3W0RA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n202a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSANVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
total genus 89
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0rA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0rA02
4U98A 4H05A 2I7QA 3LQ3A 2PYWA 5IQCA 3G15A 2PUIA 5IQGA 4FEWA 3W0RA 3HAMA 5EQYA 4EJ7A 3SG9A 4BR3A 1L8TA 3ATTA 4GKHA 3CSVA 3N4UA 3N4VA 4U94A 3MESA 3FEGA 4R78A 1ND4A 5IQEA 3HAVA 3UZRA 4CGAA 5IQHA 3W0MA 3N4TA 3SG8A 3JR1A 4DA5A 2PU8A 5IQIA 4DCAA 3FI8A 3TYKA 2Q83A 5EQEA 5IQDA 4DBXA 5IQFA 4DTAA 2PPQA 2PUPA 5BYLA 3W0SA 4ORKA 4DTBA 4CG9A 3F2RA 2CKQA 4FEUA 2CKPA 3W0QA 3TDVA 2BKKA 4DFUA 3ZM9A 5IQAA 4CG8A 1NW1A 4R77A 2IG7A 4DFBA 1J7LA 4DT9A 3TM0A 5IQBA 2B0QA 5C4LA 5EQPA 4O7PA 3Q2JA 3DXPA 3W0PA 2PULA 3DXQA 4N57A 5C4KA 4FEVA 4O7OA 3SGCA 3W0NA 2OLCA 3ATSA 5FUTA 4PDYA 4FEXA 4GKIA 2PUNA 1J7IA 3C5IA 4R7BA 3TDWA 2QG7A 2CKOA 4DE4A 5FTGA 4DT8A 3W0OA 5AFVA 1J7UA 4WZYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F7SA 5JGBA 3QXPA 2OWBA 2RFNA 3IONA 3NUXA 2ITZA 2B9FA 1P4OA 4GUBA 2A19B 5F1ZA 1W98A 4RLLA 1B38A 3ORMA 3PP0A 3Q4CA 2PUIA 3QKMA 3QUPA 4NW6A 4UYAA 3R9NA 4FVRA 3ZO1A 4F4PA 3NNWA 2XKCA 3HDMA 4NL0A 4HVHA 2FUMA 5IQGA 5E8TA 5JN2A 3R83A 1T46A 3HA8A 2X39A 4ZXTA 4IM3A 3Q4TA 3ZO3A 4LOOA 5EQYA 4NUSA 3BRBA 5EKNA 3EZVA 2R3MA 5CAQA 1RE8A 5KE0A 2YJRA 4XG3A 1H1QA 4ANSA 5HGIA 3RCJA 3TTJA 5CF6A 5HTCA 2PWLA 3KKVA 1GZNA 5AUZA 5LVOA 4QMUA 3LFAA 2WOTA 2J51A 1OKZA 3HV7A 3QZIA 2WTVA 2YISA 4OBQA 4Y73A 5E1EA 3HYHA 1Q24A 4NU1A 1J91A 5BQ0A 4IB0A 3PYYA 2VTRA 4IFCA 3RZBA 2Y7JA 1YHWA 4N4SA 4V0GB 4XHKB 4YPDA 4PMPA 5HO7A 5C8MA 3OUKA 4RX5A 2Z7LA 5HU9A 4QYGA 3UIUA 2JBPA 3FY0A 3KRLA 5CU4A 3ZZWA 5H9BA 4FODA 5HVYA 3FXZA 1QPEA 3ML1A 2HENA 3BHYA 3E62A 3AC2A 2WMVA 3GB2A 4K77A 2H9VA 4I5HA 3D5VA 4N6YA 3UOHA 4EJNA 5BV3A 4JNWA 3ZXZA 1OIUA 2NP8A 5AV2A 1ATPE 5IDNA 2P33A 2FSTX 5JMSA 3LCKA 1ZZLA 4ALUA 3QXOA 3R30A 2YIQA 3QU0A 3KA0A 3VN9A 4MNEA 4BDHA 3IW6A 3DBDA 4M12A 4RJ5A 4G3EA 5AP0A 3BLRA 5HE1A 1H28A 3V5TA 2QC6A 2UUEA 4GJ3A 2W1FA 5G1XA 3R22A 4EKKA 