5GSTA

Reaction coordinate motion in an snar reaction catalyzed by glutathione transferase
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWNVRGLTHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCYNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots along the reaction coordinate of an SNAr reaction catalyzed by glutathione transferase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Rattus rattus
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
total genus 68
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1993-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5gstA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5gstA01
2DIYA 2YZUA 4K1FA 4K7OA 1FO5A 3DVWA 4NAXA 1GSDA 4KF9A 2GSQA 1KNGA 2WCIA 1Z6NA 4AF2A 2V6KA 4NV2A 3H93A 4YQVA 2LTKA 2I81A 1OC9B 1JHBA 3EMPA 3EINA 2HZFA 3D0ZA 3NIVA 2LQOA 4MH2A 1BJXA 1Y6EA 5D9TA 2VO4A 4GQCA 3EMXA 5D73A 2AAWA 3DKSA 2O8VB 3EC3A 5F0GA 4ZB6A 3QD9A 4BVXB 5J5NA 3IAM2 4PQIA 5LD0A 2REMA 1ERVA 3QOUA 1V58A 1I5GA 4F0BA 1HNAA 1WPIA 2DIZA 4CDOA 1DSBA 5ENUA 1VF2A 5HFGA 4FYBA 4KAEA 3FZ9A 3GH9A 2B1LA 3TUEA 4PGTA 5DCGA 1TTZA 4OMVA 1YY7A 5FWGA 1O6JA 4DVCA 1GSFA 5HR3A 5JWOB 3GSSA 1XWKA 2WRTA 2MMZA 5AISA 4YH2A 2VUPA 1YEPA 1X5DA 4I5QA 1B9XC 3C71A 2J9HA 5GZZB 2VCTA 4F03A 5CRGA 1AIUA 2ALBA 1V57A 3PH9A 3US3A 2IIYA 1YZXA 4IS0A 1NM3A 4JE1A 4MF6A 1TDIA 2OADA 5CREA 1ST9A 20GSA 4LL1B 2C0GA 1DBYA 2VCZA 1B48A 4BL7A 4F0CA 1ACVA 4IHUA 4KNDA 1SYXA 2HFDA 5KN0A 2GZZA 3M3MA 3ZIVA 1JZWA 1NW2A 4NPBA 5IMDA 2I3YA 3GKKA 5ECOB 2O89A 2IL3A 2VCQA 2L4QA 3LG6A 1Q4JA 1J9BA 2V32A 4MZBA 4K7IA 5E59A 1URMA 5G1LA 2EIOA 2FGXA 4TVEA 4WKWA 3D6IA 2H6XA 3TOUA 2YCDA 2LJAA 2E0QA 1O81A 3F6FA 4G10A 3EU3A 3KGKA 1R4WA 4JU5A 5ECPB 3UAPA 3HVXA 1AQXA 4IJ3A 2WJUA 3BCIA 4WBJA 5GAPD 1EGOA 2VIMA 5D9XA 5IO0A 1J08A 3LYKA 3UVTA 1TK0B 2HNLA 4EXJA 3ERWA 2GSSA 5DAKB 2OKAA 3QAWA 2LJKA 2LQQA 1PGTA 4WEYA 3QFAC 2TRCP 2LRNA 1THXA 2GSTA 3FY7A 3EURA 1G7OA 3FR6A 1XPVA 3CTFA 3J7Yb 2B5EA 3HXSA 4ZL7A 2ON7A 3UL3A 2DC5A 2WB9A 4ZB9A 3HYPA 