5ECOB

Crystal structure of fin219-fip1 complex with ja, leu and mg
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
LPILLDYWPSMFGMRARVALREKGVEFEYREEDFSNKSPLLLQSNPIHKKIPVLVHNGKPVCESLNVVQYVDEAWPEKNPFFPSDPYGRAQARFWADFVDKKFTDAQFKVWGKKGEEQEAGKKEFIEAVKILESELGDKPYFGGDSFGYVDISLITFSSWFQAYEKFGNFSIESESPKLIAWAKRCMEKESVSKSLPDSEKIVAYAAEYRKNNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of jasmonate-amido synthetase FIN219 in complex with glutathione S-transferase FIP1 during the JA signal regulation
pubmed doi rcsb
molecule tags Ligase/transferase
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Jasmonic acid-amido synthetase JAR1
total genus 65
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence C, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
B PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5ecoB02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ecoB01
1SENA 2G0FA 2H0HA 3FZ4A 3PH9A 4POKA 4ZL9A 3RPNA 3ERGA 3IPZA 2JZRA 1PD21 2QKEA 3UBLA 1F37A 1K0BA 2I3YA 2ZCTA 2IPAA 4YAVA 3APOA 1V98A 3C8EA 4ECBA 1MTCA 2DSAA 4HDEA 4PNFA 3ZIJA 1B9YC 3BOAA 1X9SB 2M80A 1SJ6A 1B4QA 1GUKA 4MF7A 1EEMA 4POBA 1U3IA 3H93A 1YF1A 3P7XA 1A8LA 1J9BA 3HVSA 4RQRA 4LL4B 4CW9A 1ZL9A 2CX4A 2XC2A 2R4VA 5GZZB 5IO2A 2YWMA 1PL1A 3ZTLA 4O92A 4G0LA 3ZIVA 2HNLA 5IO0A 1SKRB 4ECIA 1AAZA 2DMLA 1QK8A 3IK9A 3DXBA 4PX1A 2FLSA 1M0UA 2CVKA 3W6GA 1SL0B 2GZPA 12GSA 5ECNB 1Z6MA 3KTBA 1GP1A 3GNJA 1SYXA 5F05A 3ME8A 5G1KA 2DJJA 17GSA 2GS3A 2H6YA 2DJ0A 1XIYA 2V6KA 1AXDA 3Q19A 1ON4A 4G0IA 2P0GA 4G9HA 1F3AA 2AAWA 4Q5QA 3C1RA 1ERUA 2H0IA 5KN3A 2ZUPA 1AQXA 1ZZYA 2RUEA 2YN1A 4KUNA 4GRFA 3IE3A 2JADA 1NW2A 4PXOA 3KIJA 3S9FA 4FO5A 2GZZA 3UVHA 1G7OA 1KTEA 3TJFA 1QQ2A 4XCSA 