2X0PA

Co-complex structure of alcaligin biosynthetase protein c (alcc) with adenosine from bordetella bronchiseptica
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
596
structure length
577
Chain Sequence
PHPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLANAPNLPNPIACFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Co-Complex Structure of Alcaligin Biosynthetase Protein C (Alcc) with Adenosine from Bordetella Bronchiseptica
rcsb
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bordetella bronchiseptica
total genus 196
structure length 577
sequence length 596
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0pA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0pA04
2X0QA 2X0OA 2X0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UX9A 5HORA 3A7JA 5HX6A 5AV1A 3H10A 4IM3A 4ZZNA 5AR3A 4QMSA 4F0IA 4FV5A 4QYYA 5AP4A 5KZIA 5KKRC 1TQMA 4HNIA 3GFEA 2K3QA 2OJ9A 5EH0A 4YTHA 2W1IA 4V04A 4I6QA 4M3QA 3ENMA 4BTMA 4C4FA 1AQ1A 2OICA 4ALVA 3KXHA 5IA3A 3W8LA 1NVQA 5I9XA 2UW4A 4PPAA 5EOBA 3PY0A 3SW4A 1Q5KA 2R3QA 4CLJA 5DHJA 1JVPP 4F6WA 2R3LA 3R7IA 4C33A 3ZZEA 2CCIA 4QP4A 4RIXB 2X0GA 3LJ2A 4V2QA 3ODZX 4IC8A 4FV1A 4V05A 3O50A 4EI4A 1GOLA 4Y5QA 5DRDA 4UBAA 4Z55A 1KOBA 3P9JA 4D2TA 3QD0A 4M69B 2ZOQA 1TWGA 3G5DA 4NSTA 4XP3A 3V5QA 4CKIA 4RX5A 1PMUA 3BGQA 5FP6A 3R9NA 4B7TA 5A4CA 4F64A 2BRBA 3PY1A 3C4WA 3P1AA 4FKLA 5L2TA 3RM7A 2ZDUA 4Z3VA 2KTYA 4QP1A 1V1KA 2YM4A 3OG7A 5JH6A 3R6XA 4Z16A 4IB5A 3D14A 3OFMA 1TVOA 2R2PA 5HU3A 4NIFA 2PMLX 3Q32A 5DPVA 2ZYBA 2F57A 4MTAA 4FYNA 1Q4LA 4DGLC 5CT7A 3DKGA 4FV7A 3LXPA 5AUUA 3VULA 4F99A 2QD9A 2YJSA 4TL0A 2YIYA 4WRSA 4CT1A 2Y9QA 5DRBA 2UZBA 3V01A 3ZEPA 5EHYA 3LOKA 4QYEA 4JQ7A 5HIBA 2B9FA 5A4TA 1GJOA 4E20A 3QC9A 5LVPA 1B6CB 3UOHA 4HYIA 1TQIA 3E3PA 3K5VA 4L3JA 3QCYA 4FTLA 4JAJA 4G3DA 4C0TA 2EXMA 4U45A 3QTSA 3GNIB 5IZ2A 3H30A 4O0UA 4EL9A 2JKQA 2VO7A 5HX8A 2E2IA 1S9JA 4AA4A 2VRXA 5LMKA 1PXJA 4C6GA 3QTWA 3KVXA 2UZTA 5E7RA 1ZYRD 5T68A 2OF4A 4BIDA 4FF8A 3O96A 4IB3A 4MHAA 5A14A 1W7HA 3EFLA 