5IQYA

Structure of apo-dehydroascorbate reductase from pennisetum glaucum phased by iodide-sad method
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
VEVCVKAAVGAPDILGDCPFSQRVLLTLEEKKITYEMKLVDLSNKPEWFLKISPEGKVPVFNSGDGKWIADSDVITQVIEEKFPTPSLVTPPEYASVGSKIFPSFVKFLKSKDASDGSEKALLDELQALDEHLKAHGPYISGENVSAADLSLGPKLFHLQVALEHFKGWKIPENLTSVHAYTKALFSRESFVKTKPANQYLIAGWAPKVNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Pennisetum americanum
publication title Non-native ligands define the active site of Pennisetum glaucum (L.) R. Br dehydroascorbate reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dehydroascorbate reductase
total genus 61
structure length 211
sequence length 211
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2016-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5iqyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iqyA01
3QCPA 1SL0B 2HXKA 5F06A 4YQVA 1TW9A 3LG6A 1WMJA 1PSQA 10GSA 1ZCPA 4XRDA 2DJ1A 2YZUA 4ECJA 3F4RA 2WRTA 4KH7A 5GAPD 3RAZA 4PXOA 5F0GA 2OBIA 2EC4A 17GSA 1Y6EA 4NHZA 1K0NA 3U5RE 1SK0A 3APQA 5HQPA 3D22A 4K7NA 2PN8A 4NAXA 1SL1B 1V57A 3N9JA 2VCVA 1M7TA 2HZEA 1BJXA 2FCHA 2VUPA 5CNWA 1SKSB 2OE3A 2OE1A 3TKPA 4LL1B 4WBRD 1PN9A 1NHOA 3GSTA 3ZLPA 2H76A 1Z6MA 4OMVA 4JR6A 4HUAA 3P8WA 3E3EA 3FR9A 2L6CA 2LJAA 1T4YA 1ML6A 2IMKA 1AQXA 2L4CA 3PR8A 4X43A 1QXHA 2DIYA 3GSSA 4XS1A 5G2ZA 1EOHA 3NIVA 2HRFA 4BA7A 3QAVA 5ECLB 1M2BA 2LS5A 2WZ9A 2ON7A 3QFBC 3QDNA 1FAAA 4I97A 4K0NA 3LORA 3VURA 1PMTA 4XS4B 3Q74A 2GT5A 1XWCA 5D93A 13GSA 2B7KA 1F9MA 4PUFC 3TKQA 1K0MA 4MPGA 4DSQA 1ILOA 1KNGA 1GL8A 3IK9A 2HYXA 2HZEB 1GP1A 4NHWA 1XWGA 3H8QA 4I5QA 1AAZA 3H79A 4DSRA 3EURA 3IPZA 3VWVA 4KF9A 1A8YA 4NXIA 1QK8A 4GQFA 1B4PA 