5ECKB

Crystal structure of fin219-fip1 complex with ja, ile and atp
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
LPILLDYWPSMFGMRARVALREKGVEFEYREEDFSNKSPLLLQSNPIHKKIPVLVHNGKPVCESLNVVQYVDEAWPEKNPFFPSDPYGRAQARFWADFVDKKFTDAQFKVWGKKGEEQEAGKKEFIEAVKILESELGDKPYFGGDSFGYVDISLITFSSWFQAYEKFGNFSIESESPKLIAWAKRCMEKESVSKSLPDSEKIVAYAAEYRKNNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ligase/transferase
molecule keywords Jasmonic acid-amido synthetase JAR1
publication title Structural basis of jasmonate-amido synthetase FIN219 in complex with glutathione S-transferase FIP1 during the JA signal regulation
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 61
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence C, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5eckB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5eckB01
1GTAA 1M2AA 3I43A 2VCWA 2GSSA 4OFNA 1XFLA 1DE1A 4IP6A 3TRXA 3MSZA 1SK0A 2H76A 4YAPA 4OCEA 2AV4A 2H0IA 1JLVA 2I81A 2TRXA 1BJXA 3F6DA 3FHKA 2I3YA 4IW9A 2VL9A 5HFIA 5LD0A 3BCIA 1GUKA 3DYRA 3TUEA 3C71A 3KMNA 4NHZA 3TKPA 2WB9A 2JZRA 4MZBA 4PGTA 4Z7XA 1XW9A 2LQQA 1XWGA 1PKZA 4HS1A 2FWEA 4MH2A 2LTKA 1B4QA 1QUWA 1T00A 3CBUA 2IMDA 1FVKA 1SU9A 4I2TA 2FA4A 1GNEA 4IJIA 3FEUA 5IM9A 4PTSA 5GSTA 4IELA 3HDCA 4K1FA 2YNXA 3NZNA 5D9VA 2HI7A 5L71A 4KCEA 2E0QA 2F8FA 4EO3A 2RIIA 2C4JA 3GV1A 1WJKA 2DSAA 5JCWA 2HSMB 2PVOC 2JU5A 2VLUA 4TXOA 1FHEA 2VD0A 2O85A 3HJMA 3P2AA 5IO0A 3O3TA 4HZ2A 4G0IA 1GSYA 1X5DA 4L0WA 3W8SA 3L0HA 4ZILA 5ELAA 2L4CA 2WGRA 3QAVA 2AB6A 4DSSB 3GKKA 1XW6A 2ZNMA 5IIZA 1ERUA 1OYJA 3DIEA 3UBLA 12GSA 2FWHA 4G19A 4F2IA 4IJ3A 3VURA 4LL1B 1ZMAA 3QR6A 2OE0A 1THXA 2JACA 3KGKA 2LEGA 2CA8A 1UC7A 3KZQA 1XOAA 