2X0QA

Co-complex structure of alcaligin biosynthesis protein c (alcc) with atp from bordetella bronchiseptica
Total Genus 209
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
209
sequence length
599
structure length
582
Chain Sequence
HPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGFMRGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLANPNLPNPIACFRPSWL
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Co-Complex Structure of Alcaligin Biosynthesis Protein C (Alcc) with ATP from Bordetella Bronchiseptica
rcsb
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bordetella bronchiseptica
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
total genus 209
structure length 582
sequence length 599
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0qA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0qA04
2X0OA 2X0PA 2X0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BZIB 3VIDA 4IJPA 2QOLA 4OTRA 4DHFA 2JDSA 4GRBA 2H96A 4AW5A 1JVPP 3P1AA 4IB1A 3MIAA 4G9RA 1YI3A 3VS2A 2Z8CA 2E9PA 4H3QA 1P4FA 2PVJA 5IA5A 4X3FC 3HYHA 5AP0A 5FTQA 4IVDA 4P5QA 5AIRA 1UWHA 3VJOA 1PMUA 2VTQA 4S34A 4WUAA 3DBFA 4U80A 2YIWA 5T68A 1YXTA 4FF8A 4QMNA 2E9UA 4TTHB 3BCEA 1IA8A 5JZNA 5DR9A 3CPBA 3R8UA 2IZTA 3E5AA 1R0EA 3MSSA 4K18A 4C34A 4RVTA 3LJ0A 5E8XA 1FINA 2RG6A 3OXTA 3TG1A 3WF5A 5HQ0A 1W83A 4CKRA 4D1ZA 2NVYA 4E26A 1QPCA 3BLRA 3KVWA 4IVAA 4YJOA 3QTXA 3TZMA 4PTGA 4YPDA 4DG0E 4FGBA 4O6LA 4FSUA 4M14A 3LM5A 4N6YA 5HO7A 4RIYB 4EQUA 4CZYB 4YC3A 2UW7A 1Y6AA 3KF7A 1UU8A 1W2DA 5FXSA 3Q9YA 2ONLC 2QO2A 4YNEA 4ZY4A 1BX6A 4KS7A 2QOHA 1PYEA 3UG1A 5CU3A 1ZYJA 2GDOA 5CU4A 5FDPA 2VTIA 4RIWB 2YIRA 4OAVB 2YCQA 5IA0A 5LQFA 3RAKA 3Q5ZA 4DH7A 2XM9A 3PP0A 3VN9A 3TI1A 3WIGA 3NUPA 5KNJA 2QOFA 3A4PA 3G6GA 4UXLA 4UMQA 5KO1A 5ANKA 5ICPA 1FVVA 5FTOA 3QKMA 4IMYA 2VWBA 3F3WA 4BIBA 5LVNA 2WMXA 4E20A 4RIOA 2ITOA 3CR0A 5TT7A 2OI4X 2EB3A 2ZV7A 5KE0A 2ZDUA 3V6SA 3A8WA 3F69A 4HCVA 5BQ0A 4G5PA 4ENYA 3THBA 5ANDA 4I3ZA 2PSQA 4Q9SA 2ACXA 4M69A 5DE2A 3ZOSA 3EIDA 3F5XA 2JDVA 4D55A 4EK6A 4O6EA 