2XANA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with amp pnp and ip5
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
435
structure length
414
Chain Sequence
MILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFSQGSGGDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICKEELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSRNAWDSEPSGDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQKAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase is a Distant Ipk Member with a Singular Inositide Binding Site for Axial 2-Oh Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 141
structure length 414
sequence length 435
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2010-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xanA01
4LV7A 4AXFA 3UDZA 2XARA 3UDSA 4AXEA 3UDTA 4AXDA 4AXCA 2XAOA 4AQKA 2XALA 2XANA 2XAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VUDA 2YCQA 4EQCA 5DT3A 3LFCA 4UWYA 1ZZ2A 2OH0E 4G3FA 5DH3A 4JG7A 1QPEA 3GCSA 3FLNC 4RWLA 2BMCA 5JRSA 3BYOA 2XBJA 4RJ5A 4O7VA 3UODA 2WD1A 1IASA 3DK3A 3QRKA 3QTUA 5FP6A 4XG3A 4BDCA 5JRQA 3OP5A 3UIXA 3F3ZA 5HG8A 2XEYA 3E8DA 2JDTA 4NUSA 4F1OA 1O9UA 3BHTA 4IX6A 2ZV7A 2XK7A 3FMHA 1KV2A 4I92A 5CT0A 4AW5A 4DGMA 2SRCA 4TNBA 5M4CA 1VR2A 1X8BA 5IISA 4PL5A 2BTRA 3QCYA 4IVDA 2Y6OA 1Q8ZA 5D7VA 3LM5A 5IA2A 3U87A 3NIZA 3PXQA 4LG4A 1GY3A 5CT7A 3OROA 3TV6A 4FV7A 2CSNA 4QPAA 3ZLXA 4EEVA 4G5JA 3KXZA 3QGWA 5AX3A 5HHWA 4YTHA 2O3PA 4CQEA 4F70A 4FV0A 4BB4A 3JYAA 3QU0A 4EOJA 4IW0A 1OL2A 5TO8A 5CYIA 2ZV8A 5AV1A 4J95A 5HKMA 1MUOA 3JY0A 2YN8A 3A62A 3PG1A 3GC8A 4YBKA 3VF9A 1I44A 1ZY5A 3FUPA 3QGYA 4NM5A 5LQFA 4I93A 4R7IA 5CANA 3FDNA 5CU2A 2YIRA 4OTHA 4UALA 4QTEA 3LLTA 4GT3A 3VRYA 3D7ZA 4YLJA 5EYKA 1A9UA 3WZEA 3E3BX 1WBNA 4TWOA 1APME 4D2SA 1OITA 5LWMA 2W5AA 3I6WA 2C6EA 3TJDA 5HLWA 3I7BA 3UOHA 4CG8A 4E4MA 1QL6A 