4LV7A

Crystal structure of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase e82c/s142c
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
435
structure length
390
Chain Sequence
MILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKCVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDCALILNDHSLFDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENILKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQKAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Conformational stability of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase (IPK1) dictates its substrate selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
total genus 122
structure length 390
sequence length 435
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4lv7A01
2XARA 3UDSA 4AXDA 2XANA 2XAMA 2XALA 4LV7A 4AXFA 4AXEA 4AQKA 3UDTA 3UDZA 4AXCA 2XAOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OMWA 4AUAA 4MXAA 4HVSA 2WQMA 3NYVA 1FINA 3I81A 2VWBA 4ZSEA 3F3TA 3Q5IA 4FKVA 4Y85A 5DE2A 3PG3A 4FTIA 2CDZA 2YIQA 3R8VA 2QI8A 5KMOA 3IS5A 3G5DA 4EH2A 3V5WA 5EHYA 2F49A 3DBFA 3FEGA 3L1SA 3KK8A 4CTBA 3QZGA 2RKUA 3CE3A 4XMOA 4CVAA 5JK3A 2BVAA 3VAPA 4TYJA 4DH5A 3BQCA 5GIOE 2B9JA 3DBEA 3GU4A 3FLQA 4FSYA 5IG1A 4D0XA 5M56A 5HG9A 1J1CA 5GINE 4HVHA 4X21A 4U6RA 3ENHA 2PHKA 2FSLX 3R9HA 3U9CA 3FXZA 4FV7A 4IX6A 4GMYA 3MH0A 2P3GX 3MW1A 4HVIA 2BDJA 5ACBC 2FA2A 2HY0A 3LM0A 3DDPA 2PU8A 3GB2A 4NU1A 4HNFA 2Z2WA 4L9IA 2C1BA 3BYSA 5BVKA 3PY1A 4FT5A 3QQFA 4NYEA 5D41A 4DITA 5AFVA 3VN9A 4NSTA 4AW0A 5DG5A 1A48A 3ZBFA 5M4UA 3C5UA 4LFIA 5FXQA 3ZYAA 4CQEA 4LYNA 3AC2A 4C7TA 2XRUA 4JIKA 3EQCA 2C69A 3R0TA 4YLKA 5IA2A 4D9TA 4O0UA 3ZM4A 1LPUA 5T68A 3LXKA 2EXMA 4O81A 1W8CA 2X9EA 3DBCA 3GU7A 1WVWA 4JNWA 2WQNA 4L3LA 2R3MA 2VTSA 3C0HA 3W55A 2BZIB 1UWHA 4BYJA 2YWVA 2XCKA 4RIOA 3TKHA 4GVAA 4NZWB 4ERKA 1XHAA 3S0OA 4JG6A 2DQ7X 3BCEA 4D0WA 2YISA 4MBLA 3SX9A 4OT5A 5CZIA 4FTKA 2VNYA 3PPJA 2EB3A 4XX9A 5FDXA 5K3YA 5IEYA 4J95A 3E64A 5DFPA 5EFQA 1J91A 4AXDA 2PZ5A 2XK4A 3KRWA 2R0UA 4F64A 5I5ZA 1RDQE 3ZO3A 3O0GA 3NWWA 5BPYA 