3VFIA 2IN3A 4QL9A 1QMVA 5DBQA 1LU4A 2R2JA 1GLPA 2DJ2A 2Z9SA 2LKUA 4OCFA 3UAPA 4PQIA 2YJ7A 1T8EB 4YQUA 1R26A 5ID2A 2OA7A 1S3CA 2B6MA 2IMEA 3BJ5A 5DALB 1FAAA 1I5GA 3RDWA 1JHBA 3MNGA 1WP0A 3D5JA 1FB0A 4HU7A 5JCGA 4L8EA 3KM6A 2M46A 2QC7A 1AIUA 4EL1A 4XHMA 1X5CA 4AGSA 5DCGA 2P0GA 4JR6A 5B6NA 5IMCA 5JWOB 3LJRA 2IFQA 2O8VB 5KEJA 2RUFA 1K0OA 2QGVA 4ECJA 16GSA 14GSA 2VO4A 1GTIA 2VL3A 2F3MA 3G7IA 2HRKA 4OFMA 3D21A 4WF5A 1VF2A 3GH6A 3TOTA 2J9HA 4KNDA 6GSUA 1U3AA 5GAND 3DVXA 2LRCA 4PNFA 2C0GA 3GNJA 4IP1A 4LMVA 4QQ7A 1BAYA 3J7Yb 1KBNA 3HJOA 1TRWA 1XBSA 5F05A 2YCDA 2KOKA 3LYKA 1XZOA 2RUEA 4JBBA 2REMA 3UVTA 1SKRB 4PX1A 4XRAA 1VRSD 5J9CA 1WWJA 1TJDA 2GLRA 1C72A 2PN8A 4QL7A 1TXXA 1JZDA 2G2QA 4OO5A 2OE3A 3Q18A 5DAKB 4KX4A 1M99A 3GMFA 3VWWA 2I4AA 1UA5A 1TRSA 5AGYA 1NSWA 3IV4A 1XOBA 1GNWA 1AQXA 4Q5FA 3DWVA 1SL1B 5ECLB 1OE7A 2LUSA 3IAM2 5GZZB 2DJJA 1OKTA 4OWYA 4WEYA 4PURA 1J9BA 1HYUA 2YZHA 1Z7PA 3TB2A 1TP9A 3C1SA 3E0UA 4BVYB 2GGTA 4MF6A 1EGRA 3GKNA 2VD1A 4ILFA 3HYPA 2CX4A 2L6CA 4AF2A 2C0EA 4F0CA 6GSVA 1J08A 1WOUA 5B8AA 3KTLA 3F3RA 3UOMA 4J56E 1MEKA 4NV5A 2CAIA 1UN2A 4KA0A 2LNTA 4TRXA 4O32A 3VI5A 4EKZA 4E8HA 3ZRDA 1T7PB 4F82A 4GTUA 5DQYA 2V32A 1UVZA 3ZVJA 4BL7B 3QAWA 5DCHA 2PU9C 3GN3A 4JU5A 2JSYA 4K6XA 3TKQA 2GZPA 1ML6A 5EL8A 4HU9A 3KMOA 2PMTA 4I2UA 1WMJA 2FHEA 1T4YA 1VF1A 2OKAA 2DJ1A 4AJ8A 1JLWA 2B5XA 3LQ7A 3EMXA 1G6WA 2K9FA 4ACSA 2H71A 3TKSA 4ULXA 3DRNA 2JZTA 3ZREA 1TTZA 5DQSA 2VUPA 2CX3A 4G0KA 1S3DA 5IPGA 3A5WA 1XVWA 1I9DA 1TW9A 3US3A 3IK9A 5GSSA 2L59A 5A4UA 2HSHA 4BWQA 4F03A 3L9VA 1HNAA 1KTEA 2ZCTA 2KHPA 5J5NA 2X8GA 1K0BA 3WT2A 2VAFA 4X0XA 1YZXA 1EEJA 2B5YA 2KP1A 1N8JA 3TKSE 5LCZA 5EVOA 5F07A 1K0DA 3U6VA 1XIYA 1YEXA 4XS4B 3LFLA 4NMUA 4K9ZA 