3MPAA 4C59A 2XJ1A 3KN5A 1O9UA 3BLHA 4MBLA 1TWFA 5FBNC 5IMEA 4C7TA 3MBLA 3IECA 3MI9A 4WNOA 1IG1A 5DT4A 4YHTA 1R9TA 2VTLA 4U43A 1XQZA 5EKOA 2BRHA 4D2VA 5L2SA 2JIVA 4KNBA 1W84A 2WTCA 3W8QA 2XF0A 4K8AA 5AR8A 4BDFA 2C3JA 1ZY5A 5CASA 5HO7A 3OW4A 4R6VA 2XIYA 3ZC6A 3U6JA 2HW6A 4D1ZA 4IHPA 3JY0A 3ORMA 3QGWA 4FZ6A 4O0SA 4QIWA 5TT7A 3UGCA 5JQ8A 4USDA 5KMOA 3C5UA 1FGIA 1QPDA 4BCIA 2XUUA 3CKWA 4FV0A 3KB7A 2XK7A 4XG2A 4MXZA 3NW6A 4LRJA 2CHLA 4UYNA 4KIOA 4YJUA 3OEZA 1ZARA 5ETIA 4DG2E 4Q9ZA 4D1XA 4S30A 2QO9A 4QMZA 4L45A 2HOGA 4IAKA 2JDVA 4BDEA 2CKEA 1ZYMA 3GTMA 1Q99A 4RLKA 3R8ZA 5GZ8A 2IZSA 4IAIA 4WRGA 5AUZA 3QZHA 4HOKA 2JLDA 3POZA 4RJ3A 5AV0A 3D5VA 1U5RA 4F7SA 5IZFA 3KK8A 1H1WA 3TKIA 1GNGA 4ITHA 3P23A 4KIKA 3G9NA 4ZY4A 5HO8A 4Y73A 4AXAA 5A4QA 3EN4A 3NIEA 4I4EA 4KKEA 4TYEA 5GJFA 4CFMA 1YDSE 4PDPA 5H8GA 4AAAA 4IZ5A 2R3OA 3DJ5A 2XM8A 4PPBA 4BYIA 3FXZA 4Y5HA 1U59A 2GHGA 3QWKA 4O91A 5BX0A 3VUKA 4ZJVA 1NA7A 4KS7A 3EQGA 4OBOA 2RGPA 3FV8A 3RNIA 2WMRA 3F7WA 1OKWA 1K3AA 4QTEA 3OEFX 3KXMA 4LOPA 5AADA 3ULIA 3MVMA 5DGZA 5CSPA 1T6JA 5CWZA 2W1CA 3Q53A 3V3VA 4Y85A 1XH9A 3RNYA 3PUPA 3V5PA 3QUDA 4F6UA 2LPIA 5DN3A 4YUQA 3R22A 4HZSA 2C6DA 4FMQA 4F9AA 2GS2A 4FSNA 5GNKA 2JKKA 3REPA 2Z7SA 1Q8UA 3TXOA 3NAXA 3OT3A 4IANA 5AIKA 4C8BA 2PMNX 4E6CA 1XH4A 2YIQA 2JKMA 5BQ0A 4NWMA 3PVBA 3KC3A 3WF6A 3DB6A 3LFCA 4GT3A 4GFMA 4RWJA 3TZ9A 2OG8A 3V8TA 5FGKA 4FTIA 3CPCA 5ANGA 4O27B 3LHJA 2LPJA 4U0IA 3V8SA 2BIYA 2BVAA 2ZMCA 3RCDA 4KB8A 1ZOHA 2Y6OA 2I6LA 2X0OA 4C62A 4RJ5A 2WFYA 4CFVA 2PE0A 4FV4A 4BVUA 2EXCX 2WU6A 5CSWA 4FOBA 5FEDA 2GNGA 3ZH8A 4CEHA 4KABA 4L3PA 4U3YA 2WTWA 4E4NA 3DNDA 3VS7A 2ZVAA 2R7BA 3RALA 2O64A 3KCKA 4FKSA 4E5AX 1OVEA 3F69A 4FG9A 2WTIA 4C5SA 2R3JA 4XS2A 5EOLA 2PZIA 3BI6A 1MQBA 3QX2A 1PF8A 2CN8A 2A68D 4AZEA 4U80A 4IEBA 2WELA 5CAUA 2BCJA 4W4XA 3MTLA 3R9DA 2RSVA 4FKRA 4QRCA 2JDTA 1XH7A 4DFNA 2PVHA 3QYWA 1BL6A 2WXVA 3A7HA 3BU3A 3H4JA 3NNWA 3RPYA 3SRVB 4JBOA 5L3AA 4RX8A 2VK9A 1NVRA 5HVJA 3TIYA 4MEDA 1W2CA 2YWPA 4TYHB 3OWLA 1PY5A 3SKCA 4I0RA 4PNKA 4HGLA 