6GSUA

First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu glutathione transferase
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWNVRGLAHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCYNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu gluthathione transferase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Rattus rattus
molecule keywords MU CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE OF ISOENZYME 3-3
total genus 76
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1996-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 6gsuA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 6gsuA01
1EWXA 2GQKA 3RAZA 1Y6EA 3LWAA 1GWCA 5HR0A 4TR3A 4BWSA 2P5RA 1ERUA 4V2LA 8GSSA 1G7EA 1SJZA 3DWVA 2HRFA 1KEBA 3FR3A 3ZREA 4MF6A 3GIXA 4BVYA 2E0QA 2IFQA 2MMAA 1M9AA 4MLYA 3CBUA 4ZB6A 4K8MA 3KMOA 1Z7PA 3DVWA 3ERGA 1N2AA 1Z9HA 1JHBA 2VCWA 5D9XA 3OR5A 2C0DA 1GTUA 2O89A 3UMAA 1PRXA 3F8UA 3LORA 2VL2C 3GHAA 3RPNA 2V32A 19GSA 2HSMA 2WFCA 1BYEA 1TP9A 2MBTA 1J9BA 3F4RA 3GL3A 4PGTA 2HYXA 4X43A 2H01A 1HNBA 1F6MC 1HNAA 2JZTA 4HOJA 4WKWA 3QFAC 4MCUA 2H0IA 2PUKC 4YAPA 5IPGA 3HDCA 3LFLA 2GZZA 2FWEA 2YPMA 1O81A 4LLRA 4Q5NA 2LUSA 4GQCA 1SD9A 4ZXGA 2VIMA 2GT5A 2WDUA 4BVXA 2L57A 3HYPA 2WCIA 2DJ2A 4K0GA 3ISOA 4MZBA 5IMFA 2KP1A 3L9SA 3SBCA 3H4KA 3WD6A 2VAFA 1OKDA 1R5AA 3CMIA 5B8AA 4BPYA 1X0RA 3I6AA 1T00A 4IW9A 2N5AA 3FRCA 4BWQA 2DJKA 3M0FA 5B6MA 5D93A 4EXJA 3DIEA 2O7KA 2FWHA 5C04A 2PBJA 1A8YA 1V40A 2YWOA 5LD0A 1B9XC 3APQA 3GSSA 4MPFA 2G2QA 1K3LA 3US3A 1BQ7A 2B7JA 5D9TA 2AHEA 3TDGA 1OC3A 5ECNB 5JCGA 1K0AA 5ECPB 3KEBA 4N10A 3L9UA 1YEPA 1FOVA 1OYJA 1CQHA 2CX3A 1PN9A 4NPBA 3C1RA 4FYUA 4ACSA 2M72A 5J9CA 2RUEA 1ON4A 4XIHA 1X9SB 1BEDA 5D96A 2DSAA 3QAWA 4KX4A 3IBHA 4JE1A 4CW9A 3FZ5A 2ALBA 2XPDA 1UC7A 2EIOA 2AUVA 5ELAA 4L0WA 1BX9A 4IGJA 2YANA 2OKAA 2YCDA 3H79A 1QGVA 2ON7A 1GH2A 4IP1A 1FB0A 4PNFA 3MDKA 1EP8A 1WRYA 3KH9A 1NW2A 2IJYA 3F9UA 3GV1A 1TJDA 4YH2A 1FVJA 2GZPA 1A2MA 3CTFA 4G0LA 4XS4B 2NPBA 3VWUA 5ECMB 4HJ2A 