2X0QA

Co-complex structure of alcaligin biosynthesis protein c (alcc) with atp from bordetella bronchiseptica
Total Genus 209
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
209
sequence length
599
structure length
582
Chain Sequence
HPAEIVAHLQPEIWNKVNRLLVRKAISEYAHEWLLEPQRLGPGETPGFERFRLTLADGAQYDFDAQVMAMRHWRIPPESIVKTVAGVPAPLDALQFVIEIRDKLGLPVDRLPIYMDEITSTLHGSAYKHGRTTLGAAALARADYQTIETSMIEGHPSFVANNGRLGFDAEDYHGYAPEAATPVRLMWLAVHKDNAHFSCLSDMDYDSLMSEELGESAVTDFAARLREQGLHPADYYFMPAHPWQWFNKLSLAFAPYVAQRKIVCLGYGEEQYLAQQSIRTFFNISRPGKRYVKTSLSILNMGFMRGLSPYYMAGTPAINEYIHDLISADPWLRANGFRILREVASMGFRNYYYEAAIDTDTPYKKMFSALWRENPLTLIAPGQNLMTMAALLHVDPQGRALLPELIQASGLDAGTWLERYVDAYLTPLIHCFYAHDLVFMPHGENVILVIQDGVPVRAFMKDIAEESSILNPQVRLPQAAQRLAADVPEAYKLLTIFVDVFEGYFRHLTQILVETELMPEHDFWRLVAGRIAAYQQAHPQRLDKYRRYDLFAPDMIHSCLNRLQLANPNLPNPIACFRPSWL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Biosynthetic protein
source organism Bordetella bronchiseptica
publication title Co-Complex Structure of Alcaligin Biosynthesis Protein C (Alcc) with ATP from Bordetella Bronchiseptica
rcsb
molecule keywords ALCALIGIN BIOSYNTHESIS PROTEIN
total genus 209
structure length 582
sequence length 599
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04183 IucA_IucC IucA / IucC family
A PF06276 FhuF Ferric iron reductase FhuF-like transporter
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.274.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Enzyme I; Chain A, domain 2 Enzyme I; Chain A, domain 2 2x0qA01
1.10.510.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 2x0qA04