3R02A 3O51A 1UNGA 4F09A 3W10A 1VYWA 4EK8A 2BKKA 2IWIA 5JFWA 3QRTA 2HXLA 3FLWA 2XCHA 5AX3A 5LQFA 4USFA 4ZMFA 4BIDA 4DFNA 1SZMA 5M51A 5CNOA 3L1SA 5CNNA 5BVNA 3KXMA 4O81A 3HL7A 2J0JA 2V7AA 1H0WA 4BDKA 3E3PA 4DGMA 4IVAA 4OTQA 3N51A 3VIDA 1PMNA 1PJKA 4FNYA 3PWYA 4TN6A 5DH3A 2BRNA 2XK8A 3BGQA 3QTXA 4XP0A 1H8FA 3GU8A 4APCA 4C38A 2YAAA 1HOWA 5A9UA 2QOQA 3R2BA 5LMBA 4BCQA 2VTOA 1FQ1B 1NY3A 4G16A 3FYJX 3NYXA 4I41A 3VS7A 1QMZA 3D5WA 2BCJA 3P1AA 4F9BA 5M56A 2CMWA 3MVMA 4XG2A 2OFUA 4F08A 4ZY4A 5AAGA 3ZU7A 4FTKA 2OLCA 3SXRA 4L7FA 5GNKA 1YRPA 3FZTA 4EUTA 4CMOA 1PY5A 5BVWA 3QF9A 4UALA 3RAKA 3HGKA 4EC9A 4I94A 2X4FA 2H96A 5DHJA 3GI3A 3NUYA 2ZV8A 2OIBA 3UZPA 3VBTA 4ACGA 4R7BA 1RDQE 3O5AA 2Z60A 3EN5A 3FV8A 1YDTE 3VQUA 5ANIA 4XBUA 1XH8A 2OH0E 4JS8A 4EOKA 4AS0A 3W0OA 4YJSA 2H8HA 3BE9A 3QD3A 4TYHB 2HCKA 3DJ5A 1KUTA 3R9RA 2PVFA 1NT2A 1ZZ2A 3DBCA 5BMMA 1RQQA 5AMNA 1Q8YA 2CSNA 4QMMA 5DNRA 2R3GA 3G9NA 4H58A 5DT0A 3DOGA 3ORLA 4GK4A 3SQQA 3VHEA 4FTTA 2C47A 4JR7A 3RMFA 4DDIA 3C13A 4CMUA 4KIPA 3BU5A 2YERA 4M8TA 4MXZA 3FZ1A 1KE6A 3QZGA 4G6NA 3LZBA 5TKDA 4BHZA 5CXZA 3Q53A 4ZJVA 2JAMA 4D4RA 2VTLA 5F20A 4XNEA 5T68A 4DG0E 3NPCA 3R2YA 2J9MA 2UVXA 3C4EA 2IN6A 2ZJWA 3FHIA 3KF7A 4KRDA 4OBOA 4WRSA 4C33A 3HAVA 3GU6A 1ZYJA 3LOKA 4ACHA 1R1WA 2F49A 4FV4A 5KHWA 4GK3A 4ZTMA 3AT3A 3RVGA 3HMIA 4Q5HA 2CNQA 3TEIA 4L42A 2R9SA 3VUDA 3D94A 1Q8UA 3TACA 1KE9A 4ZIMA 3UIBA 3KC3A 3S95A 3C50A 1JLUE 3EH9A 3HVCA 4FKUA 4QP3A 2XMYA 3UP2A 3WE4A 4WNMA 4GV1A 3K2LA 4N70A 5JH6A 4JVGA 4FV8A 4NIFB 4ASZA 4OTIA 5IQFA 4DTAA 3JXWA 3QCQA 4FEQA 2UW9A 2J5EA 2YFXA 3MJ2A 4TYGA 3W0SA 2YACA 3O71A 3L8PA 4CFMA 4EHZA 1CTPE 2UV2A 4YZCA 4PRJA 3DAKA 3LM0A 4FC0A 1KSWA 1YI4A 4GFMA 2Y6OA 4FV2A 5JFSA 4HVGA 4PL3A 1H1RA 4FUYA 4Y95A 4AFJA 1YWRA 2OBJA 1BX6A 4YZMA 5BUJA 5IPJA 4QTEA 3VRYA 1J7LA 2PZ5A 4KKEA 4RQKA 3PY0A 2BAKA 2B0QA 1M52A 4AAYA 4EQMA 5G6VA 4KIOA 3DXPA 2X7OA 1OMWA 2O65A 3ZUUA 5HLPA 3PXKA 5KUPA 5LVPA 4FT9A 3NUPA 3VUHA 3ZO2A 2PVJA 3SD0A 4R5SA 2W4JA 4RQVA 2UZNA 5IMEA 2NPQA 3HP5A 3IS5A 3P0MA 4FIIA 4MTAA 4TRLA 1FGIA 4JG6A 4CKIA 2V5QA 2ETMA 4D2SA 4USEA 2Z7RA 2WFYA 4OT6A 3W2CA 