5M08A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis pkni kinase domain, c20a_r136a double mutant
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
256
structure length
247
Chain Sequence
MALASGVTFAGYTVVRMLGASAMGEVYLVQHPGFPGWQALKVLSPAMAADDEFRRRFQRETEVAARLFHPHILEVHDRGEFDGQLWIAMDYVDGIDATQHMADRFPAVLPVGEVLAIVTAVAGALDYAHQRGLLHADVNPANVVLTSQDQRILLADFGIASQPSYPAPELSAGADVDGRADQYALALTAIHLFAGAPPVDRQPPKLSAFRPDLARLDGVLSRALATAPADRFGSCREFADAMNEQAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
publication title The crystal structure of PknI from Mycobacterium tuberculosis shows an inactive, pseudokinase-like conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknI
total genus 71
structure length 247
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m08A01
2A2AA 4WO5A 1WFCA 2JIVA 3CP9A 5LARA 3UOHA 4C4EA 3R2YA 5FDXA 2P55A 3KULB 3LCKA 4D1SA 2B7AA 5J8IA 3ZOSA 3GCVA 4RC2A 2WFYA 2YHVA 4LOPA 1QMZA 4I5PA 4AGWA 3ENHA 2W1ZA 2OFUA 4PX6A 2XNBA 2QG7A 3PPZA 4EUTA 4OTRA 2VTLA 1A48A 4RVMA 4M12A 4FEWA 2IZRA 1H24A 2OKRA 3OBJA 2CGXA 3PY3A 2XBJA 3C50A 2C6LA 3LFCA 2IZTA 3QRUA 4YBKA 3CR0A 2VAGA 3BWFA 3RTPA 3ZO1A 3OWJA 3OY1A 4FTCA 1QPCA 3GU8A 4IC7A 4O96A 4TWNA 3ZDUA 3PPJA 2YIRA 4I0RA 3CPBA 2YDKA 3U6JA 4KRCA 4EJ7A 4YZDA 2YDIA 4RX8A 5ANDA 2Q0NA 1PYEA 2ZDTA 3EFJA 3FI8A 3FLWA 4V0GA 4DFXE 3PPKA 3G33A 2QD9A 3A8WA 3QZIA 5M08A 2F9GA 4YHTA 3FY0A 1MP8A 4R7IA 4O7NA 4FVQA 5DVRA 4OBPA 4IVDA 4KSQA 2AC3A 3ODYX 3WZEA 4CFFA 3QTUA 3SXFA 3LQ5A 2VO3A 3NZ0A 4RBLA 4U8ZA 4XP3A 3V04A 2XKFA 1UNLA 2PTKA 5EHYA 4EHZA 3QZFA 2YITA 1ERKA 3TV7A 2ZV8A 3UQFA 3CSVA 5CU6A 3BU6A 1GY3A 3HMNA 4E7WA 3H30A 5CSPA 3RPYA 4GG5A 5IEXA 4RLKA 1XQZA 1YI6A 2YM6A 4TRLA 4II5A 3VS7A 4IW0A 4C33A 5D10A 3QZHA 4FTTA 4F6WA 3VUDA 2BHEA 1VYWA 2E2BA 4YNOA 4CT2A 3WOWA 1P14A 1Z57A 3ZZEA 4GKHA 4RFMA 2X9EA 4DT9A 5CXZA 4AX8A 4YR8A 2OJIA 