2X0OA 2X0QA 2X0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H3QA 3F3TA 1R3CA 3L9MA 4YJOA 3MJ1A 3E8EA 4F9BA 4K9YA 4E5AX 5JFSA 4I23A 1KE8A 4D5KA 4U40A 3UNKA 3F5UA 3TXOA 3ZYAA 2OFVA 4BICA 4C4FA 4L53A 2FA2A 4Q2AA 4FSYA 5HO6A 4MD7E 4YJSA 2CGUA 1U46A 5FLFA 3P7CA 5DVRA 2R9SA 3ORIA 3GCQA 3QA8A 4QP6A 1R0EA 4KKEA 1OIQA 3CY2A 3FMJA 3Q52A 4LL5A 1TQPA 1H07A 3E3PA 3O96A 5BVOA 3ET7A 3BYUA 4G2FA 4M7IA 5CSHA 3Q3BA 4O4BB 5ANEA 2A27A 3WIKA 5CEQA 1OKYA 3NUUA 2B4SB 4G3EA 3OZ6A 2N3EA 2W1IA 2WTWA 2UZWE 4I20A 3Q4CA 4KSQA 3R28A 4UWYA 4PMMA 2VK9A 3L8XA 4OTFA 1H0WA 2R5TA 4QP3A 3LXKA 4RIWB 3PY3A 4F6UA 4I5HA 3PA3A 1IRKA 4RVLA 2VWIA 3HMPA 3BWFA 5A54A 4X2JA 2R7BA 5CU2A 3G33A 3RWQA 3DNEA 2W99B 2PVMA 3MI9A 4EHVA 5CSPA 1M2QA 5AUXA 5HLPA 4BTKA 5A46A 3T3UA 4ACMA 2VTLA 3HL7A 3QX2A 2JDVA 3UVQA 4UY9A 2V55A 3FKOA 3KEXA 3F66A 2CGXA 3I60A 2O3PA 4R8QA 3ROYA 4J52A 2JBPA 2DS1A 2JA6A 4Y95A 3DT1A 3BE9A 5C27A 2XEYA 3OW3A 5CZIA 4QP1A 2WQEA 2PMLX 2JIUA 4E26A 3FL5A 4MXXA 4IAFA 5LVPA 4YO6A 5IU2A 3T9TA 1Y8GA 1SYKA 2HWOA 3UIMA 4PV0A 4AGDA 5CVGA 2WMTA 4DFYA 4FKQA 5CEPA 1H24A 1Q97A 3CKXA 5C01A 1TKIA 2AC3A 4WT6A 2X0OA 2YERA 3IDPA 5BX0A 2QVSE 2ZAZA 2YCFA 4UXQA 4XV3A 4M84A 4E4NA 4O38A 2FVDA 5DOSA 5JZNA 2C6IA 2YEXA 4OLIA 4NW6A 3AQVA 3CTJA 4V01A 4FV3A 2HYYA 3QC4A 4U44A 4MD9E 4XOYA 2QD9A 4RLLA 4AZWA 2Q0BA 1WAKA 3D5UA 4QNAA 3VQUA 4BDAA 5BVDA 3ZSIA 2C47A 3OBJA 2W5AA 1DAYA 3DLZA 3OUNB 1W27A 3U87A 4HCVA 4XP2A 4D58A 3KKVA 4JAIA 4YPDA 3NWWA 4C36A 3PY0A 3A60A 4F7SA 3PXRA 4FEQA 1UNGA 3BRBA 3O71A 4GK4A 5JEBA 4HGEA 3ZSGA 2VRXA 1YXUA 3EQIA 4QTBA 3NLBA 4P5ZA 3UQCA 4YJTA 2GMXA 4E6QA 2QOCA 3F5GA 1CTPE 4EOQA 3MFRA 4ZAUA 1MQ4A 3MPMA 4HOKA 4O0RA 4EBWA 2PUUA 3C13A 4FUYA 1XO2B 4I5CA 4MF0A 3BIZA 4BHZA 4X6RA 5EHOA 4D2PA 3EJ1A 4M69A 3QBNA 2YIIA 3V8SA 4FTMA 3BHVA 2Y0AA 3MVLA 4YHTA 2W96B 4JT3A 5CALA 4P90A 1WBNA 2QKWB 2JKOA 4JNWA 2X2KA 4IBMA 2K3OA 3R7OA 1FMKA 3EH9A 3EFLA 3DBEA 5EW9A 3FZRA 3OCGA 4FG9A 3R7YA 3G6HA 3KRWA 1XWSA 4NIFA 3RM6A 1RE8A 