1IAJ | Genus

Total Genus 72

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	72
sequence length	278
structure length	253
Chain Sequence	YYYSAVERNNLMRLSQSIPFVPVPPRGEPVTVYRLEESSPSILNNSMSSWSQLGLCAKIEFLSKEEMRRAVKVLCTWSEHDILKSGHLYIIKSFLPEVINTWDTVLHLCLREIQQQRAAQKLTFAFNQMKPKSIPYSPRFLEVFLLYCHSAGQWFAVEECMTGEFRKYNNNNGDEIIPTNTLEEIMLAFSHWTYEYTRGELLVLDLQGVGENLTDPSVIKAEEDAIKNFRAKHHCNSCCRKLKLPDLKRNDYT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of the atypical protein kinase domain of a TRP channel with phosphotransferase activity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRANSIENT RECEPTOR POTENTIAL-RELATED PROTEIN
molecule tags	Transferase
source organism	Mus musculus
total genus	72
structure length	253
sequence length	278
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2001-03-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02816	Alpha_kinase	Alpha-kinase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.200.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	Protein kinase-like fold	MHCK/EF2 kinase	1iajA02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	1iajA01

4M68A 5KBQA 3RPYA 5HQ0A 3F5XA 3NW7A 3DQWA 4QMVA 3EWHA 4BICA 1GAGA 5KKRC 5C8MA 1H1WA 3COHA 3H0YA 1XH7A 4I5PA 2W0JA 1K9AA 4U5JA 3P78A 1UU8A 3D7ZA 3MDYA 5FEDA 3VUDA 1ZARA 4GFOA 4FTJA 4TYHB 3E7VA 3TJDA 3F66A 2C6MA 4QRCA 4NL0A 3TM0A 4F08A 3NZ0A 3O23A 4JG7A 4YTIA 2I0HA 1PRYA 4MHAA 4EOQA 3QF9A 4S33A 3QD4A 4QP3A 5JK3A 4LUEA 4C36A 4KAOA 4B8LA 3VF8A 3MV5A 2JC6A 2YDKA 4IADA 5TOZA 2PYWA 4JQ8A 4QQCA 1OPLA 3RPVA 5KMOA 2FSTX 2UW6A 3FY0A 4Y8DA 2VTQA 2YITA 3FMNA 5AIKA 5DN3A 4Z7GA 4PF4A 4IJPA 2PVHA 2CCIA 3NVKI 4CLJA 4IB3A 3KGAA 4GK2A 3VBWA 2J9MA 4TYIA 1AD5A 2R3OA 5EM5A 3FPQA 4EH6A 4QYGA 5GJGA 3TKIA 4AP7A 5AEPA 4IFCA 4WBBB 1H27A 4IIRA 4AZEA 2XRUA 4QPSA 3IONA 3HMMA 1U4DA 3ORNA 4BCMA 3R83A 3G6HA 2WXVA 1LUFA 3R21A 3DZQA 3TXOA 3UZRA 3WZUA 4FZ6A 4DFYA 4ZAUA 2W99B 5C9CA 4YURA 4ZLOA 3OCTA 2V7OA 1YHWA 4NH1A 3C4FA 1L3RE 1AGWA 3A4PA 5CEMA 1FINA 2PMIA 4G5JA 4UB7A 2OG8A 4E4LA 2OI4X 4J95A 2OFUA 4C3PA 3PXYA 1J7UA 4GG5A 4M8TA 4YBJA 2OZAA 4FSQA 4ZZNA 5CSXA 5ITAA 2BILB 1J91A 4ASEA 