2XARA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with ip6.
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
435
structure length
417
Chain Sequence
MILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRNDSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFSQGSGGDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICKEELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSRNAWDSEPSGDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQKAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase is a Distant Ipk Member with a Singular Inositide Binding Site for Axial 2-Oh Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 128
structure length 417
sequence length 435
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2010-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xarA01
2XAOA 2XALA 4AQKA 4AXDA 2XAMA 3UDZA 4AXFA 3UDTA 4LV7A 4AXCA 2XANA 3UDSA 4AXEA 2XARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PDTA 3RTPA 4W8EA 4ITHA 4GIIA 4F9BA 1U46A 2ITWA 4W4YA 5HESA 5KMNA 4FKQA 5TO8A 1PMEA 3PE2A 3VBXA 4WKQA 5T3QA 3RPVA 4Z7HA 3BKBA 1MP8A 4KRDA 4CZTA 3F2NA 4FTNA 3MFRA 4M8TA 5IA3A 2Z02A 5CF4A 4NM3A 3V5PA 4ALUA 3AC1A 1MUOA 3BGPA 4XG2A 3DB8A 5ACBC 3Q2MA 5GJFA 5DE2A 4L67A 5I9YA 3CBLA 3ORLA 3OUKA 4PNKA 4NH1A 3TJDA 4ZJVA 3CQUA 3OOGA 2EB3A 3UIXA 4MXAA 4TYHB 4YPDA 2WTKB 4C58A 1B39A 1WVYA 3VBWA 3FMJA 3MS9A 4FT9A 3GT8A 4U5JA 3KVXA 3D2KA 4BDIA 2WELA 5EM8A 1XWSA 4X6RA 1OKZA 1H1QA 2X4FA 3AMBA 5HLWA 1U5RA 4Q9ZA 2W1GA 4AAYA 3HUBA 2OZAB 4RVKA 4DBXA 4EH9A 5AA9A 4Q9SA 5LVOA 1OBGA 4KKGA 1KE7A 1RE8A 1VLRA 3EN7A 2R0IA 4GG7A 2JDRA 4L01A 3F3WA 4TKSA 3HEGA 4JOAA 4QQJA 2ACXA 1R78A 1FBNA 3UMXA 3BYUA 4B6LA 4O27B 1GY3A 1W83A 4FICA 4PMSA 5ANGA 1YXVA 2VAGA 3LQ5A 3LQ8A 2UZBA 1O6LA 3NAXA 4XG3A 5EK7A 3BE9A 4AZWA 2XM9A 2YHVA 2XBJA 4XG6A 2R3FA 5TR6A 2OZOA 4QDEA 4QQCA 4K33A 4FL2A 4RQVA 5G1XA 4HCUA 5CXZA 5IA1A 4RWIA 4R3CA 3PXZA 3DV3A 4EORA 2QCSA 3WIKA 4D4SA 1UU7A 4S33A 5IQBA 4Y95A 3KC3A 3OZ6A 3ROYA 4L7FA 4FV3A 3K3IA 2NRUA 5AP6A 1YXXA 4DG3E 3AGLA 3VJOA 2CLQA 3A61A 3IONA 4KKEA 4RLKA 