5F05A

Crystal structure of glutathione transferase f5 from populus trichocarpa
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
210
structure length
210
Chain Sequence
PLKLHGSVLSTNTQRVLATLYEKEVEFELVNVNLGAGEHKQEPHISLNPFGQVPAAVDGDLKLFESRAISQYVAHQYASKGTQLGAAGNGYATILVWQEVESHQFDPSASKLVWEQVFKPVFGLPTDAALVAETEVTLGKVLDVYEARLSQSKYLASDSFTLADLHHLPNIQALLGTPSKKLFDSRPHVSAWVASITGRPAWGKVLALLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Populus trichocarpa
publication title Structural plasticity among glutathione transferase Phi members: natural combination of catalytic residues confers dual biochemical activities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phi class glutathione transferase GSTF5
total genus 81
structure length 210
sequence length 210
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5f05A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5f05A01
2V6OA 1SJ6A 2G0FA 5J5NA 5DBQA 22GSA 1UA5A 3DD3A 1SD8A 4HDEA 3M9JA 1I9DA 3H4KA 1XZOA 2HRFA 4YQVA 4BVXB 3I43A 3EINA 3IC4A 3V1WA 2H1BA 4KE3A 2LKUA 2YWNA 3F9UA 1GRXA 4PGTA 4MF5A 3HVXA 3HYPA 3W8JA 1PX7A 4MLYA 4V1Ag 2NPBA 2RLIA 4PXOA 1N8JA 4F9ZA 2ON7A 4MMMA 3A2WA 4G9HA 3WD6A 1VF3A 4YAVA 3Q74A 1BAYA 4N11A 5ECKB 1K0BA 1XW9A 4POMA 1TU7A 1R5PA 2OE3A 3KEBA 1ERUA 5J3RA 4LA1A 3UARA 4OMVA 3HXSA 4OFTA 1O7UA 4IQ1A 2KP2A 4KCEA 4MK3A 1SYXA 1VRSD 2IIYA 2OACA 2C0EA 4MJEA 1RQMA 4QL7A 1Z6MA 3CRUA 3O76A 4GSNA 1EEMA 4JBBA 4P3YB 4L0WA 2MMAA 2LUSA 4NHWA 1YEXA 4ECBA 3LQ7A 4Z7XA 4ISDA 3IPZA 3CBUA 5D9TA 2JZRA 1PL1A 3W6GA 4OWYA 2GSTA 1YZXA 2IFQB 3ZREA 1QMVA 5EL8A 4IQAA 3VWVA 5DAKA 2GQKA 2YJ7A 5D93A 5J9BA 3EWLA 3QFBC 4MZBA 5JWRB 2FUG2 4F2IA 1GSQA 5B8AA 3HD5A 4DEJA 2YWOA 3F4SA 1O8XA 3LXTA 1F3BA 