1IA9A

Crystal structure of the atypical protein kinase domain of a trp ca-channel, chak (amppnp complex)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
YYYSAVERNNLMRLSQSIPFVPVPPRGEPVTVYRLEESSPSILNNSMSSWSQLGLCAKIEFLSKMGGGLRRAVKVLCTWSEHDILKSGHLYIIKSFLPEVINTWSSIYKEDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSPRFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLAFSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEKRSCDMVFGPANLGEDAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Crystal structure of the atypical protein kinase domain of a TRP channel with phosphotransferase activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL-RELATED PROTEIN
total genus 87
structure length 276
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2001-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02816 Alpha_kinase Alpha-kinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel Protein kinase-like fold MHCK/EF2 kinase 1ia9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1ia9A01
3VUIA 1VEBA 2XNBA 1OBGA 1SZMA 3V5JA 3BLRA 5HNGA 5L3AA 3NUSA 2J2IB 5H8BA 5L6PA 4ZLOA 2B54A 5IEXA 2YM5A 2W7XA 3PFQA 4Q5EA 1WVYA 1Z5MA 3BGPA 4IWQA 3BGQA 3QRKA 4FTUA 4IAZA 4CTBA 4CCUA 1J7UA 5AAEA 3KULA 3PIZA 2X7FA 1W84A 4IZ7A 5CEPA 5IEVA 3BE2A 3PE2A 4RFMA 5LVLA 1XWSA 2PY3A 3UP2A 4HYUA 2PZRA 3MVMA 3NW5A 5BMMA 1JSUA 4KBKA 4BBMA 3BQCA 4KBCA 4DEIA 2QQ7A 2X0GA 4QP7A 1ZYCA 3C9WA 4FSZA 5J1VA 4RIOA 4MXOA 4QQJA 3CGOA 1WBTA 5DFPA 5AV1A 4M84A 3POOA 4QMYA 3TG1A 5CU6A 3ZM9A 4J96A 2XCHA 3QRJA 4C33A 5IMXA 4U6RA 4XH6A 4DYMA 4F99A 1ZZLA 4RWLA 5M56A 4I21A 4XEYA 2JIUA 3B2WA 2QVSE 3FMEA 4DF3A 2C3KA 2W5AA 2FSTX 2VTOA 1KWPA 2YACA 2Y6OA 4Y72A 5F4NA 1XQZA 4X2NA 5HLNA 4ERWA 5EM7A 3GXLA 3GCSA 3PVGA 5M44A 4PP9A 2RKUA 3FHRA 3HP2A 2Z02A 3E7OA 5AP2A 4IWOA 4ZTHA 1CSNA 5E8UA 4AW5A 5H2UA 2ZV2A 4QP9A 3R8VA 3LFAA 4FK6A 3NUNA 3T3UA 3QQJA 4OBPA 5JFSA 2XB7A 4G3DA 4HYIA 5FM2A 4O0YA 4BDAA 2BALA 5CF6A 4CTCA 4EH8A 4O21A 5E92A 2UW4A 1R0PA 2WTVA 3QUEA 4ZOGA 4F9YA 2WEVA 2UW8A 3UOJA 3OTUA 5LCJA 2F2CB 1H1PA 4AA0A 4Y46A 4JR7A 3KXMA 5F95A 3EHAA 5HGIA 3LLAA 3S00A 