2ZM3A 3AC2A 1LEWA 2YLEA 4FV2A 2P0CA 3BHUA 1J1BA 3A62A 3OEZA 3EQRA 2B9IA 4ANNA 2Y4PA 2OZAA 1Q62A 2NRYA 4QTEA 3EZAA 2BR1A 4E4XA 4QNAA 1P5EA 3GNIB 3R6XA 4FVRA 3S4QA 4C5SA 3K3IA 2C3IB 3AGLA 4BCNA 2Z7LA 2VX1A 2X8EA 5DNRA 2ITYA 5M56A 5JEBA 2FH9A 2OIBA 2BILB 3FKNA 3PE2A 4BIEA 2UZBA 5FP6A 2CGWA 3PXKA 3GC9A 4FV9A 1JSTA 5CQUA 3QTSA 2PVKA 3ZBFA 4AGWA 5IDPA 5CENA 5JN2A 5CXHA 4O1PA 5K0XA 3MB7A 4FG7A 1BI7A 1YXVA 3HP2A 2ETRA 3G2FA 3MA3A 2FGIA 3OOGA 4NKAA 2VTLA 2BFYA 4RBLA 4IADA 3ZEWA 5CSPA 1Q8WA 5C8MA 4I22A 4K0YA 1FPUA 4FIGA 1Y57A 5DRBA 3GC8A 4QTBA 4ZJJA 3BWFA 2VU3A 4WT6A 2XF0A 3LZBA 4XG4A 4S32A 4WA9A 2EZCA 4WOVA 4BL1A 4CFUA 1TWHA 2YN8A 3IOKA 4FV8A 4GEOA 3UMWA 4X3FB 1YHSA 5A6OA 2QU6A 3WE4A 2YM7A 1KV2A 3MI9A 3MY0A 5H2UA 1B6CB 2W5BA 5E1SA 5L2WA 3FC1X 3NRMA 2F7ZE 4LUDA 2F49A 5LCJA 3L9MA 4E5WA 4CFVA 2ITZA 4A07A 4NUSA 5AAGA 2YLFA 4U9AA 2H8HA 5M53A 3R8MA 4L53A 3KF4A 1PMEA 3I6UA 3KL8A 4GYIA 4ANSA 5EHOA 5LARA 1OVEA 4ONAA 2JDTA 4H3PA 2V62A 4YJNA 3R83A 3OVVA 5HICA 4YZCA 1E9HA 3FE3A 4LQMA 3PFQA 2BZHB 1LUFA 4QP7A 5L2IA 4FI1A 3HRFA 4MXOA 2JBOA 3UMXA 3ORMA 4KS8A 4FTLA 3R2BA 4QMXA 4C6GA 3ZO3A 3OTUA 3VJNA 1RDQE 3D14A 5D41A 2VD5A 3O8PA 3VBTA 5BNJA 3TEIA 2Y9QA 4QMTA 1UU3A 3Q96A 3IS5A 4R6VA 5HLWA 2J50A 2WD1A 4RC3A 4XEYA 1FMKA 1YWNA 4Z7GA 4QQ5A 1NA7A 5DR6A 4NT4A 3ANQA 4XOYA 5EFQA 4O4FA 3R7OA 1YVJA 3R8PA 2VTRA 3LFQA 5A46A 4XG3A 3UZTA 3R71A 4L42A 4MWIA 1KSWA 4FZAB 3PA3A 1GOLA 2W1HA 1H28A 2YDIA 3BQCA 3F2AA 3AC4A 3ZS5A 5CF8A 1H8FA 4QMPA 3DAEA 4J8MA 3LJ2A 5HCZA 4BRXA 4F9YA 5JQ8A 2XK7A 2FIOA 4C2MA 3ZONA 5CLPA 3S00A 4S30A 3LCTA 5DN3A 3DK7A 5BVNA 4CMTA 3FKLA 2O8YA 1H1PA 3WZUA 2PVRA 3LW0A 3E8NA 3KXXA 4XG7A 5LCKA 1PJKA 3GUBA 2XM8A 2QO9A 2XJ2A 3SLSA 2GQGA 3ACJA 4MCVA 4C8BA 4MD7E 4LV8A 3VWAA 4L3PA 5BVFA 2BALA 2IVTA 3NUSA 4GK2A 4F6WA 4FG8A 3GFWA 2R2PA 1F5QA 5FM3A 3SX9A 4W4WA 4C4IA 3MJ2A 4RFYA 4ITIA 4EOQA 3EN5A 3CTQA 3ZDUA 1TWGA 3KN6A 4BDCA 3ZCLA 4LM5A 3UIUA 1JWHA 3HLLA 2VRXA 3QAME 2QOCA 4YZDA 2ZOQA 3CQEA 4FKQA 4FT9A 3VHKA 3BYVA 4L43A 5CSHA 4Q2AA 4ZJVA 3SA0A 2BZKB 2ZJWA 3R9DA 3MVHA 4G16A 4O0WA 4W9WA 