5D9TA

Crystal structure of dehydroascorbate reductase (osdhar) from oryza sativa l. japonica
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
GVEVCVKAAVGHPDTLGDCPFSQRVLLTLEEKKVPYEMKLIDVQNKPDWFLKISPEGKVPVFNGGDGKWIPDSDVITQVIEEKYPTPSLVTPPEYASVGSKIFSCFTTFLKSKDPNDGSEKALLTELQALEEHLKAHGPFINGQNISAADLSLAPKLYHLQVALEHFKGWKIPEDLTNVHAYTEALFSRESFIKTKAAKEHLIAGWAPKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural understanding of the recycling of oxidized ascorbate by dehydroascorbate reductase (OsDHAR) from Oryza sativa L. japonica
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Oryza sativa subsp. japonica
molecule keywords Dehydroascorbate reductase
total genus 67
structure length 211
sequence length 211
ec nomenclature ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date 2015-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5d9tA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d9tA01
4Z7XA 4IKHA 3DVXA 1G7EA 2TIRA 2HRKA 4KGIA 1BQ7A 2VL3A 4TXOB 1WMJA 2VLVA 3VPQA 1SJZA 1T1VA 2HZEA 1XOAA 1CQHA 4IP6A 4MPFA 4GSTA 3D6IA 3TKRA 1M99A 4OFNA 4BVYA 1TRVA 5DALA 2LUSA 1ERUA 4MDCA 4BVXB 2VLUA 2PPTA 1HQOA 1ACVA 3KZQA 5DCHA 5IPGA 1KNGA 2GZYA 3BOAA 5JCUA 3GL3A 5B6NA 8GSSA 4TR0A 3HA9A 3L9UA 3N9JA 3FY7A 1BYEA 2E0QA 3KIJA 2L6DA 4O7HA 2OA7A 4OFMA 4RI6A 4GXZA 1EV4A 16GSA 3EURA 3CRTA 1SK1A 1UA5A 4V1Ag 2YWIA 5CAXA 1VF3A 5FT3A 4I2TA 2P0GA 2WRTA 1SJ6A 3LORA 3ZL5A 3ZRDA 1GSFA 4MLYA 1M2BA 2L57A 2ES7A 1MDIA 3VI5A 3IA1A 4ILFA 3ZIJA 4N10A 3UIWA 5L71A 1T8EB 5IMDA 1FG4A 2H70A 4JZQA 3EYTA 1N8JA 2KP2A 1H75A 1GSQA 4PNGA 3F4SA 3QPMA 1Z5YE 2ON5A 2C4JA 2WDUA 2F8AA 3L4NA 2MZCA 1EZKA 1JZOA 2WCIA 3EMPA 2YZHA 3GMFA 4EF0A 2CZ3A 1U87A 2KLXA 4E8EA 2GVPA 1TU8A 5G2ZA 