1Z7RA 3MSZA 4K7IA 4USSA 4HOJA 3LEFA 4IJ3A 2YN1A 5ID2A 4Q5NA 4BVXB 2B6MA 1OC3A 4TW5A 4ML1A 1SU9A 5CRGA 5HR0A 4MP4A 3FR6A 4GQCA 2MBSA 1YKAA 1XIYA 2H0HA 2RLIA 2KUCA 1AW9A 1O73A 2X64A 4G19A 3TB2A 4EVMA 3GTUB 4IW9A 3M0FA 1URMA 4I8BA 1K0OA 3UIWA 2GS3A 2H19A 3A2WA 3VWXA 1GUHA 4ZILA 3UBKA 1ERWA 7GSSA 2FD3A 5ELGA 3CXGA 2HSMA 4MZBA 4XS6A 4K0GA 2XHFA 4DVCA 1F6MC 1T4ZA 5G1KA 4BVYA 2UZ8A 1MEKA 1VF1A 3H4KA 1A2JA 2MMZA 1EGOA 5ID2B 4GSNA 1J9BA 18GSA 4GSTA 5G5EA 2L59A 3A2XA 4HZ2A 1W89A 1V98A 1ZYEA 3DVXA 1PGTA 5EL8A 5D8IA 2C0DA 1R5PA 2IJYA 2OADA 2HE3A 2GGTA 2JZSA 5CRHA 4K9ZA 1A2MA 2ZUPA 4EKZA 3LGCA 1DUGA 4JBBA 1SYXA 5DVBA 1XWBA 2HI7A 4KDXA 1QUWA 3W8JA 2RIIA 2YJ7A 2O87A 4F9ZA 5D9VA 1PQNA 3TGZA 1T3BA 3I69A 2IMEA 1UA5A 2O89A 2C0GA 1SK1A 3WGEA 1K0CA 1EZKA 3E9JB 4KA0A 4FQUA 4WETA 3QAWA 3D4MA 2PVQA 2CVDA 3EU4A 4PNFA 3F0IA 1XVQA 5FT3A 2OBKA 3MNGA 4N11A 3A5WA 2YV9A 2GZZA 1OKTA 4NV2A 5B8AA 1YZXA 2LQOA 5IO0A 3DYRA 1X9SB 2M80A 4KDYA 1VF4A 5D9TA 1K0BA 4BWQA 1TDIA 5A5KA 3UVHA 2LTKA 4IHUA 2KHPA 3F3QA 4BWSA 4L0WA 4ECBA 1X9WB 2LUSA 1ZZYA 1AQVA 3K8NA 3F6FA 2VLTA 2H1BA 2JACA 4OCEA 2H01A 3HXSA 3MDKA 2CZ3A 3QFAC 1WIKA 2VM1A 4EE0A 3P7XA 2YP6A 3CSJA 3KTLA 2JSZA 2FY6A 4FIWA 3BJ5A 4KW6A 4GWRA 4AGSA 3NOFA 2C3QA 4TR1B 1V2AA 3LJRA 1YY7A 2XPDA 1TRWA 1GWCA 4OCFA 2LSTA 4TKYA 1AQWA 4J56E 2GSRA 2GSQA 4MA9A 1EP7A 5IMVA 3GX8A 5IM9A 2IPAA 4MH2A 2VM2A 4MH3A 2D2ZA 1XW6A 3HJOA 1JLWA 4PQ1A 4V1Ap 4HJ2A 2CZ2A 4TXOA 1GTBA 2OKAA 2C3TA 1S3CA 4KUNA 6GSWA 1V40A 4PQHA 2AYTA 2V6KA 3HJPA 4ILFA 2DMLA 2PVOC 2NVLA 3EMXA 2FA4A 3Q18A 4KSMA 4D73A 2H71A 5A4VA 2H1DA 4IGJA 4RQRA 3D0ZA 2L57A 4PQIA 4KSOA 3LXTA 3GRXA 2EIOA 5GAND 2VD1A 1FO5A 2LKUA 2IN3A 3ISOA 1XZOA 1GNWA 4PX1A 3TJFA 4ZBAA 1OKDA 1BYEA 4WF5A 