5ECLB

Crystal structure of fin219-fip1 complex with ja, ile and mg
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
LPILLDYWPSMFGMRARVALREKGVEFEYREEDFSNKSPLLLQSNPIHKKIPVLVHNGKPVCESLNVVQYVDEAWPEKNPFFPSDPYGRAQARFWADFVDKKFTDAQFKVWGKKGEEQEAGKKEFIEAVKILESELGDKPYFGGDSFGYVDISLITFSSWFQAYEKFGNFSIESESPKLIAWAKRCMEKESVSKSLPDSEKIVAYAAEYRKNNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of jasmonate-amido synthetase FIN219 in complex with glutathione S-transferase FIP1 during the JA signal regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Jasmonic acid-amido synthetase JAR1
molecule tags Ligase/transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 63
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence C, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5eclB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5eclB01
2KP1A 2C1YA 2B1KA 3GKMA 1FB0A 2IMIA 3KXOA 4KAEA 2GLRA 2YV9A 1R5PA 1U3IA 3LYKA 2H0HA 4I8BA 3V1WA 1FOVA 2LV3A 1BAYA 5FWGA 2XPEA 1K0OA 1ON4A 1Z3EA 1SJZA 2H75A 1LJRA 3VWVA 3IK7A 4V2MA 3HXSA 2JSZA 5J9BA 3KIJA 3HKRA 3VFIA 4OCFA 2YV7A 1OVNA 5ABRA 3APQA 1M0UA 1SJIA 4EC0A 4NWYA 3APSA 3ZITA 4NHZA 2CVKA 2H6ZA 2B1LA 4YQMA 3L9SA 5CNWA 3M9KA 2HRKB 3F6FA 4KF9A 1XIYA 4HQSA 2G0FA 5A4WA 4AF2A 4V1Ag 2C3NA 2GSQA 1VF3A 1UN2A 3GA4A 1GL8A 4ZBBA 1ILOA 3TKRA 2HRNA 3DRNA 1LBKA 2JZTA 3CTFA 2LUSA 2K8SA 1W89A 5CRWA 2WGRA 2FD3A 3HVXA 4KX4A 4WR4A 4DEJA 3GX8A 4L5OA 2H8LA 1M2DA 1U88A 3WT1A 3ED3A 2GZPA 3D21A 1GSFA 4KB3A 4IJIA 4ECJA 2H71A 4WR5A 5LCZA 1HD2A 3RPNA 5HFGA 2YANA 2N5AA 3HVVA 3F0IA 5HR2A 4LA1A 2PMTA 3G7IA 4CHSA 4OD7A 4GTUA 3I6AA 3TB2A 2HSHA 3BD2A 5IIZA 1U87A 5ELAA 2V1MA 4JEDA 2TRXA 1XFLA 1YQ1A 3UL3A 2PPTA 4K9ZA 5DJLA 