6GSXA

First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu glutathione transferase
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGFWNVRGLTHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCYNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu gluthathione transferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MU CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE OF ISOENZYME 3-3
molecule tags Transferase
source organism Rattus rattus
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1996-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 6gsxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 6gsxA01
3CBUA 4ECJA 2O89A 5DAKA 1OKDA 11GSA 3FKFA 3BOAA 4V2NA 2YP6A 2LRNA 1QQ2A 2DJ0A 2C0FA 1E6BA 3FR3A 2VCWA 3G7IA 2E0QA 3MNGA 4IQ1A 1ML6A 2VL3A 4HS1A 4POLA 4XS4B 1HD2A 4X43A 2NTOA 4O92A 1TTZA 2FA8A 3UIWA 3EE2A 4IN0A 2H6YA 4DVCA 1GNWA 3WGEA 2RM5A 3LORA 5DALA 1ZZYA 2LV3A 1AQWA 1FW1A 1Z6NA 1GLPA 2WGRA 2FWEA 4XRAA 4RQXA 3ZYWA 2FWFA 3E9JB 3HY2A 2AYTA 2CVDA 1GSDA 2RIIA 1GUHA 5E59A 4O5RA 5IMCA 1B4PA 4TXVA 3FHKA 2VUPA 4FYCA 1WIKA 3PH9A 2LTKA 2NDOA 3GFKA 2GS3A 4J2FA 1ON4A 1T4ZA 2LNSA 2IMEA 3IDVA 1S3DA 1AQXA 2YV7A 3LJRA 2QSIA 4ML6A 5A4WA 2V6OA 2PWJA 1ZCPA 4OO5A 5J9CA 3RAZA 1GSSA 1A2MA 2KP1A 3APOA 4D73A 4G19A 5JWOB 1RK4A 1G6WA 1UC7A 2CZ3A 4MLYA 2GQMA 3ZMKA 1YEXA 1TI1A 1GULA 5DJLA 2HZEA 2XHFA 2MYGA 1B4QA 2WRTA 3L9VA 1B8XA 1UVZA 1SK1A 4ULXA 4EUYA 2VCXA 1K0MA 4EDZA 4TXOA 4FQUA 1ZOFA 2EC4A 2GQLA 4YAPA 1OC3A 3ZLPA 3IC4A 2YZHA 1VGLA 4V1Ag 3C1SA 4IS0A 1U87A 2OBIA 4ZIJA 2MBTA 1T00A 1FO5A 2YV9A 5G5EA 3D5JA 3TRXA 2DIZA 3GL3A 4IW9A 4ZBAA 5IQYA 3DGQA 1THXA 2H0HA 4USSA 5G1KA 3KH9A 3GA4A 4IGJA 4IP6A 2MBSA 4QL7A 1X5EA 1TW9A 3MWHA 10GSA 2V2GA 2L4CA 1G7OA 1EZKA 3Q74A 4JRRA 4WF5A 2AUVA 5HR2A 3KGKA 5CNWA 1TK5B 4EC0A 2H0IA 2VL9A 3G9BA 2DBCA 4F9ZA 4I97A 3DYRA 5H5QA 1V57A 2K8SA 1TP9A 5ID2A 1SL0B 2HSYA 2MMOA 3LXTA 2PVOC 3CYNA 3O3TA 5ELAA 2FHEA 3JCML 3I69A 3ME8A 4NHWA 4NAXA 2H1AA 2YJ7A 4Q5FA 6GSWA 5CYYA 2L59A 4MF6A 