5E4WA 2YV7A 2IMEA 3H8QA 2OACA 4IKHA 3L78A 2H73A 1B4PA 1BG5A 1OC8A 1K3OA 3C7MA 1MDJA 1M2AA 2IPAA 1U88A 4BA7A 5KN2A 3A2WA 2GQKA 2K8VA 1R26A 4HU7A 2PU9C 5IOXA 2IN3A 4EDZA 2CT6A 3IXRA 4X0XA 4RI6A 5G1KA 2XHFA 2K6VA 3L4NA 5G30A 3VURA 4L5OA 3DD3A 2HZEA 1VRSD 4N0ZA 1YKAA 4WR5A 3BD2A 2WS2A 3M9KA 4I97A 3VWVA 3HJPA 2B7JA 3WD6A 2ZNMA 2PWJA 4WBRD 2RIIA 1R5PA 5IIZA 1RQMA 1ABAA 1GL8A 3ZFLA 4GF0A 2K18A 2PVOC 3HZ8A 3GHAA 1ZL9A 5A4UA 2H1DA 2R2JA 4KDYA 3D21A 2LSTA 4EUYA 2HSMA 1TK5B 1VF1A 4GSNA 3VPTA 3DWVA 2N5AA 2FD3A 2H30A 7GSSA 4MPFA 3QR6A 1O8WA 4F82A 1FB6A 1GSEA 1ON4A 2F8AA 3FW2A 1TI1A 5INYA 6GSSA 1PSQA 5B7CA 2PN8A 5CNWA 3HCZA 5F8BA 2NBSA 2DJ0A 2IMIA 3IAS2 3ZFBA 1XWBA 3TKQA 4RUVA 4TW5A 2P5RA 3KH9A 4RQXA 4G2EA 3KJYA 2HXKA 2JZSA 4AJ8A 3GN3A 2DLXA 2RUFA 3H1NA 1EWXA 2VL3A 4ML6A 3VI7A 1K0CA 2L6CA 1XW5A 1PX6A 2XBQA 1EP8A 4ISDA 1EEMA 1SK0A 1XOBA 1UA5A 1A2JA 3PGTA 2HQTA 3O3TA 4MJCA 1JLWA 4BVYB 3W8SA 4XS4A 2VD1A 4PURA 1BX9A 2V6OA 4HZ2A 3M8NA 2K9FA 4MJBA 2WULA 2AYTA 3LGCA 3I9V2 3G9BA 3TRQA 5GSSA 1UC7A 3GRXA 1AAZA 5JWQB 3G7IA 5COHA 1XIYA 4OCEA 4MMMA 4XS6A 5HQPA 4GRFA 4TR3A 5HR1A 5CO3A 1TRVA 3EYTA 5ECLB 3A5WA 4L5LA 4TRXA 3R2QA 1J0FA 3GUSA 1X5CA 3KH7A 1WWJA 1MDKA 4YQUA 3MWHA 2JL4A 3KTBA 4NWYA 3TJGA 4MJEA 1SKWB 2E2GA 5JWRB 2MZCA 3HZ4A 3DRNA 2H0GA 2C1YA 1M99A 5FHIA 4FH8A 4JBBA 1ZMAA 2FWGA 4HZ4A 2H8LA 2G0FA 3KD0A 1R5AA 5KN3A 2IFQA 5IMZA 4YQMA 4Q5NA 3Q19A 1K0BA 5B6MA 2F9SA 3ERFA 3TKSE 3RBTA 3KIJA 3LEFA 1KEBA 5KEJA 1JZOA 3SBCA 4BL7B 3D22A 2YPMA 4JZQA 3FK8A 2HLSA 4JR4A 2IMKA 5J41A 4XS1A 2C80A 1H75A 1GTBA 3GNJA 3DIEA 2BMXA 3KMOA 1XFLA 3E3EA 1FOVA 2GT6A 3TGZA 5DQYA 2NTOA 4KSOA 4DSQA 3FYGA 1MTCA 4EDYA 2H0HA 4DEJA 3F9UA 1BAYA 1PKZA 4MH3A 4I2TA 3NOFA 1GTUA 1X0RA 4YAVA 2I9HA 4O92A 1SD8A 5C00A 3HJMA 1Z3EA 2L4CA 3IBHA 3VPQA 2DSAA 5D9VA 1LBKA 3UARA 2HSYA 2KP2A 2H72A 1TOFA 4ILFA 1BQ7A 4V2LA 2C0FA 4NHZA 2O7KA 1WP0A 19GSA 2H6YA 5DALB 1T8EB 2KOKA 4PUFC 2YANA 2FUG2 2V1MA 1T1VA 2YOIA 2IWTA 3C1RA 1YQ1A 2PBJA 1G7EA 3ZMLA 2VLTA 1DUGA 2CQ9A 4DSSA 2J23A 3WGEA 1SL0B 