2OJFE 3GU4A 3LFEA 3WI6A 1M2PA 1B38A 3UYSA 3ZMMA 3FLWA 2ZDUA 4YJNA 4N6ZA 5JH6A 2J6MA 2P2HA 4CG9A 3C0HA 3CXWA 4OTWA 2OXDA 3CD8A 4EOKA 3QXPA 5C01A 1FVRA 1NT2A 3W10A 3Q4ZA 4G5PA 4RJ4A 2X9FA 4ASZA 1GOLA 4EKKA 4F0IA 1P5EA 4J8NA 3R7UA 3W33A 4EWQA 5FXQA 3FZSA 4ZTLA 4AOTA 1ZYDA 3ZEWA 5EFQA 3Q4CA 4DFUA 3ORMA 2JAMA 3QUDA 4PUZA 1XHAA 2QD9A 3NNVA 4BCJA 4E1ZA 2PMNX 3PVWA 2GQGA 3C0IA 4XOZA 1OM1A 2JIIA 3QQGA 4MXAA 4ONAA 1CM8A 4GIHA 4UXLA 2C47A 5AFVA 2R3IA 4XMOA 3IOKA 5FDXA 2I0VA 3WF9A 4YZDA 4JOAA 3NUUA 2QI8A 3VNTA 3VUIA 3A4OX 4RX9A 4HVHA 1JWHA 2GCDA 5E8XA 3OEFX 4KD1A 5IA5A 4AW1A 4O27B 5AM7A 2W7XA 3R8PA 2QHNA 4JLCA 3FJQE 4S32A 3TV4A 2XYNA 1KOAA 5JFSA 3FV8A 4CT1A 4O2ZA 4K0YA 4XYFA 4HCUA 3ZFMA 2QU6A 2NP8A 4LOPA 4DAWA 5HEZA 4IE9A 3SOCA 2ZM4A 3I5ZA 4IDVA 3RI1A 3TNWA 3OW3A 4CTBA 2O65A 3IW8A 4K77A 3ENHA 4ITHA 4PTCA 2AYPA 3OTUA 3E62A 5I9ZA 2V0DA 4U3YA 1RDQE 4V0GB 4LQMA 1QPDA 4G9RA 4XG2A 4CRLA 4L68A 3E64A 3DKGA 1PMNA 4IAKA 4TYEA 4UV0A 5E8ZA 2X4FA 3KULB 5ETCA 2IN6A 4NWMA 2JKMA 3I4BA 4QMNA 4C38A 5DE2A 3TM0A 4CCBA 1J1BA 1F3MC 5B0XA 4D9UA 4N4SA 4L00A 1UWJA 3PA3A 3ML1A 4AXFA 2VTSA 4QP7A 1WAKA 5HTBA 2YJRA 4HGSA 5EDPA 3C7QA 3HX4A 2XANA 5AP5A 2NRYA 3IO7A 3HV5A 2Q83A 4XP2A 3JXWA 2C3JA 3AXWA 3C4XA 3KXXA 4MX9A 5CQWA 3U6HA 1URCA 3OFMA 2G2FA 1FGKA 2CLXA 3KK9A 3HDNA 3F5XA 3O50A 4MBJA 2HZ4A 1R0EA 4O2PA 3TACA 3WZUA 4JQ8A 3AT4A 3BYMA 5AUXA 2C5VA 3PY3A 3A60A 2BAQA 1Y8YA 3GC7A 3HV7A 4I5HA 4NM7A 5FEQA 5B2MA 4F0FA 3TKIA 4B7TA 5IH4A 1PW2A 4BCHA 4CFVA 4TL0A 4F6SA 3TUDA 4AQCA 3VW6A 2IVUA 4ZLZA 3P5JC 4FT0A 2H96A 3OG7A 4H39A 2B0QA 3DY7A 2VTAA 4BIEA 4RZWA 5C8MA 5IH5A 2R3RA 3H9FA 3EHAA 4LL0A 4YBJA 4BCKA 4FZFB 3BZ3A 3GFEA 3VHKA 3KKVA 3KRWA 1SNUA 3KREA 2X7GA 3QYZA 4S30A 4BDGA 5ACBC 3V6RA 4YHTA 4IH8A 3AG9A 4X3FC 3MPAA 1Q3DA 3P86A 3TZ9A 3VS1A 2IO6A 4MYGA 1TKIA 5HI2A 1GZKA 3LXPA 3QBNA 4MD7E 2GSFA 3TL8A 2W1CA 1SZMA 2JITA 4GJ3A 