5DALA

Crystal structure of human glutathione transferase pi complexed with a metalloid in the presence of glutathione
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
210
structure length
209
Chain Sequence
MPPYTVVYFPVRGRAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase P
publication title Visualisation of Organoarsenic Human Glutathione Transferase P1-1 Complexes: Metabolism of Arsenic-based Therapeutics
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 209
sequence length 210
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5dalA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dalA01
1TI3A 3RAZA 1O73A 3TJGA 3CTFA 5HFGA 4GWRA 3G7IA 4IW9A 4IP1A 2GQLA 4I6XA 5B8AA 2H6YA 2YZHA 3WYWA 3L9SA 1PMTA 2C0DA 3VPQA 5A4VA 1GUHA 3GURA 1XCCA 2QGVA 5D9VA 2WRTA 5CNWA 2I81A 3UMAA 1JZRA 3TDGA 1XFLA 1GUKA 1RW1A 2ZNMA 1TK0B 2WULA 3HZ4A 4HEA2 3ZVJD 1M0UA 2H0IA 2X8CA 3ISOA 2OE0A 2L5OA 2HI7A 4TXOB 1SL0B 2O87A 3H79A 2AUVA 3IC8A 2XBIA 3I43A 4ECIA 4K1FA 1XVWA 5IM9A 1UN2A 2CAIA 4ECBA 3L0HA 5JCWA 10GSA 1RK4A 3A2WA 4G0KA 4XIHA 1V40A 1XOBA 1A2JA 3EURA 5H5QA 2HRKA 2JADA 1E2YA 1OKDA 2GGTA 4Z7XA 2GSRA 4MH3A 3F8UA 1URMA 2MMAA 1DBYA 5D73A 1ERWA 2I3YA 5ABRA 4IELA 1M2BA 2QC7A 2PVQA 1JFUA 4ZXGA 2R2JA 3QAGA 4F9ZA 5KN2A 1NHOA 5A4UA 1AIUA 2F8FA 4TW5A 2HQTA 4XS1A 2MZCA 5JWRB 2DMMA 3HA9A 2PU9C 1MTCA 5CO3A 2G2QA 5JWQB 5F06A 5D9XA 1CQHA 1GSDA 2CX3A 4WKWA 1G0TA 2YN1A 5DCGA 5D8IA 2MYGA 3RHBA 2VM1A 2KP1A 3RHCA 3HKRA 3DGQA 3IAS2 4WBJA 1SJIA 3KH7A 4K7OA 4L5LA 1AUCA 1GLPA 4PQIA 1O7UA 5IPGA 4JU5A 3DIEA 2LRTA 3WGXA 3PR8A 1GLQA 3ME8A 2H6XA 3IXRA 1R7HA 1V2AA 5G31A 4KSOA 2JSYA 1Y6EA 2GT6A 1WMJA 2FGXA 4HDEA 1MEKA 4AJ8A 1F2EA 3UEMA 1V58A 3BCKA 1SL1B 1DE1A 2AJQB 2L4CA 1O6JA 1WOUA 3IR4A 3GKMA 4HQZA 3H4KA 5E59A 5DJLA 5DAKB 3KTLA 1THOA 3FZ5A 4L0UA 3G7YA 1EEMA 3C73A 3DKSA 1SKSB 2IL3A 2IPAA 4BVXB 3IAM2 4GSNA 5ID2A 5B8BA 4ACSA 3EVIA 4L8EA 1XVQA 1R26A 1K3LA 1A0RP 3FR6A 1VRSD 1OE7A 5IMDA 4YQMA 1GRXA 1TRWA 2GS3A 2I9HA 1O81A 4IKHA 2ZUPA 4EF0A 5F05A 