3BL7A

Synthetic gene encoded dcps bound to inhibitor dg156844
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
LPFSGFRLQKVLRESARDKIIFLHGKVNEEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLTGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRQLNDVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLRLIRETGDDYRNITLPHLESQSLSIQWVYNILDKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGIRSLRDLTPEHLPLLRNILHQGQEAILQRYRMKGDHLRVYLHYLPSYYHLHVHFTALGFEAPGSGVERAHLLAEVIENLECDPRHYQQRTLTFALRADDPLLKLLQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Scavenger mRNA-decapping enzyme DcpS
total genus 75
structure length 286
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.59: 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase.
pdb deposition date 2007-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05652 DcpS Scavenger mRNA decapping enzyme (DcpS) N-terminal
A PF11969 DcpS_C Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3bl7A01
3.30.428.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich HIT family, subunit A HIT-like 3bl7A02
1FHIA 4QEBA 3KSVA 5FITA 3N1TA 1GUPA 3P0TA 4EQGA 5EMTA 2FITA 3TW2A 4EGUA 1KPAA 1HXQA 4ZKVA 4NDHA 4YKLB 4INIA 4ZGLA 4NDGA 3BL9A 1ZWJA 3RHNA 1XMLA 3O1CA 5IPEA 3OHEA 5IPDA 3SPDA 1EMSA 3ANOA 4INCA 4NK0A 5IPBA 1KPEA 4ZKLA 3I4SA 3OMFA 4EQEA 1ST4A 3R6FA 3LB5A 3NRDA 3SP4A 4FITA 6RHNA 3I24A 2OIKA 4RHNA 3WO5A 1XMMA 1Z84A 1FITA 1HXPA 6FITA 2Q4LA 3OXKA 3O1XA 3N1SA 1KPFA 3O1ZA 3SPLA 1RZYA 4NDFA 5BV3A 4EQHA 1GUQA 2EO4A 1KPCA 5CS2A 5IN3A 3OJ7A 5I2EA 3BL7A 4NJZA 1ST0A 1VLRA 5IPCA 4NJXA 1KPBA 4QDVA 3FITA 3QGZA 5I2FA 5RHNA 4QDEA 2H39A 5ED6A 3L7XA 1Y23A 3O0MA 4NJYA 2FHIA 3IMIA 3SZQA 2Q4HA 1AV5A 5ED3A 3BLAA 4NDIA 4XBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VTTA 1OL5A 4CMTA 1YWRA 4ACHA 3FSKA 4FTRA 3PSDA 2E9VA 2C4GA 3U87A 1ND4A 4IJPA 5CT0A 1V1KA 5FITA 2YERA 4KBAA 3CJFA 4B4LA 2WQEA 2Y8OA 4DLJA 5CEOA 2VWIA 3COMA 3LCKA 3PWDA 2PZ5A 1O6KA 2QOCA 3K2LA 5A14A 1Y8YA 3PFQA 5J1VA 5DE2A 2RL5A 3MPTA 4F99A 2JITA 