3GTKA 3MFUA 5DWRA 4HPTE 3WYXA 4RFYA 2W1HA 3VJNA 4BKJA 2W4JA 4E4XA 5CNOA 3MIYA 3FJQE 1PXIA 5ETFA 3QFVA 2PSQA 1OZ1A 1SNUA 5J5SA 3AG9A 3DQXA 3PA3A 3LAUA 4G31A 2VTMA 4DEDA 3QQHA 3OWPA 4KBAA 4QMPA 5BUIA 2EZCA 4J96A 3QALE 4U7ZA 3QRTA 3UTOA 3LXNA 1PMNA 1CKPA 2WMSA 3CGOA 4EZ3A 2QG5A 2YCFA 4BCJA 4YP8A 1E1XA 3DTWA 3P79A 1ZOEA 3S1HA 3P7CA 2F49A 4WIHA 5J9YA 4ITIA 4HVSA 3MJ2A 4U9AA 4U79A 5E8XA 3FKOA 3LCTA 4GK4A 4RMZA 5AA8A 5FXRA 3HV7A 3LR2A 4RVLA 1B38A 2PMOX 3E3BX 4I93A 4KS8A 1J1BA 4RIWA 4BIBA 2GHMA 4RJ7A 4X2KA 3FXWA 3T9TA 3K3IA 5KX8A 1Q41A 3TNIA 5CXZA 1UWHA 2C6MA 3C4CA 3WE4A 5EDPA 4R5YA 3H0GA 3AXWA 1LEZA 5GZAA 3VBVA 3IW6A 4YTCA 4IC7A 4E4MA 3VW8A 4IAZA 2FVDA 4OTIA 4MCVA 2QOLA 2YM5A 4FSZA 4A9TA 1P4FA 1FMKA 1OECA 4YTIA 3KGAA 4GK3A 4A07A 3PG3A 2Z2WA 4AOTA 3UIBA 3NPCA 4D55A 4XNEA 2X8EA 3PIYA 2A6ED 1YWNA 3L9LA 3ZBFA 4C36A 2OIBA 3W1FA 5F9EA 4JDHA 3CD3A 3QQKA 4WSQA 3DT1A 3R2YA 4L53A 2H34A 1ZXEA 4JIAA 5HE2A 2UZVA 3SXRA 5AP1A 2ZM3A 1REKA 3AC8A 3EQHA 4EZ7A 2PMIA 3C51A 1VYZA 4XP0A 5EW3A 3QYZA 4MH7A 4TWCA 3ZXZA 4U81A 2WTVA 5HICA 3SXFA 3MS9A 4A7CA 3D7TB 1U54A 4YHFA 2RFDA 4FKVA 3TJCA 3TTIA 3VUMA 1YRPA 3CS9A 4OBPA 5C03A 4B99A 2I0EA 4M14A 3ZFXA 2R92A 4R5SA 4XRLA 2ERKA 5BVEA 3RMFA 3SX9A 4BZDA 1R78A 3PXFA 1H0VA 2XKFA 3FZTA 5C27A 3TNHA 4DN5A 4EK4A 3FMDA 2VWZA 2QVSE 3D15A 2VD5A 3ACJA 2MX9A 3DBDA 3ORPA 5AM7A 2JFLA 4NM0A 4KA3A 3FI3A 2C69A 4BCGA 3A4OX 5CNNA 4ACHA 2LAVA 3QHRA 1YOMA 2F4JA 3LLTA 2YU9A 4CQEA 5EK7A 2YHVA 3QQJA 3ENHA 3RWPA 1MQ4A 5EFQA 4JBVA 3I6UA 4BWKA 1SM2A 4EK6A 2YM6A 5IA2A 3VF9A 2NP8A 4A06A 3MGYA 4BDKA 4EC9A 2XNEA 4BI2A 2ITTA 5TR6A 3DAJA 2J50A 4XG9A 3QTZA 3BGPA 3RPRA 5CEIA 1PKGA 5KMIA 1IEPA 2OZAA 3PTGA 4FV2A 4GT5A 2J6MA 2WTKC 4I24A 4K18A 4R3RA 5HE3A 5J79A 3M2WA 3BGZA 4O0WA 3NS9A 2WMVA 3DLZA 3C13A 4KKGA 3G90X 1O6YA 2ETKA 2EWAA 4FBSA 2PVJA 3F7ZA 3WZDA 3R9OA 2O0UA 3HDMA 4M0YA 3IONA 1PXLA 4QP9A 3AT2A 4EOSA 4ZTQA 3A61A 4H1MA 5LJJA 3KXGA 2J0MB 3BX5A 3HMIA 4GEOA 1YDRE 3ORLA 1XO2B 3JVSA 2PTKA 3RK5A 3UQCA 4NM3A 5HGIA 4O1OA 3HMPA 2I0VA 1JSUA 5HTBA 