1SNXA 4EK6A 1A48A 2WMVA 3NSZA 2GFSA 3BHYA 3NAYA 2CDZA 4NWMA 2RFNA 3UZRA 3R9OA 3OS3A 2FVDA 3FMLA 5KKRB 3GC8A 3EHAA 2PMIA 3GOKA 3V8TA 4JQ7A 3PY1A 3TEIA 5J95A 3H0YA 4UXQA 3WZKA 2QI8A 3K5UA 4B4LA 5H8EA 3HLLA 3G9NA 4FEXA 4JG8A 2BAQA 3H30A 4EC9A 1L3RE 3H9RA 4MF1A 3U6HA 2ZV2A 3JVSA 1XH4A 5CVHA 2PK9A 2W1HA 2R3OA 2F57A 4L44A 4IHPA 2X6DA 3G33A 5HEZA 1BYGA 1YKRA 3A2CA 5CALA 5IPJA 3BYOA 3UOKA 3A7FA 1ZZ2A 1MRUA 4KRCA 4RJ6A 3ZM4A 4BB4A 4HVSA 4GT3A 2BZIB 4QNAA 2XNMA 2ITUA 4QNYA 4QYHA 4MXCA 2OO8X 5IMXA 3LXKA 4LM5A 4U45A 1BL6A 1J7IA 5AV1A 5EKNA 1GZKA 3HMNA 4BDKA 2VGPA 2Z60A 3MA3A 4F9AA 1JPAA 2WMSA 2PUPA 2X6EA 2UZUE 3I79A 3PSDA 3I7BA 4O7NA 4TWNA 3QD3A 4L68A 3BI6A 4TT7A 4QEBA 4ZTMA 2WTDA 4D9UA 2HIWA 2ZV8A 4FTCA 3IOPA 4F1MA 5D1JA 4IX6A 4JQ8A 4FIHA 2W1FA 4PUZA 4N6YA 2WMAA 1YOJA 4PL5A 2WU7A 3JR1A 4O7LA 5M53A 4A07A 5HU3A 2X9FA 4NSTA 3UZTA 4BYIA 4O81A 1JNKA 3POZA 4F78A 5TOZA 3ZM9A 3EFJA 3RJCA 3F6XA 4EOPA 2HZ4A 4UYNA 3SKCA 1IA8A 1H00A 1Q3DA 2VGOA 3HAMA 5A46A 4RVLA 1QCFA 2C6KA 3TI1A 4U81A 4I93A 2GSFA 4WIHA 3V6SA 4IVAA 4MX9A 1PKGA 3BL7A 4RQKA 4KS7A 2OLCA 3LKMA 3TIYA 3EFKA 3ZSHA 2UW8A 1PXJA 2KTYA 5FRIA 4BDEA 4E4MA 4IZYA 1Q8WA 2WO6A 1TQMA 1YXTA 1U54B 2GS2A 5CT0A 2GMXA 1I09A 1AGWA 2ZV9A 4MXYA 5KCVA 5EYMA 3ZOSA 2QOHA 3TACA 4FNZA 2QOBA 3SGCA 3IW8A 5KNJA 3HRCA 1LEWA 4H58A 3C4XA 3PIXA 4O84A 4FEUA 3VONA 2WMBA 4W4WA 3ZUUA 2X39A 4EOLA 4ACMA 5CVGA 2BAJA 2J0IA 5HBEA 4ZSAA 3RWPA 3D5XA 4AFJA 5JKGA 5I9UA 4RFMA 5EI6A 4PL3A 3UIBA 3KCKA 4N6ZA 2X2KA 3UO6A 5CT7A 4PRJA 2ERKA 4YC8A 3UQFA 4W4XA 5DI1A 2I0YA 4DG2E 4Y5QA 3BU6A 5K3YA 4AUAA 1KV1A 1XBCA 1Y6BA 2GTNA 5B2MA 3FXXA 2PVMA 3EZRA 4AF3A 4ENXA 3FXWA 3QC9A 2F2UA 2JFMA 4MXXA 1J7UA 4FNYA 1Q8TA 3F3ZA 4CV9A 5FXRA 4XBUA 4RJ5A 3ZONA 2ONLA 3VUKA 3L9MA 5HZNA 3MN3A 4QRCA 3OBGA 2C5YA 2Q0NA 2XNNA 3CCNA 3A8XA 4GW8A 3RPOA 1OL6A 4QMYA 5J8IA 1W98A 4FSRA 4DT9A 4ANBA 4YU2A 5E91A 3FYKX 2F4JA 3OXIA 3P78A 4GU6A 2QODA 3LCDA 2I1MA 3V5QA 2GFCA 4LOQA 4GJ2A 4JBPA 4ZTQA 1I44A 3II5A 3N4UA 2YWVA 2PVNA 2A1AB 4RIWA 3RAKA 4M67A 3Q5IA 2OH4A 4HNIA 5CI7A 3WYYA 5AAEA 2C3LA 3V51A 3ZFYA 2PPQA 2IN6A 3DQWA 3LCOA 