3WT2A 4BVYB 2WULA 1SL1B 4JBBA 2IFQB 5EL8A 1Z6NA 1BG5A 3C8EA 4IJIA 5H5QA 4NHZA 3M3MA 4F9ZA 3DMLA 3HVSA 5FWGA 1M7TA 2H73A 2F8AA 2KUCA 2VD1A 2MYGA 2L5LA 3LYPA 1MEKA 1JLWA 2LRCA 5GZZB 4EDYA 2HRAA 2VLVA 3NIVA 3UIWA 3RBTA 3FEUA 4MMMA 3ZRDA 3CSJA 1SKSB 2X8GA 3LQ7A 1GSQA 2IMKA 1THOA 5ECOB 4GSSA 5CREA 4MA9A 1K0CA 3FZ9A 10GSA 1XW6A 2B1LA 1EGRA 3I69A 3C71A 5ENUA 1TI1A 3QAGA 3HJOA 5ECLB 1K0BA 1NHOA 3HHVA 4O5RA 1ERWA 3D21A 2J9HA 4FYBA 4EDZA 4J2FA 1T4YA 3KM6A 1R4WA 1XBSA 3TJBA 1YZXA 1AW9A 2GSTA 1A0FA 2OE1A 1VGLA 1WIKA 1M2BA 4EE0A 1EZKA 5IQYA 2CAIA 3E3EA 1GNWA 1ERVA 4WETA 3CTGA 1YJ6A 4V2MA 1NSWA 1DSBA 2DJ3A 4MJAA 4RQRA 1Z5YE 4YQUA 4AF2A 3ZZXA 4WR4A 2CQ9A 2L4CA 4POLA 2CX4A 3F4SA 3CRTA 1DE2A 3NZNA 3W8JA 5A4WA 3MWHA 3VPTA 4ILFA 3ZIVA 2QC7A 3HZ8A 4G0IA 1TRSA 5AGYA 3KTBA 1X5DA 2C8UA 2AAWA 4FO5A 1JZRA 3TRXA 4KDYA 4F0BA 2BTOT 4Q5QA 4K0NA 4EKZA 2HLSA 2FUG2 2F3MA 1VRSD 1LU4A 4CDOA 3TKSA 2H8LA 2O8VB 3TKRA 2QSIA 4GTUA 1RW1A 1GL8A 2L5OA 1M9BA 4FIWA 3BD2A 5G30A 2VOCA 2I4AA 3GH6A 5J4UA 3TKQA 4ML1A 4DSSB 3Q18A 3H1NA 2BJXA 1O8WA 4DSQA 1ZYQB 5CRHA 3ZLPA 3G9BA 1ERTA 1VF2A 5GSSA 2CVDA 2LNTA 4KCAA 4WR5A 1DE1A 1WOUA 1FHEA 2ZCTA 5H5SA 3TGZA 1TXXA 1A23A 1F9MA 3QCPA 2V2GA 5IMVA 2GVPA 2YNXA 5CAXA 4RI7A 3KP8A 4MZWA 5FHIA 1TW9A 3TKPA 3U5RE 3L78A 4OO4A 1JZOA 2H70A 2RM6A 4YQVA 3I43A 3FK8A 1QK8A 4I6XA 4ZL8A 2HI7A 2I9HA 1YEXA 2B3SA 3EURA 3TOUA 4HUAA 3GKNA 12GSA 2FY6A 3G7IA 3GX8A 4ZL7A 2DLXA 2BMXA 4GLTA 1XVQA 1MDJA 3F6DA 3QR6A 2HRKB 2IMEA 3KGKA 1H75A 2J23A 5H5RA 2VLTA 4KW6A 4O92A 3EINA 4PUFC 3UBKA 1SK2A 5IO0A 2IWTA 2PVQA 3GKXA 3VI7A 14GSA 4L0UA 1X5CA 4OO5A 22GSA 2OJLA 2RUFA 1USBA 4HEA2 1AUCA 2RIIA 7GSSA 2OACA 2R2JA 5BMUA 1R7HA 2P5QA 4NV5A 1BAYA 5GAND 3F3QA 4JU5A 3JCML 6GSVA 3HJPA 3FYGA 4PXOA 2B5YA 3VWWA 6GSXA 2CVBA 5AIVA 4V1Ag 1O8XA 3KIJA 4TVEA 1H4OA 1JZWA 4IVFA 1GTIA 2I1UA 4XS4A 5B6NA 4POMA 2H0GA 3DKSA 5EY6A 5JWRB 1QMVA 1DUGA 3EMPA 4K7OA 5B8BA 2LNSA 2HNLA 4JZQA 1TRWA 2X8CA 4OCEA 2R5GA 2R37A 2LTKA 4AJ6A 2ON5A 4KA0A 4G2EA 5COHA 2FGXA 3KH7A 5G5EA 3VLNA 