3BBWA 2YM7A 3QXPA 3TKIA 3VS4A 5AUTA 2JKKA 2YDJA 4AZSA 3ROCA 1H28A 4R7HA 1XR1A 4QMUA 1HCLA 3S95A 4WSYA 4BCOA 3Q6UA 2NO3A 4BDKA 3D4QA 2BHEA 3FKNA 5KE0A 3KB7A 3UE4A 1SZMA 1NVRA 1PXPA 5FQDC 4FVPA 4RA4A 4NFMA 4AZFA 4QP4A 3SX9A 1PY5A 4BBMA 4FIEA 5AAEA 5CQWA 4DITA 4IVDA 4NH1A 2HIWA 3RK9A 4CFMA 3WZEA 1IR3A 4MNFA 5IUGA 4MBJA 4PNKA 3BQRA 3FSKA 2VN9A 4AOIA 5HHWA 3R8PA 4WKQA 5CEMA 1EZAA 2W1EA 4EC8A 3HUBA 2HW7A 5AP6A 5I9WA 4ACGA 4KBAA 4TZRA 3BLHA 5IMEA 4EOKA 2MX8A 4C3RA 4W4VA 3R8ZA 4E1ZA 2OBJA 2AYPA 3R9HA 1M7QA 3F6XA 4BABA 4PDOA 2A4LA 1GAGA 4CEIA 4TTHB 4XH6A 4BCGA 4YU2A 4CKJA 1YI3A 5BUIA 4FSWA 3JS2A 1OKWA 5HO7A 4JAJA 5D12A 3R00A 4EBVA 2BDJA 3P5KA 3KXGA 3TEIA 5IEVA 5EK7A 3LHJA 3QGWA 4LOPA 2QOFA 4ZZMA 1I50A 3LQ5A 3A4OX 4AFEA 4K0YA 3H9RA 4JBPA 3HV7A 4HVHA 4XEYA 1WBOA 5TKDA 2O63A 5FXQA 3A8XA 5CF5A 4FL3A 4UMRA 2VZ6A 4FTKA 4KS7A 5G6VA 4RJ5A 4A9TA 1G5SA 3GTQA 3I4BA 4U43A 4I1ZA 2XK6A 4GIHA 5EM7A 3OCBA 5ACKA 2R0UA 4OTRA 5DR6A 3FL4A 3DK3A 4F7LA 5IF1A 2Z7SA 3RAKA 4KIPA 3AT2A 4HZRA 5J79A 1UU8A 3BYSA 1CDKA 3MB6A 5DH3A 3IW7A 4U7ZA 3HYHA 3ORKA 3BV2A 4IB5A 4RQVA 3ZC5A 5JT2A 3RCJA 1U59A 5I4NA 4L45A 5CVFA 4Q5HA 4HW7A 2AQLA 3GTGA 2JDTA 2QR7A 3GT8A 4QMSA 4ZTSA 3H0YA 3HX4A 4AW5A 1ZOHA 4CV9A 3N9XA 3GFWA 4BDGA 2Y9QA 4Z16A 5JFVA 5EYCA 3ALOA 3TKHA 4S34A 3S3IA 3R22A 1F0QA 4DINA 2VWWA 4CV8A 2FSMX 4BBEA 2QR8A 5CX9A 3VUTA 1WCMA 4DLIA 4GT5A 3TT0A 5M55A 4U6RA 5ANDA 5CF4A 1YRPA 5CAPA 1BI7A 3QUEA 4OTHA 2X4FA 1CKPA 4F9WA 3TCPA 1JKTA 2OF4A 2JKMA 3QYZA 1PXMA 3KCKA 3UO6A 3RPVA 4AZTA 2JAVA 4ZY4A 2VV9A 4MWIA 4E6CA 4FV4A 4S31A 4YZNA 2HXLA 1W2FA 4UWBA 4YZ9A 3CQZA 3IG7A 2UZDA 4LRJA 3F7WA 4GU6A 3FKIA 4LRMA 5IKWA 3B8RA 4FV2A 4MEDA 4IQ6A 1OIYA 3FMDA 4AA0A 2R7ZA 3G2FA 3ZTXA 4V2QA 3FC2A 3TV6A 4U97A 4M0ZA 2V0DA 3I79A 4AGCA 4EQUA 4PPCA 3AD6A 2C3IB 2QG5A 4BKYA 3SXRA 