1PXJA 5CZIA 4JG8A 3NUYA 2A6HD 2XH5A 4IC8A 4EOSA 3GCUA 4IM0A 3FZ1A 5EOBA 3U87A 4ZTRA 3HEGA 2EUFB 3EHAA 4YHFA 2F2UA 3ORTA 3QBNA 4RA4A 2RFSA 5A54A 3AC5A 1JKLA 1WFCA 2Y4IC 3COIA 3DB6A 3ZHPC 3BHYA 2JKQA 2WTKC 4J97A 3UO5A 4Y5QA 2XP2A 3D7TA 4IZ5A 3BHHA 4L44A 5HEZA 3VS3A 4I41A 2UZWE 4ZTHA 2C0TA 4E5BA 2PZRA 3FLZA 3JUHA 4WRGA 4JIKA 3RKBA 3RM7A 2ZVAA 2BTSA 2HZ4A 1UU9A 4ZEGA 3G90X 4ZXTA 1OUYA 4M12A 4R7IA 3V04A 4G6LA 3L9PA 3WYXA 4L45A 2QVSE 2PMOX 5BVEA 4HPUE 2K3OA 4EH9A 5ETCA 4PL3A 4S2ZA 3V5JA 2XIZA 3GTMA 2WAJA 3UYTA 2UW3A 3IOPA 3QD4A 2ITQA 2OH0E 1V0OA 2YCRA 3C0HA 2CKEA 3R30A 4NZWB 4A7CA 3ERKA 1FVRA 4NFNA 1ZMUA 2BTRA 3W2SA 3EYHA 4EBVA 4EOKA 3EFLA 4WSYA 1HQMD 2A19B 3AC8A 2FIPA 3N51A 4YJTA 3LFNA 4DEGA 2PMLX 2GU8A 2BRBA 2OFUA 3FQEA 3ZLXA 2R0IA 4D4SA 4B8MA 4D1XA 4JDJA 3PXZA 4WBOA 1O6YA 3CJFA 3F2NA 3NR9A 4G3DA 3V01A 4BKJA 3AD5A 4XG8A 2HWOA 4IDTA 4TYGA 5H9BA 2C5VA 3NIZA 4ITHA 5K3YA 4RLKA 3ZO1A 1U5RA 3PSCA 3WE8A 4ZY5A 2ZB1A 4AAAA 3HUBA 2YWPA 4W9XA 2MX8A 1UNLA 5AP4A 3C13A 3KY2A 3OWLA 4FYNA 2X39A 4S31A 4UX9A 5DIAA 4XBUA 2J0IA 3FMHA 4FKSA 3C0GA 3UO4A 4C4FA 4EJNA 3POOA 2XYUA 4PQNA 4QRCA 3DKGA 4WNOA 2XK9A 1H00A 1URCA 4K2RA 3EJ1A 3HKOA 4R1VA 4QP1A 1R39A 4FICA 1XH5A 5G1XA 4F63A 5TKDA 4AZEA 2X9FA 4V01A 3ZUTA 2YFXA 2W1FA 5IZ2A 5GJGA 1UKHA 2YERA 3JYAA 1JKTA 1UNHA 3KCKA 4LOPA 4FSMA 4QP8A 4F9BA 4R7HA 4CQEA 3P23A 3GCSA 4KIOA 3DS6A 1VZOA 3BPRA 1RQQA 3PJCA 3QCYA 4C5UA 4GS6A 4UMTA 2UW6A 3GXLA 3HMNA 4AFEA 2LTHA 5KMLA 4RX5A 2XEZA 5M55A 2VNWA 5D12A 5EDPA 4YSMA 4FKOA 5HG5A 4BDDA 4Z3VA 3Q4UA 3K5VA 4QTCA 4QPMA 1ZY4A 3T9IA 1U54A 2VTOA 5AV0A 4FV7A 3I7CA 1SVGA 3FQSA 3OZ6A 1OKZA 1FGKA 3E8EA 4JJRA 4OTHA 4FT5A 2X1NA 2UW8A 3PRFA 2Y4IB 1QL6A 3CGFA 2WTKB 3RNIA 1OL6A 3V3VA 5C8NA 3FMJA 3KXMA 5C8KA 5BUIA 2XNEA 1KE5A 3HV4A 2QKRA 4EOMA 3B8RA 3PYYA 4I93A 2W1EA 4QQCA 3GCPA 5K9IA 4BDIA 1PXMA 5L8LA 1YQJA 3RPOA 3O96A 2QOIA 2WMVA 2IZRA 2W9FB 4MXCA 5I9YA 2UVZA 4UV0A 5G6VA 3W8LA 3EZEA 4EYJA 1XH7A 1JBPE 2XIKA 4J98A 4XP2A 2QOKA 4LUEA 4ASDA 3QD3A 4DBNA 4HNIA 2DQ7X 3A60A 4ZS0A 3F3TA 3GTGA 4HCUA 2UZDA 3TUCA 2IJMA 