6GSVA

First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu glutathione transferase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWNVRGLSHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCYNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords MU CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE OF ISOENZYME 3-3
publication title First-sphere and second-sphere electrostatic effects in the active site of a class mu gluthathione transferase.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus rattus
total genus 82
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1996-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 6gsvA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 6gsvA01
4MMMA 2NDOA 4FYCA 3UJ1A 1KBNA 2JL4A 3RHCA 3C8EA 1B8XA 4KX4A 3ZIJA 2O8VB 4MZCA 4L5OA 4ECBA 4KCAA 3TRPA 3TJJA 1OAZA 4FIWA 3DVWA 3A2VA 1OC3A 4TR1A 2BMXA 4OO4A 1ZYQB 2A2SA 4MF5A 1GWCA 1WP0A 4RQXA 4GLTA 1CQHA 5ECQB 3HZ8A 5A5KA 3EVIA 3TKSA 2O7KA 5AN1A 2V2GA 3F3RA 3GURA 3IE3A 4TKYA 2HZEB 1ACVA 3BOAA 4IP1A 2ON5A 1H4OA 4L0WA 5F06A 4V1Ap 1AQWA 4RI6A 2K9FA 1ZMAA 2K8VA 2KP2A 5H5SA 2MBSA 2FGXA 1YKCA 2XC2A 4KH7A 3ZREA 2OA7A 1XWBA 2PERA 3H4KA 4TXVA 3N9JA 4IQAA 2MMNA 2PVOC 5A4VA 4TXOA 1VF2A 1CQGA 6GSSA 3QOUA 2PMTA 1G6WA 3EMXA 3ZVJD 3KTLA 1HYUA 4XTSA 2LUSA 3GKKA 5ECRB 4DSRA 2JSZA 2FWEA 1WIKA 1R4WA 3FEUA 3P90A 2FWFA 5JCGA 1HNCA 4ZBAA 2VLUA 3APSA 2CVKA 2E0QA 2V1MA 4Z7XA 3FZ5A 4KGIA 5DBQA 2ZCTA 5C00A 1K3OA 4IW9A 3GL5A 1F3BA 1M2DA 3R2QA 3VWVA 4XRDA 2VAFA 2NPBA 4DEJA 4I8BA 1ABAA 3H1NA 3WGXA 4EXJA 3CBUA 1F9MA 4MK3A 3DXBA 1G0TA 3L9SA 3I69A 3APQA 3RBTA 1X5CA 1JLWA 4CDOA 3N5OA 2MMOA 4RI7A 1TXXA 4JU5A 1A23A 5CRDA 2J23A 4TVEA 1AQXA 4NV2A 1ILOA 5G1KA 1XXUA 1EV4A 3DWVA 5ECKB 3O76A 1SJ6A 2LQQA 1VRSD 1V57A 3L0HA 3C71A 3NZNA 4ZIJA 1T00A 4POMA 3PH9A 1JHBA 1K0BA 1WPIA 3KP8A 1K3YA 4IHUA 4OCFA 2TRCP 1N2AA 3K8NA 4OWYA 5ELGA 2GSTA 3HXSA 1SYXA 2H1BA 2KLXA 2HSMA 4KW6A 1B9YC 3G7JA 2JADA 3J7Yb 4V2NA 1AXDA 1YEPA 2EIOA 3QAGA 4I97A 2KUCA 2ZUPA 3GIXA 4G0LA 