1IAHA 4ARKA 5HIEA 5EM8A 4HCVA 4G6LA 3F2RA 3I0OA 2REIA 3OCTA 2PZRA 2Z8CA 3LCOA 5LMKC 1LEWA 5EQEA 2XM9A 2OGVA 3AC3A 3DQXA 4FVRA 4QYHA 4AGCA 1YRPA 3D2IA 3LXLA 3ROYA 1ZZLA 3PXZA 4RFZA 2PZYA 5BPYA 4FGRA 4H3QA 2GNGA 2JKQA 4LMNA 4FKOA 5HE1A 3D5UA 4CEGA 3TZMA 4D9UA 3E8CA 4S33A 2P2HA 2OU7A 4PWNA 3U9CA 2BZIB 4GJ2A 2BRMA 5EYMA 2QOOA 3F61A 3BKBA 3A62A 2UVZA 3D5XA 3GT8A 3V5LA 3QALE 4PP7A 2WMWA 2YACA 4YBJA 3NVMB 4EOQA 4EZ3A 3B8RA 1PXPA 2WMBA 3TN8A 4ZZOA 3UVPA 1KE8A 4IB0A 4IM3A 1DI9A 5CVGA 4G34A 3NNWA 4C3RA 1G5SA 4UXLA 2JKMA 3OVVA 3GBZA 3FHRA 5BX0A 4QYEA 2UW7A 3TJDA 3T3UA 4XUFA 1H1WA 2C5VA 3SVVA 2AUHA 4N57A 4CRSA 2IVTA 4IZAA 3GC8A 3E63A 5FRIA 2ACXA 3UO5A 5KMOA 2GNIA 3PLAE 1OL7A 4E6AA 4FIGA 1YOMA 4X21A 4F63A 3MS9A 1R3CA 5BMSA 1Q3DA 4FV2A 5KMNA 1Q3WA 3TNQB 2JITA 4A9YA 3W55A 5LMAA 3P7BA 4HNFA 4R7HA 3BE2A 2E9UA 4LGHA 4LYNA 3W1FA 3FXXA 4QMVA 4ZJJA 4TXCA 1IEPA 2OIDA 2QODA 3PIXA 4K77A 4JQ8A 5CQUA 3NNUA 4EUUA 5JGDA 3C4EA 3LHJA 4GFOA 2R3MA 3LJ0A 5CAQA 1O6LA 2VU3A 5M4IA 5AP5A 3TDWA 3G0FA 5JFWA 4BGHA 3D4QA 3O96A 4PNIA 1M2RA 4AG8A 2P3GX 1KE6A 3ORIA 4QMQA 2ZB1A 1OPLA 3FKOA 4QYFA 3SG8A 1OIRA 4DTKA 2X39A 2UZLA 2PZ5A 4KKGA 5HG5A 3U8WA 4BDIA 4D2RA 1WBOA 3ENMA 5FP6A 3R8ZA 3L8XA 4UY9A 5CANA 4FK3A 2VTSA 3VS5A 4QP6A 3R9NA 5C4KA 2V5QA 1TQMA 2E9VA 4FSTA 5KMLA 1AD5A 3RK7A 3OMVA 4L00A 1NVSA 1SM2A 2UUEA 4C34A 2WXVA 3ET7A 2A19B 1TVOA 3P79A 4HPTE 3WIKA 4IAFA 3GC9A 3HNGA 1U54B 3FKLA 4XG7A 4YJUA 3EQCA 1H07A 2PL0A 4AFEA 1WZYA 3E62A 4FIEA 3CS9A 4RX7A 4QTCA 4CSVA 3NYVA 4GV1A 1KE5A 3QRTA 4QTAA 1T45A 4YSJA 3TV4A 4MWHA 2ITVA 1Z9XA 1V1KA 4Q9ZA 4ITIA 3NCZA 5BVFA 3JR1A 5E8SA 1G8AA 4DFUA 4O0RA 2ITPA 2QOQA 3FI2A 3FHIA 5I9VA 2V7OA 4MF1A 5HIDA 2W4JA 5DT0A 5HZNA 2WQEA 3N51A 4EK4A 3GQIA 3KEXA 5HG8A 3OP5A 4DEDA 3SOAA 1WBNA 4PTCA 3H3CA 3EQHA 5DA3A 3SXSA 4DBNA 1CSNA 4X3FA 5CWZA 3HGKA 3T8OA 3UYSA 2XCHA 3ERKA 4AW5A 1ATPE 