3ZSGA 5AA9A 1UU9A 2R7IA 4MNEA 4C3FA 3NMUF 4F6UA 4MWIA 5M57A 2UW9A 2UZEA 5A46A 3BEAA 5IMEA 1UU7A 4QMZA 3UO6A 4QT1A 2JDSA 3ZM4A 3HKOA 2QHMA 4R78A 4PNKA 3ZXTA 5J9LA 4K11A 3TG1A 3N4UA 1CKPA 1PMVA 4RT7A 4AWIA 3JPVA 1UV5A 3A8WA 4LL5A 2ITNA 4TZRA 2IWIA 4EONA 4PMSA 3C51A 4USDA 4BCNA 3QLGA 1ZYSA 1ZOGA 3G6HA 3CKWA 5K3YA 5IQHA 3D4QA 2XIYA 1JKSA 3H3CA 3HECA 1TQPA 1H1PA 3WYXA 1DAWA 1RE8A 4FV3A 1JKKA 5C27A 3GVUA 1XBCA 3NUNA 1W0XC 5CSPA 3G33A 4F1MA 3ZUTA 1J7UA 4AAAA 4IVAA 3G5DA 5T6KA 5IMXA 2R5TA 3CY3A 4QMWA 5EG3A 2XRWA 3W8LA 4YJVA 4UWCA 1P4FA 1VLRA 1IAJA 1VYZA 2QO2A 3GBZA 3NYVA 5HVKA 5I9VA 4U79A 5HE0A 3HZTA 3FI3A 3V5WA 5M56A 2W9FB 4QQTA 3IDCA 2C69A 4K6ZA 4EHGA 1CMKE 4IEBA 2YIYA 4FTLA 2ZVAA 3RZBA 2JC6A 3MV5A 4PP9A 2B9HA 3KRJA 4QMUA 3UZTA 4DH3A 4QMTA 2CGVA 4AGCA 4QP8A 1OKZA 5B2LA 5BYLA 4BZOA 3OZ6A 4BCOA 3UC4A 2UZWE 1WZYA 4DFXE 1FMOE 2NNWB 5FM3A 4MNFA 2XS0A 2Z7RA 2XNGA 3DV3A 3SXRA 4IWDA 1QMZA 2VWXA 4FUXA 4JT3A 3V5PA 4CKRA 3LE6A 4EK3A 1JNKA 2WMAA 4IAAA 2XK3A 2XK4A 3VS5A 5HBEA 5DR6A 4NTTA 3S00A 3MH2A 1OKWA 3ANQA 3DBCA 3QX2A 5K4JA 4EK8A 3QD0A 3P78A 4QP1A 2WB8A 5JQ8A 3SW7A 5KHXA 5ACKA 2P33A 3R30A 5A14A 4YNEA 1U59A 5CEKA 2JEDA 5BUEA 5E1EA 3OY3A 3VS0A 5BNJA 1ZMVA 3W2RA 4MXZA 2F2UA 3OEZA 4XBRA 4Z3VA 3VS3A 2XAOA 3DBDA 3KK8A 3V8SA 4EHVA 1U54B 5EYCA 3AT3A 4R3PA 3SG9A 1H0VA 3ENMA 3KMMA 4H1MA 5E90A 4HVIA 4BCQA 2XK9A 4ACGA 3EQGA 2PUPA 3CTQA 4B8LA 3TV7A 3FY0A 5L6OA 4AXEA 4AS0A 3QUPA 4KIOA 3O5AA 5H8BA 1YXTA 3OHTA 3R83A 4D0WA 3HGKA 5EM7A 5J1VA 5CAOA 4L7FA 3PUFC 4BY9E 3HAVA 4ZTSA 4FTIA 4BRXA 2FYSA 2YZLA 3C4ZA 2RFSA 4GT4A 3COIA 5AIKA 2RG5A 2ESMA 2WMXA 5FRIA 4MD8E 3ZC5A 4GEOA 4DDGA 4ACMA 3IW6A 4X2JA 3FKNA 2VD5A 3RK5A 4ZSJA 4FKTA 5FLFA 5DFPA 4AGDA 4AT3A 4AT4A 5TT7A 4D1XA 3PXZA 2I1MA 3R1SA 1WMKA 3OD6X 4V0GA 3U4UA 3QYWA 3UIUA 2W06A 3VBQA 2KTYA 4DHJA 4RIXB 4QNYA 3R7YA 4FTJA 3HMNA 4EH8A 4FTKA 4BF2A 4O7YA 