2L5LA 5IMVA 5EPFA 2LRCA 2VO4A 2L5OA 4FYCA 1YF0A 2RIIA 5B7CA 4KAEA 1ON4A 5D73A 3F6DA 3TKQA 2LSTA 5AGYA 2XPEA 3IC4A 1J0FA 1EGRA 4MCUA 4K7IA 3RHBA 3SWLA 1V98A 1KBNA 4KF9A 4N0ZA 2YWMA 1SYXA 3A3TA 1GNWA 1X9SB 3GRXA 4IELA 2CVKA 1VF1A 2VCTA 4I8BA 3KMNA 4HUAA 3V1WA 2N5FA 3RHCA 5DDLA 3GV1A 5F05A 1ABAA 1JLWA 4IBPA 1V58A 1TRUA 4G0IA 2IN3A 4MJCA 3P90A 2F3MA 2A4VA 1HNCA 1M9AA 3UEMA 4KCEA 1LBKA 4ZL9A 2CX4A 4MH3A 4TXOA 2IMEA 3DD3A 1G6YA 2G2QA 1ZYEA 3JCML 1IYHA 3O6TA 1NHOA 3ZZXA 1H4OA 2CV4A 2GLRA 2HFDA 3LQ7A 1EP7A 5ECNB 3F4TA 3RPNA 3IC8A 4RUVA 1BAYA 4QL7A 3GSTA 1TI3A 1K0AA 1K0NA 4NV2A 3UOMA 2UZ8A 3HZ8A 2VL9A 3VI7A 3GKXA 1ZOFA 3R3EA 2CAQA 2HRAA 3MNGA 2OJLA 4DSRA 2H71A 2HT9A 5A5KA 3IK9A 3LSZA 4WBJA 1ERTA 1MTCA 1V40A 1W4VA 2OE3A 5KN3A 2CVDA 5CRDA 1EGOA 3QFBC 3TDGA 1G6WA 1O7UA 4OWYA 1NSWA 3BBYA 3KH9A 2FCHA 1ZYQB 2MBSA 2VAFA 3GX0A 3KTBA 1EP8A 4MZBA 1X5DA 3NIVA 4G9HA 4L5OA 4ZL8A 4G10A 1PGTA 3D5JA 5H5SA 3DMLA 4WF5A 3Q6OA 4X0XA 5D93A 1MDKA 3F6FA 1R5PA 2H72A 2DIZA 5GZZB 3MWHA 3GKKA 3BJ5A 1V57A 1B9YC 4L0UA 5D9WA 4K2DA 4XS4A 3IV4A 3FZ4A 4HQZA 5EL8A 2FNOA 3WYWA 3CSJA 19GSA 4PQIA 3KJYA 3IXRA 1S3CA 4HS1A 1SK2A 4WR4A 5HFGA 4BA7A 6GSSA 3DYRA 5F06A 2O7KA 1XW9A 2DJ0A 1WPIA 1F6MC 4OO4A 1VGLA 4NHZA 3G7YA 2DMLA 2GQMA 1URMA 1XBSA 3EC3A 1WRYA 2AHEA 2QGVA 1TJDA 3P8WA 3FZAA 3ZVJA 1YY7A 4DSSB 5ID2A 4KW6A 5D8IA 1FHEA 4OD7A 4GF0A 3CRUA 3MDKA 1DBYA 1VF2A 5J5NA 1XVQA 1OYJA 3GH6A 3EWLA 2BJXA 1K0CA 6GSTA 3ERGA 5ECIB 1SENA 1O8WA 5C04A 4PURA 2IMIA 1TRWA 3D22A 2AV4A 5CP1A 4GWRA 1XCCA 3TJKA 3M3MA 1TU7A 3ZLPA 2QKEA 5LCZA 1ZL9A 1EOGA 3SBCA 1XVWA 1OC3A 4YQVA 3F3RA 5ABRA 2K18A 1NW2A 2FWGA 3FZ5A 3QR6A 2WS2A 2X99A 4WBRD 4Q5FA 1XOBA 2YANA 5H5RA 2CA8A 2H76A 5G30A 4TR3A 3KMOA 5DAKB 1TI1A 2P5QA 