2XYNA 4EOIA 4I0SA 1U59A 1JSVA 3R7VA 2IW6A 2R3FA 4JG6A 2XF0A 3I4BA 4M97A 5E8UA 1YXTA 3W8QA 4AOTA 4LRJA 4L43A 4ANBA 2C5NA 2O63A 3HVCA 5M51A 3D15A 3CGFA 2GDOA 4ZLOA 3QTWA 5G6VA 2A4LA 4QMSA 3I1AA 4I93A 3QLGA 1YDRE 2W17A 5AUXA 1UNHA 5JN2A 4FV5A 4WG4A 3DCVA 2Q0BA 4HVHA 3A2CA 4FUXA 4EBWA 2F7XE 5LVOA 3MVHA 4TZRA 4B6LA 1LEZA 3RAIA 3FYJX 2Y7JA 5AUYA 3UO4A 3NMUF 1OKYA 3IG7A 4AUAA 4ZOGA 2IN6A 4QMTA 3RZBA 2F49A 3E3PA 3GCPA 4C61A 4QMXA 2WQBA 3ORMA 4X2FA 5EI6A 2XUUA 3NUSA 4BIEA 4EJNA 4EOJA 4X7QA 1X8BA 4I94A 4DH5A 2RFNA 2XRWA 4K6ZA 2BAJA 4F1OA 3DY7A 2O8YA 2P33A 5L3AA 2VNYA 5E8ZA 3FI4A 3FMLA 4JQ7A 4QPAA 4YJNA 4JXFA 4IVAA 3SDJA 3A8XA 4FTAA 4EH8A 2G1TA 2OWBA 5CASA 2JEDA 3AC5A 4MHAA 2B9IA 3BU5A 4IIRA 2BKZA 2LGCA 2OG8A 2RFDA 3MB7A 3DXPA 3FLNC 5L8JA 4IX6A 2EXCX 4D0XA 4O38A 5K5NA 2WMQA 1RJBA 4G17A 4U42A 2PWLA 4WG3A 5D41A 4GYGA 1YOJA 3D7TA 4RC4A 4I21A 3U4UA 5F20A 4PDYA 3ZBXA 4I6QA 4CV8A 2AYPA 4EH4A 2VTIA 3IOPA 4FTOA 3HZTA 3VUHA 5J1WA 3AXWA 5IMXA 3MW1A 4V0GB 1ND4A 5M56A 3FC1X 4C4HA 3II5A 3RK5A 4ZJVA 1OKWA 4ZY4A 5HLPA 1Y6BA 1QPDA 2YDJA 3G90X 3N4UA 1XH8A 3F3VA 1SNUA 2XIRA 3NDMA 4XBRA 4MQ2A 4FV6A 3ID6C 3L9PA 1J7UA 4B0GA 3GU7A 5CY3A 5CF6A 4G5PA 3NW5A 5CT0A 3QCXA 4GK2A 3TT0A 5DOSA 5AUVA 2B52A 1UWJA 3OF0A 5F4NA 5IQDA 3ZSHA 1FVRA 3RK9A 4F1TA 1H28A 4E4NA 4FV8A 4ANQA 2UW4A 2PMNX 3QYZA 3UC3A 3S0OA 2BTRA 3WZKA 4B99A 1Y8GA 4BC6A 3GCSA 4BDBA 4FC0A 3UPZA 5HG7A 3R8LA 2WTDA 3H9FA 4JS8A 4M0YA 4FIFA 4MXCA 4FT9A 4XOYA 2BDFA 4PQNA 4AZSA 3HV3A 4FSNA 3CQEA 4IX5A 2PVYA 5AA8A 1J7LA 4N70A 3DKGA 4YP8A 3FBVA 3MVLA 3ZTXA 2IPXA 3S00A 5HEZA 3VHEA 2C3LA 3EJ1A 3NUXA 5AAGA 4C59A 2A0CX 5A4QA 2XJ2A 3BHVA 5GIPE 1ZY4A 5DT3A 4O86A 3LFNA 3C4FA 2VX1A 4JBVA 3UMXA 5E7RA 4IWOA 4DE4A 3BZ3A 4YUQA 2C6TA 4P2KA 4RIYA 4D2SA 3P86A 4IDVA 1WBSA 2GNHA 3VBWA 3E3BX 4DG2E 5AM6A 2WTVA 3JUHA 1HCLA 3LQ3A 5DNRA 5A6OA 2DQ7X 2HYYA 2XNPA 3FEGA 