4GXZA 2OBKA 4N0VA 1M9AA 1ERWA 1K3YA 5J9BA 2DLXA 4IBPA 1M0UA 2L4QA 4WETA 1WRYA 2LJKA 2FWFA 5EY6A 1O73A 3W8JA 4IN0A 4HI7A 1RK4A 3LWAA 1YY7A 2DJ3A 4TR1B 2HNLA 2KUCA 1M9BA 6GSTA 3HVSA 3LSZA 1QQ2A 4GLTA 2K18A 4J2FA 2VLTA 3EVIA 5ECQB 2JZSA 2VL2C 4NWYA 2PUKC 1AUCA 3GYKA 3KCMA 5DVBA 3GTUB 2H75A 5F8BA 4KDXA 3JCML 1XW5A 5C04A 3PH9A 4PQ1A 3FK8A 3KP8A 5B6MA 6GSSA 1TU8A 1OC9A 2C80A 1FB6A 2HSYA 1TK8B 4KAEA 4ZBAA 2BJXA 2YV9A 3N5OA 1GLQA 1A2LA 3KXOA 1V40A 2OE1A 2V2GA 3KH7A 3KJYA 3S9FA 2LV3A 1G0TA 5J3RA 4GQCA 1OVNA 2G0FA 2VCXA 2P5QA 2MMNA 2H66A 5CO3A 3ZMLA 1MD3A 4USSA 1OC3A 3D4TA 2HT9A 3UEMA 3ZFLA 3FR9A 3DMLA 4O92A 5A5KA 4ZB8A 3KD0A 1SYXA 5AN1A 2GVPA 3GRXA 2FD3A 1GTBA 2H01A 4YQVA 2GTUA 3DD3A 1WIKA 2DMMA 2E2GA 3VI7A 3J7Yk 3DKSA 4FQUA 4WBRD 1ZZYA 3WT1A 1K3OA 3F4SA 3RAZA 4EDYA 5IMAA 1OAZA 1O7UA 2DIZA 4LL4B 1GSQA 4O5RA 1EWXA 2EIQA 1TRUA 5IOWA 3FRCA 1DUGA 3FZ9A 3L9UA 4MPGA 2YANA 5IOXA 4MK3A 1F9MA 3G7YA 5D8IA 3HVXA 3BCKA 3F6FA 2VLVA 4RI6A 5DJMA 2C3TA 3R3EA 3D4MA 3IBHA 1NHYA 2ALBA 4MABA 1V58A 2K6VA 1XWAA 4MJBA 1V98A 4I97A 1ZOFA 4XIHA 2IMKA 2HZEA 5ECHB 3CXGA 2HFDA 1EGOA 3ME7A 3TJFA 3UBKA 4MPFA 2X64A 4D73A 1SK1A 3VPQA 3PINA 5AIVA 4BVXA 5COHA 2YWMA 3FW2A 3P90A 3IK7A 2XHFA 2MMOA 5CRWA 3P7XA 2ON5A 5IQYA 1XWKA 4OD7A 1VF3A 3TKRA 3LXTA 2MMAA 2P5RA 4CDOA 1JZOA 2H1BA 3FZAA 1LBKA 1ZYEA 4X1UA 4TKYA 5ECMB 3UJ1A 2LRNA 5F06A 4Q5NA 4YH2A 1HD2A 2O7KA 5KN0A 3ZFBA 3HKRA 4MZWA 1PL1A 4OFTA 3IPZA 1T4ZA 1M7TA 1G7EA 2H8LA 3DVWA 5A4WA 1TI3A 1PQNA 1AQVA 2H0HA 2C1YA 4J57E 3DEXA 3GHAA 3IRAA 1H4OA 1FG4A 2O87A 2IWTA 4GQFA 2XBQA 2F8AA 4K7OA 4MP4A 1ON4A 3GSSA 4JRRA 2NTOA 2CVKA 2N5FA 2C3QA 3L9SA 2EIOA 2YWNA 3TGZA 5G1LA 4KDUA 1SYRA 5IMFA 2XBIA 4ZBDA 2A2RA 4GSTA 18GSA 2LJAA 5G5EA 1DSBA 