3UARA 2HFDA 1K3OA 2O85A 4GRFA 1J08A 2H71A 3QDNA 3RHBA 4XCSA 4EC0A 3TRQA 3WGDA 2WRTA 2C3NA 5DAKA 2YP6A 3F3RA 1V58A 1TK0B 4GSTA 3FZAA 2K8SA 2C0FA 3D4MA 5IMCA 2YJ7A 4MPGA 5GSTA 4LA1A 2LKUA 1XWBA 1GSFA 2VM1A 2FA8A 3TJKA 2N5FA 5IMAA 4O7HA 1EV9A 3GMFA 1FB6A 4N0ZA 1GSEA 2I81A 4QL7A 1GRXA 1XWAA 2FHEA 2JSYA 1ZGNA 2GZYA 3QAVA 5E59A 5A5KA 2VCXA 2DJ0A 2B5XA 3CSIA 2FLSA 4HU7A 1V98A 4ZIJA 2GQLA 2DIYA 1HYUA 3HXSA 3ME7A 1T7PB 1TK5B 2WB9A 1T8EB 4G19A 2R4VA 4HDEA 3F0IA 3J7Yb 4L8EA 2K18A 2YOIA 3LSZA 1YKCA 1RQMA 4XRDA 4G9HA 4G10A 3HKRA 3TJJA 2WJUA 3Q6OA 1Z3EA 3TKSC 3KTLA 3F6FA 5CP1A 1FG4A 2K9FA 2I3YA 1XOBA 2YWNA 3FW2A 4WF5A 4PTSA 2GS3A 3ME8A 1PSQA 2NVLA 1GSSA 2DJ1A 3GA4A 3N9JA 1FW1A 2FWGA 2CA8A 5E4WA 2VCTA 3KP9A 3BCKA 3F63A 4KGIA 2CV4A 3HA9A 1O7UA 3LXZA 3PH9A 4GWRA 1PKWA 4KE3A 1TK8B 4PNGA 3TUEA 2HRNA 4K2DA 2LJKA 1OC8A 5F07A 4TR0A 5ID2B 6GSTA 1YF0A 2GSQA 4OFTA 2L6CA 3GNJA 4LMWA 5G2ZA 3IRAA 2H0HA 2JL4A 1GULA 3GKMA 3D0ZA 3UAPA 4DSSA 5HFKA 3DEXA 3F4TA 2CVKA 2AV4A 1SKRB 2H75A 2IN3A 3PPUA 1I9DA 3ZYWA 4ULXA 1TI3A 2DBCA 5AIXA 3ZVJD 4ISDA 2PGTA 3UJ1A 1G6WA 2GSSA 4GQFA 3VI5A 5HFIA 1XOAA 2LQQA 1T4ZA 4TKYA 1GSUA 4ZILA 2LV3A 2ZUPA 1TRVA 4TR4A 1V2AA 4Z7XA 3GSTA 1OVNA 4FH8A 1KNGA 1XW9A 4ZBDA 3FZ4A 4YAVA 4TXOA 1N8JA 4EF0A 5F0GA 1PD21 3DD3A 1VF1A 4F82A 5DAKB 2HZFA 1T3BA 4MJEA 3V1WA 1WE0A 2HRKA 2AB6A 1SKWB 2GGTA 1F2EA 5IO2A 3ERFA 1RK4A 2A2SA 3Q19A 4OWYA 3HVVA 4KCEA 1EP7A 2E2GA 3E9JB 4K1FA 3ZVJA 1V57A 5IM9A 1OE8A 1X9MB 4ZBAA 3TKSE 5JCUA 1O6JA 18GSA 2X99A 2VCVA 4XRAA 1SU9A 2DC5A 2E7PA 2MBSA 4KSMA 2IIYA 2VD0A 2QKEA 4NMUA 1TU7A 2JACA 5ECKB 2LJAA 4KH7A 1Z7RA 1JZDA 5J5NA 4JR4A 9GSSA 4IBPA 3K8NA 3IR4A 1URMA 1U87A 2VL2A 3RPPA 2C0GA 2LRTA 3Q74A 4E8HA 1T1VA 2KOKA 1SENA 3IC4A 4IELA 2H74A 2GQMA 2K6VA 4XS1A 1QXHA 1U3IA 4GXZA 4HQSA 4MF7A 4KF9A 1B48A 4POBA 3O3TA 5DDLA 5ECRB 1DBYA 4K9ZA 3IHQA 2LRNA 1BJXA 5G1LA 4X0XA 1EGOA 4MH3A 3LEFA 5J41A 2XPEA 2GTUA 2PN8A 3ZTLA 3IDVA 1VF4A 4MJCA 5AN1A 5HQPA 3D4TA 3IE3A 4PQIA 3HD5A 4IJ3A 3S9FA 1JFUA 5D9VA 4BL7A 1EEJA 3VFIA 3LXTA 