3CSIA 2VL2C 2JACA 4KA0A 1GULA 5EL8A 3BD2A 4I6XA 3UEMA 2JU5A 13GSA 1B48A 2P5RA 3QFAC 2FWHA 1CQGA 1PX7A 2WCIA 3WT1A 5ECIB 1EP8A 5FWGA 4WBRD 1MDJA 3QFBC 4ID0A 2MYGA 2PWJA 4FH8A 2VLUA 3A2XA 4KF9A 3ISOA 4HEA2 1TDIA 4OWYA 5ECQB 1SU9A 2FUG2 4BVYA 1XWAA 2H73A 3HY2A 2B7JA 1XBSA 1NHYA 2HQTA 5FHIA 1SL1B 1TK5B 4KDXA 2KHPA 1B4PA 1X0RA 1UVZA 3A2VA 1UA5A 4PURA 3D22A 5JWQB 3US3A 3D6IA 3UBKA 4F2IA 3OR5A 4ML6A 2C8UA 4PQHA 16GSA 4MJBA 2CX3A 3HXSA 5AIXA 3JCML 4JRRA 4EO3A 5H5SA 5B8AA 2N5FA 2A4VA 4BWQA 3DEXA 2K6VA 1FHEA 1Z3EA 5F8BA 1GSEA 5KN1A 1FAAA 4Q5FA 1DSBA 2NVLA 5B7CA 4X1UA 1YF0A 1U6TA 3QMXA 5ECHB 4XTSA 3HDCA 1THXA 4RQXA 2CVBA 3UJ1A 2CA8A 3E9JB 1A2JA 5D8IA 4IVFA 4XS1A 2R3XA 5DJMA 3CXGA 1S3DA 4JZQA 4JU5A 3L78A 2IJYA 1SK0A 1VF2A 3ME7A 1GH2A 4IJ3A 4OFMA 1ERVA 6GSVA 3HYPA 4OO4A 1HNAA 2VLTA 5G5FA 2PUKC 5CAXA 3VFIA 3R3EA 3QR6A 2UZ8A 3VURA 5IIZA 1ABAA 1PSQA 4LA1A 2K9FA 2JSZA 1CQHA 1FVKA 2O85A 4BVYB 3RHBA 2GQKA 5D9TA 2KOKA 1T1VA 2LRCA 2GSRA 4HU7A 2CV4A 5J9CA 1O85A 2M46A 3C1SA 3KGKA 2MMZA 2LRTA 5H5QA 2RLIA 1ZYQB 3A2WA 4EKZA 2HT9A 2YZHA 2GVPA 4IELA 3EMXA 2C3TA 2LJKA 4GXZA 3H4KA 4J57E 3LYKA 3F3QA 2HXKA 3V1WA 2JL4A 2GSQA 1Y6EA 2F3MA 1B8XA 4EUYA 1XWGA 3W8JA 2F9SA 2F51A 1A2LA 4POMA 1GUMA 1E6BA 2R37A 4IHUA 2C3QA 2IIYA 3SBCA 4L0UA 2B7KA 3A5WA 3KEBA 2AV4A 3W8SA 1GWCA 5CRGA 4K7IA 4HJ2A 2VL2A 1A8YA 4N10A 1K0DA 3PGTA 3EINA 3H1NA 2PN8A 3VWUA 2PPTA 2CZ2A 4MZWA 1GLQA 3DYRA 1M2AA 1GL8A 2V41A 3TB2A 4RI6A 3FK8A 3DWVA 1PMTA 2OACA 1U88A 2VCXA 2LQOA 2X8HA 1EGRA 2B1LA 4ACSA 5JCGA 2I1UA 2O8VB 3TRPA 2H1BA 2AJQB 6GSSA 3TJKA 3HJMA 2H70A 4NHWA 2WRTA 1O8WA 3LEFA 3U6VA 2R6KA 4QL7A 1FVJA 2IFQA 2DBCA 3ZL5A 2HRFA 3GKNA 3KJYA 5JCUA 2K8SA 4F03A 3FHKA 3F4RA 3IAS2 5L71A 1Q98A 1A0RP 5H5RA 