3DJ6A 3ZC5A 4MXXA 4AW1A 3IGOA 4L01A 3IW8A 2YM8A 5AADA 3WYYA 3OCTA 4NFMA 1Y6AA 4L6QA 1T45A 4MNFA 2BDFA 3E62A 3QZHA 3FPMA 5T6KA 5FP5A 5E8TA 4S30A 3QXPA 3NPCA 4I0TA 5FTQA 3ZXTA 2RFDA 2H9VA 3U51A 1FMOE 4IM2A 3HNGA 5DNRA 2R3PA 3TACA 3P5KA 3LZBA 5CTPA 4IB3A 4PDPA 5CALA 3SW4A 3SKCA 5CEMA 2OJ9A 4S31A 4A06A 3QTQA 5ITAA 2EWAA 3VW8A 3R30A 4D28A 2OJGA 3QFVA 1XH8A 3DJ7A 2WKMA 1E1XA 3GCSA 4GSBA 4DAWA 4U79A 2C6KA 4TWOA 5JKGA 2V5QA 3ZSHA 3RGFA 5EYMA 5IMXA 2C0TA 3PJ3A 3LFFA 4NJ3A 3ZEWA 4R7IA 3OD6X 1WBNA 2P2IA 2PVRA 3GU8A 4L42A 2HZNA 5AJQA 5DH3A 3HAMA 3DKFA 4EHEA 1H00A 4O7SA 3T8OA 4C02A 1SNUA 3UG2A 4BJJB 4L43A 2PK9A 4I0SA 2QR8A 4AN3A 2UZUE 3OY1A 3VBXA 5DT4A 5KO1A 3TZ8A 2C5YA 2XYUA 3E92A 3QRTA 2B9IA 3CS9A 5AP2A 2VAGA 3ZC6A 4AG8A 3BE2A 4I41A 3THBA 3UC4A 2BIKB 3FI3A 3MH3A 4QP9A 4BDJA 5DT0A 4CLIA 4HOKA 4F7JA 5AP0A 4CZUA 3UIBA 4EBWA 2XB7A 4LV5A 5M55A 4KKGA 1CDKA 2XK6A 1J3HA 2OF2A 4DE4A 3QX4A 4RIWA 1OL1A 3FC1X 4IVCA 4R5SA 3E8NA 4RLKA 2J90A 3AMYA 4AU8A 4ERWA 2Y6MA 2ACXA 3GP0A 4UB7A 3FJQE 2XYNA 2R3OA 3VRYA 3A8XA 4OR5A 4D5HA 3PA4A 3ZRKA 1PW2A 3BYOA 2CNQA 2FSMX 3HGKA 3MY1A 3RI1A 2R3GA 4O22A 2V22A 2PVYA 4MWHA 4RIXB 4CFWA 4O7TA 1WBTA 3PYYA 4MTAA 4O96A 4ZTRA 4RLLA 4DH1A 3IW7A 3ZEPA 3IQ7A 4C33A 2Y9QA 2A19B 4AZVA 5CSPA 4RQKA 4EOOA 3EN5A 2BAQA 1B38A 4NL0A 5BMMA 1OKZA 2CKEA 3JPVA 2J0LA 3VUKA 5IA3A 3ZDUA 2WMWA 4RJ5A 3QKKA 4G17A 5IDPA 2UVYA 4YC8A 4DGNA 4TWCA 3VBWA 5CVHA 2Y8OA 4FODA 1OKYA 1O6YA 1Q5KA 1YWRA 3A7GA 3C1XA 3DFCB 3LFBA 4FSWA 4QTCA 2W9FB 3QYWA 3RJCA 2G01A 2O65A 4J97A 4MK0A 2YDIA 4QEBA 3DLSA 5HORA 3QF9A 3KGAA 1HCLA 4YU2A 1DI8A 3FV8A 5AP6A 3I6WA 3U54A 3F2NA 1YI6A 2QHNA 1H1PA 2W1EA 5JEBA 3AOXA 3LQ5A 5BVDA 1PJKA 4TL0A 1ZY4A 1HCKA 3S3IA 4EI4A 4EK5A 5A54A 5L2TA 1K9AA 3MI9A 4ZXTA 3MSSA 5M44A 2CLXA 4X2JA 3RINA 2XIZA 4YTHA 4LRKA 3BYMA 1QPEA 3H9OA 1RJBA 4S2ZA 2J9MA 3MTLA 4RX8A 1PXNA 4EOJA 3VUMA 4BICA 1Q8ZA 3HDMA 3VF9A 3L8PA 5CU3A 1OITA 5LVLA 3M11A 3VBQA 4PNIA 4EOQA 3V51A 3UBDA 3UVRA 4C34A 3BLAA 5D12A 3MS9A 1YHVA 1OZ1A 2R7IA 4TWPA 3KMMA 4FKGA 3RP9A 4DHIB 1PY5A 3R00A 4FOCA 2GQSA 4FICA 5CQUA 2YZAA 