4KX4A 1X5DA 3GMFA 2HNLA 4XRAA 3TOTA 1XPVA 2G2QA 4I2TA 3FRCA 5DDLA 2KP2A 4TXOB 2K9FA 1WPIA 2N5AA 4IP6A 2IMIA 4HDEA 4RI7A 2C1YA 1Z3EA 1SENA 2I3YA 3HA9A 1KTEA 1XW5A 2V32A 1XFLA 3BBYA 2RM5A 4OWYA 4WKWA 3CSHA 3TJJA 3R2QA 5B7CA 4AJ7A 1U87A 1BG5A 1HNAA 2FWEA 5GZZB 2VL9A 2I4AA 5EVOA 2C4JA 1FG4A 1BAYA 5HR3A 3DXBA 1TRUA 2F9SA 1JZDA 6GSUA 3DIEA 2GQKA 3CSIA 3LXZA 2CA8A 4AF2A 4L5LA 5KN0A 2MZCA 16GSA 3HDCA 5IMAA 8GSSA 4WXTA 2XPEA 2DJ0A 1G6WA 1YJ6A 3E0UA 2KLXA 4BL7A 4TR0A 5GSTA 4Q5QA 4GTUA 3IDVA 4ZBBA 4G0IA 1LJRA 1ACVA 2DSAA 2CVBA 5D73A 1SKWB 1BEDA 3KP9A 1SD9A 2C8UA 3UVTA 5JCUA 5AISA 2ES7A 4JR4A 3FZAA 4ZL8A 19GSA 5DJLA 3EINA 1SD8A 2P5QA 20GSA 2AUVA 4IQAA 2IIYA 1VF2A 3GV1A 2HT9A 4L0UA 4FYBA 1B9XC 4N30A 5ECQB 1JZWA 3FY7A 1BX9A 2A2SA 4DSSA 1A8LA 4ULXA 4BPYA 5F8BA 1TU7A 2K18A 3IV4A 1GSFA 1AIUA 1X5EA 5DALA 4WEYA 1CQHA 2ON5A 3GN3A 3GYKA 1IYIA 4N0ZA 4KE3A 2CV4A 1C72A 3EC3A 5IIZA 3SBCA 3IE3A 3C8EA 3UEMA 4MJAA 3ZMKA 3IC8A 4XTSA 1GSEA 3FK8A 3DVWA 4MF6A 2HSYA 3O6TA 2C3NA 3RPNA 5ECHB 3M9KA 3FR3A 1A24A 1FVKA 1SJIA 3ED3A 1GRXA 4HEA2 1Q98A 3H1NA 2DMMA 3Q19A 3TOUA 1XVWA 9GSSA 1GTUA 2GSSA 4RQXA 2WB9A 2CX3A 1ERVA 1F3BA 2WS2A 2YPMA 1M2AA 4PNGA 4DSSB 5KN1A 3ZTLA 4AJ6A 5ELAA 1EP8A 2IFQA 2GSTA 2A4VA 2EIQA 5DALB 3TJBA 2X99A 3VI7A 2VAFA 4MJBA 3WT1A 4ZB8A 3TDGA 2BTOT 1ST9A 1GNEA 5CREA 1M2DA 4MJEA 4IELA 2VCZA 1V58A 2C80A 4YAVA 5A4UA 6GSYA 3HVXA 2VL2A 4MABA 3TKRA 2H8LA 3TJKA 1QQ2A 3KEBA 5CAXA 5J3RA 1PKZA 4IQ1A 4WR5A 4MLYA 2H6XA 3HHVA 3EYTA 4QQ7A 2MBTA 4MMMA 1ABAA 2L4QA 4YQMA 4OFTA 5F05A 4G9HA 2RUFA 1SJZA 3NZNA 3HYPA 3HD5A 1NW2A 1T7PB 3FZ4A 4TN8A 2NTOA 1LU4A 4N10A 5HFKA 1TK5B 4HQZA 3CTFA 3IXRA 3DWVA 3F8UA 4TRXA 1M0UA 2DJ2A 2BJXA 3G7JA 4JE1A 5L71A 3IA1A 3LQ7A 2HLSA 2IFQB 