2YV7A 3MDKA 1FB6A 2VCZA 5IM9A 4KH7A 1X5CA 2EC4A 1GNWA 1Z5YE 2J9HA 2RUFA 3GKMA 5LCZA 4MF5A 4KB3A 4N11A 1PN9A 3FKFA 3APQA 2BTOT 2H1GA 1PX6A 1SYRA 2B1KA 2FA8A 3BJ5A 4HOJA 1JZRA 3DD3A 1QXHA 4GSTA 1G0TA 2PVQA 2YCDA 4ILFA 5B6NA 3D4TA 18GSA 4DSRA 2FCHA 5ECPB 2IN3A 4XHMA 1EGOA 5GSTA 4K9ZA 2L6CA 1Z7RA 4OCFA 2E2GA 4G19A 4BL7A 1EEJA 3GIXA 2YV9A 3GH6A 3HVVA 3TUEA 2H0GA 5HR3A 4PUAA 2H01A 4K6XA 3EE2A 1WMJA 4ULXA 4DVCA 3APSA 4K8MA 22GSA 4FYCA 4WXTA 2C0GA 1G6YA 3UMAA 4TR0A 3VWVA 4O7HA 3O76A 4BVXA 1XOAA 6GSUA 4POLA 4GTUA 1XW6A 3AY8A 2IFQB 2XPDA 3EURA 4WBJA 5DDLA 1K3LA 1N2AA 2WGRA 1SKSB 5EVOA 3VWXA 4V2NA 3GTUA 5AIVA 4TR3A 1URMA 2OBKA 4PUFC 1M2DA 3C71A 3WYWA 1TXXA 4HZ2A 5E4WA 2HSMA 2WDUA 1TOFA 2DJ3A 2TRCP 3N5OA 8GSSA 2L57A 2RM5A 1PKWA 1A24A 1TU7A 2VIMA 3F9UA 4HS1A 2CVDA 1GSQA 1JZDA 4TOPA 1X9WB 2OE0A 5LD0A 1QUWA 3G9BA 3L9SA 3VWWA 1MD3A 2DIYA 5J41A 3LWAA 4LLRA 2XHFA 3L0HA 3RPPA 2C80A 1PRXA 4MCUA 1KEBA 1EOGA 4V1Ag 1EV9A 4TXOB 4I2UA 4Q5RA 4IN0A 4BL7B 1JHBA 4AJ8A 5HR0A 3TKPA 5F06A 2VCQA 1ZOFA 1SKWB 1SK1A 2XPEA 5J4UA 1YJ6A 3FR3A 2IL3A 1EWXA 4K7NA 5ECMB 1V58A 5CO3A 5DBQA 3ZLPA 2O7KA 4EC0A 5HR1A 1W89A 1M7TA 3ZREA 1T8EB 4TN8A 1WPIA 2H74A 3KMOA 4NXIA 1JLWA 4BVXB 4I5QA 1UN2A 5ECSA 2F8AA 3G7JA 2X99A 4GF0A 2ES7A 1I9DA 4IGJA 1B9XC 5D96A 2QC7A 3UARA 2AUVA 1SD8A 1K3YA 4HI7A 2VAFA 4GLTA 3L4NA 3GTUB 9GSSA 3Q18A 1GSFA 5HQPA 2R2JA 4HU9A 2H6ZA 3KD0A 4GQCA 4MPFA 4GCIA 1GTAA 1R5PA 4V2MA 3IC8A 2X64A 5C00A 2HSMB 4CDOA 4MDCA 3VLNA 1TK0B 4MF6A 3DVXA 2GZYA 3PPUA 1NHOA 2H66A 4IBPA 4L5OA 4K1FA 2GQLA 4X0XA 1X5EA 4MZCA 3NOFA 1YEXA 4FQUA 3P8WA 4EF0A 1PGTA 4EDZA 4IQAA 1R4WA 2VD0A 5DCHA 2PU9C 2A2SA 2JZTA 2GT5A 2GQMA 2ON7A 3TOUA 2BMXA 5B6MA 4ZB8A 2IMDA 3NZNA 2L6DA 1TKDB 1F9MA 2DJ1A 3M9KA 