3MIYA 2J90A 1MRYA 2W1GA 4UEUA 4AN2A 4GFGA 4QTEA 3A8XA 3NRMA 3NW6A 2ZMDA 3R22A 2PTKA 3VS2A 2O8YA 2BZKB 3F3VA 2QODA 2ZM4A 5K5NA 4YPDA 4LYNA 2O5KA 4PMMA 2CN8A 1OL5A 3PLSA 4BI2A 2X1NA 3C0GA 3QRJA 4FI1A 4FV5A 3UE4A 4ACCA 5M4IA 2OJFE 1ZY5A 2ZDTA 3P7AA 5CZIA 4RVLA 4BZDA 4I4FA 4DITA 4J8MA 4Q9SA 4W8EA 3UC4A 2RFNA 1URWA 1Z9XA 2WELA 1WBOA 2XIRA 3M11A 3UJGA 2C3JA 3MPAA 4C37A 1ZYJA 3MPMA 4XCUA 2WIHA 3VHEA 3C4XA 1BLXA 4CMOA 3MTLA 5GHVA 2BCJA 1IA9A 4XG4A 3IPHA 3SRVB 1I09A 4I94A 5D10A 2X0GA 1Y8GA 4EH8A 3Q3BA 2WMAA 2JBOA 4PUZA 3A62A 2YCFA 1OIRA 3PJ3A 2ETKA 3HUCA 4D4RA 4DFNA 3HP5A 3Q4CA 3F3UA 3F3WA 4JOAA 1E9HA 2XH5A 3CQWA 4X3FA 2JEDA 3TWJA 4QOXA 2XJ0A 1WVXA 3KL8A 5B0XA 3ZU7A 4BVUA 2JD5A 4EHGA 2H96A 2XK3A 4ZJVA 2NRUA 4Z7HA 4AF3A 1OVEA 4FOCA 3UOJA 2VTTA 4BN1A 5CEIA 3E5AA 4OBQA 1YXUA 2E9OA 3EQBA 1FPUA 3EB0A 2WMUA 1NXKA 1X8BA 4F7JA 3QTQA 5HG9A 4LG4A 3N51A 2GNFA 1YOJA 4FIIA 3NSZA 5JZNA 3S95A 4CFMA 4YJVA 5BYYA 4MKCA 1TQIA 2UZWE 3HKOA 4X21A 3VRYA 2VD5A 3ZUVA 2J5EA 4AGDA 3ZLWA 3LOKA 1XHAA 5EYKA 3U9NA 3UQFA 3TV7A 3Q52A 5AAEA 4PNIA 4ZY5A 3PG1A 1KWPA 4E6AA 5L6PA 4MWHA 4CEGA 2WOTA 4I6BA 4IB0A 5CZHA 3F5UA 4CKIA 4CMTA 3D5XA 3BU3A 4JI9A 5ETIA 5J7HA 4YLJA 4A9TA 5E8SA 2VTIA 4FSZA 5HTBA 2A19B 3R00A 4OTRA 1SVGA 2BVAA 3HMIA 4LV8A 1PMNA 5JRSA 1OB3A 2CKPA 3UNZA 4N6YA 2VWBA 4Z9LA 3AD6A 2XBJA 3R28A 1RW8A 2C5XA 4E6QA 4NFMA 2IW9A 1U54A 2B9IA 4L45A 4DYMA 3R1QA 3GU6A 4RX5A 5D12A 5CSWA 4OUCA 3TNQB 2Y8OA 3RM6A 4AT3A 4YUQA 3ZDUA 4FODA 3SAYA 4RT7A 4KUJA 3LCOA 4IDVA 4O0YA 4EZ3A 2C6DA 3F6XA 3QX4A 4EOPA 5JFVA 1R0EA 2X4FA 3D9VA 3OXIA 5LMKA 4G9RA 2RIOA 5E8UA 3UVRA 2BTSA 4C2WA 5L2WA 1PKGA 4AA5A 3VS0A 4JAIA 5JFXA 3KQ7A 2UZNA 3LIJA 2VNWA 4TTHB 1QPEA 4GL9A 4IFGA 3ULIA 4JQ7A 3P86A 3HV4A 1B6CB 3G0EA 5E1EA 3VJOA 3MWUA 1VR2A 1U59A 4FGRA 2XBAA 4DCEA 2VNYA 2C1BA 4FNXA 2QD9A 3N4TA 2R3RA 4J8NA 3ZUTA 3BGZA 4BYIA 5LVNA 4TRLA 2QOBA 3DOGA 3O8PA 3ZM4A 4C35A 2H34A 4X2JA 2PZIA 2C5OA 4O7NA 2GQGA 1WBPA 5EDPA 3SOCA 2ITPA 5KCVA 2B9HA 4IX3A 5FD2A 3OP5A 1LEWA 4BDIA 3L9PA 1YI4A 4YSMA 4R78A 3VS5A 5HG8A 2XKDA 3PSCA 3R1SA 3E64A 3OW4A 3DPKA 5DT0A 4ANBA 3QYZA 3W55A 5JQ5A 4G5PA 1CKIA 3FE3A 4X2KA 4E5WA 4EL9A 4HVDA 