3ZFBA 4MH2A 1ZOFA 1SKWB 3CSJA 4JR6A 4LLRA 3D4TA 1SYRA 2N5BA 4GQCA 3ZREA 2C0FA 1PGTA 4ECCA 4ZL8A 5CREA 1EOGA 1G7EA 3KGKA 3APOA 1EEJA 1K0BA 3FR3A 3NOFA 3U5RE 4RI7A 4Q5RA 3IPZA 1T00A 2VAFA 4EKZA 1T7PB 1WIKA 4X43A 2B3SA 1TK8B 2FUG2 1FHEA 2PVOC 22GSA 5D9WA 5G5EA 1EGOA 1OC9B 2VCTA 2CV4A 1YEPA 4LMVA 1V98A 3GKXA 2RUFA 3TJJA 2C8UA 2IN3A 1SYXA 1EV9A 2B5YA 1FVKA 2A4VA 2GZYA 1X5DA 4LA1A 1F3BA 4ECJA 4OD7A 2VO4A 4F03A 2VL2A 4IGJA 2L6CA 3EU4A 1NW2A 1DE2A 2WJUA 2H0HA 3CTGA 1ZZYA 2RLIA 4AF2A 2HNLA 4HZ4A 2FA8A 3KP8A 3UBKA 2RM5A 5G5FA 4TRXA 2AHEA 3TKQA 4K0GA 4PURA 4Q5FA 1SK0A 5GSTA 4KA0A 4BWSA 3F9UA 2H75A 3TRQA 1K0DA 2VCQA 1S3AA 3VURA 4N10A 2PGTA 1U3IA 2GSTA 1XOAA 2VD0A 3IC4A 3FRCA 3FR9A 1DUGA 1J0FA 3VPTA 4GRFA 4PX1A 2YV7A 5ECLB 2FWEA 4K6XA 5ECIB 5F8BA 3WT2A 5IMCA 4IJIA 13GSA 5DAKA 1G6WA 4V2MA 5LCZA 4PUFC 2OACA 4EUYA 5LD0A 3EINA 1KNGA 3Q18A 1VF3A 4RQRA 1FO5A 1HD2A 4WETA 2JACA 2VLTA 2FLSA 2DJ1A 1T4YA 3QMXA 4JBBA 5FHIA 1GWCA 1YF0A 4F82A 4IQ1A 1PA3A 3TKSC 4CHSA 5ECSA 4WEYA 4WXTA 4HQSA 1A8YA 1LBKA 4MLYA 2H6ZA 3H1NA 2YANA 2VM2A 4I8BA 3D22A 2C3NA 4HUAA 1AQXA 3CRUA 5CYYA 3ZFLA 5G2ZA 3DVXA 2GLRA 4OO4A 3WD6A 1X5EA 2GZZA 3PINA 3C1SA 4ID0A 4ZBAA 4POMA 3UBLA 1SJZA 2H1BA 3I9V2 5GSSA 4K7IA 3C71A 4DSSA 3P7XA 1ZMAA 1GSEA 2HZEB 4OFMA 4BA7A 4TKYA 1K3OA 4ZILA 1ST9A 1SK1A 1Q98A 2HT9A 3GKNA 1NHYA 1WE0A 3GRXA 1JZDA 3GH6A 4HOJA 4KDYA 3FYGA 4JZQA 4NV2A 2KHPA 4POLA 5BMUA 4XS4B 5IMVA 2H74A 4YQVA 2H1GA 3TKPA 3VWXA 2IIYA 3GX8A 6GSXA 1GL8A 4NAXA 1A2LA 2REMA 3ED3A 5KN1A 4AJ7A 4GCIA 3TRPA 1B4QA 2DC5A 3FKFA 1M2DA 1M99A 3TKSE 4TR1B 1TOFA 2HSMA 5F0GA 3HJMA 1ZL9A 1OYJA 3RPNA 3IBHA 3QOUA 2IFQA 3IOSA 1GH2A 5ENUA 2HRNA 5EVOA 1HYUA 5AIXA 2VCWA 1JLVA 3IE3A 3HVXA 4MMMA 1QUWA 3GSTA 1U6TA 4DVCA 1FOVA 1ZGNA 3RBTA 3DWVA 1FB0A 2GQMA 3TB2A 4EE0A 2LNTA 2O89A 3ERGA 5DQYA 2BMXA 5CRGA 4IHUA 2VLVA 1PRXA 3ZZXA 2ALBA 1TRSA 4ZL9A 4QL7A 4KCEA 3AY8A 1EP8A 1OE8A 2N5AA 2C1YA 4PTSA 3CXGA 1QMVA 2KLXA 1Y25A 4O32A 1OKTA 3VWVA 4BL7A 1T3BA 3GV1A 3GIXA 17GSA 2O8VB 2P31A 1B4PA 3GTUB 3LJRA 