4MF7A 1WJKA 1XVWA 4JRRA 3LWAA 4QL9A 4G9HA 4K6XA 2XPDA 2DJJA 3HVSA 22GSA 4G0LA 3RHCA 1XWGA 4KW6A 4IBPA 1T4ZA 1A8LA 4V1Ap 4D73A 3TB2A 4ZB8A 3QMXA 3BOAA 4LA1A 2LNTA 3EE2A 5DVBA 3PPUA 1PRXA 2GZPA 4HUAA 1TRSA 2X64A 1PL1A 5CP1A 2CA8A 2H1AA 5HFIA 3GTUA 1GSQA 5EY6A 3PR8A 2HRKA 1GSSA 5DCHA 3F4SA 1AXDA 3QDNA 4EO3A 4OO4A 5IM9A 1JZRA 3IR4A 3N9JA 1I9DA 2B6MA 3F8UA 2JU5A 3P90A 1PMTA 4IVFA 2HSMB 4FYCA 1TP9A 4EC0A 2RLIA 4PX1A 4L8EA 1EV4A 1G6YA 4GCIA 2QKEA 5J3RA 5HR2A 2VL2C 2KUCA 2PGTA 4GLTA 1LU4A 4TXOA 3HHVA 3WGXA 1GP1A 1TRUA 5DQSA 5CYYA 4I2UA 5IMAA 4TXVA 4ZIJA 3GYKA 2FNOA 3CBUA 2H01A 1AW9A 1ZGNA 2XC2A 12GSA 1OKDA 2WDUA 1A0RP 3JCML 4XRAA 3APQA 1K3LA 5AGYA 1SJIA 1XWCA 3IHQA 3CMIA 1UVZA 1JLVA 1ERUA 1SKSB 4L0WA 3TRXA 2AUVA 3PINA 4ZL8A 2L5LA 1GH2A 2D2ZA 2GSRA 1AUCA 4K0GA 5ECHB 3A3TA 2C3NA 2DMMA 1O7UA 2OJLA 3WT1A 2F3MA 3TKPA 3TRPA 1WOUA 2LKUA 2B5YA 2EIRA 4RI7A 4X43A 4PUAA 1XXUA 1SYRA 4ECCA 5B8BA 2X8HA 4ECIA 5ECQB 4XS4B 5DJMA 1U3AA 3G7YA 2A2RA 3UBLA 1N2AA 1ZZYA 1EZKA 4AJ6A 3CXGA 6GSYA 3IRAA 3V1WA 3C73A 3QAVA 1X5EA 2VOCA 3TOTA 3A2XA 3O6TA 2N5BA 1TJDA 3GIXA 4G0IA 3RPPA 4NXIA 4NMUA 1YF1A 2TIRA 1U6TA 5IMVA 1S3DA 1UN2A 2YNXA 2VM1A 4FIWA 2VLVA 4ZXGA 5D96A 1GRXA 1OKTA 4ZL9A 2MMNA 3WT2A 3ZITA 5G2ZA 1RK4A 3RAZA 3TKRA 3CSHA 4BVXA 4EL1A 4HI7A 1V98A 4JR6A 1IYIA 4KGIA 2I4AA 1PD21 4O32A 2CAQA 4HJ2A 2LRCA 3I43A 4Q5RA 2B7KA 2X8GA 1RW1A 3OR5A 1FVKA 4PNGA 1SU9A 5D93A 5CRWA 1GWCA 4MLYA 5H5SA 4QL7A 1ML6A 2IFQB 1ERWA 1Q98A 1GTAA 1QQ2A 5J4UA 2N5FA 3Q74A 1EGRA 3EU4A 2VD0A 3ED3A 1EOGA 3ME7A 2GQLA 3M0FA 3APSA 1YKCA 1F37A 1U3IA 2CAIA 3FR3A 5ECNB 3C1SA 3TJBA 2KLXA 2GZYA 3ZMKA 2PVQA 2YP6A 2MMAA 1GSYA 2CX4A 4J56E 1SK2A 4TR1A 4KCAA 3Q6OA 3ME8A 2NVLA 2YN1A 2H0IA 3TJKA 3UBKA 2NPBA 1PKWA 3IK7A 1F6MC 1YEXA 1FAAA 3CRTA 3HJOA 4J57E 3F63A 3E0UA 1R7HA 1ZOFA 5ECMB 2F51A 5F07A 5GSTA 2H1BA 4KE3A 5ECRB 2JACA 2LNSA 3ZREA 5BMUA 1LJRA 3U6VA 1ZYEA 2C3TA 1CQHA 2GQMA 4MDCA 1KBNA 2OE0A 3IDVA 4MJAA 5CRHA 2AV4A 1Z7RA 1A24A 2MMOA 1M2DA 2A2SA 1Z6MA 2ES7A 2DJ1A 2PPTA 4OWYA 5D9WA 3MAKA 10GSA 