4OCEA 2VM1A 3EU4A 1PX6A 4ZBAA 1GRXA 3A2WA 4I5QA 2D2ZA 2KOKA 2XBQA 5JCGA 4TRXA 3VPTA 4ACSA 5E4WA 4YQUA 1O6JA 2C0DA 3C7MA 2WJUA 2XBIA 3ZMLA 2HSHA 1TOFA 5HFIA 3ZYWA 3IDVA 2YP6A 4WEYA 3DEXA 4KSOA 4PNFA 5A4WA 2LKUA 1Z3EA 4P3YB 2PMTA 4IN0A 3IOSA 3DWVA 2GSSA 4LMWA 2VD0A 1ZMAA 5HFKA 2B1LA 3QMXA 4G2EA 1SJIA 5IM9A 3DKSA 3TKPA 1ERVA 5FWGA 2O89A 3TJJA 3E0UA 3E9JB 4NAXA 1EEMA 2WFCA 4HJMA 4XTSA 2O8VB 3C8EA 4TXVA 2MBTA 2EIQA 1JZRA 1U88A 1HNBA 1MD3A 4BL7B 1GSUA 3F9UA 1E6BA 2LTKA 3FHKA 2FD3A 3ME7A 1K0DA 2PERA 3IK7A 1OC8A 1YKCA 2C1YA 3KCMA 1MD4A 4ZL7A 3VWUA 4EL1A 4F0BA 3GIXA 1BG5A 1U3AA 2YV9A 4XIHA 1SK0A 1C72A 3TB2A 1GWCA 2N5AA 3FR3A 1GUKA 1GSYA 1FB0A 4MF7A 1B48A 1T4YA 4K7OA 3W8SA 2K8VA 1FVKA 5DVBA 4MH2A 2PUKC 3EVIA 4HDEA 2HSNB 5J4UA 3WGXA 2OE0A 2KUCA 2ON7A 3ZTLA 2X64A 3KP9A 1TKDB 4KDUA 2CT6A 4DSSA 2PBJA 2FWEA 2R37A 4PGTA 4MABA 20GSA 2YJHA 3DXBA 1GH2A 3RDWA 3J7Yb 2G0FA 1FAAA 1X0RA 3ME8A 4HQSA 1XW5A 1HD2A 4GCIA 4N30A 5GAND 1A2MA 1J08A 1U6TA 1DE1A 4RI7A 4IGJA 5CRGA 5B8BA 4HZ4A 2EIOA 1HNAA 3HD5A 2RLIA 3C1SA 5J3RA 1YEPA 2MMNA 2EC4A 1R7HA 2IMDA 1JLVA 1PKWA 2H1GA 4J2FA 3UBLA 3HY2A 2HYXA 5IQYA 2V41A 1K0BA 4MZCA 5A4VA 2HRFA 2DIYA 1PL2A 4IHUA 5INYA 2R6KA 4I6XA 1GTAA 5ECKB 1QK8A 3IHQA 1YJ6A 5DAKA 2DLXA 5HQPA 1X5CA 4DVCA 4Q5QA 3HDCA 4KUNA 5D9XA 3KGKA 3UVTA 1GTBA 2GSQA 2L6CA 2M80A 6GSVA 4HU9A 5DQYA 4AGSA 3M0FA 1S3DA 2ZUPA 3CXGA 5HR3A 4JU5A 2PWJA 4MP4A 2RM5A 2FA4A 1PX7A 3TRQA 3RBTA 1FB6A 2JSYA 4IVFA 5G5EA 3HJOA 3DGQA 3LG6A 4IJ3A 1PN9A 5DJMA 3UL3A 3GTUA 1TW9A 4IJIA 2JACA 2H6XA 4WETA 2Z9SA 1YKAA 2R2JA 2NVLA 2FA8A 4FIWA 2TRCP 1KEBA 2IIYA 2H6YA 2DJ1A 2LNTA 1XWAA 5ECQB 1ZGNA 3H1NA 3TKSA 4YAPA 5IIZA 4X1UA 1ERWA 1GTUA 1SL2B 1YQ1A 2YNXA 4LL1B 3HXSA 5CNWA 4ECIA 5IOWA 1G0TA 