4TRXA 5F8BA 3GKNA 1QXHA 2AB6A 3V1WA 1WPIA 5F06A 5JCGA 2AJQB 3F63A 1Z6MA 1GSEA 2HRNA 2FCHA 2IN3A 3WT1A 5IO2A 5D8IA 1JLWA 4FYUA 1EP7A 4FYBA 3ZREA 4XIHA 2YZUA 4GF0A 4ZB9A 4NHZA 5ELGA 4I2UA 4O32A 4PGTA 3US3A 5A5KA 1GLQA 3FZ5A 2OA7A 4HUAA 4N11A 1A8LA 5ECKB 3LFLA 3GTUB 1V9WA 4F03A 3FRCA 1H4OA 2GGTA 2H19A 3TDGA 5CO3A 4GSSA 2EIOA 3APSA 4RUVA 4ZB6A 1IYHA 3SWLA 5COHA 3PR8A 3D0ZA 2FNOA 2LNTA 2DMMA 1YF0A 3ZFBA 3M1GA 4ZL7A 2PVQA 1B48A 2H74A 2GSQA 2C8UA 3MSZA 1U88A 1JFUA 3IBHA 2C0GA 2O8VB 4WR5A 2DMLA 1SK2A 2HRKB 4I5QA 2ON5A 1T4YA 2GTUA 9GSSA 3L9SA 4K8MA 3APQA 2B5EA 1ZL9A 4HJ2A 1T7PB 1K0DA 4MJEA 4KNDA 4XHMA 4F0BA 3BD2A 1XXUA 2P31A 7GSSA 4KB3A 2H71A 3LYKA 3UOMA 4KAEA 5CAXA 4BVYA 2PU9C 1ERWA 1FOVA 3HDCA 5HR0A 4QL9A 2XC2A 2VD0A 4PTSA 4LA1A 5J41A 4G0LA 2L5LA 2IWTA 4TR1A 4EKZA 3EMPA 2E7PA 4AJ6A 2BJXA 1M9AA 3FZ9A 2PMTA 2YPMA 3IPZA 2LKUA 2WJUA 1ZGNA 3GN3A 3TKRA 1EWXA 4PUFC 1U3IA 2IMDA 5F07A 3VI7A 4YAVA 2H73A 4OFTA 1H75A 3EINA 5ECIB 1LBKA 4DSSB 1GNEA 2DJ2A 2CV4A 4YQUA 2YANA 3CRUA 4MK3A 3TB2A 2VL2A 3J7Yb 2FWHA 1VF2A 2OACA 3F6FA 5IOWA 2LQQA 1GWCA 2HE3A 2I1UA 4GXZA 4LLRA 2H8LA 1M2DA 4IELA 5JWRB 3C1RA 2H6ZA 3KTLA 1XW9A 4KW6A 3W6GA 3EU4A 2L4QA 5AN1A 3A3TA 4E8EA 3F3RA 4ECIA 4WF4A 2HSNB 5GAPD 3BJ5A 3BCIA 5IPHA 2CX3A 2C4JA 4L5LA 3ZZXA 2HT9A 1XIYA 4TN8A 3H4KA 2DJ3A 1KEBA 1O85A 4JR4A 4CHSA 1XOBA 1PN9A 3HXSA 1SD8A 1SYRA 5LNKe 3IC8A 5ECLB 3P7XA 4G0IA 4ZILA 5JCWA 4AF2A 4EE0A 2DJKA 3H79A 3CRTA 1OC8A 4K2DA 1F37A 3GKXA 4OCEA 1Y6EA 4L5OA 4L0WA 3IA1A 3TOTA 1QK8A 1K3OA 1AXDA 3FZAA 2LJRA 3GHAA 2BTOT 5IIZA 2D2ZA 1GP1A 4MA9A 4AGSA 5DBQA 1M0UA 3LWAA 4IHUA 3QCPA 1OYJA 3WYWA 1HNAA 4PXOA 2B5YA 1AW9A 3ZIJA 3A2XA 5AIVA 4BVXA 4NPBA 2VM2A 1XCCA 1F9MA 1URMA 5CRWA 4KCAA 2LRTA 1PKWA 4MJBA 3Q19A 4YH2A 1THOA 4JEDA 2CAIA 1YKCA 1J08A 3TKSA 3VLNA 3TJFA 4WETA 4K6XA 4AJ8A 4PURA 2AAWA 1Y25A 2A4VA 1V98A 5B6NA 1UN2A 5IO0A 3ERGA 2CX4A 1PX7A 2OJLA 1Q4JA 3GKKA 4MPGA 1T8EB 3A2VA 3F8UA 4TW5A 4V2LA 4KX4A 2NPBA 6GSUA 2KLXA 3GKMA 1TOFA 1PKZA 1K0CA 3TKQA 2HLSA 4NMUA 2DJJA 2GQKA 1GUMA 