4EO3A 1QXHA 5KN0A 4KX4A 3GHAA 1AQVA 2F51A 4FH8A 1GNEA 1CQGA 3MAKA 3IHQA 3KMNA 4ML1A 1O8WA 2F3MA 3LGCA 3G7JA 4IP6A 4NV5A 4WBRD 4ILFA 4P3YB 3TOUA 1O85A 2NBSA 1KTEA 2CQ9A 2Z9SA 4MDCA 3UIWA 5DQSA 4DSRA 5FWGA 1TKDB 2XPDA 5HR2A 3QDNA 2B5EA 3UVHA 3ZITA 3F3RA 3GUSA 2CZ2A 4OO5A 5JCUA 2WDUA 2GVPA 2FCHA 3VLNA 5H5RA 4JEDA 3DYRA 2DJ2A 2YWNA 4D73A 2VLUA 2FNOA 1TP9A 1BYEA 1XIYA 3TKRA 3E0UA 1UA5A 2BTOT 3HZ8A 2H19A 4H86A 2WCIA 4OCEA 2BJXA 1PL2A 3IDVA 1ON4A 2LRCA 3FHKA 2VOCA 2AV4A 4NPBA 5DALB 3LWAA 2DSAA 1VF4A 1Z6NA 3E9JB 2KOKA 3TKSA 4FQUA 5DJMA 5JCGA 2CX4A 1XWKA 2CT6A 1B9YC 4K8MA 1KBNA 3KMOA 3BOAA 1SK2A 5IMAA 2OKAA 3CYNA 1JLWA 3ME7A 1T1VA 3GKKA 4JRRA 2IJYA 4J56E 4LL4B 3GYKA 2P5RA 3CSIA 2E7PA 3TJKA 4JR4A 3Q19A 3R3EA 1B9XC 1AC1A 3JCML 5IQYA 3F4TA 3LFLA 3O6TA 3ERWA 3KJYA 2EC4A 2ON7A 2CAQA 2C0EA 4YAPA 4LL1B 4XRAA 1EV4A 2NTOA 2O7KA 7GSSA 3S9FA 1PX7A 2YWMA 3BBYA 3HDCA 1XWBA 4OFNA 4GLTA 1ZYEA 2LQOA 5CRDA 2LS5A 3GTUA 2L4QA 3EMPA 1GP1A 2ZCTA 2FWGA 2PN8A 4HS1A 4N0VA 1MDJA 1A2MA 2UZ8A 1X9SB 1WRYA 4KCAA 2MBTA 1GULA 2YWOA 3FEUA 2J9HA 4N0ZA 2GZPA 3GL3A 2K18A 1T4ZA 1ABAA 1K0NA 1F3AA 1VGLA 2OBIA 2PUKC 2DIYA 5KEJA 2C0GA 3LYKA 2R4VA 3LEFA 4TXOA 3H8QA 3ZIJA 1BAYA 1YKCA 1TRVA 1NM3A 3MNGA 1VF1A 2NDOA 4KW6A 1XW5A 3TOTA 1AQWA 5AGYA 14GSA 3ZTLA 1GTIA 3WGDA 1M9BA 1X0RA 2YJHA 2K9FA 1GTUA 1QFNA 3TCOA 1DSBA 1XW9A 2H66A 4OCFA 2JZRA 2M46A 3US3A 2LV3A 1EOHA 1AAZA 5CRWA 3KCMA 1B8XA 4KB3A 1Z7PA 1N2AA 5ECQB 6GSVA 20GSA 2CA8A 5IOWA 5DALA 4NMUA 4ZB6A 5J5NA 2HXKA 2H73A 2DMLA 3FZ9A 5G30A 4IQAA 1X5CA 2IMEA 3HY2A 4GQFA 2HRAA 4LMWA 1RQMA 1B48A 2TRXA 4HU7A 1IYHA 1M2AA 3BJ5A 2E0QA 5CRHA 3HJOA 4NHWA 1TJDA 3C7MA 3I69A 4F0BA 2DIZA 4OFTA 1GUMA 4FYUA 3F6DA 3UJ1A 2WS2A 2IWTA 2V6OA 2V41A 4MJEA 1S3DA 3VFIA 1EP7A 2DJKA 2YWIA 4G9HA 3F6FA 1WWJA 5HFIA 4MJAA 3GN3A 1ACVA 3VK9A 2HSYA 5A4WA 2LJAA 2K8SA 3QPMA 4KE3A 3P8WA 5EL8A 1N8JA 1WJKA 4WF5A 3ZMLA 3LQ7A 1U3AA 2FWHA 3MWHA 5KN3A 2A2SA 1FVJA 4IS0A 4EL1A 2LTKA 4I2TA 5EY6A 3UOMA 2AAWA 5DVBA 2R3XA 5G1LA 3A2XA 5D96A 4FO5A 2FY6A 2VCZA 