5IOXA 1S3AA 4O5RA 2G0FA 3W6GA 3L9SA 2VCWA 5LCZA 3C1SA 1PRXA 3IK7A 3KGKA 4P3YB 4WF4A 3FEUA 4O92A 3FW2A 3G9BA 2GQLA 2JL4A 1R7HA 1EEJA 3RHCA 4QL9A 1A2LA 2YWNA 3AY8A 5A4WA 2DBCA 2FLSA 4H86A 1NHYA 1S3DA 2FUG2 2XBQA 1YF0A 1TI3A 2B1KA 1AUCA 4JU5A 3GNJA 5IMZA 1TK8B 2VCTA 4J2FA 5DAKA 3PINA 2K8VA 1M9BA 1JZOA 3GKNA 3WD6A 3C73A 2K8SA 1O6JA 3J7Yb 2R37A 4GXZA 3IRAA 2FHEA 2VO4A 1JLVA 2IL3A 5ECSA 3GIXA 2TRCP 3CRTA 3GL5A 1XXUA 2CVKA 1MD3A 1MDIA 4LA1A 4LMWA 1QGVA 2L6DA 5DBQA 4TXVA 3DD3A 5CRDA 2JZTA 3D5JA 4L8EA 3GA4A 1JHBA 4IKHA 3EU3A 3ZRDA 2P0GA 5JWRB 3P90A 2LRNA 1V9WA 5JCWA 4XIHA 4ZL7A 5KN3A 1GSQA 3V1WA 1GSYA 2YZHA 5IQYA 4V2NA 3M1GA 2I1UA 2HSMB 2R6KA 3IC4A 4ZL9A 2OJLA 3F3RA 2NBSA 5DQSA 3F63A 4QL7A 5ECPB 3UMAA 5DAKB 2WULA 3VPTA 4BVYB 2YOIA 2C0FA 3I9V2 2HZFA 1G0TA 3IOSA 3KMNA 5LNKe 2YWMA 1F2EA 2BMXA 3APOA 4EO3A 2P31A 3ZIJA 2FA8A 2LNSA 2YJHA 1PL1A 3TKSA 4FYUA 1WWJA 3QD9A 4EF0A 2J23A 2XC2A 1DBYA 2WFCA 1AXDA 2GQMA 3GFKA 3ZVJA 1OVNA 3W8SA 3QPMA 2O7KA 3BD2A 2R4VA 6GSXA 1GUKA 1TRVA 1ZOFA 4KGIA 4PUAA 2FGXA 4G0KA 2B5YA 4F03A 1SK2A 1A23A 3TKSE 4KB3A 2HRKA 2MYGA 3ZFBA 3ERFA 4PURA 2N5FA 1FVJA 4LL4B 5CRWA 2CQ9A 1GLQA 4HU7A 1WJKA 1Z5YE 2YNXA 1F3AA 1T1VA 2LQQA 5D96A 5D9WA 3UBLA 4HQSA 5IMDA 1OC9A 3GUSA 2LEGA 3H93A 3FKFA 2WJUA 3GHAA 4N0VA 5INYA 1XBSA 2DC5A 4ACSA 2PWJA 3I43A 1KBNA 3JCML 4WR4A 3KXOA 4MDCA 2X8GA 4K6XA 4GLTA 2QC7A 1J0FA 1B9YC 3UOMA 5EY6A 3CYNA 3BOAA 2PPTA 1TU8A 2VCQA 4HI7A 2NDOA 5IMCA 2H30A 5E59A 1ERUA 1ZYQB 2V2GA 4YQUA 4LMVA 2TIRA 3M8NA 5HR2A 1XWKA 1USBA 5IPHA 1SYRA 6GSVA 3GURA 4FH8A 2AJQB 4NV5A 2ZCTA 4POLA 3EWLA 1B8XA 2IWTA 4TOPA 22GSA 1PX6A 2HSHA 2H1GA 2PBJA 2HRKB 3WT2A 12GSA 4KAEA 2MMAA 3US3A 2B1LA 3HZ8A 3HJMA 3IR4A 1UC7A 2IMFA 3BCIA 1EWXA 