2EIOA 1A0FA 3D6IA 2VCTA 3G9BA 5B6MA 3N5OA 3LORA 3IXRA 3DWVA 3P2AA 3FZ5A 2YWOA 4MF7A 3HY2A 1GSQA 3M9JA 2YZHA 5ENUA 4N30A 3UBLA 4HEA2 2GS3A 3C8EA 1EOHA 6GSWA 1T7PB 1TU7A 4G0KA 3C71A 3E3EA 1WMJA 2H73A 3LFLA 1B4PA 1Y25A 1J0FA 1SYRA 2F9SA 3LGCA 1G7OA 2O8VB 4XRAA 3PINA 4GF0A 5ECKB 5G2ZA 3APOA 2H66A 2AYTA 2OE3A 1YEXA 1GLPA 4OFMA 2R2JA 4E8HA 2WS2A 4ECBA 3GYKA 2IFQB 4GSNA 5KN1A 1ZGNA 5IOWA 2HSMB 4KH7A 4PNGA 1GSDA 3KJYA 1XOAA 4ZXGA 2CV4A 3HDCA 4MA9A 1CQHA 1A2MA 2MZCA 1R26A 3AY8A 1HQOA 1AUCA 1DE1A 10GSA 2OKAA 1JLWA 5F0GA 3P8WA 4MLYA 5LD0A 4ZL8A 3KZQA 3C73A 4I2UA 4TXVA 1URMA 3FEUA 4CDOA 1Q98A 1V98A 3I69A 1NSWA 1TTZA 5DJMA 4PXOA 5DDLA 3M3MA 4J57E 3LEFA 2VL9A 4TN8A 2VCVA 1GWCA 4POKA 1YY7A 4XIHA 4FYUA 2IMFA 3ZFLA 2KOKA 4CW9A 3US3A 4PUAA 1GTAA 4LLRA 4ZBDA 2F8FA 1SKSB 5ECNB 2H72A 2OACA 4IVFA 4L5LA 3CBUA 4F9ZA 4MK3A 3C1SA 3O6TA 1B9XC 3DIEA 2G2QA 1OC3A 2WB9A 3GKNA 3DKSA 1HYUA 1Z7RA 4HUAA 2L5OA 3IAS2 4XHMA 5D73A 1GTUA 3P90A 4WBJA 1PKZA 4KDUA 2OBIA 1LU4A 5IQYA 4JU5A 3TRXA 4HU9A 4KNDA 2GQKA 4BA7A 2IPAA 2R6KA 5ID2B 2B7KA 1PN9A 3FR3A 2B6MA 1EGOA 1IYHA 2C0FA 3CYNA 2CVBA 4J56E 1GULA 2XBIA 4NPBA 3F6DA 2I81A 2YN1A 4ECCA 4IQ1A 1NHYA 1V57A 5HQPA 1XXUA 3MAKA 3E9JB 1PX6A 3L9UA 3QR6A 4K2DA 2HRKA 4QL7A 2P31A 1AC1A 3EYTA 1Z6MA 2J9HA 2PERA 6GSTA 5H5SA 4O7HA 4N0VA 1SJ6A 3CRUA 3ZVJA 1OC9B 1MDKA 2O87A 2OBKA 3EVIA 5AGYA 4H86A 1N2AA 4ZB8A 3GV1A 1Z5YE 5CAXA 5CO3A 2CAIA 4QL9A 4JZQA 2AV4A 2FA4A 3IK9A 1F9MA 2E0QA 1O85A 4IN0A 5IMDA 1GSEA 4NV2A 4I2TA 1TXXA 2I1UA 3LG6A 3KM6A 3J7Yb 1G6WA 3ZZXA 3QFAC 1OC8A 3A3TA 3TGZA 2N5BA 1CQGA 3KMOA 3IA1A 2IMKA 4K0NA 2C0DA 3ZFBA 2HQTA 4GRFA 1QXHA 1F37A 1SK0A 2OE0A 3IV4A 3HHVA 2EC4A 5KN0A 3VI7A 4XRDA 4MPGA 3IPZA 1V9WA 4WF5A 3UIWA 2GQLA 2A2RA 