3FK8A 5J9BA 3CSHA 1MDIA 1K0CA 1LU4A 1PD21 5C04A 4BVXA 2R5GA 1JZOA 3MSZA 1KEBA 2R6KA 2YNXA 1XWGA 3HXSA 2L6DA 1HNBA 1YEXA 1XWAA 5AISA 3SBCA 1PKZA 4MJBA 1TU7A 4MCUA 3HVSA 5HR1A 4ZBDA 4MABA 2EIOA 5DCHA 1OC8A 1PKWA 4ML6A 3QD9A 2HSHA 4ZIJA 1TU8A 1YKAA 2R37A 2DJ3A 3D5JA 4CW9A 4O5RA 1I9DA 2XC2A 4I97A 4RQXA 3QR6A 4KF9A 1EWXA 1XW6A 4KSMA 2YZUA 2H1AA 2FWFA 1J08A 1GTAA 4BWQA 3QFAC 2HZFA 5D9TA 1A8LA 1GSQA 5DDLA 4V1Ag 4JE1A 1K3YA 2O85A 2K6VA 2XHFA 1OC9A 2OA7A 4FYBA 1ERVA 1PSQA 1THXA 3D0ZA 4EDYA 2H01A 1UVZA 1SL2B 3ZIVA 3WT1A 2QSIA 3ZYWA 5COHA 1J9BA 1YJ6A 2M80A 3A5WA 4MF5A 2AYTA 1X9WB 2YP6A 3EWLA 4ZB8A 3HD5A 1ZYQB 2LJKA 3GL5A 3QAWA 2HRKB 4MF6A 3W8SA 11GSA 3ERFA 3IK7A 4O7HA 2K8VA 4PQ1A 2V1MA 3Q74A 4G2EA 2YV9A 3N9JA 2B7KA 2M72A 1XWCA 3W6GA 3HHVA 4PNFA 1U87A 2E2MA 3D21A 3KTBA 1FG4A 2G0FA 2FA4A 4KDUA 3M9JA 3DD3A 1Z7RA 1A24A 4EDZA 1R4WA 1U88A 2OE3A 4X1UA 2X8GA 1A0FA 3GMFA 2XBQA 2HRFA 1XBSA 4YQUA 1E6BA 5GAPD 1GSFA 2V2GA 3E3EA 2IMDA 2L57A 6GSYA 4MP4A 4EC0A 3RDWA 4GF0A 4N11A 5G1KA 3D6IA 5GAND 3GH9A 3TUEA 5J9CA 1ML6A 1TK5B 2QKEA 4V1Ap 3EMXA 5IIZA 4G0IA 2LRNA 4MF7A 5IMFA 5GZZB 2X99A 1EGRA 3RPPA 5FT3A 3IK9A 2CVDA 3UARA 3R2QA 1K0MA 3F4SA 2OBKA 1SD9A 1HNCA 3LXTA 5B6MA 4L0WA 1BX9A 1HQOA 3KEBA 3ZVJA 3CMIA 5C00A 4HZ2A 12GSA 1LJRA 3FY7A 1JHBA 2KP2A 1F9MA 2C80A 2B6MA 4GXZA 3VI7A 4QL9A 2VL2C 4EVMA 4OMVA 3M8NA 3DMLA 4NHZA 1AW9A 1QQ2A 1C72A 1Z3EA 1TW9A 2PWJA 3DRNA 2NVLA 2OJLA 2H71A 4MPGA 3PGTA 1SU9A 2KUCA 4TR0A 3J7Yk 5ID2B 2AB6A 2HZEA 3APSA 1M9AA 1Z9HA 2GSQA 2H30A 1MD3A 5IPHA 2YOIA 2PMTA 4K7NA 2C3QA 1I5GA 4MJCA 3M0FA 3LSZA 4KAEA 4XS4A 1K0OA 5B6NA 4Q5QA 2X64A 3P2AA 1TTZA 4DEJA 6GSWA 5AIVA 4QQ7A 2DLXA 3GA4A 5D93A 2XPEA 1GTBA 4ZB9A 3GX0A 3IV4A 3G9BA 2C3TA 4PUAA 4MZWA 1YDKA 3EYTA 4TR1A 4K0NA 2OE1A 2X8HA 2YPMA 4KH7A 4N30A 3FZAA 3F3QA 1ERTA 4AJ6A 3KM6A 8GSSA 3TJBA 2L5LA 4WR5A 4YAVA 4HJ2A 3J7Yb 4MPFA 2MBSA 4V2NA 2ON5A 1FAAA 1R5AA 4XS6A 2B1LA 2HLSA 3TRXA 4I5QA 1ILOA 4J57E 3PPUA 4G10A 2RIIA 4TR4A 3HVVA 4IVFA 4IJ3A 2P5QA 2B7JA 1AXDA 2PPTA 3IA1A 