3ZIVA 5J5NA 4BL7A 2CQ9A 1NSWA 3F9UA 5IM9A 4H86A 5B7CA 2RM5A 4LLRA 5DCHA 4ZILA 2F8AA 3GKNA 1V58A 2H66A 4HEA2 3WT2A 4Q5NA 3IK7A 3GH6A 1TP9A 2AJQB 5J3RA 5B6MA 2OE0A 3D22A 3KCMA 1WMJA 1XFLA 2YN1A 4NXIA 5E4WA 3KIJA 3PGTA 3IOSA 4EKZA 1YY7A 4GWRA 4WBJA 12GSA 1Z9HA 2VLVA 4O32A 2PU9C 3M1GA 3FYGA 2MMZA 1A8LA 1T4ZA 2CV4A 5AIVA 1TTZA 4WETA 4QL9A 2IJYA 3KTBA 3ZITA 2YANA 4CHSA 3ZTLA 2HSHA 1MD4A 2HT9A 1FB0A 2AUVA 2H73A 2FD3A 2LV3A 3O3TA 4BPYA 2FA8A 3BJ5A 2L59A 2WULA 2VIMA 1R26A 1O7UA 3CSHA 4PX1A 2JACA 1R5AA 1F37A 3FZ4A 2E7PA 2H19A 4YH2A 1OC9A 4OO5A 4N11A 2TIRA 2OADA 1GSEA 5IO2A 4TR0A 1PRXA 1OC8A 3GV1A 1A2MA 1A0FA 4N0VA 2B5YA 1A2LA 2H8LA 3DRNA 5KN2A 3EWLA 3UVHA 4J57E 3KD0A 4J2FA 3HJMA 4TOPA 3MWHA 5AIXA 2C80A 5H5RA 3PPUA 4WEYA 3D4MA 3PR8A 3IPZA 2VCTA 5EY6A 3DGQA 4K7OA 1THXA 1PQNA 2REMA 2FLSA 3LWAA 5B8BA 5G2ZA 3QPMA 4BWQA 2H70A 2H75A 4GSNA 4NV5A 2X8GA 2LJAA 2DIYA 3WYWA 2YWIA 3PINA 1PL2A 1USBA 4F0BA 3TJGA 2R5GA 1U3AA 2WZ9A 2D2ZA 2P31A 3RAZA 1GUMA 4EL1A 1IYHA 3W8JA 1IYIA 2GDRA 1B9XC 4E8EA 1JZDA 1S3CA 2L57A 2C3QA 6GSYA 3CSJA 4ISDA 1PKWA 3MNGA 4F9ZA 2IMDA 2VO4A 2YWNA 3A2XA 4MH2A 2C0FA 4JEDA 3U5RE 3GRXA 1B4PA 4ZB8A 3TJFA 3F4TA 2IMKA 4LA1A 2E2MA 1TW9A 2H72A 2VL2C 3IDVA 1R7HA 4KCEA 1E2YA 4X43A 1X5DA 2OBIA 3GTUA 4POKA 2HSYA 2I81A 2OACA 1YDKA 5DAKB 2AHEA 3LYKA 1SJIA 3NIVA 1QGVA 4XS4A 3HJPA 1MEKA 4MABA 3KMOA 4WR4A 2NBSA 3LEFA 5IQYA 1EP8A 2LS5A 4V2LA 5HFGA 5HR2A 5EVOA 1YZXA 3HYPA 2NVLA 1QK8A 5ID2A 2OBKA 3TB2A 4LL4B 1GSFA 4TR1B 4IGJA 2H76A 4JZQA 1OE8A 4JE1A 2N5FA 3W8SA 4HQZA 5F05A 3KH7A 2LQOA 5ECPB 2YCDA 7GSSA 1Z6MA 1Y25A 3GUSA 3VI5A 3M0FA 3OR5A 5G30A 2BTOT 1SU9A 2PVQA 3FK8A 5CRGA 1SK2A 4ILFA 2LSTA 3L78A 3ZFLA 3GL3A 1VF1A 1SK0A 4ZB9A 4MCUA 3P2AA 1B4QA 1GSQA 3TRXA 3F8UA 3IK9A 1M9AA 1FG4A 4K2DA 2FWGA 3VI7A 1SL0B 4YAVA 3EURA 1I9DA 2L6CA 2QSIA 3FZ9A 4TXOB 1BQ7A 5KN1A 4ACSA 4RQRA 2VUPA 3EE2A 4KSMA 5ECOB 2WFCA 1XWAA 3TKSC 4N10A 4IQ1A 1YEXA 3ZYWA 3HZ4A 4PGTA 4TR4A 4QQ7A 2HRKA 3UAPA 1GTUA 2TRXA 1GH2A 3HKRA 3IRAA 1ZL9A 3A2WA 3NOFA 3QAVA 1O8WA 1TDIA 2HSNB 2YOIA 3IA1A 