2TRXA 5IMVA 2LRNA 3F6FA 5CREA 3ZFLA 4L8EA 2MMNA 1GRXA 5B8BA 3KH9A 3KTLA 2NPBA 3D0ZA 4MPGA 5DJLA 4D73A 5COHA 1X5DA 3FW2A 1Q4JA 2VO4A 14GSA 1FW1A 1J0FA 3HHVA 5A4UA 4OCEA 3CTFA 1RQMA 3HKRA 3QAVA 1R5AA 5DQYA 3D5JA 1TJDA 1R7HA 4Q5NA 3GL3A 3LYPA 3IRAA 3TJGA 3IR4A 1C72A 1K0OA 2C3NA 2ZNMA 3FYGA 1HYUA 3QAGA 3ZYWA 5HFIA 2KP1A 1FOVA 3GX8A 3K8NA 3M9JA 2HSNB 5LNKe 4TKYA 4MLYA 3CRUA 3J7Yb 4PNGA 3TKQA 2LSTA 4MP4A 1T00A 1YKAA 3VI5A 3P2AA 5ECLB 1GTIA 4MA9A 1WP0A 4WF4A 2C0FA 4O32A 1YKCA 3GUSA 2DJKA 3WGXA 4P3YB 3FEUA 4EDYA 2IMFA 4PQ1A 4MH2A 5G5EA 3E3EA 4OFTA 3CMIA 2VM2A 1PL2A 4DEJA 1BX9A 4NWYA 4BWSA 2FD3A 2PMTA 3TKSC 3BCIA 3M3MA 4WKWA 4FYBA 2CAQA 4ECCA 4JR4A 3LJRA 3FR6A 1H4OA 4KAEA 1XPVA 2H6XA 2LEGA 1Z9HA 5AN1A 5EPFA 3HJPA 3TJJA 2RIIA 2LJAA 3TRXA 2HI7A 3KM6A 3LFLA 3DIEA 2MMOA 2WS2A 3ZVJD 2AB6A 3WT2A 4D73B 1TRVA 1OC3A 3C7MA 2V6OA 1G7EA 2B6MA 4JBBA 1IYHA 3GMFA 1A2MA 1JLVA 2FNOA 5ABRA 3VPTA 1M2BA 1FO5A 2V2GA 1AW9A 3UVTA 3TRQA 3DMLA 3FRCA 2VUPA 1PQNA 1GSYA 2PBJA 1FG4A 4XRDA 2L59A 3HZ8A 4E8EA 5G2ZA 1RK4A 4HJMA 1NSWA 4KCEA 3F0IA 1AUCA 3IHQA 4OMVA 2I81A 1XWKA 3ED3A 2EIQA 1LBKA 3KZQA 2EIOA 1OVNA 4KE3A 6GSYA 3MAKA 4ECJA 4MZBA 4N30A 5AGYA 1FB0A 3GL5A 3IDVA 1Y25A 2H1DA 3LGCA 3U5RE 4XS6A 1AQVA 3DKSA 1MD4A 1TTZA 3TKRA 1WRYA 2FHEA 3H79A 4TVEA 4G2EA 2P5QA 1ST9A 4ZL8A 1UC7A 3EMPA 3GKXA 1GSUA 1OE8A 4K2DA 5IOWA 1XWCA 2VCWA 5CNWA 4J56E 5A4WA 1I5GA 3LXZA 3UIWA 1YQ1A 4V1Ap 2GGTA 4LMWA 7GSSA 2HZFA 1GTUA 2H30A 4ZBDA 5ID2A 2K18A 5CYYA 3F4SA 3IAM2 3MSZA 1Z6NA 3GKKA 2Z9SA 1E2YA 4KDUA 1ZMAA 2IMEA 2YZUA 4JE1A 1HNBA 5D9VA 5AISA 4I2TA 1YEPA 4LMVA 2IMIA 3H8QA 2QSIA 1BYEA 5A5KA 4TR1A 1SL2B 2E0QA 3GH9A 1TI3A 2KLXA 4YQMA 5IOXA 2YJHA 2LKUA 4IP6A 4TXOA 5J9BA 2XBIA 3EVIA 2LNTA 3KH7A 1TRSA 