3KULA 4L6QA 2BZKB 1BL7A 3KXHA 2UZVA 4CFMA 4E4LA 1SVHA 3K5UA 2J51A 4V05A 4QYHA 5IA1A 4O7WA 1BL6A 3ZS5A 4IJ9A 3AOXA 3ITZA 4BVUA 4DG3E 4RLKA 4WKQA 5BVDA 3V5LA 4I6HA 1YHVA 4IB1A 3AD4A 5E8VA 4HYUA 4AZSA 3ORLA 3V8WA 2QOHA 3QKKA 3T8OA 3VF8A 3NUSA 4C4FA 3MBLA 3PJCA 2WZJA 3JR1A 4C3PA 3FPMA 2CJMA 5HE2A 5I4NA 4G31A 2PMOX 1XH8A 2J0LA 3MVMA 2QODA 4X2NA 4CMOA 4PQNA 3OW4A 3E5AA 5L2IA 4KA3A 4OTQA 3SDJA 3V6SA 4WRGA 3RHKA 2BDFA 2X8DA 3TNPC 3W2OA 1WBVA 1H27A 5CAUA 4Z16A 2QR8A 4L8MA 1H28A 3A8XA 3O8TA 1I09A 2R0IA 3DZOA 3IS5A 1YWVA 3R02A 4OT5A 2I0HA 3LAUA 3QKLA 5ETIA 2IW8A 5AADA 3SA0A 5JN2A 3PE1A 2JDVA 2F57A 3AMAA 3CEKA 3DXQA 4NKAA 1LP4A 3W0PA 4AT5A 3LIJA 2I0EA 2GHMA 2WMQA 2PVFA 2YEXA 4RFZA 1J91A 3TUCA 4CD0A 5FXSA 2C0OA 1QPCA 3C4EA 5IDNA 5HG9A 3NNXA 2LAVA 2GPHA 2G15A 3CBLA 2EUFB 4FKUA 4EC9A 2H6DA 3OWKA 5FBOA 5HVYA 4RFYA 3KVXA 3EQDA 4OTGA 3COHA 2C6MA 4PNIA 2I6LA 2B9IA 3Q4TA 4I0TA 2R3MA 4KBCA 5F94A 4FL2A 5HLNA 2VO3A 5FEEA 2OGVA 1XH5A 2JFLA 3LMIA 4G3EA 5KMNA 4NCTC 1ND4A 2W1ZA 3AQVA 4LOOA 3NIEA 4FEUA 4ZK5A 5AP0A 1BKXA 1YWNA 5CEQA 4DBXA 2XIRA 3FC1X 4E7WA 3FMDA 4CMTA 1B6CB 3LXKA 2OZAB 4RIYB 3ORZA 3TNQB 4YTCA 2R3QA 2XVDA 3W2CA 4EH3A 4JVGA 4HYSA 1K3AA 3EH9A 2R3PA 2NYAA 3FKOA 3PG3A 4U41A 5F20A 3TT0A 2CMWA 4AE9A 3GCUA 1URWA 1OVEA 3BWJA 1Q24A 3RK7A 1MQBA 2X6DA 4IVBA 2WU6A 3L9PA 4DH5A 4B6LA 3CSVA 4BTKA 4DT9A 4EC8A 3WE4A 5L2SA 2FO0A 3DB8A 3VN9A 3R21A 1TQMA 5AJQA 3W0NA 4EUUA 3R28A 4BDKA 2PVYA 4FEXA 3KXGA 3OWJA 4O91A 3W8QA 5AAGA 2GQRA 2WQEA 3D83A 4FV8A 5B2KA 2HW7A 4CFUA 2V62A 5I9XA 4L9IA 3GQLA 4AZFA 4K18A 4WRSA 1VEBA 4FKRA 2QR7A 3RWPA 4XLVA 3HAMA 3DLZA 2BIKB 2VNWA 4RA4A 1PHKA 2QO7A 3BU3A 3VO3A 1TQIA 3UG2A 3C0GA 1YKRA 2Z2WA 3CCNA 4E6CA 3V3VA 4FYNA 2ZMCA 2F7EE 1YI4A 4D4VA 3FI2A 3ZDUA 2I0YA 2PVHA 1LEZA 2QOKA 3LCDA 4Y5QA 1O6YA 4ZJIA 5B7VA 5JGDA 5KX8A 1G8KA 1KUTA 3GT8A 4KS8A 4JIAA 2C3KA 4BYIA 2JKQA 1ZZLA 5KMMA 