2Y4PA 3E92A 4F7SA 3ZEPA 3DGKA 3MH2A 5E4HA 4K6ZA 5K4JA 5BUIA 4D4SA 5CEOA 3VBVA 3FMJA 4B6LA 3H9OA 4IANA 4IC7A 4DCEA 4WUAA 3RPVA 3TZ9A 3W2RA 4JLCA 4KUJA 2YM8A 4FI1A 3ZRMA 4DFBA 4I41A 2HENA 4YZNA 2J9MA 1JBPE 3KRWA 3TXOA 2GNHA 4BIDA 4C35A 3QHWA 3KULB 4GK3A 2KTYA 1YDTE 2DWBA 4QNYA 4DC2A 2F57A 2DYLA 3C5UA 1KE6A 4GEOA 4O6EA 4QP1A 4QTBA 4F6WA 4XNEA 2FVDA 3FLZA 2W96B 4E4NA 3BBTB 5BUEA 4O7YA 3NYXA 2HY81 2VTHA 5HG8A 3V5WA 4EK6A 1OIQA 4FGBA 2IZTA 3P23A 4M0YA 4BTMA 4DGNA 3FLWA 4O6LA 3ZO4A 4PDYA 4O7TA 4HGTA 3UO6A 4EQUA 5HTCA 3ATTA 2GDOA 2ITWA 3PA4A 4RJ6A 5FEEA 4D1ZA 3LJ1A 1J7IA 5E8VA 4EC8A 5K9IA 4MD8E 3I6WA 2XJ2A 3QTZA 2OZAB 3OMVA 3RK5A 4F9BA 4BDEA 3SXFA 2XZSA 3CJFA 3WF7A 4ZZMA 4FR4A 4NFNA 5IA1A 5IH4A 3LCKA 4O0TA 3ZS5A 3TT0A 2OU7A 4TN6A 3M2WA 4TY1A 3V5TA 3FLNC 5HZNA 4XRLA 1JSVA 3O8PA 4AACA 4XP0A 2CKQA 4F6UA 2VTPA 1YHVA 3FWQA 1ZMUA 3Q6WA 4FV3A 4FV8A 4ERKA 2ERKA 2HZ4A 4FSTA 5CSXA 4H05A 5AUTA 3R01A 2IO6A 1K9AA 4DH8A 1E1XA 5ACBC 4KBAA 2VWYA 4YJNA 4TPTA 3F6XA 4FVPA 2XRWA 3HMNA 4FZ7A 2QU6A 5F20A 3TJCA 4C0TA 3B8QA 3H0YA 5FG8A 3QC4A 4UYAA 3Q4UA 5IF1A 2X8EA 4TNBA 3TKIA 2UZEA 3BEGA 3NLBA 2CLQA 5CSHA 4QRCA 5BNJA 4G16A 2BR1A 4GT3A 5BVNA 4D55A 4DEHA 1QPCA 3HDNA 5IQIA 4X3FA 3SQQA 4F09A 4F7JA 3QQHA 5LXMA 3JVRA 3EL7A 4U97A 3R9RA 5EKNA 3PG3A 5JFXA 3VS7A 1XH5A 4H58A 3OVVA 4EJNA 3NUUA 3RWPA 2QONA 2R3RA 4W4VA 3W1FA 3Q32A 2VTSA 4GJ2A 4U3ZA 4OUCA 3SGCA 3R71A 1PXMA 5FEDA 1PXJA 5D1JA 5D11A 3LAUA 1H4LA 2Y8OA 2BTRA 4YLJA 2UW0A 2VGOA 3DFAA 4G5JA 2VWUA 3BKBA 4BDKA 1QPDA 3C4ZA 1LEZA 2UW5A 3SA0A 2A2AA 1QCFA 2WMVA 3K2LA 5HIDA 3VAPA 3KXZA 1A06A 4AZEA 5HO8A 3LFQA 1OMWA 1YDSE 3VBWA 1Q8ZA 4TKSA 2CGUA 4CKRA 3EOCA 3R1YA 1Y6AA 3KK9A 4UXQA 2WU6A 3DCVA 4CSVA 3E5AA 3MIYA 4FKSA 3RTPA 3UP7A 5IZFA 1XH4A 3PVUA 4CFMA 4YC6A 3FHIA 5KKRB 2C5OA 5KE0A 5HESA 2ZJWA 1PXOA 3GC7A 3O17A 5A6OA 3DQXA 3CKWA 4I5HA 4USEA 2YIQA 5FTGA 5ETIA 5AX9A 3OCGA 4YUQA 3GT8A 2HXQA 3FMKA 2ZB1A 2XH5A 3BHTA 4MQ2A 5JK3A 2OIBA 3MYGA 1NVRA 3LZBA 4GV1A 4FV7A 5EDRA 4R7IA 3P08A 1OIYA 1ATPE 3M42A 3F3VA 3OWJA 4FG9A 4XX9A 1JVPP 3HGKA 3EKNA 3QLFA 4CT2A 4ANBA 3KEXA 2DQ7X 3D7ZA 4YJQA 3EN7A 3EN9A 3QUDA 2WMSA 