4N57A 2VO6A 4EOJA 3NFFB 4TL0A 4FUXA 3NMUF 2A4LA 3W0PA 1CKJA 1E9HA 4I1ZA 4F6UA 3JY0A 5CSPA 2I0VA 3LFCA 4XV2A 3UZPA 4DFZE 2CSNA 2XANA 3D94A 4EH3A 1Q99A 3PRFA 5FQDC 3ZRKA 5E8VA 3PPZA 4QP1A 4OBPA 3ZUTA 1FVRA 3I4BA 4CMTA 4FGBA 4MXZA 2VTOA 3SW4A 5CU6A 2IZTA 4GKHA 4NTTA 3IGGA 5HICA 2C69A 4QTBA 4R5YA 1PKDA 4RIYA 4ZMEA 4O7YA 3GU4A 3QCYA 2B0QA 2C5OA 2OW3A 3Q32A 5FDPA 3JUHA 3LIJA 1NVRA 3W2RA 4L3PA 3REPA 2XJ1A 3KF4A 4EZ7A 4L42A 4O2ZA 4RG0A 4FR4A 3S2PA 4IVDA 4Q2AA 4U9AA 4DFYA 3HRFA 4F99A 1H24A 2JFLA 4NU1A 4TTHB 4YJVA 3MY0A 4TN6A 3NIZA 4EQCA 2XK4A 3IW5A 3PG1A 1XJDA 4A9SA 4D28A 3UNKA 4V01A 3IDPA 4RIXA 5E8SA 1BX6A 2CCHA 5IQDA 3PVGA 4ASEA 1YRPA 2W7XA 4JI9A 3TNIA 2UZLA 3ZEWA 4YSJA 3CTHA 3RVGA 3IW7A 2R3NA 4QMXA 4N4SA 1R0EA 4JG6A 5IH6A 4U7ZA 2JBPA 2Z7LA 3GQLA 5AP0A 5C4LA 5HU9A 5JMSA 5HGIA 5CENA 4XYFA 1G5SA 4CG8A 3FLWA 3LJ1A 4YHTA 3TYKA 4X3FA 2BIYA 1PXPA 4HVDA 2HXQA 3H10A 1JBPE 1SMHA 4DGGA 1ZXEA 1Q24A 1QL6A 3BYMA 5LXMA 1E1XA 4I41A 1W8CA 4IFCA 1YW2A 5AAFA 4AGCA 3UQCA 3VRZA 2IVUA 5CWZA 3IOKA 1QMZA 3E5AA 3HDMA 2ITXA 2OJFE 1KE6A 4II5A 1ZYJA 2QOCA 4L8MA 3ACJA 1Y8GA 2VTIA 4XMOA 5F95A 4KS8A 3WILA 3RK7A 4JRNA 1KV2A 2QLUA 2X4ZA 5H9BA 3ZLXA 4XG7A 5ANDA 4F9WA 1AD5A 3ZC6A 3QUPA 2VO7A 1ZOHA 3RAWA 3M1SA 4YTCA 4H39A 3QAME 1GOLA 3A7GA 3VW8A 5HX6A 3DBFA 3CXWA 4B99A 2AUHA 5CZHA 2J90A 3WZDA 5DGZA 4YMJA 4EBVA 2WQNA 2HENA 4O82A 3BPRA 1YWRA 3QU0A 5KMIA 2OXXA 4JDHA 4CRLA 3LLTA 4F7SA 3ORKA 4FTLA 4HVIA 1OKVA 5DWRA 2NNWB 5JZJA 3DA6A 4EKLA 3Q6UA 4HVHA 3R6XA 2ZMCA 4ITIA 3DLSA 3BGZA 3PE1A 3UNJA 5J9ZA 4AT4A 3EQPA 2W96B 2JEDA 3FZPA 3L9PA 4G1WA 3VS3A 3A8WA 5AX9A 1DS5A 3SG8A 3GCQA 4YNEA 4BDGA 2ETKA 3TUBA 4MWHA 3VRYA 2GHMA 5EI2A 3P08A 4NL0A 4QDVA 4E4XA 4ZAUA 1TFFA 3CJGA 5JEBA 1APME 4I0RA 3ZZWA 4YC6A 4E7WA 4IWOA 4GL9A 3QTWA 2DYLA 2WB8A 5E8XA 3UDZA 3R8UA 2BPMA 2CGWA 3KXNA 1UVRA 2J2IB 3KL8A 3L9LA 4OBQA 4QP8A 3MJ2A 3ZDUA 3K5VA 3PPJA 4AZFA 3TTIA 4K0YA 4AOIA 2OIQA 2VN9A 4BTMA 3EFWA 2X0GA 3ATSA 1OECA 2BRNA 5D41A 1IA9A 1OIUA 4GKIA 4EONA 4R7HA 2WQOA 4IVCA 3ZTXA 5JGBA 3I6UA 1FINA 3LMHA 4LDTA 5LWNA 4AXCA 2B52A 3DXQA 3MPMA 5LMKC 4UEUA 