2X0OA

Apo structure of the alcaligin biosynthesis protein c (alcc) from bordetella bronchiseptica
Total Genus 194

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
595
structure length
578
Chain Sequence
PHPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGFMRGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLAAPNLPNPIACF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bordetella bronchiseptica
publication title The Scottish Structural Proteomics Facility: Targets, Methods and Outputs.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
total genus 194
structure length 578
sequence length 595
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0oA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0oA04
2X0PA 2X0OA 2X0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NPQA 2PE1A 5EH0A 3VUKA 3UQGA 2NP8A 2R3QA 3QQUA 2R4BA 4ANLA 5JRQA 3F3VA 2W0JA 3ENHA 3PY3A 1PKGA 2PMOX 3UNJA 4CKJA 3DB6A 4WBOA 4DAWA 3PSBA 3EHAA 3COMA 1K2PA 2VX3A 4C37A 5E8VA 2PL0A 2R7BA 3DBFA 4RJ8A 4DEIA 5CEPA 2K3QA 4E6QA 2UZDA 3Q6UA 5JRSA 4BCNA 1BLXA 1ZMUA 1SVEA 3QRTA 3MGYA 3QUDA 2W1HA 1K83A 3E88A 4G3CA 5BX0A 4FTCA 4KBKA 1JPAA 4WG3A 1PXPA 1CKPA 3Q5IA 2XNOA 2C6IA 5E8WA 2R7IA 2W1FA 5FG8A 3WF9A 4AZFA 3SAYA 1WVWA 3ZXZA 2NVXA 1PXNA 3R1QA 3DV3A 2QR8A 4IIRA 2VTRA 3KVXA 3MH0A 4J53A 2PHKA 3QLFA 3ERKA 3BBTB 5EM5A 2FSLX 4DEDA 2GCDA 2WMTA 3UQFA 3RAHA 3EZEA 1J1CA 4C58A 4E73A 4Q2AA 4L7SA 5I9ZA 2CMWA 5ANEA 1UU3A 3FKOA 3WYXA 3ZLYA 3ZU7A 3QALE 5F95A 4O27B 3RPVA 3TIZA 2W9FB 3GP0A 4EOQA 1RQQA 4E5WA 3NIZA 5AIRA 4BBFA 4F9WA 4TNDA 3ZDIA 3R7EA 1ZY5A 2OJFE 5BQ0A 3ZSIA 3ZC6A 4YJSA 1G5SA 3FQSA 4S33A 2YCSA 3ORXA 3EYHA 3QRUA 3QTSA 3C4EA 4R1YA 3GCPA 1TVOA 2C6LA 3D94A 3KRLA 5L2QA 3RP9A 3B8RA 4GK4A 4F6UA 3CC6A 3OZ6A 4FV0A 2W17A 4UMRA 3OTUA 4AZSA 2WNTA 4CTBA 4ENXA 2FSOX 3VUIA 1XH5A 1CMKE 1ZY4A 3LFQA 4EK4A 4WSQA 3RAKA 2R3RA 2I0EA 1PW2A 3G0EA 2WXVA 2XKFA 3QGWA 1U4DA 4K33A 4RVMA 5IMXA 2YM4A 3R30A 3GU4A 4RC2A 1HCKA 2OICA 4ANQA 4FRFA 1JSVA 3OF0A 4OTHA 3TG1A 2PZYA 5TE0A 2PVMA 