5CAOA 5JRQA 2H96A 5JGBA 3E93A 1H1QA 2C6DA 2PVRA 4YJPA 2JITA 4U9AA 4EYMA 5LVMA 5DNRA 3GCVA 3QYWA 5TR6A 1YNJD 5HG8A 2PSQA 3G0FA 1WVXA 2V22A 2BAQA 3O7LB 4JDHA 4AGUA 3V8WA 4C62A 3CTQA 3QU0A 5AUWA 3BQCA 5A14A 4ACCA 2ZDUA 4F09A 5K0XA 4ID7A 2RL5A 2WTCA 1JKKA 2XZSA 3GTPA 5CSVA 3UP7A 3CGOA 4YHFA 3RHXA 2XRUA 3HRCA 3SRVA 3QWJA 4K1BA 3PLSA 4FV9A 4RIXA 3D7TB 4TW9A 1XJDA 2KULA 4FIJA 5EW8A 4CCBA 5J9LA 2FGIA 2BMCA 3HUCA 3A61A 2Z8CA 4D4RA 4IC8A 4C5UA 4XOZA 3S00A 3RHKA 4BWXA 4W4XA 3I5NA 2ITOA 3DK7A 3K54A 4EOJA 4G31A 2RIOA 2WTJA 5L8JA 3QQJA 2ZVAA 1WFCA 2QC6A 2WMWA 2R7IA 3OROA 4BGGA 2F2CB 3F3ZA 3MH0A 4B7TA 3UIUA 4EK6A 4O22A 5IH6A 3M42A 3RMFA 3ZFXA 1RJBA 5J95A 2A19B 3EQFA 2YJRA 3BHUA 3L9LA 4WNPA 3MY5A 4O4FA 2ZM3A 4AW2A 2C1BA 2W4OA 3ALNA 2J0MB 2O65A 4FKSA 2I40A 5I9VA 3DFAA 2WHBA 3DAJA 2YZAA 1JQHA 4XLIA 2X39A 3OTUA 1ZARA 2IW9A 3KXHA 4FT3A 2OXXA 3W18A 5HGIA 3E5AA 4MVFA 3MVHA 1PF8A 5GJFA 4ANOA 2G9XA 3QTRA 1YXVA 4LYNA 1YNND 4O6EA 1ZZLA 3UDBA 1RQQA 4F70A 2GU8A 4EZ3A 4JDJA 4IM0A 2WIPA 2CDZA 4GFOA 3D14A 4M12A 5L2TA 5EM8A 2JGZA 4F1OA 4A4OA 3A7FA 1JVPP 1NVSA 2CN5A 1KSWA 2WEIA 5A4LA 1W2DA 4F9YA 3ACJA 4IX4A 1OGUA 5ETFA 4XG7A 4RZWA 5AX9A 3IONA 4QTEA 4RLKA 2YIYA 3OMVA 1YOLA 4Y5QA 4TYEA 4ZJJA 3G51A 1TWFA 2UV2A 4RQKA 5BYYA 2VTNA 5ETAA 4BWKA 2YCRA 5EM6A 3FQSA 3OXTA 2GFCA 1XBCA 2QONA 4RRVA 3AT3A 4RFMA 5BQ0A 2XIZA 4RX5A 4IC7A 3PPKA 5AR5A 3PPZA 1Y57A 1SNUA 2I1MA 3WZJA 1CM8A 2BIYA 2HZIA 3GU4A 4P2KA 4WHZA 4E8AA 4H1JA 4XG3A 3D94A 1DI8A 4YTHA 5KMLA 1UWJA 2A98A 4F99A 1QPEA 2JDSA 3DA6A 2C6EA 4QQ5A 3PJ2A 3Q5ZA 4NJ3A 4FV7A 2X8IA 4PQNA 4L3LA 2Y4IB 2W1ZA 4XBRA 1M2PA 2A6HD 1M52A 4IXPA 1ZOGA 3FZOA 4O27B 3ZOSA 5I9YA 4DFZE 3VS1A 5GZAA 5AV0A 4FTCA 4D4VA 4CFXA 4UX9A 3UIBA 3HRBA 1OL6A 3BHTA 4J99A 4PY1A 3SV0A 2WQOA 3FKLA 4QPMA 4O96A 3BEGA 4BN1A 4ANBA 4FSUA 