4TTHB 1FVTA 2H6DA 5HEZA 4EUTA 3U9NA 4C4IA 4GIHA 2C5NA 4MKCA 2GFSA 4NT4A 3MWUA 3CPBA 5EKOA 2C5XA 4FSNA 3GFEA 5A46A 5LMKC 2FB8A 3HL7A 1Q3DA 2WQNA 4NW5A 5CZHA 5CX9A 2ZMCA 3F88A 2VNWA 3EKKA 3FI4A 4O2ZA 5AV3A 5J95A 4I4EA 4L9IA 4Y5QA 3V8WA 3ACJA 1WBNA 5H9BA 2VTIA 4OGRA 1J3HA 4FX3A 1KE5A 3SW7A 3FI3A 3O2MA 5A6NA 4UYNA 3R7IA 3NEWA 3ENMA 4X3FB 4O0VA 4LGHA 2HWOA 3R0TA 2BFXA 4G3GA 1J91A 5EI6A 4ZLZA 3MY1A 2WXVA 3UQGA 3F69A 3O7LB 3HAMA 3MVLA 5EW3A 1CKJA 4NFMA 2PUUA 4YMJA 3LQ8A 3MSSA 5BVDA 2E9UA 3U54A 5JZNA 2JKKA 4GH2A 3I0OA 4EEVA 3O7LD 5EHLA 3VJNA 1Q41A 3ANQA 3OXIA 3KY2A 1W0XC 5HTBA 3PXYA 3DZOA 1OGUA 3IW4A 4RX5A 5FDPA 1P2AA 4YLLA 1ZY4A 3E7VA 2EUFB 5CF4A 2W99B 1ZRZA 5DA3A 4BGGA 1O9UA 4B8LA 5ANOA 3EMGA 1BI8A 3VRZA 3R8UA 2XK7A 3P86A 2YM6A 3IOPA 1AD5A 5IQEA 3BLHA 4DTKA 4KRDA 5BPYA 5BVKA 3S95A 3LKMA 1ZMWA 3HX4A 4P2KA 1M7QA 3QD4A 4RIXA 4GL9A 3COHA 4V04A 3WF6A 4HCUA 5T3QA 2UZLA 2R3KA 1SYKA 5JFWA 4QP8A 3QD0A 3FMMA 3POZA 4GKHA 5IA0A 3DFCB 1UNLA 2F2UA 3VUKA 3AC2A 3KF4A 4R5SA 2YCRA 5CI7A 3VS3A 1CKPA 1KE7A 3OZ6A 4K33A 3ATSA 4TWCA 4F64A 2X4ZA 1W8CA 3FKOA 2ITQA 4FTMA 1GY3A 4PL4A 3OWKA 3TZ8A 3O0GA 2ITPA 3P0MA 2BZJA 3R22A 2PE2A 4FODA 4OTHA 2I7QA 3BU3A 3RVGA 2C3LA 3AT2A 2JFLA 2VN9A 3CCNA 4IB0A 3TEIA 3ORMA 4PNKA 2ITVA 2Y7JA 5JRQA 4FL1A 3WZEA 4FTIA 4ITHA 3E93A 2GTNA 2WTIA 2RFDA 2JDSA 3TDWA 4F6SA 4D1SA 2HCKA 3UG2A 2R2PA 3UVPA 4J95A 4JDIA 4C61A 3ID6C 3V04A 3OUKA 5IUHA 5GHVA 2C4GA 3RHXA 2XJ1A 2ITZA 4QT1A 4BZDA 3JXWA 3SLSA 1PY5A 4ENXA 3ZEWA 3LQ5A 2R3FA 3V5LA 5CU3A 2RIOA 4PTCA 3PIYA 4X2KA 4M8TA 4IAFA 1UWJA 3F61A 3QWKA 5HU3A 4I0RA 4BI1A 3DBFA 3FC2A 5C1QB 1WZYA 3EIDA 2ITXA 5CTPA 3VUDA 1ZOGA 5IU2A 4AZWA 4HVIA 3ORXA 4HOKA 3R7EA 3ZBXA 3JPVA 2I1MA 4N70A 4NCTA 2Z7QA 5HE3A 1REJA 3Q96A 3QCYA 4L6QA 4DA5A 5AEPA 5M4IA 4FTKA 5IH6A 4RVMA 4ZS4A 5HICA 3BV2A 5AP4A 3ZH8A 5JMSA 3OS3A 4JAJA 2OGVA 4CRSA 3NMUF 2PZYA 4RT7A 3MW1A 4O7VA 3PYYA 3RPYA 3D5UA 4FT5A 1JNKA 4D2RA 3DXNA 4RIYA 4Y83A 4HGLA 1JSTA 2CJMA 2W0JA 4FKRA 2VO6A 1ZARA 3KA0A 4C3RA 5CY3A 4JXFA 3DJ5A 4BKJA 4N6YA 4O38A 3CE3A 3TL8A 4ACMA 4GFOA 4E73A 3A8WA 2OJ9A 4BDFA 3ZFMA 3GP0A 1A48A 3BIZA 4EOSA 4GFMA 4MYGA 