3DB8A 3TTIA 4XG2A 4QMNA 4FZAB 2XK4A 4WRSA 3VRYA 2XIKA 3U6IA 4FKUA 2OK1A 4FSYA 4IC7A 2G9XA 1JAMA 2ACXA 4QOXA 5DBXA 4U44A 1RDQE 1Q5KA 4O6EA 5AUWA 3LQ5A 5GJDA 4L00A 5K5XA 3PWYA 3DAEA 3LR2A 2OZOA 2B7AA 3Q32A 4V01A 3R8PA 3U4QA 3WZDA 4ZTQA 4G5PA 3LXLA 4G3EA 4M67A 3KVWA 5DVRA 2VTPA 5K3YA 3UO4A 1U5RA 2OW3A 4UB7A 5DRBA 3D7TA 3BGQA 4DG2E 4LI5A 1PMUA 2YM5A 4K0YA 1WBPA 5CI6A 2LPIA 3JS2A 4QYFA 5F9EA 2E2IA 3FY0A 3E87A 4MXAA 2WTCA 2VRXA 3EQRA 3I5ZA 3FLWA 3O7LB 3D5XA 3ZXTA 4XV2A 4GVAA 5HNGA 1YWVA 3GU7A 5FGKA 3GTKA 2BRGA 5D12A 4GG7A 4H1MA 4BI2A 4V0GA 3TV6A 2IO6A 4M68A 3H9RA 4IB0A 2ETKA 3FLQA 5EM6A 2V0DA 3HL7A 4C4HA 3ZFXA 3WE4A 1V0BA 3FPMA 3H9OA 3QUPA 3HV3A 4OTQA 1PXJA 5H2UA 4BAAA 1BKXA 5CEIA 5LVMA 1JSUA 2W9ZB 3MTFA 3Q60A 3FZOA 4BDFA 4Y8DA 4F1OA 4G3GA 4XMOA 5AMNA 3B2WA 1XBAA 5ANOA 2W4KA 3U51A 3QYWA 4IW0A 3VUHA 4A06A 3IO7A 4J1RA 4WIHA 2XMYA 1Q3DA 2ZDTA 5A46A 2GNIA 4B99A 3AT3A 3QD3A 4FNXA 4FTQA 3E7VA 3RPSA 4F7SA 1KOAA 3AGMA 3HDNA 4I6BA 4C0TA 3EIDA 3ORNA 1YRPA 2EWAA 4D2PA 3VUGA 2XM8A 4EK3A 4Y85A 1E1XA 3Q53A 3ZSGA 3DTWA 4DH8A 4FVPA 5BMSA 4O91A 5ICPA 1GIHA 4UWBA 3A99A 3QUEA 4F1MA 2GS7A 5M4FA 2UW9A 5CNNA 3TJDA 4IC8A 2PUUA 2XS0A 5KKRB 3UZTA 4I5CA 4ZIMA 4BCGA 3QTIA 2VWBA 3F3TA 4C02A 3EZVA 4ID7A 4JT3A 4EOIA 2C68A 3ZHPC 5LVNA 2LYIA 2EU9A 5IG1A 2C6OA 4HGTA 4DFXE 1GOLA 3Q4ZA 2REIA 4JIKA 4C2WA 4C36A 4YO4A 5L2IA 2W99B 4ZZNA 4GL9A 1F3MC 5JEBA 4D1ZA 3FDNA 5EYKA 2FB8A 3DFAA 3EQCA 3F5UA 5DEYA 3RAWA 4B7TA 3V8TA 1IRKA 3WI6A 2BDWA 2UZUE 1Z5MA 4GK3A 5I5ZA 4MQ1A 5FXQA 5CU3A 3ODZX 4X6QC 3WOWA 2JDRA 2OJ9A 4XEYA 2WQNA 3KK9A 4PTEA 3PZEA 4Q9ZA 3D7TB 4J97A 4J99A 4H1JA 3V5WA 5ACBC 4CT1A 1QPJA 1ZYRD 1MQ4A 1J3HA 5EFQA 3TXOA 2X8IA 3MJ2A 3VS2A 3EN4A 4G31A 2WQMA 4WO5A 5HG9A 5M44A 4QQTA 3RINA 3BBWA 2G2HA 3EQFA 3LJ0A 2QD9A 4ANMA 4EH4A 2QURA 4MD8E 4UEUA 1JKSA 2P0CA 1LPUA 3VJNA 3RPOA 4M0YA 4ALUA 2X39A 2IF8A 2QG5A 4V0GB 4YZMA 3W2OA 5FM3A 4A4LA 5JKGA 5A14A 4RJ7A 5E1EA 3WF5A 3FYJX 5IZ2A 2R3HA 5BVWA 4ZSLA 3WZEA 4KKHA 3A60A 4KD1A 5LWMA 4NJ3A 4KBCA 4CFMA 4BWXA 5FBOA 3OWPA 3OBGA 3FI2A 