4K0GA 4HQZA 2VM1A 5G1LA 5DDLA 2YCDA 14GSA 5KN2A 1Z5YE 1PX6A 2K9FA 4NV2A 5ECQB 3FW2A 4MCUA 3F4SA 2IL3A 2MZCA 3ERWA 1LJRA 1FG4A 3I9V2 1W89A 5FHIA 18GSA 1TRSA 1GSQA 5BMUA 2PUKC 2OE0A 2R3XA 5D9XA 3HVVA 2XPEA 2H1DA 5DCHA 3DRNA 2PPTA 2WB9A 1M9BA 3D6IA 2A2SA 2YWIA 5DQYA 3M9KA 4MABA 3OR5A 2ON7A 17GSA 2WDUA 3D21A 3EU3A 4LL1B 3GH9A 2X99A 1OE7A 3F3QA 3ZMLA 3RPNA 1A23A 3ZTLA 1WMJA 2K6VA 5D96A 13GSA 2YWNA 4NV5A 5EY6A 3GH6A 3UBLA 3EC3A 2CA8A 1X9MB 2GZYA 6GSSA 3HVXA 1VF1A 3G7YA 4XRDA 2RUFA 1ZMAA 2VLUA 1ERUA 1M7TA 4ID0A 5IMAA 2B6MA 1BJXA 4ZXGA 1KBNA 4TR4A 5ECSA 1AAZA 4Q5QA 5KEJA 3EYTA 1EV9A 1PD21 2OBKA 2GSRA 3IV4A 5IMFA 1XW6A 1FVJA 3FEUA 3DIEA 2HFDA 1N2AA 2FY6A 2NVLA 5B8BA 3F9UA 3VWUA 2K18A 1KNGA 1F2EA 2H1BA 4MH2A 3W8SA 1SJIA 3KM6A 3RBTA 1YEPA 1PGTA 3EMXA 3HD5A 4MZWA 4I2TA 4MZCA 4ZBBA 3ZRDA 3GNJA 1NSWA 3TJJA 4Z7XA 1Z9HA 1J0FA 4JU5A 4ECBA 1O81A 3KP8A 3M8NA 4ZL9A 4NWYA 3VWWA 2R37A 3GV1A 4ZBDA 1XPVA 3TJKA 4YQVA 5JCUA 4MF7A 3M0FA 2I9HA 3TRPA 4YQMA 3VI5A 1K0BA 4EO3A 2QGVA 3CTGA 2AV4A 1SKWB 4GLTA 1YJ6A 5IM9A 3GURA 5CP1A 4MF5A 4KDYA 1X9WB 4D73B 4IP1A 1A2LA 3QMXA 1ZYQB 2DIYA 2WFCA 3C8EA 2OE1A 4L0UA 3MDKA 1WP0A 3KXOA 4KGIA 2VCVA 3ZVJD 2NBSA 3NZNA 2R2JA 4CDOA 3CSIA 3M9JA 4AJ7A 3QFAC 4TR0A 1HNCA 2HSMB 5G31A 2ZCTA 2HNLA 1QMVA 4LL4B 3D4MA 4N0VA 2C0EA 5CRDA 1K0AA 3ZVJA 4PQ1A 3P90A 2LEGA 6GSVA 2RLIA 1DE2A 4ZB8A 2CAQA 2WULA 3KD0A 3WT2A 5JWQB 2CVKA 2FUG2 1SJ6A 4KH7A 3C7MA 3C71A 4BL7B 2A2RA 5B6MA 3IR4A 4V2MA 3ZL5A 4XCSA 4MH3A 1TI3A 4FO5A 3N9JA 3TCOA 1BG5A 2L6CA 4OFMA 5GSSA 2IMKA 1RQMA 2HYXA 5ID2B 1FVKA 3QAWA 1WE0A 1XFLA 4HZ2A 1TK8B 4POKA 4GQCA 2YNXA 1R7HA 3TUEA 2BMXA 5HFIA 4GRFA 3VK9A 1J9BA 1PSQA 2VCTA 4DSSA 4PUAA 3AY8A 1E2YA 3DVXA 3UMAA 1X9SB 1NW2A 1A0RP 3CXGA 3PINA 1USBA 2H66A 3GRXA 2L6DA 1XWBA 1MD4A 2B1LA 3UBKA 1JZDA 2F9SA 1XZOA 20GSA 3RHCA 3UJ1A 4GSTA 2Z9SA 3E0UA 1ABAA 1HQOA 4HU9A 5E4WA 2R4VA 16GSA 1MEKA 5D93A 4K9ZA 4IJIA 2IFQA 2X8HA 2CT6A 1YDKA 3KTBA 3IHQA 4ILFA 2OE3A 1YQ1A 2VL2C 4Q5NA 3LXZA 3VPTA 4PNFA 3DMLA 4PQHA 3KP9A 5IOXA 4L8EA 3UVHA 