1IAHA

Crystal structure of the atypical protein kinase domain of a trp ca-channel, chak (adp-mg complex)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
YYYSAVERNNLMRLSQSIPFVPVPPRGEPVTVYRLEESSPSILNNSMSSWSQLGLCAKIEFLSKMGGGLRRAVKVLCTWSEHDILKSGHLYIIKSFLPEVINTWSSIYKEDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSPRFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLAFSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEKRSCDMVFGPANLGEDAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYT
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Crystal structure of the atypical protein kinase domain of a TRP channel with phosphotransferase activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL-RELATED PROTEIN
total genus 82
structure length 276
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2001-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02816 Alpha_kinase Alpha-kinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel Protein kinase-like fold MHCK/EF2 kinase 1iahA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1iahA01
5ANGA 3ZLYA 3E63A 5CT7A 2QOLA 2UZLA 3OZ6A 2C1BA 2IVSA 3QKKA 1LUFA 3TNPC 3RGFA 3C13A 2QONA 3UIBA 4RT7A 2ZM3A 4O7ZA 4YO6A 3I5NA 3UC3A 4PQNA 2YAAA 3K3JA 4UWBA 4HVSA 2HYYA 4B8LA 2UZTA 3VN9A 2JKMA 4XHKB 3V8TA 3LXPA 4Z3VA 5IUGA 5FTGA 4TPTA 4E6DA 1J3HA 1WBPA 5CANA 3N51A 1CTPE 5EKNA 5FP5A 5D1JA 4BDJA 1OIYA 3QD0A 2A4LA 2C6KA 3QCYA 5HGIA 3Q4TA 4HPTE 3EQCA 3C4ZA 2J0MB 2OLCA 5M09A 3PSCA 3UZPA 3G0FA 1YDSE 4R5SA 4QMQA 1OL6A 2F9GA 3F88A 5G6VA 4BDHA 4GK3A 4NCTC 2CHLA 3F5XA 4QP8A 4GRBA 3FMKA 3QC9A 4BTFA 2PU8A 1K2PA 4F0IA 4FT9A 5CQUA 2F7XE 3ZRMA 3C4EA 3KU2A 3KXXA 3V3VA 3QTSA 4YZMA 1H1QA 2G2FA 3E7VA 4GSBA 5HIEA 4U5JA 4WRGA 4R78A 3TM0A 2OXXA 3MDYA 4G34A 4YURA 3TL8A 1CKIA 1SYKA 3OCGA 4H58A 3EH9A 4TYIA 4MBJA 2X7GA 2NP8A 3S3IA 2QOOA 3EOCA 3VS1A 3LMIA 4PNIA 3VO3A 3E8CA 4MAOA 3UOJA 1NVQA 