4U43A 2Z7LA 3CGOA 4AW0A 4I4EA 5LVOA 4C35A 2Y0AA 2WIHA 3FSKA 2PMNX 5LMAA 4YUQA 4F0FA 5IDPA 2WTIA 5A3XA 3RNIA 1H00A 4UXLA 4EI4A 3NLBA 3Q4CA 4FV1A 4RJ6A 4FK3A 4KRCA 4OT6A 3SC1A 5HTIA 3ZSHA 2RKUA 3VIDA 2ITUA 4H39A 1WBOA 1XWSA 2O2UA 4TNBA 2VTOA 5F1ZA 3CTJA 3V5TA 5CEMA 3LCDA 3PE2A 4I22A 2X8EA 1UWJA 4L46A 1EH4A 4ALWA 1M14A 2JDVA 2XK9A 2FSMX 3S3IA 3TACA 4A4XA 1HOWA 3QCQA 4FTOA 5IA4A 4FIHA 4LL0A 1XO2B 2EVAA 4BHZA 3HP2A 4EJNA 3QXPA 1FVTA 4I92A 1Z9XA 2JA5A 4ZEGA 3R0TA 3DZOA 4FKGA 3NAYA 5AP6A 3R9DA 5M56A 4CCUA 2XK7A 1XH9A 2R9SA 2F49A 4EOKA 5AP5A 4DEGA 4WOVA 3OXIA 3FLZA 4IHPA 1JBPE 2C3IB 2WMWA 4AW5A 4CXAA 1ZYLA 2ZV7A 2WTKB 1ZZLA 4KIOA 4HVSA 3UYTA 4ZTMA 1WAKA 2WOTA 4Y5QA 5DPVA 4CT2A 3F88A 4A9UA 2ONLC 4CZUA 4R3RA 4IAKA 4K8AA 2GTNA 3DPKA 4U81A 5CEKA 3MIAA 3Q4UA 3V01A 3UOJA 5AAGA 2O64A 3BYMA 5HD4A 4YJTA 3II5A 3GTQA 5HIEA 3NYNA 5FEEA 2YWPA 3WILA 2E9OA 4JXFA 3L8SA 4AN9A 2GHGA 2JLDA 2YDKA 2XM9A 5DN3A 3QQKA 1Q8ZA 3QKKA 5AJQA 2HZNA 2MX8A 3VBQA 3P86A 4AW1A 4O4BB 3P79A 4F6WA 4CLJA 2UVXA 2BROA 3NR9A 4U9AA 5IDNA 1KE6A 2UW3A 4IACA 4BIDA 4IWPA 2BHHA 3EZRA 3BHVA 3H3CA 2Y4IC 4BRXA 2B4SB 1OIQA 4M97A 4V05A 4FBSA 3SDJA 3RM6A 3PJ1A 3UIMA 3VC4A 3ZC5A 3KC3A 3K3IA 3R9HA 4U80A 3FMEA 4GT4A 2YJSA 2WZJA 3OG7A 3BEAA 2OIDA 2C4GA 1Y1VA 3KXZA 3EN9A 4WNOA 3ZFMA 4IJ9A 3OFMA 4M8TA 4MKCA 3FZTA 4O0TA 3O23A 3IDPA 5DT4A 5JZNA 1H1PA 4M84A 4JR3A 2R3OA 4NEUA 3UG1A 3Q9ZA 5LVPA 4C3RA 2ITOA 4FKJA 4MWIA 3GUBA 5KO1A 3K5UA 5E8ZA 3VW6A 2IN6A 4OTWA 4D2SA 3NIEA 4KAOA 5IA3A 3QQHA 5K0KA 5AR3A 3SXSA 3LVPA 4ZLYA 2QOHA 4I41A 3COIA 3ZS5A 5A6OA 3ZRMA 1UVRA 2R3KA 3QYZA 4PTGA 2VO3A 2O3PA 1H27A 5HCYA 5I9YA 2VV9A 5BVNA 4DFYA 2QU6A 4JQEA 3L1SA 4L43A 1U59A 2H8HA 3L9LA 4Y72A 3AD6A 3TCPA 4Q9SA 3UIBA 4RT7A 4TTHB 2UZOA 3QD2B 2JDTA 4NW5A 1OMWA 4JG8A 3UVRA 5IZFA 4C4JA 4ACGA 2FIPA 5HO8A 3VF8A 4L42A 4E8AA 5DWRA 3R8LA 5JFXA 2C6KA 3C4FA 3FQEA 3NW7A 4J98A 5GHVA 3MYGA 4R5YA 3ZUUA 2EXMA 4HNIA 3EZBA 4IB1A 1YOJA 4UMPA 4ASXA 4WA9A 4U79A 1AD5A 3CCNA 4DHFA 3EQPA 3E8NA 4QP3A 1IW7D 2GQGA 2O65A 4UV0A 4IZAA 3R21A 2GDOA 