3G7JA 2FA8A 3DEXA 2CVDA 2PVOC 4D73B 4TOPA 3BCKA 4TXOA 3IBHA 1XW5A 2FGXA 3IRAA 3UBKA 1S3DA 5ECMB 3F9UA 2DJ1A 5ECHB 2OJLA 5ECOB 4FYCA 5DAKB 2DIYA 2IWTA 2LRTA 1IYIA 1O7UA 2GDRA 3D5JA 13GSA 1X9WB 1M9BA 2R37A 1WIKA 2MBTA 2KLXA 2YPMA 2X8GA 3TJGA 1B4QA 5JCUA 3Q74A 3UAPA 2IMEA 3QCPA 3RHBA 3IAM2 1TJDA 1TRVA 4F2IA 5IOXA 2DJKA 4OFNA 1ERVA 4F0BA 3CSHA 2FWGA 2IFQA 1ERWA 4K8MA 2L6DA 2JSYA 3H93A 2H1AA 3UEMA 3HD5A 2CZ2A 3NOFA 4G19A 1WWJA 4ECIA 17GSA 4EO3A 3K8NA 5CREA 22GSA 4V2LA 1SU9A 3RBTA 2DLXA 16GSA 3TOTA 2E2GA 2HT9A 4KA0A 2C8UA 2PVQA 3M8NA 1EWXA 4HOJA 3VWWA 4EUYA 1WOUA 2Z9SA 2H0IA 2JL4A 5ECPB 1N8JA 2C0EA 1JZDA 3QAWA 2LQOA 1O73A 2WJUA 2WCIA 4K0GA 6GSYA 3TDGA 2KP2A 4X1UA 1DSBA 1AQWA 3KTBA 3QD9A 2YP6A 4GXZA 5HFIA 4O32A 1PMTA 3FZ4A 4XTSA 3ZREA 4MJCA 3TKQA 4HQZA 1BX9A 2F51A 3KP9A 3VWUA 1QQ2A 4HJMA 1GNWA 3DXBA 3W8JA 4MJAA 3L9VA 3BJ5A 1MD3A 3D4MA 5H5RA 2ON7A 1AQXA 3R3EA 2PU9C 2R3XA 2IJYA 2IN3A 1FHEA 2PWJA 3I43A 4JRRA 1K0DA 4EVMA 3N9JA 3WGDA 2H1GA 2L59A 1XBSA 1MEKA 2VCWA 3F4RA 2YWMA 4EL1A 5G5EA 4EE0A 3I9V2 4DSQA 5ID2A 2I9HA 4IHUA 4L0UA 1MDJA 2LNSA 5G1KA 5IMCA 4PX1A 1Z9HA 3ME8A 4ID0A 4KDXA 5B7CA 4KSMA 1ML6A 3RPPA 2GZZA 3UVHA 2GZYA 4ZL9A 2VOCA 3KH9A 4ZB9A 1PQNA 5ECIB 2K6VA 1SL1B 4Q5QA 1TP9A 2HRFA 3HVSA 1J08A 4J2FA 3IR4A 4N0ZA 2FCHA 2H30A 1M7TA 1GLQA 5J41A 4MJEA 4NXIA 7GSSA 2GSSA 3UVTA 2FLSA 1MD4A 2LKUA 2MMZA 1X0RA 3ZIJA 3ZVJD 1OC9A 5ECSA 2HE3A 1B8XA 2FWEA 2VD0A 1JZOA 4RQRA 3EURA 1ZYEA 1K0BA 2RM5A 4MZCA 1TI3A 4FYBA 5GZZB 4K7OA 2M72A 1XOBA 5FHIA 5FT3A 2QGVA 4PTSA 3GSSA 3E0UA 3GFKA 1XPVA 2NDOA 4MZWA 4BL7B 5IMZA 1XVWA 5A4VA 3CXGA 2PUKC 2H74A 1K0AA 2CQ9A 4IBPA 5ECQB 5HFKA 2WRTA 11GSA 1PD21 1RK4A 5D9WA 5G5FA 1J9BA 4WBRD 3GH9A 4X0XA 4F0CA 2HI7A 3GN3A 