3UVQA 2QLQA 5LJJA 2R3MA 1ZOEA 1FPUA 4HGEA 4RJ4A 3U6IA 3ULZA 2CN5A 3LCSA 3O71A 3W2OA 1SM2A 2FSOX 2VTJA 4O0WA 4O7SA 5DE2A 5E8SA 4FL3A 3LCOA 2YM7A 3EYHA 4ZEGA 1PRYA 4C2WA 2ETKA 1G5SA 4QMQA 1NT2A 5B2KA 3C4XA 5KMIA 4IFGA 3FQHA 2PU8A 4X0MA 4O82A 3F5XA 3C0GA 2ZVAA 4RJ8A 4CEGA 4CCBA 3BCEA 1ERKA 4FTQA 4YHFA 3P79A 1TQIA 4YZ9A 2QCSA 2A19B 3NAYA 3QXPA 5HNBA 3BI6A 4YO4A 3FXZA 4EORA 4RJ7A 2PVMA 1JLUE 3R1QA 4GYGA 4YSJA 2XP2A 1JWHA 4QMSA 2RG6A 2VZ6A 4LUDA 4O7ZA 3I4BA 4E4XA 3C13A 4AZVA 5KMLA 3C4FA 4ZMEA 1MQ4A 2X6EA 4FT7A 1OKZA 3OY1A 2JDRA 1ZY5A 4JG6A 4RRVA 3VUGA 3WE8A 2R3IA 1LR4A 3HV7A 4A4XA 2BTSA 2OIQA 4L42A 4AW1A 1R78A 4CFVA 3QU0A 4WT6A 4LFIA 2C0TA 2EB3A 2GHLA 4Q9SA 1JKTA 5I9YA 3ORNA 5AJQA 5C26A 5GJDA 1J1CA 4IAIA 1MRYA 1YOMA 2R3HA 5D10A 5TF9A 3DK7A 4FIGA 4DEGA 1V1KA 4X21A 4HVDA 5CANA 3D94A 4AF3A 3UQFA 5GIOE 3CC6A 1ZOHA 5CF8A 3P7CA 5AUXA 2UVZA 3AT4A 3C4EA 3L9LA 3R2YA 3GU6A 3COIA 4F08A 4I6BA 1Y8GA 4PRJA 2W17A 3UQCA 1RQQA 4FSQA 3NNWA 4QPSA 4RIYB 2WAJA 3DJ6A 4U41A 5DT4A 3NNXA 3FPQA 3M11A 3C7QA 3CLYA 4BI2A 3QZFA 4FT3A 2XK6A 4E93A 2OJIA 5BUJA 3OW3A 2ZDUA 3ZSIA 4QYFA 5DI1A 5K5NA 4FKVA 4IBMA 3SDJA 3F5PA 3KC3A 3QA0A 2Y4IB 4X2JA 4F1MA 4J71A 5DRDA 4O7RA 4C4JA 3QZIA 4FT0A 2VWBA 2QOFA 2ITYA 3GENA 5CAPA 1DAWA 2XUUA 1URCA 4H1JA 4JNWA 4UBAA 5LCKA 3SVVA 2QKWB 3VIDA 4R7HA 3PA3A 1LEWA 3PSBA 5HD7A 2UZVA 5LMAA 4PMTA 4TW9A 3QTSA 4PL5A 2VX3A 3G5DA 3H0ZA 3UPXA 3LFBA 3G9LX 3SC1A 2BDWA 3S2PA 3UO5A 2WOUA 4GG7A 2XNPA 4L43A 4K18A 4I6FA 3Q04A 1H00A 2XM9A 1UNGA 3PJ8A 4J97A 4WNKA 4IFCA 4KKGA 4F4PA 5JQ8A 4G9CA 2OKRA 3HAVA 2VAGA 4HNIA 3I81A 4JQ7A 2QLUA 3UBDA 4A06A 3UIMA 5LVPA 3F2RA 3QQUA 4QYEA 3ZZWA 3F3ZA 3KRRA 3NVKI 2WIPA 3NUPA 3NYOA 2REIA 4FNXA 5IQDA 4F63A 2R4BA 3L9MA 3MTFA 4LV8A 3S4QA 4LUEA 5DGZA 1T45A 2Q83A 3UZTA 2X9FA 3E3PA 4NK9A 5HI2A 5GJFA 3RGFA 4UZHA 4IWDA 4IW0A 1LUFA 4CLJA 4RSSA 3IS5A 1MRVA 4ZS0A 2BZHB 4MAOA 1JKKA 2BUJA 3O8TA 4GT5A 3AGLA 4IVBA 3GC0A 2QHNA 3PTGA 4LQMA 3DXPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1IEP A;  5M51 A;  5HQ0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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