1Z5YE 4DSSB 3VLNA 1HD2A 2H75A 2C4JA 2DMLA 4V2NA 3TJFA 1KTEA 3HA9A 4IN0A 3GH6A 1Z9HA 14GSA 2DJ3A 3MSZA 2YJHA 3IV4A 5DAKA 3UMAA 4XCSA 2EIQA 3CSIA 4OFNA 1A0FA 2LV3A 2KP1A 3FEUA 5IPGA 2R6KA 3NZNA 1IYHA 4ZBBA 4XIHA 3H79A 1S3AA 4D73B 2HRFA 1T3BA 4I6XA 4KUNA 3M1GA 4KDUA 2QC7A 4TN8A 4MK3A 2E7PA 5IQYA 1EOHA 4Q5QA 2JZRA 1NHYA 3GMFA 5A4WA 2V2GA 1FB0A 2HSHA 1OE7A 2M46A 4POMA 1N8JA 2AB6A 1W4VA 2DBCA 1MDIA 8GSSA 4ZBDA 3FKFA 2C8UA 2B3SA 1BYEA 1HYUA 2QSIA 3L9VA 2VL2A 1FVJA 1B4QA 2H6ZA 4LLRA 1JFUA 2E2MA 4EKZA 1EEJA 1HQOA 4EF0A 2YJ7A 11GSA 2WGRA 3CSJA 1AQVA 3FRCA 1ILOA 3LXZA 4GWRA 4GSSA 1SD9A 3IOSA 3N5OA 3UIWA 3F4RA 2VCXA 1Y25A 3DVXA 2Z9SA 3IA1A 2RM6A 4TXOB 5ELAA 2X8CA 5IOWA 2P5QA 5D8IA 5DDLA 3CYNA 3QFBC 3FHKA 3GURA 3ZYWA 3P7XA 5IMFA 2GS3A 1WMJA 2R3XA 4HJMA 2OE3A 3VWXA 5ID2A 3IK9A 1TI3A 2NDOA 1F2EA 4IGJA 1GUKA 1F9MA 3GV1A 2YWNA 2H1GA 4E8EA 4GXZA 5A4VA 1U87A 3S9FA 1SKRB 4MP4A 2G2QA 2TRXA 3U5RE 18GSA 1HNCA 5F05A 1QGVA 4OCFA 1THOA 3TCOA 4HU9A 3TKSA 4KH7A 4OFTA 5F06A 2H71A 1GLQA 2P31A 4RQRA 2GT5A 3VFIA 3L9SA 5ECSA 4NHWA 3K8NA 2JSYA 2PMTA 1OC3A 1PX7A 4K7NA 3BJ5A 4H86A 4G19A 4KX4A 2HYXA 2CVDA 2VAFA 4MF5A 5AIXA 2JZTA 1XVQA 2LS5A 3TJJA 5EVOA 4ID0A 5EL8A 3O76A 4BVYA 2YV9A 4HEA2 2R5GA 3L0HA 1TW9A 5B8AA 3HD5A 3QPMA 4PQHA 1X9MB 5GAND 4WF5A 3GSTA 1O73A 2P0GA 2B1KA 4DSRA 2HRNA 1PN9A 2H76A 1TRWA 2IJYA 4ECJA 3C8EA 2HZEB 3IPZA 2C0DA 2ZUPA 3RPNA 1QMVA 4YAPA 1A2LA 2L5OA 3E9JB 1SJZA 4LL4B 2DJKA 2EC4A 1M9BA 4ULXA 4J2FA 3UOMA 1QUWA 3GFKA 2FHEA 2R4VA 1E2YA 1T7PB 3LSZA 5IO2A 3P2AA 2A4VA 3G7JA 4KA0A 2PUKC 4XTSA 1V2AA 2HE3A 3F0IA 3HKRA 2MBSA 3LYPA 4G0KA 4TOPA 4L0UA 1WE0A 2AJQB 2CVBA 3ZRDA 4WXTA 1JZDA 3ZLPA 2BTOT 3W6GA 2WZ9A 4K9ZA 1FW1A 2XPEA 3BCKA 3ZZXA 4K0NA 2ZCTA 2DJ2A 4MA9A 3ZVJA 5JCGA 3HY2A 2FWFA 2H74A 5J9BA 3WYWA 4TR1B 4WETA 3VK9A 2UZ8A 4Q5FA 3LJRA 1YDKA 4KSMA 2CVKA 4BPYA 9GSSA 1EP7A 2RUEA 2LJRA 3CTGA 4OO5A 1O8XA 1HNBA 4CW9A 1WRYA 3DGQA 1XBSA 3SWLA 4V1Ag 3F6DA 3IE3A 4IP1A 4WF4A 5H5RA 3KXOA 3AY8A 2FWEA 3VI5A 5G31A 4MPGA 3I69A 2O85A 4N10A 3W8JA 3ZL5A 