4PQ1A 2YJHA 5IMVA 1VF4A 1PX7A 3NIVA 4EF0A 4G10A 3IHQA 3MSZA 4QQ7A 3BBYA 3HYPA 3QFBC 2ON5A 2L4QA 2JACA 2CX4A 4GWRA 1F2EA 2VCXA 2I3YA 5D9TA 1E2YA 4IQAA 3VI5A 4D73A 3ZMLA 3D22A 4IP6A 2H19A 4GLTA 1O6JA 5F05A 6GSVA 2YWIA 2YNXA 4HZ4A 1A2JA 2GSRA 1PRXA 2B5EA 2YCDA 1YF0A 3HJPA 3BCIA 2JADA 4Z7XA 20GSA 2LTKA 4BPYA 3PPUA 1B9YC 5B8AA 12GSA 5KN2A 3TJKA 1NW2A 2HZEB 2L57A 3G7YA 4YAPA 2BTOT 1AW9A 3CSIA 1NM3A 4DSSB 4WF4A 4MMMA 2HLSA 3O3TA 3QPMA 4EXJA 6GSSA 4I5QA 2H6YA 3UMAA 4XCSA 2MMOA 2OADA 1OYJA 1TRUA 5IO2A 2LNTA 1Q4JA 3IC8A 1FO5A 4WKWA 2F8AA 1T3BA 5EPFA 4I6XA 4ML1A 3W8SA 4MH2A 1HNCA 4IS0A 4MH3A 1F6MC 3BOAA 2TRCP 1SKRB 5F8BA 1THOA 3KEBA 1QFNA 2PN8A 19GSA 5E4WA 4BVYB 1TK5B 4PQIA 1K0CA 1K0NA 2VLTA 1VF2A 1AQVA 3WYWA 1MDIA 1X9SB 3GTUB 3GL5A 5F07A 1TW9A 1EEJA 3A2XA 4ISDA 2DJ0A 3VPQA 3PH9A 5GSTA 4NHWA 5E59A 2HFDA 1JLVA 4YH2A 3EU3A 2X99A 1ZMAA 1M2BA 2YWNA 4OFTA 3H8QA 2DBCA 3QAGA 3CTGA 3U5RE 3NZNA 4RI6A 6GSUA 3TJBA 3CSJA 2K18A 1YKCA 4L8EA 5IPGA 1SK2A 3VPTA 3GIXA 3MDKA 2NTOA 1YEPA 1JZWA 3L0HA 2FWFA 3S9FA 2VO4A 5EY6A 2V6KA 1G0TA 2MBSA 4NMUA 1SL0B 5LNKe 5HR1A 3KD0A 2GT5A 2P5RA 3H4KA 5G1LA 1OE8A 4HZ2A 1SYXA 2GVPA 2B5XA 3GKXA 2QKEA 4K7NA 5J5NA 4HU7A 1WPIA 1K3LA 1ZYQB 3GH6A 1JHBA 5GSSA 4POBA 3IOSA 2DC5A 4USSA 5KN3A 1OE7A 3D0ZA 3FK8A 3FY7A 3DD3A 5IM9A 4PNFA 4F03A 1EV9A 3RAZA 4KCAA 1GTBA 3DYRA 1FVKA 4NAXA 1KNGA 1K0MA 3A2VA 4MDCA 2H1BA 2M80A 2GT6A 4TR3A 4TKYA 4ZL7A 1A8YA 2GGTA 4KGIA 3EMPA 6GSXA 2TIRA 1M2AA 4GSSA 5J3RA 1I5GA 1TRWA 1F3AA 2VCZA 1RQMA 5CRGA 2AJQB 2JZRA 3PR8A 2QC7A 1S3AA 5AN1A 1ERTA 3F63A 1T1VA 4ZBAA 2ZUPA 2F3MA 5A5KA 2C3TA 2C0GA 4BL7A 4MF5A 2C80A 2DJ3A 1ZZYA 3ME7A 2AB6A 2DMMA 1DUGA 1TK8B 2O85A 4YQUA 2A2SA 3LQ7A 1SL2B 2M46A 3IC4A 3GURA 2HRAA 