2BAQA 3RTPA 4ZGLA 2ZMDA 2H96A 4FR4A 4LL5A 4WO5A 2PU8A 2XF0A 3QRKA 4YJTA 5IH5A 4AT5A 2AUHA 3KQ7A 4EWQA 3PA3A 5J87A 4E6DA 5DR2A 4BCKA 4O84A 3ZO2A 3KU2A 3GU6A 4XG2A 1M2QA 3QQHA 1WVYA 5B2LA 1CMKE 5EM6A 4RGJA 3KCKA 1H26A 4WA9A 5CWZA 5EW3A 4JG8A 4V04A 3MY1A 4ZOGA 2VGPA 4K6ZA 4GK3A 3LCSA 3W32A 4F78A 3QQUA 4EOJA 3D14A 2B9FA 4XH6A 2EVAA 1R3CA 3LB5A 1Q3DA 3FC1X 4XOZA 3WOWA 3IECA 5AP6A 5GJGA 1OIQA 3A4OX 3A8XA 3KKVA 3FMEA 4C37A 4F9AA 2BHHA 1UV5A 3R1YA 2I1MA 3VUMA 3KXNA 1SVGA 4GS6A 4BBMA 3ORLA 4JMQA 4W4XA 3R0TA 4D4VA 4IM0A 4QMVA 4AW2A 5HIDA 5EW9A 2VX0A 4D1ZA 3R8VA 3HMNA 2OJ9A 3O1ZA 4C2WA 2C6EA 4X3FB 3R6XA 5FXQA 4QMUA 5AA8A 5ITAA 3VS1A 3QWKA 3V5TA 4E6CA 3DB8A 3CGOA 4HYUA 4FZDB 5EYCA 4CLIA 3AT2A 4D5KA 2HK5A 4TN6A 4AXFA 3TJCA 5I2EA 2ZM1A 4RFYA 1PJKA 5M07A 5FBOA 5A6OA 1UVRA 2GTNA 4ZJIA 4ASXA 3BE9A 3TM0A 1IASA 2FA2A 5HLNA 3PZHA 4FG8A 4N4SA 3V04A 3PYYA 3ZRMA 3UOKA 1SVEA 2IZRA 4U9AA 3RAHA 4O21A 5HNBA 4G0AA 3HMPA 1NVSA 4YO4A 5EHYA 3U55A 2GNGA 3ZSGA 1IAHA 3FXWA 1LUFA 2ITVA 3HMOA 2GS2A 1QPJA 4MF1A 3MBLA 3PSBA 4BR3A 4EOLA 2XK9A 3GBZA 4E4LA 3R04A 5BYYA 2QODA 3WF9A 3JXWA 5JFWA 1PMEA 3W8LA 3DU8A 3GEQA 2WOUA 4I5MA 4QYHA 2O3PA 3DTWA 3WZDA 2QCSA 2JFLA 2JC6A 4NTTA 1J91A 5HKMA 4RC4A 4WNPA 3C4WA 3F61A 3FMJA 1W98A 5E8UA 3PP1A 4BZDA 3Q4TA 2NPQA 5J9ZA 4ERWA 5T68A 5LMKC 4EK6A 4BDAA 1XQZA 3MV5A 4AFJA 3KFAA 1F3MC 4EHGA 4JBPA 3RCJA 4ENYA 1UNHA 2BPMA 3R1QA 2QU6A 2YM4A 4GU9A 1I44A 4L01A 2C0TA 3MS9A 4HCVA 4PF4A 3FXXA 4DDGA 3TDVA 3AC5A 4TXCA 2CCHA 4BI0A 4BDEA 4G3EA 1QMZA 2BILB 3DAEA 3I5ZA 5CT7A 4C4FA 2WTDA 5KZIA 2GFCA 2JEDA 2BDJA 3WF5A 4H36A 4IW0A 4FOBA 5I9VA 3UIXA 5KBQA 3IGOA 3PP0A 4GH2A 4MAOA 3RNYA 2C6DA 4NDGA 3ATSA 3E88A 3CPCA 1ZWJA 3QRIA 4KNBA 2C6IA 4DYMA 5J5SA 4BHNA 3TUDA 4PL3A 4O86A 2C0OA 2C3IB 4CMUA 2V22A 3QGYA 1WBSA 2R3MA 3QTRA 4RZVA 4ERKA 5JT2A 2ZFYA 3A61A 2W9ZB 2W9FB 4ZK5A 4NZWB 4GG7A 5EH0A 1EMSA 2XALA 4CLJA 2C5XA 4GEOA 3EMGA 5CF4A 4Z3VA 1V0BA 5K4IA 4INCA 3C1XA 4C7TA 3FYKX 4FK3A 5IPBA 3PLSA 3DBFA 4EK5A 5GIOE 2UZTA 3NUNA 1Q97A 2RFNA 3AC3A 3RCDA 2A19B 2ONLC 4EQEA 4OTWA 