3U87A 2BKKA 4FT0A 4D4RA 1O6YA 4DG2E 4DCAA 3MN3A 4GJ3A 3GUBA 5D41A 5IZFA 2JAMA 3CKXA 4TZRA 3GVUA 3PY1A 3OCBA 4PDSA 2PE2A 4Y83A 4O27B 1DAWA 3AXWA 3BLQA 3VJOA 1Q3DA 5KZ0A 1OL2A 2C4GA 3EQBA 2YITA 4U9AA 5EYKA 2R3GA 4N70A 2BROA 2PVMA 4PL5A 3GU5A 2X81A 4IJ9A 2QR7A 2W9ZB 4O0RA 4PDYA 4FV3A 4EYMA 3FLSA 2PVNA 4W8EA 2DWBA 3TZ9A 2OK1A 4YU2A 4D28A 5AX9A 4Q9ZA 2GTNA 2BHHA 2WMAA 4OLIA 5K3YA 3CXWA 3IDCA 4CLIA 4G5PA 2VX0A 4PP7A 4K2RA 3RM6A 1M14A 2ZB0A 2J5EA 2OICA 4BDDA 3DAEA 3NCGA 4MK0A 2IO6A 4QTDA 1E9HA 3MFSA 5DRBA 4XG6A 4CT2A 4QQ5A 4G6LA 4CCBA 1U54B 2R3FA 2UZNA 3D14A 4LQMA 4DHFA 5C4LA 5JFXA 2RFSA 5KMNA 4H36A 2IW8A 4KIOA 4GG7A 4IANA 3FY0A 4NH1A 3RCJA 3A4PA 5LMBA 2PMOX 1PF8A 1EH4A 2C47A 2WTJA 3EZRA 4FSRA 2RF9A 2VN9A 4Y95A 4AFJA 2UZDA 3R1NA 2B9HA 1KE9A 4RIYB 4RJ6A 4HVDA 3UOLA 3I4BA 4EQCA 3GP0A 3MVJA 3V6RA 3KK9A 4HYUA 3KRWA 2OXYA 4EUTA 4ERWA 1ZLTA 4TW9A 4RWJA 3MI9A 3DDQA 2BRBA 2VTIA 4KA3A 3CPBA 3NUSA 4FODA 4TWPA 4DH3A 3P08A 5KHXA 3V51A 3SAYA 4IIRA 1P14A 5HO8A 5EHYA 2XZSA 4AXAA 1H00A 2HXQA 1OPKA 4S33A 4LRKA 2YWVA 1FGIA 3VAPA 4C4JA 3DLZA 5EK7A 3QTUA 4AGUA 5CEMA 4XRLA 3AGMA 1CKPA 4MXAA 1GNGA 2F57A 4YC8A 3RPVA 1Q99A 3RM7A 2X0GA 2OF2A 3R73A 4D1SA 3EN7A 3BE9A 3PSDA 1R39A 3DGKA 2OH0E 5C8MA 2XM9A 2XK7A 4BCJA 4RG0A 4YLJA 4I6HA 4U42A 4BGQA 4MX9A 3DKFA 4JJRA 4TN6A 4YJNA 4F08A 1H8FA 2ITPA 2XK4A 4M8TA 5C8KA 2ITZA 4FTKA 3OEZA 3R9DA 3TG1A 4FKLA 4FUYA 1WBWA 1YWNA 3DTCA 2JDOA 4CCUA 5LWNA 2HZ0A 2BDJA 3HMPA 3DU8A 4G3GA 4OBOA 1OIQA 4FV5A 5EH0A 2PE1A 3ITZA 4QP1A 5HQ0A 1YXUA 3H9RA 3KN5A 5LVMA 3DS6A 1HOWA 2R4BA 4MTAA 5HG9A 3ZXZA 4O96A 4EK8A 4C61A 2YM3A 4BY9E 4HCVA 5ETAA 4V0GB 3KN6A 3O23A 4XG9A 3V5TA 3QTRA 3U6HA 2Q83A 4TT7A 4IFCA 4UZDA 3D7TA 2IZSA 5KMJA 4U0IA 3O96A 5BVKA 3VHEA 3U51A 5KMIA 3CGOA 2BALA 5A6OA 2CGWA 2CGUA 3DPKA 1BL6A 2WPAA 2WQOA 5K5XA 4ZTMA 3P7CA 2C5VA 4I0RA 4R7BA 4ARKA 5FTOA 4I5PA 4M97A 3UGCA 4R7HA 5FBNC 4E7WA 5HCYA 4LL5A 4CQEA 4YJTA 1PXLA 2QQ7A 