4ECCA 5IOXA 4LL4B 3ZTLA 3HVVA 3VPQA 1TK8B 7GSSA 3UJ1A 1FO5A 1R5AA 1O73A 2ZCTA 3DRNA 2VCVA 3GA4A 2H6ZA 2HSYA 4XS4B 5B7CA 3LYPA 5CYYA 5AN1A 3M3MA 1GLQA 3UBKA 2K6VA 1Z3EA 1R26A 3UBLA 2VCTA 5DALB 3TKRA 3FK8A 1X5EA 1G7OA 3KTLA 1PN9A 1OAZA 4IJIA 5EY6A 4HU7A 2YWMA 3VI5A 3IAM2 5IPHA 2H72A 3EVIA 5ID2B 2HZEB 5KN1A 4ID0A 1GL8A 1SJIA 1GNWA 3J7Yk 2V6KA 4WXTA 4WKWA 1GULA 2LJAA 4O7HA 5J9CA 2DJ1A 2I4AA 2VLUA 4TKYA 4MF6A 1FW1A 1WJKA 3VLNA 4K7NA 2RUFA 2CVKA 4IP6A 1UVZA 1FOVA 1LU4A 3I69A 3TRQA 4ZB8A 3HJOA 4IKHA 3D22A 2IMFA 3ZIJA 3DEXA 1GSYA 1YY7A 2LEGA 4KSOA 2X99A 1BYEA 3Q6OA 1SKRB 4X0XA 2NTOA 1FB0A 2CX4A 2LRNA 1SL2B 2DJKA 1H75A 4HI7A 4K8MA 1HNCA 9GSSA 3A2VA 2BMXA 1EOHA 4TXOA 1I5GA 4MH3A 3P90A 2HSHA 3KJYA 3ZVJD 3LFLA 1GP1A 2J9HA 4LMWA 3M8NA 5JCUA 2HQTA 1XWBA 3QFAC 1NSWA 5DCHA 1A2MA 3GL5A 1GWCA 1K3LA 3NZNA 3TOUA 5ELAA 3FZ4A 2PERA 3GUSA 3UL3A 3Q19A 1MDJA 2L4QA 3UAPA 5A4UA 3CTGA 4EVMA 2L5OA 2GZPA 3SWLA 1Q4JA 4V2MA 3FY7A 2V1MA 5ECOB 3DIEA 4DVCA 2R6KA 4N0ZA 4D73A 5HFKA 2V41A 1B9XC 4MJBA 3IAS2 2DJ0A 1ERWA 4I97A 3FZAA 4HQZA 1BEDA 2AB6A 2E7PA 3F6DA 5IMZA 3O3TA 4N0VA 2LQOA 3TUEA 4TR1B 5JCGA 3KM6A 2LQQA 2AUVA 1TDIA 2JZTA 4G0KA 2GZYA 2YP6A 3VPTA 2FA8A 1G6YA 2CVBA 3F4RA 3ZRDA 4GTUA 1KBNA 1BG5A 1PD21 1XCCA 1SYRA 1XPVA 4JR6A 4O92A 4MPGA 3J7Yb 2H01A 4G0IA 2TRXA 5DQYA 3TKQA 1V57A 3WT1A 2GLRA 1SKWB 2KLXA 1GUMA 3C73A 1AAZA 2N5BA 3ZMKA 1F3AA 12GSA 3FHKA 3UOMA 1TK5B 2RIIA 4K7IA 3HZ4A 4I6XA 3FR3A 4IHUA 2L4CA 4NV5A 4ZB6A 4TVEA 3UMAA 1EP7A 3QR6A 2R4VA 2ZNMA 2V2GA 1EZKA 2ALBA 3C1SA 1TJDA 3QAVA 3TB2A 4TOPA 2IMIA 4PURA 2GSRA 2EC4A 2AV4A 5DVBA 2VLTA 5IO0A 2KP1A 1YF0A 1K0MA 1JFUA 5D9XA 3RPNA 5CO3A 3MDKA 4G0LA 2WZ9A 2HYXA 3LORA 5LD0A 1URMA 1B48A 3CSIA 1T4YA 4V2LA 4FQUA 3ZFLA 4J56E 