5CEMA 5AUVA 4UZHA 5EI6A 3DQWA 2CCIA 4V05A 4QMMA 5HE1A 4RX7A 3ROYA 6RHNA 4BDKA 2GU8A 4LRJA 5LOHA 4FKGA 4X6RA 1AQ1A 3AGLA 3K5VA 3O8UA 4JRNA 3UOJA 4C02A 3BLRA 5IEYA 3EQGA 5DH3A 2JDTA 4RZWA 4Z55A 4YO6A 3C9WA 3C50A 3UNKA 2VTPA 2XP2A 3HMMA 4YNEA 3SPLA 3QZFA 4CRLA 1IR3A 4FJVA 4I92A 4L7SA 5DYJA 5EKNA 1SNXA 2W7XA 3Q2JA 3QCQA 1GUQA 2YM6A 1HCKA 5IN3A 1TKIA 5DOSA 3MY5A 3BI6A 3SKCA 4L53A 4QP1A 4TRLA 2ITYA 1PKDA 4GUEA 3AD4A 4G6OA 4TYEA 5LWNA 3UMXA 3VHEA 3QTQA 2F49A 3DPKA 4K9YA 2IO6A 5HVYA 3S2PA 5M08A 2GHGA 3PIYA 3U54A 4ZY4A 3ZZEA 5JGBA 4CT1A 3CSVA 5FP5A 1ZXEA 4O7NA 3CTHA 5ED6A 5K5NA 1PW2A 3BYOA 3ZFMA 5AIKA 3W2QA 1MRYA 4JBQA 2BZJA 4Y5HA 4ZTRA 3LE6A 5AX9A 3VJOA 1OITA 1PF8A 2F7ZE 4DAWA 3ELJA 3BBTB 5HG9A 4CV9A 3HVCA 3QKLA 4BI1A 3KXMA 5CU4A 4QMPA 3W2SA 3RINA 1H27A 4IWQA 3LJ0A 4JL9A 1FBNA 4LG4A 3R8ZA 3LCTA 4U45A 2XIKA 4NWMA 4A9TA 4EQCA 4AZTA 4F1MA 2O5KA 2IPXA 3NRMA 5E7RA 4TYHB 5JFXA 3TDWA 4HVDA 3WZEA 5C4KA 4A06A 5IQGA 1V0PA 1OL1A 1HCLA 3IONA 3FI4A 4AE6A 3DK6A 3IOPA 5BVFA 4XBRA 4CCBA 5D41A 4MCVA 3QCYA 4X7QA 4FV1A 2OU7A 2PE2A 3GGFA 3U6IA 2R3HA 4FYNA 1NVRA 3FSFA 2HWPA 4RT7A 4V0GA 4LOPA 3SOAA 4I5TA 4YKLB 3EQRA 3T3VA 2VTSA 3P86A 3PVUA 4OT5A 4MNFA 4FIIA 2A27A 5AV3A 3BL9A 2UZUE 4JJRA 5DNRA 2QG5A 5EK7A 4E73A 2X2LA 1G8KA 3LM0A 5EI2A 5LVLA 2VWXA 4GKIA 3I6UA 4EZ7A 4HYSA 3HA6A 5J1WA 3AKJA 5IPDA 3DXQA 4YHJA 1WBVA 2YM3A 4AWIA 4XV3A 2OJIA 3A7IA 3GUBA 4RIOA 2XYNA 2J0MB 5CU0A 3QZHA 4I41A 3RMFA 5M4IA 2JKQA 5TF9A 4TTHB 4X2KA 3CC6A 4IIRA 4BCMA 5ANKA 2QURA 3UP2A 2C5VA 3WILA 4EYMA 1IA8A 4FKUA 5LJJA 4QMTA 5KX8A 3PXRA 3BKBA 1K3AA 2Y4IB 3CTQA 4CSVA 5M4CA 5KE0A 2R7JA 1PXKA 5I9UA 1GNGA 4GIIA 4L46A 1XWSA 3FMDA 4RIYA 2W1DA 3OY3A 3F3TA 4M12A 3EN7A 3NX8A 1XKKA 3ZXTA 3HAVA 4ASDA 4BKJA 5I4NA 2W5AA 5C4LA 1ZRZA 4A4LA 4E5AX 2OIBA 4GMYA 3OFMA 1OKZA 2YDJA 4CXAA 4FSUA 4U3ZA 4Y85A 3S95A 2QNJA 4HGLA 3POOA 4XG9A 2R3KA 4R6VA 4FTKA 2BR1A 5DWRA 3M11A 4CFFA 4ZSGA 3D15A 3VBVA 5IA1A 4Q9SA 5AP2A 1WCCA 2JDOA 3MWUA 5C8KA 2ZAZA 3H9RA 4O7TA 3T3UA 4C38A 5CS2A 4O27B 4R77A 4RIWA 3TIZA 4FKRA 5AA9A 3LVPA 3PA5A 2X9FA 