3VQUA 4D58A 2PVMA 3WZDA 3EJ1A 1M7QA 4DTBA 3ENHA 3TCPA 4YO6A 2XNBA 3F2RA 4ZSEA 4YJNA 4GFMA 3ATSA 2VWZA 4JR3A 2CNVA 4KIOA 1NY3A 2JKKA 2OKRA 3QTUA 4RIOA 5AP4A 4GVJA 2PUNA 1BUHA 3AMAA 4IBMA 1PF8A 4UWCA 3T8OA 3EN5A 3E8DA 3VW6A 3O50A 3R7OA 5C8NA 1YDSE 3FMEA 4TZRA 3UNKA 1W8CA 4BHZA 2ZV2A 3PRFA 4OBPA 4XRJA 5EK7A 4DLIA 5LCJA 4AGUA 3OVVA 1SYKA 2XK7A 3HMPA 4MEDA 2Z7SA 3MVMA 3MI9A 1XO2B 4IVBA 3UO4A 1JVPP 4O22A 4KS7A 3LPBA 4ZJJA 4F9CA 2R3HA 4R6VA 4EOSA 3ZRKA 4FTNA 5JSMA 3ROCA 3VJNA 4IW0A 2X2MA 1QL6A 3MB6A 4TKSA 4QMNA 1ZMUA 4U42A 3DXPA 2XK4A 1ZLTA 2ZV7A 3THBA 4ZEGA 4ZSJA 4FNWA 2QOQA 1UVRA 3EN4A 3A8WA 4TWPA 1IG1A 4XOYA 3UMWA 4G6OA 2R3IA 3V5PA 3VW8A 2YIXA 4R3CA 3QGYA 3P23A 2VO6A 5DLSA 4BDDA 2QKRA 4N4SA 3IG7A 2YA9A 1UKIA 4NM3A 4X3FB 4KINA 4DEHA 4EC9A 4YTCA 5C4KA 3DKFA 3I5NA 1H01A 3G9NA 5CU3A 1KE9A 3RAIA 3PP0A 1PY5A 1K3AA 4ZLZA 4BDKA 2YCSA 2PZYA 4BHNA 3WE8A 1UNLA 3DCVA 4AW5A 3FL5A 3EFWA 3ZSHA 2OLCA 3CE3A 5HU9A 4JT3A 5HD4A 3OHTA 4CFUA 3CQUA 3QC4A 3W8LA 4NZWB 4EOOA 2XCHA 1MUOA 1Q61A 3HAMA 2C5VA 2R3FA 3WZKA 4ANQA 4F0IA 3KVWA 4XBRA 3PZEA 3SG9A 3F69A 4EH2A 4PDPA 4FTKA 5FLFA 3MB7A 4D55A 3TTIA 3Q6WA 2C3KA 4CG8A 4KKHA 3R9NA 1LEZA 2QOCA 4NIFB 4D5HA 2YZLA 3CKXA 2VWYA 4L7SA 5J87A 3T9IA 1W98A 1Q62A 3LW0A 2X6DA 4JJRA 3M1SA 5DT3A 4D1SA 2CJMA 4DFLA 3LCTA 4EQCA 5DR9A 2BZJA 3GXLA 3R0TA 2J0JA 2JBPA 1O6LA 3R73A 3DJ7A 4EUUA 5LXMA 3MBLA 3OG7A 4AE6A 3EYHA 3HMOA 4CXAA 3Q96A 3Q6UA 1H28A 1U54B 4FTRA 5A6NA 2GDOA 4YJRA 3UYTA 1KV2A 4NM5A 4QT1A 4UYAA 1QPDA 3LFDA 4YJSA 5DGZA 3WARA 3DT1A 3PG3A 3U87A 4WG4A 2XK8A 3CR0A 3DNDA 2YWVA 3DAJA 2JAMA 3OBJA 2R3LA 3SX9A 2X8DA 2SRCA 2W1EA 1Q99A 2PULA 4P5QA 3HDNA 3NYXA 4ZTSA 4NCTC 1UWJA 5HVYA 5ANGA 4E1ZA 4ZTMA 3IO7A 4O2PA 3R7UA 4XG6A 5EYCA 2XKFA 4EWQA 3CS9A 4TYEA 5GIPE 5CU0A 2HXQA 3RHKA 4RQVA 4DBNA 5JGAA 2ITVA 3R1NA 1SZMA 3C51A 5AP7A 2DYLA 3QL8A 4ZSLA 4YBKA 3QTRA 4YLKA 3EYGA 4FX3A 5AM6A 3KRWA 5HBEA 3F7ZA 3MY5A 3OWLA 3EFLA 3Q53A 3R8MA 4LV5A 4WO5A 5BVDA 4ZXTA 5BUIA 4FKGA 2QNJA 3NWWA 4NKAA 3VBQA 1MP8A 1UU7A 4ZY6A 2C0IA 5CU4A 4XOZA 3U6HA 5B7VA 5IMEA 3Q04A 4IAYA 1DI8A 2VTNA 3UQGA 3UC3A 4ZTNA 3VRZA 2V22A 2C6IA 4IE9A 4P7EA 5EHOA 3KULA 1Q3WA 3FZPA 5JH6A 