2YOIA 2OADA 5IMVA 1BEDA 1IYIA 3QAGA 2MZCA 2RM5A 1RQMA 5ECRB 7GSSA 11GSA 2X99A 1PGTA 4EF0A 1A2JA 2X8CA 1AW9A 1G6YA 3PR8A 1VGLA 5JWRB 2LJRA 2E2MA 1SD9A 1GSDA 2H6ZA 3APQA 3C1RA 1SENA 4FIWA 1PKWA 6GSWA 1WPIA 4EVMA 1B9YC 4KH7A 3QFBC 1U88A 4TVEA 3KH9A 3HHVA 3IDVA 1GRXA 5G31A 1QK8A 4ZXGA 4MMMA 4EC0A 4POLA 3WYWA 4L5LA 22GSA 1MDKA 4NV2A 5C00A 4MDCA 4N30A 1Z5YE 2J23A 5CRHA 1LJRA 1K0AA 1EV4A 1ILOA 2M80A 4POBA 1R4WA 4TXVA 2YJHA 3F3QA 3CMIA 2F9SA 2FNOA 2HQTA 1GL8A 2YN1A 4KDYA 4HQZA 3TOUA 4EXJA 1Y6EA 1AAZA 2MYGA 2VM1A 4IKHA 1AXDA 3G7JA 4WKWA 2VCTA 2H6XA 3IR4A 1U6TA 3HJPA 3LXZA 2FWGA 1ST9A 4YQMA 3CRUA 5ELGA 2QKEA 1CQHA 3RHBA 5CNWA 2DJKA 1F2EA 2XC2A 2V6OA 1EV9A 2GDRA 2HSNB 5ABRA 1SKSB 2CVBA 4XTSA 1XCCA 1HNCA 2B1LA 1OKDA 1X9SB 1E6BA 4G0LA 2R6KA 4FO5A 4E8EA 2K8VA 5ECOB 4XS1A 2BMXA 3H93A 2RM6A 2VCQA 2NBSA 4POMA 4TN8A 3EU3A 4F9ZA 4OMVA 4KUNA 4OO4A 2CZ2A 4RQXA 4KSOA 1PD21 1OE8A 3EINA 5B7CA 1O81A 2IJYA 1YF1A 2H74A 4NXIA 3FKFA 5ECIB 3A3TA 3ZITA 5GAPD 3ZTLA 3RHCA 2HSMA 3APSA 1A23A 3TJKA 2LS5A 1B4PA 2L57A 1TI1A 5G30A 4PQHA 2H1GA 2EIRA 1EEMA 4FYCA 5H5QA 1GSFA 4DSQA 2GT5A 5HR1A 4MJAA 1Z6MA 4ZB9A 4KGIA 3HZ8A 4WXTA 4MLYA 4DSSA 3GX8A 4NHWA 4IVFA 4JR4A 2K8SA 2H72A 3D6IA 5IO2A 1AQWA 3TJJA 1URMA 3CSIA 3I6AA 1GP1A 3RBTA 4HQSA 5ECPB 3F9UA 3HD5A 1S3AA 1MDIA 4TXOB 2B7JA 2B5EA 1JFUA 1BG5A 4DEJA 3QPMA 4ECIA 4P3YB 2WZ9A 4HZ4A 4MF7A 2PERA 4K8MA 2I1UA 1N2AA 1A0RP 4MCUA 4N11A 3VWUA 1Q98A 4ECBA 5IMDA 2FUG2 2L5LA 1DE2A 1H75A 3SWLA 4V2NA 1QXHA 4IGJA 4ZB6A 5A4VA 5FWGA 1JZRA 3QFAC 1YKCA 3VWVA 3UMAA 2VIMA 4I8BA 3ERGA 5DALA 2M72A 2JADA 2XPEA 2N5BA 2CQ9A 2C3NA 2PGTA 2FA8A 4TOPA 5CYYA 3R2QA 4DSRA 5FHIA 1K3LA 2EC4A 3KIJA 3WGEA 13GSA 2DC5A 2V1MA 5ID2B 5KN2A 3O6TA 1V2AA 4H86A 