3APSA 3J7Yk 2GZZA 1F9MA 2L4QA 1EV9A 3TKSE 5IO0A 3RAZA 1LJRA 4HEA2 4OFTA 2BTOT 3F8UA 1RQMA 3VWVA 4H86A 5IO2A 2FWFA 2ALBA 5D9TA 2DMMA 1O85A 2JSZA 3IAS2 2X8CA 4DSQA 2YWNA 5KEJA 2CVBA 3HVVA 3D21A 2JL4A 2B5YA 3W8JA 3HKRA 5ELAA 4AJ6A 2H8LA 2RM6A 2J9HA 2ZCTA 2CAIA 3QCPA 4E8HA 2JZTA 1T00A 2V6OA 2AYTA 1GUHA 2B6MA 1OAZA 1JFUA 1V9WA 4BVXA 3CSIA 3LYPA 2XHFA 3LEFA 2GQLA 4IQ1A 4WF4A 4G19A 2HZFA 5EY6A 1LU4A 1OKDA 2B3SA 2YN1A 2H0HA 4LL4B 3FRCA 4IS0A 1OKTA 3EE2A 4ULXA 1RW1A 1OE8A 4LA1A 1X5EA 1AQVA 3TRPA 2HI7A 3DVWA 2AAWA 13GSA 3VK9A 6GSYA 11GSA 3LWAA 4Q5NA 4MMMA 4WXTA 2GSTA 2I9HA 3WT2A 4AJ8A 2VCVA 4G0KA 3CSHA 2I4AA 6GSXA 2BMXA 3TUEA 1PMTA 3F63A 4JEDA 2GZPA 1K3OA 3KM6A 3UAPA 1QGVA 2VL2A 3G7IA 2QC7A 3BCIA 4XS6A 3UARA 1PSQA 1WJKA 1WP0A 1AC1A 2A2SA 2GT5A 5AIXA 5ECSA 3HVXA 3I69A 5HR1A 2WULA 3VURA 1M9BA 2C3TA 3FYGA 5ECOB 2CX3A 4OO5A 1EOHA 3WGDA 2C80A 3ZREA 4FYUA 2YJ7A 1ZZYA 3GNJA 3EINA 4XRDA 2ZNMA 4EC0A 2H19A 2LRNA 3ERFA 5IPHA 3FK8A 1NHYA 4K1FA 1Y25A 2DJKA 4OMVA 1K0OA 3IRAA 3PINA 2AUVA 4ZIJA 4EDYA 1PL1A 1E2YA 3ISOA 3C73A 1XW6A 4MF6A 2L4CA 4HU7A 2H75A 2NTOA 2RUEA 3R2QA 1K3YA 3QAVA 2E2GA 1X9WB 4MPGA 3GA4A 1A24A 1MEKA 3APOA 4K9ZA 5E59A 3TRXA 2NPBA 4GTUA 4TN8A 1DUGA 1USBA 4EVMA 3GX8A 3ZIVA 2C0FA 3KD0A 2YPMA 4ML1A 2VL2C 4D73B 5J9CA 4N0VA 2K8SA 4MJEA 4NWYA 5CREA 2IJYA 4WKWA 1YDKA 5F8BA 2C3NA 4YH2A 2H0IA 1BJXA 2YCDA 1ST9A 5G1LA 2IFQB 3CMIA 5ECMB 2L59A 3L9VA 1GLQA 2REMA 3TGZA 2LEGA 6GSWA 1JZDA 4EXJA 4EKZA 2PGTA 1FVJA 3DIEA 2XPDA 2M46A 3WT1A 2EIRA 1HYUA 4HI7A 3P2AA 2GGTA 3Q74A 1JZWA 2VOCA 4MA9A 3GUSA 3H79A 1ILOA 3TCOA 4HJ2A 2C0EA 1TK0B 4GSSA 2LJAA 3W6GA 5AISA 2MMOA 5D9VA 2HSMB 2IMKA 1KTEA 2CZ2A 4JBBA 4K0NA 4NXIA 4HOJA 4FH8A 2VLTA 2B1KA 2CQ9A 5KN2A 2R5GA 2NDOA 4J57E 2LJRA 