4UBAA 4EH4A 4JDIA 3EL8A 3EQFA 4UY9A 3SA0A 4KSQA 2QOOA 5M55A 4EZ3A 3AOXA 2PE2A 4DFLA 1OL7A 3P7CA 1ZMVA 5D7AA 5ITAA 2X2LA 4P5ZA 5A4TA 1REKA 4QP7A 3UOKA 1Q3DA 4BHNA 2GNIA 4M14A 5AAFA 5I9XA 2FYSA 4EOIA 2NYAA 2R0UA 5E90A 3TDWA 3UJGA 3VVHA 4ANLA 1QPCA 3BBTB 2C5YA 3F5UA 3DPKA 5EG3A 4QTDA 5HD7A 2O5KA 3CGFA 3V8SA 2C6IA 2WU6A 3A8WA 4IVDA 2GNGA 2VWUA 3F6XA 4ZLZA 2IZSA 4RJ7A 5M07A 2J0MB 4I24A 3OOMA 2XNPA 2YZLA 1Y6BA 3VUKA 4J7BA 2ZDUA 4MD7E 3ZFMA 4A07A 3F5GA 3UYSA 3L9NA 3OWPA 5C27A 3Q3BA 4L3JA 5D10A 4DH1A 3QC4A 4XOZA 1OIQA 1TKIA 1W84A 2HK5A 4C2WA 1IAHA 2QR8A 3ODZX 3R0TA 2IW8A 2OJIA 1BI7A 4AE6A 4H39A 4U5JA 1H27A 2YDJA 4CQEA 3M1SA 5FDXA 4HYUA 5JQ8A 4V05A 4ID7A 3K5VA 4XP2A 5ANEA 3DAJA 3QD0A 5ANGA 4WG3A 3WF5A 1L3RE 4QNYA 3HRCA 4RSSA 4Y83A 1LEWA 3CBLA 5EOLA 2QOFA 4FICA 3SW4A 4L3LA 2VTHA 2XBJA 1WCCA 3E5AA 4QPSA 4WHZA 1XKKA 1P14A 3DB6A 3I7CA 4FKOA 4H1MA 4KBCA 5CU0A 4O0YA 3W0MA 3K5UA 4GVAA 5AEPA 1ZWSA 4E4XA 4E7WA 1OKYA 2PK9A 5FTQA 1XQZA 4O7RA 2PU8A 2VX3A 5JFVA 4XRJA 3D7TA 4CRLA 3DT1A 3R1YA 3FI8A 2OI4X 4FL2A 5DGZA 4CTBA 2CN8A 3BU6A 4EH5A 3Q4UA 4FYOA 3SVVA 5CU6A 4KUJA 5EW3A 4L68A 5EI8A 4ZY6A 2OKRA 3KK8A 4BYJA 4BJJA 2XBAA 3AKLA 2PUPA 5CF5A 4KS8A 3V8TA 2VO6A 4H3QA 4ITHA 5KMMA 3PIYA 2J0KA 2QR7A 4ORKA 3CKWA 4KINA 3W2PA 4AZVA 2IVTA 4D28A 2DWBA 5M4UA 5JRQA 2PE0A 3H30A 1GOLA 4KD1A 4OBPA 2PVMA 3H9FA 5AV3A 3D7TB 3VBYA 2BIKB 3ZLWA 3HRFA 4ZLOA 5I9YA 4MXXA 2B9IA 4IAYA 4FKJA 1R3CA 4R3PA 3R1SA 3V5PA 4L8MA 3MIAA 4AQCA 4R3RA 4O7PA 3B8RA 1UNLA 4BJJB 4KRCA 4O38A 4WNOA 4QTBA 4IAFA 5AV0A 4PTEA 4I23A 4FSQA 3CY2A 4M69B 1B39A 4RA4A 4DINA 4O86A 4AZFA 4RMZA 2WMWA 3JUHA 2W17A 5HCZA 2XNEA 2J0LA 3PPZA 3RK5A 4MWHA 3CJGA 4FTMA 4IDTA 4LL0A 1PXKA 3B8QA 3CC6A 4H36A 4WA9A 2GMXA 5AA9A 4TY1A 5EH0A 4DGGA 4EBWA 4W4VA 5FUTA 5JZNA 4FV7A 2PUNA 4BIEA 3GXLA 4F6UA 5CWZA 3BX5A 4XG9A 4BN1A 1K9AA 4FUXA 5B2MA 3KXZA 2BAQA 3OCTA 4QP1A 4YP8A 3MH3A 3QQUA 3NIEA 2J4ZA 5IU2A 5AFVA 4I6FA 3FMEA 4ZSLA 4IB3A 2XH5A 2PMNX 2J0IA 3RP9A 5H8BA 4HNIA 2Y6MA 2PL0A 4AU8A 3PJCA 5HVJA 1BL6A 2WMQA 3SLSA 4AT5A 4I92A 3UDSA 3H0YA 3NLBA 3GCQA 2OICA 3HAMA 3KFAA 2XZSA 4GIHA 2C3LA 2W1CA 