4MP4A 1PSQA 3ZZXA 5H5QA 2GS3A 4HEA2 1GTBA 2VUPA 3U5RE 1O6JA 1U88A 4OO4A 1T7PB 3LG6A 5KN0A 4RI7A 1WOUA 3BBYA 3ZITA 2OE1A 1GSDA 3N5OA 4LL1B 3IOSA 2E0QA 4KUNA 1JZDA 4GXZA 5H5SA 2H30A 4MABA 5L71A 2RM6A 2WS2A 3ERFA 2K8SA 3ED3A 2N5FA 1OVNA 2E2MA 4PUFC 5FWGA 2MMOA 4BWQA 4ZL9A 3MNGA 2MBTA 5ECIB 2MMNA 4AJ8A 2LNSA 2VM2A 3D21A 4OCFA 4G19A 1WMJA 4NPBA 5LCZA 4EF0A 1JLVA 4WF5A 1WRYA 3TJBA 3KGKA 1EV4A 14GSA 2CA8A 4I5QA 4IGJA 4XS6A 2GT6A 2FY6A 2HSMB 4L8EA 1HQOA 1GSFA 2H75A 4MA9A 3SBCA 4IVFA 3IK9A 4WBRD 5CRGA 3F4TA 13GSA 4I2UA 1XVWA 2IL3A 1IYHA 1XFLA 2HNLA 4ZBBA 2DIYA 2YWIA 1XW5A 3TKSE 2HZFA 2F8FA 4PNGA 1FHEA 3GSTA 4AJ7A 2FD3A 3GTUA 2GVPA 1A2LA 3KMOA 1NW2A 4ECJA 4CDOA 4CHSA 2GT5A 2XC2A 3RHCA 2JU5A 1E2YA 4MCUA 3HA9A 2CVDA 1V40A 4J57E 4WF4A 2D2ZA 4EL1A 1U6TA 2MZCA 3EU4A 1M9BA 2CQ9A 1TRWA 1ZYQB 3D4MA 3H1NA 1JZWA 2HRAA 5GZZB 3M0FA 4F0CA 3WGEA 4F82A 1ILOA 3PPUA 1TRSA 1DE1A 3HDCA 2OA7A 4NV2A 2XPDA 2H70A 3FKFA 1GLPA 4I2TA 3PR8A 1OC9B 2FWGA 3GH9A 3CSJA 4RQXA 4JZQA 3RAZA 2HT9A 2ES7A 5CRDA 2VCXA 5B6MA 3GSSA 2A2SA 4O32A 3PGTA 2L5LA 2VL2A 2C0FA 4BL7A 2H1GA 3EMXA 3CTFA 2KUCA 2QGVA 6GSYA 4MJCA 1PMTA 3VI7A 2GSQA 4BPYA 1BX9A 2F3MA 3VWXA 1X5DA 3S9FA 3KMNA 2H1DA 4HS1A 4TXOB 2MBSA 2A2RA 3EU3A 2YV7A 4L5LA 4K9ZA 1B9YC 4QL9A 3A5WA 1Z6NA 3GX0A 1V58A 3CXGA 2V32A 2OADA 3HZ8A 3HHVA 3VWUA 3LWAA 2WRTA 2FWFA 1QQ2A 3I6AA 5G30A 2ON5A 6GSTA 5COHA 4G2EA 4ZL8A 1XIYA 3GNJA 4ILFA 3L4NA 5JWQB 1AQVA 3LYKA 5LNKe 1MTCA 1X0RA 2VIMA 4OD7A 1OKTA 1SJZA 4KX4A 1ZCPA 1M2DA 3DMLA 1ZGNA 4D73B 1Z5YE 1HNAA 1USBA 4MZWA 3DVWA 3W8SA 5HQPA 1AW9A 3M1GA 1X9MB 1DUGA 1XWCA 1UN2A 5GSSA 4TR0A 1NHYA 1SL1B 4XIHA 4BVYB 5B6NA 1BJXA 3C71A 4E8HA 1M99A 1PL2A 1TKDB 3TKSA 1C72A 4Q5RA 2JZSA 5G1LA 4PQHA 2O89A 5HR2A 