4HYHA 3DBDA 1WBPA 2ITYA 2CNUA 2XBAA 1ZMWA 2CKPA 4BGHA 3EIDA 3NUSA 4AXEA 4O7WA 4R5YA 5HD7A 4LL0A 5E8XA 1STCE 3GQLA 4JRNA 4P5ZA 2BKZA 5F1ZA 1G8SA 4TYEA 2OH0E 4U97A 3FKLA 5FEDA 5IZFA 3ZS5A 2X2MA 5EQYA 1YHWA 4O6EA 4OTIA 3EQHA 1GZ8A 1OKWA 5BYZA 2E9UA 3E3BX 3UOHA 3NUPA 2CPKE 3PXZA 4IDTA 3ZOSA 4DHJA 4CRLA 4FZ7A 3BHUA 2VX1A 2DUVA 5B2LA 2C6LA 3NUAA 2VV9A 4A9RA 2IZTA 3HEGA 1UNLA 2ZV2A 5IU2A 1ZARA 4FZDB 4PV0A 5CI7A 4JQEA 4IVDA 5EYKA 3ZLYA 5IF1A 4IVAA 2VTHA 3NEWA 1Q3WA 2ZV8A 3E7OA 3OWLA 2B53A 4LGHA 4XOYA 4XV9A 4ALWA 2UZLA 4J7BA 4YLJA 3PXKA 1T46A 1R0PA 2XNOA 4U3ZA 2XKFA 2VO0A 3Q53A 5BX0A 3FSKA 5CNNA 2CCIA 2UW9A 5HBHA 1LUFA 2PVMA 1Y91A 1CM8A 2C5XA 4I6QA 5C4KA 4R7BA 5J7HA 4JOAA 2WAJA 1BYGA 2JBOA 3JVSA 3NX8A 2Y7JA 4RJ6A 2I0EA 3KIOC 5KHWA 4F78A 4ZMFA 5AV0A 1PXIA 3DCVA 4NTSA 3A4PA 3E3PA 3LVPA 5HKMA 2ZDTA 4WUAA 4I92A 4X2NA 4ASEA 1UA2A 3CPCA 4FTJA 3PRIA 4ASXA 3MFTA 1VYZA 3REPA 4G6NA 3W0MA 2X8DA 3QTSA 3LAUA 1GNGA 4F63A 4YC6A 4ZY6A 2R9SA 3GGFA 2PULA 3KRLA 2W0JA 1GAGA 1H24A 3N4UA 4UXLA 4G5JA 4IAYA 4EYMA 4YSJA 1M2RA 3ORZA 4IAKA 2AUHA 5DEYA 3LJ0A 4RVLA 3QKLA 2C5NA 4TYIA 3DAEA 2F7EE 5L2SA 2BZHB 2WQOA 4DN5A 2QOOA 4QMOA 1YQJA 4M84A 4N0SA 1O6KA 4C4GA 2OO8X 2ITWA 3L9NA 2X8IA 3LJ1A 4QOXA 3QCQA 4Z16A 3D5VA 5FEQA 3BZ3A 4GIHA 2ERKA 2R3FA 2QU6A 4FIFA 4WA9A 2HW7A 5EOBA 3VW6A 2W17A 1OGUA 4ARKA 3DU8A 4Q9ZA 4YP8A 2IZUA 2XF0A 4XEYA 4ZS4A 4N4SA 3BHTA 2Z7QA 3FUPA 3T9TA 2J50A 4QTDA 4FSRA 4DEEA 4IANA 1H26A 5D7VA 4D55A 4WNKA 4FIHA 3COMA 2VTNA 2Z7LA 1YWNA 5FXRA 1JLUE 1ZOHA 2EUFB 4FUYA 2VX3A 2WPAA 2NRUA 4I6LA 5HEZA 3ZLXA 4YZBA 1KWPA 2UZTA 1Y8GA 4BI0A 4JAIA 2QOHA 2YIYA 4M0YA 4I5HA 2OWBA 1PXLA 4BBMA 5A4LA 5I9UA 4C61A 4BN1A 2HOGA 1BL7A 4AQCA 3D7TA 4DFZE 3DTWA 2IN6A 3BRBA 4ITIA 2X6EA 3P5JC 3UDTA 5HLNA 4HGTA 3JY9A 3RAHA 4UZDA 2VUWA 2C6MA 3AC3A 4FIIA 4IWOA 3W2QA 2UW3A 5EDPA 1L8TA 2FSTX 3E87A 2JLDA 3LOKA 3NRMA 4JS8A 5DRBA 4PP7A 1SVEA 2FYSA 2WIHA 1U5RA 5DOSA 3SXRA 3H0ZA 5IUGA 3LCTA 4MYGA 4WRGA 4F7NA 2A0CX 3F69A 4X2FA 5IEXA 4JX7A 3QZIA 1XBBA 1G8KA 3V6RA 3UO5A 3VUHA 2YWPA 1IA8A 5CWZA 4E7WA 4I5CA 3VULA 3DQXA 2IG7A 3JUHA 