5JSMA 1F0QA 2XARA 3COMA 3OW3A 4EQUA 3Q9XA 4FK6A 4OTIA 1M2QA 4MWIA 4NT4A 3E92A 3NR9A 3F61A 3Q4ZA 4Y83A 5KMLA 5EFQA 2PVFA 3Q96A 1T45A 4I3ZA 1UKHA 4C2WA 3RKBA 5A3XA 3QQGA 1XHAA 2V22A 3W0RA 3ZBXA 3LFAA 4PL4A 4RC3A 2VTMA 5DYJA 4NUSA 3FKOA 3QGYA 2A0CX 3F5UA 4FVRA 2GDOA 3WE8A 1HOWA 4IJ9A 2JDSA 4EH5A 2REIA 1ZMVA 3DKFA 5E92A 4GJ3A 4IVBA 3UIUA 3ZSIA 3U54A 2XK6A 5L2TA 4LL5A 4X2NA 5A4EA 4JQEA 3PY0A 3ZLWA 4EK4A 3E7VA 5GIPE 4ZY6A 2QONA 2H96A 3GNIB 3AMAA 3LXPA 4GRBA 4IC7A 3O23A 1M7QA 1YOMA 3FC2A 3LQ3A 3MH3A 2XK3A 4U3ZA 4GYGA 3DZQA 2HZ0A 4F0GA 1R0PA 2VUWA 3NCGA 3Q4UA 3V5LA 3UOHA 3LFNA 4DEAA 1PY5A 3MPTA 2YCFA 4DEGA 4CG9A 2PU8A 5A6NA 2VWZA 4IDVA 3UP7A 4AZEA 3NYOA 4BKJA 5E8WA 3RZBA 3CQWA 4JJRA 4B0GA 3DKGA 2JIUA 3Q52A 4NM5A 3H3CA 4O2PA 2BZHB 2HOGA 5AV0A 3DK6A 1H08A 4FKWA 2EWAA 2ZYBA 3CP9A 3DKCA 3RHKA 3F7ZA 1YHVA 4EZ5A 5BYLA 2IZUA 1W0XC 3ANRA 4PWNA 4BHZA 4RIYB 5ANOA 2O2UA 3NW5A 4L3JA 5EW3A 3P86A 5AAGA 2JBOA 2G2FA 4JR3A 5EW8A 1Z57A 4NTSA 3GBZA 3ACKA 4XP0A 2VWWA 4FL1A 3RM7A 4DH7A 4NCTA 5CY3A 5IQAA 4LOPA 3UPXA 2W1ZA 3HA8A 3FL4A 3ORPA 4ZK5A 3GOPA 3W0SA 4BTJA 4MXOA 4FV8A 3MIYA 3T3UA 4PQNA 4D1SA 5HE0A 1YQJA 4YLJA 4EYMA 4ZJIA 3ELJA 1PRYA 3CPCA 3ORXA 1RW8A 2EXMA 3OWKA 4RIXB 2PZPA 2WPAA 2WTKC 4IH8A 2VRXA 5AP5A 5HIDA 3W0QA 4ZY4A 5LVMA 2XIZA 1XH5A 5AUZA 3OT8A 4HPTE 4HYSA 3T3VA 3HMIA 3FMNA 3RI1A 5F1ZA 2XK9A 3H9OA 3ATTA 3VHKA 3ANQA 3NS9A 2QOLA 4KAOA 2W1IA 4O22A 3ZBFA 5FEEA 4BZDA 3B2TA 4FSTA 4NK9A 4O0UA 3QZIA 3AMYA 1GZOA 5HIBA 3RMFA 4C4FA 4FT5A 5CAOA 3PTGA 3UOJA 3OP5A 2WTCA 4YO6A 5EI8A 5AIRA 1OMWA 3KN5A 4XV9A 4IE9A 4M0YA 3ALOA 1REJA 3OWLA 3P79A 3ODYX 5CLPA 2PYWA 3PUFC 4YHFA 4AA0A 5HLPA 4ENYA 1OIRA 4BDDA 2W4JA 1O9UA 3CQEA 1BL7A 2PSQA 2O63A 4EBWA 3O7LB 3NNUA 4TYGA 2UZEA 1IR3A 3MY1A 3FUPA 3LW0A 2BR1A 4H3QA 2BVAA 2B9IA 2BRGA 4NFMA 1YHSA 3VIDA 2OICA 4IAIA 5E8TA 5AP1A 4S2ZA 3W1FA 5FP6A 2ERZE 4WRGA 3TDWA 4AA5A 1NT2A 1MRYA 2AC5A 5CQUA 4RA5A 1JKKA 3UC4A 1FGIA 1Q8YA 5H8GA 3EN9A 3WF7A 5C03A 5K5XA 2RIOA 4KBKA 4Z7GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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