4GFOA 3SOCA 2HZ4A 3QHRA 4EH8A 3ZSIA 4F7JA 1P2AA 2W1GA 3KXMA 5KMKA 5J9LA 3QTIA 1MRVA 4JX7A 5A54A 4FZFB 1R0PA 3FI8A 3I0QA 3BLRA 4EOLA 4F63A 3AC1A 4C3RA 4ZMFA 1M7NA 1S9JA 3QKMA 4CNHA 5DYJA 1IAJA 5E8YA 5IQCA 2WHBA 4MD8E 5FGKA 5M4CA 3QQHA 3BEGA 1KOBA 3JVSA 4FK3A 2BILB 4LRJA 2WTKC 4O2PA 4IJPA 3WF8A 2YIWA 3NYVA 4G16A 4MXOA 5AV1A 2JITA 3EQDA 3AC5A 4K6ZA 4YBKA 3QQLA 2JKOA 4FEQA 4ZTQA 4DA5A 4EWHA 5LXMA 4OTRA 2QKRA 4U79A 2F49A 3JR1A 2EXCX 2VWWA 5C01A 4CFNA 4IAYA 2IWIA 3D5WA 3Q32A 2W5BA 4FTJA 4L7SA 4AF3A 2HAKA 5KZIA 4M14A 4ANBA 5IDPA 3QCSA 4NKSA 5FBOA 3W8QA 2V55A 1XH4A 4J7BA 4QMZA 3NW5A 3LFAA 1H28A 3KK8A 2UZBA 5IQAA 4H3PA 3SHEA 3VUMA 2CN8A 3E7OA 4AZEA 4HGTA 4KABA 3FL4A 4HZRA 3FBVA 3QRKA 3ZFYA 3A99A 2YACA 3H0ZA 4E5AX 5EHLA 2V7AA 2YIRA 5BUJA 3JYAA 2GS2A 4E20A 3WI6A 2ZAZA 2OZAA 3GOKA 1TQIA 1V0OA 2Z02A 4DFBA 2W05A 3A8WA 4WRSA 1CMKE 3LIJA 4BDCA 3DDPA 1FQ1B 1JSVA 2ITUA 4G3DA 4II5A 5A4EA 5IA0A 5BVNA 1XH7A 4FIGA 4FTNA 1R0EA 4TWCA 3QA8A 2VWBA 5TO8A 1H0WA 1UU7A 3PJ2A 4J8NA 4D9UA 2QVSE 3EHAA 1SVEA 3P0MA 1X8BA 3Q4UA 4IVBA 3NSZA 4L67A 3SW4A 4ZSAA 3B2TA 1AQ1A 2XVDA 2Y4IB 2ZDTA 3LJ2A 3BWJA 3QRTA 1MQBA 3DA6A 3F2RA 5LCJA 2ERZE 3DCVA 3EN9A 3EZVA 4MWIA 4U6RA 4QOXA 4AFEA 4CMOA 3UQCA 4NJ3A 4EH6A 4KBKA 4FA2A 5D10A 3QQGA 2C3KA 4ZJIA 4FV8A 4EJ7A 3KCKA 3COMA 2WEIA 5DFPA 3OT3A 3TKHA 5EM7A 1Q61A 1KOAA 4QYEA 4DINA 4Z16A 4LRMA 4ZY4A 4FNWA 4ZSEA 4FOBA 1URCA 2R3IA 4JOAA 3T3UA 3DK7A 2WNTA 3R1QA 3CQEA 3MY5A 2ZMCA 3VULA 3WBLA 5CZIA 1XH5A 3WIKA 1M7QA 3ZUVA 5F94A 2VTRA 2XB7A 3AG9A 4H1JA 5LVOA 3MH1A 5I9UA 3V6SA 4E5BA 3HMMA 4NUSA 1G8AA 2VWIA 5HTCA 3AGLA 4IAIA 4IAAA 4UY9A 5TOZA 1GIHA 5HCZA 4LV5A 5FDXA 4BZNA 3OWLA 3VBWA 4HCTA 2OKRA 5ETFA 3HLLA 4D4VA 5BVOA 1LEZA 4I5HA 3QQFA 5KCVA 4FKRA 2NPQA 2BKZA 3N4UA 2E9OA 4D5HA 2B4SB 3G9NA 2JGZA 4U44A 2RKUA 3C5UA 2AC5A 2HW7A 2J0JA 4F1TA 2KTYA 3EFKA 2WMQA 3MH3A 3ORTA 4GMYA 2H9VA 4L53A 4X21A 4YC6A 4YGAA 5BMSA 3NGAA 4DEDA 1FVRA 2QO2A 