHA 2VM1A 3C71A 3APOA 1SKWB 3ZVJD 2LTKA 4ZL8A 3FR6A 4LLRA 3KMOA 5HR1A 4L5OA 2VUPA 4AJ7A 2LJRA 3WT2A 3H4KA 4ULXA 2N5BA 1G7OA 2LS5A 1TP9A 1SK1A 5LNKe 2YJ7A 4IHUA 2GSTA 5ELAA 3GH6A 1K0MA 3GUSA 2VM2A 3HY2A 4EUYA 1FAAA 3CTGA 5KN1A 5INYA 2O87A 1PA3A 4MZWA 4BPYA 4KE3A 4ILFA 3U6VA 1SL2B 1BG5A 1GLQA 1XW6A 1XFLA 2L6DA 2XPDA 2GSSA 3NIVA 3L4NA 4IVFA 5IM9A 1AQWA 5IO2A 2VD1A 1LJRA 4GSNA 1XCCA 5ECHB 2Z9SA 2GSRA 3CTFA 3UOMA 2BJXA 3MSZA 4IJ3A 4KCEA 2AYTA 4I5QA 2EC4A 1WOUA 2L6CA 3ME7A 2A2SA 4TXVA 1T4YA 3GKMA 1DE1A 4HDEA 5F06A 3GA4A 1O73A 1K0AA 4FH8A 1KBNA 3PPUA 1JFUA 5CNWA 2H0GA 5KN3A 2PERA 1F37A 3ZMKA 2QKEA 4JEDA 4MLYA 4MZBA 5E59A 2H6XA 1QQ2A 2IFQA 2JACA 2VCZA 3PGTA 2PGTA 5DJLA 1ZGNA 4ZB9A 2L57A 4K6XA 2RM6A 2D2ZA 1Q98A 2YN1A 4NV5A 1Z6MA 4XRAA 5ECOB 4XTSA 2C3NA 2DJ2A 1CQGA 1WRYA 5H5QA 1LU4A 3EWLA 5HR2A 4E8HA 2YPMA 3I69A 2GT6A 3N5OA 2UZ8A 4K0NA 1YEPA 1GTIA 2VCXA 3CRUA 2DC5A 4DVCA 2HLSA 2I4AA 1PX7A 1QUWA 1ERVA 2AUVA 2HZEB 1K0BA 4P3YB 3O3TA 4F0CA 3ZIVA 5LD0A 1X5CA 3H8QA 4JR6A 5J5NA 8GSSA 4WETA 5IO0A 1PD21 1PQNA 2I3YA 3FZ9A 2FWEA 2JZSA 3HYPA 3G7YA 1QMVA 2GQKA 4HJ2A 2GZPA 2F3MA 5HR0A 5BMUA 3KZQA 3M8NA 4LMVA 3F4TA 5CRDA 3TRXA 2LRTA 1GNEA 3FR3A 1M2BA 3KD0A 1PRXA 1H75A 2HRKA 1ERTA 3HA9A 4EL1A 1UA5A 3RPNA 5AN1A 3KP9A 3WT1A 5ID2A 4Q5FA 4IP6A 1RW1A 3VPQA 2H75A 2RLIA 1JZOA 1GSQA 4J57E 1M2DA 1A8YA 5E4WA 1FB0A 2WDUA 1AIUA 1K0CA 1V57A 2WGRA 1WMJA 5CRGA 3TKSA 2FA8A 4L0UA 1X9WB 2GGTA 2PN8A 5C04A 2TRXA 2C1YA 4JR4A 1FHEA 3GKNA 1F3AA 4XS1A 5ECQB 2BMXA 1BEDA 2VCWA 3C8EA 3V1WA 3RAZA 4AGSA 3UVTA 5DJMA 5IMZA 2GZZA 2P5QA 2IJYA 4OD7A 1SYRA 4G0LA 3UAPA 3VPTA 4PNFA 3TGZA 2C4JA 1NM3A 1WE0A 2HRAA 3SWLA 1EEJA 1HD2A 2HNLA 1W4VA 2IL3A 1OC3A 2H70A 5G5FA 1GSUA 2AJQB 2KP2A 4TN8A 3LJRA 1VF1A 2C0DA 2QSIA 2F51A 2AV4A 1XWGA 1YJ6A 5L71A 3C73A 2DMLA 2VLUA 1PKZA 5A5KA 4G10A 4GSTA 4TR1B 5JWRB 1MD4A 4O32A 4XHMA 4TVEA 3L0HA 5B7CA 4YAPA 2REMA 3VLNA 2NPBA 1OC9A 5FT3A 1O85A 1FVKA 2VL3A 4GLTA 4TR0A 2KLXA 3ME8A 1K0DA 3L9SA 2H30A 2JU5A 4OMVA 4F82A 5DCHA 1ZL9A 3UBKA 4PURA 1ERUA 3QDNA 1TKDB 1OVNA 1JZWA 2VCVA 3M3MA 2AB6A 1T4ZA 4RUVA 2GZYA 1ON4A 16GSA 4K7NA 3NZNA 4IJIA 1R5AA 4L0WA 5D9TA 5HR3A 1RK4A 4BWQA 2O8VB 5COHA 3F9UA 4I2UA 1V58A 4LL4B 20GSA 4KUNA 3GX8A 4OFTA 5AISA 4MPGA 2H74A 6GSWA 1TRVA 3FK8A 1NW2A 1N8JA 5ID2B 4O5RA 4MMMA 2V1MA 2V2GA 5KN2A 4KDUA 4BVYA 6GSYA 2ALBA 3J7Yk 1WJKA 3DWVA 2IMEA 2LQOA 1XBSA 3ERGA 5G5EA 2C8UA 4DSSA 2DMMA 1JLVA 3S9FA 2QC7A 1ST9A 5A4VA 2GLRA 4IS0A 3Q19A 2YZUA 5HFGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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