1PGTA 4GQFA 1GUHA 3MWHA 1W4VA 2HSMA 3HJOA 5DALB 3ZTLA 3ERGA 3O76A 2DJJA 4KDYA 2MMNA 3TUEA 3EMXA 2V6OA 1NHOA 1BQ7A 1X5CA 1TKDB 5D8IA 2KUCA 3ZRDA 5DVBA 4Q5RA 3QOUA 4K1FA 2I4AA 5DBQA 4MPFA 1A2LA 1FG4A 2FNOA 2HXKA 1YJ6A 2GTUA 3QDNA 1HNBA 2N5FA 1VRSD 5IMAA 2L6CA 2HZEA 4KE3A 1AXDA 2WZ9A 4IGJA 3FR9A 3TOUA 4RI7A 3CRTA 1PSQA 4WXTA 1AIUA 1FAAA 2ALBA 1S3CA 4DSSA 4WEYA 18GSA 5AISA 3M0FA 2VIMA 4XS4B 1VGLA 4XS6A 2AAWA 3UJ1A 3F8UA 4N10A 2EIQA 2OE1A 2YJ7A 5COHA 1XW9A 1T00A 2HYXA 2C3QA 3FHKA 4RUVA 1E6BA 4HI7A 1YKAA 2VM2A 1GNEA 3TRPA 4OMVA 5DCGA 1KEBA 2X64A 1OKTA 2L4CA 1YF1A 4TR4A 2JU5A 3KCMA 1GSYA 4MABA 2EIRA 5AIVA 5JWQB 4X43A 2LJRA 4IELA 3WGEA 5DQYA 3GNJA 1K3OA 4BWQA 4BVYA 2FHEA 4FH8A 1M9AA 3FW2A 4POMA 1H75A 2WULA 4F82A 3GMFA 1TDIA 4KCEA 4N11A 3MNGA 3ERFA 3GTUA 4JR6A 2AUVA 1OAZA 4IP1A 1QUWA 4V1Ap 1XWBA 4K6XA 5F06A 4JE1A 3LJRA 5JWRB 4ZIJA 3GX0A 3DGQA 4TW5A 5BMUA 1T8EB 4IKHA 5JCWA 1A23A 2C4JA 1VF1A 2K9FA 5C04A 5D93A 1USBA 2R4VA 3LXZA 3P7XA 2H0GA 4BVXB 3KP8A 4AJ6A 4G2EA 2D2ZA 4DVCA 2MMAA 3QMXA 3CMIA 2XHFA 2UZ8A 4FIWA 3KGKA 3L78A 3FKFA 3LXTA 5D9VA 4O5RA 3UOMA 4MCUA 1U6TA 1WJKA 2LJKA 4PUFC 3GSTA 3M1GA 1R7HA 5GAND 5GAPD 4OO4A 3TRQA 2CT6A 3VWXA 3Q18A 3RDWA 2GQMA 1EV4A 1HNAA 3FZ9A 3WD6A 5JWOB 4MF6A 2RM6A 2OA7A 3SWLA 3VLNA 1FVJA 4TXOB 4TRXA 2XPDA 2CA8A 4ULXA 2MYGA 2PGTA 2ZCTA 3C7MA 4NV5A 5ECRB 1BG5A 5ELGA 2FUG2 2VLVA 1SK1A 1K3YA 1O81A 2VUPA 1A24A 1B48A 2B7JA 1SD9A 3A5WA 4ZB6A 3DMLA 1GRXA 1YZXA 2NPBA 1XW6A 4KW6A 4ZILA 2DSAA 5CRDA 4POLA 1PA3A 2E7PA 4OCEA 1GSSA 4V2NA 5J4UA 3EINA 2FY6A 4TR1B 4LMWA 1ACVA 5CYYA 5DQSA 2V41A 1QK8A 1XWGA 3H79A 1TI1A 3GUSA 5ECLB 1XCCA 3TKPA 2LS5A 4JR4A 1Z7PA 5DAKA 2YOIA 3HCZA 5EL8A 3TJJA 1GP1A 1JZRA 3RHCA 3DVWA 2B5YA 1EP8A 3WGXA 