2X8CA 4PNFA 3ERFA 2VM1A 3Q74A 8GSSA 2VL9A 4KAEA 4AJ7A 4XRAA 1T4YA 3D0ZA 5J9BA 1GLQA 3KZQA 2IMIA 1LBKA 2DIZA 1G7OA 2OKAA 1GP1A 4IJIA 2L4CA 4TRXA 4KNDA 2FUG2 5ECMB 1TKDB 1KTEA 3GKXA 2V32A 2IIYA 1OVNA 1NHYA 3UMAA 4MLYA 2LNTA 3C1SA 4I2TA 2MZCA 1ML6A 3HJOA 1X5EA 2FCHA 3IHQA 1LU4A 5GAND 4QL7A 2K8SA 1GTAA 2HRAA 2H1GA 3APOA 5G5FA 2CZ2A 3L9VA 2DMLA 3TKSE 2L5OA 1DBYA 2HXKA 1XVWA 1DUGA 2HYXA 2DJJA 2HSMB 3TRQA 5G5EA 2EC4A 1QQ2A 1VF3A 1ZCPA 2LJRA 4G0KA 3D4TA 4K0NA 4BL7B 3DKSA 18GSA 4FQUA 4MZBA 3ZRDA 2GT5A 3BCIA 13GSA 1E6BA 1PL1A 4MPGA 2M80A 4OFMA 5ELAA 3M9KA 4MH3A 2P5QA 2I3YA 4DSSA 4K9ZA 5CNWA 2B5EA 4PNGA 2L6DA 3CRUA 2WCIA 2DC5A 1X9MB 4X1UA 1V98A 3CYNA 1MD3A 2LNSA 4OD7A 1JZWA 3VPTA 5JWOB 5DDLA 2UZ8A 3KXOA 4FYUA 5DCGA 2EIQA 3IXRA 2H1AA 2Z9SA 2JZTA 2IL3A 3AY8A 5L71A 5HR1A 2PGTA 2PWJA 4BVYA 3O6TA 3RHBA 1OE7A 2CZ3A 4AGSA 3RPNA 4JRRA 4MJCA 4XIHA 3E9JB 4HU7A 2IWTA 4V2MA 3VURA 1Q98A 1FHEA 1ZYEA 2IPAA 2GSQA 4BVXA 10GSA 9GSSA 1TU7A 1EGRA 5G31A 5EL8A 2CT6A 3LSZA 2ON7A 1OKTA 1OC9B 2H1DA 2M72A 4CW9A 2WS2A 3F0IA 1W89A 1GNWA 1X0RA 5IOXA 4ZBBA 4AF2A 3TKRA 3H93A 2HQTA 2VM2A 1HQOA 4LMVA 4XS6A 3HY2A 2VOCA 3WD6A 5D9WA 3F6FA 5LD0A 3W6GA 2DBCA 2CA8A 1M9BA 4V1Ag 3HA9A 4BA7A 2P5RA 1GSSA 3LGCA 11GSA 2OJLA 2B3SA 2JZSA 4JR4A 4ECJA 5ENUA 4NHZA 3RPPA 1M2BA 4FYBA 4JBBA 1UVZA 4ID0A 2GGTA 5JCWA 3CSIA 4GF0A 1URMA 3FY7A 1ERUA 4I2UA 2VD0A 3F3QA 4TR3A 1MDIA 3VFIA 1Y6EA 5D93A 1SKRB 4PQ1A 4ECCA 2XPDA 1SL2B 16GSA 2GZYA 1O73A 4WR5A 5H5QA 4IN0A 3HVVA 1U88A 5IMFA 3BD2A 6GSTA 4N0ZA 4KDYA 3C73A 1K0MA 3WT1A 5D73A 2G2QA 1SD8A 1PX6A 1QMVA 5GSTA 2E2GA 5B8AA 2H30A 2O89A 2QGVA 2FWHA 1YJ6A 2F8FA 3QD9A 3KJYA 20GSA 2XBQA 1H75A 3FRCA 4WKWA 1QUWA 3H79A 2VCZA 4GQFA 4NHWA 4NPBA 1OYJA 3EINA 3GTUB 1EP7A 3HHVA 2PUKC 2YJ7A 2FA4A 1Z6NA 2AB6A 1Z3EA 2KHPA 1HD2A 3A5WA 3V1WA 5JWRB 4XS4B 3E0UA 3GN3A 3J7Yk 3VLNA 1TK5B 1G7EA 1U87A 2FNOA 4G9HA 1JZOA 2DLXA 5EPFA 2H74A 4DVCA 5DALA 3ZZXA 5ID2B 1A8YA 2IFQB 3HCZA 1BX9A 1S3AA 3C7MA 4YQVA 2DJ2A 4HI7A 1XW6A 4O5RA 3D21A 1X9SB 1XIYA 5INYA 2MBTA 5HR0A 3QFAC 1J9BA 