17GSA 2LEGA 2FCHA 3MDKA 3D4TA 1ERTA 6GSXA 4N0VA 3F4TA 2CX3A 2MBTA 5ABRA 3LQ7A 3VWUA 1DE1A 4GTUA 2VL9A 3MNGA 4HQSA 5G5EA 5DJLA 4OFMA 1VF4A 4MABA 2GTUA 4AGSA 3DMLA 3QAGA 3L9UA 4OD7A 4HOJA 1GNWA 4AJ7A 1FHEA 4HS1A 4PTSA 4N11A 5EPFA 1C72A 1XWAA 3Q18A 1XW9A 1XW6A 5DALA 2OBIA 3I6AA 1EV9A 4KDXA 1OC9A 3TKSC 1OYJA 2GGTA 5CRDA 5IMCA 2GVPA 1T00A 2OBKA 4QQ7A 1NHOA 4FQUA 1GULA 1O85A 1TU8A 2L59A 3LORA 3EWLA 4N30A 16GSA 4K8MA 2YWIA 2HT9A 3ERGA 5DBQA 4PQ1A 1VGLA 1M0UA 6GSTA 1YF0A 4JEDA 4BWQA 3FZAA 4ECBA 1K0DA 3GX8A 3F3RA 5JCWA 2YWOA 1M9AA 3KM6A 4V2MA 5FT3A 4O7HA 3J7Yk 1OAZA 2KHPA 4FYUA 5AIVA 2OA7A 4EVMA 1GUHA 5C04A 1TK8B 1S3CA 3GKMA 2QGVA 2MYGA 1T4YA 3APOA 1AQWA 1V40A 2B5XA 4ACSA 1DE2A 1PA3A 3QCPA 4KB3A 1FG4A 2XBIA 4POLA 1GTIA 5AN1A 4LMWA 1GSUA 3D4MA 3KZQA 1WIKA 3UEMA 2X99A 4O5RA 4PNFA 3EVIA 5KN1A 3FR9A 1NSWA 2H19A 4TR4A 1MD3A 4K2DA 4MZCA 1XCCA 1V9WA 1GLPA 3KEBA 1X9WB 2GDRA 5ID2B 4BWSA 2OE1A 1X9SB 1K0MA 1SK1A 3A2VA 2JADA 2HI7A 1QXHA 1QFNA 4Z7XA 3R3EA 5A5KA 4LMVA 13GSA 1K0AA 3H4KA 4IP6A 1XOAA 1QK8A 3KP9A 4E8HA 5B6NA 2K8SA 1GUMA 3M9JA 2V41A 5LCZA 1CQGA 1ZYQB 4WR4A 3FZ5A 3FZ4A 4P3YB 1G0TA 6GSVA 2FLSA 5HFKA 1A2MA 3RHBA 1G6WA 1SJ6A 2BJXA 2WFCA 4TR0A 2LUSA 4ZBAA 3F3QA 2JSZA 2GLRA 1PL2A 4TKYA 1A23A 2FA8A 4EE0A 5ECKB 3GL3A 1A8YA 4F2IA 2FA4A 3HDCA 3IC4A 3KP8A 3CRUA 2O87A 5HR0A 2H66A 3HVVA 2M80A 1B9YC 1SL1B 3BBYA 3GKXA 1H4OA 3ZVJD 1TXXA 4GSTA 4MZWA 1USBA 4POBA 2R37A 3VWWA 4HDEA 1AC1A 1OVNA 4X1UA 2I1UA 3UVHA 2M72A 1K3YA 1F3BA 3GX0A 3GTUB 4HQZA 1B8XA 1XZOA 2HRKB 2VCWA 4ZILA 3DXBA 2CZ2A 2VLUA 2CZ3A 4XHMA 4IQAA 2CV4A 4XRDA 2L6DA 3TDGA 1PQNA 2ON5A 3LXTA 1ZCPA 4CHSA 1TKDB 2IMFA 1MD4A 3DEXA 3KCMA 2F8FA 3GKNA 2VCVA 4USSA 3LFLA 1VF3A 2YWMA 2HRAA 4IW9A 3UJ1A 2VM2A 1K0OA 5JCUA 4I8BA 4IJIA 3ZTLA 2H70A 4KCEA 4F9ZA 1OE8A 2FWHA 4FO5A 1BEDA 5CAXA 4ML1A 3KTLA 5LNKe 3P8WA 2C3QA 2PERA 4PXOA 2YZHA 5L71A 3GL5A 1SENA 3WGDA 1E6BA 1YJ6A 1MEKA 4GQFA 4POKA 2C0EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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