1O9UA 4MXOA 3LM5A 2ZV7A 5EDRA 4E4XA 2HAKA 3QTZA 4OR5A 5HBJA 2IZTA 1XJDA 2OGVA 3GCSA 5AUYA 1G8SA 4IADA 3IW7A 3VUGA 4B6LA 3KA0A 5JKGA 4EC8A 4EH3A 2CNUA 5E1EA 3SX9A 5L6WL 4CGAA 4YTFA 5BPYA 4O38A 4FV7A 4IVCA 2E2BA 2UW4A 5HBEA 2IVTA 2UW3A 5JRQA 1M2PA 3MH0A 3L7XA 3QKKA 3A7GA 3Q6WA 2QONA 3VRZA 3RHXA 4FYOA 3FQHA 4PTCA 5JQ8A 3N9XA 3RPOA 5TO8A 5AV4A 3NVKI 4MNEB 4YLJA 2ETMA 3QC4A 2J4ZA 2IW9A 3OCBA 3D2KA 3FYJX 4PP9A 1CKIA 3BQCA 3VUKA 2WMAA 2G1TA 3HUBA 3UQGA 2WMXA 4GJ3A 4IB5A 2CPKE 3E8EA 1YOJA 4NU1A 3W0MA 5HVJA 4CZTA 4FT0A 4PMTA 2W1EA 2B7AA 3DY7A 4XHKB 4JIKA 3DA6A 3EL7A 4JIAA 1YW2A 4AACA 4BCQA 4MD7E 2WGJA 5CQUA 5EYDA 5GHVA 3Q2MA 4BDHA 2OH4A 5ANIA 1KV2A 4IVBA 5IZFA 4E5WA 3H9FA 3UZPA 4TW9A 4CG8A 5EQEA 4DFUA 4QQJA 2VTJA 3BBWA 1E9HA 4KIQA 1ZYDA 4KRDA 3U9NA 1BMKA 4JX7A 3ODZX 3PPZA 3QYZA 4GFOA 5T3QA 3A7JA 5JGAA 5KHWA 4NDHA 2Z7QA 4TPTA 2VWUA 5KUPA 3UIUA 3R9HA 5JZJA 3BEGA 3F69A 1PXNA 4FV4A 4KINA 2RFSA 3OROA 3BLQA 3II5A 3FEGA 4IWDA 3G9NA 3UDBA 4NJDA 3NR9A 3VUHA 4K18A 4O0VA 1GZ8A 3G2FA 4HPUE 4ZLOA 1SM2A 2HENA 3PVGA 3QUPA 4EH8A 4JDKA 4DHZA 2PVFA 1OBGA 2HXLA 2QR7A 3GP0A 3QD3A 1Q99A 5AEPA 2PZYA 2PZIA 1KE9A 3C0IA 3KY2A 2HZNA 4CFMA 4XG3A 2O65A 4K11A 4XEYA 4FKOA 2I0YA 4QMYA 4QYEA 1KPEA 5J9YA 2ZM3A 2C5NA 2R7CA 3ENMA 1ST4A 4O83A 3NFGB 4XG8A 3SP4A 1ZY5A 3UIMA 3KULA 2PMOX 4FOCA 1UU9A 3KF4A 4I0SA 5EM8A 3EIDA 3PRFA 4NM5A 5J8IA 5B7VA 4AN2A 3GU8A 2HWOA 1JKTA 5LMAA 4BDDA 4YURA 1PMUA 1UWHA 2X6EA 3AQVA 2ITWA 4MD8E 4QPSA 3FJQE 4I22A 4WRGA 3FQEA 4OTIA 2HZ0A 3AKKA 2BRHA 1REKA 1ZARA 2I0EA 4YC6A 4WG5A 5IQFA 1F0QA 3OEFX 3W0OA 4CVAA 2R3JA 2WIHA 2WMWA 4QQCA 3QFVA 5FG8A 4FT7A 3QZGA 3SXFA 4HVGA 5HIBA 1PXJA 3C13A 5E90A 5FLFA 2DS1A 5BUJA 3FKLA 3P5JC 2PUNA 2WB8A 1OGYA 1FPUA 3DK3A 3UNJA 3NDMA 4BDCA 4BF2A 4BGGA 4EOQA 5FEDA 2IZUA 4IBMA 4M14A 4DLIA 1OBDA 2R0IA 5C8NA 2WTKB 3JYAA 1I09A 2XK4A 4HGEA 3AKLA 5CY3A 4J52A 1H07A 4JAJA 3DZQA 4IFGA 1XH4A 3IPHA 2FYSA 3H10A 4DEGA 4EJ7A 2QOBA 5ACBC 1OI9A 2V0DA 2W06A 5L2WA 5E8ZA 3QCSA 4LL0A 1Y23A 1HOWA 3LFFA 4II5A 3RAWA 4YTHA 3SLSA 1H0VA 2PPQA 2WTVA 4FODA 4AXEA 