3OUKA 3PJCA 4O91A 4CFMA 5GINE 2CCIA 4XG2A 3DTCA 4DYMA 4ZMEA 2PMOX 4YTHA 4ENYA 3ZC5A 3P1AA 3L8PA 3VJNA 1B6CB 4JIAA 5IQIA 4O0WA 2XNOA 1PY5A 4ZS0A 2UZEA 3AT2A 3G6HA 3SRVB 2OXYA 1W8CA 3LXNA 2DWBA 2G9XA 4DEEA 2BAKA 4QMMA 1PXJA 4D9TA 1OMWA 2CN5A 2ITTA 3DBCA 4X6QC 1SVEA 2IO6A 3V6RA 4FNZA 5M06A 5JMSA 5CZHA 1KE7A 4AOIA 5KX8A 2DS1A 3ZLXA 1ZYCA 2UW3A 1FOTA 4ONAA 2DYLA 2YWVA 3FMHA 2O0UA 1T46A 3KXXA 4DBXA 1JNKA 4K33A 4XLIA 4Y5HA 5LCJA 4L3PA 5CEMA 4F9CA 1Q99A 3PRFA 2C0OA 2VV9A 1ZZ2A 2J51A 3F6XA 3GU5A 4F99A 3WF5A 2GQRA 4BCOA 4F0IA 2XVDA 4M68A 4FV7A 2A1AB 1GOLA 4LV8A 2HW6A 5M44A 5ANJA 2X4FA 3KFAA 3KRRA 1FMOE 2QOKA 4YNEA 4EZ5A 5J7HA 4C4IA 1BI7A 4WOVA 3HRCA 3OCBA 2WQOA 5E8XA 3FXZA 3VS6A 3ZO2A 3KXHA 3KN6A 2BZKB 4I4EA 4NM5A 3I0QA 3ZBFA 3QA8A 2XKCA 1RDQE 4FL1A 4X3JA 4X6RA 3AD6A 4YSMA 2W1DA 2B9JA 2FSTX 4FGBA 4TW9A 3MA6A 5HCYA 2OO8X 4GS6A 4J96A 2PVHA 3ZEWA 3QCQA 5H3QA 4MX9A 3ZMMA 3DDQA 4FT3A 3R63A 4DCEA 4EQMA 5L2WA 2IW8A 2CDZA 5CF5A 4OT6A 4DLJA 4RWKA 5LOHA 3O23A 3LZBA 2IG7A 4N6ZA 5DR2A 3JXWA 5C8KA 4LI5A 1YHVA 3QHRA 2WMRA 1YWNA 1R0EA 4P90A 1LPUA 3EQRA 4L46A 5KE0A 2XJ0A 4E93A 3LJ2A 1REJA 4O7RA 3EQFA 3FMNA 3HMPA 4L45A 3HLLA 4RIWB 4ZTRA 3WE4A 3PJ1A 4AZFA 4F6SA 1TQIA 3F2AA 2CSNA 3DKCA 3QUEA 2PVMA 3GU6A 3OXTA 4D55A 2H34A 3V5PA 4JDIA 3W8LA 2QO2A 2R3NA 5AP2A 2ZAZA 3DDPA 3DNEA 4DEGA 4F9YA 2WMXA 4Z16A 3BX5A 3T9IA 5A9UA 4TYHA 4FKIA 1YXUA 3M11A 3U4WA 1U5RA 3Q4ZA 5C01A 4FT7A 3D7ZA 4EH6A 2GHMA 4BDDA 1JKKA 4F65A 3QU0A 1R1WA 3F3TA 3DZQA 2YIXA 4FTLA 2JD5A 3IGOA 4O0TA 5EKNA 4MEDA 4FKUA 2C6EA 4NW5A 4CCBA 3NVKI 2PHKA 3G51A 2J0IA 3TL8A 3VS2A 1S9IA 4O81A 2HZ4A 4KSPA 1PMNA 4FUYA 5KNJA 4C35A 4D4YA 2XKEA 5CZIA 1J91A 4E1ZA 3QD3A 4U45A 2W06A 4C36A 1FVTA 4BCHA 2VD5A 5DGZA 5HQ0A 3EH9A 2A27A 1XBAA 4FKRA 4X2JA 5EDQA 4ANLA 2QCSA 4IB5A 2QOLA 4JDKA 1XBCA 3GCUA 4I20A 4YPSA 4EH5A 2PMIA 3OS3A 3JYAA 4C62A 3LFDA 