3UMXA 3FYKX 3SXRA 3CTQA 5BVFA 4MK0A 3PIZA 4CRSA 1FOTA 3ITZA 3N9XA 3MB7A 4RSSA 4IAZA 4AA5A 2R3IA 3ZFYA 4EK6A 2GNJA 2WKMA 5J7BA 3AT2A 3GU6A 1UKIA 2PVJA 1UU7A 3C50A 3RK9A 4FX3A 4D2RA 1WBNA 3V8WA 2AYPA 1W2DA 1UNLA 2F2UA 3OCBA 1O9UA 2E9PA 2ZDUA 2XRUA 4QIWA 4NK9A 5HD7A 1XH4A 4X3FC 1OL2A 2QOFA 4J96A 3EFJA 4GW8A 2QLUA 1GY3A 3AC5A 5LQFA 2FVDA 1AQ1A 5CSVA 2UZTA 1BUHA 2YN8A 4K1BA 3VHEA 4FNZA 4BWPA 4O0VA 4E6DA 4E4NA 4NKAA 5KHXA 1T45A 3LQ8A 3LCTA 3PFQA 1QL6A 4JI9A 3QTXA 1OECA 2HCKA 4QMPA 2F7XE 2VTHA 5KMJA 3CXWA 1FGIA 4BHNA 4DC2A 4FR4A 1STCE 5T3QA 1CM8A 3OEZA 4QMZA 4A07A 2EZCA 4YPSA 5JGBA 1V0PA 2VX1A 3IGOA 3DZQA 3R7GA 4LUEA 3SRVA 3VJOA 1URWA 3UZPA 2HW6A 2VK9A 4WG4A 4YLLA 4EYMA 3HVCA 2WPAA 1KWPA 4HZRA 3KMUA 5EKNA 4Q5EA 4NH1A 5AM6A 2UZVA 3K2LA 2C6EA 4HYIA 5C8KA 4J71A 5DHJA 2R0UA 3HUBA 4K2RA 4LMUA 5I9UA 1PMEA 4F1TA 5DA3A 4DG3E 3F7WA 3R04A 4L9IA 4OUCA 1UKHA 3ZO3A 3GT8A 2QC6A 1GZKA 5D1JA 3BU3A 4U0IA 5IUHA 2QODA 5L3AA 2ESMA 1OM1A 4E6CA 3EL7A 4ACHA 4BIBA 3O96A 3RAIA 1UWHA 3Q52A 5AP1A 4AN2A 2ZV9A 1F0QA 1OKYA 4AT5A 5G6VA 3QHWA 4FKRA 3SX9A 1GZ8A 3CD8A 4IAFA 3EYGA 5F94A 2BRHA 5CX9A 4E5AX 4L01A 3QXOA 4ACCA 4A9RA 1E1VA 1ZAOA 3BZ3A 3CR0A 4O21A 5HE1A 3G9NA 5KMNA 2Y9QA 1YXTA 2BR1A 4JAJA 3R83A 4MH7A 1R9TA 4QP2A 2CN8A 3PRFA 5AP0A 4DGMA 1IEPA 4PWNA 1WVXA 4YNOA 4EWHA 5CAQA 2B54A 1R1WA 3LZBA 3QGYA 2WQEA 4E4MA 4QMMA 4F9YA 2VN9A 4G1WA 4BTKA 4Z55A 2YM6A 2QKWB 2IZSA 3TKHA 3C13A 4C61A 1AGWA 1WVYA 5E8XA 5EYCA 3CBLA 4RJ4A 3E93A 2ITPA 4PMMA 5DI1A 3W1FA 4BWKA 4X2NA 3QBNA 4M0ZA 2DWBA 2X9FA 4GMYA 1I44A 3THBA 4FL2A 4JDIA 3KL8A 3RTPA 3DBCA 2BE5D 2WQBA 3FV8A 3MVJA 4RBLA 2EUFB 3ZO1A 2R3JA 3D5VA 4EH5A 4QNAA 3FBVA 5J9LA 1REJA 4EEVA 4G9RA 4KB8A 4JX3A 4IAYA 5HNIX 1NVRA 4MWHA 3UIUA 2YDIA 3LIJA 3UP7A 1WMKA 3FUPA 2CGWA 3BPRA 3L8XA 4MAOA 2PVFA 1H26A 3RPRA 4C4EA 3A8XA 3IW6A 4OTFA 3FL5A 2FYSA 3EQGA 3R7VA 5M4IA 1W82A 2OI4X 4DINA 1CTPE 3ALNA 1OKZA 2PMLX 4O0YA 4TWCA 5D10A 4CFVA 3Q04A 3ULIA 4IH8A 4FSZA 4NSTA 1Q41A 1XKKA 3VW8A 1ZYJA 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