4E8EA 3RBTA 4CHSA 1CQGA 1WE0A 3FHKA 4EXJA 4G2EA 1OC9B 1THXA 2JZRA 1YQ1A 3KD0A 2VOCA 3N5OA 4EL1A 4Q5FA 5J41A 2R3XA 5E4WA 2CT6A 2ZNMA 4WBJA 4OFNA 4HZ4A 3TRQA 4IP1A 3ZFLA 1R26A 2TRXA 4NWYA 3DEXA 3F6DA 1TXXA 4OD7A 4D73B 2LRTA 6GSTA 3UARA 1GSDA 3BCKA 3ME8A 2A2RA 1NSWA 3IHQA 1O7UA 1YDKA 2WGRA 1WP0A 4HJMA 3APSA 4I6XA 1MTCA 4TR4A 2OACA 3VI5A 5ECMB 4RUVA 2RUEA 4ECIA 5JWOB 1GSUA 3P2AA 2GTUA 2YV7A 3F4SA 5B6NA 2LV3A 2V41A 1PX7A 3G7IA 2HQTA 4DEJA 3QR6A 2R2JA 3DGQA 4JRRA 1FOVA 2H0IA 4ZB6A 4EDYA 3FYGA 1A0RP 1X0RA 4PTSA 4E8HA 1TOFA 4IBPA 1RK4A 4RI6A 1Z9HA 3KH7A 3RDWA 4G10A 1THOA 2B7JA 4JEDA 3WYWA 4IN0A 4ID0A 4OFMA 3VWUA 3ME7A 1T00A 1ZMAA 5J5NA 1FHEA 3KH9A 3QMXA 2XBIA 3A3TA 3TCOA 2F51A 4ZBDA 1EGRA 4MZWA 5G5FA 4TR3A 3S9FA 2QKEA 4L5OA 4F2IA 4BL7B 1XCCA 2E2GA 2DJKA 5AGYA 4JZQA 3DRNA 2X8CA 3UL3A 2JSYA 2M46A 1ZGNA 3LYPA 1SL2B 5J9BA 3HZ4A 1YEXA 4G0LA 3ZVJD 4XS4A 1EV9A 4ZIJA 3MAKA 1FB0A 1I5GA 2VL2C 5ECNB 2M72A 4ZXGA 3O76A 2B3SA 5G30A 3D4TA 1K3LA 1VF3A 2N5BA 4X0XA 3GKMA 3PH9A 2J9HA 1G6YA 2PU9C 1U3AA 3CBUA 3OR5A 4GSSA 3A2VA 3CTGA 1XOAA 1UVZA 5EPFA 3GX0A 1GLPA 1SJ6A 3RPPA 3CMIA 2H6YA 1F37A 2LRCA 1NM3A 5D9XA 1LBKA 4CW9A 1GULA 3IAM2 3C7MA 5DJMA 4BVXA 5CO3A 2HRNA 1JFUA 1WRYA 3R3EA 1N2AA 1GH2A 2VL3A 2E7PA 4KNDA 2P5RA 2QSIA 2E0QA 3QOUA 5H5QA 5C00A 3KTBA 2VD0A 2IMDA 2LJKA 2CAQA 3WGDA 2PGTA 1E6BA 1Z7PA 4V1Ag 3M3MA 4FYCA 3ZZXA 3MWHA 14GSA 3GTUA 1GTAA 2JADA 4POBA 1Y25A 1SKRB 5ECKB 3VPQA 3TJGA 4KCEA 4CDOA 2GZYA 1XOBA 3U6VA 2DJ3A 3DKSA 5FHIA 1H4OA 4FO5A 1K0AA 2X8HA 2OE0A 3ZIVA 5HR1A 1Q4JA 3GL3A 1O81A 1TP9A 1XWAA 3LWAA 1HNBA 3KIJA 1TJDA 4MZCA 2VLVA 4NPBA 4HU9A 5ENUA 1QFNA 1FB6A 1FW1A 3KP8A 1GSSA 1K3YA 4V2LA 1DE1A 1YKCA 1TKDB 1G7EA 1MDKA 1U6TA 3KZQA 5ECIB 3UAPA 2LNTA 