2H1AA 2KP2A 2HRAA 2VL3A 2HLSA 4TR4A 3WGEA 2TIRA 2YJ7A 1BQ7A 4ZB6A 3PINA 3HCZA 2FWGA 1BAYA 3MNGA 2WULA 3HJOA 3O3TA 3QD9A 3TKSA 4NAXA 5F0GA 3UL3A 3F63A 2PERA 4GWRA 5HFGA 2VL9A 6GSWA 3GHAA 3ZMLA 2H71A 1WE0A 1WJKA 3EYTA 4YAPA 3D21A 5F07A 4YQUA 4PQIA 4ZILA 3DRNA 4L5LA 3VK9A 1DUGA 20GSA 1O8XA 1QFNA 4MK3A 3FR9A 1EZKA 2JSYA 2WJUA 4IP1A 3ZFBA 3IOSA 4OD7A 2VCVA 5ID2B 2GSTA 4TXVA 5DAKA 4PGTA 3GYKA 3HVXA 4PTSA 5DVBA 4X43A 2G2QA 5CP1A 3PR8A 5DQSA 3QPMA 3F3RA 2AYTA 2REMA 3LXTA 1KBNA 3I69A 3LQ7A 2B5XA 1VRSD 1ML6A 2YWNA 4MMMA 2XBQA 4G0KA 4J2FA 1OKDA 5KN2A 2YP6A 5IMFA 1J08A 5ECKB 4FYUA 4TR1B 4IKHA 3TGZA 5CRWA 2L4QA 4XS4A 2H72A 1XW9A 1ERWA 1BEDA 3GSTA 6GSTA 2FGXA 4DSSA 3TJBA 4EE0A 1XVWA 4ZXGA 4N0VA 2ON5A 3KP8A 3RAZA 3M8NA 1SK2A 2J23A 4GSNA 2NBSA 2FA4A 3CRTA 2IWTA 3CSJA 3FY7A 4IJIA 4TRXA 5JCWA 2O89A 4AJ7A 1BJXA 2HFDA 2VLVA 3TKSE 3NIVA 4ZB9A 2I4AA 4ISDA 3SWLA 2CT6A 4IW9A 3EU3A 1M9AA 4K0NA 3I9V2 5HR2A 3ZZXA 3GV1A 1AC1A 3BCKA 3M1GA 2GSSA 4ML1A 2OE3A 2LS5A 4O5RA 3ERFA 2LQQA 2O87A 4K7OA 2OA7A 1LU4A 2V1MA 5IMZA 2HRNA 2H8LA 4L0WA 3GFKA 2YPMA 3R2QA 5DAKB 2X8GA 4F0BA 3EC3A 1SD9A 3IC4A 3I6AA 1XOBA 1XZOA 4JR6A 3KXOA 1DBYA 4HQSA 4HUAA 1WOUA 2IMKA 5KEJA 3TDGA 1K0NA 2H19A 1W4VA 1TRUA 2BJXA 4GQFA 4AF2A 1V9WA 4OO5A 2DC5A 3WD6A 1AIUA 5CRHA 4F0CA 3LG6A 4JEDA 2X8CA 4XS4B 1ACVA 5GSSA 1XXUA 3ZITA 2AHEA 3L9VA 4DSSB 4EXJA 3DGQA 2RM6A 4G10A 1USBA 2C0EA 5GAPD 5JWOB 2CZ3A 2LJRA 2D2ZA 1XVQA 4MH3A 3QOUA 4ZL7A 2HSYA 3DVWA 1LJRA 2C0DA 4V2LA 2JZSA 1OC9A 2N5AA 3QDNA 1A23A 4XRAA 1NM3A 1EV4A 1QMVA 4WR5A 4NHZA 1IYIA 1V40A 4KDYA 1MDKA 2OKAA 1O7UA 5IPHA 3RDWA 5DALA 3F8UA 2FWFA 4NV2A 5IPGA 4BA7A 4KNDA 2OE1A 4F9ZA 3QAWA 3L9UA 1THOA 3UAPA 2F8FA 1HD2A 2VM1A 1M9BA 1TK8B 5IMAA 3MWHA 1F6MC 2NTOA 