4PGTA 3HCZA 3APQA 3UVTA 2A2RA 5F07A 6GSSA 2CZ3A 3ZMKA 3NZNA 1QGVA 2H76A 16GSA 3UAPA 1SJ6A 3P90A 5IOXA 2E2GA 4TR3A 2FHEA 5ECPB 2LSTA 5JWOB 2GDRA 4PQHA 4KNDA 3PH9A 4RI6A 2VCVA 1K0AA 2LUSA 1X9MB 1F6MC 5ECRB 3V1WA 1EZKA 3C8EA 2WFCA 5CP1A 3DVWA 2F9SA 2VIMA 3M3MA 2TIRA 3H93A 3W8JA 1TI1A 2LQQA 1TRUA 4FIWA 3BD2A 2LNSA 3F4RA 3O76A 3N5OA 1XZOA 2GQKA 4PXOA 4K9ZA 4G19A 3FZ4A 3VI5A 18GSA 2DJJA 3F0IA 4NWYA 1A23A 5J3RA 5E4WA 2HE3A 2PBJA 1TDIA 5ELGA 2HYXA 5B7CA 1W89A 2RM6A 2H72A 5IO0A 4AGSA 3A3TA 1TXXA 1O8XA 5H5SA 1FB6A 5DBQA 3LORA 2ES7A 4MZCA 4RUVA 4V2LA 1M7TA 1PL1A 1T8EB 4KGIA 3WGEA 3VWWA 3KH9A 5IMZA 1GNWA 4Q5NA 4DSSB 4MA9A 4IBPA 4DSQA 3KD0A 1PN9A 2EIQA 3KXOA 2NPBA 1MD4A 3BCIA 3UL3A 3Q6OA 4J2FA 4PNGA 1R5PA 4WF4A 1Z5YE 2VL3A 4HJMA 4X0XA 1BEDA 2MMOA 4BVYB 1YY7A 5J4UA 2MMNA 4L5OA 4ULXA 1V9WA 1G7OA 5EPFA 4MZBA 2LEGA 3SWLA 3OR5A 4K2DA 4OWYA 1USBA 1SENA 1H4OA 3HYPA 1XPVA 2HSMB 1QK8A 3LXZA 1WPIA 2CVKA 2IFQB 5INYA 3QFBC 1V57A 4HI7A 4NXIA 2H0GA 4XTSA 4O92A 1F37A 2VUPA 1YF1A 1MDKA 1YQ1A 2WGRA 4TN8A 4USSA 1PX6A 3L9VA 3DEXA 1ZCPA 1SKRB 3EU3A 1OVNA 1NSWA 3VWUA 4TVEA 6GSTA 3MDKA 4XCSA 4E8HA 3GNJA 2C4JA 1G6YA 9GSSA 1ERUA 3QCPA 4F0CA 5ECOB 5ELAA 1BJXA 4I2UA 4POKA 2P0GA 2JU5A 5AN1A 3ZL5A 3QAVA 4ISDA 2RUEA 4ZBBA 4BL7B 19GSA 2WB9A 2LJRA 5LNKe 5HFKA 2FD3A 2V32A 2GTUA 2DBCA 5CAXA 1PQNA 3TGZA 3LYPA 2YCDA 2JL4A 5ECNB 2WZ9A 2I4AA 4WR4A 2YJ7A 1OAZA 2IMIA 3CBUA 4KDXA 4XHMA 2CVBA 5ECMB 2V6KA 1UC7A 1GSYA 5ECKB 4TXVA 3ZLPA 1SD8A 4CDOA 3KZQA 2TRCP 1FW1A 1GSSA 4XRDA 3FW2A 4POBA 1S3CA 4KUNA 1OC3A 4TOPA 4HU9A 4BPYA 4MK3A 5HR3A 3A2VA 2H8LA 2J23A 3LG6A 2N5FA 4GTUA 1Q4JA 5HQPA 3KP9A 3KIJA 2LKUA 1YZXA 3DXBA 1WP0A 1H75A 2OADA 2JZSA 3IRAA 3M9KA 3O3TA 2GSSA 4D73B 2HFDA 2GT5A 2PERA 5L71A 3K8NA 3I6AA 5IO2A 2IMKA 1GSUA 4BVYA 5A5KA 1JZWA 2JSZA 4EXJA 3L78A 1Z6MA 4ZL7A 3L9UA 1XXUA 2H1DA 2D2ZA 4GSSA 1W4VA 1BQ7A 2L59A 2VD1A 5J41A 2EIRA 3CRTA 2B5XA 2IMFA 4E8EA 1BG5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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