4ZL9A 3A2VA 5H5RA 4IHUA 2WS2A 4YAVA 2PVQA 4F0BA 1PSQA 1YF0A 3E3EA 4HDEA 1J0FA 4EUYA 4O7HA 3M9KA 3ZVJD 2KP2A 3UIWA 4JEDA 3IC8A 1SJIA 4FYUA 1PN9A 2X8HA 5CP1A 2L6DA 17GSA 5EPFA 4EDZA 4N0ZA 4ID0A 4Q5QA 4MZCA 3GUSA 1FW1A 5ECNB 2IFQB 5KN1A 1BQ7A 3ERWA 1G7OA 5LNKe 9GSSA 2HRKB 5IPHA 4KSMA 1EP8A 3F4TA 3VPTA 1TDIA 3GA4A 4IS0A 5DAKA 2H1DA 3IA1A 3N9JA 5F0GA 2YPMA 1YEPA 3GL3A 3TDGA 4TW5A 3WGDA 3C73A 5ECKB 5HR0A 1T1VA 3SBCA 4V2LA 4HEA2 1ZGNA 2GZZA 1VF4A 3TKSC 1B8XA 2CV4A 4GSSA 4AJ6A 3WD6A 1F37A 1B48A 1GSEA 3QD9A 1KNGA 1MD4A 4BVYA 1R7HA 1GSUA 3TCOA 3ZIJA 1Z7RA 4MH3A 6GSXA 3GKXA 4HUAA 1E2YA 3NOFA 5G2ZA 3FZ4A 3TJBA 2TRCP 1EOGA 1QFNA 1ERTA 3W6GA 3KP9A 3TRQA 2WDUA 3GURA 2PBJA 2NDOA 3HZ4A 1PL2A 2YZUA 1HNBA 6GSYA 2ZUPA 4BL7A 2GS3A 3GSTA 1PRXA 4K7NA 4DVCA 4IQ1A 2GQMA 4BPYA 2P31A 3CSJA 1SKWB 2R4VA 2YV7A 5H5SA 4FH8A 1F3AA 1GULA 3RPNA 3K8NA 4RQRA 2MMZA 2HYXA 2YWOA 3DGQA 3H79A 1IYHA 4JE1A 1USBA 5BMUA 5HR2A 2CT6A 2B1KA 1KEBA 2I9HA 3G9BA 2MBSA 2TIRA 1GSSA 3PPUA 1SL0B 3ED3A 3M8NA 5D96A 4GCIA 3VK9A 2MBTA 4I5QA 4PXOA 3ZMKA 1THOA 3C8EA 3ZL5A 2WFCA 3GH9A 3LG6A 4RUVA 3M1GA 1EOHA 2ES7A 3HA9A 2H30A 3TJGA 4MJEA 1K0CA 3GFKA 2D2ZA 4XS4A 2VM2A 3MAKA 1SJZA 4TR3A 5DDLA 5ENUA 3CTGA 4ZIJA 3KEBA 3M0FA 1BYEA 2IIYA 2CZ3A 2R37A 2VCZA 1XXUA 1X9WB 2OACA 4GSNA 4I6XA 4KF9A 3EC3A 4TR1A 2O89A 2HE3A 3IE3A 2VCVA 3EYTA 5G1KA 2AHEA 5INYA 4MJCA 2GSTA 2WULA 1WE0A 3P8WA 2B7KA 2OJLA 5D9WA 1ABAA 4XCSA 5D9XA 4HJMA 2A4VA 3GTUA 5D73A 4MF5A 3ZIVA 4ZL7A 1PX6A 1AC1A 3F8UA 4KE3A 4G10A 1Y25A 1RW1A 1A0FA 3IAS2 1ZL9A 3GL5A 2DIYA 3ERFA 1TRVA 1TOFA 3RPPA 1TK0B 1U87A 3GKMA 1Q4JA 3NIVA 3A2XA 3QOUA 4G9HA 3ZYWA 5JWQB 3Q74A 1K0MA 1X0RA 5CRDA 4MA9A 1FVJA 2H1AA 3ISOA 1A24A 2JL4A 3LGCA 4K0GA 2WJUA 3EURA 3C7MA 