5HORA 4L00A 2GFSA 1OL6A 2YISA 4FIEA 3V8SA 4MYGA 1ATPE 5IQCA 4G6LA 3EYGA 3F2RA 3A8WA 4ORKA 5D7AA 3RM7A 4H58A 3I1AA 3U9CA 1Q61A 2W96B 5CSVA 4D55A 3UBDA 5IG1A 2HXQA 3CBLA 1OUYA 3DBCA 2Y4PA 5BMSA 5DIAA 4RIXB 3QTWA 3OXIA 2OJJA 2BFYA 3OHTA 4NFMA 5AV2A 5HO7A 4FKPA 3P0TA 4EQGA 2CGVA 2UZLA 3UPXA 3QD0A 4A9YA 2H34A 1ZZLA 2C5OA 3BQRA 4FTQA 5AM7A 3ITZA 4LGGA 4TYJA 4F64A 1FVVA 3F3WA 4BZOA 3ZU7A 1KPAA 1HXQA 4GU6A 1STCE 4PWNA 4YNOA 4ALWA 4OW8A 4M0YA 1ZMWA 4L7FA 4F63A 3QUDA 4FSZA 2ESMA 3WZKA 4C0TA 4EZ5A 5J9LA 4FV9A 3HA8A 3WZUA 4KKGA 1WZYA 2OIQA 5CEIA 5LQFA 5ETCA 2QOHA 2UV2A 4E4NA 1XMLA 3MVMA 2OSCA 4BCFA 5A9UA 3Q9WA 3LQ8A 4IH8A 4EOOA 1SYKA 4EYJA 3UP7A 3NUUA 2G15A 3IG7A 3MFSA 3QQJA 4L44A 1P5EA 3QF9A 4QT1A 2CDZA 2ETKA 3M2WA 3KK9A 3NUYA 2VX3A 3EQDA 3ORPA 5IU2A 4JQEA 3TI1A 2PVLA 4MXAA 1PXPA 4GUBA 5BVDA 3OZ6A 4EOMA 4FTMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4MED A;  3VS3 A;  4FZ6 A;  5TT7 A;  2GCD A;  4RJ4 A;  3LCD A;  3RPV A;  1JBP E;  1ZOG A;  2UW7 A;  3O23 A;  3Q96 A;  4FNW A;  5CNO A;  2Z8C A;  3C5I A;  1OGU A;  3NZ0 A;  2FST X;  3OUN B;  4DIT A;  1ST0 A;  3TEI A;  2ITQ A;  3OWP A;  1XH9 A;  1J1C A;  1XR1 A;  3E8D A;  4XCU A;  3Q4U A;  4HVS A;  2ITU A;  3OOM A;  4ZZM A;  2UW5 A;  4F7J A;  3KMW A;  2Z7L A;  1JNK A;  3BV2 A;  4YJN A;  2O8Y A;  4JOA A;  2XCH A;  4DE4 A;  3NSZ A;  1R0E A;  4WOV A;  3ZLX A;  5JFV A;  1H01 A;  1X8B A;  3NYV A;  4CKR A;  2WPA A;  2VU3 A;  4O0W A;  3O0G A;  1YQJ A;  3A2C A;  4KSP A;  3B8R A;  4L52 A;  4AXD A;  2JKK A;  1TFF A;  4LM5 A;  3ZSI A;  3QGW A;  1OL7 A;  4NCT A;  5AP7 A;  2ZJW A;  3QAM E;  5BYL A;  4DC2 A;  1KE5 A;  3BLA A;  2DYL A;  4FSQ A;  2XNO A;  3JY0 A;  3QXO A;  4O0T A;  5HEZ A;  2C30 A;  4NKS A;  5H8B A;  3FAA A;  3Q4Z A;  4EH7 A;  3ZXZ A;  3ZFX A;  3ETA A;  1J1B A;  4QMX A;  3WIG A;  4I4E A;  3F5P A;  2XAM A;  3IDC A;  1IEP A;  3DTC A;  3GXL A;  1Z57 A;  4WNK A;  2WQO A;  2RFD A;  2EU9 A;  3Q52 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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