1MD3A 1MDJA 1ST9A 2XPDA 4EL1A 3R2QA 4HU7A 3GSSA 3K8NA 2FA4A 4JR6A 1GTUA 1AUCA 1XBSA 3HZ4A 3HYPA 4BPYA 2GVPA 5AGYA 2FGXA 6GSYA 3E3EA 3EVIA 2PGTA 4N0ZA 3L0HA 4P3YB 4OO4A 4PNGA 1ERVA 4KSMA 2JACA 1GTBA 3C73A 4HQSA 4OD7A 4WKWA 5J9BA 3I43A 3DXBA 3UVTA 3KEBA 5KN3A 3L78A 4G2EA 6GSXA 2KHPA 1M2AA 2IMFA 2GT6A 1AC1A 1OC9B 2HQTA 5IPGA 1X0RA 3A5WA 5ECNB 2MMAA 2OKAA 3FR6A 1Q98A 1XVWA 1OVNA 5C00A 1NM3A 4LMVA 2IIYA 2VCQA 3HKRA 1R5PA 4WBRD 2L5OA 1G7EA 1GUKA 2KUCA 1NHYA 4JZQA 1TKDB 1Z7RA 4ZL8A 2I4AA 2JZRA 5HQPA 3LG6A 2WS2A 4MJAA 3BBYA 2O85A 4TOPA 5D9VA 4GTUA 3KCMA 3U5RE 3UL3A 3ERFA 1K3YA 1XOAA 1PRXA 5HR3A 2H0GA 3I6AA 2H6XA 2G2QA 5IMVA 1M99A 4IVFA 3EURA 2GDRA 1VF4A 4GQFA 4J57E 3TGZA 4DSRA 1OAZA 3TKSC 3Q18A 1EEMA 1T3BA 3ZIVA 1GSFA 5ECOB 4FH8A 2KP2A 4WEYA 5HFGA 4F2IA 3QAGA 2PERA 2HSHA 5DCGA 1EOGA 1PQNA 1VF3A 3HA9A 3GYKA 3KJYA 4XS4A 1TRVA 3FZ4A 1TRUA 4GCIA 4MPFA 2V32A 2B7KA 3IAM2 2VIMA 5ECMB 5EVOA 3GIXA 5J5NA 1AQVA 1DE1A 3IK7A 2H1GA 3ISOA 3RPPA 4BWSA 3MAKA 4G10A 3LYPA 3IK9A 5J4UA 2L57A 1GTIA 3A2WA 4HEA2 3QAVA 2CVBA 5EPFA 4MP4A 1DSBA 2HXKA 1LU4A 1N8JA 3GX0A 1TU7A 3HJOA 4RQRA 2FWGA 5IMDA 1C72A 1KTEA 2YWMA 4IKHA 1GSYA 3H8QA 1T1VA 1G0TA 1V58A 1UA5A 4K0NA 1A0FA 3QD9A 1O8XA 4HOJA 1XWGA 1BX9A 2PBJA 4BVXB 1F3BA 3GMFA 4MJCA 3UEMA 2GLRA 2GSSA 2M80A 4I8BA 1EP8A 2HRFA 5LCZA 5D9TA 4GWRA 3L4NA 1MDIA 1JZRA 3SBCA 4HI7A 2C80A 4KUNA 2P5QA 3CSHA 2DJ1A 2YN1A 2GZZA 3HJMA 4MMMA 2C3TA 4KF9A 2N5BA 2WZ9A 3GL5A 5B7CA 3KMOA 2YJHA 2JADA 1HNBA 2N5AA 5KN0A 2M72A 4WBJA 2EIQA 2VAFA 1SYXA 2F8FA 4DEJA 3GSTA 4ACSA 5ECRB 3D4TA 5DAKB 3P2AA 3TKPA 1O6JA 1YKAA 3GUSA 5FT3A 2QKEA 4EF0A 3H93A 1ACVA 3FR9A 2G0FA 2B1KA 4XTSA 3GX8A 2RUEA 3HHVA 1EGOA 2R6KA 2MMNA 1QUWA 3VPQA 5ABRA 5AIXA 4F82A 4E8HA 3DEXA 1K0OA 1WRYA 3LGCA 3KMNA 3LEFA 5DALB 1FB0A 4QQ7A 3WGDA 1SK0A 1PL1A 3ZFLA 4MZBA 2ES7A 2JU5A 2OADA 1YZXA 4JBBA 4KDUA 2VD1A 5G2ZA 5CREA 2HSMA 1GSUA 1EV4A 3CMIA 4TKYA 1MTCA 2H01A 5F05A 5DVBA 2ALBA 5G30A 1EGRA 2TRCP 1BAYA 1BYEA 4LMWA 3F0IA 1HYUA 2C3NA 2J23A 1QGVA 3VURA 2MMZA 2DLXA 