3FE3A 2C0OA 2QU5A 3RAIA 3ZOSA 4PWNA 1XQZA 4DBNA 4IFGA 4ACDA 2BZKB 3QALE 4L7FA 3MJ2A 5CU3A 5TR6A 3LFQA 3ZO3A 4CZUA 2X2MA 2WIHA 3ZEWA 2PVHA 1B6CB 4I5CA 2IZRA 4J53A 4DITA 3P5KA 3QUDA 4IACA 1ZYJA 3CKWA 4I92A 3BLHA 5CU4A 4M68A 2WQEA 4B8MA 4RJ8A 5E90A 5EW3A 2JC6A 4YJOA 5DIAA 4UWYA 1YW2A 2GFSA 4DFUA 3UVPA 5L8LA 3BIZA 4TKSA 4FG9A 4H1MA 3MJ1A 2CSNA 2YJSA 4L68A 4A9YA 3NUPA 4IDTA 2O65A 3RKBA 2C5NA 1UWJA 2HELA 4UB7A 1ZXEA 4EH4A 4FKUA 2YCRA 3MGYA 4IB5A 3JUHA 4F6WA 4HGEA 3GCQA 3AT4A 3KC3A 2VD5A 4X2GA 3PA4A 5C8NA 4B0GA 5JGAA 3UO4A 4FG8A 3L8PA 3Q9YA 4RX7A 4ACMA 3MFRA 4RGJA 4CFWA 3PPJA 3F69A 3P1AA 2OFUA 1MRYA 1PXNA 3TWJA 1LR4A 3TJCA 3IW5A 4AAAA 5CU6A 4JBQA 5AJQA 4O0UA 4DN5A 1JPAA 1CKJA 3EQRA 4WG5A 5EI8A 5T6KA 4IWDA 3LXNA 2BZIB 2ZJWA 2C30A 3Q4CA 4BDFA 5A4LA 4EONA 3ID6C 3HNGA 4IM0A 4MD9E 2Y4IC 1NW1A 2O3PA 3LCDA 5CNNA 4AA0A 3LFDA 4TXCA 2I7QA 4B6LA 2PWLA 4D1XA 4CKJA 3W10A 3DKGA 3UO5A 3KRJA 4D4YA 3ZS5A 1Z5MA 4DGOA 3BELA 3SLSA 4DH8A 5IH6A 4KRDA 3LLTA 3GC9A 3RPYA 3R0TA 3U55A 5BQ0A 3ODZX 1Y8YA 4LM5A 4YTCA 2X4ZA 4JBPA 2XNPA 4I3ZA 3G6GA 3VC4A 4QMOA 3PZEA 3OF0A 3DB6A 2PUNA 3FPMA 4XS2A 2QOFA 3Q5IA 4N0SA 5CS6A 3DB8A 3CLYA 3ORZA 1OB3A 2C5OA 1ZOGA 4JR3A 4DG3E 3COIA 1AGWA 4EHGA 2XK9A 4AU8A 2R2PA 3AQVA 1H1WA 5F4NA 3ZHPC 4L3LA 4OTDA 3ET7A 2YM7A 4IX4A 4FZ6A 2QO7A 3JS2A 5CX9A 4EK3A 2UW6A 4ORKA 3HA6A 3T8OA 1LPUA 3C4XA 4L52A 4FV7A 4KKGA 2J6MA 3HX4A 4EWQA 4TL0A 4DGMA 3QX4A 3P23A 2BDWA 1XHAA 3ENMA 4G1WA 4LFIA 2X2KA 4IQ6A 3B8RA 3ORXA 4DFNA 2X8EA 1HCLA 3U4UA 3R8MA 2CKOA 2JDSA 4YC3A 4ITIA 3DBQA 3RAWA 3U6JA 2PVKA 3RTPA 4EH9A 4FZ7A 1I09A 5HICA 3ZC6A 3BEAA 2B7AA 3DJ5A 4UWCA 3COHA 4UYAA 4HCUA 4BRXA 4DC2A 4PX6A 2J0LA 3M1SA 3H3CA 2XS0A 3L9PA 3OXTA 2C68A 4U40A 3AC4A 3BV3A 3W1FA 2VTNA 2ZV2A 3PXFA 4X7QA 4LUDA 3ZUTA 4CKIA 4E6AA 4F9AA 4F9WA 3V5WA 3PJCA 1U5RA 2PY3A 4NK9A 4OGRA 4A9SA 5LQFA 4W4VA 3R7IA 5AP2A 4LYNA 2VTJA 4S30A 2QNJA 3V8SA 3VBQA 4KKEA 2C0IA 2JFLA 5C03A 4EZ7A 