2A4VA 4DEJA 2B7KA 1MD4A 4RQXA 3KZQA 4TW5A 1PL2A 3HCZA 3LJRA 4K7IA 4HJMA 4IKHA 2XBIA 3RHCA 4LMVA 3BOAA 2M46A 2FNOA 1A2JA 2C3QA 3BCIA 1GLPA 1ABAA 5KN0A 2DMMA 4D73B 3C1SA 1KTEA 1W89A 2OBKA 4J57E 2VL9A 3LYKA 5IPHA 1LBKA 3FKFA 2YN1A 2F9SA 2MZCA 1U88A 1B8XA 3UVTA 3GL5A 1AIUA 1I5GA 5A4UA 1ZCPA 3M9JA 1PX7A 2EIQA 4K7NA 2F8FA 3IAS2 2GDRA 3UVHA 5G31A 5ECSA 4JEDA 1A2LA 4KB3A 4L5LA 4TXOB 3APSA 1PA3A 4ECIA 2QGVA 5IOWA 1AQVA 1ZYEA 4MH2A 3KJYA 1R5PA 1TU8A 5ID2A 1B4QA 4G0KA 4NAXA 3WYWA 1MDKA 5KN1A 1ZL9A 3DVXA 3FHKA 1SL2B 1TOFA 16GSA 5DQYA 4MJBA 1V9WA 4HQZA 4OCFA 2HSYA 3UEMA 4EVMA 2DIZA 4F2IA 3IA1A 3M8NA 3PINA 5CYYA 4KDUA 3QFBC 1PMTA 1A24A 3ERWA 3KXOA 1IYHA 1SYXA 1OC9B 3WGXA 2HXKA 2PERA 2HZEB 3EYTA 2H1DA 1YF1A 1F37A 2LEGA 1AQXA 3KD0A 4EL1A 4HS1A 3EU3A 5IOXA 2X8HA 3GKKA 4LL1B 3GTUB 3EU4A 1PQNA 1YKAA 4KDXA 1XZOA 5ABRA 4GSNA 4OFNA 2H1AA 2VL3A 2H6XA 1SK0A 4I5QA 3QOUA 1PL1A 1O73A 6GSYA 2CZ2A 1ZZYA 3APOA 3BJ5A 5IMDA 1F3AA 5EPFA 3A2VA 4ML6A 2V1MA 3GRXA 5KN2A 1C72A 3TJGA 1EV4A 5D73A 5FT3A 5DJMA 1WJKA 2F51A 3TJFA 4HU9A 3HVXA 2CT6A 2EC4A 2L59A 4TR1B 1ML6A 3H93A 4LL4B 1G6YA 3R3EA 2OE3A 3NOFA 4MDCA 3VWVA 3QMXA 3VPQA 2B5EA 4FQUA 1EOHA 3GFKA 4PX1A 1X5EA 3N5OA 1MDIA 2JU5A 4BL7B 2PU9C 2MMZA 3H8QA 1M2DA 2OADA 2H66A 3GH9A 5DCGA 2G0FA 2E2MA 5CO3A 2XHFA 3LGCA 4MZCA 3L4NA 1S3CA 3GX0A 2MMOA 4NV2A 4WBJA 1SK1A 5LNKe 1QFNA 6GSUA 5J9BA 4MABA 1U6TA 2HQTA 4DVCA 4IHUA 17GSA 4KUNA 1A0RP 4I2TA 1UN2A 2O87A 5LCZA 1O85A 5CRGA 1S3DA 1YY7A 1FAAA 1GNEA 2WS2A 3BBYA 1E2YA 2YWMA 5GAPD 2YV9A 2FD3A 2TRXA 2CZ3A 3QD9A 4ECBA 2DMLA 2AJQB 1Q4JA 3CSHA 1J0FA 1HQOA 3CYNA 2YZUA 3DRNA 1XVWA 3A5WA 3G7YA 1U3AA 4V1Ap 1GSDA 2H1GA 2FA4A 3IV4A 3KMNA 5HR3A 4DSRA 2MMNA 4K6XA 5IIZA 1EOGA 1K3YA 2NDOA 5DVBA 3P8WA 3UOMA 5KN3A 1SD8A 3W6GA 2IMDA 1YQ1A 4BA7A 2LSTA 4N0VA 3HZ4A 2C3TA 4OFMA 4FYCA 1PX6A 4IQAA 3E0UA 5G1KA 1MD3A 1VF3A 3CRUA 1YDKA 3UBLA 2PMTA 5F06A 4I8BA 3EE2A 5D8IA 2V6OA 4ID0A 3PR8A 3GURA 5AISA 2PPTA 1OKTA 1K0NA 5DQSA 1TKDB 4AGSA 3ZFBA 3FR6A 3FY7A 2XC2A 3TRPA 2C80A 3VURA 1XXUA 3O76A 