2CVDA 2C4JA 2H0IA 1J0FA 2GTUA 3GA4A 4POLA 5HFKA 2N5BA 1AIUA 3GX0A 2HRNA 3ME8A 4MF6A 2LKUA 1WOUA 5ECIB 3VWWA 1Z5YE 3BBYA 4OMVA 1ZZYA 3MAKA 5F07A 2IN3A 2KP1A 2GZZA 1TI1A 3HVXA 4ZL7A 2YV7A 2V41A 3GSSA 1HNAA 1JLVA 3UEMA 1F6MC 4HU9A 1SKWB 3GFKA 17GSA 2AYTA 2PBJA 1BG5A 4K7NA 3EYTA 2ZNMA 4PQIA 2C0EA 1K0CA 4G2EA 5FHIA 3ZVJA 1GSYA 2RIIA 3KM6A 2K6VA 4K6XA 5LNKe 2H71A 2I9HA 4I6XA 1K0AA 1ERTA 2YWOA 1XBSA 3A3TA 3FHKA 3TGZA 4DSQA 4ECIA 1XVQA 1AQVA 4GQCA 2GSRA 1EOHA 2HRKB 4TN8A 1GUKA 4MDCA 3CXGA 1AW9A 2F9SA 1XPVA 4NWYA 3ERGA 3GH9A 2L4QA 3MDKA 1Q4JA 1HNBA 3IV4A 2KOKA 3DYRA 1Z7PA 1XW9A 1JZRA 1YF1A 3H8QA 1LJRA 2HFDA 4IBPA 1X9WB 4IKHA 2RM6A 1VGLA 5CRHA 3CRTA 2R2JA 3JCML 5HFIA 3LQ7A 2H0HA 2DJKA 2OE1A 3M8NA 1EZKA 1O8XA 4MJAA 5DJLA 1T7PB 3TKQA 5IOWA 5LCZA 1PD21 1PN9A 1PMTA 3R3EA 5IMDA 1FVKA 3CTGA 1ERWA 1XOAA 4K7IA 1O6JA 2HZFA 5GAPD 2GQKA 1F3AA 2YJHA 4EDYA 1I5GA 5JCUA 3VWUA 5F8BA 2GLRA 1SD9A 3VK9A 2K18A 5D8IA 4Q5QA 2B1LA 3DEXA 2WRTA 2GS3A 3FR6A 3IBHA 1C72A 2CVBA 2JSYA 5CP1A 2R3XA 2YZHA 1XZOA 2VLTA 4KSOA 4IJ3A 1NHOA 3U6VA 1PGTA 1A0RP 2NTOA 3IAS2 4USSA 5A4WA 4IELA 1FO5A 5G1LA 4G10A 2VL3A 4D73A 1SENA 1FOVA 2WJUA 1MDJA 4JR6A 4PURA 5IPGA 4DSSB 5ECLB 1B48A 5J9CA 1MTCA 2B5XA 1KNGA 4ML1A 1O81A 4RUVA 1BJXA 4LL1B 1PA3A 5KEJA 1TK8B 2XHFA 5IIZA 3DMLA 3LJRA 1TOFA 3GHAA 5HQPA 3ZL5A 3QAWA 4HJ2A 1TJDA 1O85A 2GVPA 1V2AA 3HD5A 1TU8A 5CRWA 3ISOA 5ABRA 3P7XA 4BVYB 2RUEA 1QXHA 1SJZA 2F3MA 1SYRA 1EEMA 1GNEA 2DMMA 2R6KA 3VPQA 2QKEA 1AUCA 4Q5FA 3UL3A 1PSQA 1AAZA 3UARA 4OCEA 3ZMKA 5D9VA 1ZGNA 3FR3A 5CYYA 4BVXB 1WRYA 4L8EA 4HUAA 1RW1A 3TJKA 5GSSA 1SK1A 1TI3A 2L5LA 5F0GA 2GT6A 4EO3A 1EWXA 5E59A 1A24A 4PQHA 1U6TA 1BAYA 5CREA 2M46A 2YWMA 4KF9A 1OKDA 3DVXA 3TUEA 1SL1B 3FW2A 4ZXGA 5IMAA 1NW2A 2H6ZA 3IAM2 1V9WA 4KE3A 5GZZB 1EOGA 4WBRD 4PUFC 2O85A 1T8EB 3ZLPA 1K3LA 1V40A 4FO5A 3WGDA 4J56E 5C04A 3QFBC 4ULXA 3IC8A 3DIEA 2C8UA 2O87A 4OFNA 4F03A 4N30A 3Q6OA 5CO3A 1VF4A 2C0DA 1TK0B 4O7HA 1XCCA 1EEJA 4PUAA 1XW5A 3IC4A 4WF5A 1DSBA 1EGOA 4KUNA 4MJBA 4WXTA 3M9JA 1M0UA 2XPEA 19GSA 2LTKA 2HZEA 