1ZYEA 5ELGA 2L4CA 4NV5A 2DLXA 1T3BA 3FZ9A 1TU8A 1RW1A 5G1LA 1AQWA 2QGVA 3F4TA 2L5LA 1V57A 3CBUA 2C1YA 2H75A 2B5EA 2WB9A 2FWEA 4DSQA 4YQVA 1O73A 1XW5A 2H76A 2HSHA 1TW9A 19GSA 2LNSA 3ZMKA 2HZEA 5J5NA 1T4YA 3IK7A 2B5YA 2YOIA 2PGTA 1ZCPA 1TI1A 4QQ7A 3GSSA 3CTGA 2YWOA 3ZVJA 3GURA 2YWIA 5D9WA 1Z7PA 3EWLA 4ZIJA 10GSA 2GTUA 1T4ZA 1VGLA 4AGSA 4TW5A 4NMUA 1OC9B 3E0UA 5INYA 2HRKA 5D93A 3I43A 1OAZA 4MJAA 1XFLA 3TOTA 1SJZA 5IQYA 3A3TA 3Q6OA 4FIWA 3IXRA 2M72A 4RUVA 4QL9A 4MJCA 3Q74A 5DALB 3GRXA 1U3AA 2E7PA 4USSA 4KCAA 2C4JA 2GDRA 1M99A 2LUSA 1PA3A 4I8BA 1K0CA 11GSA 5KN0A 4CHSA 1TRWA 4ZBAA 2MMAA 1OC8A 3D4MA 4F82A 4KGIA 4N0ZA 4GSSA 3C73A 1GSDA 4HZ4A 5CRDA 2HYXA 1XCCA 1YDKA 2MBSA 1DE1A 3HD5A 1OKTA 4Z7XA 1EOHA 4EL1A 4H86A 3HA9A 4YH2A 3QCPA 5ENUA 4EVMA 3G7IA 3TCOA 5IMCA 2DMMA 4HQZA 2N5BA 1HNCA 2YANA 3F6DA 3LORA 3J7Yk 5D73A 2P31A 3BBYA 1YZXA 3EU4A 1SJIA 2HZEB 2MBTA 2R5GA 2GLRA 1ILOA 5J3RA 1WIKA 1S3AA 2WFCA 2YNXA 3ERWA 1JFUA 1WWJA 5DCGA 3O6TA 1BG5A 1TP9A 1PKZA 1MDIA 3IV4A 4KW6A 1O6JA 2NDOA 1OYJA 1JZWA 1VF4A 1XWBA 1T7PB 1MEKA 1X9MB 1GTBA 3ZRDA 2HRKB 4KSOA 3KCMA 3RBTA 3FZAA 1GSSA 4WETA 2MZCA 4K0GA 1EP7A 4LL1B 4IQ1A 2A2RA 2OADA 1VF1A 4IS0A 2FY6A 3IBHA 2LV3A 3GN3A 4RI7A 4XIHA 1OE7A 1A0FA 3VI7A 3UOMA 2LTKA 4MJEA 2KUCA 1ZGNA 2GT6A 5A4VA 3KMNA 1JZOA 4I97A 4E8HA 1F2EA 2VOCA 2WZ9A 4BPYA 3M0FA 3KP9A 2OBIA 2V32A 1GLPA 3N9JA 3IA1A 1N8JA 2CAIA 2B3SA 2DJ2A 2E2MA 5E59A 5EY6A 1ERTA 1DE2A 1F3BA 5ELAA 4KSMA 2HE3A 1QGVA 1VF3A 5IMDA 2L5OA 1V2AA 4KX4A 2CQ9A 1K0MA 3GA4A 4WF5A 4WR4A 2K8VA 3RHCA 1GUHA 2OJLA 4OFNA 5HFKA 3HZ4A 1S3CA 5C04A 4NPBA 1R26A 3VPQA 5FT3A 4MABA 2I9HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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