3EE2A 4KCAA 1Z3EA 3MWHA 1DBYA 1YKAA 2F51A 2FY6A 2HRAA 4V1Ap 4PNGA 3IHQA 1OC9B 5CAXA 3WGXA 2HZFA 2JSZA 4Q5RA 2L5OA 4L5OA 1MTCA 3M3MA 3BBYA 2C8UA 1V9WA 4V1Ag 1U3IA 2CVDA 1GUHA 2AYTA 4L0UA 5HFGA 4AJ7A 3L4NA 3LYPA 3OR5A 2H73A 1FO5A 3V1WA 4G2EA 5IMZA 1EP7A 1YQ1A 2FCHA 2WCIA 3D22A 2C0FA 1R5PA 1XVQA 4PUAA 4KW6A 2AUVA 3APOA 4TR0A 3MDKA 2C0DA 1X9MB 4ML6A 3I9V2 2DJ0A 2HRFA 1O6JA 1M2DA 1NM3A 2GZYA 3CRTA 1A8LA 10GSA 5B8BA 4ISDA 2FLSA 3IXRA 3PGTA 2PPTA 2GSRA 3D0ZA 3EMPA 1K0NA 1SK2A 1YJ6A 4POKA 1R5AA 2RLIA 2VL2A 2ON7A 3AY8A 5J41A 2V6KA 5KN3A 1TKDB 2N5AA 3Q6OA 4TR4A 3HXSA 3U5RE 3Q19A 4HOJA 3CYNA 1X5EA 1O85A 4EE0A 1YDKA 4V2MA 3FY7A 3KTBA 3VWXA 2IMIA 2LNSA 3FZ5A 3QMXA 1XWBA 4PUFC 3VLNA 3UL3A 2OBIA 5FT3A 1QGVA 4LMWA 1ACVA 2DBCA 2GQLA 2UZ8A 4NAXA 4K7IA 1Z9HA 4ZL8A 2VOCA 2HZEB 3F4RA 2GQKA 1SJ6A 3O76A 1W89A 1NW2A 5ECSA 3GIXA 3TRPA 3ZZXA 3DXBA 3I69A 1PX7A 1ZCPA 3H4KA 1XPVA 4D73B 4GWRA 2A2SA 4WR4A 5AISA 2R5GA 1ERVA 3FR6A 4BVXB 4HJ2A 1O8WA 3FYGA 4KB3A 2H70A 1F3BA 5J4UA 1MDJA 4K0NA 2H6YA 3BOAA 3BD2A 2NVLA 3QCPA 1ZYQB 2IPAA 8GSSA 2LQOA 2GT6A 5HQPA 3L78A 3H1NA 3IC4A 4ZBBA 2YP6A 4CHSA 2CAQA 2NPBA 1A8YA 3CTFA 2IMFA 2HXKA 4WF4A 5E4WA 2LSTA 2E7PA 5CRGA 1Z6NA 1NHOA 4CW9A 1JZWA 5D9TA 4GRFA 3UVHA 5HFKA 5G5FA 3F63A 1OC8A 4BWSA 1V57A 4IQAA 4ECCA 4XRDA 4N10A 4GF0A 2HLSA 1B9XC 2BTOT 5DJLA 1O8XA 3UARA 1GWCA 2V41A 4NPBA 4RI7A 3F0IA 20GSA 3A2WA 3ME8A 1GUMA 3FR3A 4LLRA 4XS6A 3E9JB 3HCZA 2B3SA 4ML1A 2H19A 19GSA 1TK5B 1SD8A 1XWCA 3EU4A 4X43A 4LA1A 5D93A 1A2MA 1TU7A 4K2DA 3EWLA 2AAWA 4WBJA 2AJQB 1F6MC 4JZQA 2KLXA 1PA3A 3LEFA 2FGXA 2H0GA 3GX0A 1GH2A 1BX9A 3QDNA 2LRTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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