3QMXA 4GQFA 1OE7A 3LSZA 4HU9A 2I1UA 2N5AA 1Q98A 4BVXA 1TXXA 1ZYEA 4K2DA 3GFKA 2DJ2A 2DSAA 2C3QA 1H4OA 3QD9A 4DSSB 1FAAA 3VWWA 2CT6A 2DLXA 1G0TA 4KW6A 4MH2A 2WB9A 5IMFA 5JWOB 1X5CA 2YCDA 3G7JA 1JZRA 3ZVJA 3R3EA 1MD4A 1AQWA 2B7JA 3IDVA 3WGXA 2WDUA 2LJRA 4L0UA 1Y25A 3IR4A 4CW9A 5ECMB 2O8VB 1R4WA 3WGDA 4YAPA 3IXRA 4ML1A 2UZ8A 3RDWA 3GL3A 3E3EA 5C04A 2VCZA 3U6VA 4JR4A 3APQA 5EPFA 4BA7A 4NWYA 1QUWA 2MMZA 1GH2A 3ZYWA 5FHIA 11GSA 1TI1A 3TGZA 2YN1A 4EO3A 3WT2A 2IMDA 4OFNA 3BCKA 3LEFA 6GSXA 3L9VA 1JZOA 2IFQA 5KN2A 2VD0A 4ULXA 2VCQA 3TOTA 4POKA 2HSNB 2IWTA 5H5RA 5D96A 5ECQB 3GKXA 3TJKA 2PN8A 3F3QA 4WR4A 4LMVA 4ZILA 4FIWA 1UC7A 1TI3A 2O85A 3F63A 3TRPA 2PU9C 2DIZA 1W89A 5J4UA 1A2JA 2H74A 1SK0A 1HD2A 2HLSA 2CX3A 1PKWA 5DQSA 3RBTA 2IN3A 1S3DA 2JACA 3US3A 4XS4A 2H71A 2C80A 3QAGA 3ME8A 2DMLA 2M46A 1YKAA 3DVXA 1YEPA 2WFCA 1EP8A 3G7YA 4JEDA 5DALA 1RW1A 2O7KA 5HFGA 2C3NA 2X64A 5G1KA 4HQSA 3JCML 2JSZA 1F9MA 5DCGA 2NVLA 2JADA 2R37A 4OO5A 1QFNA 4K1FA 1ABAA 4KAEA 3ERWA 1SD9A 2LJKA 1M9AA 5ID2A 3GMFA 4FYCA 3KZQA 4HUAA 4NMUA 2GSSA 2RM5A 3TCOA 4DSQA 3DYRA 4I8BA 2EIQA 3CSHA 4GRFA 1BQ7A 18GSA 2PUKC 2C4JA 2I3YA 1MEKA 1TRVA 1OE8A 4XTSA 3H93A 4X43A 3FR9A 4ZBAA 2H0GA 3R2QA 4K6XA 1PGTA 1K0CA 4Q5NA 2CAIA 3LXZA 1XOAA 1LJRA 5ECPB 1SK1A 4EDZA 1K0OA 4KH7A 3QPMA 4OCEA 1A0RP 3L0HA 5ECRB 2XBIA 2R2JA 3IA1A 4FO5A 2B7KA 3NIVA 3EURA 5ENUA 1A23A 1AUCA 2FLSA 2OE0A 1QXHA 2HXKA 5CAXA 6GSUA 4ZB9A 10GSA 5HFIA 1YDKA 5BMUA 3VK9A 2B1KA 5F0GA 4NHZA 2A4VA 3L78A 2RUEA 1B4QA 2VCWA 5ECNB 3KP9A 1XXUA 6GSVA 4DSRA 4NXIA 2C1YA 1WE0A 4XS1A 2GGTA 5D8IA 2H0IA 1AC1A 3TDGA 3QAWA 2YOIA 2H66A 1W4VA 3O6TA 5ABRA 5A5KA 2BTOT 2LTKA 2CZ3A 1Z7RA 2PBJA 6GSSA 1OC8A 4MZCA 5IM9A 1Z9HA 5IPGA 2DBCA 3LGCA 1AQXA 