5IMAA 3GYKA 1T7PB 5G5FA 1IYIA 5BMUA 3HJPA 1AW9A 3CBUA 2DBCA 1XWCA 5HR0A 4K0GA 5ECHB 1K3LA 1SD9A 2PN8A 5JWQB 3L9SA 3A2XA 3DRNA 4CDOA 2VCWA 4KB3A 1MDJA 4TR4A 4POMA 3ZVJD 2XC2A 5B6MA 2F51A 2C3QA 3C71A 3WGEA 2FY6A 4KNDA 1F37A 3VFIA 2B7KA 2DJ2A 3IE3A 3KEBA 4IQAA 1B9XC 1AQXA 3M9KA 2GQKA 2VUPA 1QXHA 3IBHA 1QFNA 2B7JA 4HZ2A 1G7OA 4I97A 5GAPD 1VRSD 1AQWA 2HRNA 2IMFA 9GSSA 2DSAA 4YQMA 1GSSA 3LXTA 4F03A 1K0MA 2H1AA 3A5WA 4AJ7A 4V2NA 1J9BA 3H93A 3US3A 5JWRB 1AIUA 1A0RP 4NMUA 1EEJA 3F3QA 4PTSA 1I9DA 2LQQA 4JRRA 1YZXA 3BD2A 5ECLB 1BEDA 5C00A 4PQHA 4I2UA 2R3XA 4PX1A 3Q19A 4MF5A 7GSSA 2GDRA 1M7TA 1GL8A 5EVOA 1TP9A 4CHSA 4ZB8A 2PVOC 4D73A 4L8EA 4BWSA 5AN1A 5AIVA 1THOA 4TKYA 4FQUA 1Q98A 3GHAA 4ECCA 4TVEA 1SKSB 4DEJA 3PH9A 4NPBA 2IFQA 1B4PA 3Q18A 2M72A 4ML6A 3H8QA 3TOUA 5ELGA 3N5OA 3O76A 3QDNA 1GUMA 1XWGA 18GSA 1EWXA 1UN2A 6GSUA 3G7JA 5IOXA 4ID0A 3FR6A 4KDXA 2LJKA 3F0IA 4V2MA 1THXA 2H73A 4FO5A 3QAGA 4GRFA 1SU9A 2GSRA 4IW9A 2PU9C 5ECPB 4XHMA 1TDIA 3IR4A 4XRAA 2WGRA 4OCFA 2I81A 4K7NA 3TJFA 2HSMA 3GKNA 4ISDA 4EDZA 3KXOA 4TR1B 4JR6A 1R5AA 12GSA 2WZ9A 1XZOA 2YZUA 3UJ1A 3BCKA 1A2LA 4NV5A 4J56E 2P5RA 22GSA 4ZXGA 5CYYA 4O5RA 1O73A 3CTGA 5H5QA 3A2VA 3I6AA 1UC7A 1GP1A 2IPAA 1Z6NA 3FW2A 1TK8B 2H6ZA 1M2DA 1T4ZA 4EUYA 2V32A 3LFLA 1SYRA 1A8LA 1R4WA 3M1GA 3IPZA 3CYNA 4N11A 5IMCA 2HE3A 3I9V2 2H1DA 4FYBA 1X9MB 3APQA 2DJ3A 4CW9A 4RQRA 2O85A 5CRHA 3HVSA 3RPPA 2O87A 4BL7A 3GL5A 1QMVA 4XS4B 3NZNA 3FEUA 3FR9A 1SD8A 4V1Ap 3HJMA 3C1RA 3L78A 3P7XA 2FGXA 4KA0A 1TTZA 1OVNA 1XXUA 1Z7PA 3U5RE 1WIKA 2X8HA 4ECJA 3M9JA 5KN0A 4ZB6A 1XPVA 2J23A 1WE0A 2FWHA 2GT6A 4EE0A 2YV7A 3ZITA 3GKMA 4G0LA 2K6VA 3IAM2 3ZMKA 4JE1A 1BX9A 4TOPA 5ID2B 2MMZA 4V2LA 1T3BA 4KE3A 3TJBA 1YF1A 1JHBA 1VF4A 4ECBA 