3R9RA 3V5JA 5GINE 2YDJA 4ZTNA 4MHAA 3NAYA 5IA4A 1FVTA 4IDVA 4YZ9A 2HK5A 5DEWA 1IASA 3LKMA 4FL1A 4BN1A 5CF6A 1Z57A 2G2HA 2OIBA 3I5ZA 1ZRZA 3BBTB 4JQEA 4BVUA 4J97A 5CLPA 5HTBA 5E1SA 5DLSA 4ZJJA 4MXXA 4U80A 4ZLYA 2J51A 4AW1A 4PDPA 5A4CA 3PJ1A 1NXKA 2R3OA 2R7BA 3EFJA 4USDA 4AN9A 2ETRA 2ONLA 4TRLA 5CZHA 4I6FA 3OBGA 4W4YA 4C02A 4AACA 2UW3A 2W1HA 3PVWA 3NNXA 4FTLA 2E9VA 2PULA 4ITJA 2BHEA 4X2JA 5DT0A 3HV3A 4NM7A 3NCZA 4BCKA 4HNIA 4X6RA 5HI2A 5CF8A 3D2KA 1M2PA 2PMIA 3CTQA 4PTCA 3A7HA 3JY9A 4BDKA 4YJUA 3LXKA 4XV1A 2Z7SA 4LMUA 3O8UA 4KWPA 4O83A 4FVRA 3VS2A 4RWIA 2VTPA 4OTHA 4NM5A 3BHTA 2XKCA 3KGAA 2FYSA 5HG5A 3R8ZA 3R6XA 5IDNA 3OMVA 5L2SA 4J1RA 4FSQA 1U54A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5I0B A;  5J5S A;  3I81 A;  2W4O A;  1GJO A;  5KE0 A;  3BGQ A;  4G3F A;  3F61 A;  2BRG A;  4QDV A;  3RNI A;  3UC4 A;  2JII A;  3W2Q A;  3QGY A;  4U97 A;  2O64 A;  3F2A A;  5BUI A;  3QQJ A;  3EQP A;  3BU5 A;  5A9U A;  3NUN A;  3ATS A;  4MYG A;  4TYE A;  2QG5 A;  2XP2 A;  3WE4 A;  3C50 A;  4G6O A;  3II5 A;  1Q5K A;  3ENH A;  3LFB A;  4FKT A;  1YXS A;  2AEG A;  5EHO A;  3UIM A;  2CKE A;  3FZS A;  1S9I A;  4GII A;  4O7N A;  2HZI A;  4FTU A;  4FV2 A;  4UAL A;  3FQS A;  1J91 A;  5AP7 A;  3RI1 A;  3LXL A;  5EQY A;  3FL5 A;  4BCG A;  5JZJ A;  4FEW A;  3ULI A;  3VRZ A;  4JQ8 A;  2QOI A;  2OWB A;  4M15 A;  4O0S A;  2VRX A;  3R21 A;  3ZLX A;  4GIH A;  4UX9 A;  1FMK A;  1H25 A;  2YDI A;  3F5P A;  4RQK A;  3BV2 A;  5GJD A;  3K54 A;  3ZRL A;  4XH6 A;  2FH9 A;  4A7C A;  3KF7 A;  2C6T A;  1ZMV A;  4WUA A;  4AXC A;  3FZO A;  5DBX A;  4LOQ A;  3EID A;  2YN8 A;  5LWM A;  2I1M A;  3WF5 A;  3UP2 A;  3WF7 A;  3CJF A;  1UU8 A;  1JBP E;  4JMQ A;  2W1F A;  2R7I A;  5L2I A;  4XNE A;  1SVH A;  4QTC A;  3R02 A;  4E1Z A;  5ACB C;  4BI1 A;  5LMK C; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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