4MF5A 2H73A 1MDJA 1RW1A 4KCAA 4GF0A 1YF1A 1OAZA 3HVVA 1HD2A 4MPFA 3FZ9A 1EEMA 3C1RA 1OYJA 1TTZA 3L9UA 3VLNA 5B6MA 4O7HA 2FWGA 4ECCA 3DMLA 3WGXA 4YH2A 3G7YA 1PA3A 1QMVA 4MK3A 5J9CA 4F82A 3Q6OA 3GH9A 2H6ZA 3GH6A 4F0CA 2REMA 1VRSD 2H66A 2B5XA 2GVPA 4X1UA 3CRUA 3TKSC 1XW9A 4HS1A 5HFGA 3ZREA 3L4NA 3VK9A 1M99A 4V2MA 5ABRA 2OA7A 5J4UA 3F4TA 2AHEA 5IMFA 3ERGA 3PGTA 3ZMLA 3EE2A 5ECRB 5KEJA 3M9JA 2H70A 3GKKA 5AN1A 4GRFA 2KP1A 1TRSA 2PMTA 5DCHA 2AV4A 3VWWA 2F8FA 1UN2A 2FWHA 3ZYWA 4TR1A 1DSBA 3LSZA 5HFIA 1AC1A 4K7OA 5H5RA 1GTIA 2I9HA 5F07A 4AJ8A 2VLUA 4OO4A 3VFIA 1U3IA 3ZITA 2L5OA 2JU5A 5G1LA 3ERWA 2GDRA 2CAIA 4POKA 1ON4A 2HFDA 2YWIA 3D21A 3I6AA 1JZRA 4YAPA 2QGVA 3HCZA 4K8MA 3FZ5A 2VIMA 1HYUA 4K1FA 1R4WA 5JCGA 4ISDA 2H74A 4ML6A 2PUKC 4IS0A 2YWOA 3ZL5A 1K3OA 1YEPA 2O8VB 3LYKA 2E2MA 2GZPA 1T8EB 5DCGA 4MJCA 4EC0A 3QAGA 4J57E 1W4VA 2B5EA 1PKWA 2MMOA 2C0EA 1U88A 2DIZA 2GLRA 3KCMA 2V1MA 3SWLA 4Z7XA 2H1AA 3TUEA 1J08A 2HRAA 4PGTA 3IBHA 5GSSA 1B4QA 4O32A 3J7Yk 4F0BA 2Z9SA 2VCXA 2GT6A 1O85A 1M9AA 4Q5RA 5IO2A 4IJIA 2YCDA 3RHBA 3TRPA 3L0HA 1ZL9A 3C71A 2ALBA 1N8JA 5KN2A 3O3TA 3TRXA 1IYHA 1O8XA 4K2DA 1HNCA 3L9VA 2RM6A 1B48A 2F3MA 4KDUA 2O85A 1A0FA 4GCIA 1BQ7A 5FWGA 3KM6A 2LJRA 4POMA 5COHA 4ZB9A 3PPUA 11GSA 2HSNB 2WDUA 5BMUA 2WCIA 5G31A 1E2YA 1PD21 1KEBA 3HY2A 5DQYA 1OC8A 5B8BA 2DJJA 4NMUA 2F8AA 3KMOA 2DLXA 2I81A 3LFLA 1EOGA 5H5SA 1WOUA 4LLRA 3UJ1A 2H72A 1EV4A 5IOWA 1H75A 4EUYA 1G7OA 1MD4A 2FWFA 3D6IA 5JWQB 2CX4A 1TI1A 5AIXA 1OE8A 2EIRA 5LD0A 2R5GA 5CYYA 5C04A 1PL2A 4OO5A 2YANA 4EDZA 2H75A 5IPGA 4I2UA 2AAWA 1O8WA 4XCSA 2K6VA 2AB6A 4XHMA 1GUMA 1X9MB 2H0GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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