2LV3A 5GSSA 4BPYA 2FLSA 4XCSA 3GFKA 2B5XA 3QD9A 1YEXA 4POLA 1AXDA 3K8NA 4ZBBA 3GURA 3ZFLA 3FKFA 1SL1B 2KHPA 4MJBA 2LS5A 3EMXA 4MK3A 3TKSC 3HZ4A 5ECRB 3D0ZA 4O32A 3TOTA 3O3TA 5F0GA 1F3BA 3HCZA 1FW1A 2QSIA 1XFLA 2LQOA 1A2JA 3G9BA 2YOIA 1GNEA 3U6VA 3LJRA 4F0CA 5LD0A 1OE7A 5ENUA 4KSMA 2VIMA 4GQFA 1QUWA 5J41A 5GSTA 3QAWA 4LLRA 1W89A 2TRXA 4PXOA 4TR1A 4ZBDA 4USSA 2IWTA 1OC9B 5DQSA 17GSA 5KN1A 5DJLA 4K8MA 2VCZA 1QQ2A 3L0HA 1M0UA 1O8XA 5B8AA 4JR4A 2HXKA 2JU5A 2OACA 2P31A 1SKRB 1PRXA 2NBSA 2DJJA 4YAVA 1Q4JA 5DBQA 5G1KA 4L0WA 3MAKA 3PR8A 1GULA 1TXXA 2JZRA 3FZ9A 1B4QA 1NM3A 2FUG2 3QOUA 3UMAA 2H30A 2RUFA 3KTLA 5IMFA 4GLTA 5CO3A 1S3AA 4IP1A 1UVZA 2OKAA 5JWOB 3S9FA 4PQ1A 3ZFBA 5HR2A 2VCQA 4EO3A 2VCXA 2GTUA 3D4MA 5JCWA 5D96A 3HHVA 1DSBA 2JADA 1F2EA 2GS3A 4WR5A 4TW5A 1PD21 3E3EA 3HYPA 4RQXA 4BWQA 1AUCA 3EU3A 1SL0B 1FOVA 3H4KA 2DC5A 2I3YA 3PGTA 14GSA 2HLSA 4PUAA 2HRKB 4AF2A 3LYKA 4KDYA 1GLPA 1XWKA 1B8XA 1M2AA 3NOFA 3PPUA 2X8GA 2I1UA 3I43A 2HZEB 1U3IA 2F9SA 4F82A 1GTIA 4F9ZA 5J9BA 4BVYB 5DALB 4NHWA 2C8UA 2A2RA 2OE1A 2AJQB 5LNKe 1XWBA 2H66A 4GSNA 2K9FA 3VWXA 4KCAA 1DE2A 1PA3A 1PQNA 3VLNA 2H01A 2E7PA 1Y6EA 5F07A 5FHIA 3WD6A 4KX4A 1Z7RA 3OR5A 5COHA 4XS1A 3VWWA 2H1BA 3GN3A 4ZB9A 2B5EA 2V6KA 2OADA 3MSZA 3QFAC 1A0FA 1GSDA 4QQ7A 2LRTA 2HNLA 1WWJA 4PUFC 1ZCPA 2H0GA 2PVQA 5CRWA 4K6XA 1Z9HA 2V2GA 1GSEA 3UVHA 1OC9A 2VD1A 1Z6MA 4POBA 3LGCA 2JZSA 4X43A 2F8FA 1A23A 5A4UA 1RK4A 2VM2A 4LMVA 2E2MA 1TK5B 4Q5RA 2H74A 10GSA 2HQTA 4GQCA 4L5LA 1TRSA 3GSSA 4MZWA 1SKWB 3M8NA 5G31A 4MJAA 3ED3A 1F3AA 3GTUB 2AB6A 2FHEA 1N2AA 3F4RA 5IMZA 1A8YA 2MMAA 1XIYA 3KP8A 2MYGA 2OBKA 1FO5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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