1ZYLA 5LARA 4FT0A 4D4RA 4OW8A 3DGKA 3DFCB 4J71A 2UZOA 3T3UA 3QC4A 1P4OA 2VTSA 3E7VA 4WO5A 3LFAA 2I40A 5CSHA 2Y4IB 2XIRA 4M0ZA 5DNRA 4ANLA 5IG1A 2WOTA 5LVOA 3EZBA 4L8MA 3UVQA 4TWOA 4JAIA 3LRDA 3GC7A 3FYKX 2R93A 5HE1A 4DYMA 2ZM1A 1K2PA 4IDVA 4ZTNA 2BFXA 4JG7A 3VW6A 2X4ZA 1UKIA 4K2RA 3CTHA 1M2QA 2PL0A 3BYVA 4EJNA 3BYUA 1I44A 4GYGA 4XBUA 5AA9A 1KV1A 1XBAA 3F3ZA 3KF4A 2OBJA 5CEMA 5LVMA 4BHNA 4XG7A 4QQ5A 4I22A 2GNFA 4YZDA 3FC1X 3MA6A 4UWBA 2MP0A 3RTPA 2W1EA 5HLPA 3DK6A 3EYGA 3WE8A 3VQHA 3KVWA 4IX5A 5EW8A 2F9GA 3FKIA 2YACA 2DYLA 4C61A 2A2AA 3FE3A 5DT3A 3MFSA 4Q5HA 1YKRA 3HEGA 2XRWA 3B2TA 2P2HA 3RP9A 3GP0A 4K33A 3F2AA 2BUJA 4E73A 2X6DA 4TNDA 4G3FA 4CKRA 2ZV7A 2G15A 3NUYA 3QF9A 4QNYA 5CU2A 3WZJA 3RAHA 2CJMA 2RFSA 4FZFB 4E6DA 2V0DA 3R21A 2VN9A 2Z7QA 5CLPA 4D9TA 2R3HA 3O0GA 3UODA 2BZHB 3GEQA 4RA5A 3QD4A 5CANA 5K4IA 1SVEA 2QOQA 2G01A 4MNEA 4TY1A 4TYGA 4RZWA 5CVGA 3HMOA 4CEIA 5L8JA 5IF1A 3Q3BA 5DR9A 4BZNA 4NFNA 4AUAA 4QMYA 4RX9A 4CKJA 3QD2B 4TW9A 4X0MA 3HRBA 4HVGA 4ACCA 3FLSA 4R3PA 1P5EA 4G6OA 4FIEA 4ASEA 2CGXA 3KL8A 3WZKA 3B2WA 4RT7A 5LWMA 2VTOA 1FOTA 5AX3A 2C5NA 3L9NA 4ZSEA 5BMMA 4ANOA 2NO3A 4ACDA 1QPJA 4FTCA 1ZYJA 2J5FA 3COIA 1TWCA 2X8IA 3JS2A 2X39A 3DCVA 2J51A 3KMMA 3PPKA 4FICA 4FTAA 4HCTA 4K6ZA 4N70A 4YSJA 1KE9A 4RIYB 5AUYA 4BCQA 3U6IA 3U9CA 2IJMA 5EW9A 3A8WA 2WGJA 4X21A 3K3JA 1E9HA 3NNXA 2ETRA 4MF0A 5E91A 3BZ3A 4C4IA 1H1QA 3U9NA 4OAVB 3QTUA 3CEKA 4DLIA 2HXLA 4O0RA 5GZ9A 3EYHA 5K4JA 2VUMA 3RKBA 5G1XA 5E8YA 2VWUA 5AAFA 3L9MA 3ROYA 3TZ8A 2BPMA 2X2MA 2WNTA 3HMMA 4N6ZA 2C1AA 2CN5A 3FC2A 4U44A 3V5JA 4FR4A 4RWLA 5AP3A 2X81A 3ZSHA 2XIZA 4YJSA 4ZSGA 3V5WA 5AWMA 4EHGA 4KRDA 3L8PA 2GQGA 5FWKK 1YXXA 3OMVA 4PF4A 4CFFA 4GJ3A 5C8KA 2Z8CA 3V5LA 1ZAOA 2VTIA 3IS5A 3RPVA 5JRQA 2P4IA 3D2IA 2W1DA 2HZIA 2XNNA 4NW5A 4O0YA 3ELJA 2JDOA 2IVSA 4FIHA 3OXTA 4M15A 3CPBA 2YIWA 3ANQA 3MY0A 2REIA 5EDRA 4XBRA 3MIAA 4O0VA 4QTBA 3CJGA 3I81A 4BGHA 3O17A 4NT4A 4ANQA 3FHIA 4Y8DA 3UQGA 2ZV9A 3UIUA 3OS3A 1IW7D 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