3R7VA 4A7CA 1AQ1A 2YHVA 3W1FA 3TKUA 4A9SA 1UKIA 1OB3A 2H96A 2YACA 3EB0A 3HA8A 3KCKA 4U5JA 5EDRA 1IR3A 2B1PA 3IG7A 3QTWA 1LR4A 4QP6A 3R9OA 1SVGA 4BDDA 2IWIA 2OFVA 4UX9A 3FMEA 3A2CA 2C4GA 3QQHA 4XHKB 3UODA 5IMEA 3ORPA 5E8UA 4Z55A 4O7LA 3IK3A 3KVXA 4HPTE 3IDPA 3LJ2A 3PIYA 4KINA 4TYHA 2XEZA 4TW9A 3Q4CA 3V04A 5IISA 2R3RA 1ZRZA 1OGYA 2OZAA 4F1TA 5B2MA 4EC9A 3U6JA 1NVRA 2OG8A 3QLGA 3EQDA 1TQPA 2GFSA 4IM0A 4QMQA 1XBCA 2J7TA 3W0SA 4ORKA 3FI4A 5FDPA 2IPXA 2QVSE 5HIDA 2ESMA 5HO8A 4C4EA 3SGCA 4KABA 3FSFA 5JQ8A 4L00A 1PYEA 3AC8A 2QLUA 2XK7A 5J9LA 1QMZA 4Z9LA 2JITA 3HMNA 4G2FA 4X0MA 4K33A 2Y4IC 2Y4PA 4E93A 1UKHA 4EH6A 5JGBA 2JGZA 4YLLA 1V1KA 3UG1A 3GI3A 1WMKA 3DNDA 4MD9E 4OTGA 2VTIA 4JQ7A 3ZLWA 2JIIA 4CCUA 5IUHA 4FV9A 3ZLSA 3G0EA 4JQ8A 5LVNA 5FD2A 2V62A 2UW0A 3G2FA 3COIA 4YJTA 1Q41A 3RTPA 2IVVA 1JKKA 4EOPA 4IE9A 4JR7A 4AWIA 5CF6A 2PY3A 2XJ2A 3VWAA 5L8KA 1PKDA 3AD4A 4PF4A 4B99A 3UDSA 1RE8A 3FYKX 1Q8YA 2UZEA 3ALNA 3ET7A 4DEIA 3D9VA 4RWIA 3F3ZA 3VS1A 3QA0A 5I9XA 1NY3A 3IPHA 2XEYA 4IAZA 3GC8A 3MV5A 3NW6A 4W4VA 4NCTC 2BCJA 1SZMA 2BZKB 3FLNC 1SNXA 1WCCA 3HRCA 2ITVA 2QOKA 3EOCA 1OL7A 2XNPA 3NNWA 5CVGA 3ZH8A 4BDKA 2HXQA 4EWHA 3A62A 4X7QA 3KB7A 4IZ7A 1H28A 3OXZA 4YZ9A 3LFDA 5HNGA 5M4CA 4UY9A 3TL8A 3NCGA 5B2KA 4IC8A 4R1YA 4USEA 4A4XA 4Z7HA 2Y4IB 3OZ6A 1BL6A 2V55A 4J98A 4GEOA 3BBWA 2X1NA 4RBLA 4LRMA 4DFYA 2JIUA 3HAVA 4FVRA 3VC4A 3BGZA 4JLCA 3BEGA 5AA8A 4EOLA 3NVMB 4AX8A 3OP5A 3QLFA 4DDGA 3S4QA 3BI6A 3TNHA 3TZ9A 1IAJA 2X4FA 4FYOA 1FMKA 2VTPA 4F65A 3ROYA 3TNPC 3GFWA 1Q4LA 3HP2A 4JBVA 3A7HA 3HV7A 4U0IA 3R9RA 3T3UA 1XMMA 3D5XA 5J9ZA 4M15A 3D7TB 3ZCLA 5CYIA 1P2AA 5CI6A 5GHVA 3O51A 4N70A 5IDNA 5M53A 3E5AA 2G9XA 4IZYA 5FBNC 2BPMA 2FB8A 4EQUA 4RMZA 4AW2A 1O6LA 3Q2JA 3FMDA 3UIMA 3DY7A 3R63A 4KIPA 5CQWA 2GS6A 2ITXA 5CX9A 2QONA 2CCHA 2CGVA 3ODZX 2OFUA 2WHBA 4GJ3A 4IMYA 4WKQA 3QGWA 5DYJA 2PTKA 2QHMA 3PJ1A 4C4HA 4QTEA 2YITA 1L3RE 5BUIA 4AQKA 1PXOA 4PTGA 3ZU7A 3I5ZA 3W8LA 3CD8A 4CZTA 5ANIA 4ANLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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