4HYIA 1ZXEA 4QQTA 5M4UA 2DS1A 1B38A 2JKOA 3NIEA 4IVBA 4KIKA 5HBHA 1RE8A 4IX3A 3QXPA 2DWBA 5FP5A 4ZK5A 2CW0D 2UVXA 3SXSA 4HVSA 4ZZOA 4USFA 4UZDA 2CN8A 2X6DA 4DN5A 5HZNA 1QPJA 2EZAA 4K8AA 2HZ0A 4GMYA 5HKMA 3PVGA 4MD9E 1BL6A 3POZA 4FL3A 1Q8ZA 3OWPA 3U6HA 3H0ZA 5HVYA 4A9RA 1XQZA 2R3MA 4JAJA 3VS1A 4PPBA 4ZIMA 3VS5A 2OKRA 4RJ5A 5DPVA 5FGKA 3SC1A 2J51A 4AWIA 4D0WA 2FSOX 2NRUA 1PF8A 3HX4A 4WG5A 2WKMA 4YBKA 2WU6A 3QXOA 4C3RA 5CEIA 4YO4A 3UVQA 2QODA 2A4LA 4M67A 3E62A 3KRWA 1HOWA 4FTCA 3RGFA 4MQ2A 5JSMA 4D2WA 2E9OA 5CX9A 4RQVA 5DWRA 2UW4A 5DVRA 4BCJA 3VUGA 3BE9A 5EOLA 1PHKA 4HNFA 3SRVB 4Y85A 1YHVA 3OBGA 4YJPA 3PXFA 3DXNA 3MVMA 2EXMA 4QP3A 4UY9A 3BLQA 2ZM1A 3VBVA 4F6SA 4L9IA 4EZ7A 3EZVA 4QO9A 4E6AA 4CT1A 3DKCA 4FTQA 3IDBA 3O17A 4E7WA 3DJ6A 5C01A 2CLQA 4AS0A 4LGHA 3LPBA 3GP0A 2GNHA 1Y91A 4P5ZA 4AT5A 2GMXA 1Q41A 4LRJA 5TOZA 2Z7QA 2X6EA 3A7GA 1IR3A 1BLXA 4V2RA 3TTIA 2WTJA 2UZLA 5AP2A 5EM5A 1MP8A 3DTWA 4UWYA 3F7ZA 5BYZA 5JFXA 3GU4A 3GQIA 3Q5IA 3PJ8A 3DPKA 3Q53A 4X2FA 5KZIA 4IX4A 4FKIA 4FMQA 4DITA 2W4KA 3TNQB 4AT4A 4BDFA 5JRSA 3JVSA 5HE1A 3WZEA 3HV7A 3CQWA 3I0OA 4AE9A 2R9SA 2A27A 3DAJA 3EQBA 4LRKA 5LOHA 1WBTA 2ITUA 3BV3A 5DT3A 4DEIA 4AN3A 4K6ZA 2WB8A 4W4YA 4GU6A 3D5UA 3NNUA 4IM2A 3R7YA 3ELJA 3NW7A 5I3OA 3G9LX 4O38A 3ROCA 3LAUA 2XYNA 5AR4A 5I9WA 4GK4A 1ZYDA 4NH1A 4L68A 5EHLA 3VHEA 4PP9A 2HCKA 2W05A 3QHWA 4BDAA 5E8TA 3PE1A 2GS2A 2QKWB 2YDKA 4JAIA 4DEEA 2QHNA 4IANA 3R8ZA 3VBXA 2J90A 4GT5A 3BLHA 2XEYA 3NX8A 3MFTA 4HVDA 3ZLWA 4FNZA 4JDHA 3ZRKA 3C4FA 3LFEA 3CLYA 5A4LA 2BPMA 4EOPA 4D2TA 5KBQA 3V6RA 3QLFA 4KWPA 3II5A 2R3QA 3D7ZA 2ITWA 2XIYA 3SQQA 4B7TA 4IH8A 3P7CA 3Q4CA 2OJ9A 3ZUUA 1ZYMA 3S1HA 2X7FA 5ANJA 2XJ0A 4DGMA 2YABA 4C62A 4TWPA 5IA2A 4TXCA 4UWBA 3W33A 4R5YA 4BICA 4QMWA 4BCHA 2VGOA 2QU5A 3O2MA 4OBQA 3N9XA 4I21A 4WNPA 2XK4A 3W2QA 1PYXA 2NP8A 2JD5A 4IB3A 1DAYA 2C0IA 1GZKA 2NVXA 4M15A 4JVGA 4GUBA 3VW8A 3FQHA 3Q9XA 3PWDA 4DEAA 3CGOA 4J99A 1AQ1A 3ZH8A 4FUYA 1UA2A 3NGAA 3ORNA 5IEVA 2AC3A 3ZEPA 1PMNA 3EQIA 2Y6OA 5AM6A 5M44A 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