1YOLA 2NRYA 3NUUA 4EYJA 3B2TA 2C3JA 4IZ5A 3R8MA 3GOPA 4L7SA 4EK8A 2QHMA 2J0LA 4O7ZA 3GP0A 3DAEA 3EOCA 2O65A 2OBJA 5EDPA 1ZOHA 4UXQA 3W2PA 5BNJA 5JFSA 5KCVA 3ZO4A 1ZMUA 2JKOA 3RMFA 4RA5A 3B8QA 2HY81 2J7TA 4O7VA 4XMOA 5DIAA 4E8AA 3FLQA 3BEGA 4I6FA 5F95A 4ZZMA 1UKHA 4IWPA 4YLJA 4A4LA 3KVXA 3P4KA 1H1QA 3WI6A 3ZSIA 5KO1A 4O7TA 3R7EA 3FQSA 5T68A 2QR8A 2V22A 4E26A 4GW8A 4WA9A 2QOCA 3QA0A 5BMMA 3A7IA 2YCFA 3MTFA 3R6XA 2YWPA 5L2TA 4U0IA 2J6MA 2V7AA 4FICA 3V5WA 2QOHA 4FIJA 3V5TA 4AZTA 5DRBA 3IW5A 4HZSA 1JBPE 4XG6A 3FZOA 5KZIA 4O2ZA 3KXGA 2QHNA 4KABA 3VRZA 3CQWA 4XRJA 2J0MB 4F7SA 4QRCA 4X2GA 4CMUA 3OD6X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2B9H A;  4I4F A;  4RRV A;  2JAV A;  2WEL A;  3ANR A;  3R7Y A;  4KS8 A;  2ZV7 A;  2RF9 A;  1PHK A;  4JDJ A;  5CTP A;  4BCJ A;  5J9L A;  3Q5Z A;  2YCQ A;  2ZMC A;  5M4U A;  2C0I A;  2JDS A;  3K5U A;  3Q2J A;  4NYE A;  4AS0 A;  2XS0 A;  4RLL A;  5AIR A;  3NAX A;  3I5N A;  4KIP A;  3WBL A;  4DF3 A;  3RVG A;  2NP8 A;  1JST A;  5B7V A;  5HNI X;  1F5Q A;  4FK6 A;  1P4O A;  3ZC6 A;  4O0S A;  2WO6 A;  3FMJ A;  3QXO A;  5EFQ A;  3ZUU A;  4ZLY A;  2OF4 A;  2W4K A;  3FMK A;  4FMQ A;  3PA3 A;  5HCX A;  2WHB A;  2XP2 A;  4U6R A;  4RX5 A;  3GCQ A;  2H9V A;  5E4H A;  4WG5 A;  3QTZ A;  3U87 A;  5IF1 A;  2UW0 A;  3IS5 A;  1KSW A;  4NIF B;  2GPH A;  3DT1 A;  3FZT A;  2JDR A;  5D1J A;  4ALU A;  4C58 A;  4CD0 A;  2XAO A;  4JT3 A;  1UKI A;  3QFV A;  5CLP A;  3QQL A;  3K54 A;  4V04 A;  4Z55 A;  3WF6 A;  2PVL A;  2WOT A;  4FSM A;  1JWH A;  4HVI A;  2BRN A;  1XH4 A;  3R83 A;  1WCC A;  3WZU A;  4HVG A;  3O50 A;  3PA5 A;  3VBY A;  1UNG A;  2OIQ A;  2OXD A;  3KRJ A;  3VUG A;  4RFY A;  4AE6 A;  2XK4 A;  4OBQ A;  4IB3 A;  2GNJ A;  4E6C A;  5L6O A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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