4EH5A 4QTCA 2J7TA 3FY2A 2XJ1A 1MP8A 4DT8A 4D1SA 3PFQA 4FSYA 3EYHA 3U6IA 2A19B 2XK6A 1KV1A 1XH4A 1M7NA 3MVHA 5FUTA 4FE2A 3QHRA 5HIBA 3EQFA 4LM5A 2CNVA 2OFVA 4D58A 4EH9A 5EDRA 3N51A 4F7NA 1DM2A 2GNGA 4L42A 3K3IA 4U0IA 1XBBA 3I60A 1U54A 2UZBA 2X7OA 3L9NA 3PZHA 3CJGA 5CVGA 3R9RA 5J5SA 2FVDA 4LOQA 4C4HA 3KFAA 3W1FA 2A4LA 3EZVA 5L8KA 2AUHA 3H9OA 4FKGA 3U55A 3I81A 4FVRA 4UXQA 3V5QA 3RWQA 4IWPA 5AP1A 5BUJA 3AGMA 4J98A 2C6IA 1Q5KA 3LMHA 1AQ1A 2OG8A 3HUBA 4ZTQA 5C03A 2V7OA 1YXVA 4H05A 1XQZA 4DCAA 5M51A 5K5XA 1BI8A 4D9TA 4UN0C 3R7VA 4QO9A 5IQEA 1SVGA 1STCE 3UE4A 4G6LA 2X8EA 5EDQA 3UNKA 5FTGA 2CNQA 3BU5A 3PSBA 3MY5A 3NUAA 4IWQA 5T3QA 3W32A 4R6VA 2OJGA 3O0GA 4LRKA 1TVOA 2JLDA 1PXMA 2VTIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3VUD A;  2YCQ A;  4EQC A;  5DT3 A;  3LFC A;  4UWY A;  1ZZ2 A;  2OH0 E;  4G3F A;  5DH3 A;  4JG7 A;  1QPE A;  3GCS A;  3FLN C;  4RWL A;  2BMC A;  5JRS A;  3BYO A;  2XBJ A;  4RJ5 A;  4O7V A;  3UOD A;  2WD1 A;  1IAS A;  3DK3 A;  3QRK A;  3QTU A;  5FP6 A;  4XG3 A;  4BDC A;  5JRQ A;  3OP5 A;  3UIX A;  3F3Z A;  5HG8 A;  2XEY A;  3E8D A;  2JDT A;  4NUS A;  4F1O A;  1O9U A;  3BHT A;  4IX6 A;  2ZV7 A;  2XK7 A;  3FMH A;  1KV2 A;  4I92 A;  5CT0 A;  4AW5 A;  4DGM A;  2SRC A;  4TNB A;  5M4C A;  1VR2 A;  1X8B A;  5IIS A;  4PL5 A;  2BTR A;  3QCY A;  4IVD A;  2Y6O A;  1Q8Z A;  5D7V A;  3LM5 A;  5IA2 A;  3U87 A;  3NIZ A;  3PXQ A;  4LG4 A;  1GY3 A;  5CT7 A;  3ORO A;  3TV6 A;  4FV7 A;  2CSN A;  4QPA A;  3ZLX A;  4EEV A;  4G5J A;  3KXZ A;  3QGW A;  5AX3 A;  5HHW A;  4YTH A;  2O3P A;  4CQE A;  4F70 A;  4FV0 A;  4BB4 A;  3JYA A;  3QU0 A;  4EOJ A;  4IW0 A;  1OL2 A;  5TO8 A;  5CYI A;  2ZV8 A;  5AV1 A;  4J95 A;  5HKM A;  1MUO A;  3JY0 A;  2YN8 A;  3A62 A;  3PG1 A;  3GC8 A;  4YBK A;  3VF9 A;  1I44 A;  1ZY5 A;  3FUP A; 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