2PN8A 5HR1A 1RW1A 1F3AA 3GTUA 4X0XA 4BL7A 3KZQA 22GSA 5INYA 2JL4A 6GSTA 1W4VA 1TU8A 4KDXA 1GRXA 3Q6OA 1WOUA 2C3QA 4MDCA 1SJZA 4ECCA 1ZYEA 2HZEB 1V40A 1CQHA 5EL8A 5ENUA 2O87A 19GSA 3QDNA 1PMTA 2B7JA 4TXOB 4KSOA 3TOUA 2RM6A 1V2AA 1IYIA 2JSZA 1X5DA 1PL2A 4RI6A 3L9UA 2HRKA 4WR4A 5FWGA 2WCIA 2IPAA 5AISA 2JSYA 2R5GA 1S3AA 5IMZA 2TIRA 1K3LA 2H72A 5GSTA 3BCKA 2LRCA 2LJAA 3HCZA 3D22A 3TRQA 5G5FA 1A8YA 2ZUPA 2V1MA 3F4RA 5J3RA 3IAS2 2ZNMA 2E2GA 1YF1A 2P0GA 2O7KA 4WXTA 1M2BA 1MDKA 4BA7A 4OFNA 5CRHA 2K8VA 4PQIA 1FB6A 3CTFA 4O7HA 1R5AA 2I81A 1XW5A 1JZWA 3VWXA 1K0NA 1F6MC 3DWVA 2B5XA 4NXIA 1A24A 4G9HA 3DD3A 5H5RA 1A2JA 1FAAA 1SU9A 3N5OA 5CRGA 2YWOA 3KIJA 4KA0A 1EOHA 3ZITA 2H30A 3QOUA 2KOKA 1VRSD 4K7IA 4H86A 3F6DA 2IMIA 1U6TA 1NHOA 2IJYA 1R4WA 3ME7A 1JZOA 4POMA 4KE3A 4FIWA 4V1Ap 1OC9A 2HRAA 1B9XC 3NOFA 3O6TA 3QFBC 4ML1A 1I5GA 2VOCA 4DSQA 2M46A 4IJ3A 2CZ2A 5ECPB 3R3EA 1PA3A 3WD6A 2X64A 5H5SA 1JHBA 4EXJA 2FLSA 3S9FA 3RHBA 2HZFA 2P5RA 4G0KA 2LS5A 4IQAA 4EVMA 3DVWA 3TJBA 4N10A 1QFNA 3O76A 3QPMA 2DC5A 1TJDA 4HJMA 3W8JA 2FD3A 2REMA 2F51A 3IE3A 5DQSA 5HFKA 1OE8A 4OCFA 3LQ7A 1CQGA 4TR3A 4K7OA 2H70A 4K1FA 5ECHB 1SENA 2N5FA 5A4VA 3TKSE 2LUSA 4F0CA 1SKSB 3CSJA 5D9WA 3VWVA 3PGTA 4EDYA 4HZ4A 1AIUA 2LQOA 3IOSA 1SKRB 2XBIA 4TVEA 3U6VA 8GSSA 12GSA 4CW9A 3P8WA 2V41A 5GAND 4PX1A 4OMVA 4BVYB 1TK0B 1XWAA 5KN1A 2GT5A 1G6YA 4GSNA 2VCZA 4KCEA 3EWLA 2F3MA 3TJGA 4POBA 2IFQB 1GL8A 1TRWA 4TR1B 5F0GA 2GZPA 3IXRA 5D73A 3PPUA 2EIRA 2LSTA 1DBYA 1DUGA 3HVSA 1FHEA 2XBQA 1Z3EA 2AHEA 1OKTA 2UZ8A 5DJMA 4I6XA 2DSAA 2X8GA 1Z7PA 1XVQA 4JE1A 3FY7A 3KH7A 1ILOA 5B8AA 1TDIA 2J9HA 2HI7A 1ERTA 3H1NA 2VLTA 1WWJA 3NIVA 4XS1A 3ED3A 2C1YA 2TRXA 4Q5RA 3WGXA 3M3MA 4RI7A 3G7JA 1O8WA 2LJKA 2H76A 2JZSA 4X1UA 4OWYA 1B9YC 2I3YA 3DKSA 1I9DA 1SD9A 5GZZB 3LSZA 4IBPA 1GH2A 4K7NA 4N30A 1WJKA 4ISDA 2GSTA 4BWQA 3VFIA 3J7Yk 3UARA 3UAPA 3RDWA 2V6KA 1O73A 3HZ8A 3HJPA 2B3SA 2E2MA 1TXXA 2JZTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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