4FSTA 3SXFA 3ZRLA 5BVOA 3PE2A 2QG5A 2OIQA 2RKUA 2XNMA 5ANJA 1Q99A 4UXLA 4O0RA 4X0MA 4D1ZA 1UNHA 1REJA 1ZY5A 2VTQA 4KBKA 4PDPA 4YNOA 1H26A 4C02A 1KE5A 4IM0A 3RK9A 1FGKA 3ETAA 4OTDA 4B0GA 4PNKA 4TWCA 2WMUA 3A7JA 5J1VA 4X3JA 3FHRA 3LJ0A 3CEKA 3I60A 4JI9A 2VTMA 5ETCA 2PVYA 3R7VA 2YN8A 3NNUA 5C8NA 5KZIA 5AUUA 5AP3A 2C3IB 4FVQA 3TG1A 3UZRA 2PVKA 1ZMUA 4FK3A 4Z7GA 5BUIA 5HD4A 2BKZA 3N4TA 4FSUA 5EW8A 3U9CA 5HO8A 1DI9A 3JR1A 4FSRA 4DA5A 4QOXA 2QOKA 1LR4A 1KOAA 3R1NA 4YNEA 2WOUA 3PXQA 3S00A 4YPSA 1DI8A 2R5TA 2QQ7A 3BQRA 5IQIA 3TV7A 4IC8A 4XLIA 5AP2A 5A6OA 4HZRA 3C9WA 1XBBA 2XK3A 3NNVA 4G6OA 2OO8X 1NVRA 5EHOA 3Q6UA 5HCXA 2AEGA 4TWPA 4OR5A 2QOLA 5FM2A 2Q0NA 4JQEA 4NM3A 5TF9A 5JQ5A 5HIEA 4YTHA 2WMXA 4G3GA 4AP7A 1ZXEA 2C4GA 2UZWE 3KN6A 5A4LA 2VX0A 5LXMA 2XM9A 4TKSA 5IG1A 2YZAA 4CG9A 3UODA 5E4HA 2WGJA 2FVDA 4G17A 4QT1A 5FLFA 3VO3A 3PFYA 2G01A 5CTPA 4F9CA 4ZTRA 3TCPA 3VUIA 4S31A 4EI4A 2IW6A 3DQXA 1U54A 3LHJA 1UVRA 2XEZA 4YZDA 4I6QA 4U41A 4BGQA 3V3VA 5CU3A 5CQUA 4W4WA 3F82A 3VNTA 4A7CA 4DFBA 5CXHA 4ZTSA 3RAHA 3BLHA 3C4CA 3QLGA 5EDRA 2JDRA 3GUBA 4EQCA 4E4NA 3PIXA 5CSVA 4ZTNA 1JKKA 2BZKB 5EHYA 3ZYAA 3TNWA 5E8WA 3LXKA 4ZS4A 1MUOA 2OJFE 3CKXA 3DK6A 4WSYA 4XYFA 3EQIA 4LUEA 3U6HA 3RPOA 1OUKA 3NAYA 3WARA 2XKFA 1OBDA 2J5FA 4OTWA 5HBEA 3V5LA 4ACCA 4J96A 5EKOA 2QI8A 3IGOA 3TKIA 4F0IA 3R63A 4FV3A 4DCEA 3RKBA 2X9FA 3HMPA 3NEWA 5J9ZA 4RVLA 4ZK5A 4E20A 1G5SA 4FTNA 2YIYA 3UQFA 5J87A 3C5IA 3PTGA 2ZV2A 2VWWA 4BBEA 1YQJA 3Q4ZA 4NM7A 3FMNA 3UO5A 4AW1A 1XH6A 4CLJA 3CIKA 3QTSA 5FTGA 4FSWA 3A7IA 3OEZA 4IE9A 3T3UA 2XK4A 4B8MA 4EC8A 5M53A 1PYXA 4ARKA 4E5AX 2FSLX 4H3PA 4XV1A 1YOMA 3C5UA 3AC3A 3OCGA 3P08A 5EM5A 5T6KA 4AG8A 3OXTA 5BUEA 4E93A 2WB8A 5KO1A 1SVEA 2VWXA 2I7QA 2A27A 3R7IA 5IQCA 3P4KA 3R8UA 3G15A 4L9IA 1IAJA 5M44A 5IA2A 4O7ZA 2Y4PA 1W82A 3LXNA 5ACBC 1EH4A 1R78A 3AT2A 4LDTA 4QO9A 1Y91A 4EQUA 2VX1A 4O7NA 4ZTQA 4L01A 4OUCA 2JDTA 2BZHB 3LMHA 4PUZA 4DN5A 5FXQA 4HGLA 3A60A 2IZRA 3FC1X 3JVRA 3ACKA 4HZSA 4QNAA 1ZLTA 3QAME 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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