1GNEA 1ST9A 1U87A 3KCMA 5CP1A 4TR1A 1GSSA 5DAKB 2B6MA 2FGXA 2PPTA 1F6MC 3GURA 4ACSA 1PQNA 4EKZA 2WJUA 1K3YA 1O8WA 5G31A 2HRKA 1EOGA 1V2AA 3E9JB 5CREA 5KEJA 3CYNA 3DGQA 4ECIA 1ZMAA 4POLA 1GUKA 2F51A 5CNWA 1KNGA 3D5JA 3H79A 2JL4A 5JCWA 2TIRA 1M2AA 3M9KA 3TJFA 3GKNA 3GYKA 4IW9A 2L59A 4USSA 3FZ5A 5AGYA 2FWEA 5G2ZA 3KH9A 2I81A 3GH6A 3ME7A 2GTUA 8GSSA 1FVJA 5EVOA 2REMA 1XWAA 1SL0B 2PVOC 3K8NA 1WPIA 1THXA 1OKDA 1OYJA 3F8UA 2AAWA 2DMMA 2EIOA 3UVHA 1F2EA 4EXJA 4XCSA 2GZZA 3DWVA 2HFDA 2AHEA 5CRHA 1VF2A 2EIRA 2NBSA 5F06A 3PINA 2X8CA 1SENA 3TRXA 1JLWA 4IELA 4PTSA 4AF2A 3D4TA 5DJMA 1IYIA 4GWRA 4RUVA 1K0AA 1Y6EA 3L9SA 3TKPA 4WR5A 2WGRA 2JSYA 2P5RA 2IMEA 4JU5A 4MPFA 4ZIJA 2L6CA 4N30A 1FVKA 1O85A 5F05A 1V98A 4Q5FA 5ECHB 2C0DA 1M0UA 2YZHA 3ZMLA 3C8EA 1EEJA 3RHBA 5IMCA 4WETA 1A8YA 1HYUA 3IRAA 4HOJA 4H86A 3KTBA 4TR4A 1B4PA 5E59A 2YZUA 2DJJA 1SK2A 2L57A 4Q5QA 2F8AA 3C7MA 1YJ6A 4GF0A 3QCPA 1RK4A 4F03A 4JRRA 4KCAA 4PNFA 2IJYA 4HJ2A 2B5YA 3UEMA 5AISA 1QGVA 4KB3A 2HSMA 4K7OA 6GSWA 3P7XA 1M7TA 1K0NA 1WWJA 1K3OA 4PX1A 1JHBA 5HR3A 1YKCA 3IE3A 1B8XA 1T4ZA 1E6BA 2PVQA 1NHOA 2FWHA 2OJLA 4K0NA 2IMKA 3CRTA 3HVSA 4WBJA 1XW6A 2VL3A 3HJPA 4XRDA 4PUAA 3FRCA 1AIUA 5E4WA 1SKSB 5ECLB 2KHPA 4MDCA 3GHAA 2AJQB 4FYUA 2X8GA 3DXBA 1U3IA 1G6WA 4BWSA 3KP8A 2VL9A 4GSSA 1XWGA 4IP1A 3AY8A 5IMVA 5FT3A 2BJXA 16GSA 4EE0A 4KGIA 20GSA 17GSA 1MDKA 1T8EB 1J0FA 1F37A 3F3RA 4X1UA 4E8EA 4EDYA 2VLVA 2LRTA 5F8BA 1VF1A 3APSA 4TRXA 3GIXA 1OC3A 1OC9A 3FEUA 2R3XA 2C3TA 3BCIA 4KDXA 1T00A 3DKSA 2LRCA 3ZL5A 1K0DA 4QQ7A 3VURA 3GV1A 1S3AA 4ZL7A 4V2NA 1ACVA 2J23A 4AGSA 4TXVA 3OR5A 2AYTA 1XWKA 4O5RA 3CMIA 2I9HA 1WIKA 1EWXA 5IMAA 5D9VA 3MSZA 3IV4A 1CQHA 4FYBA 2FHEA 1XOBA 4KSMA 3ZLPA 5A4VA 1FG4A 1PX6A 2LS5A 