4BL1A 4AS0A 2VTPA 4QMTA 4BDFA 1Q8WA 5I0BA 4ALWA 3ZMMA 5IEYA 1Q3WA 2BFYA 4O2ZA 5CEOA 5K4JA 3IW5A 5CAUA 2WMBA 2UVZA 2RFDA 2XJ0A 4M66A 3FLNC 3ZEWA 3LR2A 4JDIA 2ITZA 2C5OA 3S2PA 5FG8A 3VUHA 2XEZA 2LYIA 3NPCA 4KIKA 1H27A 3E8DA 2YISA 1Z9XA 2CGVA 1YKRA 3HEGA 5D1JA 2XB7A 4MBLA 4EJNA 4EOPA 4EZ5A 2FH9A 1XH4A 4AACA 3OT8A 5ANGA 4F6WA 3U6IA 3CQWA 4BVUA 4GG5A 4HYSA 2WXVA 2LPJA 4L6QA 4HVDA 3QCSA 4KKHA 3UYTA 3G0EA 4IFCA 4M3QA 3MW1A 3GCUA 3R1QA 4GEOA 2K3NA 5J7HA 1ZOEA 5FEQA 3UG2A 4OT6A 5CF6A 3EKKA 2WIHA 3U51A 4E4XA 1UA2A 1XH5A 4C59A 2QO9A 2VD5A 4FVRA 2XKDA 3ZRKA 3T3VA 2UW5A 4MBIA 3TIZA 3KK8A 3LZBA 4IAIA 4X2FA 3QHWA 4X7QA 4ZTNA 5HLNA 2NRYA 3QTIA 1XH7A 2V7AA 4DBNA 4JX3A 5J87A 4M97A 4ANQA 5A4TA 4LV8A 3V5PA 4RJ7A 3F2AA 4XG9A 1UV5A 1W2CA 3VW6A 3MYGA 4OUCA 4GVJA 3QZFA 3BGQA 4JIKA 4DGOA 2QOQA 2WMUA 5JGDA 5FWKK 4NCTA 5E8UA 3POZA 1GZOA 2A69D 2I0YA 4NEUA 4V2RA 4EOSA 4ERWA 4RPVA 1UU7A 4FKUA 3GU7A 4XS2A 1YDRE 2PZYA 5CVHA 4IH8A 3P1AA 5HIBA 4DEEA 2P55A 1FGIA 4ONAA 3WI6A 3KXMA 4PMTA 3QZGA 4G3GA 4QRCA 4FIIA 5HVYA 2Z7LA 3GBZA 3UVPA 3ZXTA 1QL6A 4UWCA 3EQPA 3UOLA 4X2KA 3SXSA 1Q24A 4X3FB 3ENMA 3RWPA 4IX5A 3S4QA 4PF4A 4MQ1A 5CSXA 2J9MA 4ZSAA 3EZEA 5DT4A 3KF7A 4L7FA 4O1OA 4MTAA 3UBDA 1ATPE 3LCOA 4I41A 4RJ4A 3FBVA 3GU8A 4JR7A 3GC7A 4WIHA 5KMOA 3KULA 4G3CA 5EHLA 3W55A 2F49A 2QURA 4N6YA 4B99A 3RK5A 3NAYA 1H1WA 3R01A 3TTIA 4BYJA 3QKKA 3VW8A 2HOGA 4ANMA 3KXXA 2CMWA 5HLWA 5J1VA 4G5JA 2OH0E 1SNXA 3DS6A 1PKGA 1P4FA 2I0VA 1TVOA 3QTUA 4RG0A 1L3RE 1XH6A 4IB3A 3FLWA 1ZYLA 2R3RA 2WU7A 3HV4A 3EN5A 3A4PA 4U45A 4AUAA 1X8BA 4B8LA 3O17A 4E3CA 4F0GA 5ANIA 4JBVA 5B0XA 4OW8A 2ITUA 3QLFA 4KBCA 2IN6A 2QCSA 3LJ0A 3RPYA 3HDNA 2ESMA 4BF2A 4USEA 4R1YA 5HNIX 4QMPA 2C6LA 2OK1A 3DAEA 3ENHA 3VULA 4BTFA 3SW4A 1Z5MA 3ZRMA 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