4IVFA 3LG6A 4EVMA 4BWSA 3L9UA 2LEGA 2VCXA 5CAXA 2C1YA 1FW1A 1TRVA 4KDUA 3I43A 2V6KA 5B6NA 2CAQA 3TCOA 1BEDA 3I6AA 1M7TA 4GXZA 1R5PA 5COHA 3UOMA 2YP6A 4ML6A 1K0NA 1KEBA 1XWGA 5IMZA 5A4UA 4YQUA 3DD3A 3ERWA 3LFLA 1ERVA 2DJ0A 1NM3A 3QDNA 3P8WA 2VD1A 1WJKA 1MDKA 3F4RA 5DALB 2H6YA 2C0GA 1BYEA 4XS1A 3G7YA 3GX8A 4L0UA 5IMCA 1TRSA 1K0DA 4IP6A 1SKSB 2IMFA 2J9HA 2FY6A 3TDGA 2FHEA 1ST9A 5DJMA 3GMFA 2PN8A 5KN3A 1GTIA 1GULA 1RQMA 5IMVA 4L5LA 3LYPA 4GTUA 3UBKA 1N8JA 22GSA 1QFNA 6GSVA 4GCIA 3ZMLA 4EE0A 4MF7A 1YQ1A 3EU3A 3GKMA 4HOJA 3F6DA 3C1RA 2MYGA 3SBCA 4PTSA 3IR4A 2HLSA 5ECSA 3KP9A 4IS0A 2AAWA 1AC1A 5D9TA 3UBLA 1Z7RA 2LJKA 3TOUA 5KN0A 2X64A 3D6IA 2YZUA 3LORA 4HQSA 1ON4A 3EC3A 2H6XA 2WGRA 2YPMA 3KMNA 2A2RA 6GSXA 3GNJA 4MPFA 3HVSA 2B1KA 1G6YA 2DJ3A 5DQYA 4MZWA 4MP4A 2X99A 2R37A 2GSSA 4XCSA 1ZOFA 4MA9A 3ZFBA 5IO0A 4GRFA 1UC7A 2A4VA 1GL8A 4WF4A 2F51A 1PKZA 4EC0A 3FKFA 1YF0A 1GLPA 2GQLA 3Q19A 3M3MA 2GZPA 3CMIA 4KDXA 1T1VA 3TKPA 3UVTA 2H0GA 1TRUA 4HJMA 3I9V2 6GSWA 2LRNA 3TJBA 5AGYA 4NAXA 4F82A 4HZ2A 4PXOA 2WB9A 2LRCA 4X0XA 4I5QA 2YV9A 3ME7A 4TW5A 1F2EA 2ALBA 4OFTA 1M99A 3LXTA 3EU4A 2JU5A 2JZRA 1GSDA 2VCQA 2HNLA 2HE3A 1GUHA 5HR3A 4YQMA 1EV9A 4FH8A 2LRTA 1UA5A 4G19A 3HDCA 5J4UA 1T3BA 3F4SA 3G7IA 1W4VA 4MJEA 3D5JA 2PPTA 4XHMA 3US3A 2CAIA 4F0CA 2I1UA 3KEBA 3LXZA 5AISA 5FWGA 3FR9A 1XWCA 3EMPA 2H01A 4GSTA 1FB6A 4KA0A 5BMUA 3BCKA 4D73B 2CX3A 4P3YB 4O92A 5ECHB 4AJ6A 1XWKA 4AJ8A 1WWJA 1RK4A 14GSA 1DE2A 5DVBA 2VCVA 1UN2A 3KH9A 2OE3A 3L4NA 4ZB6A 1M2AA 2DSAA 2IMEA 5D9XA 4GSSA 3MSZA 3WGEA 2BJXA 4NMUA 2YNXA 3SWLA 4POBA 6GSUA 4Q5RA 4LMWA 1A2JA 2P0GA 1JFUA 4ZL9A 2DJ1A 1J08A 4KB3A 2ES7A 5D96A 3QMXA 2HRFA 2MMAA 2QC7A 5ECNB 2RUFA 1WE0A 2IFQA 1U3IA 5DQSA 4EUYA 3VWXA 2N5AA 2VL2A 1XOBA 1PX7A 4EF0A 3QCPA 1FVJA 2G0FA 2B7KA 2EIRA 1S3DA 2GQMA 4YAPA 2VCWA 2X8HA 3FZAA 3RDWA 4G0IA 1GRXA 2B6MA 2CX4A 4K1FA 2I4AA 2XBIA 1DE1A 1FAAA 4F2IA 2WDUA 4ZBDA 2R4VA 1GTBA 3QR6A 4E8HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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