2H6ZA 1M0UA 2NTOA 2OE0A 3EMXA 3GUSA 5ECQB 4ZBBA 3RDWA 1ZMAA 13GSA 3L0HA 2IMIA 4H86A 2PWJA 2OBIA 4IN0A 3O6TA 5DALB 3ZL5A 1Z6MA 4D73A 2JZSA 4AJ7A 2AYTA 3ZIJA 3M9KA 1GSYA 1UA5A 5DCHA 4Q5FA 3AY8A 2TRCP 4PQHA 3GYKA 5INYA 4KSOA 4ECJA 3TOTA 3L9VA 1XWKA 2B1KA 3MNGA 1ST9A 1EEMA 5JCWA 2H19A 3D22A 1ILOA 2HT9A 5C00A 5HR1A 3FR9A 1SL0B 3SWLA 3A2XA 6GSSA 1QQ2A 3QPMA 2P31A 1G0TA 4X1UA 2REMA 5A4VA 1OE7A 2KHPA 5IMZA 2P0GA 4MF5A 1TRUA 1M99A 3P7XA 4PUAA 4PURA 1B9YC 1K0OA 2VUPA 3IK9A 1FVKA 1WMJA 4P3YB 5KEJA 2FCHA 2RM5A 4JR6A 3P2AA 2HSMB 2GSRA 1W4VA 3KCMA 4ZB8A 3W8SA 4XS6A 1JLVA 5F05A 2IPAA 5J3RA 2H6YA 2DJJA 2X64A 2LQOA 4MP4A 4NXIA 3CXGA 2PVOC 3DGQA 3HJMA 1OC9A 2EIRA 4F0CA 2HZEA 5L71A 1LJRA 3A3TA 2A2RA 1R26A 1XWCA 1GUHA 5CRDA 1GUMA 2WGRA 3IAM2 4I2UA 3VK9A 2LS5A 2IL3A 2D2ZA 4O32A 1GP1A 2KLXA 4WF4A 4XTSA 3GTUA 4BVXB 2UZ8A 2H76A 2YV7A 3DYRA 5F8BA 2TIRA 3ZITA 2VCQA 2RLIA 1B4PA 2HSHA 2B6MA 3C73A 2JZRA 1OAZA 3EC3A 5HFGA 1SJ6A 5JWQB 1XWGA 4POKA 3I9V2 5HR2A 2IMFA 2JSZA 3MSZA 4QL9A 4ECCA 2VLUA 5DJLA 2H1BA 1AQWA 3EWLA 5DBQA 1AC1A 5B7CA 4TR1A 3IC8A 4OD7A 2R6KA 2HE3A 4WXTA 4ZL9A 3TB2A 1PKZA 1TTZA 2VM2A 4L5OA 2JADA 1MTCA 6GSWA 4YQMA 1K0MA 5CNWA 1TDIA 1XPVA 1NM3A 1QUWA 4NWYA 3IPZA 3MAKA 1IYIA 4N11A 2H30A 2NBSA 2FWFA 1XFLA 1THXA 4PQ1A 4OMVA 3G7JA 2GT6A 1AXDA 2HSNB 4EUYA 2YZHA 4RI6A 1ACVA 4KAEA 2LJRA 1SJIA 4N30A 1XCCA 3EVIA 3UL3A 4AJ8A 3D5JA 1CQGA 4GF0A 5CRWA 1GUKA 5ECHB 5D9WA 2L6DA 2ES7A 1K0DA 5JWOB 1GTAA 2VO4A 4TRXA 3WT1A 1X9WB 2C4JA 2YWIA 3HY2A 2CAQA 2L4QA 3IK7A 4RUVA 3PGTA 2K8VA 4EO3A 2V6KA 2V41A 4XHMA 4F03A 2H72A 1Q98A 4E8EA 4TN8A 4HI7A 2C1YA 2WZ9A 1FO5A 3GN3A 4HZ4A 2M80A 4IS0A 1G7OA 3ZMKA 3ZMLA 1ZOFA 1XW5A 3WGEA 4V2NA 1AAZA 2Z9SA 3A2WA 4I97A 2ZNMA 3M1GA 5G5FA 1WPIA 4J56E 1GTBA 1F3BA 3ED3A 5ELGA 4USSA 2KP2A 1A8LA 1NHYA 4MK3A 5ECIB 1PGTA 4HZ2A 2YJHA 4CHSA 1E6BA 4Q5RA 3ZFLA 1Y25A 3R2QA 2OA7A 3TCOA 1KBNA 1S3AA 4ZB9A 1SYRA 3LG6A 2R3XA 4IQ1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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