4ML6A 3ZMKA 1TOFA 1R4WA 1ST9A 1DE2A 5INYA 2X8CA 4OWYA 5IO0A 1X9MB 3F4SA 2PBJA 2LSTA 9GSSA 3ZYWA 2IMDA 1DBYA 3JCML 2CZ3A 2ES7A 2H76A 5A4UA 1WE0A 2K8VA 5IMFA 3VK9A 1R5AA 1TRSA 4E8EA 4HS1A 1XZOA 4K7IA 4KUNA 3ERWA 2HZFA 1EOGA 5DALA 3EU4A 5CP1A 2H70A 4MZBA 3TCOA 1GSUA 4EKZA 5D9XA 2RIIA 2LEGA 1KBNA 2HNLA 4L0WA 3GHAA 5J9CA 1THXA 4KSOA 3Q19A 3Q6OA 5L71A 4JBBA 2LRCA 2LRNA 3ZIVA 3ZLPA 2RLIA 4GSTA 1ABAA 3KH7A 1PL2A 2O7KA 1Y6EA 4AJ7A 1G6YA 5H5QA 2JZSA 2X8HA 5HR3A 2DMLA 4HDEA 1F3BA 1I9DA 5EVOA 1AAZA 4AJ8A 1QGVA 3KMNA 4G0IA 1WRYA 5HR0A 3GRXA 3VURA 4IW9A 4YQVA 5AIXA 3TJFA 2J23A 1TK0B 1BEDA 4XS4A 1SENA 4GQCA 1BYEA 2VAFA 4TVEA 3F4TA 4TR0A 4G9HA 3J7Yk 4PURA 2H1DA 4MJBA 5IPHA 3SBCA 3UARA 3DVXA 3EWLA 1TU8A 2E2MA 1EGRA 2KHPA 2HSNB 2ZNMA 4Q5NA 2WFCA 1OKDA 4IJ3A 3A2WA 5B8BA 1T4ZA 2P5QA 3F3QA 3IDVA 4O92A 4HJ2A 4EDZA 3ZL5A 5DCHA 1H4OA 3LYPA 1XWCA 3ISOA 4LMVA 2HSYA 2V2GA 2BMXA 2P0GA 1X5EA 1EZKA 2CAQA 4EDYA 5G31A 3KTLA 3IE3A 2H01A 4PGTA 2V32A 2IL3A 4LL1B 2IIYA 2B3SA 1ZOFA 1MTCA 3FR6A 2O89A 2RUFA 4LL4B 2XBQA 1SKWB 1T4YA 1WP0A 3D4TA 3FYGA 4XS1A 1GTIA 1XVQA 1A0RP 2VL2C 2REMA 4BVXA 3TKSC 1XWAA 2VL3A 2DIZA 2VM1A 3U6VA 3HJMA 3HZ4A 1UA5A 2NVLA 3FRCA 1G7EA 1QMVA 3TKSE 2VCQA 4ACSA 3WT2A 2VD1A 1Z6NA 4RQXA 5CRHA 1GH2A 3F3RA 2QSIA 1C72A 2L5LA 1V40A 3LWAA 1GUKA 2NBSA 1PL1A 5KEJA 4BWSA 1KTEA 3QAVA 1UVZA 1V58A 3EC3A 2VL2A 4FQUA 2H6XA 4G0LA 5B6NA 2R5GA 1ERUA 3LSZA 4PQHA 14GSA 2VLUA 3TKSA 4Q5FA 2BJXA 3HZ8A 3H1NA 3W6GA 3GL3A 4OO5A 2FWHA 1SD8A 1RW1A 3HA9A 1BJXA 1M99A 1YDKA 5C00A 1XWKA 2LQQA 4AGSA 2CX3A 1PKWA 3R2QA 1ZL9A 1O8XA 4WETA 3FZAA 1JFUA 8GSSA 4DSRA 2A4VA 1EP7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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