3HKRA 5ECSA 3FZ9A 2H6XA 1A24A 1MDIA 2P31A 5GAND 3G9BA 2IPAA 1CQGA 2GQLA 4KA0A 5DDLA 1GTUA 2M80A 5G5FA 3HY2A 3MWHA 5GSTA 2HE3A 2YJHA 1A8LA 1GSEA 3GKKA 5AIVA 1EGOA 2ZUPA 1AXDA 1KEBA 3LJRA 2HRNA 4PQIA 3I9V2 3KXOA 2PGTA 3N9JA 2NDOA 2WCIA 4GQCA 1EGRA 2Z9SA 1THOA 3WYWA 4MJAA 2FCHA 2H1AA 4KDYA 3BJ5A 1ERVA 2B1LA 3F0IA 4IS0A 1TP9A 3ERGA 3NOFA 5KN3A 2CZ2A 4GLTA 4BVYA 4AJ6A 4HZ2A 3MAKA 3HJMA 1MD3A 3FR6A 1KTEA 4TW5A 3A3TA 1VF4A 4TN8A 5ELGA 1ERTA 2K8VA 3G7IA 2H8LA 2HZEA 2TRCP 3VFIA 5IMDA 4PQ1A 5INYA 2XHFA 3TJJA 1ON4A 4KDUA 2HRKB 4IN0A 1GSUA 2VM1A 2H73A 3BOAA 1QK8A 4LLRA 2PWJA 1ZL9A 5IQYA 5C00A 3ZFBA 2FNOA 3P8WA 4N10A 2G2QA 2LSTA 4DSSA 1ZOFA 2VL2C 5G5EA 2C8UA 5F07A 2H0HA 4KNDA 1TOFA 1M2BA 2DJ3A 4F0BA 4IBPA 3FYGA 2H76A 4XRAA 3D0ZA 1G7EA 4ZXGA 3HCZA 2K9FA 3GTUB 4HZ4A 2R5GA 3UIWA 5IOWA 5D73A 2B5EA 5GAPD 1T1VA 2VAFA 3ZIVA 3A2XA 4EC0A 2WULA 3F6FA 4GCIA 3KH7A 3FW2A 1NM3A 3H8QA 5D9WA 1PA3A 4RQRA 2FA4A 3KIJA 4K0GA 2OBKA 1T3BA 2M72A 3BD2A 2QSIA 3EYTA 3ISOA 4NAXA 1HNBA 5B8BA 4WEYA 4EUYA 1GUHA 1J08A 1A0FA 2B3SA 1N2AA 1PKZA 4HJMA 1TW9A 1U3AA 1XVQA 1TTZA 4MF7A 2XPEA 1EV9A 4XHMA 2GDRA 2CV4A 3EC3A 2YPMA 1J9BA 3QDNA 5J41A 1ZZYA 4YQMA 4L5OA 2MYGA 1GTAA 2H19A 4BL7B 19GSA 2VD1A 1VGLA 1GTIA 1V9WA 3RPPA 2H6YA 4YQUA 1XBSA 5IIZA 2PMTA 2E2GA 2XBQA 4KF9A 3TKSC 2CAQA 5IO2A 4J2FA 1DE2A 3GX8A 2QKEA 3GN3A 2P5QA 2LNTA 2LV3A 3C1RA 1PRXA 2HI7A 5HR1A 4V1Ap 3UVTA 1TU8A 3Q18A 1Z7PA 4ML6A 2F9SA 1DSBA 2OBIA 5DJLA 3APOA 3KD0A 3P2AA 2YANA 3PH9A 5CRWA 1LBKA 2B5XA 2X8HA 1DBYA 2K18A 5AIXA 1X9WB 3EE2A 4RI6A 2KOKA 1YQ1A 2GQMA 3QOUA 2QC7A 5A4WA 1SU9A 4POBA 5HR0A 2VOCA 3D6IA 4G10A 4OFMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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