3ZZEA 4EJNA 2HXLA 1GY3A 2G01A 2UW4A 3OFMA 3W2QA 1ZY4A 4R3RA 2QOHA 3GCQA 5IQDA 2W1ZA 4JBPA 4M84A 1Q8TA 5BPYA 1ERKA 4F6WA 4BB4A 2W4KA 5EDQA 4I41A 2R9SA 4O83A 2EWAA 2UW5A 4IQ6A 4AUAA 4NJ3A 3RHXA 4F63A 3D5WA 2C30A 2X7OA 4WRSA 5DG5A 2YACA 3LAUA 5CTPA 3S3IA 4O7LA 4OTDA 5E8VA 4QMPA 2G2IA 2WQEA 5HNBA 2WTIA 2B53A 1PXOA 4BY9E 2J2IB 4B6LA 1FGKA 5EI6A 4TPTA 2ITQA 2WO6A 5F1ZA 5AUZA 4JBOA 3NNUA 3TDVA 3ZLXA 4EQUA 5M06A 4BC6A 3NLBA 2QKWB 4DG3E 3FMLA 5DI1A 2GPHA 3NAXA 4WUNA 2GFSA 4ZSGA 4I6QA 5EQEA 3QCYA 1WBSA 5I5ZA 2W4OA 3FBVA 3E8NA 5AAGA 1YOMA 3CBLA 1J3HA 3KC3A 3VUHA 4E4NA 4R5SA 2PVRA 1Y57A 3KN5A 5A54A 5CASA 5IQEA 4S30A 4UWBA 3FAAA 3PJCA 4EQMA 3GBZA 2XM8A 3I6UA 4HCVA 2XIXA 5IDPA 3QGWA 3FZSA 4XJ0A 4EJ7A 3TUBA 1GIIA 2JLDA 5C4LA 2ZVAA 3PJ8A 2OJJA 2R5TA 4C4HA 5C8KA 3LXKA 3KXZA 5CAOA 3OWKA 3U6IA 5F20A 4KBAA 2HYYA 1WCCA 3BV2A 1XWSA 4JDKA 4X0MA 5BVFA 5CAPA 4CKJA 2GHGA 5L8LA 4MWIA 3QD0A 4AAAA 3QZFA 4UY9A 3MIAA 2I40A 3HRCA 3R1YA 4PDOA 5GJFA 5KKRB 2VZ6A 2BROA 5LARA 5CANA 2QURA 4CZUA 2OGVA 3QCQA 1OITA 4JL9A 3UG1A 4EI4A 4J53A 3OTUA 4BRXA 5BUJA 4ZTLA 4BCNA 2I0VA 3SDJA 4HVIA 4E93A 4ZSAA 2WTDA 1GOLA 4Y5QA 1PXJA 5ACKA 4Y83A 5T3QA 4HVSA 2A4LA 4ACDA 3FLQA 3IGGA 3FDNA 4M7IA 2I6LA 2F9GA 4P5ZA 1PXMA 3BHHA 4ZTRA 2XNGA 3L8VA 4FT5A 3I4BA 3CXWA 4J1RA 2KTYA 2EU9A 4LQMA 2F2CB 3FWQA 3AC5A 4FKTA 5HGIA 2F49A 3LM0A 4FTMA 3KRXA 3NDMA 4NM7A 1V0OA 3P9JA 3H10A 1YQJA 3D5UA 3EQHA 3IECA 1M14A 3COMA 4KBCA 4PV0A 4BDFA 3GENA 4BIEA 3GOPA 5BVEA 2JDTA 4HGEA 3IW8A 5HIBA 1O6YA 4JIKA 4KSPA 3Q2JA 2QI8A 4YPSA 3TTJA 2R4BA 2RG5A 3O7LB 4IACA 3MTFA 1YW2A 4GU6A 4KD1A 1GNGA 1Y6AA 2XUUA 4XG3A 3R9DA 1VJYA 2VTMA 3PWDA 3UP2A 2ITXA 4DHFA 4DEEA 1YI3A 1Z5MA 3I60A 4OT6A 4HNIA 5CI6A 1VEBA 4HYUA 4BKJA 5LMBA 5EDRA 2FVDA 2V55A 3EQDA 4IVCA 4YJTA 4OGRA 5AV0A 1P4OA 2VAGA 5H9BA 3W16A 5LWNA 3RAHA 3GU8A 1NA7A 3POZA 4U43A 4AZSA 3UIBA 4F7SA 3UDBA 2QQ7A 3UPXA 1YDRE 5M51A 2OK1A 5G6VA 2IVUA 3DZOA 3G0FA 4BBMA 3I0QA 4I5CA 5DRDA 3KK9A 3BYOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1IAJA

Total Genus

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Chain Sequence

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